擔(dān)子菌門（BasidiomycotaR.T.Moore 1980）真菌是以食藥用菌為代表的大型真菌最主要的種類構(gòu)成，也包括植物病原菌銹菌和黑粉菌，還有酵母菌等，其物種數(shù)占真菌界的1/3，有4萬余種。該類群所涉及的食用菌產(chǎn)業(yè)自2014年就已成為農(nóng)業(yè)第5大種植業(yè)，藥用菌的活性產(chǎn)物開發(fā)前景廣闊。然而由于種類繁多、分類歷史悠久、大量新類群的發(fā)現(xiàn)引發(fā)分類系統(tǒng)巨大變革，阻礙了相關(guān)資源的認識進程。為此，中國科學(xué)院微生物所趙瑞琳團隊集結(jié)近10年來擔(dān)子菌門分類研究的新進展，首先在多基因及基因組層面對整個門的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系開展研究，并估算了目前擔(dān)子菌門內(nèi)亞門、綱、目、科的演化時間，具體包括：6個基因（LSU、SSU、5.8s、rpb1、rpb2、ef1）的多基因系統(tǒng)發(fā)育圖譜、116個代表種的396個直系同源基因的系統(tǒng)發(fā)育基因組圖譜研究及771個代表種分子鐘分析推算了科和科以上的分類階元的演化時間。為建立擔(dān)子菌門標準化分類系統(tǒng)中的各分類等級的演化時間標準提供了依據(jù)。

此外，在理清擔(dān)子菌門內(nèi)主要進化支序的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系基礎(chǔ)上，趙瑞琳團隊聯(lián)合27國專家對擔(dān)子菌門中已知的3 198個屬名進行梳理；同時還整理提供了每個合法屬的各類信息，包括分類地位、物種數(shù)、模式種、生活類型、生境、分布地、DNA數(shù)據(jù)以及系統(tǒng)發(fā)育等，進一步完善分類系統(tǒng)的各類信息。獲得目前最完整的擔(dān)子菌門分類系統(tǒng)：包括4亞門、18綱、68目、241科、1 928屬，共41 270個種（分別增加1亞門、2綱、14目、64科、337屬和9 755種）。研究成果于2019年11月發(fā)表于《Fungal Diversity》上。

以該研究成果為基礎(chǔ)的網(wǎng)站https://www.basidio.org正在建設(shè)中。該網(wǎng)站將持續(xù)對擔(dān)子菌門分類系統(tǒng)進行維護和更新，實現(xiàn)大型真菌（蘑菇）為主的這一大類真菌的分類系統(tǒng)的整體性呈現(xiàn)，不僅為分類學(xué)家，而且為資源的利用者、生態(tài)學(xué)家等提供巨大的便利。