喬國峰,李紅麗,王國艷,孟 帆,米瑞娟,張國權(quán),王志宇,孫仰介,薛俊龍,劉 源,薛翼鵬
(山西農(nóng)業(yè)大學動物醫(yī)學學院,山西太原030032)
圓環(huán)病毒屬于圓環(huán)病毒科,由4種豬圓環(huán)病毒(PCV)組成(PCV1、PCV2、PCV3和PCV4)。PCV1于1974年被發(fā)現(xiàn)是豬腎(PK-15)細胞系的污染物,是豬的非致病性病毒[1]。20世紀90年代,PCV2被發(fā)現(xiàn)并隨后與一系列綜合征相關(guān),統(tǒng)稱為豬圓環(huán)病毒病(PCVD)[2]。2016年,在美國發(fā)現(xiàn)了PCV3,其臨床癥狀與豬皮炎和腎病綜合征(PDNS)相關(guān)[3],并患有心臟和多系統(tǒng)炎癥[4]。之后,在亞洲、歐洲和南美洲在內(nèi)的世界范圍內(nèi)都有報道[5]。PCV3具有一個環(huán)狀的單鏈DNA(SsDNA)基因組,長度約為2 000個核苷酸,2個主要的ORF在相反的方向上,編碼衣殼(Cap)和復制酶(Rep)蛋白[3-4]。據(jù)報道,PCV3與不同的臨床/病理條件有關(guān),包括豬皮炎和腎病綜合征、生殖障礙、呼吸問題、腹瀉以及多系統(tǒng)炎癥和心肌炎[5-12]。有研究表明,在有類似PDNS癥狀的豬和臨床無癥狀豬的血清中均檢測到了PCV3,證明該病毒存在致病潛力[13]。山西省農(nóng)業(yè)科學院畜牧獸醫(yī)研究所預防獸醫(yī)研究室在母豬的混合血清樣本中發(fā)現(xiàn)了PCV3基因組,為了搞清母豬血清中PCV3的存在是否與死產(chǎn)的發(fā)生有關(guān),采集了分娩后死產(chǎn)母豬與無死產(chǎn)母豬的血清,調(diào)查PCV3的感染率和DNA載量,為更深入地研究PCV3與死產(chǎn)發(fā)生的聯(lián)系提供理論依據(jù)。
1.1.1 樣品 采集2020年5—8月山西臨汾、長治地區(qū)6個規(guī)?;B(yǎng)豬場中剛生產(chǎn)的母豬血液。樣本被分成2組:一組是產(chǎn)時至少有1頭死產(chǎn)仔豬的母豬(46頭)血清,另一組是沒有死產(chǎn)仔豬的母豬(43頭)血清。所有母豬在臨床上都是健康的。
1.1.2 主要試劑 柱式DNA提取試劑盒購自上海凡濟生物科技有限公司;TOPO質(zhì)粒和2×Platinum SYBR Green qPCR SuperMix-UDG購自Invitgen公司;BL21感受態(tài)細胞購自北京博邁德生物科技有限公司。
1.2.1 DNA的提取 用柱式DNA提取試劑盒從200μL的血清中提取脫氧核糖核酸。用微量分光光度法驗證DNA的質(zhì)量。
1.2.2 PCV3的實時熒光定量PCR檢測 參照GenBank中公布的PCV3全基因序列設(shè)計1對引物,并用Primer BLAST軟件進行計算機評價,驗證引物的特異性。引物正向序列為5′-AACGGTGGG GGGTCATATGTGTTG-3′,反向序列為5′-AGACGA CCCTTATGCGGAAA-3′(基因組位置1441-1616),擴增片段大小為175 bp。通過在TOPO質(zhì)粒(Invitgen)中克隆擴增子,然后轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌(BL21)所獲得的標準曲線來評估qPCR的檢測限。提取質(zhì)粒并定量,并用DNA分子構(gòu)建1×108~1×100的標準曲線。反應的最終體積為12.5μL,循環(huán)條件為:50℃2 min,95℃2 min,擴增40個循環(huán)(95℃15 s和60℃30 s)。通過逐漸升高溫度(0.3℃)60~95℃繪制熔化曲線,通過與標準曲線的比較來確定病毒DNA的拷貝數(shù)。
用卡方檢驗比較了有死產(chǎn)仔豬和無死產(chǎn)仔豬母豬之間PCV3感染的發(fā)生率。用Wilcoxon-Mann-Whitney U檢驗比較病毒DNA載量。
經(jīng)BLAST分析,qPCR具有特異性,定量限為10個拷貝數(shù)的PCV3 DNA,效率為99.4%。然而,也檢測到了低于10個拷貝數(shù)的DNA含量,盡管不能量化。因此,證明陽性樣品的標準是任何循環(huán)閾值低于39、比熔體溫度為83.4℃的樣品。陰性對照沒有產(chǎn)生擴增產(chǎn)物,所有DNA樣品都顯示出良好的質(zhì)量,A260/A280和A260/A230的比值分別高于1.8和2.0。在檢測的89個樣本中,57個(64%)被發(fā)現(xiàn)含有PCV3基因組。有死產(chǎn)母豬陽性率為67.4%(31/46),無死產(chǎn)母豬陽性率為60.5%(26/43),2組間差異無統(tǒng)計學意義(P=0.45)。所有被檢測的養(yǎng)殖場的樣本都檢測到了病毒基因組(圖1)。
所有養(yǎng)殖場的2組均檢測到PCV3 DNA,除第3場分娩正常(無死胎)的母豬血清中未檢測到PCV3 DNA外,其余均檢出PCV3 DNA。
在3號養(yǎng)殖場中,所有分娩正常(無死胎)的母豬均未檢測到PCV3。在含有PCV3基因組的57份血清中,只有25份具有可量化的基因組載量,即高于10拷貝/mL的基因組,這是qPCR的定量極限。在這25個樣本中,14個對應于有死產(chǎn)的母豬,而11個對應于沒有死產(chǎn)的母豬(圖2)。對比有死胎和無死胎的母豬,每mL血清中檢測到的DNA分子的中間值分別為676和851。在比較2組間的PCV3基因組載量時,沒有發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計學意義的差異(Wilcoxon-Mann-Whitney U;P=0.92)。
SHANG等[14]研究表明,只有在產(chǎn)死胎的母豬身上發(fā)現(xiàn)了PCV3基因組,但PCV3感染和死胎的發(fā)生之間沒有明確的聯(lián)系。本研究設(shè)計了一種定量PCR來檢測PCV3感染率和血清中的病毒DNA載量。該方法具有99.4%的效率,能夠在高通量測序(HTS)中檢測到先前陰性的樣本中的PCV3 DNA。在之前的檢測結(jié)果中,可能由于PCV3 DNA載量過低的原因,有一定的誤差,因此,該檢測技術(shù)為后期的研究提供了更加靈敏的檢測手段。
然而,在與PCV3感染之間的明確關(guān)聯(lián)已經(jīng)在有生殖障礙的豬中被報道,如流產(chǎn)和死胎豬[4-6]。事實上,在木乃伊胎兒中,報告了很高的混合感染率,包括豬細小病毒(PPV)、豬圓環(huán)病毒2(PCV2)和鉤端螺旋體(Leptsp.),但沒有闡明PCV3在這種情況下的作用。相比之下,其他研究報告了PCV3在健康動物中的感染率,在某些情況下,PCV3的感染率高于患病動物[15-16]。
在本研究中,無論有沒有死產(chǎn)母豬的血清中都發(fā)現(xiàn)了PCV3基因組。在3號養(yǎng)殖場中,所有10頭分娩正常的母豬在它們的血清中都沒有PCV3感染,可能是一個例外,因為其他農(nóng)場在2組中都有PCV3感染的母豬。本研究結(jié)果顯示,有或無死胎母豬血清中PCV3 DNA載量無顯著差異,提示PCV3可能與母豬死產(chǎn)的發(fā)生無關(guān)。但值得注意的是,被檢查的血清是從剛剛分娩的母豬身上采集的,PCV3感染可能發(fā)生在懷孕早期或更早的時期,在妊娠的前幾個階段感染一些其他感染源,也會導致死產(chǎn)。對PCV3感染在整個孕期以及在新近出生和死產(chǎn)的仔豬中的作用應進一步研究,可能會提供有關(guān)該病毒導致死產(chǎn)的更多數(shù)據(jù)支持。
通過對母豬血清中PCV3基因組的鑒定,本研究提供了剛產(chǎn)下的母豬感染PCV3的證據(jù)。死產(chǎn)的發(fā)生似乎與PCV3感染率或分娩時母豬的PCV3基因組載量無關(guān)。