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長(zhǎng)非編碼RNA在兒童急性白血病中的研究進(jìn)展

2020-12-24 08:39:09陳靜宋麗萍
關(guān)鍵詞:白血病骨髓進(jìn)展

陳靜,宋麗萍

(桂林醫(yī)學(xué)院,廣西 桂林)

0 引言

白血病是一類(lèi)造血干細(xì)胞惡性克隆性疾病。表現(xiàn)為正常細(xì)胞增殖、分化、凋亡等機(jī)制受阻,白血病細(xì)胞大量增殖累積在骨髓和其他造血組織中,從而抑制正常造血功能。兒童和青少年中最常見(jiàn)的兩種急性白血病類(lèi)型是急性淋巴性白血?。╝cute lymphoblastic leukemia,ALL)和急性骨髓性白血病(acute myeloid leukemia,AML)。ALL在兒童白血病中約占80%左右,AML在兒童中占比較少[1]。白血病居中國(guó)人群所有死亡順位第7位,居兒童及35歲以下人群腫瘤發(fā)生及死亡首位,給社會(huì)和家庭造成了沉重的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)[2]。針對(duì)這一問(wèn)題,越來(lái)越多人開(kāi)始對(duì)其治療展開(kāi)深入的研究和探討。最近的研究表明LncRNA可以用作兒童AL的診斷、治療反應(yīng)及預(yù)后的生物標(biāo)志物。本文就對(duì)不同LncRNA在兒童AL發(fā)生發(fā)展中的作用及意義進(jìn)行綜述,為今后的研究提供有用信息。

1 LncRNA概述

LncRNA是一類(lèi)數(shù)量遠(yuǎn)低于編碼基因,無(wú)蛋白表達(dá)功能的長(zhǎng)度大于200nt的非編碼RNA[3]。到目前為止,人類(lèi)LncRNA的數(shù)量在10000個(gè)轉(zhuǎn)錄物的范圍內(nèi),并且已經(jīng)確定其中一些參與了基因表達(dá)的重要調(diào)節(jié)過(guò)程[4]。長(zhǎng)的非編碼RNA通過(guò)與DNA、RNA或蛋白質(zhì)在多種生物過(guò)程中結(jié)合而發(fā)揮關(guān)鍵作用,正常長(zhǎng)的非編碼 RNA在體內(nèi)參與紅細(xì)胞生成和炎癥反應(yīng)以及各種代謝途徑等[5],特異性的表達(dá)于機(jī)體組織。研究發(fā)現(xiàn),高水平表達(dá)的LncRNA與腫瘤細(xì)胞持續(xù)增殖、抑癌基因失活、細(xì)胞永生化、侵襲及轉(zhuǎn)移、血管形成及細(xì)胞凋亡抑制的特點(diǎn)相關(guān)[6]。因此,如果在血細(xì)胞發(fā)育過(guò)程中參與基因表達(dá)調(diào)控的LncRNA失調(diào),可能會(huì)導(dǎo)致癌癥的發(fā)生和進(jìn)展。近年來(lái)許多研究表明,失調(diào)的LncRNA通過(guò)參與疾病的表觀遺傳調(diào)控、轉(zhuǎn)錄調(diào)控等過(guò)程來(lái)調(diào)節(jié)腫瘤細(xì)胞的存活、增殖、侵襲和轉(zhuǎn)移,從而促進(jìn)腫瘤的發(fā)生和發(fā)展[7,8]。自被發(fā)現(xiàn)以來(lái),LncRNA逐漸在許多惡性腫瘤的診斷、治療和評(píng)估預(yù)后的方面發(fā)揮重要作用,目前新發(fā)現(xiàn)的和兒童急性白血病相關(guān)的LncRNA主要有RNUOR、HOTAIRM1、GAS5、IUR等。

2 LncRNA與兒童ALL

兒童急性淋巴細(xì)胞白血?。╝cute lymphoblastic leukemia,ALL)是由前體B、T或成熟B淋巴細(xì)胞發(fā)生克隆性異常增生所致。LncRNA GAS5是近些年新發(fā)現(xiàn)的具有抑制腫瘤作用的LncRNA,許多研究表明GAS5在乳腺癌、肝細(xì)胞癌、非小細(xì)胞肺癌等多種癌癥中異常表達(dá),通過(guò)參與細(xì)胞增殖、凋亡等來(lái)調(diào)控癌癥的進(jìn)展。在Gao[9]的實(shí)驗(yàn)研究結(jié)果顯示,低表達(dá)的GAS5可作為預(yù)測(cè)多種癌癥預(yù)后的新型生物標(biāo)志物。Jing[10]發(fā)現(xiàn)GAS5通過(guò)抑制miR-222來(lái)調(diào)節(jié)B-LL的發(fā)生和轉(zhuǎn)移。使用實(shí)時(shí)熒光定量PCR分別檢查了30例急性B淋巴細(xì)胞白血病患者和健康對(duì)照白細(xì)胞中LncRNA GAS5和miR-222的水平,結(jié)果顯示實(shí)驗(yàn)組GAS5的水平比健康對(duì)照組顯著降低,而miR-222剛好相反。這表明GAS5和miR-222與B淋巴細(xì)胞白血病的發(fā)生發(fā)展相關(guān)。通過(guò)細(xì)胞培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)GAS5過(guò)表達(dá)降低了B淋巴細(xì)胞白血病細(xì)胞的增殖,促進(jìn)其凋亡、抑制其細(xì)胞周期和侵襲。

Tan等[11]的實(shí)驗(yàn)證明LncRNA ARIEL在T-ALL中作為一種增強(qiáng)RNA與ARID5B相互調(diào)節(jié)發(fā)揮致癌作用,通過(guò)數(shù)據(jù)集分析顯示ARIEL顯著高表達(dá),且與ARID5B表達(dá)的適度正相關(guān)。通過(guò)芯片序列分析觀察到TAL1陽(yáng)性T-ALL細(xì)胞ARIEL出現(xiàn)高水平信號(hào),ARID5B蛋白可以自行結(jié)合增強(qiáng)因子并積極調(diào)節(jié)其活性。PCR驗(yàn)證顯示ARIEL和ARID5B具有相互調(diào)節(jié)功能。ARIEL基因敲除后的細(xì)胞ARID5B顯著下調(diào),同時(shí)下調(diào)的還有TAL1、GATA3、RUNX1和MYB,這表明ARIEL可以通過(guò)調(diào)節(jié)ARID5B影響TAL1誘導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄程序,抑制T-ALL細(xì)胞的生長(zhǎng)和存活,并阻止疾病的進(jìn)展。Li[12]通過(guò)基因芯片表達(dá)譜分析發(fā)現(xiàn),兒童ALL患者血液和骨髓中LncRNA NONHSAT027612.2和NONHSAT134556.2的表達(dá)水平明顯升高,并可能通過(guò)調(diào)節(jié)免疫應(yīng)答相關(guān)途徑在兒童 ALL的發(fā)病過(guò)程中發(fā)揮重要作用。

Trimarchi[13]指出在T-ALL中,LncRNA LUNAR1通過(guò)增強(qiáng)胰島素樣生長(zhǎng)因子1受體( insulin-like growth factor1 receptor,IGF1 R)的表達(dá)促進(jìn)T-ALL細(xì)胞的增殖。IGF1R屬于受體型酪氨酸激酶,廣泛表達(dá)于在淋巴瘤和急性粒細(xì)胞白血病細(xì)胞中。Wang[14]的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)指出在兒童期T-ALL中,LncRNA通過(guò)直接與胰島素信號(hào)通路相關(guān)蛋白胰島素受體(insulin receptor,INSR)綁定,Lnc-INSR阻斷了INSR的泛素化位點(diǎn),導(dǎo)致了 INSR的異常激活以及磷脂酰肌醇3激酶/AKT信號(hào)通路,結(jié)果表明,Lnc-INSR可能通過(guò)增強(qiáng)細(xì)胞分化來(lái)促進(jìn)免疫抑制,并在免疫抑制腫瘤微環(huán)境中作為有價(jià)值的治療靶標(biāo)。Yildirim[15]指出當(dāng)LncRNA Xist丟失后會(huì)導(dǎo)致X染色體重新激活和隨之而來(lái)的全基因組變化,從而導(dǎo)致癌癥的發(fā)生,由此推斷LncRNA Xist可以抑制體內(nèi)癌癥的進(jìn)展。Fernando等[16]在進(jìn)行B-ALL治療實(shí)驗(yàn)時(shí),使用潑尼松龍會(huì)抑制BALR-2,而敲低BALR-2基因后,該基因表達(dá)分析可見(jiàn)低BALR-2激活了一些B細(xì)胞上與糖皮質(zhì)激素受體反應(yīng)相關(guān)的基因。最后低表達(dá)的LncRNA BARN-2在B-ALL細(xì)胞系中表現(xiàn)出對(duì)潑尼松龍治療的抗性,這表明BALR-2高表達(dá)與患者對(duì)潑尼松的不良反應(yīng)以及較差的總體生存率相關(guān)。

3 LncRNA與兒童AML

急性骨髓性白血病(AML)是一種以骨髓與外周血中原始和幼稚髓性細(xì)胞異常增生為主要特征的惡性克隆性疾病。HOTAIRM1是一類(lèi)對(duì)成熟的髓細(xì)胞具有高度特異性的在人類(lèi)HOXA基因簇中編碼的長(zhǎng)非編碼RNA。HOXA是同源盒基因(homeobox gene,HOX)表達(dá)于白血病細(xì)胞最常見(jiàn)的一簇,其促進(jìn)造血祖細(xì)胞增殖并抑制分化,與AML的發(fā)生緊密相關(guān)。Zhang[17]的研究表明LncRNA HOTAIRM1對(duì)染色質(zhì)狀態(tài)和結(jié)構(gòu)的相互調(diào)節(jié)以助于HOXA基因激活,從而促進(jìn)AML的進(jìn)展。通過(guò)敲除HOTAIRM1,顯示其降低了粒細(xì)胞的成熟、減輕ATRA誘導(dǎo)的CD11c和CD49d表達(dá)水平。表明了HOTAIRM1通過(guò)在基因表達(dá)水平上調(diào)節(jié)整合素控制的細(xì)胞周期進(jìn)程,在AML中起到重要作用。對(duì)兩種細(xì)胞進(jìn)行誘導(dǎo)HOXA及敲除HOTAIRM1處理,發(fā)現(xiàn)HOTAIRM1通過(guò)改變簇的染色質(zhì)組織激活基因,實(shí)時(shí)熒光定量PCR顯示HOTAIRM1介導(dǎo)相反的HOXA調(diào)控,由此推斷LncRNA HOTAIRM1激活HOXA以促進(jìn)腫瘤的進(jìn)展。

Wang等確定了與RUNX1啟動(dòng)子相互作用的新型基因內(nèi)非編碼RNA RNUOR,該LncRNA可能是參與造血系統(tǒng)惡性腫瘤染色體易位的新標(biāo)志。已知RUNX1是Runt相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子(runt-related transcriptionfactor,RUNX)家族中的一員,在造血系統(tǒng)疾病特別是急性髓系白血病的發(fā)病及進(jìn)展中具有重要作用。通過(guò)PCR,檢測(cè)到RUNXOR是獨(dú)特的長(zhǎng)非編碼RNA,可從上游啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄并與RUNX1基因的所有外顯子和內(nèi)子重疊。使用鏈特異性RT-PCR(SSRT)方法確定了RUNXOR與RUNX1按相同的方向轉(zhuǎn)錄,RUNXOR通過(guò)參與染色體內(nèi)環(huán)的形成,還可以與H3-K27甲基化酶 EZH2和RUNX1蛋白相互作用。Ellis指出LncRNA CRNDE在AML中尤其是在M2型AML和M3型AML呈現(xiàn)中高度水平升高,由此推斷LncRNA CRND可作為AML發(fā)生的介質(zhì)促進(jìn)AML細(xì)胞生長(zhǎng)并抑制細(xì)胞凋亡。

Chen等[18]根據(jù)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)LncRNA CCDC26參與了對(duì)AML細(xì)胞多途徑的調(diào)控。通過(guò)GEO數(shù)據(jù)集篩選出差異基因,用93名AML患者骨髓進(jìn)行實(shí)時(shí)熒光定量PCR驗(yàn)證發(fā)現(xiàn)LncRNA CCDC26表達(dá)上調(diào),這與表達(dá)譜分析結(jié)果相一致。通過(guò)對(duì)差異基因KEGG通路、PPI共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)及Kaplan-Meier生存分析,顯示LncRNA CCDC26參與了對(duì)AML的發(fā)病、進(jìn)展以及預(yù)后的多途徑的調(diào)控。Hirano等發(fā)現(xiàn)表達(dá)水平上調(diào)的LncRNA CCDC26在AML的發(fā)病、進(jìn)展中起著重要作用。通過(guò)定量PCR發(fā)現(xiàn)LncRNA CCDC26在急性髓系白血病和急性單核細(xì)胞白血病中高表達(dá)。根據(jù)DNA芯片表達(dá)譜發(fā)現(xiàn)有117個(gè)共同的差異表達(dá)基因,定量PCR分析顯示絡(luò)氨酸激酶受體KIT處于中心位置且上調(diào)明顯。而許多研究已經(jīng)證實(shí)KIT在許多AML患者中均過(guò)表達(dá)而起調(diào)節(jié)作用。這說(shuō)明了LncRNA CCDC26可通過(guò)調(diào)節(jié)KIT來(lái)影響AML細(xì)胞的生長(zhǎng),由此可以把絡(luò)氨酸激酶受體KIT作為AML治療上的新靶點(diǎn)。

CASC15是與蛋白質(zhì)編碼基因相鄰的一種保守LncRNAs。近年來(lái)研究表明其與肺癌、卵巢癌等惡性腫瘤相關(guān)[19]。Fernando等的實(shí)驗(yàn)說(shuō)明CASC15的過(guò)表達(dá)增強(qiáng)SOX4(Sry-like high-mobility groupbox 4)的表達(dá)并在體內(nèi)抑制細(xì)胞增殖并促進(jìn)髓樣偏向,從而促進(jìn)兒童AML細(xì)胞的增殖。該實(shí)驗(yàn)通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR發(fā)現(xiàn)CASC15在三種B-ALL亞型中均有差異表達(dá),同時(shí)檢測(cè)到CASC15在AML中4個(gè)不同易位。通過(guò)對(duì)兩個(gè)GEO數(shù)據(jù)集分析得出,ETV6-RUNX1易位的ALL患者的CASC15升高,RUNX1-RUNX1T1易位的AML患者CASC15上調(diào)。對(duì)小鼠進(jìn)行骨髓轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn),結(jié)果顯示CASC15在骨髓中過(guò)度表達(dá),CASC15過(guò)表達(dá)的髓樣細(xì)胞百分比上調(diào)。分析骨髓B細(xì)胞的發(fā)育途徑表明CASC15在體內(nèi)促凋亡并減少B細(xì)胞發(fā)育及造血。敲除CASC15后發(fā)現(xiàn)其相鄰的基因SOX4表達(dá)下調(diào)。SOX4基因是參與生長(zhǎng)發(fā)育的重要因素,具有抑制細(xì)胞增殖和分化作用。因此可推斷CASC15正向調(diào)節(jié)SOX4基因,促進(jìn)兒童AML的發(fā)生發(fā)展。

4 小結(jié)

綜上可知,LncRNA在兒童急性白血病的研究中已經(jīng)取得了一定的成果,不同的 LncRNA在基因調(diào)控以及在兒童急性白血病的發(fā)生進(jìn)展中起著非常重要的作用,同時(shí)對(duì)兒童急性白血病的臨床診斷和治療中具有潛在的應(yīng)用。盡管目前已經(jīng)報(bào)道了一些長(zhǎng)非編碼RNA的功能,但仍有許多挑戰(zhàn)有待解決。深入研究與兒童急性白血病相關(guān)聯(lián)的長(zhǎng)非編碼RNA的作用機(jī)制,并將其作為抗腫瘤靶點(diǎn)進(jìn)行識(shí)別,可為兒童急性白血病后續(xù)的研究提供新的方向。

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