譚擁軍,吳東麗,余靂,陳燕
(湖南大學(xué)生物學(xué)院,湖南長(zhǎng)沙 410082)
上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(Epithelial-Mesenchymal transition,EMT),是指上皮細(xì)胞程序性、可逆的轉(zhuǎn)化為間質(zhì)細(xì)胞的過程,根據(jù)EMT 發(fā)生的特定生物學(xué)環(huán)境將其分為1 型、2 型和3 型[1].其中,1 型主要與胚胎發(fā)育和器官形成相關(guān);2 型主要與組織再生和傷口愈合相關(guān)[2];3 型主要參與上皮細(xì)胞的惡性轉(zhuǎn)化[3].三種EMT 類型共同的細(xì)胞學(xué)機(jī)制包括有細(xì)胞形態(tài)改變、極性喪失、粘附性下降、細(xì)胞遷移能力和侵襲能力的增加[4].細(xì)胞的EMT 進(jìn)程除了可以受到TGF-β、Notch 和Wnt 的信號(hào)通路調(diào)控之外,也可以受到腫瘤微環(huán)境(如缺氧)的影響以及microRNA(miRNA)的差異表達(dá)的影響[5].對(duì)于肺癌來說,EMT 是惡性轉(zhuǎn)化的起始,其中有許多標(biāo)志物和轉(zhuǎn)錄因子的參與,主要表現(xiàn)為上皮標(biāo)志物如E-cadherin 的表達(dá)缺失及一些間質(zhì)標(biāo)志物如N-cadherin、vimentin 的表達(dá)上升[6].
E-cadherin 是鈣離子依賴性的細(xì)胞表面蛋白,屬于跨膜糖蛋白的一種,主要功能是參與細(xì)胞與細(xì)胞之間的緊密連接,促進(jìn)上皮細(xì)胞之間的粘附[7].研究表明,E-cadherin 表達(dá)下調(diào)或缺失與EMT 密切相關(guān),E-cadherin 表達(dá)的缺失被認(rèn)為是腫瘤細(xì)胞EMT發(fā)生的關(guān)鍵步驟,其下調(diào)會(huì)導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞侵襲性增加.因此,E-cadherin 被認(rèn)為是一種重要的EMT 標(biāo)志物[8].此外,E-cadherin 的丟失與各種腫瘤的惡性轉(zhuǎn)移有關(guān),如肺癌、胃癌、乳腺癌等[9].
啟動(dòng)子是一段能夠決定基因表達(dá)程度和表達(dá)頻率的DNA 序列.將E-cadherin 基因的啟動(dòng)子與熒光蛋白相連,由于基因啟動(dòng)子的啟動(dòng)或喪失能夠引起熒光信號(hào)的變化,進(jìn)而根據(jù)熒光判斷出EMT 過程中E-cadherin 的表達(dá)情況.利用啟動(dòng)子細(xì)胞熒光示蹤是一種快速、簡(jiǎn)捷的方法,可以根據(jù)熒光的變化快速判斷出大分子藥物、小分子多肽等是否影響腫瘤細(xì)胞的EMT 過程,進(jìn)而用來進(jìn)行對(duì)化學(xué)分子庫、小分子藥庫進(jìn)行快速篩選.我們通過構(gòu)建E-cadherin 基因啟動(dòng)子攜帶有綠色熒光蛋白的慢病毒載體,通過熒光的變化檢測(cè)細(xì)胞的EMT 過程,從而達(dá)到體外示蹤的目的,為進(jìn)一步研究肺癌的EMT 過程提供了材料.
pLvx-EF1A-IRES-EGFP 及包裝質(zhì)粒(pVSVG、Δ8.91)由本實(shí)驗(yàn)室保存;HEK293T 細(xì)胞、肺癌A549細(xì)胞購(gòu)自ATCC;XbaI、XhoI 限制性內(nèi)切酶購(gòu)自美國(guó)Thermo Scientific 公司;ClonExpress II One Step Clonin購(gòu)自南京諾維贊公司;EZ-trans 轉(zhuǎn)染試劑購(gòu)自上海李記生物科技公司;感受態(tài)DH5α 購(gòu)自北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司;1kb DNA marker 購(gòu)自廣東東盛科技公司;蛋白核酸分析儀來自Eppendorf 公司;DMEM 培養(yǎng)基購(gòu)自GIBCO 公司;胎牛血清(FBS)為Hyclone 公司產(chǎn)品;PBS 購(gòu)自北京鼎國(guó)公司;polybrene 助染試劑購(gòu)自Merck-Millipore 公司;β-actin抗體購(gòu)自abcam 公司;GFP 抗體購(gòu)自上生工生物工程公司;Rabbit 二抗購(gòu)自碧云天生物技術(shù)公司;Ecadherin 抗體購(gòu)自cell signal-ling technology(CST)公司.
1.2.1 PCR 擴(kuò)增E-cadherin 基因啟動(dòng)子
利用NCBI 查找出E-cadherin 的啟動(dòng)子(-2 500~100 bp)序列,利用primer5.0 設(shè)計(jì)引物,上游引物為5'-GCAGAAATCCACTTTGGCTCGAGGATGAG CCAAGAACTCTGCT-3',下游引物為5'-GAGGGAGAGGGGCGCGCCTCTAGAAGCGGGCTGGAGTCTGAAC-3',上下游引物均由北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司合成.
按照基因組提取試劑盒提取HEK293T 細(xì)胞基因組,并以該基因組為模板進(jìn)行PCR,反應(yīng)體系為:45 ul mix 酶,1 ul 模板,上下游引物各2 ul.反應(yīng)條件為:98 ℃2 min,98 ℃10 s,58 ℃10 s,72 ℃30 s,72 ℃5 min.反應(yīng)完成后用1%瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳25 min,將得到的符合長(zhǎng)度的片段用DNA 凝膠試劑盒進(jìn)行回收,用NanoDrop 檢測(cè)回收的DNA 濃度.
1.2.2 構(gòu)建重組的慢病毒表達(dá)載體
將pLvx-EF1A-IRES-EGFP 慢病毒載體用XhoI、XbaI 兩種限制性內(nèi)切酶進(jìn)行酶切,酶切產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳20 min 后,進(jìn)行膠回收.取回收后的載體2 μl,DNA 片段5 μl,酶2 μl buffer 5 μl,ddH2O 6 μl,37 ℃孵育30 min 后,冰上放置5 min.將5 μl 的連接產(chǎn)物加入到50 μl 的大腸桿菌感受態(tài)DH5α 中,冰上30 min,42 ℃熱激90 s,加入200 μl LB 液體培養(yǎng)基于37 ℃搖床振蕩1 h,取適量的菌液均勻涂布于氨芐的培養(yǎng)皿上,過夜培養(yǎng)12~16 h.第二天,挑取單菌落于100 ul 的LB 培養(yǎng)基37 ℃培養(yǎng)2 h,取1 μl 為模板,進(jìn)行菌落PCR,挑取有條帶的樣品測(cè)序.
1.2.3 細(xì)胞培養(yǎng)
HEK293T 細(xì)胞和A549 細(xì)胞均用含10%的FBS和1%雙抗(100 mg/L 青霉素和鏈霉素)的DMEM 完全培養(yǎng)基進(jìn)行培養(yǎng),放置在37 ℃、5%濃度CO2、90%相對(duì)濕度的細(xì)胞培養(yǎng)箱中進(jìn)行培養(yǎng),當(dāng)HEK293T 細(xì)胞密度達(dá)到80%可以進(jìn)行轉(zhuǎn)染.
1.2.4 慢病毒的包裝和感染
當(dāng)HEK293T 的細(xì)胞密度達(dá)到80%左右,就可以進(jìn)行轉(zhuǎn)染實(shí)驗(yàn),加樣體系如下:pLvx-pE-cadherin-EGFP 質(zhì)粒12 μg、pVSVG 質(zhì)粒6 μg、Δ8.91 質(zhì)粒9 μg,采用Ez-trans 共轉(zhuǎn)染HEK293T 細(xì)胞,8 h 后進(jìn)行細(xì)胞換液.轉(zhuǎn)染48 h 和72 h 后分別收取培養(yǎng)皿中的培養(yǎng)基至15 ml 離心管,4 ℃、1 000 r/min 條件下離心5 min,0.45 μm 濾器過濾去除細(xì)胞碎片,存儲(chǔ)于-80℃低溫冰箱.選取生長(zhǎng)狀態(tài)良好的A549 細(xì)胞,將2 mL 的pLvx-pE-cadherin-EGFP 慢病毒上清加入其中進(jìn)行感染,按1 ∶1 000 加入助染試劑polybrene 培養(yǎng)48 h 后換取新鮮培養(yǎng)基,觀察感染效果,反復(fù)三次加入慢病毒上清進(jìn)行感染,直到看到明顯的綠色熒光,進(jìn)行擴(kuò)大培養(yǎng).
1.2.5 流式細(xì)胞儀檢測(cè)細(xì)胞綠色熒光比例
在熒光顯微鏡下觀察感染成功的A549 細(xì)胞,進(jìn)行拍照.并以綠色熒光為標(biāo)志物,以未感染的A549細(xì)胞作為陰性對(duì)照,取104個(gè)感染成功的A549 細(xì)胞用PBS 懸浮,于488 nm 的激發(fā)光條件下檢測(cè)發(fā)綠色熒光的細(xì)胞所占的細(xì)胞比例.
1.2.6 mRNA 表達(dá)水平鑒定
將帶有綠色熒光的A549 細(xì)胞一組加入10 ng/mL TGF-β,培養(yǎng)48 h 后,于顯微鏡下觀察熒光的變化并記錄;1%的胰酶消化、富集熒光較亮的細(xì)胞,采用RNA 提取試劑盒,提取細(xì)胞的總RNA,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,RT-PCR 檢測(cè)E-cadherin 和GFP 的基因表達(dá)情況.RT-PCR 引物如下:
hE-cadherin-S:CGGGAATGCAGTTGAGGATC
hE-cadherin-AS:AGGATGGTGTAAGCGATGC
hGFP-S:GACAACCACTACCTGAGCAC
hGFP-AS:CAGGACCATGTGATCGCG
1.2.7 蛋白表達(dá)水平鑒定
收取A549 細(xì)胞,1×PBS 洗兩遍,刮取細(xì)胞進(jìn)入2 ml EP 管中,4 ℃離心1 000 r/min,5 min,加入合適體積的RIPA 裂解液,按1 ∶100 的比例加入蛋白酶抑制劑,冰上放置1 h 后,12 000 r/min,4 ℃離心15 min,上清即為所需的蛋白溶液,用蛋白核酸分析儀測(cè)量蛋白濃度.經(jīng)SDS-PAGE 分離,濕轉(zhuǎn)法轉(zhuǎn)移至硝酸纖維素膜,用5%脫脂奶粉室溫封閉2 h.加入GFP抗體(1 ∶2 500),E-cadherin 抗體(1 ∶2 000 稀釋),及β-actin 抗體(1 ∶5 000 稀釋),4 ℃孵育過夜;TBST 洗3 次,加入HRP 標(biāo)記的山羊抗兔抗體(1 ∶2 000),室溫孵育2 h;TBST 洗3 次,ECL 發(fā)光顯色.
首先在NCBI 網(wǎng)站及UCSC 網(wǎng)站比對(duì)確認(rèn)Ecadherin 的啟動(dòng)子區(qū)域.運(yùn)用EPD The Eukaryotic Promoter Database(https://epd.epfl.ch//cgi-bin/)預(yù)測(cè)轉(zhuǎn)錄起始位點(diǎn)上游約3 000 bp 區(qū)域,發(fā)現(xiàn)該區(qū)域具有很強(qiáng)的活性.將-2 746 bp~+74 bp 區(qū)域作為啟動(dòng)子的候選區(qū)域,根據(jù)此區(qū)域的DNA 序列設(shè)計(jì)引物.
以HEK293T 基因組為模板進(jìn)行pcr,條帶預(yù)計(jì)長(zhǎng)度為2 800 bp 左右,圖1 中可看出有條帶位置正確.將pLvx-EF1A-IRES-EGFP 慢病毒載體進(jìn)行雙酶切線性化之后,與目的片段進(jìn)行連接、轉(zhuǎn)化,挑取單克隆,進(jìn)行菌落PCR 鑒定.
圖1 E-cadherin 基因啟動(dòng)子PCR 產(chǎn)物及菌落PCR 鑒定Fig.1 Identification of PCR product and colony PCR of E-cadherin gene promoter
培養(yǎng)HEK293T 細(xì)胞,在細(xì)胞長(zhǎng)至70%~80%左右,將pLvx-pE-cadherin-EGFP 質(zhì)粒、pVSVG 質(zhì)粒、Δ8.91 質(zhì)粒共同進(jìn)行轉(zhuǎn)染,48 h 后于熒光顯微鏡下觀察到有綠色熒光,說明慢病毒包裝成功,見圖2(a).分別于48 h 和72 h 收集上清,將上述收集的慢病毒上清離心后并用0.45 μm 的無菌過濾頭進(jìn)行過濾,除去雜質(zhì),得到的上清用慢病毒滴度快速檢測(cè)卡快速檢測(cè),結(jié)果顯示病毒滴度大概為1.25×106TU/ml,見(圖2(b)(c)).當(dāng)A549 細(xì)胞生長(zhǎng)密度達(dá)到30%左右時(shí)進(jìn)行感染,反復(fù)感染3 次,于熒光顯微鏡下觀察到有綠色熒光,結(jié)果如圖3(a).說明慢病毒成功感染A549 細(xì)胞,命名為A549-p-E-cadherin;并通過流式細(xì)胞儀進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)GFP 的陽性細(xì)胞比例達(dá)到4.2%.結(jié)果見圖3(b);收集細(xì)胞進(jìn)行Western blot 檢測(cè),確定有GFP 的表達(dá),結(jié)果見圖3(c).
圖2 慢病毒的包裝及滴度測(cè)定Fig.2 Packaging of lentivirus and determination of lentivirus tit
圖3 慢病毒成功感染A549 細(xì)胞的驗(yàn)證Fig.3 Verification of successful infection of A549 cells with Lentivirus
感染成功的A549 細(xì)胞,理論上來說GFP 的變化和E-cadherin 的變化應(yīng)該保持一致.TGF-β 是一種能夠誘導(dǎo)腫瘤上皮型細(xì)胞向間質(zhì)型細(xì)胞轉(zhuǎn)化的細(xì)胞因子,因此選用TGF-β 來驗(yàn)證該示蹤體系是否有效.當(dāng)用10 ng/ml 的TGF-β 誘導(dǎo)48 h 后,可以看到成功感染慢病毒的A549 細(xì)胞的綠色熒光強(qiáng)度相較于未誘導(dǎo)的細(xì)胞有明顯的減弱,并且觀察到A549 細(xì)胞的形態(tài)發(fā)生明顯改變,細(xì)胞形態(tài)由紡錘形變?yōu)榧?xì)長(zhǎng)型,結(jié)果見圖4(a)和4(b).收集未誘導(dǎo)和誘導(dǎo)后細(xì)胞進(jìn)行RT-PCR 和Western blot 檢測(cè),發(fā)現(xiàn)經(jīng)誘導(dǎo)后的細(xì)胞內(nèi)的E-cadherin 和GFP 的mRNA 水平和蛋白水平均降低,并且二者的變化趨勢(shì)一致,結(jié)果見圖4(c)和4(d).因此可以用細(xì)胞內(nèi)綠色熒光的變化來代表E-cadherin 的變化,說明該示蹤系統(tǒng)是有效的.
圖4 A549 細(xì)胞EMT 示蹤體系的驗(yàn)證Fig.4 Verification of A549 cell EMT tracer system
已有臨床組織學(xué)表明,有近一半的非小細(xì)胞肺癌組織中E-cadherin 基因的RNA 水平比正常組織中明顯下降,主要與其啟動(dòng)子區(qū)域的甲基化水平有關(guān)[10].而E-cadherin 由于其在細(xì)胞粘附中的重要作用,被認(rèn)為是肺腺中的抑制基因,研究發(fā)現(xiàn)E-cadherin 基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化模式與肺癌的分期進(jìn)展直接相關(guān)[11].在肺癌中,E-cadherin 可以受其他轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控,如snail、slug 可以結(jié)合E-cadherin 啟動(dòng)子上的E-box 原件抑制E-cadherin 的表達(dá),進(jìn)而抑制EMT 進(jìn)程[12].而GFP 是一種小分子的綠色熒光蛋白,已經(jīng)廣泛用于多種細(xì)胞的示蹤[13].本實(shí)驗(yàn)中,我們構(gòu)建了帶有E-cadherin 啟動(dòng)子的慢病毒載體,進(jìn)而感染E-cadherin 高表達(dá)的上皮型的A549 細(xì)胞,熒光顯微鏡下觀察到大量的綠色熒光,在經(jīng)細(xì)胞因子誘導(dǎo)EMT 之后,綠色熒光減少,并且E-cadherin的表達(dá)也隨之下降.根據(jù)綠色熒光的變化實(shí)現(xiàn)對(duì)肺癌細(xì)胞EMT 過程的示蹤,簡(jiǎn)單方便,有利于對(duì)腫瘤細(xì)胞EMT 早期進(jìn)行監(jiān)控,并且適合對(duì)EMT 治療藥物的篩選,是一個(gè)快速、方便的篩選平臺(tái).
TGF-β 與腫瘤的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移密切相關(guān),其誘導(dǎo)細(xì)胞發(fā)生EMT 過程中,有多條信號(hào)通路如TGF-β-Smad 信號(hào)、Wnt/β-catenin、Notch 信號(hào)等參與[14].其中,TGF-β 信號(hào)通路是誘導(dǎo)EMT 的經(jīng)典途徑,其信號(hào)調(diào)控通過Smad 和非Smad 兩種途徑誘導(dǎo)和維持細(xì)胞的EMT[15].此外,研究發(fā)現(xiàn)在TGF-β 誘導(dǎo)EMT的過程中,可以通過SMAD3 和ERK-MAPK 途徑誘導(dǎo)Notch 通路中配體Jagged1 的合成,從而激活Notch 信號(hào)通路,而激活的Notch 通路則可以促進(jìn)TGF-β 信號(hào)誘導(dǎo)EMT 的過程[16].此外,TGF-β 與Wnt 信號(hào)通路之間也存在相互聯(lián)系,如Wnt 信號(hào)通路的下游分子Axin 通過與Smad 蛋白相互作用促進(jìn)其與Ⅰ型TGF-β 受體結(jié)合,進(jìn)而激活TGF-β信號(hào)通路[17].因此,TGF-β 被認(rèn)為是經(jīng)典的誘導(dǎo)EMT的細(xì)胞因子.
慢病毒是一種基因工程中普遍使用的逆轉(zhuǎn)錄載體,相較于其他的逆轉(zhuǎn)錄載體,慢病毒載體不僅具有容納外源片段大、無毒性且不易誘發(fā)免疫反應(yīng)安全性好等特點(diǎn),而且還有感染譜廣、效率高等優(yōu)勢(shì)[18].基于其以上優(yōu)點(diǎn),慢病毒載體被廣泛應(yīng)用于基因改造的臨床治療中,如目前的CAR-T 療法,就是通過向患者的T 細(xì)胞轉(zhuǎn)導(dǎo)CAR 序列以達(dá)到對(duì)患者的T細(xì)胞進(jìn)行改造的目的[19].我們通過對(duì)慢病毒的載體進(jìn)行改造,切去其原有的啟動(dòng)子,換上E-cadherin 基因的啟動(dòng)子,進(jìn)而感染肺癌A549 細(xì)胞,使綠色熒光蛋白能夠穩(wěn)定長(zhǎng)期表達(dá),并根據(jù)綠色熒光的變化判斷出E-cadherin 的變化過程,進(jìn)而完成對(duì)肺上皮細(xì)胞EMT 示蹤.
綜上所述,我們選擇以帶有綠色熒光的慢病毒為載體,將其原有啟動(dòng)子替換為E-cadherin 基因的啟動(dòng)子,構(gòu)建E-cadherin 基因啟動(dòng)子的慢病毒質(zhì)粒.在HEK293T 細(xì)胞中包裝成慢病毒顆粒,并成功感染肺腺上皮細(xì)胞A549 細(xì)胞,經(jīng)TGF-β 誘導(dǎo)后驗(yàn)證該細(xì)胞能有效示蹤EMT 過程,為肺癌的EMT 的研究提供了材料.