田康永,楊呂清,胡慧慧,張海德*
(海南大學(xué)食品科學(xué)與工程學(xué)院,海南 海口 570228)
木瓜蛋白酶(EC 3.4.22.2)存在于番木瓜乳膠中,是由212 個(gè)氨基酸殘基組成的含巰基的肽鏈內(nèi)切酶。木瓜蛋白酶的肽鏈之間形成3 個(gè)二硫鍵,肽鏈折疊成兩個(gè)結(jié)構(gòu)域,一個(gè)結(jié)構(gòu)域主要由α-螺旋結(jié)構(gòu)在空間內(nèi)卷曲折疊而成,另一個(gè)則由β-折疊和部分α-螺旋構(gòu)成。木瓜蛋白酶的活性中心位于兩個(gè)結(jié)構(gòu)域間的第25位半胱氨酸殘基和第158位組氨酸殘基所在的凹槽內(nèi)[1],分子質(zhì)量為21 kDa,具有凝結(jié)牛奶、水解脂肪、溶解細(xì)菌,以及其他作用[2]。因此,木瓜蛋白酶可用于許多領(lǐng)域,例如食品、醫(yī)藥、皮革、飼料、化妝品、紡織和制藥工業(yè)[3-5]。離子液體作為非常規(guī)溶劑已廣泛用于各種液相萃取模式中,因其固有的離子特性和顯著的性質(zhì)(例如可忽略不計(jì)的蒸氣壓、無效可燃性、高離子傳導(dǎo)性、以及高熱和電化學(xué)穩(wěn)定性),所以成為“綠色溶劑”的重要一類[6-7]。
雙水相體系指一些具有親水性質(zhì)的高分子聚合物與聚合物,或聚合物與無機(jī)鹽溶解在水中,當(dāng)濃度超過一定界限時(shí),能自然地分成互不相溶的兩相或多相體系,其原理主要是聚合物的不相容性,雙水相體系主要是在水環(huán)境中產(chǎn)生的[8]。離子液體雙水相基于離子液體的各種優(yōu)點(diǎn),將離子液體應(yīng)用到體系的某一水相中,運(yùn)用離子液體與無機(jī)鹽競爭水分子使目標(biāo)物質(zhì)有選擇性地富集在離子液體相或鹽相[9]。離子液體雙水相溶液酸度范圍較寬、不易乳化、界面更清晰、黏度小、不需要揮發(fā)性有機(jī)溶劑、生物相容性好、離子液體經(jīng)簡單處理可重復(fù)再利用[10],因此該技術(shù)在木瓜蛋白酶的制備中占有一席之地。
本課題組長期致力于離子液體雙水相體系萃取木瓜蛋白酶的研究。曾穎等[11]運(yùn)用1-辛基-3-甲基咪唑醋酸鹽([C8mim]Ac)與磷酸氫二鉀(K2HPO4)雙水相體系萃取木瓜蛋白酶,得到酶分配系數(shù)高達(dá)11.52,酶活力回收率為86.81%。蔡濤等[12]運(yùn)用1-丁基-3-甲基咪唑四氟硼酸鹽([C4mim]BF4)與磷酸氫鈉(NaH2PO4)雙水相萃取木瓜蛋白酶,得到酶分配系數(shù)為4.77,酶活力回收率達(dá)97.45%。Zhu Xinyun等[13]運(yùn)用1-丁基氯化吡啶([C4Py]Cl)與磷酸氫二鉀(K2HPO4)雙水相萃取木瓜蛋白酶,酶活力回收率達(dá)96.03%,分配系數(shù)為4.57。離子液體雙水相體系萃取木瓜蛋白酶取得了較好的成果,但相關(guān)的理論研究較少,本研究利用熒光光譜與分子對接分析[C4mim]BF4、[C4Py]Cl與木瓜蛋白酶之間的相互作用,以期為離子液體雙水相萃取木瓜蛋白酶提供一定的理論參考。
木瓜蛋白酶、牛血清白蛋白(均為生物純) 生工生物工程(上海)股份有限公司;K2HPO4(分析純)西隴科學(xué)(廣東)股份有限公司;[C4Py]Cl、[C4mim]BF4(均為分析純) 美國ALFA試劑公司;實(shí)驗(yàn)用水為超純水。
TU1901紫外-可見分光光度計(jì) 北京普析通用儀器有限責(zé)任公司;F-7000分子熒光光譜儀 日本日立公司;DK-98-1型恒溫水浴鍋 天津泰斯特儀器有限公司;FA2104電子天平 上海舜宇恒平科學(xué)儀器有限公司。
1.3.1 熒光光譜法分析相互作用
根據(jù)Li Xiangrong[14]和Xiao Huizhi[15]等探究分子間相互作用的方法,于一系列10 mL比色管中添加1 mL 6×10-5mol/L的木瓜蛋白酶儲備液,分別加入0.08、0.4、0.8、1.6、2、4 mL 5×10-4mol/L [C4Py]Cl和[C4mim]BF4儲備液,用水定容至10 mL,分別在25、30、35 ℃下恒溫水浴10 min后放入1.0 cm石英池中。
發(fā)射熒光光譜條件:激發(fā)波長280 nm、掃描波長范圍280~450 nm、激發(fā)和發(fā)射狹縫寬度2.5 nm。
1.3.2 熒光猝滅計(jì)算
采用Stern-Volmer方程(公式(1))計(jì)算猝滅常數(shù)(Kq),判斷熒光猝滅類型;使用雙對數(shù)方程(公式(2))計(jì)算相互作用過程的結(jié)合常數(shù)(Ka)和結(jié)合位點(diǎn)數(shù)(n);使用Van’t Hoff方程(公式(3))計(jì)算反應(yīng)的焓變(ΔH)和熵變(ΔS);使用吉布斯自由能方程(公式(4))計(jì)算各溫度下反應(yīng)的吉布斯自由能(ΔG)[16]。
式中:F0為無猝滅劑時(shí)反應(yīng)體系的熒光強(qiáng)度/au;F為有猝滅劑時(shí)反應(yīng)體系的熒光強(qiáng)度/au;τ0為無猝滅劑時(shí)熒光分子壽命/s:Kq為猝滅常數(shù)/(mol·s);[Q]為猝滅劑濃度/(mol/L)。n為結(jié)合位點(diǎn)數(shù);Ka為反應(yīng)的結(jié)合常數(shù)/(L/mol);ΔH為反應(yīng)的焓變/(kJ/mol);ΔS為反應(yīng)的熵變/(J/(mol·K));R為氣體摩爾常數(shù)(8.314 J/(mol·K));ΔG為反應(yīng)的吉布斯自由能/(kJ/mol);T為熱力學(xué)溫度/K。
1.3.3 分子對接探究對接結(jié)構(gòu)
運(yùn)用AutoDock軟件研究離子液體與木瓜蛋白酶的結(jié)合模式。離子液體的mol文件預(yù)先下載自Chemical Book數(shù)據(jù)庫(www.chemicalbook.com,CAS號為1124-64-7,174501-65-6)用Discovery Studio 軟件轉(zhuǎn)變?yōu)镻DB格式,并只保留陽離子部分。木瓜蛋白酶的晶體結(jié)構(gòu)下載自RCSB PDB數(shù)據(jù)庫(http://www.rcsb.org/,PDB編號1PPD),刪除水分子和非必需子結(jié)構(gòu),通過末端處理、加氫、加電荷等步驟完成受體結(jié)構(gòu)的準(zhǔn)備,采用半柔性對接法,其余參數(shù)默認(rèn)。對接后,選取打分函數(shù)最高的結(jié)果作為研究對象[17]。
1.3.4 相同條件下不同離子液體雙水相體系分配系數(shù)的測定
構(gòu)建[C4mim]BF4-K2HPO4、[C4Py]Cl-K2HPO4雙水相體系:固定K2HPO4添加量為0.35 g/mL、酶添加量為2.17 mg/mL、溫度30 ℃,離子液體質(zhì)量濃度分別為0.20、0.24、0.28、0.32、0.36 g/mL,用水定容至10 mL。振蕩混勻后以5 000 r/min離心10 min,讀取上下相的體積,測定上下相的蛋白酶質(zhì)量濃度,分配系數(shù)(K)的計(jì)算公式如(5)所示。
式中:ρT和ρB分別為雙水相體系中上、下相的蛋白酶的質(zhì)量濃度/(mg/mL)。
1.3.5 木瓜蛋白酶蛋白質(zhì)量濃度的測定
用Bradford法來測定蛋白質(zhì)的質(zhì)量濃度[18]。以牛血清白蛋白為標(biāo)準(zhǔn)品配制系列質(zhì)量濃度的標(biāo)準(zhǔn)溶液1.0 mL,取考馬斯亮藍(lán)G-250染色液5.0 mL,反應(yīng)10 min左右,在595 nm波長處測定吸光度。以蛋白質(zhì)量濃度為橫坐標(biāo),吸光度為縱坐標(biāo)繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。標(biāo)準(zhǔn)曲線的回歸方程為y=0.013 6+0.004 5x,R2=0.998 1。
對每個(gè)添加不同體積離子液體溶液的樣本測定3 次,使用SPSS軟件的Duncan’s法對結(jié)果的方差顯著性進(jìn)行分析[19],采用不同小寫英文字母表示不同數(shù)據(jù)之間差異的顯著性(P<0.05)。
熒光光譜法是在接近實(shí)際萃取環(huán)境下研究活性小分子與酶間相互作用應(yīng)用最廣泛的方法,其基于小分子引起的酶蛋白內(nèi)源熒光光譜變化來獲得二者的結(jié)合常數(shù)、結(jié)合位點(diǎn)數(shù)及熱力學(xué)參數(shù)等信息[20-21]。由圖1可知,隨著離子液體溶液添加量的增加,木瓜蛋白酶的熒光強(qiáng)度呈規(guī)律性降低,表明二者發(fā)生了相互作用。采用Stern-Volmer方程(公式(1))分析不同溫度下的熒光光譜最大吸收波長(表1),獲得相應(yīng)的猝滅常數(shù)(表2)。不同溫度下的猝滅常數(shù)(Kq)均大于生物大分子動(dòng)態(tài)熒光猝滅的最大常數(shù)2×1010L/(mol·s),表明離子液體通過與木瓜蛋白酶結(jié)合成復(fù)合物,引發(fā)了酶蛋白的靜態(tài)熒光猝滅[22]。
圖1 離子液體在不同溫度下對木瓜蛋白酶熒光光譜的影響Fig.1 Effect of ionic liquids on the fluorescence spectra of papain at different temperatures
表1 離子液體在不同溫度下木瓜蛋白酶熒光光譜最大吸收波長處熒光強(qiáng)度Table 1 Fluorescence intensity at maximum absorption wavelength of papain fluorescence spectrum of ionic liquid at different temperatures
表2 離子液體與木瓜蛋白酶間的熒光猝滅常數(shù)Table 2 Fluorescence quenching constants between ionic liquids and papain
對于靜態(tài)熒光猝滅過程,可以使用雙對數(shù)方程(公式(2))計(jì)算離子液體與木瓜蛋白酶相互作用過程的結(jié)合常數(shù)(Ka)和結(jié)合位點(diǎn)數(shù)(n),相關(guān)結(jié)果見表3。
表3 離子液體與木瓜蛋白酶間的結(jié)合參數(shù)Table 3 Binding parameters between ionic liquids and papain
由表3可知,隨著溫度的升高,離子液體與木瓜蛋白酶的結(jié)合常數(shù)明顯上升,而其結(jié)合位點(diǎn)數(shù)則略有增加,都趨近于1附近,因?yàn)閮煞N離子液體的猝滅常數(shù)并未遠(yuǎn)大于動(dòng)態(tài)猝滅常數(shù),所以推測猝滅過程含有部分動(dòng)態(tài)猝滅的特性,適當(dāng)升溫不僅可以加速二者在溶液中的運(yùn)動(dòng)速率,提高結(jié)合效果,還可令木瓜蛋白酶結(jié)構(gòu)更加伸展,暴露更多的結(jié)合位點(diǎn)[19]。為了理解離子液體與木瓜蛋白酶的結(jié)合過程,利用van’t Hoff方程(公式(3))和吉布斯自由能方程(公式(4))獲得了二者互作的熱力學(xué)參數(shù)(表4)。
表4 離子液體與木瓜蛋白酶間的熱力學(xué)參數(shù)Table 4 Thermodynamic parameters for interaction between ionic liquids and papain
離子液體與木瓜蛋白酶相互作用的ΔG為負(fù)值,表明離子液體與木瓜蛋白酶的結(jié)合是一個(gè)自發(fā)的過程,而ΔH和ΔS為正值,根據(jù)Ross等總結(jié)的藥物小分子與蛋白質(zhì)大分子之間結(jié)合反應(yīng)的熱力學(xué)參數(shù)數(shù)值正負(fù)性與作用力類型的關(guān)系[23],二者的結(jié)合過程是一個(gè)以熵驅(qū)動(dòng)為主的自發(fā)進(jìn)行的過程,受疏水作用力驅(qū)動(dòng),這可能由于[C4mim]BF4和[C4Py]Cl在結(jié)構(gòu)上具有一個(gè)疏水性的五元環(huán)和六元環(huán)[24],因而在與酶的疏水口袋結(jié)合過程中,疏水力發(fā)揮了主要作用。
離子液體與酶的互作涉及復(fù)雜的結(jié)構(gòu)改變,目前多種實(shí)驗(yàn)手段可用于此類研究,如光譜法(包括紫外光譜、熒光光譜、紅外光譜、拉曼光譜、圓二色光譜等)、平衡透析、電泳及色譜等方法,還有新出現(xiàn)的等溫滴定量熱、核磁共振、表面等離子共振等方法[25]。但上述方法復(fù)雜的條件參數(shù)給研究帶來了極大困難,近年來,分子模擬方法成為互作研究的重要工具。分子對接已被用于研究多種小分子與酶蛋白的結(jié)合機(jī)制[26]。由于離子液體本身極化程度非常高,能被很清晰地分成陽離子部分和陰離子部分,因此無法在AutoDock軟件中將其設(shè)置為單一小分子進(jìn)行對接[27]??紤]到離子液體與蛋白酶結(jié)合主要為陽離子在蛋白質(zhì)表面聚集來影響蛋白酶的結(jié)構(gòu)與活性的[28],所以在對接過程中使用離子液體的陽離子部分進(jìn)行對接研究。
表5 離子液體與木瓜蛋白酶分子對接的對接參數(shù)Table 5 Molecular docking parameters for interaction between ionic liquid and papain
圖2 離子液體與木瓜蛋白酶分子對接結(jié)果Fig.2 Molecular docking results of ionic liquid and papain
離子液體與木瓜蛋白酶的分子對接,選取結(jié)合能最低的對接構(gòu)像為最優(yōu)構(gòu)像,從軟件AutoDock Tools中獲取離子液體與酶作用的模擬對接參數(shù)(表5)。由表5可知,離子液體的陽離子與木瓜蛋白酶的結(jié)合ΔG均小于0,且[C4Py]Cl的ΔG小于[C4mim]BF4,由此說明離子液體小分子與木瓜蛋白酶的結(jié)合是自發(fā)進(jìn)行的,[C4Py]Cl與木瓜蛋白酶的結(jié)合優(yōu)于[C4mim]BF4。通過軟件分析可知,離子液體與木瓜蛋白酶的結(jié)合結(jié)構(gòu)如圖2所示,只存在一個(gè)結(jié)合位點(diǎn),其位于木瓜蛋白酶結(jié)構(gòu)域中間活性部位的凹槽內(nèi),通過對木瓜蛋白酶表面作疏水性分析,離子液體完全處于木瓜蛋白酶的疏水性凹槽內(nèi),由此可以得出離子液體與木瓜蛋白酶之間存在較強(qiáng)的疏水相互作用,同時(shí)通過軟件分析發(fā)現(xiàn)還存在范德華力和π-π相互作用。分子對接的結(jié)果與熒光光譜的結(jié)果相一致,同時(shí)也證明熒光光譜結(jié)果的正確性。
圖3 不同離子液體雙水相萃取木瓜蛋白酶的分配系數(shù)Fig.3 Partition coefficients of papain in aqueous two-phase extraction systems with different ionic liquids
為了驗(yàn)證熒光光譜與分子對接結(jié)果在實(shí)際提取中的正確性,分別用兩種離子液體構(gòu)建雙水相萃取體系,兩個(gè)體系均在相同的條件下進(jìn)行且構(gòu)成體系的其他成分均相同,離子液體相均在雙水相的上相,所以離子液體與木瓜蛋白酶的相互作用強(qiáng)度不同是木瓜蛋白酶分配系數(shù)不同的主要因素。如圖3所示,所有的分配系數(shù)均為正值,表明木瓜蛋白酶主要富集于離子液體相,隨著離子液體濃度的增加,兩個(gè)體系的分配系數(shù)K均呈現(xiàn)先增大后減小的趨勢,原因是適當(dāng)加大離子液體質(zhì)量濃度可以使相比例增大,因此K增大;繼續(xù)增大離子液體質(zhì)量濃度,使得體系黏度增加,阻止了兩相分子間的轉(zhuǎn)移,在兩相之間形成乳化層,使下相的酶滯留在兩相之間,酶的分配系數(shù)反而降低[29]。另一方面離子液體質(zhì)量濃度過高使離子液體產(chǎn)生擁擠,對蛋白質(zhì)的折疊和穩(wěn)定性有很大影響,擁擠會(huì)使不穩(wěn)定的蛋白構(gòu)象更不穩(wěn)定,并有助于形成致密結(jié)構(gòu)使蛋白的活性降低甚至失活[28],所以離子液體質(zhì)量濃度過高時(shí)分配系數(shù)K反而會(huì)降低。但是在相同離子液體質(zhì)量濃度下,[C4mim]BF4-K2HPO4體系的分配系數(shù)K均小于[C4Py]Cl-K2HPO4體系,從結(jié)果可以直接得出[C4Py]Cl與木瓜蛋白酶的結(jié)合能力優(yōu)于[C4mim]BF4,由此證明熒光光譜和分子對接的結(jié)果是可以預(yù)測離子液體實(shí)際的萃取效果。
本實(shí)驗(yàn)通過熒光光譜法得到兩種離子液體的猝滅機(jī)制均為靜態(tài)熒光猝滅且都有輕微動(dòng)態(tài)熒光猝滅的特性,與木瓜蛋白酶結(jié)合生成復(fù)合物,結(jié)合位點(diǎn)數(shù)為1,通過ΔG的計(jì)算得出[C4Py]Cl的ΔG低于[C4mim]BF4,說明[C4Py]Cl與木瓜蛋白酶的結(jié)合能力優(yōu)于[C4mim]BF4。分子對接分析結(jié)果表明,離子液體位于木瓜蛋白酶中間活性區(qū)域的疏水口袋中,只有1 個(gè)結(jié)合位點(diǎn),并與周圍眾多的氨基酸殘基存在疏水作用、范德華力和π-π相互作用等非共價(jià)鍵力,從模擬的角度驗(yàn)證了熒光光譜結(jié)果的正確性。離子液體雙水相體系分配系數(shù)測定結(jié)果表明,離子液體與木瓜蛋白酶結(jié)合力的強(qiáng)弱會(huì)影響離子液體雙水相實(shí)際萃取木瓜蛋白酶的效果,且與熒光猝滅所得的結(jié)果相同。本研究補(bǔ)充了[C4Py]Cl和[C4mim]BF4離子液體雙水相體系萃取木瓜蛋白酶的理論依據(jù),為構(gòu)建新離子液體萃取體系提供了參考。