仝 娜 易洪剛 柏建嶺 楊 晟 陳 峰 趙 楊△
【提 要】 生物統(tǒng)計學(xué)是一門具有較強理論性和實踐性的前沿交叉學(xué)科。除了專業(yè)技能,自主學(xué)習(xí)、科研能力的培養(yǎng)也是教學(xué)工作的重點之一。本文針對學(xué)生應(yīng)用能力缺乏這一現(xiàn)象,結(jié)合我院綜合實驗教學(xué)理念,全面提高統(tǒng)計學(xué)專業(yè)學(xué)生數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析能力,為今后生物統(tǒng)計學(xué)的教學(xué)改革提供見解。
在醫(yī)學(xué)院校,應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)(生物統(tǒng)計方向)定位于培養(yǎng)既具有統(tǒng)計學(xué)思維,掌握統(tǒng)計理論、流行病學(xué)研究方法,精通統(tǒng)計編程技術(shù),又具有基本醫(yī)學(xué)知識的復(fù)合型生物統(tǒng)計學(xué)人才[1]。從2012年起,南京醫(yī)科大學(xué)(以下簡稱“本?!?設(shè)立了應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)專業(yè)(生物統(tǒng)計方向)并開始招生,該專業(yè)學(xué)生接受系統(tǒng)的生物統(tǒng)計學(xué)理論和編程技術(shù)的培養(yǎng)。作為生物統(tǒng)計學(xué)工作者,學(xué)生在面對工作中的實際問題時,除了需要扎實的統(tǒng)計學(xué)知識,還必須將統(tǒng)計學(xué)與相關(guān)領(lǐng)域有機整合,并且具備面對各領(lǐng)域?qū)嶋H問題時自主的知識學(xué)習(xí)能力和實際問題分析能力。
在實際教學(xué)工作中,筆者注意到,不少學(xué)生已經(jīng)掌握了常用統(tǒng)計分析方法的原理和過程,但在實際應(yīng)用中,卻無法將各種方法融會貫通;不知道如何正確表達統(tǒng)計分析的結(jié)果和結(jié)論,使得最終的報告變成了過程的羅列,僅僅體現(xiàn)了統(tǒng)計學(xué)的分析過程,卻無法體現(xiàn)研究者的科研思路;缺少在不同研究背景下將專業(yè)問題轉(zhuǎn)化為統(tǒng)計問題的訓(xùn)練,導(dǎo)致對自己進行的分析缺乏自信,等等。
本校公共衛(wèi)生學(xué)院在五年制預(yù)防醫(yī)學(xué)專業(yè)中,開設(shè)了預(yù)防醫(yī)學(xué)綜合實驗,將多門實踐課程綜合,目的是為了提高學(xué)生對預(yù)防醫(yī)學(xué)有關(guān)問題的綜合解決能力[2-3]?;谶@門課程的理念,筆者提出了基于綜合實驗的生物統(tǒng)計學(xué)課程,即利用某個領(lǐng)域中的實際案例,如遺傳關(guān)聯(lián)性研究、臨床試驗、現(xiàn)況調(diào)查研究等,基于真實數(shù)據(jù)或產(chǎn)生模擬數(shù)據(jù),讓學(xué)生對案例進行分析,自主學(xué)習(xí)獲取該案例所來自領(lǐng)域的專業(yè)知識,結(jié)合自己掌握的統(tǒng)計方法,搜集、整理、分析和解釋數(shù)據(jù)。
與一般統(tǒng)計課對應(yīng)的“上機實驗課”不同,綜合實驗強調(diào)在深刻理解問題的學(xué)科背景的基礎(chǔ)上,綜合利用多種統(tǒng)計分析方法,借助于一種或多種數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析軟件完成,旨在全面提高應(yīng)用統(tǒng)計學(xué)專業(yè)學(xué)生數(shù)據(jù)管理和統(tǒng)計分析能力的實驗方法[4-6]。
以《流行病學(xué)中的統(tǒng)計分析方法》為例。該課程的目的是為了使生物統(tǒng)計學(xué)專業(yè)本科生,通過這門課程的學(xué)習(xí),系統(tǒng)地掌握流行病學(xué)研究中常用的研究設(shè)計類型及其特點,掌握流行病學(xué)研究中各種常用方法的基本原理、特點和適用條件,掌握流行病學(xué)研究中各種常用統(tǒng)計模型的建模策略,為以后專業(yè)學(xué)習(xí)和從事流行病學(xué)研究打下堅實的理論基礎(chǔ)?,F(xiàn)代流行病學(xué)研究非常強調(diào)在嚴密的流行病學(xué)設(shè)計下,綜合利用分子生物學(xué)、現(xiàn)場調(diào)查、因果推斷、數(shù)據(jù)分析等各種方法和手段。通過整合綜合實驗與課堂理論教學(xué),不再拘泥于傳統(tǒng)統(tǒng)計學(xué)教材基本知識→統(tǒng)計方法→實例計算的教學(xué)方式,采用基于案例和問題的教學(xué),精選案例,介紹案例的來龍去脈;提煉問題,課堂教學(xué)和討論圍繞相關(guān)案例的若干個問題展開。例如,綜合實驗課中包含了如下一個案例:
案例名稱:人類身高的遺傳密碼
案例題干:現(xiàn)有研究表明,人類的身高由多個基因決定。但既往很多結(jié)論來自于候選基因研究,即研究者事先根據(jù)專業(yè)知識,對可能影響身高的基因進行分型,再分析其與身高的關(guān)聯(lián)性。為了從全基因組的角度更深入地理解身高的遺傳特征,對1000例美國白人男性進行了全基因組關(guān)聯(lián)性研究。經(jīng)過質(zhì)控后的數(shù)據(jù),共包括932位男性,532569個單核苷酸多態(tài)性。
在案例中,不對該案例的具體分析目標做過多規(guī)定。只是交代問題背景、研究設(shè)計和實施等基礎(chǔ)信息。由學(xué)生在對問題背景進行學(xué)習(xí)和理解后,討論并形成分析方案(protocol),在教師引導(dǎo)下,揭示數(shù)據(jù)中隱藏的各種玄機,逐漸接近問題的真相。本案例是一個遺傳流行病學(xué)的研究問題。在第一次實習(xí)課上,學(xué)生首先需要查閱文獻,了解遺傳流行病學(xué)、全基因組關(guān)聯(lián)性研究的基本概念;同時,學(xué)生應(yīng)當了解全基因組關(guān)聯(lián)性研究數(shù)據(jù)的基本格式,學(xué)會使用plink等常用遺傳統(tǒng)計分析軟件,理解不同遺傳模型的統(tǒng)計學(xué)表達,并掌握線性模型、logistic回歸模型等常用的分析方法。而在第二次課堂上,學(xué)生將在教師的引導(dǎo)下,面臨多重比較的問題。到了第三次課堂上,本以為采用多因素回歸便能達到目的,學(xué)生又將面臨人群結(jié)構(gòu)及人群分層帶來的混雜問題。在最后一次課上,學(xué)生將前幾次課的內(nèi)容進行匯總,對最終的分析結(jié)果進行匯報。學(xué)生在學(xué)習(xí)后,不但掌握流行病學(xué)中的常用設(shè)計和分析方法,深入理解各種方法的歷史變革、使用條件和結(jié)果解讀,并親自參與研究方案設(shè)計、統(tǒng)計分析計劃設(shè)計、統(tǒng)計分析編程和報告等等,全方位地加深學(xué)生對相關(guān)知識的認識和理解。
再以《現(xiàn)場調(diào)查設(shè)計》課程為例,教學(xué)目標是使學(xué)生在進行現(xiàn)場調(diào)查的設(shè)計和實施過程中,掌握必要的統(tǒng)計學(xué)理論和方法,為以后專業(yè)學(xué)習(xí)和從事實際工作時處理現(xiàn)場抽樣調(diào)查問題打下堅實基礎(chǔ)。在《現(xiàn)場調(diào)查設(shè)計》課程的綜合實驗中,引入了基于項目的實驗方式。研究問題由學(xué)生自己提出,要求學(xué)生選取醫(yī)學(xué)相關(guān)選題,提出一個研究問題;再通過自行設(shè)計問卷、研究設(shè)計和樣本量估計、調(diào)查實施、數(shù)據(jù)分析、結(jié)論匯報和辯論等形式,完成綜合實驗的過程。通過將綜合實驗和基于項目學(xué)習(xí)的方式整合,學(xué)生不斷在實踐中強化了對調(diào)查設(shè)計相關(guān)理論知識的理解和掌握,也通過實踐操作了解了調(diào)查問卷的設(shè)計、調(diào)查執(zhí)行、問卷錄入和質(zhì)控、數(shù)據(jù)分析等全過程。通過兩個學(xué)期的教學(xué),已基本形成了較為成熟的教學(xué)體系,學(xué)生能撰寫出相對質(zhì)量較高的調(diào)查論文。
筆者選取了本校4年制生物統(tǒng)計專業(yè)第4學(xué)年所開設(shè)的《流行病學(xué)中的統(tǒng)計學(xué)方法》、《現(xiàn)場調(diào)查設(shè)計》、《臨床試驗中的統(tǒng)計學(xué)方法》三門應(yīng)用導(dǎo)向的必修課程,通過案例選擇和建設(shè)、教師培訓(xùn)、過程評價等手段,在這三門課程中添加了綜合實驗的模塊。將生物統(tǒng)計學(xué)理論知識和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、預(yù)防醫(yī)學(xué)及臨床醫(yī)學(xué)知識有機交叉融合,以學(xué)生為中心,重視學(xué)生的能力培養(yǎng)。
一般而言,理論課與綜合實驗的比例是3∶1。但其與理論課程的比例及時間安排則視課程內(nèi)容而定。例如,以《流行病學(xué)中的統(tǒng)計學(xué)方法》課程為例,課程共計48個學(xué)時,每次課3學(xué)時,本課程分別在完成病例對照研究、隊列研究、交互作用的理論授課后,進行一次綜合分析,目的是針對不同類型設(shè)計,了解資料背景,撰寫分析計劃,完成數(shù)據(jù)分析,并按照STROBE指南撰寫研究報告;《現(xiàn)場調(diào)查設(shè)計》只有一個綜合分析案例(設(shè)計并完成一個實際調(diào)查),則在講授完成抽樣方式、調(diào)查表設(shè)計、統(tǒng)計分析、敏感問題調(diào)查技術(shù)后,學(xué)生分別完成綜合實驗中的一個環(huán)節(jié),最終目的是讓學(xué)生掌握現(xiàn)場調(diào)查全過程中所需的統(tǒng)計思維和統(tǒng)計方法,等等。
在案例建設(shè)的基礎(chǔ)上,每年負責(zé)課程的老師均需在開課前集體備課,總結(jié)上一輪教學(xué)中的經(jīng)驗教訓(xùn),并根據(jù)最新研究進展對案例進行修訂。最終學(xué)生的學(xué)業(yè)成績除了包含最終考試外,綜合實驗過程中的表現(xiàn)也具有相當大的權(quán)重。例如,在《現(xiàn)場調(diào)查設(shè)計》的綜合實驗中,調(diào)查方案的質(zhì)量、問卷的質(zhì)量、調(diào)查報告的撰寫水平、最終匯報的質(zhì)量及答辯的表現(xiàn),均構(gòu)成了綜合實驗最終成績的要素。
筆者分別對剛完成綜合練習(xí)的學(xué)生及已攻讀研究生的生物統(tǒng)計專業(yè)學(xué)生進行調(diào)查。本科生共計發(fā)放30份問卷,研究生共計發(fā)放10份問卷。調(diào)查結(jié)果表明,幾乎所有學(xué)生均認可,綜合練習(xí)改變了既往實習(xí)課只是做練習(xí)學(xué)軟件的過程,有75%的同學(xué)認為綜合練習(xí)的方式有助于將幾門課的知識融會貫通,特別是已經(jīng)學(xué)完的課程會被重新喚醒;但也有部分同學(xué)認為過于消耗時間。研究生同學(xué)普遍評價較高,這可能和他們本科階段學(xué)業(yè)較為優(yōu)秀有關(guān),但他們也表示確實課上學(xué)到了很多課本上沒有,但在讀研階段很有幫助的背景知識。
在多年教學(xué)實踐和教學(xué)改革過程中,筆者所在的教學(xué)團隊緊緊圍繞人才培養(yǎng)目標,全面提高生物統(tǒng)計人才的理論水平及對生物統(tǒng)計學(xué)應(yīng)用能力。通過在《流行病學(xué)中的統(tǒng)計方法》、《現(xiàn)場調(diào)查設(shè)計》等特色課程中引入綜合實驗,提高學(xué)生全面素質(zhì),使學(xué)生成為既具備統(tǒng)計學(xué)理論與思維,又具有多方面能力的復(fù)合型人才。
目前國內(nèi)醫(yī)學(xué)院校廣泛開展基于問題學(xué)習(xí)(PBL)。PBL是一種以學(xué)生為中心的,基于問題的教學(xué)方法。與以機械性記憶為主的傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)學(xué)習(xí)方式相比,在醫(yī)學(xué)院校中開展PBL教學(xué),不但傳授知識,更傳授學(xué)習(xí)的方式。而筆者教學(xué)團隊在生物統(tǒng)計專業(yè)所開展的綜合實驗教學(xué),體現(xiàn)了PBL(基于問題學(xué)習(xí))與PBL(基于項目學(xué)習(xí))的整合。
課題組基于R軟件的Shiny包,開發(fā)了“生物統(tǒng)計交互式分析平臺”。在分析平臺基礎(chǔ)上,課題組進一
步開發(fā)了模擬軟件,利用計算機產(chǎn)生隨機數(shù),模擬醫(yī)學(xué)中的隨機現(xiàn)象,服務(wù)于綜合實驗教學(xué)。課題組將進一步完善已經(jīng)開發(fā)的軟件,包裝相應(yīng)成果,進行著作權(quán)申報和推廣[7]。
盡管從實際成效看,學(xué)生反映生物統(tǒng)計學(xué)理論與方法的綜合應(yīng)用能力有所提高。但目前對于生物統(tǒng)計學(xué)綜合能力的評價,還欠缺廣泛認可的手段。筆者所在教學(xué)改革團隊已針對醫(yī)學(xué)生的學(xué)習(xí)適應(yīng)性評價等開展了研究,后期將進一步考慮統(tǒng)計分析能力考核體系的研究[8-10]。