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棉花根際土壤真菌分離及黃萎病菌拮抗菌的篩選

2021-01-13 08:46郝海婷牛冬冬阿依妮薩阿卜力海提代先興唐澤文
關(guān)鍵詞:黃萎病菌絲真菌

郝海婷 牛冬冬 阿依妮薩·阿卜力海提 代先興唐澤文 李 猛 武 剛

(1塔里木大學(xué)植物科學(xué)學(xué)院/南疆農(nóng)業(yè)有害生物綜合治理兵團(tuán)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,新疆 阿拉爾 843300)

(2南京農(nóng)業(yè)大學(xué)植物保護(hù)學(xué)院,江蘇 南京 210095)

(3新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)第一師農(nóng)業(yè)科學(xué)研究所,新疆 阿拉爾 843300)

棉花是我國(guó)重要的一種經(jīng)濟(jì)作物。新疆棉花總產(chǎn)量已連續(xù)20多年位居全國(guó)第一位[1]。隨著種植面積的不斷擴(kuò)大和連作種植,土傳病害發(fā)生嚴(yán)重,尤其是由大麗輪枝菌引起的棉花黃萎病是棉花主產(chǎn)區(qū)的重要病害,已嚴(yán)重影響棉花的產(chǎn)量和品質(zhì)[2-3]。

一直以來(lái),棉花黃萎病的防治比較困難,尚未找到根治的有效防治方法。當(dāng)前,在新疆地區(qū),棉花黃萎病的防治大多采取“預(yù)防為主,綜合防治”的植保策略,主要通過(guò)種植抗病、耐病品種以及結(jié)合輪作、深翻等措施控制棉花黃萎病蔓延[4-5]。近年來(lái),土壤消毒、種子消毒以及生物防治等手段逐漸在棉花黃萎病病害防治中開(kāi)始應(yīng)用[5-6]。

生物防治既符合人們對(duì)綠色環(huán)保的需求,又可為農(nóng)業(yè)可持續(xù)發(fā)展提供保障,現(xiàn)已成為防治植物病害的研究熱點(diǎn)。生物防治方法中,利用有益微生物防治各種植物病害是切實(shí)可行的策略之一[7]。對(duì)植物病害有拮抗效果的有益微生物包括真菌、細(xì)菌和放線菌。拮抗真菌大多存在于植物根系和葉圍,對(duì)植物有著很好的親合性,在作物上定植,生防效果穩(wěn)定,拮抗菌分泌次級(jí)代謝產(chǎn)物,通過(guò)直接或間接的方式,達(dá)到阻礙或殺死病原菌的效果[8-9]。因此,尋找環(huán)境中高效、多功能的生防微生物是目前棉花黃萎病防治的發(fā)展方向[10]。

本研究通過(guò)對(duì)田間3株健康棉花的根際土壤真菌進(jìn)行分離和純化,利用皿內(nèi)對(duì)峙方法篩選對(duì)棉花黃萎病菌有抑制效果的拮抗菌,并利用分子方法鑒定菌種,明確其種屬地位,為研制防治棉花黃萎病的高效綠色微生物制劑提供菌種資源。

1 材料與方法

1.1 土壤拮抗真菌的分離、純化、形態(tài)觀察

棉花品種為新陸中37。選取棉田3個(gè)不同點(diǎn)分別取棉花根際土樣,每個(gè)點(diǎn)選擇一株健康棉花根際土壤。棉花根際土樣真菌分離采用稀釋平板法。具體步驟為:取棉花根際土樣5 g,懸浮于45 ml無(wú)菌水中,在水平搖床上以80 rpm、25℃條件下振蕩培養(yǎng)20 min,即得懸液,并以此稀釋至10-5倍。采用PDA培養(yǎng)基,用移液器分別取土壤稀釋液0.1 mL涂布于PDA培養(yǎng)基平板上,25℃培養(yǎng)4~5 d,選取生長(zhǎng)良好的菌落繼續(xù)純化3次,觀察記錄。

1.2 棉花根際土壤微生物DNA提取

一種快速提取DNA的方法,具體步驟如下所示。第一步:無(wú)菌條件下,用無(wú)菌槍頭挑純化好的菌絲到1.5 mL離心管;第二步:加入50 uL 10*TE buffer溶液,振蕩分散菌絲;第三步:封口,微波爐700 W 2 min;第四步:取出立即冰浴2 min,然后離心10 min;第五步:移液器緩慢取10 uL上清液作為PCR模板。

1.3 拮抗真菌的分子鑒定

以提取DNA為模板進(jìn)行rDNA-ITS、EF-1α、βtubulin和ACT基因測(cè)序,在NCBI網(wǎng)站進(jìn)行Blast比對(duì),選取序列同源性比較值較高的作為參考菌株,評(píng)估物種的相似度。所用引物序列見(jiàn)表1。

PCR反應(yīng)體系為25 uL:DNA模板1 uL,2×Es Taq Master Mix12.5 uL,引物-F0.3 uL,引物-R0.3 uL,ddH2O 10.9 uL。PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),然后送生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序。

1.4 抑菌實(shí)驗(yàn)

通過(guò)平板對(duì)峙法測(cè)定分離真菌對(duì)大麗輪枝菌的拮抗效果,具體步驟:在新鮮固體PDA培養(yǎng)皿正中間用記號(hào)筆分別在距離點(diǎn)2.5 cm左右兩側(cè)同一水平線上做標(biāo)記;用8 mm無(wú)菌打孔器在大麗輪枝菌培養(yǎng)皿邊緣打孔,菌餅菌絲面朝下放入PDA左側(cè)標(biāo)記處,封口,放入28℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)5~7 d(大麗輪枝菌生長(zhǎng)緩慢);生長(zhǎng)5~7 d的大麗輪枝菌培養(yǎng)基另一端加入純化后的分離真菌,同樣用8 mm無(wú)菌打孔器打孔,菌餅菌絲面朝下放入,28℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),直至產(chǎn)生抑菌圈;對(duì)照是在新鮮固體PDA培養(yǎng)皿左側(cè)標(biāo)記點(diǎn)打上8 mm大麗輪枝菌菌餅,右側(cè)標(biāo)記點(diǎn)打8 mm PDA空白菌餅,放入28℃培養(yǎng)箱培養(yǎng);每個(gè)實(shí)驗(yàn)三個(gè)生物學(xué)重復(fù)。

表1 所用引物序列及其來(lái)源

計(jì)算抑菌率:抑菌率=(對(duì)照組真菌菌落生長(zhǎng)直徑-處理組真菌菌落生長(zhǎng)直徑)/對(duì)照組真菌菌落生長(zhǎng)直徑×100%。抑菌率數(shù)值越高說(shuō)明抑菌作用越強(qiáng),拮抗效果越好。

1.5 數(shù)據(jù)處理

使用Excel對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理;使用Bioedit進(jìn)行序列整理,進(jìn)一步在NCBI上比對(duì)。

2 結(jié)果與分析

2.1 棉花根際土壤真菌的分離情況

采用稀釋平板法進(jìn)行菌株的分離與純化,從3份土壤樣本中分離獲得若干菌株,針對(duì)這些分離真菌的菌落形態(tài)特征進(jìn)行初步判斷,將這些菌株分為3大類。第一類菌株包括C11,菌株C11接種至PDA培養(yǎng)基中,培養(yǎng)5 d后,菌落正面呈白色,背面呈淡黃色,邊緣菌絲形狀不規(guī)則(圖1:A和B);第二類菌株包括C41、A21和C421,菌落呈波浪狀或高山狀,氣生菌絲呈白色,且輻射狀蔓延,有的菌株有白色菌絲隆起,7 d后菌絲幾乎鋪滿整個(gè)培養(yǎng)皿,基內(nèi)菌絲多層重疊(圖 1:C和 D);第三類菌株包括 B11、B51、C31和C91,菌落正面呈白色,5 d左右后背面呈淡粉色,菌絲發(fā)達(dá),絨毛狀(圖1:E和F)。

圖1 代表菌株菌落形態(tài)圖

2.2 棉花黃萎病拮抗菌的篩選

采用皿內(nèi)對(duì)峙法對(duì)分離真菌進(jìn)行抑菌試驗(yàn)(見(jiàn)表2、圖2)。結(jié)果顯示,與對(duì)照相比,分離出的每株真菌都對(duì)棉花黃萎病菌有一定的抑制作用,抑菌率為29.51%~42.86%,說(shuō)明這些菌可能產(chǎn)生了具有抑制棉花黃萎病菌活性的代謝產(chǎn)物。

表2 棉花根際土壤分離真菌對(duì)棉花黃萎病菌的抑制效果

圖2 棉花根際土壤分離真菌對(duì)棉花黃萎病菌菌絲生長(zhǎng)的抑制作用

2.3 棉花根際土壤真菌的分子生物學(xué)鑒定結(jié)果

采用通用引物ITS1和ITS4,擴(kuò)增8株菌株,得到的片段長(zhǎng)度為570~680 bp之間(見(jiàn)表3);分別采用EF-1α、β-tubulin和ACT基因擴(kuò)增根際土壤真菌,擴(kuò)增片段范圍分別為 216~229 bp、329~439 bp和 268~274 bp。

將測(cè)序結(jié)果進(jìn)一步和NCBI上的基因序列進(jìn)行比對(duì)(表3),結(jié)果表明:分離獲得的B11菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉Clonostachys rosea菌株的ITS序列同源性為99.83%(登錄號(hào)KX058045.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為97.99%(登錄號(hào)MK752496.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為98.07%(登錄號(hào)KJ413352.1)、Actin序列與C.rosea菌株同源性為98.85%(登錄號(hào)MH102067.1)。分離獲得的B51菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性為99.82%(登錄號(hào)MT845995.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為98.01%(登錄號(hào)MK752496.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為98.37%(登錄號(hào)AF358166.1)。分離獲得的C31菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性為99.83%(登錄號(hào) KX058045.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為97.99%(登錄號(hào)MK752496.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為96.90%(登錄號(hào)KJ413352.1)、Actin序列與C.rosea菌株同源性為99.23%(登錄號(hào)MH102067.1)。分離獲得的C91菌,其ITS序列與粉紅粘帚霉C.rosea菌株的ITS序列同源性為 99.83%(登錄號(hào)KX058045.1)、EF-1α序列與C.rosea菌株同源性為99.49%(登錄號(hào)MT462122.1)、β-tubulin序列與C.rosea菌株同源性為97.83%(登錄號(hào)KJ413352.1)。

分離獲得的C11菌,其ITS序列與球毛殼菌Chaetomium globosum菌株的ITS序列同源性為100.00%(登錄號(hào)MN809366.1);C41、A21和C421菌株,其ITS序列與高山被孢霉Mortierella alpina菌株的ITS序列同源性分別為99.41%(登錄號(hào)MF093212.1)、99.71%(登錄號(hào)KX343169.1)和99.56%(登錄號(hào)MT453270.1)。

根據(jù)分子研究結(jié)果,結(jié)合形態(tài)學(xué)的初步鑒定,該8株菌中B11、B51、C31和C91為C.rosea,歸屬于真菌界,半知菌門(mén),叢梗孢科,粘帚霉屬;C41、A21和C421為M.alpina,歸屬于真菌界,接合菌門(mén),被孢霉科,被孢霉屬;C11菌株為C.globosum,歸屬于真菌界,子囊菌門(mén),毛殼科,毛殼屬。

表3 棉花根際土壤真菌的rDNA-ITS、EF-1α、β-tubulin和ACT序列相似性分析

3 討論與結(jié)論

粉紅粘帚霉是重要的生防真菌,具有生長(zhǎng)速度快、產(chǎn)孢量大、拮抗能力強(qiáng)等多種優(yōu)點(diǎn),除了對(duì)病原菌有重寄生、抗生、溶菌、競(jìng)爭(zhēng)作用外,還能誘導(dǎo)植物產(chǎn)生系統(tǒng)抗性[11],有良好的開(kāi)發(fā)和應(yīng)用價(jià)值。高航等[12]研究發(fā)現(xiàn)粉紅粘帚霉有較強(qiáng)的寄生能力,對(duì)林果枝干病害病原菌抑制率達(dá)60%以上;趙士振等[13]研究發(fā)現(xiàn)粉紅粘帚霉對(duì)果蔬灰霉病有很好的防效,能有效的寄生灰霉菌核及抑制孢子的產(chǎn)生;楊蕊等[14]研究發(fā)現(xiàn)粉紅粘帚霉菌絲可以重寄生苗期玉米莖基腐病病原菌菌絲,導(dǎo)致病菌菌絲細(xì)胞原生質(zhì)顆?;⒔?,從而達(dá)到防治效果。但目前有關(guān)粉紅粘帚霉防治棉花黃萎病的報(bào)道較少,有待進(jìn)一步圍繞粉紅粘帚霉防治棉花黃萎病開(kāi)展系統(tǒng)研究。

本研究還分離出一株在農(nóng)業(yè)和工業(yè)都有應(yīng)用的球毛殼菌。該菌對(duì)病原微生物和蚜蟲(chóng)的生物防治有顯著作用[15-17],可產(chǎn)生大量有生物活性的次級(jí)代謝物[18],如球毛殼菌素,具有廣譜拮抗性和抗逆性,對(duì)多種作物病害具有良好的防治效果?,F(xiàn)有研究結(jié)果表明,球毛殼菌作為拮抗菌對(duì)三七根腐病[19]、油菜根腫病[20]、玉米大斑病[21]以及南方根結(jié)線蟲(chóng)[22]都有很好的防治效果。新疆棉花的產(chǎn)量和品質(zhì)主要受棉花黃萎病和棉蚜的影響,后續(xù)有必要將球毛殼菌作為潛在的棉花黃萎病和棉蚜防治菌,采用以菌治菌、以菌治蟲(chóng)的防治策略,開(kāi)發(fā)利用球毛殼菌防治棉花病蟲(chóng)害。

綜上所述,本研究通過(guò)對(duì)棉花根際土壤真菌的研究,獲得的2株潛在拮抗菌(粉紅粘帚霉和球毛殼菌),可為進(jìn)一步有效防治棉花黃萎病提供菌種資源[23],對(duì)后續(xù)棉花黃萎病在生物防治方面的研究具有重要意義。

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