孫 科 耿鳳英 于秋菊 王 鋒
(徐州生物職業(yè)技術(shù)學(xué)院藥品食品學(xué)院,江蘇徐州 221006)
牛蒡(Arctium lappaL.)為菊科牛蒡?qū)僦参?,是一種典型的藥食同源植物(徐孝梁,2015),具有降血壓、降血脂、抗病毒、抗腫瘤等作用(伏卉等,2015)。中國(guó)牛蒡產(chǎn)量居世界第一(趙凱 等,2015),而徐州市豐縣的牛蒡種植面積大約占全國(guó)種植面積的70%,因此,徐州豐縣有“牛蒡之鄉(xiāng)”之稱(任媛媛 等,2016)。
磷是牛蒡生長(zhǎng)發(fā)育重要的營(yíng)養(yǎng)元素之一。雖然土壤中含磷量較高,但95%以上的磷元素是以植物體不能吸收的方式存在的(閆小梅 等,2015)。因此,要滿足牛蒡生長(zhǎng)對(duì)磷的需求就要靠施用磷肥,而磷肥的施用不僅增加生產(chǎn)成本,還容易造成土壤、水體等環(huán)境的污染(劉文干 等,2012)。在土壤中存在一些微生物利用自身的代謝功能,把土壤中植物不能利用的磷轉(zhuǎn)化為植物可以利用的磷,人們稱其為解磷微生物或解磷菌(phosphatesolubilizing microorganisms)(趙越 等,2013)。國(guó)家提倡建立資源節(jié)約型、環(huán)境友好型可持續(xù)發(fā)展的農(nóng)業(yè)(銀婷婷 等,2015),解磷菌成為現(xiàn)代生態(tài)農(nóng)業(yè)的研究熱點(diǎn)之一(史國(guó)英 等,2015)。目前,有關(guān)解磷微生物菌肥研究較多,但是針對(duì)牛蒡?qū)S脧?fù)合微生物有機(jī)肥的研究還鮮見報(bào)道。本試驗(yàn)從牛蒡根際土壤分離篩選解磷菌并通過16S rDNA 進(jìn)行菌種鑒定和解磷條件優(yōu)化,為牛蒡?qū)S糜袡C(jī)肥提供解磷微生物菌劑。
1.1.1 材料 通過5 點(diǎn)取樣法在徐州市豐縣牛蒡標(biāo)準(zhǔn)化種植基地采集牛蒡根際5~15 cm深土壤樣本,裝入無菌牛皮紙袋密封。
1.1.2 試 劑 濃H2SO4、Na2CO3、Ca3(PO4)2、NaCl、MnSO4、(NH4)2SO4、MgSO4、FeSO4、KCl、KH2PO4、葡萄糖(分析純)購(gòu)自格里斯(天津)醫(yī)藥化學(xué)技術(shù)有限公司;酵母浸膏、酵母粉、蔗糖、瓊脂購(gòu)自北京陸橋技術(shù)股份有限責(zé)任公司;升汞(試劑級(jí))購(gòu)自廣州達(dá)威化工有限公司;二硝基酚、溴酚藍(lán)購(gòu)自深圳子科生物科技有限公司;(NH4)6Mo7O24·H2O(分析純)購(gòu)自杭州邦易化工有限公司;KSbOC4H4O6·1/2H2O(分析純)購(gòu)自廣州市錦源化學(xué)有限公司;C6H8O6(抗壞血酸)(分析純)購(gòu)自無錫市亞泰聯(lián)合化工有限公司。
1.1.3 培養(yǎng)基 改良PVK 固體培養(yǎng)基:Ca3(PO4)25.0 g·L-1,NaCl 0.2 g·L-1,MnSO40.002 g·L-1,(NH4)2SO40.5 g·L-1,MgSO40.1 g·L-1,F(xiàn)eSO40.002 g·L-1,KCl 0.2 g·L-1,葡萄糖10.0 g ·L-1,瓊脂18 g·L-1,雙蒸水1 000 mL,pH值7.0~7.2。
改良PVK 液體培養(yǎng)基:在改良PVK 固體培養(yǎng)基基礎(chǔ)上去掉瓊脂。
NBRIP 固 體 培 養(yǎng) 基:NaCl 0.2 g·L-1,Ca3(PO4)25.0 g·L-1,MgSO40.1 g·L-1,(NH4)2SO40.5 g·L-1,蔗糖 15.0 g·L-1,瓊脂 18 g ·L-1,雙蒸水1 000 mL,pH 值6.8~7.0。
NBRIP 液體培養(yǎng)基:在NBRIP 固體培養(yǎng)基基礎(chǔ)上去掉瓊脂。
LB 液體培養(yǎng)基:NaCl 10.0 g·L-1,酵母提取物 5.0 g·L-1,胰蛋白胨10.0 g·L-1,雙蒸水1 000 mL,pH 值6.8~7.2。
VD-850 臺(tái)式超凈工作臺(tái)(杭州旭清科技有限公司),XW-80A 漩渦混合器(廣森實(shí)驗(yàn)器材有限公司),BX43/53 生物顯微鏡(北京瑞科中儀科技有限公司),HZ-124/85S 半微量電子天平(上海諾宣科學(xué)儀器有限公司),LH-PYX3M 生化培養(yǎng)箱(常州金南儀器制造有限公司),HNY-200B 恒溫?fù)u床(上海喬躍電子科技有限公司),TDZ4 離心機(jī)(青島諾凱達(dá)機(jī)械制造有限公司),UV2800S 紫外分光光度計(jì)(上海力辰儀器科技有限公司)。
1.3.1 解磷菌富集培養(yǎng) 在裝有100 mL 滅過菌的改良PVK 液體培養(yǎng)基的250 mL 三角瓶中加入1 g土壤,置于恒溫?fù)u床28 ℃、200 r·min-1振蕩培養(yǎng)。36 h 后,取10 mL 培養(yǎng)液接種于100 mL 滅過菌的改良PVK 液體培養(yǎng)基繼續(xù)富集培養(yǎng);連續(xù)富集培養(yǎng)3 次。
1.3.2 解磷菌初篩 取富集培養(yǎng)菌液,采用平板涂布的方法接種于改良PVK 固體培養(yǎng)基上,28 ℃倒置培養(yǎng)60 h。挑選帶有透明圈的菌落,通過劃線的方法進(jìn)行菌株的分離純化。重復(fù)以上操作3~5 次,得到產(chǎn)生透明圈的解磷菌純菌落,并測(cè)量記錄菌落直徑(d)及透明圈直徑(D)。選擇D/d 值較大的菌落,斜面保藏備用。
1.3.3 解磷菌復(fù)篩 將1.3.2 初篩挑選出的菌株接種到改良PVK 液體培養(yǎng)基上,28 ℃、180 r·min-1培養(yǎng)20 h 后,每隔2 h 取樣涂平板檢查活菌數(shù)。當(dāng)活菌數(shù)達(dá)到1×108CFU·mL-1,取5 mL 菌液接種于50 mL 滅過菌的NBRIP 液體培養(yǎng)基,28 ℃、180 r·min-1培養(yǎng)5 d。5 d 后轉(zhuǎn)接入滅菌離心管中,10 000 r·min-1離心20 min,取上清液;采用鉬銻抗比色法進(jìn)行可溶性磷含量的測(cè)定,同時(shí)利用pH 計(jì)測(cè)定培養(yǎng)液的pH 值。每株進(jìn)行3 次平行試驗(yàn),以滅完菌但沒接種的NBRIP 液體培養(yǎng)基作空白對(duì)照。
1.3.4 解磷菌的土壤試驗(yàn) 在直徑25 cm 的培養(yǎng)盆中裝入新鮮牛蒡田土壤5 000 g 和100 g 處理過的檸檬酸發(fā)酵廢渣,加入復(fù)篩后的解磷菌發(fā)酵液500 mL,以添加500 mL 無菌水為空白對(duì)照,28 ℃培養(yǎng)30 d。30 d 后以去離子水處理試驗(yàn)土壤制備土壤懸液,采用鉬銻抗比色法測(cè)定可溶性磷含量。設(shè)3次平行試驗(yàn)。
1.3.5 解磷菌株的鑒定 形態(tài)觀察:借助BX43 生物顯微鏡油鏡進(jìn)行菌株的形態(tài)特征觀察,在NBRIP固體培養(yǎng)基上觀察菌落特征。
生理生化特性鑒定:生理生化特性鑒定參考文獻(xiàn)(Bashan et al.,2013;Liu et al.,2014)的方法。
16S rDNA 序 列 分 析(Vassilev et al.,2012):利用北京Solarbio 公司細(xì)菌基因組提取DNA 試劑盒提取純化的菌株DNA。使用通用引物F:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,R:5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′。采 用PCR 法克隆菌株基因組DNA 的16S rDNA 基因。PCR 反應(yīng)體系20 μL:10×PCR 緩沖液2 μL,模板DNA 20 ng,dNTPs(10 mmol·L-1)0.45 μL,上、下游引物(20 μL·L-1)各0.25 μL,TaqDNA 聚合酶0.4 μL,加ddH2O 至終體積。PCR 擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,55.5 ℃退火45 s,72 ℃延伸2 min,共35 個(gè)循環(huán);72 ℃最后延伸10 min?;厥窄傊悄zPCR 克隆片段,送至南京世和基因生物技術(shù)有限公司進(jìn)行基因測(cè)序,測(cè)序結(jié)果和NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),利用Mega 6 軟件進(jìn)行發(fā)育進(jìn)化樹的構(gòu)建。
1.3.6 解磷菌株解磷能力測(cè)定 采用鉬銻抗比色法進(jìn)行可溶性磷含量的測(cè)定(Mehta et al.,2013;Zeng et al.,2017)。
1.3.7 溫度對(duì)菌株解磷的影響 把培養(yǎng)的菌液以2%的接種量接種到含有100 mL NBRIP 液體培養(yǎng)基的250 mL 三角瓶中,分別放于5、10、15、20、25、30、35、40 ℃恒溫培養(yǎng)箱中,180 r·min-1培養(yǎng)3 d,每個(gè)溫度進(jìn)行3 次平行試驗(yàn),培養(yǎng)結(jié)束后采用鉬銻抗比色法進(jìn)行可溶性磷含量的測(cè)定。
1.3.8 初始pH 值對(duì)菌株解磷的影響 把培養(yǎng)的菌液以2%的接種量接種到含有100 mL NBRIP 液體培養(yǎng)基的250 mL 三角瓶中,NBRIP 液體培養(yǎng)基初始pH 值分別為2、3、4、5、6、7、8、9,放入28℃恒溫培養(yǎng)箱中,180 r·min-1培養(yǎng)3 d,每個(gè)初始pH 值進(jìn)行3 次平行試驗(yàn),培養(yǎng)結(jié)束后采用鉬銻抗比色法進(jìn)行可溶性磷含量的測(cè)定。
1.3.9 鹽濃度對(duì)菌株解磷的影響 把培養(yǎng)的菌液以2%的接種量接種到含有100 mL NBRIP 液體培養(yǎng)基的250 mL 三角瓶中,NBRIP 液體培養(yǎng)基鹽濃度(NaCl 濃度)分別為3、6、9、12、15、18、21、24 g·L-1,放入28 ℃恒溫培養(yǎng)箱中,180 r·min-1培養(yǎng)3 d,每個(gè)鹽濃度進(jìn)行3 次平行試驗(yàn),培養(yǎng)結(jié)束后采用鉬銻抗比色法進(jìn)行可溶性磷含量的測(cè)定。
把通過3 次富集培養(yǎng)的菌液進(jìn)行平板涂布,共獲得61 株菌株,其中具有明顯透明圈(溶磷圈)的菌株24 株,即具有解磷能力菌株24 株,對(duì)其進(jìn)行編號(hào)PSM-1~PSM-24。對(duì)菌落直徑(d)和透明圈直徑(D)進(jìn)行測(cè)量,并計(jì)算比值(D/d)。從表1 可以看出,菌株P(guān)SM-1、PSM-2、PSM-5、PSM-9、PSM-14、PSM-15、PSM-17、PSM-22 和PSM-24 的D/d 值較大,都大于1.5。說明這9 株菌株的解磷能力較強(qiáng),作為出發(fā)菌株進(jìn)行復(fù)篩。
2.2.1 解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量測(cè)定 將初篩挑選出來的9 株D/d 值大于1.5 的解磷菌作為復(fù)篩的出發(fā)菌株,按1.3.3 的方法復(fù)篩。9 株解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量如圖1 所示??梢钥闯? 株解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量均顯著高于對(duì)照,表明復(fù)篩的9 株解磷菌解磷能力較強(qiáng)。特別是PSM-5菌株培養(yǎng)液中可溶性磷含量達(dá)到198.28 mg·L-1,PSM-22 菌株培養(yǎng)液中可溶性磷含量達(dá)到173.58 mg·L-1,PSM-9 菌株培養(yǎng)液中可溶性磷含量達(dá)到了166.43 mg·L-1,挑選這3 株菌株進(jìn)一步進(jìn)行小范圍的土壤試驗(yàn)。
表1 解磷菌菌落直徑(d)、溶磷圈直徑(D)和D/d 值
2.2.2 復(fù)篩解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量與初篩解磷菌D/d 值的相關(guān)性 對(duì)解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量和解磷菌溶磷圈直徑(D)與解磷菌菌落直徑(d)比值進(jìn)行相關(guān)性分析,結(jié)果如圖2 所示??梢钥闯觯篟=0.988 5、P<0.05,解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量和D/d 值呈顯著的正相關(guān)性。也就是說D/d值越大,解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量越高。
2.2.3 解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量與培養(yǎng)液pH值的相關(guān)性 從圖3 可以看出,9 株解磷菌培養(yǎng)液和對(duì)照pH 值的大小順序?yàn)椋篊K >PSM-2 >PSM-1 >PSM-15 >PSM-17 >PSM-24 >PSM-14 >PSM-9 >PSM-22 >PSM-5,9 株解磷菌培養(yǎng)液的pH 值均顯著低于對(duì)照。對(duì)比圖1 可以看出,培養(yǎng)液pH 值大小順序和可溶性磷含量大小順序正好相反,即解磷能力強(qiáng)的菌株產(chǎn)酸能力也強(qiáng)。
對(duì)9 株解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量與pH值進(jìn)行相關(guān)性分析,如圖4 所示??梢钥闯觯篟=-0.986 1、P<0.05,解磷菌培養(yǎng)液中可溶性磷含量與pH 值之間具有顯著的負(fù)相關(guān)性。即解磷菌解磷能力越強(qiáng),產(chǎn)酸能力也越強(qiáng);解磷菌解磷能力弱,產(chǎn)酸能力也差。原因可能是解磷菌在代謝過程中產(chǎn)生某些酸性物質(zhì),降低了環(huán)境中的pH 值,而pH 值的降低有利于磷的溶出,這也和現(xiàn)有研究結(jié)果(Gong et al.,2013)一致。
將復(fù)篩中培養(yǎng)液可溶性磷含量較高的3 株解磷菌PSM-5、PSM-22 和PSM-9 挑選出來,按1.3.4的方法進(jìn)行土壤測(cè)試試驗(yàn)。從圖5 可以看出:3 株解磷菌在土壤中培養(yǎng)30 d,土壤中可溶性磷含量在前20 d 都呈現(xiàn)直線增加的趨勢(shì),但之后出現(xiàn)下降趨勢(shì),而對(duì)照的可溶性磷含量一直處于較低的水平??梢娊饬拙臃N土壤可以提高土壤中可溶性磷含量。而土壤中可溶性磷含量呈現(xiàn)先增加后減少的趨勢(shì),可能是因?yàn)榍捌谕寥乐袪I(yíng)養(yǎng)物質(zhì)較為豐富,隨著時(shí)間推移營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)逐漸消耗,解磷菌的活力下降,所以制備牛蒡?qū)S蒙镉袡C(jī)肥除了微生物菌劑之外還要有足夠的營(yíng)養(yǎng)輔料。從圖5 還可以看出,雖然3 株解磷菌都可以增加土壤中可溶性磷含量,但與實(shí)驗(yàn)室的結(jié)果(2.2.1)相差甚遠(yuǎn),原因可能與解磷菌培養(yǎng)基的豐富程度、培養(yǎng)條件、菌體的適用性等有關(guān)??傮w看來,3 株解磷菌中PSM-5 的表現(xiàn)最好。
2.4.1 菌株P(guān)SM-5 的形態(tài)特征鑒定及生理生化特征鑒定 菌株P(guān)SM-5 在NBRIP 固體培養(yǎng)基平板培養(yǎng)2 d 后,菌落形態(tài)如圖6 所示。菌落圓形,不透明,乳白色,表明光滑、隆起,邊緣濕潤(rùn),菌落周圍有明顯的溶磷圈。圖7 為菌株顯微鏡下形態(tài),PSM-5 革蘭氏染色陰性,顯微鏡下呈棒狀,大小為(0.5~0.7)μm×(1.5~2.2)μm,單生或成對(duì)存在。菌株有芽孢、菌毛,無鞭毛。菌株P(guān)SM-5 生理生化特性見表2。
表2 菌株P(guān)SM-5 生理生化特性
2.4.2 菌株P(guān)SM-5 的16S rDNA 基因鑒定結(jié)果從圖8 可以看出,菌株P(guān)SM-5 的擴(kuò)增產(chǎn)物在1 500 kb 處有1 條明亮的條帶,說明基因片段純度較高,DNA 長(zhǎng)度大約為1 500 kb。經(jīng)檢測(cè),菌株P(guān)SM-5 的16S rDNA 長(zhǎng)度為1 406 個(gè)堿基。將測(cè)序結(jié)果和NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì),從NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù)中選取與菌株P(guān)SM-5 同源性大于95%作為模式菌種,采用NJ 法(鄰接法)構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。從圖9 可以看出,菌株P(guān)SM-5 與Bacillus subtilis(GenBank:EU233271)相似度達(dá)到99.9%以上,親緣關(guān)系最近。結(jié)合菌株P(guān)SM-5 的菌落特征、顯微觀察特征和生理生化特性,將菌株P(guān)SM-5 鑒定為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis)。
2.5.1 溫度對(duì)菌株P(guān)SM-5 解磷的影響 從圖10 可以看出,菌株P(guān)SM-5 解磷的溫度范圍較廣:5~40℃都具有解磷能力,只是兩端的解磷能力較低。適宜的解磷溫度為25~32 ℃,最適解磷溫度是28℃,對(duì)應(yīng)的可溶性磷含量最高并達(dá)到顯著水平(P<0.05)。根據(jù)回歸方程求解,菌株P(guān)SM-5 解磷的最適溫度是28.46 ℃。原因可能是溫度影響菌株P(guān)SM-5 酶的催化活性,從而影響菌株解磷能力,而28.46 ℃正好是菌株酶最適催化溫度。
2.5.2 初始pH 值對(duì)菌株P(guān)SM-5 解磷的影響 從圖11 可以看出,初始pH 值較低時(shí),菌株P(guān)SM-5 解磷能力較強(qiáng),可溶性磷含量較高。隨著初始pH 值升高,菌株的解磷能力迅速下降,pH 值為9 時(shí),可溶性磷含量已降到5 mg·L-1以下。初始pH 值在3.5~4.5 之間,菌株解磷能力最強(qiáng),可溶性磷含量最高,根據(jù)回歸方程求解,菌株P(guān)SM-5 解磷的最適初始pH 值是3.79。原因可能是環(huán)境的pH 值會(huì)影響菌株P(guān)SM-5 酶活性,影響菌體代謝,從而影響菌株的產(chǎn)酸和酶的分泌,進(jìn)而影響菌株的解磷能力。
2.5.3 鹽濃度對(duì)菌株P(guān)SM-5 解磷的影響 從圖12 可以看出,當(dāng)鹽濃度低于12 g·L-1時(shí),隨著鹽濃度增加可溶性磷含量迅速增加,即菌株P(guān)SM-5解磷能力迅速增加。當(dāng)鹽濃度高于12 g·L-1時(shí),隨著鹽濃度增加可溶性磷含量迅速降低,菌株P(guān)SM-5解磷能力迅速減小。當(dāng)鹽濃度為9~12 g·L-1時(shí),可溶性磷含量最大,根據(jù)回歸方程求解,菌株P(guān)SM-5 解磷最適的鹽濃度為10.46 g·L-1。原因可能是鹽濃度影響菌株的滲透壓,從而影響了細(xì)胞膜的透性,有利于菌株分泌酸性物質(zhì)和酶。
本試驗(yàn)從徐州豐縣牛蒡種植區(qū)土壤中初篩出具有解磷能力的微生物24 株,通過測(cè)定可溶性磷含量復(fù)篩出9 株解磷能力較強(qiáng)的菌株,利用土壤接種方法最終篩選出解磷能力最強(qiáng)的菌株P(guān)SM-5。通過菌落特征和顯微特征觀察、生理生化特性測(cè)定和16S rDNA 測(cè)定,最終確定PSM-5 為枯草芽孢桿菌(Bacillus subtilis),同時(shí)優(yōu)化了不同溫度、初始pH 值和鹽濃度條件下菌株P(guān)SM-5 的解磷最優(yōu)條件。要達(dá)到最大可溶性磷含量菌株P(guān)SM-5 最適的培養(yǎng)溫度、初始pH 值和鹽濃度分別為:28.46 ℃、3.79 和10.46 g·L-1。
本試驗(yàn)篩選出的解磷菌PSM-5 具有相對(duì)較強(qiáng)的解磷能力,28 ℃、180 r·min-1條件下培養(yǎng)5 d,菌株培養(yǎng)液中可溶性磷含量達(dá)到198.28 mg·L-1。呂睿等(2017)從陜西省西安市周至縣獼猴桃園農(nóng)田土壤中分離出具有高效降解無機(jī)磷能力的菌株JWP3,鑒定結(jié)果為膠質(zhì)芽孢桿菌(Paenibacillus mucilaginosus),當(dāng)接種量為4%、培養(yǎng)溫度30 ℃、搖床轉(zhuǎn)速200 r·min-1、初始pH 值為7 時(shí),培養(yǎng)液中可溶性磷含量最高可達(dá)99.56 mg·L-1。蘇輝蘭等(2019)以廣西鐘山縣貢柑果園土壤為試驗(yàn)材料進(jìn)行解磷菌篩選,篩選出解磷菌株W3 初步鑒定為黃絲曲霉屬(Talaromyces),當(dāng)接種量為7%、培養(yǎng)溫度30 ℃、搖床轉(zhuǎn)速220 r·min-1、培養(yǎng)時(shí)間7 d 時(shí),培養(yǎng)液中可溶性磷含量最高可達(dá)148.57 mg·L-1。本試驗(yàn)對(duì)菌株P(guān)SM-5 進(jìn)行了土壤試驗(yàn),后續(xù)還將進(jìn)行盆栽試驗(yàn)、大田試驗(yàn),逐步對(duì)菌株進(jìn)行馴化,使其真正成為牛蒡?qū)S蒙镉袡C(jī)肥的解磷菌劑,為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)服務(wù)。