姜夢(mèng)珂,李孟霜,李中源,曾忠秀,楊林美,杜 欣,李淑英
(玉溪師范學(xué)院 化學(xué)生物與環(huán)境學(xué)院,云南 玉溪 653100)
無(wú)花果藥食兼用,具有較高的藥用、營(yíng)養(yǎng)及經(jīng)濟(jì)價(jià)值,且無(wú)花果適應(yīng)性強(qiáng),種植簡(jiǎn)單,采收期長(zhǎng),產(chǎn)值較高,是一種高效益的特色種植果林品種[1],果實(shí)及其葉具有顯著的抗癌與抗腫瘤、增強(qiáng)免疫力、抗氧化、抑菌作用[2-3]。無(wú)花果的這些營(yíng)養(yǎng)價(jià)值與藥用功效一定程度上與其器官中的內(nèi)生菌有關(guān)[4-5]。植物內(nèi)生菌與高等植物在長(zhǎng)時(shí)間的協(xié)同進(jìn)化中,與植物體內(nèi)物質(zhì)或根際分泌物等相互作用,可以提高宿主植物次生代謝產(chǎn)物生產(chǎn)能力等[6],無(wú)花果根、莖、葉及果實(shí)中含有豐富的內(nèi)生菌,包括具有發(fā)酵性能酵母菌和具有抑菌性能的細(xì)菌、真菌[7],劉瑞[8]等人從無(wú)花果葉內(nèi)篩到5株內(nèi)生真菌并進(jìn)行了分類鑒定和抑菌活性測(cè)定,陳正培[9]等人從百香果果漿分離到的3株內(nèi)生細(xì)菌研究認(rèn)為其生長(zhǎng)最適pH值均為5.5,分析認(rèn)為與內(nèi)生細(xì)菌的存在環(huán)境有關(guān)。本文選擇無(wú)花果作為實(shí)驗(yàn)材料,從其果實(shí)內(nèi)分離篩選出兩株活性內(nèi)生細(xì)菌,通過(guò)形態(tài)特征觀察及分子生物學(xué)方法鑒定,確定其分類地位,并對(duì)它們的耐堿性、耐鹽性及產(chǎn)淀粉酶能力等生物學(xué)特征進(jìn)行了研究,為兩株無(wú)花果活性內(nèi)生細(xì)菌的進(jìn)一步利用奠定基礎(chǔ)。
無(wú)花果(FicuscaricaLinn.):超市購(gòu)買;菌株:金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus),湖北保藏中心購(gòu)買;大腸桿菌(Escherichiacoli)及變形桿菌(P.vulgaris),本校微生物實(shí)驗(yàn)室保存。
LB培養(yǎng)基:胰蛋白胨10g,酵母提取物5g,NaCl10g,瓊脂粉15g,蒸餾水1000ml。
淀粉培養(yǎng)基:牛肉膏5g,蛋白胨10g,可溶淀粉20g,瓊脂粉20g,NaCl5g,蒸餾水1000ml。
新鮮無(wú)花果經(jīng)無(wú)菌水沖洗后用75%乙醇浸泡2min,無(wú)菌水沖洗3次,再用3% NaClO溶液浸泡3min,無(wú)菌水沖洗3次。無(wú)菌刀切為小塊后轉(zhuǎn)入研缽加100ml無(wú)菌水與滅菌石英砂充分研磨。取0.5ml菌液加入有4.5ml無(wú)菌水的試管中,吹打均勻制成稀釋梯度為10-1菌懸液,同樣方法稀釋至10-3,靜置15min,取10-1、-10-3菌懸液各0.5ml上清液涂布LB平板,每個(gè)稀釋梯度接種3個(gè)LB平板,35℃恒溫培養(yǎng)24~48h,挑選生長(zhǎng)良好單菌落純化2~3次保存于4℃冰箱備用。把最后一遍漂洗無(wú)花果的無(wú)菌水涂布于LB培養(yǎng)基上,做漂洗液檢驗(yàn)法對(duì)照,35℃培養(yǎng)24~48h。
采用平板對(duì)峙法將金黃色葡萄球菌、大腸桿菌及變形桿菌及分離純化得到的無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌在LB固體培養(yǎng)基平板上劃線,35℃下恒溫培養(yǎng)48h后觀察平板是否有抑菌帶產(chǎn)生,篩選出活性內(nèi)生細(xì)菌。
采用改良的CTAB法[10-11]提取DNA,經(jīng)電泳檢測(cè)后進(jìn)行PCR擴(kuò)增。
采用30μl體系:提取所得DNA1μl、前引物和后引物各1μl(細(xì)菌通用引物:前引物27F:5'-AGAGTTTGATCMTGGCTCAG-3'和后引物1525R:5'-TCCTCCGCTTATTGATATGC-3')、Taq酶5.5μl(Ex Taq 0,1μl、10x Ex Taq Buffer 3μl、dNTP mixture 2.4μl);
擴(kuò)增程序?yàn)椋孩?4℃預(yù)變性4min;②94℃變性30s;③57℃退火30s;④72℃延伸1min;⑤72℃延伸10min,步驟②-④循環(huán)33次。
PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后送至上海捷瑞生物工程有限公司進(jìn)行堿基測(cè)序,將測(cè)序得到的16S rRNA基因序列在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST比對(duì),與數(shù)據(jù)庫(kù)中的已知序列進(jìn)行同源性分析,選取下載同源性最高的幾條序列,用MECA-X10.2.5軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
簡(jiǎn)單染色及芽孢染色參照[12]進(jìn)行:培養(yǎng)至24h進(jìn)行簡(jiǎn)單染色;培養(yǎng)至16h開(kāi)始進(jìn)行芽孢染色[13],染色間隔時(shí)間為2h,最初出現(xiàn)芽孢的時(shí)間即為活性內(nèi)生細(xì)菌開(kāi)始產(chǎn)芽孢的時(shí)間。
用5ml無(wú)菌水洗脫活性內(nèi)生細(xì)菌斜面,重復(fù)3次合并于同一無(wú)菌試管中制成菌懸液。
取1ml菌懸液接種到不同pH(5、6、7、8)LB液體培養(yǎng)基中,3個(gè)平行/菌/pH,35℃、120r/min恒溫振蕩培養(yǎng)24h,于可見(jiàn)光分光光度計(jì)600nm測(cè)定OD。
4.2.2 活性內(nèi)生細(xì)菌耐堿性
取1ml接種于pH為8、9、10、11的LB液體培養(yǎng)基中,3個(gè)平行/菌/pH,35℃、120r/min)恒溫振蕩培養(yǎng)24h,于可見(jiàn)光分光光度計(jì)600nm測(cè)定OD。
將活性內(nèi)生細(xì)菌分別接種到含NaCl為0、5%、10%、15%、20%的LB液體培養(yǎng)基中,35℃、120r/min恒溫震蕩培養(yǎng)24h后600nm測(cè)定OD。
采用點(diǎn)種[14]方法將活性內(nèi)生細(xì)菌接種于淀粉瓊脂篩選培養(yǎng)基平板上,點(diǎn)種3次/平板,35℃倒置培養(yǎng)24h,滴加適量盧戈式碘液于平板,觀察菌苔周圍是否出現(xiàn)水解圈,并測(cè)量水解圈大小。
根據(jù)菌落形態(tài)、顏色、濕潤(rùn)度等特征從無(wú)花果果實(shí)中分離得到19株內(nèi)生細(xì)菌,經(jīng)金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)、大腸桿菌(Escherichiacoli)和變形桿菌(P.vulgaris)篩選后得到2株活性內(nèi)生細(xì)菌,編號(hào)為3251、3252,通過(guò)革蘭氏染色兩株細(xì)菌為革蘭氏陽(yáng)性菌、桿狀,芽孢染色有芽孢生成,3251芽孢生成時(shí)間為25h,3252芽孢生成時(shí)間為26h,兩株細(xì)菌初始芽孢形成時(shí)間有一定差異,研究[13]發(fā)現(xiàn)1株簡(jiǎn)單芽孢桿菌芽孢形成時(shí)間為16h(六氯苯脅迫寬葉香蒲根際分離得到),1株枯草芽孢桿菌芽孢形成時(shí)間為46h,張戈等[15]指出不同的微生物形成芽孢的機(jī)制并不相同,對(duì)特定的微生物而言,需要探索其合適的條件控制其芽孢的形成。研究認(rèn)為[16-17]營(yíng)養(yǎng)缺乏、高濃度礦物元素、pH、溫度、水分、高細(xì)胞密度和輻射等多種因素都可引發(fā)營(yíng)養(yǎng)體細(xì)胞的分化并形成芽孢。
注:A-3251菌落形態(tài),B-3251簡(jiǎn)單染色,C-3251芽孢染色(總放大倍數(shù):1600)。圖1 無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌3251菌落及形態(tài)特征
注:A-3252菌落形態(tài),B-3252簡(jiǎn)單染色,C-3252芽孢染色(總放大倍數(shù):1600)。圖2 無(wú)花果內(nèi)生細(xì)菌3252菌落及形態(tài)特征
圖3看出3251、3252兩株活性內(nèi)生細(xì)菌DNA分子量大小為1500bp,將擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行基因組測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果于NCBI中進(jìn)行BLAST比對(duì),比對(duì)結(jié)果如表1,并通過(guò)MEGA軟件構(gòu)建3251、3252親系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹(圖4),親緣關(guān)系進(jìn)化樹所示,兩株活性內(nèi)生細(xì)菌均屬于芽孢桿菌屬(Bacillussp.),根據(jù)兩株芽孢桿菌生理生化特征分別命名為BacillusWHG3251、BacillusstrainBF3252。
圖3 活性內(nèi)生細(xì)菌電泳結(jié)果
表1 16SrDNA同源性比對(duì)結(jié)果表
圖4 3251、3252系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹
5.3.1 pH對(duì)兩株活性內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響
圖5結(jié)果發(fā)現(xiàn)BacillusWHG3251和BacillusstrainBF3252生長(zhǎng)最適pH為7.0,較多細(xì)菌生長(zhǎng)的最適pH為6.0~8.0,本實(shí)驗(yàn)從無(wú)花果中分離到的兩株活性內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)最適pH在此范圍內(nèi);通過(guò)圖6耐堿性測(cè)定結(jié)果發(fā)現(xiàn)無(wú)花果兩株活性內(nèi)生細(xì)菌耐堿性有較大差異,BacillusWHG3251在LB培養(yǎng)基pH=11時(shí)生長(zhǎng)狀態(tài)明顯好于BacillusstrainBF3252,說(shuō)明BacillusWHG3251耐堿能力較強(qiáng),而BacillusstrainBF3252在pH=9時(shí)生長(zhǎng)狀態(tài)相對(duì)較好,pH=11時(shí)BacillusWHG3251生長(zhǎng)受到明顯抑制,兩株無(wú)花果活性內(nèi)生芽孢桿菌對(duì)pH的耐受性有明顯不同。從植物分離到兩株具有芘降解功能內(nèi)生細(xì)菌[18]及銀杏內(nèi)生細(xì)菌JX-3進(jìn)行條件優(yōu)化}結(jié)果發(fā)現(xiàn)生長(zhǎng)最適pH為7.0,與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果相同。
圖5 無(wú)花果兩株活性內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)最適pH
圖6 pH對(duì)無(wú)花果兩株活性內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響
5.3.2 不同濃度NaCl對(duì)兩株活性內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響
本實(shí)驗(yàn)從無(wú)花果分離到的兩株活性內(nèi)生細(xì)菌BacillusWHG3251和BacillusstrainBF3252耐鹽性測(cè)定結(jié)果發(fā)現(xiàn)(圖7),兩株活性內(nèi)生細(xì)菌耐鹽性也較強(qiáng),NaCl濃度為10%時(shí)對(duì)兩株無(wú)花果活性內(nèi)生細(xì)菌的生長(zhǎng)狀態(tài)良好,其中BacillusstrainBF3252的生長(zhǎng)狀態(tài)明顯優(yōu)于BacillusWHG3251,BacillusWHG3251在NaCl濃度為5%時(shí)生長(zhǎng)狀態(tài)比對(duì)照好,而NaCl濃度為5%對(duì)BacillusstrainBF3252的生長(zhǎng)表現(xiàn)出一定抑制作用,當(dāng)NaCl濃度增加到15%時(shí)兩株無(wú)花果活性內(nèi)生細(xì)菌的生長(zhǎng)受到明顯抑制,NaCl鹽濃度為20%時(shí)兩株無(wú)花果活性內(nèi)生細(xì)菌又表現(xiàn)出生長(zhǎng),一般來(lái)說(shuō),低濃度鹽對(duì)厭氧微生物生長(zhǎng)有促進(jìn)作用,高濃度鹽對(duì)厭氧微生物有抑制作用[20],代金霞[21]等從小葉錦雞兒分離到78株內(nèi)生細(xì)菌發(fā)現(xiàn)內(nèi)生細(xì)菌NaC1的耐受能力差異較大,只有少部分(該實(shí)驗(yàn)為5%)能夠在NaC1濃度10%的平板上生長(zhǎng)。本實(shí)驗(yàn)從無(wú)花果分離到的兩株活性內(nèi)生細(xì)菌為芽孢桿菌屬細(xì)菌,兩株芽孢桿菌芽孢形成時(shí)間分別為25h、26h,芽孢出現(xiàn)時(shí)間相對(duì)較短(本實(shí)驗(yàn)室保存的枯草芽孢桿菌芽孢出現(xiàn)時(shí)間為46h)[13],芽孢的形成對(duì)不良環(huán)境條件有一定的耐受性,另外,BacillusWHG3251和BacillusstrainBF3252在鹽濃度為20%出現(xiàn)生長(zhǎng)可能深度休眠芽孢萌發(fā)有關(guān)[22],研究[23-24]也發(fā)現(xiàn)不同植物分離到的內(nèi)生細(xì)菌能在NaCl濃度為10%的培養(yǎng)基中生長(zhǎng)。
圖7 NaCl對(duì)無(wú)花果兩株活性內(nèi)生細(xì)菌生長(zhǎng)的影響
5.3.3 兩株活性內(nèi)生細(xì)菌菌解淀粉能力結(jié)果
表2 株活性內(nèi)生細(xì)菌解淀粉能力
表2結(jié)果顯示BacillusWHG3251和BacillusstrainBF3252都能產(chǎn)生淀粉酶,兩株無(wú)花果活性內(nèi)生細(xì)菌在淀粉培養(yǎng)基上培養(yǎng)24h后,BacillusWHG3251的水解圈平均直徑為0.21cm,BacillusstrainBF3252水解圈平均值為0.26cm,兩株細(xì)菌產(chǎn)淀粉酶的能力有一定差異但比較接近,該水解圈大小不能完全代表這兩株活性內(nèi)生細(xì)菌的最大分解淀粉能力,研究[25-26]發(fā)現(xiàn)不同植物分離到的內(nèi)生細(xì)菌有產(chǎn)淀粉酶的能力,其中內(nèi)生芽孢桿菌具有產(chǎn)淀粉酶能力,但產(chǎn)淀粉酶能力有一定差異,微生物分解淀粉能力較弱與其對(duì)培養(yǎng)環(huán)境的適應(yīng)能力有關(guān)。
(1)從無(wú)花果果實(shí)中分離得到19株內(nèi)生細(xì)菌,金黃色葡萄球菌(Staphylococcusaureus)、大腸桿菌(Escherichiacoli)和變形桿菌(P.vulgaris)篩選后得到2株活性內(nèi)生細(xì)菌,分子量大小為1500bp,16SrRNA基因序列在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)BLAST比對(duì)后確定為芽孢桿菌屬細(xì)菌,生理生化實(shí)驗(yàn)后命名為BacillusWHG3251、BacillusstrainBF3252。
(2)兩株活性內(nèi)生細(xì)菌形態(tài)為桿狀,革蘭氏陽(yáng)性菌,芽孢產(chǎn)生時(shí)間分別為25h和26h。
(3)BacillusWHG3251和BacillusstrainBF3252的生長(zhǎng)最適pH為7.0,BacillusWHG3251比BacillusstrainBF3252有較強(qiáng)的耐堿性;兩株活性內(nèi)生細(xì)菌都有較強(qiáng)的耐鹽性,BacillusstrainBF3252表現(xiàn)出更強(qiáng)的耐鹽性特點(diǎn);兩株活性內(nèi)生細(xì)菌都有產(chǎn)淀粉酶的能力。