海生
想象在太空中漂浮著一種外星生物,它沒有自己的家,也不能依靠自己移動和生長,但它只要進入一個適合它的星球,就會迅速繁殖起來,過不了多久就占領了整個星球。
這聽起來像科幻,但你只要把“星球”改換成“宿主”,這個描述基本上適用于我們身邊的一種微生物——病毒。
病毒由兩部分組成,外面是一層蛋白質外殼,里面是遺傳物質DNA或RNA。嚴格說來,病毒不算生命,因為它沒有獨立生存的能力,離開了宿主,什么都不是。但它是地球上最豐富的有機體。從海洋、森林到你身邊的牲畜、人群,再到你自己的體表、體內,它無處不在。這個由病毒組成的世界被稱為“病毒圈”。鑒于我們對病毒的了解比任何其他生命形式都少,病毒圈對于我們長期以來是一個神秘的世界。
但這種情況現在正在改變。我們檢測病毒的能力正指數級提高,在過去五年中,我們鑒定出的病毒種類數量已經翻了20倍。更重要的是,我們對病毒的看法也在改變:這些奇特多樣的微生物不完全是殺人機器,它們在地球生命的進化過程中也扮演了重要角色。
就數量而言,沒有哪種生物能與病毒相提并論。我們的星球名副其實是一個“病毒星球”。一項研究估計,地球上的病毒總數達到1031個。病毒的尺寸一般在100納米的量級。如果把所有這些病毒首尾相連,長度差不多是1億光年,遠遠超出了銀河系的范圍。在地球表面每平方米的面積上,每天都有大約8億個病毒附著在塵埃上降落,而我們對它們中的大多數幾乎一無所知。
病毒離開宿主,是完全惰性的。不過,病毒在宿主以外存活的時間有長有短。短的只有幾秒鐘,長的則能活幾十年。影響其存活時間的一個重要因素是溫度,此外還有陽光、酸堿度等。在非常熱的環(huán)境中,病毒往往死得很快,這就是為什么加熱能殺死病毒的原因。這甚至可以解釋我們的身體為什么會進化出發(fā)燒,作為對病毒感染的一種反應。在較冷的溫度下,離開宿主,病毒可以存活數月甚至數年。天花病毒可在4℃~5℃的溫度下生存數十年。
一旦進入宿主體內,病毒就開始行動。它劫持宿主的細胞,復制它自己的遺傳物質。病毒的宿主可以是任何一種生物,動物、植物、細菌,甚至是另一種病毒。譬如,一種稱為“斯普特尼克病毒”的小病毒就寄居在一種名為“媽媽病毒”的巨型病毒身上。病毒復制非常迅速,在感染后幾個小時內就開始;幾天之內,它們的蹤跡已遍布宿主的所有細胞。
盡管病毒在宿主體外是不活躍的,但一旦進入宿主體內,它們的行為就變得異常復雜。有些病毒(包括那些引起流感、麻疹和脊髓灰質炎的病毒)進入宿主體內后會發(fā)出信號,以協調同伙的行動。譬如說,決定是攻擊還是暫時蟄伏。不同種類的病毒都有自己的秘密信號。此外,它們還能夠感知宿主細胞或其他病毒之間的交流信號。
我們可以利用這個發(fā)現來對抗疾病。事實上,研究人員已經設計出病毒“奸細”,來感知其他微生物(包括大腸桿菌和沙門氏菌)特有的信號,然后將這些微生物鎖定并摧毀。有朝一日,我們可以利用類似辦法操縱噬菌體(一類專門感染細菌的病毒),來殺死極難對付的耐藥性細菌。
盡管我們有先入為主的觀念,以為病毒只會給宿主帶來害處,但事實上,病毒對某些宿主也會帶來好處。以一種叫“破壞性假裸囊菌”的真菌為例。當這種真菌被病毒感染后,會產生更多的孢子,所以病毒反而幫助了它的傳播。
病毒與宿主之間的相互作用,是病毒生態(tài)學的研究領域。鑒于它們的關系錯綜復雜,這是一項艱巨的工作,但是我們已經取得一些進展。2 017年,病毒生態(tài)學家繪制出第一張病毒-宿主的相互作用圖,涵蓋了當時已知的所有病毒種類。研究顯示,大多數病毒“擇居”的對象相當專一,它們往往只感染一兩種宿主。譬如,一種病毒能感染狗,但對貓可能就無可奈何,除非發(fā)生變異。近年來,病毒生態(tài)學的另一個進展是,將對病毒圈的研究擴大到了一個更加神秘的領域——一個由專門感染古細菌的病毒組成的世界。
不過,這只是冰山的一角。我們長期以來一直懷疑病毒是地球上種類最多的微生物,但具體有多少種,我們只有模糊的概念。在過去2 0年中,被確認的病毒種類超過了以往任何時候。譬如,我們知道了巨病毒的存在。這種病毒有1000多個基因,相較而言,最小的病毒只有10個基因。截至2019年4月,研究人員已鑒定出19. 5萬種病毒。
但依然有大量的病毒在我們的掌握之外。隨著分析技術的提高,研究人員現在可以不必找出整個病毒,就能夠識別出病毒的基因。用這種方法的時候,他們經常發(fā)現大量未知病毒的基因片段。
當病毒的宿主是人類自身時,研究病毒生態(tài)學可以幫助我們及時發(fā)現潛在的威脅,預測哪些病毒可能跳轉宿主,來感染我們(見拓展閱讀:下次疫情可能來自哪些病毒?)。
我們關于病毒的印象,幾乎都是負面的,但事實上,在地球生命的進化史上,病毒居功至偉。
病毒的進化速度比任何其他生物體都要快得多,比我們至少要快上百萬倍。進化生物學家開始意識到,正是病毒源源不斷地提供的新的遺傳物質,幫助了動物、植物和細菌等其他生物的進化。
病毒是通過一個叫“水平基因轉移”的過程,與宿主共享它們的基因的。你可以把水平基因轉移想象成打牌中的換牌,玩家可以通過交換手上的牌來優(yōu)化自己的牌組。如果兩位聯手的玩家中恰巧有一位的牌可以不斷翻新(病毒),那么他們通過換牌就可以建立一個更具競爭力的聯盟。
科學家猜測,正是病毒的快速進化能力,再加上交換基因的能力,使得地球上早期的單細胞生物能夠快速適應幾乎任何環(huán)境??紤]到地球早期的環(huán)境惡劣,這對最早的生命是至關重要的,而病毒可能在它們的成功中扮演了重要角色。
因此,更多地了解病毒、宿主及其環(huán)境之間的關系,能夠讓我們更好地了解生命的進化乃至生命的起源。