賴婷婷 陳亮 張川 田鯤
牙釉質(zhì)作為最堅硬、最精密的硬組織,其形成過程復(fù)雜,需基因表達,細胞分泌,蛋白及酶調(diào)控等共同作用,構(gòu)建從分子、納米至宏觀均高度有序的結(jié)構(gòu)。該過程最重要最基礎(chǔ)的是釉原蛋白發(fā)生一系列自組裝反應(yīng)形成納米球,搭建起釉質(zhì)細胞外基質(zhì)最基本的結(jié)構(gòu)實體,再進一步聚集成高級構(gòu)象作為有機模板,指導(dǎo)羥基磷灰石晶體有序地成核與伸長[1]。釉原蛋白(amelogenin)是釉質(zhì)形成初期最主要的細胞外基質(zhì),占90%[1],在體外能自組裝成直徑16~70 nm的納米球[2]。通過原子力顯微鏡[3]、小角度X線散射(SAXS)[4]、核磁共振[5]、動態(tài)光散射(DLS)和透射電子顯微鏡(TEM)[6]等的研究,納米球結(jié)構(gòu)已被廣泛認可。隨著牙釉質(zhì)礦化成熟,釉原蛋白逐漸降解、消失,即表現(xiàn)為在牙胚發(fā)育早期高度表達,晚期及已礦化期低表達甚至無表達。
釉原蛋白的自組裝過程發(fā)生在水性環(huán)境中,若進行常規(guī)脫水會導(dǎo)致蛋白結(jié)構(gòu)明顯改變。冷凍電子顯微鏡能將蛋白樣品迅速冷卻至玻璃態(tài)冰[7],鏡下結(jié)構(gòu)基本反映冷卻前的瞬時狀態(tài),最大程度減少了脫水偽影,且需要的樣品量少[7]。因此,本實驗采用冷凍電子顯微鏡來觀察人釉原蛋白在體外的自組裝過程,初步探究釉原蛋白的自組裝機制,為體外修復(fù)缺損釉質(zhì)提供思路。
完整取出青少年下頜第三磨牙牙囊(處于釉質(zhì)發(fā)育期)1 例(四川省人民醫(yī)院口腔正畸科), InvitrogenTMTRIZOL?試劑(賽默飛世爾,美國)提取牙胚細胞總RNA,根據(jù) Gen Bank 公布的人釉原蛋白全長序列(Genebank M86932),利用 Primer Premier 5 生物學(xué)軟件分析并設(shè)計特異性引物,引入酶切位點 Bam H I 和 Sac I。引物由上海生工生物公司合成,引物序列如表 1,劃線為酶切位點。逆轉(zhuǎn)錄合成cDNA鏈,通過聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增釉原蛋白基因全長序列,并回收、克隆、篩選及鑒定(圖 1)。與pMD19-T原核表達載體構(gòu)建重組質(zhì)粒,采用過熱激法再將質(zhì)粒轉(zhuǎn)入原核表達菌株宿主菌E.coliTop10 中培養(yǎng)(圖 2),A600值為0.6時,以0.3 mmol/L異丙基-β- D-硫代吡喃半乳糖苷(isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside,IPTG)誘導(dǎo)表達、純化,電泳檢測(圖 3)。透析法調(diào)pH為3.5,冷凍干燥保存。
在冰上用pH為3.5的超純水溶解釉原蛋白凍干粉, 4 ℃放置24 h,確保蛋白質(zhì)完全溶解。滴入4 mmol/L pH=8.0的PBS液,使蛋白液pH值從3.5躍升至8.0,蛋白最終質(zhì)量濃度為0.1 mg/mL。在自組裝發(fā)生1、 10、 20 min 時終止反應(yīng),觀察組裝情況。將20~50 μL的蛋白溶液滴至銅網(wǎng)多孔碳側(cè),凍干后將銅網(wǎng)置于cryo TEM(Tecnai F20 TEM型,F(xiàn)EI公司,美國)下觀察。
表 1 釉原蛋白全長引物
M: MD2000 Marker; AM:人釉原蛋白
冷凍電子顯微鏡觀察人釉原蛋白在1、 10、 20 min 的自組裝狀態(tài)(圖 4)。當(dāng)pH從3.5迅速提升至8,隨時間遞增,蛋白形態(tài)、結(jié)構(gòu)逐漸變化:由最初的低聚體到納米小球,最終形成網(wǎng)狀蛋白框架鏈。該過程是復(fù)雜、循序漸進的,兩個單體疊加成二聚體,進一步團聚成六聚體,八聚體等大小不同形狀不同的團聚物[8]。
M: MD2000 Marker; 1: pMD19-T-Am PCR產(chǎn)物
M: Protein maker; 1: 無 IPTG(None IPTG); 2: 0.1 mmol/L IPTG; 3: 0.2 mmol/L IPTG; 4: 0.3 mmol/L IPTG; 5: 0.4 mmol/L IPTG; 6、 7: 誘導(dǎo)前(Before induction); 8、 9: 0.3 mmol/L IPTG誘導(dǎo)后(after 0.3 mmol/L IPTG induction)
隨著聚集體數(shù)目的增加、相互融合,出現(xiàn)更大分子量的多聚體與納米球,而納米球串聯(lián)形成納米帶,納米帶縱橫交錯形成大面積的網(wǎng)狀蛋白支架。在1 min時主要觀察到蛋白分子的低級結(jié)構(gòu)——低聚體(圖 4左)。蛋白的組裝并非同時進行,同一視野既有單個小體積球體(圖 5A),也有L型(圖 5B)、蝴蝶夾狀(圖 5C)的四聚體等,體積均相對較小,最長軸直徑 10~40 nm不等,此時發(fā)生自組裝的蛋白也較少。10 min時自組裝蛋白明顯增多,體積增大(圖 4中),低聚體出現(xiàn)環(huán)狀或縱向延伸,呈花瓣狀(圖 5D、 5E)、帶狀(圖 5F),同時出現(xiàn)較多的納米球,約20~30 mm(圖 5G),甚至聚集成直徑約80 nm的巨大的蛋白分子(圖 5H)。 20 min時,蛋白的組裝趨于成熟,小體積的多聚體較少,蛋白在空間三維方向上的延伸明顯(圖 4右),有類似錐體型的結(jié)構(gòu)(圖 5I),體積明顯變大,形成網(wǎng)狀結(jié)構(gòu)(圖 5J)。
圖 4 釉原蛋白的自組裝過程
1 min(A: 小體積球體; B: L型四聚體; C: 蝴蝶夾狀的四聚體; D: 小花瓣狀); 10 min(E:大花瓣狀; F: 帶狀; G: 納米球; H: 不規(guī)則巨大蛋白分子); 20 min(I: 錐體型; J: 蛋白網(wǎng))
釉原蛋白的結(jié)構(gòu)與功能緊密協(xié)作、不可分割。人釉原蛋白由三個不同亞單位組成:N 端具有45 個氨基酸,酪氨酸的含量高,又稱TRAP (tyrosine-rich amelogenin peptide);中央段具有疏水性,由Xxx-Yyy-Pro重復(fù)序列構(gòu)成(X和Y主要是谷氨酰胺;P,脯氨酸),變異性大,不同物種氨基酸序列重復(fù)單元長度不同;C 端較短,具有親水性,富含亮氨酸。Fukae等[9]提出核-殼模型:中性的N端和中央段形成納米球的致密核心,負極域(C端)暴露于溶液中,形成疏松帶負電荷的殼。適宜條件下,負電荷殼產(chǎn)生排斥力防止納米球之間相互聚集,調(diào)節(jié)納米球大小。此外,C端還參與羥基磷灰石表面的附著,而N端和中央段主要影響蛋白質(zhì)之間的相互作用[10]。釉原蛋白的親疏水性,使其在生理條件下微溶于水,呈固態(tài)或半固態(tài),易聚集形成團聚物,也為自組裝創(chuàng)造了條件。釉原蛋白轉(zhuǎn)錄時還可出現(xiàn)RNA 的選擇性剪切,產(chǎn)生富含主要功能區(qū)的異構(gòu)體蛋白片段——LRAP(leucine-rich amelogenin peptide),其也可自發(fā)組裝成納米球[11]。
釉原蛋白作為釉質(zhì)形成過程中主要的功能性蛋白,屬于內(nèi)在無序化結(jié)構(gòu)蛋白(intrinsically disordered/unstructured protein family,IDPs)。Goto等[12]研究豬的釉原蛋白認為不同蛋白區(qū)域有相應(yīng)的二級結(jié)構(gòu),N端 (TRAP) 為 β-sheet;中央段富含展開的聚脯氨酸 II 或 β-turn,如 β- 螺旋;C 末端為不規(guī)則螺旋。IDPs構(gòu)象不穩(wěn)定,常以非折疊狀態(tài)存在,與不同分子相互作用時轉(zhuǎn)變不同的結(jié)構(gòu),適宜條件時趨于自組裝成納米球,可以解釋圖中觀察到的大小不等、形態(tài)各異的低聚體、多聚體等。釉原蛋白的自組裝受多種因素影響, 包括蛋白質(zhì)濃度,溫度,pH和離子強度等[13]。本實驗最先觀察到是直徑約10 nm的低聚體(圖 3A),與實驗[14]提到的3~10 mm大小一致。但未見明顯的單體——直徑小于3 nm的細長結(jié)構(gòu),猜測釉原蛋白強烈依賴pH,當(dāng)pH從3躍升至8,觸發(fā)了釉原蛋白構(gòu)象從無序狀態(tài)到折疊狀態(tài),自組裝開始,單體迅速消耗聚集成低聚體。低pH時易觀察到單體,如pH=4.4,單體及單體鏈占主體[13],在酸性溶液中單體呈不對稱的狹長桿狀或橢圓形[15];低聚體形成后由釉原蛋白N段誘導(dǎo),中央段通過質(zhì)子化作用參與納米球的形成,C端對聚合反應(yīng)的作用較小,主要抑制聚合體尺寸過大[16-17]。納米球形成后,表面暴露多個氨基酸序列(如 ATMP 模體:PYPSYGYEPMGGW),由于該實驗中缺少非釉原蛋白等物質(zhì),不能進一步組裝成超分子集團[18],納米球大小僅20~30 mm?,F(xiàn)暫無足夠證據(jù)表明納米球形態(tài)為扁圓形或球形,但傾向于納米球不是均質(zhì)的,是低聚體圍繞球體空心性排列,呈甜甜圈狀[3,19]。本實驗圖3 DE可能是低聚體正環(huán)聚成納米球的過程。 20 min時觀察到的網(wǎng)狀蛋白鏈(圖3J)為非典型的單一軸向蛋白鏈,因為本實驗中蛋白濃度足夠(0.1 mg/ml),溶液中任一空間點均可發(fā)生自組裝,同時由于缺乏非釉原蛋白,如成釉蛋白(ameloblastin),釉蛋白(enamelin),蛋白酶以及生長因子類物質(zhì)等的參與,無法完全模擬體內(nèi)自組裝環(huán)境,最終呈現(xiàn)出較散亂的鏈狀結(jié)構(gòu)。當(dāng)然,冷凍電子顯微鏡是對三維結(jié)構(gòu)的二維投射,觀察到的平面結(jié)構(gòu)可能與真實結(jié)構(gòu)存在偏差,若需驗證低聚物、納米球、蛋白鏈確切的空間結(jié)構(gòu)及功能,有待進一步探索。
雖然釉原蛋白的自組裝過程已基本達成共識,Moradianoldak實驗發(fā)現(xiàn)[20],納米球并非剛性結(jié)構(gòu),吸附在不同疏水性或不同電荷的表面會解組裝,猜測最終是低聚體亞基在釉原蛋白-礦物質(zhì)接觸面發(fā)揮作用,低聚體才是誘導(dǎo)釉質(zhì)形成的功能實體。體外已很好地證明了釉原蛋白的逐步分級自組裝,而體內(nèi)是相當(dāng)復(fù)雜的過程,需綜合考慮礦物質(zhì)、其他蛋白質(zhì)、分子間親疏水性等影響裝配過程的各因素?,F(xiàn)如今,牙釉質(zhì)的仿生礦化被廣泛研究,除釉原蛋白外,有多肽、細胞外基質(zhì)類似物、聚酰胺-胺型樹枝狀分子及殼聚糖等不斷被提出[21],但進一步弄清釉原蛋白自組裝機制及功能實體,才是研究新材料及開發(fā)新療法修復(fù)和再生牙體硬組織的基礎(chǔ)與關(guān)鍵。