周楚人 ,郝曉峰 ,劉一涵,陳咸吉 ,肖揚(yáng)波 ,曾露芝 ,向蒙,劉甫智,李桂陽,汪啟明*,彭國平*
(1湖南農(nóng)業(yè)大學(xué)生物科學(xué)技術(shù)學(xué)院,長沙 410128;2道地藥用植物規(guī)范化栽培與綜合利用湖南省工程實(shí)驗(yàn)室,湖南長沙 410128;3湖南一線情農(nóng)業(yè)有限公司,邵陽 422208;4湖南省康潤農(nóng)業(yè)科技發(fā)展有限公司,懷化 418013)
龍牙百合(Lilium brownie var.virdulum Baker),是我國一種珍貴的稀有和暢銷的特產(chǎn)蔬菜,是湖南長期栽培的百合地方良種,在湖南邵陽有1 800多年的種植歷史,因其鱗片肥大,形似龍牙而得名,是百合中最名貴的品種之一。它鱗莖個(gè)體肥厚、抱合緊密、結(jié)拜細(xì)嫩、顏色鮮艷、品質(zhì)優(yōu)良、營養(yǎng)豐富,具有安神寧心、補(bǔ)中益氣、養(yǎng)陰潤肺、理脾健胃等功效,有較高的營養(yǎng)價(jià)值及藥用價(jià)值[1-3]。
龍牙百合多采用無性繁殖,易造成病毒累積,嚴(yán)重危害其產(chǎn)量和品質(zhì)。目前已報(bào)道侵染百合的病毒達(dá)19種以上,最主要的為百合斑駁病毒(Lily mottle virus,LMoV)、黃瓜花葉病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)和百合無癥病毒(Lily symptomless virus,LSV)[4,5]。這3種病毒通常以其中2或3種同時(shí)侵染百合植株,給百合生產(chǎn)造成嚴(yán)重影響[6-8]。研究表明,病毒侵染后的表現(xiàn)包括幼葉向下反卷扭曲、系統(tǒng)花葉、壞死斑、花葉出現(xiàn)斑點(diǎn)或花葉卷曲,植株矮化呈從簇狀,甚至無花、植株無主稈等癥狀,造成百合切花或鱗莖品質(zhì)嚴(yán)重下降。而植株一旦感染則終身攜帶,通過蚜蟲或汁液傳播,病毒傳播范圍進(jìn)一步擴(kuò)大[9-11]。
為保證龍牙百合質(zhì)量,栽培無毒種球是防控百合病毒性病害的根本措施,而有效的病毒檢測(cè)技術(shù)是確保脫毒苗真正無毒的有效措施。
實(shí)驗(yàn)材料于2020年6月取自湖南省邵陽市隆回縣三閣司鎮(zhèn)(27.116415°N,110.978235°E)龍牙百合發(fā)病田,以5點(diǎn)法取樣獲得數(shù)株染病龍牙百合。
實(shí)驗(yàn)儀器:實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀ABI7500、超凈工作臺(tái)BIOBAS、微量移液器Eppendorf、漩渦混勻儀Kylin-Bell、掌式離心機(jī)Kylin-Bell、熱循環(huán)儀ABI Proflex、電泳儀(上海天能科技有限公司)。
實(shí)驗(yàn)試劑:DEPC處理水(R1600)Solarbio、三氯甲烷(10006818,國藥集團(tuán)化學(xué)試劑有限公司)、Gel-Red染 料(#41003)Biotium、RNA Loading Buffer(9168)TaKaRa、Tris-Borate-EDTA Buffer(TBE)10×Powder,pH8.3(T9122)TaKaRa、SuperReal PreMix Plus(SYBR Green)(FP205-02)天根、RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit(K1622)ThermoFisher、RNAsimple Total RNA Kit(DP419)天根。
根據(jù)NCBI Genebank(The National Center for Biotechnology Information,美國國立生物技術(shù)信息中心)中登錄的百合CMV、LMoV、LSV病毒基因序列,應(yīng)用Primerpremier 6.0軟件分別設(shè)計(jì)3種病毒的特異性引物。LMoV-99、LMoV-101、LSV-70、LSV-169、CMV-110、CMV-70由上海生工生物工程有限公司合成,具體序列見表1。
表1 實(shí)驗(yàn)所用引物序列Table 1 Primer sequences used in experiments
使用Hipure HP Plant RNA MiNi Kit提取植物總RNA小提試劑盒,按說明書提取總RNA。
利用RT-PCR法進(jìn)行龍牙百合主要病毒的檢測(cè)。采用引物L(fēng)MoV-99 R/F、LMoV-101 R/F、LSV-70 R/F、LSV-169 R/F、CMV-110 R/F、CMV-70 R/F,從總RNA提取液中分別擴(kuò)增CMV、LMoV、LSV等病毒,根據(jù)RT-PCR試劑盒操作說明,設(shè)定RT-PCR體系為:(1)體系中加入RNA(90~100 ng/uL)11μL、Random lexamer Primer 1μL,混勻離心,PCR儀上65℃反應(yīng)5 min,立即置于冰上冷卻,離心后放置冰上。(2)體系中加入5×Reaction Buffer 4μL、Ribolock RNase Inhibition 1μL、10 mM dNTP Mix 2μL、ReverlAid M-MuLV RT 1μL,混勻離心。(3)PCR儀中25℃作用5 min,然后42℃作用60 min,70℃作用5 min,終止反應(yīng)。(4)補(bǔ)加20 μL NF-H2O至40μL,獲得cDNA并做好標(biāo)記,隨后檢測(cè)。(5)在冰上配制如下反應(yīng)體系:2×Super-Real PreMix Plus 10μL,相應(yīng)上下游混合引物10 μM,cDNA 2μL、RNase-free H2O 7.4μL,混勻離心。(6)95℃預(yù)變性15 min,95℃變性10 s、60℃退火30 s、72℃延伸30 s。45個(gè)循壞進(jìn)行PCR,產(chǎn)物檢測(cè)溶解曲線[12,13]。
使用美吉生物科技有限公司提取植物總RNA小提試劑盒從龍牙百合鱗莖組織提取總RNA,用分光光度儀檢測(cè)8份龍牙百合引物總RNA提取液的濃度和純度,檢測(cè)結(jié)果如表2。其A260/A280值基本在2.0左右,表明純度高,可以進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn)。
表2 百合提取RNA的純度與濃度Table 2 The purity and concentration of RNA extractedfrom Lily
圖1 各引物RT-qPCR擴(kuò)增曲線Fig.1 RT-qPCR amplification curve of each primer
采用引物L(fēng)MoV-99 R/F、LMoV-101 R/F、LSV-70 R/F、LSV-169 R/F、CMV-110 R/F、CMV-70 R/F從總RNA提取液中分別擴(kuò)增CMV、LMoV、LSV等病毒。對(duì)RT-qPCR產(chǎn)物檢測(cè),其擴(kuò)增曲線如圖1,溶解曲線如圖2,CT(Cycle threshold)值如表3,凝膠電泳圖如圖3。LMoV99、LMoV101引物的反應(yīng)產(chǎn)物擴(kuò)增曲線結(jié)果較好,雖然其CT值不穩(wěn)定,但都小于35,LMoV-99引物的反應(yīng)產(chǎn)物溶解曲線Tm值集中在85.5℃左右,且均為單一峰,而LMoV-99引物的反應(yīng)產(chǎn)物溶解曲線Tm值集中在84.5℃左右。部分實(shí)驗(yàn)組存在多峰現(xiàn)象,可能出現(xiàn)了非特異性擴(kuò)增。LSV-70、LSV-169、CMV-110、CMV-70引物的反應(yīng)產(chǎn)物擴(kuò)增曲線雖然CT值大部分小于35,但其溶解曲線Tm值小于80℃,且樣本間差異極大,可能是引物間發(fā)生了非特異性擴(kuò)增。
圖2 各引物RT-qPCR溶解曲線Fig.2 RT-qPCR Melting curve of each primer
凝膠電泳結(jié)果顯示,LMoV-99、LMoV-101引物擴(kuò)增PCR產(chǎn)物的片段長度在100 bp左右,符合預(yù)期設(shè)計(jì)所能擴(kuò)增出的片段長度,而LSV-169、CMV-70引物擴(kuò)增PCR產(chǎn)物的片段長度在50 bp以下,不符合預(yù)期片段長度,而LSV-70基本沒有獲得PCR產(chǎn)物。
表3 百合病毒cDNA的qPCR循環(huán)閾值Table 3 qPCR cycle threshold table of lily virus cDNA
續(xù)表3
圖3 龍牙百合各引物PCR結(jié)果Fig.3 PCR results of different primers of Lilium longicornis
在采用RT-PCR檢測(cè)百合病毒的文獻(xiàn)報(bào)道中,大多數(shù)通過RT-PCR產(chǎn)物中有無病毒的特異片段來判斷被檢測(cè)的百合是否感染該病毒[14-16]。筆者在對(duì)隆回龍牙百合3種主要病毒CMV、LMoV、LSV的檢測(cè)過程中,以95℃預(yù)變性15 min,95℃變性10 s、60℃退火30 s、72℃延伸30 s,45個(gè)循壞的PCR參數(shù)進(jìn)行RT-qPCR,但只有采用LMoV-99 R/F、LMoV-101 R/F引物進(jìn)行qPCR時(shí),溶解曲線、擴(kuò)增曲線符合預(yù)期,CT值在15~25之間,之后進(jìn)行的普通PCR進(jìn)行凝膠電泳的結(jié)果也表明擴(kuò)增出了LMoV病毒的片段,而以LSV-70 R/F、LSV-169 R/F、CMV-110 R/F、CMV-70 R/F引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增時(shí),溶解曲線紊亂,擴(kuò)增曲線顯示CT值普遍在35左右,可以認(rèn)為是引物二聚體,并沒有擴(kuò)增出CMV病毒和LSV病毒的特異片段。
根據(jù)以上實(shí)驗(yàn)結(jié)果,可以判斷隆回縣龍牙百合感染了百合斑駁病毒,而未感染百合無癥病毒及黃瓜花葉病毒。此外,謝晚彬等[17]對(duì)江西萬載的龍牙百合進(jìn)行主要病毒檢測(cè),發(fā)現(xiàn)萬載龍牙百合感染了百合斑駁病毒,沒有感染黃瓜花葉病毒和百合無癥病毒,與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致。筆者認(rèn)為可能病毒本就存在于龍牙百合種球內(nèi),隨后在田間傳播;也有可能龍牙百合對(duì)黃瓜花葉病毒和百合無癥病毒有較高的抵抗力,而對(duì)百合斑駁病毒抵抗力較弱,易感百合斑駁病。