李學(xué)才,常 瑜,白 靜,武軍艷,李博文,趙玉紅,孫柏林,王萬鵬,唐德耀,范小龍,朱文英,馬 驪,孫萬倉
(1.甘肅省干旱生境作物學(xué)重點實驗室,甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,甘肅 蘭州 730070;2.甘肅省農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣總站,甘肅 蘭州730020;3.甘肅省康縣茶葉科技開發(fā)中心,甘肅 隴南 746500;4.甘肅省崆峒區(qū)農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心,甘肅 平?jīng)?744000)
世界上有灌溉條件的耕地面積尚不足15%,其余皆為依靠自然的雨養(yǎng)農(nóng)業(yè)區(qū)[1-2]。隨著氣候變暖及陸地表面趨向干旱化,水資源短缺成為限制農(nóng)業(yè)發(fā)展的主要因素之一[3-4]。中國北方大部分地區(qū)屬干旱、半干旱地區(qū),面積約占我國陸地面積的50%,其生態(tài)環(huán)境脆弱、氣候異常多變、水資源匱乏,農(nóng)業(yè)生產(chǎn)因干旱受到嚴重損失[5]。
脫落酸(Abscisic acid,ABA)是一種重要的倍半萜類植物內(nèi)源激素,不僅參與胚胎發(fā)育、種子休眠、葉片衰老等生長發(fā)育過程,同時又是植物體內(nèi)的一種抗脅迫激素,參與傳遞逆境信號,誘導(dǎo)植物產(chǎn)生一系列抗逆反應(yīng),提高植物的抗逆性。玉米黃質(zhì)環(huán)氧化酶(Zeaxanthin epoxidase,ZEP)是一種類囊體膜基質(zhì)面的雙功能單加氧酶,其主要作用是將玉米黃質(zhì)環(huán)氧化形成花藥黃質(zhì),再進一步環(huán)氧化形成紫黃質(zhì)。分子氧和NADPH是ZEP的協(xié)同作用底物,F(xiàn)AD是其輔助因子,能夠提高其催化活性[6]。研究表明ZEP是黃質(zhì)醛轉(zhuǎn)變成ABA的間接合成途徑中的關(guān)鍵調(diào)控酶[7]。擬南芥(Arabidopsisthaliana)中ABA1缺失突變體表現(xiàn)為玉米黃質(zhì)無法轉(zhuǎn)化為紫黃質(zhì),煙草中則為ABA合成反應(yīng)第一步無法進行[8]。ZEP在不同環(huán)境脅迫下的表達模式隨植物種類和組織而發(fā)生變化。在煙草和番茄中,根中ZEP的表達量在干旱脅迫后顯著上升,而葉片中的表達量基本不發(fā)生變化[9-10]。Audran等[11]卻發(fā)現(xiàn)煙草葉片中ZEP的表達量在干旱脅迫下急劇下降。過表達ZEP會導(dǎo)致番茄對強光的敏感性增加,也會使轉(zhuǎn)基因擬南芥中ABA含量上調(diào)[12-13]。Park等[14]研究發(fā)現(xiàn),擬南芥過表達AtZEP基因,轉(zhuǎn)基因植株在鹽脅迫和旱脅迫條件下生長更旺盛。通過RNA-seq技術(shù)對甘藍型油菜的耐旱基因進行挖掘發(fā)現(xiàn),干旱脅迫下ZEP、NCED等參與ABA合成基因的高表達提高植株的耐旱性[15]。在逆境條件下,植物體內(nèi)合成大量的ABA,可以促進氣孔關(guān)閉,抑制氣孔開放,抑制植物的光合作用,從而減緩逆境環(huán)境對植物造成的傷害,增強植物的抗逆性。
白菜型冬油菜是我國北方寒旱區(qū)重要油料作物之一,具有生育期短、耐遲播、耐貧瘠、抗逆性強的突出優(yōu)點。北方白菜型冬油菜3月中下旬開始返青,進入需水旺盛期,但北方4—6月為旱季,7—9月才進入降雨期,油菜返青后需水期與降雨期不同步,對北方冬油菜生產(chǎn)造成了嚴重影響[16]。因此,研究北方白菜型冬油菜的抗旱性具有重要意義。本課題組前期研究表明[17],超強抗寒白菜型冬油菜品種根系及葉片的ABA含量升高時期早于弱寒性品種,白菜型冬油菜根系A(chǔ)BA 含量與其越冬率和抗寒性呈顯著正相關(guān)。因此,本研究對ABA合成途徑中的關(guān)鍵調(diào)控酶基因ZEP進行克隆并分析其在干旱脅迫下的表達模式,進一步揭示ZEP基因在白菜型冬油菜抗旱響應(yīng)中的作用,為白菜型冬油菜抗旱機理研究提供科學(xué)依據(jù)。
以白菜型冬油菜隴油7號和天油4號為試驗材料。選擇健康、均勻的種子用0.1% NaClO消毒10 min后,用蒸餾水沖洗2~3次,播種在鋪有2層濾紙的培養(yǎng)皿中進行種子萌發(fā)(光照14 h,25℃;黑暗10 h, 25℃),待胚根露白后播種至裝有基質(zhì)的花盆中,培養(yǎng)至五葉期選擇生長健康的植株進行脅迫處理。
試驗設(shè)置4個處理:T1:對照(CK),噴施蒸餾水200 mL;T2:噴施20 mg·L-1ABA 200 mL;T3:噴施10 mmol·L-1鎢酸鈉200 mL;T4:同時噴施20 mg·L-1ABA 100 mL和10 mmol·L-1鎢酸鈉100 mL。試驗材料處理前7 d始終保持花盆內(nèi)土壤持水量在70%~80%,并用土壤水分儀(恒美HM-WSYP)監(jiān)測每日土壤含水量[18]。將試驗材料放置于光照培養(yǎng)箱中(光照14 h,25℃;黑暗10 h,25℃;相對濕度45%)進行干旱處理,取第0天(Normal)和第7天(Drought)植株葉片和根系,并液氮冷凍后存儲于-80℃冰箱。
參照TIANGEN天根生化科技(北京)有限公司試劑盒(DP419)說明書提取總RNA,質(zhì)量檢測后按照TakaRa大連寶生物有限公司PrimeScriptTMRT Master Mix(Perfect Real Time)試劑盒的方法合成cDNA,檢測質(zhì)量及濃度后-20℃保存。
根據(jù)美國國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)提供的白菜型油菜的玉米黃質(zhì)環(huán)氧化酶(ZEP)基因的CDS序列,利用Primer 5.0設(shè)計擴增引物。引物序列為ZEP-F:5’-ATGGGTTGTTCAACTCCCTTCTGCT-3’;ZEP-R:5’- TCAAGCAGCCTGAAGCAATTTACCG -3’。以隴油7號(CK)葉片cDNA為模板,進行PCR擴增,擴增程序為:94℃ 3 min;94℃ 30 s,62℃ 30 s,72℃ 2 min,30個循環(huán);72℃ 10 min;16℃保存。PCR產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測擴增產(chǎn)物片段大小,參照Axygen Prep DNA凝膠回收試劑盒(離心柱型)說明書回收目的條帶。采用pMD-19T載體連接回收產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細胞中進行藍白斑篩選,挑取陽性克隆進行測序(生工生物工程上海股份有限公司)。
采用ORF Finder軟件對ZEP的核酸序列、氨基酸序列和開放閱讀框進行分析,利用Protparam工具進行蛋白質(zhì)基本理化性質(zhì)分析,氨基酸疏水性分析采用Protscale,跨膜結(jié)構(gòu)預(yù)測采用TMpred Server軟件,采用Signal P4.1 Server預(yù)測蛋白信號肽,利用SOPMA工具預(yù)測蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu),保守結(jié)構(gòu)域分析用SMART工具。利用DNAMAN進行白菜型冬油菜ZEP基因的氨基酸序列比對及進化樹構(gòu)建。
依據(jù)實時熒光定量PCR引物設(shè)計原則設(shè)計白菜型油菜ZEP基因(XM_009105212.3)qPCR引物。以相同濃度隴油7號和天油4號cDNA為模板,以白菜型油菜β-actin(Actin-F,5'-GTGTCATGGTTGGGATGGGT-3';Actin-R,5'-AAGAACCGGGTGCTCTTCAG-3')作為內(nèi)參[15]。實時熒光定量PCR按照Unique Aptamer TM qPCR SYBR? Green Master Mix試劑盒說明書(天津諾禾致源生物信息科技有限公司),采用兩步法,擴增程序為:95℃ 5 min;95℃ 10 sec,60℃ 30 sec,40個循環(huán);熔解曲線:95℃ 15 sec,60℃ 60 sec,95℃ 15 sec。采用2-ΔΔCt法[19]對ZEP基因的表達量進行分析。
以隴油7號葉片cDNA為模板,進行PCR擴增,純化回收目的片段,連接T載體后轉(zhuǎn)化大腸桿菌,利用菌液PCR篩選陽性克隆,得到一條2 000 bp左右的目的片段(圖1)。對挑選的陽性克隆進行測序,結(jié)果顯示該基因全長為2 013 bp。
利用NCBI ORF finder對隴油7號的ZEP基因堿基序列查找開放閱讀框,結(jié)果顯示,該序列含有一個長度為2 013 bp的完整開放閱讀框,編碼含670個氨基酸的蛋白質(zhì),起始密碼子為ATG,終止密碼子為TGA(圖2)。利用ProtParam在線軟件預(yù)測ZEP基因編碼蛋白質(zhì)的理化性質(zhì),結(jié)果顯示:ZEP蛋白的分子式為C3294H5172N912O980S25,由20種氨基酸組成,Gly(G)、Leu(L)所占比例最高,分別為10.0%、8.2%;含有酸性氨基酸(D、E)88個、堿性氨基酸(K、R)83個、疏水氨基酸(A、I、L、F、W、V)234個和極性氨基酸(N、C、Q、S、T、Y)142個;預(yù)測相對分子質(zhì)量為74.03 kDa,理論等電點(pI)為6.16;預(yù)測不穩(wěn)定指數(shù)為46.09,屬于不穩(wěn)定蛋白(穩(wěn)定系數(shù)>40即為不穩(wěn)定蛋白質(zhì));預(yù)測脂肪指數(shù)為81.94,平均親水性值(Grand average of hydropathicity)為-0.261(圖3A),說明ZEP基因編碼的蛋白是親水性蛋白。
白菜型冬油菜隴油7號ZEP蛋白的N-末端信號肽預(yù)測結(jié)果表明,該蛋白無信號肽(圖3B)。利用TMpred分析ZEP蛋白氨基酸序列,結(jié)果顯示含有3個跨膜區(qū)段(圖3C);利用SOPMA 預(yù)測ZEP蛋白二級結(jié)構(gòu),結(jié)果顯示該蛋白無規(guī)則卷曲(Random coil)占42.39%,α-螺旋(α-helix)占30.45%,延伸鏈(Extended strand)占19.85%,β-轉(zhuǎn)角(β-turn)占7.31%(圖3D)。采用SMART在線軟件對隴油7號ZEP保守序列進行預(yù)測,結(jié)果表明,該基因編碼的蛋白具有非常保守的結(jié)構(gòu)域:黃素腺嘌呤二核苷酸(FAD)結(jié)合位點和57個氨基酸組成的FHA結(jié)構(gòu)域(圖3E)。
利用DNAMAN及BLASTP對隴油7號與其他十字花科植物ZEP蛋白同源性進行比較,結(jié)果表明,隴油7號ZEP蛋白序列與其他植物的ZEP氨基酸序列相似性很高,與甘藍型油菜、甘藍、大白菜、蘿卜以及擬南芥ZEP基因的相似度分別為99.40%、97.16%、98.81%、95.52%、89.25%(圖4)。從進化樹分析發(fā)現(xiàn)(圖5),隴油7號與天油4號的ZEP蛋白在進化上同甘藍型油菜(Brassicanapus)、大白菜(Brassicarapasubsp.pekinensis)的ZEP氨基酸序列親緣關(guān)系更近。
利用qPCR分析外源噴施ABA與鎢酸鈉對干旱脅迫下白菜型冬油菜隴油7號、天油4號葉片中ZEP基因表達量的影響,結(jié)果如圖6所示,將未進行干旱處理的白菜型冬油菜葉片的ZEP基因的表達量定為Normal,干旱脅迫后隴油7號和天油4號葉片中ZEP基因均上調(diào)表達。干旱脅迫處理噴施ABA后,2個品種ZEP表達量在轉(zhuǎn)錄水平上顯著高于CK,隴油7號、天油4號較CK分別增加66.63%、75.35%;干旱脅迫處理噴施鎢酸鈉后,2個品種的ZEP基因表達量在轉(zhuǎn)錄水平上均低于CK,隴油7號、天油4號較CK分別減少12.74%、16.32%;干旱脅迫處理并同時噴施ABA和鎢酸鈉后,隴油7號、天油4號較CK的ZEP基因表達量分別增加3.3倍和2.28倍。
外源噴施ABA與鎢酸鈉對干旱脅迫下白菜型冬油菜根系中ZEP表達量的影響如圖7所示,未進行干旱處理的白菜型冬油菜根系的ZEP基因的表達量為1,隴油7號和天油4號2個品種ZEP基因均上調(diào)表達。噴施ABA干旱處理后,隴油7號、天油4號較CK的基因表達量分別增加1.18倍和1.74倍。噴施鎢酸鈉根系中ZEP在轉(zhuǎn)錄水平上低于CK,干旱脅迫后,隴油7號、天油4號較CK減少了12.52%和11.44%。同時噴施ABA和鎢酸鈉,干旱脅迫下,隴油7號、天油4號較CK的基因表達量分別增加1.07倍和1.27倍。
干旱脅迫下,植物對外界環(huán)境的刺激做出反應(yīng),產(chǎn)生各種代謝產(chǎn)物以適應(yīng)外界環(huán)境。ABA是植物產(chǎn)生的重要激素,在逆境脅迫中可調(diào)節(jié)植物的代謝活動,提高植物的抗逆能力。ABA在植物受干旱脅迫時通過信號傳導(dǎo),調(diào)控脅迫基因表達,調(diào)節(jié)植物體內(nèi)蛋白、激素等物質(zhì)的積累,從而增強植物對環(huán)境的適應(yīng)能力[20]。玉米黃質(zhì)環(huán)氧化酶ZEP是ABA合成反應(yīng)第一步的調(diào)控酶,催化玉米黃質(zhì)(Z)經(jīng)單環(huán)氧玉米黃質(zhì)(A)向雙環(huán)氧紫黃質(zhì)(V)的轉(zhuǎn)化[21-22]。這一反應(yīng)在植物葉黃素循環(huán)途徑、ABA合成途徑以及類胡蘿卜素循環(huán)中都具有重要作用[23-25]。ABA 合成抑制劑鎢酸鈉通過抑制 ABA 合成中的醛氧化酶原(ABA-aldehydeoxidase)使得 ABA 醛不能轉(zhuǎn)化為 ABA[26]。本研究發(fā)現(xiàn),干旱脅迫下,白菜型冬油菜葉片和根系中ZEP基因均上調(diào)表達。鄧昌哲等[27]研究表明,ABA合成抑制劑在類胡蘿卜素降解途徑中可抑制ZEP的表達,本試驗發(fā)現(xiàn),噴施ABA后,無論葉片或根中,ZEP基因的相對表達量均顯著高于對照,說明ABA可以誘導(dǎo)ZEP基因的表達。本試驗研究表明,外源噴施鎢酸鈉后,白菜型冬油菜葉片和根中的ZEP基因表達受到抑制,相對表達量顯著低于對照。
ZEP是一種雙功能單加氧酶,也是ABA合成途徑中的調(diào)控酶之一,屬于脂質(zhì)運載蛋白家族[28],主要定位到葉綠體類囊體膜和外被膜上[29-30]。本試驗成功克隆了白菜型冬油菜的ZEP基因,包含2 013 bp的開放閱讀框,編碼含670個氨基酸殘基的蛋白質(zhì),預(yù)測蛋白質(zhì)分子量為74.03kDa,理論等電點(pI)為6.16,包含F(xiàn)AD-binding 3結(jié)構(gòu)域及FHA結(jié)構(gòu)域,這些結(jié)果與甘藍型油菜和紫花苜蓿中的研究相似[31-32]。ZEP不僅是ABA間接合成過程中的作用酶,也是葉黃素循環(huán)中的關(guān)鍵酶。本試驗從白菜型冬油菜隴油7號和天油4號中成功克隆出ZEP基因序列,與擬南芥、甘藍型油菜等進行比對,發(fā)現(xiàn)其同源性分別為89.70%和99.40%。經(jīng)qPCR分析發(fā)現(xiàn),ZEP基因在白菜型冬油菜葉片和根系中均有表達,與煙草ABA2、番茄NpZEP的表達模式相似,葉片中的表達量最高,根系表達量較少[12,33]。且干旱脅迫下,葉片和根系中均有表達,說明ZEP基因在白菜型冬油菜抗旱中發(fā)揮作用。