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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)聯(lián)合GEO芯片探討金雀異黃素治療子宮內(nèi)膜癌的機(jī)制

2021-04-29 22:37徐信薛曉鷗宗春曉王謙邵晨曦范夢(mèng)騰謝偉
關(guān)鍵詞:子宮內(nèi)膜癌網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)

徐信 薛曉鷗 宗春曉 王謙 邵晨曦 范夢(mèng)騰 謝偉

〔摘要〕 目的 采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)聯(lián)合GEO數(shù)據(jù)庫(kù)差異基因分析的方法,探討金雀異黃素(genistein)治療子宮內(nèi)膜癌(endometrial carcinoma, EC)的潛在作用機(jī)制。方法 依托TCMSP等8個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)獲得金雀異黃素的靶標(biāo)基因,并通過(guò)Uniport蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行名稱(chēng)規(guī)范;然后,運(yùn)用GEO數(shù)據(jù)庫(kù)獲取子宮內(nèi)膜癌GSE17025數(shù)據(jù)集,并運(yùn)用R語(yǔ)言獲取其差異表達(dá)的基因;進(jìn)而,作金雀異黃素靶標(biāo)基因與子宮內(nèi)膜癌差異基因的映射集合,再將交集靶點(diǎn)提交至STRING平臺(tái)獲得蛋白互作網(wǎng)絡(luò),并采用Cytoscape 3.7.2進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?,篩選重要靶點(diǎn);最后,對(duì)交集靶點(diǎn)進(jìn)行GO注釋和KEGG富集分析。結(jié)果 金雀異黃素作用于70個(gè)交集靶點(diǎn)發(fā)揮對(duì)子宮內(nèi)膜癌的治療作用,其中重要靶點(diǎn)有STAT3、BIRC5、MKI67等基因,主要富集在IL-17(IL-17 signaling pathways)、p53(p53 signaling pathway)、TGF-β(TGF-beta signaling pathway)等多條信號(hào)通路上。結(jié)論 金雀異黃素通過(guò)多靶點(diǎn)、多途徑治療子宮內(nèi)膜癌,其可能是通過(guò)IL-17、p53、TGF-β等信號(hào)通路發(fā)揮治療作用。此研究為深入闡釋金雀異黃素治療子宮內(nèi)膜癌的臨床研究及進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證提供了思路。

〔關(guān)鍵詞〕 金雀異黃素;子宮內(nèi)膜癌;網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué);分子作用機(jī)制;GEO芯片

〔中圖分類(lèi)號(hào)〕R285? ? ? ?〔文獻(xiàn)標(biāo)志碼〕A? ? ? ?〔文章編號(hào)〕doi:10.3969/j.issn.1674-070X.2020.12.022

〔Abstract〕 Objective To explore the potential mechanism of genistein in the treatment of endometrial carcinoma (EC) by network pharmacology and differentially expressed genes (DEGs) of GEO chip. Methods The TCMSP database and other 7 databases were used to obtain the target genes of genistein, and the target protein name was transformed into the target gene name by the Uniport protein database; the GEO chip was used to obtain the EC GSE17025 data set, and the R language was used to obtain its differentially expressed genes; furthermore, the mapping collection of genistein target genes and EC differential genes was made, and then the intersection targets were submitted to the STRING platform to obtain the protein interaction network. The Cytoscape 3.7.2 was used to perform network topology analysis to screen important targets; finally, GO annotation and KEGG enrichment analysis were performed on the intersection target. Results Genisteine acted on 70 intersection targets to play a therapeutic role on EC. Among them, STAT3, BIRC5 and MKI67 and other genes were important targets, which were enriched in IL-17 signaling pathways, p53 signaling pathway and TGF-β signaling pathway. Conclusion Genistein can treat EC by multi-target and multi-channel, which may play a therapeutical effect through IL-17, p53, TGF-β and other signal pathways. This study provides an idea for in-depth explanation of the clinical research and further experimental verification of genistein in the treatment of EC.

〔Keywords〕 genistein; endometrial carcinoma; network pharmacology; molecular mechanism; GEO chip

子宮內(nèi)膜癌(endometrial carcinoma, EC),又稱(chēng)子宮體癌,是來(lái)源于子宮內(nèi)膜的上皮性惡性腫瘤[1]。據(jù)美國(guó)癌癥協(xié)會(huì)2019年公布的最新數(shù)據(jù),子宮內(nèi)膜癌發(fā)病率仍高居女性生殖系統(tǒng)惡性腫瘤第一位[2],發(fā)病率呈上升態(tài)勢(shì),年齡日趨年輕化,死亡率也呈逐步上升趨勢(shì)[3],手術(shù)治療仍是其治療的主要手段,然而,術(shù)后復(fù)發(fā)率高,同時(shí)也嚴(yán)重破壞了婦女的生育力[4]。在我國(guó)全面開(kāi)放二胎政策及發(fā)病年齡日趨年輕的背景下,越來(lái)越多的患者迫切要求保留生育力[5],目前對(duì)于EC的防治尚缺乏有效的措施和藥物,因此,尋找與EC的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)的潛在靶標(biāo)及安全有效的靶向治療藥物具有重要的價(jià)值。

EC的發(fā)生、發(fā)展是極其復(fù)雜的病理生理過(guò)程,并受多因素、多途徑調(diào)節(jié)。近年來(lái),隨著高通量測(cè)序技術(shù)的發(fā)展,大量基因表達(dá)信息得以挖掘[6]?;虮磉_(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)(Gene Expression Omnibus database, GEO)存儲(chǔ)了海量的高通量測(cè)序微陣列信息。通過(guò)對(duì)GEO的目標(biāo)數(shù)據(jù)進(jìn)行挖掘、整合及分析,能快速有效篩選與疾病相關(guān)的差異表達(dá)基因(differentially expressed genes, DEGs),為各種疾病的研究提供重要線索[7-8]。

金雀異黃素(genistein, GST),又名染料木黃酮,是大豆來(lái)源的異黃酮,它具有弱的雌激素作用,具有緩解更年期癥狀、抗腫瘤等活性[9-10]。本課題組在前期體外實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)[11-12],GST能通過(guò)調(diào)節(jié)ERα及ERβ的表達(dá),改變ERα/ERβ的比例,從而抑制子宮內(nèi)膜癌HEC-1B及Ishikawa細(xì)胞株增殖,誘導(dǎo)其凋亡,但隨著研究的深入,高劑量的GST并不遵循雌激素受體途徑發(fā)揮抑瘤作用[13],與此同時(shí),臨床的其他報(bào)道也都大多集中在單靶點(diǎn)、單機(jī)制的境況。故本研究采用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)結(jié)合GEO數(shù)據(jù)庫(kù)差異基因的分析方法,針對(duì)金雀異黃素治療EC的靶點(diǎn)和機(jī)制進(jìn)行探索,從微觀角度闡釋其多靶點(diǎn)、多環(huán)節(jié)、多效應(yīng)的科學(xué)內(nèi)涵。

1 資料與方法

1.1? 金雀異黃素潛在靶標(biāo)預(yù)測(cè)及ADME特性

以金雀異黃素的英文關(guān)鍵詞“genistein”或其2D Structure,對(duì)8個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行全面系統(tǒng)地檢索,進(jìn)而獲得金雀異黃素的作用靶標(biāo)。8個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)分別為中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)與分析平臺(tái)(TCMSP, http://tcmspw.com/tcmsp.php)、Swiss Target Prediction數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.swisstargetprediction.ch/)、中醫(yī)百科全書(shū)(ETCM, http://www.tcmip.cn/ETCM/)、美國(guó)比較毒理基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)(CTD, http://ctdbase.org/)、DrugBank數(shù)據(jù)庫(kù)(https://go.drugbank.com/)、STITCH數(shù)據(jù)庫(kù)(http://stitch.embl.de/)、ZINK數(shù)據(jù)庫(kù)(https://zinc.docking.org/)、藥物靶標(biāo)數(shù)據(jù)庫(kù)(TTD, http://bidd.nus.edu.sg/group/cjttd/)。各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)搜集的靶點(diǎn)存在命名不規(guī)范的問(wèn)題,進(jìn)一步利用UniProt蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù),將獲得的蛋白名稱(chēng)轉(zhuǎn)化為其官方名稱(chēng)(Official Symbol)并限定物種為“Homo Sapiens”。

ADME是指藥物發(fā)揮藥效,需克服藥代動(dòng)力學(xué)屏障,所包含的吸收(absorption)、分布(distribution)、代謝(metabolism)、排泄(excretion)過(guò)程[14]。采用TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)的ADME預(yù)測(cè)功能,得到金雀異黃素的藥代動(dòng)力學(xué)特性,包括口服生物利用度(oral bioavailability, OB)、類(lèi)藥性(Drug-likeness, DL)、小腸上皮細(xì)胞滲透性(Caco-2 permeability)等[15]。其中,DL是藥物設(shè)計(jì)中的一個(gè)定性概念,用于評(píng)估化合物是否有可能成藥,有助于優(yōu)化藥物動(dòng)力學(xué)和藥物性質(zhì),如溶解度和化學(xué)穩(wěn)定性[16],一般認(rèn)為DL>0.18即具有很好的類(lèi)藥性。

1.2? GEO 數(shù)據(jù)庫(kù)提取子宮內(nèi)膜癌差異表達(dá)基因

以美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心(National Center for Biotechnology Information Search database, NCBI)的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)(Gene Expression Omnibus database,

GEO)檢索子宮內(nèi)膜癌的相關(guān)數(shù)據(jù)集,設(shè)置“Organism”為“Homo sapiens”,經(jīng)過(guò)瀏覽題目、設(shè)計(jì)方案及樣本信息等,最終確定由Risinger JH等提交的GSE17025基因數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集納入子宮內(nèi)膜癌患者樣本91例,以12例正常的子宮內(nèi)膜樣本(取自絕經(jīng)后的受試者)作為對(duì)照。進(jìn)一步運(yùn)用R語(yǔ)言的limma軟件包[17](http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/limma.html)進(jìn)行差異基因表達(dá)的分析,篩選標(biāo)準(zhǔn):adjust P<0.01且|logFC|≥2。

1.3? PPI網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?/p>

為明晰差異基因與金雀異黃素靶點(diǎn)之間的相互作用,利用R語(yǔ)言將二者取交集并繪制維恩圖,從而確定二者的映射靶點(diǎn),并提交至STRING 11.0在線平臺(tái)(https://string-db.org),生物種類(lèi)設(shè)置為“Homo sapiens”,最小互相作用閾值設(shè)定為“high confidence”(置信度>0.7),其余為默認(rèn)設(shè)置,構(gòu)建蛋白互作網(wǎng)絡(luò)(protein-protein interaction,PPI)模型[18]。得到的PPI網(wǎng)絡(luò)通過(guò)Cytoscape 3.7.2軟件進(jìn)行可視化呈現(xiàn)及分析,使用內(nèi)置的“CytoNCA”模塊計(jì)算網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù),并以連接度值(Degree)作為節(jié)點(diǎn)重要性的量化參考,進(jìn)而篩選其重要靶標(biāo)。

1.4? GO功能富集分析

將金雀異黃素與內(nèi)膜癌差異基因的交集靶點(diǎn),利用生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫(kù)[19](DAVID, https://david.

ncifcrf.gov/summary.jsp, Version 6.8)進(jìn)行GO富集分析(P<0.01),尋找出參與調(diào)控的信號(hào)通路及相關(guān)生物學(xué)過(guò)程,并以R語(yǔ)言繪制條形圖及氣泡圖。其中GO富集分析涵蓋分子功能(molecular function, MF),細(xì)胞組分(cellular component, CC)和生物過(guò)程(biological proess, BP)3個(gè)部分[20]。

1.5? KEGG通路富集分析

通過(guò)Cytoscape 3.7.2中的ClueGO插件,對(duì)金雀異黃素與內(nèi)膜癌差異基因的交集靶點(diǎn)進(jìn)行KEGG信號(hào)通路(P<0.05)富集分析。

2 結(jié)果

2.1? 金雀異黃素潛在靶標(biāo)預(yù)測(cè)及ADME特性

通過(guò)TCMSP、Swiss Target Prediction、ETCM等8個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù),全面細(xì)致地獲得金雀異黃素的潛在靶標(biāo),其中TCMSP獲得97個(gè),Swiss Target Prediction獲得101個(gè),ETCM獲得56個(gè),DrugBank獲得13個(gè),STICH獲得10個(gè),ZINK獲得21個(gè),CTD獲得830個(gè),TTD獲得1個(gè),靶標(biāo)名稱(chēng)經(jīng)由UniProt蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫(kù)規(guī)范,及合并去重最終為879個(gè)。并基于TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)獲得金雀異黃素DL、Caco-2、OB等ADME參數(shù)信息,結(jié)果顯示其DL值為0.21。見(jiàn)圖1。

2.2? 子宮內(nèi)膜癌差異表達(dá)基因

基于GEO數(shù)據(jù)庫(kù)獲得GSE17025基因微陣列,與健康對(duì)照組比較,子宮內(nèi)膜癌患者中930個(gè)基因存在差異表達(dá),其中,580個(gè)表達(dá)上調(diào)(圖中紅色三角),350個(gè)表達(dá)下調(diào)(圖中綠色方形)。見(jiàn)圖2。

2.3? PPI網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?/p>

將挖掘得到的差異表達(dá)基因靶點(diǎn)與金雀異黃素基因靶點(diǎn),利用R語(yǔ)言相映射篩選出70個(gè)交集靶點(diǎn),見(jiàn)圖3。進(jìn)而將交集靶點(diǎn)信息提交至STRING 數(shù)據(jù)庫(kù),設(shè)置生物種類(lèi)為“Homo sapiens”,最小互相作用閾值設(shè)定為“high confidence”(置信度>0.7),得到的PPI網(wǎng)絡(luò)圖通過(guò)Cytoscape 3.7.2軟件及內(nèi)置的CytoNCA模塊進(jìn)行可視化呈現(xiàn)及網(wǎng)絡(luò)拓?fù)浞治?。此PPI網(wǎng)絡(luò)中共涉及50個(gè)節(jié)點(diǎn),142條邊,進(jìn)一步根據(jù)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋮?shù)對(duì)節(jié)點(diǎn)重要度進(jìn)行排序,以Degree>10為篩選條件,排名依次為STAT3、BIRC5、MKI67、MMP9、CDC20、CCNB2、NCAPG、CENPF、ASPM、KIF20A、PBK、TOP2A、DLGAP5、RRM2,這些蛋白與其他蛋白相互作用更強(qiáng),在網(wǎng)絡(luò)中發(fā)揮了關(guān)鍵作用,說(shuō)明金雀異黃素可能主要通過(guò)這些蛋白發(fā)揮對(duì)子宮內(nèi)膜癌的潛在治療作用。見(jiàn)圖4。

2.4? GO功能富集分析

將預(yù)測(cè)的金雀異黃素治療子宮內(nèi)膜癌的70個(gè)交集靶點(diǎn),提交至DAVID數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行GO功能富集分析,設(shè)置pvalue≤0.01得到條目70條,涵蓋生物過(guò)程(BP)44條,細(xì)胞組成(CC)10條,分子功能(MF)17條。GO生物學(xué)功能富集分析表明了金雀異黃素治療子宮內(nèi)膜癌的藥效機(jī)制,主要涉及RNA聚合酶II啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、凋亡、凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)控、藥物反應(yīng)等生物過(guò)程;細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核等重要的細(xì)胞組分;蛋白結(jié)合、酶結(jié)合等分子功能。以R語(yǔ)言將GO富集分析結(jié)果繪制條形圖,僅展示BP、CC、MF排名前10的生物學(xué)功能,見(jiàn)圖5。

2.5? KEGG通路富集分析

將預(yù)測(cè)的金雀異黃素治療EC的70個(gè)交集靶點(diǎn),以Cytoscape 3.7.2中的ClueGO插件進(jìn)行KEGG通路富集分析,設(shè)置pvalue≤0.05,得到21條相關(guān)通路,從圖中可以看出IL-17(IL-17 signaling pathways)、p53(p53 signaling pathway)、TGF-β(TGF-beta signaling pathway)信號(hào)通路為其主要富集的通路,所涵蓋交集靶點(diǎn)的數(shù)目較多且P值較低,說(shuō)明金雀異黃素治療子宮內(nèi)膜癌可能主要通過(guò)這些信號(hào)通路發(fā)揮調(diào)控作用,其中IL-17 signaling pathways不僅涵蓋交集靶標(biāo)數(shù)量最多,且與其他信號(hào)通路交互作用也最多。見(jiàn)圖6,表1。

3 討論

天然產(chǎn)物是發(fā)掘抗癌藥物的重要源泉,紫杉醇、喜樹(shù)堿、長(zhǎng)春堿及人參皂苷Rg3等植物源性化學(xué)分子已廣泛應(yīng)用于癌癥臨床治療[21]。金雀異黃素是自然界廣泛分布的天然異黃酮類(lèi)物質(zhì),多項(xiàng)研究[9,11-12]表明其抗癌活性明顯,本課題組前期的基礎(chǔ)研究也發(fā)現(xiàn),金雀異黃素通過(guò)上調(diào)ERα、下調(diào)ERβ的表達(dá),進(jìn)而升高ERα/ERβ的比值,發(fā)揮抑制子宮內(nèi)膜癌HEC-1B及Ishikawa細(xì)胞株的活力和增殖。高偉敏等[22]的研究表明,金雀異黃素可在腫瘤細(xì)胞中減少Bcl-2蛋白表達(dá)的同時(shí)上調(diào)Bax的表達(dá),使Bax/Bcl-2比值顯著增高,從而誘導(dǎo)腫瘤細(xì)胞的凋亡[6]。研究熱點(diǎn)多集中在單一機(jī)制的體外基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)上,不足以系統(tǒng)揭示金雀異黃素抗子宮內(nèi)膜癌的復(fù)雜機(jī)制。故本研究通過(guò)網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)聯(lián)合GEO的差異基因分析的方法,試圖闡釋金雀異黃素治療EC的靶點(diǎn)及機(jī)制。現(xiàn)討論如下:

網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)作為新興藥理學(xué)研究方法,它涵蓋了系統(tǒng)生物學(xué)、計(jì)算生物學(xué)和網(wǎng)絡(luò)分析等多學(xué)科技術(shù),具有整體性及系統(tǒng)性的特點(diǎn)[23],顛覆了既往單靶點(diǎn)機(jī)制通路難以詮釋藥物多靶點(diǎn)協(xié)同作用的狀況。基因的差異表達(dá)分析是在轉(zhuǎn)錄組學(xué)水平上鑒別組織間或細(xì)胞基因表達(dá)差異的技術(shù),是生物信息學(xué)領(lǐng)域重要的分析手段之一[24]。本研究基于開(kāi)源GEO數(shù)據(jù)庫(kù),經(jīng)匹配篩選后獲得編號(hào)為GSE17025高通量數(shù)據(jù)集,該數(shù)據(jù)集來(lái)源于91個(gè)子宮內(nèi)膜癌樣本和12個(gè)正常內(nèi)膜樣本,經(jīng)以R語(yǔ)言分析后,獲得930個(gè)差異表達(dá)的基因。本數(shù)據(jù)集樣本量大,且來(lái)源于人體組織,更真實(shí)準(zhǔn)確的子宮內(nèi)膜癌患者差異基因的表達(dá)信息。

金雀異黃素經(jīng)TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)獲得其ADME參數(shù),王永華等[15]通過(guò)計(jì)算TCMSP數(shù)據(jù)庫(kù)中所包含的全部化學(xué)成分的類(lèi)藥性,得出DL>0.18的分子具有較好的類(lèi)藥性,由圖1(A)可知金雀異黃素的DL值為0.21,表明其可以作為一個(gè)良好的藥物候選分子。

進(jìn)一步通過(guò)對(duì)8個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)檢索金雀異黃素的潛在靶標(biāo),各個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)通過(guò)文本挖掘、藥效集團(tuán)匹配、疾病臨床資料、實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證等知識(shí)發(fā)現(xiàn)技術(shù)獲得靶標(biāo),通過(guò)以上獲得了較為細(xì)致且全面879個(gè)金雀異黃素的靶標(biāo)。進(jìn)而通過(guò)R語(yǔ)言獲得差異基因與金雀異黃素70個(gè)交集靶點(diǎn),經(jīng)構(gòu)建的PPI網(wǎng)絡(luò)及CytoNCA模塊進(jìn)行拓?fù)鋮?shù)分析,金雀異黃素可能主要通過(guò)STAT3、BIRC5、MKI67、MMP9、CDC20、CCNB2、NCAPG、CENPF、ASPM、KIF20A、PBK、TOP2A、DLGAP5、RRM2等基因發(fā)揮對(duì)子宮內(nèi)膜癌的潛在治療作用。其中,STAT3、BIRC5、MKI67、MMP9、CDC20、ASPM和TOP2A已被證明與EC密切相關(guān)。STAT3[25]、MMP9[26]在子宮內(nèi)膜癌中呈現(xiàn)高表達(dá),發(fā)揮癌基因的功能,且與病理分級(jí)、臨床分期等密切相關(guān)。BIRC5是Survivin的編碼基因,Survivin是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的凋亡抑制蛋白,促進(jìn)腫瘤的增殖并抑制其凋亡[27],但BIRC5與子宮內(nèi)膜癌的直接機(jī)制尚未報(bào)道。MKI67即Ki67,多項(xiàng)報(bào)道其在EC患者呈高表達(dá),對(duì)子宮內(nèi)膜癌的診斷及預(yù)后具有重要意義[28-30]。ASPM[31]、 CDC20[32]可以作為臨床獨(dú)立預(yù)測(cè)的預(yù)后指標(biāo)及治療的潛在靶基因。Fuminori Ito[33]發(fā)現(xiàn)TOP2A過(guò)表達(dá)的患者預(yù)后較不表達(dá)TOP2A的患者差,并且TOP2A可能是接受輔助紫杉醇-鉑類(lèi)方案治療EC的生物標(biāo)志物。并且回溯GSE17025基因微陣列,以上7個(gè)基因也均在EC中表達(dá)上調(diào),與本次研究結(jié)果相符合。但CCNB2、NCAPG、CENPF、KIF20A、PBK、DLGAP5和RRM2雖與多種腫瘤的發(fā)生及進(jìn)展密切相關(guān),但與EC的關(guān)系尚不明確,值得進(jìn)一步深入研究。

此外GO功能富集分析表明金雀異黃素治療EC藥效機(jī)制,主要涉及RNA聚合酶II啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄的正調(diào)控、凋亡、凋亡過(guò)程的負(fù)調(diào)控、藥物反應(yīng)等生物過(guò)程;細(xì)胞質(zhì)、細(xì)胞核等重要的細(xì)胞組分;蛋白結(jié)合、酶結(jié)合等分子功能。ClueGO的KEGG通路富集結(jié)果表明,金雀異黃素主要通過(guò)IL-17(IL-17 signaling pathways)、p53(p53 signaling pathway)、TGF-β(TGF-beta signaling pathway)等信號(hào)通路發(fā)揮藥效機(jī)制。其中,IL-17 signaling pathways不僅涵蓋交集靶標(biāo)數(shù)量最多,且與其他信號(hào)通路交互作用也最多,如Toll樣受體、TNF和AGE-RAGE等信號(hào)通路,多項(xiàng)研究亦發(fā)現(xiàn),IL-17在EC呈高表達(dá)[34-36], 并能使HEC-1-B細(xì)胞的活力、遷移和侵襲明顯增強(qiáng)。p53蛋白[37-39]主要存在于子宮內(nèi)細(xì)胞核內(nèi)部,結(jié)構(gòu)上含有脯氨酸及多重絲氨酸結(jié)構(gòu),其能夠通過(guò)結(jié)合下游糖蛋白配體,進(jìn)而促進(jìn)信號(hào)通路的激活,促進(jìn)子宮內(nèi)內(nèi)膜癌細(xì)胞的持續(xù)性浸潤(rùn)和轉(zhuǎn)移過(guò)程,突變的p53可直接反映子宮內(nèi)膜癌的惡性程度,可作為獨(dú)立的生物學(xué)標(biāo)志物。TGF-β[40-41]是作用于上皮細(xì)胞的重要生長(zhǎng)因子之一,具有多重生理功能,在調(diào)控細(xì)胞增殖、分化、遷移和凋亡中扮演重要角色,在腫瘤的惡性生物學(xué)行為中的起雙向調(diào)節(jié)作用,在EC發(fā)展的早期主要發(fā)揮抑制性效應(yīng),而在EC的進(jìn)展期及晚期主要發(fā)揮促進(jìn)作用,主要表現(xiàn)為促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖、突變,抑制機(jī)體抗腫瘤免疫反應(yīng)等。

綜上,本研究運(yùn)用現(xiàn)代信息技術(shù),將隱性的知識(shí)顯性化,系統(tǒng)挖掘金雀異黃素治療EC的作用靶點(diǎn)及潛在作用機(jī)制,為進(jìn)一步深入闡釋其機(jī)制,及臨床研究和實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證提供了思路。但基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)、GEO數(shù)據(jù)庫(kù)差異基因分析技術(shù)本身的局限性等多方面因素,得出的結(jié)論有待后續(xù)臨床及實(shí)驗(yàn)的進(jìn)一步驗(yàn)證與完善。

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