董 坤,陳 玲,盧 俊,張曉玲,鄭立飛,4,楊柱瓊,余學堂,曾黎瓊
(1.云南省農(nóng)業(yè)科學院富源魔芋研究所,云南 富源 655500;2.云南省農(nóng)業(yè)科學院生物技術與種質(zhì)資源研究所,云南省農(nóng)業(yè)生物技術重點實驗室,農(nóng)業(yè)部西南作物基因資源與種質(zhì)創(chuàng)制重點實驗室,云南 昆明 650223; 3.威信縣農(nóng)業(yè)技術推廣中心,云南 昭通 657900;4.云南農(nóng)業(yè)大學園林園藝學院,云南 昆明 650201)
魔芋是天南星科多年生草本植物,其球莖中含有大量葡甘露聚糖,該物質(zhì)具有高吸水性和高膨脹性,在醫(yī)藥、食品、化工等領域都有廣泛的應用。中國是魔芋的原產(chǎn)地之一,栽培和利用魔芋歷史悠久。云南省特有的地形和氣候條件,是發(fā)展魔芋產(chǎn)業(yè)的適宜 區(qū)域[1-2]。尤其是近年來,隨著國家鄉(xiāng)村振興戰(zhàn)略的實施,魔芋產(chǎn)業(yè)成為山區(qū)扶貧的重要項目之一,農(nóng)民種植魔芋的積極性日益高漲。目前,關于魔芋的研究多集中在栽培技術[3-5]、病蟲害防治[6-7]等方面。也有學者就魔芋的形態(tài)學開展了一系列研究[8-10],制定了相關的國家標準[11],為魔芋種質(zhì)資源的鑒定奠定了良好的基礎。在分子標記方面,RAPD、AFLP、ISSR等技術都被應用于魔芋種質(zhì)資源研究[12-16],為魔芋屬植物分類以及種質(zhì)資源的遺傳多樣性分析提供了依據(jù)。筆者利用ISSR 分子標記技術,對富源縣金地魔芋種業(yè)有限公司收集和自育的15 份魔芋資源的親緣關系進行分析,旨在為不同魔芋資源的鑒定及其開發(fā)利用提供依據(jù)。
15 份魔芋資源編號為1~15 號,其中,1、5~7、11 號來源于云南富源,2 號來源于云南普洱,3 號來源于云南楚雄,4 號來源于云南文山,8 號(遠雜1 號)來源于湖北恩施,9、12 號來源于云南臨滄,10、13、14、15 號分別來源于云南會澤、貴州威寧、云南昭通、云南瀘西。收集后于2019 年種植在富源縣金地魔芋種業(yè)有限公司魔芋種植基地。
參考NT-T2500—2013 植物新品種特異性、一致性和穩(wěn)定性測試指南 魔芋觀測記錄魔芋植株葉柄、葉片、球莖、花、果的形態(tài)特征。播種時測定種芋重量,膨大期測量其株高、葉柄周長、葉柄長度、開展度,倒苗后挖出球莖測定其重量。
采用Magen(美基)生物公司DNA 提取試劑盒提取供試材料單株葉片基因組DNA。DNA 純化后用0.8%瓊脂糖凝膠檢測,以確定其質(zhì)量。利用紫外分光光度計將DNA 濃度調(diào)整為10 ng/μL,存于-20℃冰箱備用。
PCR 反應體系總體積為15 μL:天根2×Taq PCR MasterMPCR 7.5 μL,引物(10 μmol/L)1 μL(所用引物由上海生工合成,詳見表1),模板DNA(10 ng/μL)2 μL,ddH2O 4.5 μL,最后加1 滴石蠟油防止蒸發(fā)。反應條件為:94℃預變性5 min;94℃變性30 s,50~55℃復性30 s(溫度因引物不同而異,具體溫度如表1 所示),72℃延伸1 min,共35 個循環(huán);72℃延伸10 min。PCR 擴增產(chǎn)物在3%瓊脂糖凝膠上以5 V/cm 恒壓電泳,選用DL 1 000 marker (寶生物工程大連有限公司)作為對比,通過凝膠成像系統(tǒng)拍照記錄。
采用Excel 和SPSS19.0 統(tǒng)計軟件進行試驗數(shù)據(jù)的分析比較;運用Popgeng-32 軟件計算各材料間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離,并進行聚類分析。
表1 ISSR 引物名稱,序列及其退火溫度
15 份魔芋資源的形態(tài)特征詳見圖1 和表2。1、3、15、5、13、9 號樣品具有花魔芋形態(tài)特征,它們的主要區(qū)別在于葉柄主色、葉柄斑紋顏色和形狀的不同。1、3、15、5、13、9 號樣品球莖肉色都為白色,其中15號樣品白色球莖肉色中有紅絲,與其他樣品明顯不同。1、3、15、13、9 號魔芋的肉穗狀花序長度高于佛焰苞位置;5 號魔芋的肉穗狀花序長度約等于佛焰苞位置。6、7、14、8 號樣品具有白魔芋形態(tài)特征,植株較矮小,主要區(qū)別是葉柄主色、葉柄斑紋形狀和顏色不同。6 號魔芋葉柄綠色,細小點狀灰白色斑紋;7號魔芋葉柄綠色,塊狀斑紋;14 號魔芋葉柄綠色,點狀斑紋;8 號魔芋葉柄淺粉紅色,塊狀墨綠色斑紋。2號魔芋植株相對較大,球莖肉色為黃色,附屬器淺紫色且有皺褶,果序為藍色,鑒定為勐海魔芋。4 號魔芋植株分叉處有株芽,植株較大,球莖肉色為粉紅色,佛焰苞內(nèi)側紅色,外側粉紅色,果序為橙紅色,是一種珠芽魔芋。10 號魔芋和11 號魔芋鑒定為滇魔芋,主要區(qū)別是葉柄和葉柄斑顏色不同,11 號魔芋的葉柄主色更深,斑點更多,果序為藍色。12 號魔芋植株較大,叢生性強,球莖上芽點較多,根系發(fā)達,球莖肉色為橙色,鑒定為甜魔芋,開花后干枯死亡,未見結子。
圖1 15 份魔芋相關器官的形態(tài)特征
表2 樣品來源及形態(tài)比較
如表3 所示,2、4 號魔芋的平均株高、葉柄長、開展度、葉柄周長數(shù)值較大,6、7、8、14 號魔芋的平均株高、葉柄長、開展度、葉柄周長數(shù)值較??;生長系數(shù)最大的是5 號魔芋,為5.78。
提取15 份魔芋葉片基因組DNA 進行了ISSR分析。從41 條引物中篩選出31 條引物可擴增出清晰穩(wěn)定、重復性好、多態(tài)性高的條帶,圖2 為引物UBC822 的電泳圖譜。結果顯示,以15 份魔芋葉片基因組DNA 作為模板,31 條引物共擴增出490 條DNA帶,其中多態(tài)性條帶共489 條,占99.80%。
利用Popgen 32 軟件計算不同魔芋材料間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離,結果見表4。可見,15 份魔芋材料之間的遺傳相似系數(shù)在0.555 1~0.942 9,遺傳距離在0.058 8~0.588 6,其中1 號花魔芋與3 號花魔芋之間的遺傳相似系數(shù)最大,為0.942 9,遺傳距離最小,為0.058 8;3 號花魔芋與11 號滇魔芋芋之間的遺傳相似系數(shù)最小,為0.555 1,遺傳距離最大,為0.588 6。聚類分析結果見圖3,15 份魔芋材料在遺傳相似系數(shù)為0.69 的位置處分成6 大類:第一類包括1、3、15、5、13、9 號樣品,具有花魔芋形態(tài)特征;第二類包括6、7、14、8 號樣品,具有白魔芋形態(tài)特征;第三類包括2 號樣品(勐海魔芋);第四類包括4 號樣品(珠芽魔芋);第五類包括10、11 號樣品,具有滇魔芋的形態(tài)特征;第六類包括12 號樣品,具有甜魔芋的形態(tài)特征??梢姡?5 份魔芋的遺傳聚類與形態(tài)外觀調(diào)查分析結果基本一致。
表3 15 份魔芋材料的生長情況
圖2 ISSR 分析電泳圖(引物UBC822)
表4 15 份魔芋材料的的遺傳相似系數(shù)(—以上)和遺傳距離(—以下)
在同樣的種植條件下觀察不同魔芋種質(zhì)資源的農(nóng)藝性狀,可以看出曲靖市富源縣竹園鎮(zhèn)的氣候環(huán)境不是白魔芋、勐海魔芋、珠芽魔芋、滇磨芋和甜魔芋的最佳生長條件,導致這些魔芋植株長勢稍差。從生長系數(shù)看,5 號魔芋更適合在當?shù)胤N植。
圖3 15 份魔芋材料的聚類結果
對15 份魔芋材料的葉、球莖、花、果等進行了觀察記載和農(nóng)藝性狀分析調(diào)查,并利用ISSR 分子標記技術分析了它們的遺傳多樣性,聚類分析結果顯示,花魔芋、白魔芋、勐海魔芋、珠芽魔芋、滇魔芋、甜魔芋各自聚為一類,遠雜1 號在遺傳上更接近于白魔芋,為今后魔芋種質(zhì)資源鑒定和保護利用提供了依據(jù)。
ISSR 分子標記技術能夠揭示植物的遺傳多態(tài)性,有效反映出品種間的親緣關系。任盤宇等[14]對云南南部5 種魔芋屬植物居群遺傳結構的分析中,通過PCR 擴增9 個ISSR 引物共獲得95 條條帶,其中多態(tài)性條帶占總條帶數(shù)的100%。在該研究中,15 份魔芋材料通過31 個引物進行PCR 擴增共獲得490 條條帶,其中多態(tài)性條帶489 條,占總條帶數(shù)的99.80%。遺傳相似系數(shù)是比較不同品種或群體間遺傳多樣性的重要指標。任盤宇等[14]利用ISSR 技術對云南南部5 種魔芋屬植物居群遺傳結構分析的樣品間遺傳相似系數(shù)為0.857 1~0.473 7,宣慢[16]利用ISSR 技術對49 份魔芋屬資源的多樣性分析,其遺傳相似系數(shù)為1.00~0.68,該研究中15 份魔芋樣品間的遺傳相似系數(shù)為0.555 1~ 0.942 9,居于前二者的研究結果之間。聚類分析結果顯示,花魔芋和白魔芋的雜交品種遠雜1 號的親緣關系更靠近白魔芋。滕彩珠等[17]進行的云南魔芋種質(zhì)資源親緣關系ISSR 分析發(fā)現(xiàn)甜魔芋與花魔芋聚到一起,與該研究結果中甜魔芋(12 號樣品)與滇魔芋(10、11 號樣品)聚到一起,有所不同,可能是因為該研究所選擇的ISSR 引物較少未能全面地反映二者在DNA水平上的差異所致。