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miRNA 調(diào)節(jié)乳腺組織脂肪代謝的研究進(jìn)展

2021-05-17 08:12馬青山王長法劉桂芹
中國畜牧雜志 2021年5期
關(guān)鍵詞:乳脂脂質(zhì)脂肪酸

馬青山,王長法,劉桂芹,李 艷

(聊城大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山東省黑毛驢高效繁育與生態(tài)飼養(yǎng)工程技術(shù)研究中心,山東省驢產(chǎn)業(yè)科技協(xié)同創(chuàng)新中心,山東聊城 252000)

乳脂作為乳制品中主要成分之一,其組分種類及含量是影響乳口感及營養(yǎng)價(jià)值的重要因素。乳脂代謝涉及到一個(gè)龐大、復(fù)雜的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),受眾多激素及信號分子調(diào)控[1-2]。隨著研究的不斷深入,越來越多的研究表明microRNA(miRNA)也是乳腺組織脂肪代謝的重要調(diào)控因子[3-5]。miRNA 為一類單鏈非編碼小分子RNA,能夠從轉(zhuǎn)錄后水平負(fù)調(diào)控基因表達(dá),參與動物的生殖、生長及發(fā)育等多種生命活動[6],還是肝臟和脂肪等脂質(zhì)代謝旺盛組織中脂肪代謝的關(guān)鍵調(diào)控因子[7]。本文對近年來miRNA 調(diào)控乳腺組織脂肪代謝的研究做一綜述,為從miRNA 層次研究乳脂代謝,進(jìn)而改善乳品質(zhì)提供參考。

1 miRNA 簡介

miRNA 是一類內(nèi)源性、長度約在21~22 個(gè)核苷酸的非編碼RNA(Non-Coding RNA,ncRNA),通過完全或不完全堿基配對的方式結(jié)合靶基因上的miRNA識別位點(diǎn),導(dǎo)致目標(biāo)mRNA 翻譯抑制、脫腺苷化或發(fā)生降解,從而在轉(zhuǎn)錄后調(diào)控基因表達(dá)[6]。研究表明,miRNA 參與調(diào)控細(xì)胞增殖、分化和凋亡等過程,并同糖代謝、脂代謝、蛋白質(zhì)代謝、胰島素抵抗及器官發(fā)育等多種機(jī)體生命活動密切相關(guān)[8]。

編碼miRNA 的基因可存在于基因間(Intergenic)或基因內(nèi)(Intragenic)。研究顯示,大多數(shù)miRNA 的基因位于編碼/非編碼蛋白基因的內(nèi)含子區(qū)域或非翻譯區(qū)(Untranslated Region,UTR)及基因組重復(fù)區(qū)域[9]。其中,內(nèi)含子區(qū)域的miRNA 可共享宿主基因的啟動子及調(diào)控元件,從mRNA 轉(zhuǎn)錄本上完成剪接[10]。miRNA在細(xì)胞內(nèi)的生物合成過程極為復(fù)雜,受到多種催化酶及輔助蛋白的協(xié)同調(diào)控,合成過程:①Pri-miRNA 生成,在細(xì)胞核內(nèi)RNA 聚合酶Ⅱ催化下,miRNA 基因及相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子轉(zhuǎn)錄形成局部發(fā)夾結(jié)構(gòu)的初級miRNA 轉(zhuǎn)錄本(Primary miRNA Transcript,Pri-miRNA,長度>1 kb)[11],發(fā)夾結(jié)構(gòu)通常包含于ncRNA 或mRNA 的內(nèi)含子中[12];②Pre-miRNA 生成,在核Drosha-DGCR8 異二聚體作用下,Pri-miRNA 在發(fā)夾基部裂解形成60~70 個(gè)核苷酸的莖環(huán)中間體,稱為前體miRNA(PrecursormiRNA,Pre-miRNA)[13];③Pre-miRNA 轉(zhuǎn)運(yùn),核膜轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白5(Exportin-5,EXP-5)識別Pre-miRNA 發(fā)夾3'突出部分的2 個(gè)核苷酸后[12],在Ran-GTP 的輔助下將Pre-miRNA 轉(zhuǎn)運(yùn)到細(xì)胞質(zhì)[14];④Dicer 酶切割,在細(xì)胞質(zhì)中,Dicer-RNase-III 酶與Pre-miRNA 發(fā)夾基部的5'磷酸鹽和3'突出具有特殊的親和力,能夠識別Pre-miRNA 的雙鏈部分[15],在離發(fā)夾底部約2 個(gè)螺旋處切割Pre-miRNA,形成22 個(gè)核苷酸的雙鏈miRNA(miRNA Duplex)[16];⑤miRNA 成熟及RISC 組裝,雙鏈miRNA 在解旋酶作用下產(chǎn)生成熟miRNA(約為20 個(gè)核苷酸),互補(bǔ)鏈(miRNA*)多被降解,成熟miRNA 結(jié)合到由Argonaute 家族蛋白組成的復(fù)合物中,組裝形成RNA 誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RNA-Induced Silencing Complex,RISC)[17],RISC 可與靶基 因mRNA 3′UTR 或CDS 序列的特異性位點(diǎn)結(jié)合,進(jìn)而調(diào)控靶基因表達(dá)[15]。

隨著研究的深入,越來越多的miRNA 被發(fā)現(xiàn)和鑒定,miRNA、靶基因以及miRNA 同其他RNAs 互作的海量信息構(gòu)成了研究miRNA 的重要數(shù)據(jù)庫。常用數(shù)據(jù)庫包括miRBase、TargetScan、ENCORI、PITA、PicTar、RNAhybrid、miRWalk、DIANA-microT、miRNAMap 及Deepbase 等。其中,miRBase(v22,http://www.mirbase.org/)是存儲miRNA 信息最主要的公共數(shù)據(jù)庫之一,可提供miRNA 序列、注釋信息及靶標(biāo)基因預(yù)測等全方位數(shù)據(jù),該數(shù)據(jù)庫已收錄271 個(gè)物種共38 589 個(gè)發(fā)夾前體和48 860 條成熟的miRNA 序列[18]。TargetScan(v7.2,http://www.targetscan.org/vert_72/)是預(yù)測miRNA 哺乳動物靶基因較為常用的數(shù)據(jù)庫,該數(shù)據(jù)庫通過尋找與miRNA 種子區(qū)匹配的保守8mer、7mer 和6mer位點(diǎn)對miRNA 的生物學(xué)靶點(diǎn)預(yù)測[19],已覆蓋人、小鼠、大鼠、猩猩、恒河猴、奶牛、狗、負(fù)鼠、雞和青蛙等動物miRNA 靶基因信息。在研究miRNA 互作方面,ENCORI(2019 版本,http://starbase.sysu.edu.cn/index.php)數(shù)據(jù)庫覆蓋了包括32 種癌癥的10 882 個(gè)RNAseq 和10 546 個(gè)miRNA-seq 數(shù)據(jù),可提供基于CLIPseq 和降解組測序挖掘的miRNA-ncRNA、miRNAmRNA、ncRNA-RNA、RNA-RNA、RBP-ncRNA 及RBP-mRNA 之間的相互作用分析[20],這對研究miRNA功能及其調(diào)控網(wǎng)絡(luò)具有重要幫助。

2 乳脂代謝

乳脂代謝涉及到一個(gè)龐大、復(fù)雜的分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),受到眾多激素及信號分子等調(diào)控,包括脂肪酸、甘油三酯的攝入、轉(zhuǎn)運(yùn)、活化及合成,脂滴的形成和分泌等過程,相應(yīng)的關(guān)鍵基因:①脂蛋白酯酶(Lipoprotein Lipase,LPL)為血液及乳腺組織與脂肪酸攝入相關(guān)基因;②脂肪酸結(jié)合蛋白3(Fatty Acid Binding Protein 3,F(xiàn)ABP3)和白細(xì)胞 分化抗原36(Cluster of Differentiation 36,CD36)為胞內(nèi)脂 肪酸轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因;③長鏈?;o酶A 合成酶1(Acyl Coenzyme A Long-Chain l Synthetase,ACSL1)和乙酰輔酶A 合成酶1/2(Acetyl Coenzyme A Synthetase 1/2,ACSS1/2)為長鏈及短鏈脂肪酸活化胞內(nèi)活化相關(guān)基因;④乙酰輔酶A 羧化酶α(Acetyl-CoA Carboxylase Alpha,ACCα)和脂肪酸合酶(Fatty Acid Synthase,F(xiàn)ASN)為脂肪酸從頭合成相關(guān)基因;硬脂酰輔酶A 去飽和酶(Stearoyl Coenzyme A Desaturase,SCD)和脂肪酸去飽和酶1(Fatty Acid Desaturase 1,F(xiàn)ADS1)為脂肪酸去飽和相關(guān)基因;1-?;视土姿狨;D(zhuǎn)移酶6(1-Acylglycerol-3-Phosphate O-Acyltransferase 6,AGPAT6)、線粒體甘油-3-磷酸?;D(zhuǎn)移酶(Glycerol-3-Phosphate Acyltransferases,Mitochondrial,GPAM)和脂素1(LPIN1)為甘油三酯合成關(guān)鍵基因;⑤脂滴形成、分泌相關(guān)基因包括嗜乳脂亞家族1 成員A1(Butyrophilin Subfamily 1,Member A1,BTN1A1)、黃嘌呤脫氫酶(Xanthine Dehydrogenase,XDH)、脂滴包被蛋白2(Perilipin2,PLIN2)、脂肪分化相關(guān)蛋白(Adipocyte Differentiation Related Protein,ADRP)及黃嘌呤氧化還原酶(Xanthine Oxidoreductase,XOR),由上述基因組成的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)參與并調(diào)控乳脂代謝[1,21]。另外,調(diào)控機(jī)體脂質(zhì)代謝重要的轉(zhuǎn)錄因子對乳脂代謝通路中的關(guān)鍵酶及蛋白表達(dá)起到調(diào)控作用,如過氧化物酶體增殖物激活受體γ(Peroxisome Proliferators-Activated Receptorsγ,PPARγ)、固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白-1(Sterol Regulatory Element-Binding Protein 1,SREBP-1)、胰島素誘導(dǎo)基因1(Insulin Induced Gene 1,INSIG1)和肝X 受體(Liver X Receptor,LXR)等[1,22]。隨著候選基因篩選策略和比較基因組學(xué)研究方法的發(fā)展,更多的乳脂代謝相關(guān)的基因及調(diào)控因子被學(xué)者發(fā)現(xiàn)并驗(yàn)證功能,miRNA 便是其中一種重要的調(diào)控因子。

3 miRNA 調(diào)控脂質(zhì)代謝

在機(jī)體脂質(zhì)代謝調(diào)控領(lǐng)域,研究較多的轉(zhuǎn)錄因子包括SREBP-1C、PPARs 和LXRα等[23-25]。而 隨著研究的深入,miRNA 在脂質(zhì)代謝中重要的調(diào)控作用也逐漸被發(fā)現(xiàn),研究報(bào)道較多的包括miR-33a/b、miR-96、miR-122、miR-182、miR-183、miR-17-5p、miR-10b/21/27b 和miR-130b 等,其調(diào)控脂質(zhì)代謝信號通路如圖1 所示。

研究表明,miR-33 可通過多種途徑調(diào)控脂質(zhì)代謝,miR-33a/b 可抑制ATP 結(jié)合盒轉(zhuǎn)運(yùn)體A1(ATP-Binding Cassette Transporter A1,ABCA1)的表達(dá)豐度,調(diào)控膽固醇從細(xì)胞輸出及高密度脂蛋白的生物合成[26-27],這對維持細(xì)胞內(nèi)膽固醇動態(tài)平衡至關(guān)重要[28];另外,miR-33a/b 還可調(diào)控參與脂肪酸β氧化的基因,如肉毒堿棕櫚酰基轉(zhuǎn)移酶1A(Carnitine Palmityl Transferase 1A,CPT1A)、肉堿氧位甲基轉(zhuǎn)移酶(Carnitine Oxymethyl Transferase,CROT)和羥輔酶A脫氫酶β亞基(Hydroxyacyl Coenzyme A Dehydrogenase Bβ-subunit,HADHB),進(jìn)而降低脂肪酸的分解代謝[29-30],可知miR-33a/b 可結(jié)合多個(gè)靶基因序列,在不同層面調(diào)控宿主脂質(zhì)代謝。另有研究發(fā)現(xiàn),微生物也可影響miR-33 表達(dá),從而調(diào)節(jié)宿主脂質(zhì)代謝,結(jié)核分支桿菌(Mycobacterium tuberculosis)可誘導(dǎo)miR-33 及其互補(bǔ)鏈miR-33*表達(dá),從而抑制巨噬細(xì)胞中參與自噬、溶菌酶和脂肪酸氧化的通路,以支持細(xì)菌自身復(fù)制[31],這表明菌群-miRNA 互作在調(diào)控脂質(zhì)代謝中或許也發(fā)揮著重要作用。

miR-96/182/183 組成的miRNA 簇能夠通過靶向INSIG-2和F 框/WD-40 域蛋白7(F-Box and WD-40 Domain Protein 7,F(xiàn)BXW7)基因的3' 端非翻譯區(qū),實(shí)現(xiàn)對其表達(dá)的負(fù)調(diào)控,并通過轉(zhuǎn)錄因子SREBP2調(diào)控脂肪酸的合成[7],這表明miRNA 不僅可以直接結(jié)合脂代謝相關(guān)的靶基因,還可調(diào)控關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,從而在不同分子水平影響脂代謝。而miR-122、miR-10b/21/27b、miR-17-5p、miR-130b 和miR-454 都可調(diào)控細(xì)胞中PPARs表達(dá)豐度,從而影響機(jī)體膽固醇和脂肪酸代謝[32-36],此外,miR-370 還可通過miR-122 間接作用,調(diào)節(jié)靶基因SREBP-1c、二酯酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶2(Diacylgycerol Acyltransferase 2,DGAT2)及CPT1的表達(dá)豐度,進(jìn)而導(dǎo)致肝臟中甘油三酯累積[37],這表明miRNA-miRNA 之間存在互作并對靶基因表達(dá)產(chǎn)生影響。同時(shí),miR-122 還可通過促炎性因子、AGPAT1及單酰甘油-O-?;D(zhuǎn)移酶1(Monoacylglycerol O-Acyltransferase 1,MOGAT1)影響著肝細(xì)胞的正常形態(tài)及功能[38]。此外,通過高通量miRNA 測序分析前蛋白轉(zhuǎn)化酶枯草桿菌蛋白酶/KEXIN9 型(Proprotein Convertase Subtilisin/Kexin Type 9,PCSK9)和低密度脂蛋白受體(LowDensity Lipoprotein receptor,LDLR)基因敲除的小鼠發(fā)現(xiàn),miR-33、miR-210 和miR-21a 以及之前未報(bào)道的miR-434 都與脂類代謝關(guān)系密切[39]。以上研究表明,miRNA 對動物脂質(zhì)代謝存在多層次互作調(diào)控,不單單是某個(gè)或幾個(gè)miRNA 對靶基因的直接作用,還存在miRNA-miRNA、miRNA-mRNA 及mRNA-mRNA 等多層次的綜合調(diào)控。

圖1 miRNA 調(diào)控機(jī)體脂質(zhì)代謝[7]

4 miRNA 調(diào)控乳脂代謝

4.1 參與調(diào)控乳脂代謝的miRNA 隨著研究的深入,miRNA 在動物乳腺發(fā)育及乳脂代謝過程中的重要調(diào)控作用日益受到關(guān)注。然而,已有報(bào)道表明,乳腺組織中脂肪代謝同機(jī)體脂質(zhì)代謝存在明顯的差異,miRNA調(diào)控方面亦是如此,這或許是由于乳腺細(xì)胞表達(dá)專屬的miRNA 所致[40]。因此,應(yīng)用高通量測序及基因芯片技術(shù)建立不同條件下乳腺組織miRNA 表達(dá)譜就顯得尤為重要。在人類研究中,Munch 等[41]對母乳脂質(zhì)進(jìn)行smRNA-Seq 發(fā)現(xiàn)了21 個(gè)新miRNA,而且存在于乳中外泌體內(nèi)的miRNA 對嬰兒發(fā)育起著重要的調(diào)控作用。還有研究發(fā)現(xiàn)母乳中的miRNA 主要來源于乳腺上皮細(xì)胞,而非母體循環(huán)系統(tǒng)[42]。對乳瘀和乳瘀+乳腺腫瘤的人乳樣本進(jìn)行測序,分別發(fā)現(xiàn)了271 個(gè)和140 個(gè)新的miRNA,這些miRNA 可能同乳腺癌的發(fā)生有關(guān)[43]。在反芻動物中的研究發(fā)現(xiàn),Shen 等[44]對源自乳脂率差異極顯著的奶牛中分離的原代乳腺上皮細(xì)胞表達(dá)譜進(jìn)行測序分析,共發(fā)現(xiàn)292 個(gè)已知的miRNA 和116 個(gè)新的miRNA。Bu 等[45]也在牛乳腺組織中獲得99 條miRNA,其中miR-23a、miR-24、miR-143 和miR-103的表達(dá)水平較高。

目前,乳脂代謝相關(guān)的miRNA 及其作用的靶基因尚未完全發(fā)現(xiàn),且通過與靶基因結(jié)合miRNA 或可影響上、下游相關(guān)基因表達(dá)。因此miRNA 對乳脂代謝的影響存在復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。miR-33、miR-103、miR-106、miR-200、miR-27、miR-25、miR-125、miR-130a、miR-141、miR-148、miR-183 和miR-454 等是目前研究較多的幾個(gè)乳脂代謝相關(guān)miRNA。研究發(fā)現(xiàn),不同miRNA 對乳脂代謝的調(diào)控存在差異,miR-33a、miR-103 過表達(dá)可促進(jìn)乳腺上皮細(xì)胞甘油三酯的合成[46-47],miR-141 通過抑制靶基因去乙酰化酶(Sirtuin1,SIRT1)表達(dá),進(jìn)而上調(diào)奶牛乳腺上皮細(xì)胞乳脂代謝相關(guān)基因的表達(dá)[48]。與之相反,miR-25、miR-27a 及miR-454 都可抑制靶基因PPARs的表達(dá),降低細(xì)胞內(nèi)甘油三酯的合成[4,36,49],miR-183 則可靶向山羊乳腺上皮細(xì)胞細(xì)胞質(zhì)中的哺乳動物STE 20 激酶1(Mammalian Sterile 20-Like Kinase1,MST1)基因,抑制乳脂合成過程[50]。Chen 等[5]研究發(fā)現(xiàn),過表達(dá)的miR-106b 導(dǎo)致奶牛乳腺細(xì)胞中甘油三酯和膽固醇含量下降,而抑制miR-106b 表達(dá)則使甘油三酯和膽固醇含量增加,進(jìn)而抑制乳脂合成。還有研究發(fā)現(xiàn),羊乳腺組織中miR-103、miR-200a、miR-27a 及miR-23a 協(xié)同調(diào)控了乳腺脂肪酸合成過程,而且對相關(guān)基因的調(diào)控模式也存在差異[51],這表明乳脂代謝過程受到眾多miRNA的協(xié)同調(diào)控,單一miRNA 可以調(diào)控多條mRNA,而且同一性狀或生理過程也可受到多個(gè)miRNA 的調(diào)控。

此外,在泌乳的不同階段miRNA 表達(dá)也存在差異。在人類中的研究發(fā)現(xiàn),與足月母乳相比,早產(chǎn)兒母乳中miR-320a 表達(dá)豐度較低,而miR-148a 表達(dá)豐度較高[52]。沙袋鼠(Macropus Eugenii)不同泌乳階段乳內(nèi)miRNA 表達(dá)量存在差異表達(dá),這些miRNA 可作為乳腺活動的假定標(biāo)記和功能候選信號以促進(jìn)幼仔的生長和發(fā)育[53]。對反芻動物的研究發(fā)現(xiàn),奶牛產(chǎn)奶高峰期表達(dá)的1 692 810 個(gè)reads 中,在干奶期僅有34%表達(dá);差異表達(dá)的173 個(gè)miRNA 中,在泌乳高峰期有165 個(gè)表達(dá)量下調(diào)[54]。乳山羊乳腺泌乳早期和晚期miRNA 表達(dá)譜也同樣存在差異[47],這表明miRNA 的表達(dá)模式或許隨著動物的生理狀態(tài)、泌乳階段等而發(fā)生變化。

4.2 miRNA 調(diào)控乳脂代謝的靶基因 獲知miRNA 的靶基因?qū)M(jìn)一步明確其調(diào)控的信號通路至關(guān)重要。調(diào)控乳腺組織乳脂代謝miRNA 的靶基因功能主要集中在乳脂的合成、轉(zhuǎn)運(yùn)、氧化及分泌等過程(表1)。

如表1 所示,miRNA 調(diào)控乳脂代謝相關(guān)的靶基因數(shù)目眾多,其中miR-135a 作用于極低密度脂蛋白受體(Very Low Density Lipoprotein Receptor,VLDLR)基因[63],miR-214 靶基因?yàn)镠ADHB基因[54],miR-34b 通過靶基因脫帽酶1A(Decapping Enzyme 1A,DCP1A)調(diào)節(jié)乳脂合成[58],而miR-26 家族靶基因?qū)儆赑I3K-Akt、MAPK信號通路和脂肪酸生物合成通路[56]。進(jìn)一步分析可知,單一靶基因可受到多個(gè)miRNA 調(diào)控,如調(diào)控靶基因PPAR的miRNA 包括miR-17-5p、miR-130a,調(diào)控靶基因過氧化物酶體增殖物激活受體-γ共激活因子-1(Peroxisome Proliferator-activated ReceptorγCoactivator-1,PGC-1)相關(guān)的miRNA 包括miR-17-5p、miR-25,調(diào)控靶基因FAS相關(guān)的miRNA 包括miR-103、miR-148,調(diào)控靶基因HADHB相關(guān)的miRNA 包括miR-33a/b、miR-214,調(diào)控靶基因ABCA1相關(guān)的miRNA 包括miR-33a/b、miR-106,而miR-10a、miR-15b、miR-142-5p 及miR-374b都可能作用于溶質(zhì)載體家族30 成員4(Solute Carrier Family 30 Member 4,SLC30A4)基因[54],從而對乳脂代謝進(jìn)行調(diào)控。對小鼠乳腺上皮細(xì)胞的研究發(fā)現(xiàn),miR-142-3p 的靶基因?yàn)榇呷樗厥荏w(Prolactin Receptor,PRLR),在轉(zhuǎn)錄和翻譯水平調(diào)控PRLR的表達(dá);miR-142-3p 還可以影響SREBP1、絲氨酸/蘇氨酸蛋白激酶(Serine/Threonine-Protein Kinase,AKT1)、哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(Mammalian Target of Rapamycin,mTOR)、核糖體蛋白S6 激酶(Ribosomal Protein S6 Kinase 1,S6K1)及信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和轉(zhuǎn)錄激活因子5(Signal Transducers and Activators of Transcription 5,STAT5)等泌乳信號基因的表達(dá),調(diào)控小鼠乳腺上皮細(xì)胞的增殖及泌乳[62]。此外,miRNA 對靶基因還存在協(xié)同調(diào)控。研究發(fā)現(xiàn),miR-148a 和miR-17-5p 可協(xié)同作用于靶基因PGC-1和PPARA,進(jìn)而調(diào)節(jié)乳腺細(xì)胞脂質(zhì)代謝[55]??梢姡琺iRNA 對乳腺組織脂肪代謝相關(guān)靶基因具有重要的調(diào)控作用,而且存在協(xié)同調(diào)控機(jī)制,但調(diào)控網(wǎng)絡(luò)極其復(fù)雜,深入解析miRNA 參與的乳脂代謝調(diào)控網(wǎng)絡(luò)將對調(diào)節(jié)乳脂率、改善乳品質(zhì)具有重要幫助。

表1 乳脂代謝相關(guān)的miRNA 靶基因及其功能

5 miRNA 與乳品質(zhì)

如前所述,miRNA 在奶牛乳腺發(fā)育、泌乳過程及乳品質(zhì)調(diào)控中發(fā)揮著重要作用。對不同乳品質(zhì)奶牛乳腺組織進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn),miR-152 在高乳品質(zhì)奶牛乳腺中的表達(dá)豐度明顯高于低乳品質(zhì)奶牛,其靶基因DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)表達(dá)豐度顯著降低[64]。蔣磊[65]研究也發(fā)現(xiàn),miR-148b 在奶牛乳腺組織中呈現(xiàn)出類似的表達(dá)豐度。共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析則證實(shí)miR-148a 是影響奶牛泌乳率的重要因素[66]。王學(xué)輝[67]通過高通量測序技術(shù)分析高乳品質(zhì)與低乳品質(zhì)荷斯坦奶牛乳腺組織差異mRNA 及miRNA,發(fā)現(xiàn)7 個(gè)同乳脂和乳蛋白合成相關(guān)的差異基因及其調(diào)控miRNA,即KDR(miR-424-5p 及miR-450b)、IRS1(miR-424-5p、miR-214 及miR-154b)、IGF2(miR-9-5p、miR-409、miR-182 及miR-31)、TGFB3(miR-2888)、SREBF1(miR-154b)、PFKFB3(miR-2888)和PCK2(miR-382)。另有研究表明,bta-miR-145 通過調(diào)節(jié)靶基因肌動蛋白結(jié)合蛋白1(Fascin Actin-Bundling Protein 1,F(xiàn)SCN1)提高乳腺上皮細(xì)胞增殖活力,進(jìn)而影響乳腺細(xì)胞功能[68]。上述研究進(jìn)一步證實(shí),在乳腺發(fā)育及乳品質(zhì)調(diào)控中,miRNA 起重要作用。此外,Wang 等[69]研究發(fā)現(xiàn),低品質(zhì)飼料(玉米秸稈和稻草)影響奶牛飼料利用相關(guān)miRNA 表達(dá)豐度,如瘤胃miR-99b、十二指腸miR-2336、空腸miR-652、肝臟miR-1 和乳腺miR-181a,從而對下游產(chǎn)奶過程及乳品質(zhì)產(chǎn)生影響,這表明飼料中營養(yǎng)成分也會影響動物miRNA 表達(dá),進(jìn)而影響乳品質(zhì)。

雖然目前關(guān)于miRNA 調(diào)控乳腺組織乳脂代謝的研究主要集中在細(xì)胞水平[36,50,58],但相關(guān)研究結(jié)果可作為指導(dǎo)生產(chǎn)的依據(jù)。Jabed 等[70]應(yīng)用靶向miRNA 技術(shù)成功敲除了牛奶中98%的β-乳球蛋白(β-lactoglobulin,BLG),且提升了酪蛋白含量,顯著降低了牛奶致敏性,改善了乳品質(zhì),這暗示靶向miRNA 表達(dá)技術(shù)可能是一種改良乳成分的有效策略。然而,在動物體內(nèi),miRNA 調(diào)控乳脂代謝靶基因的同時(shí),又受到轉(zhuǎn)錄因子、細(xì)胞因子及環(huán)境因素的調(diào)節(jié),這些復(fù)雜的因素交織成為一個(gè)龐大、復(fù)雜的調(diào)控網(wǎng)絡(luò),而目前對該網(wǎng)絡(luò)尚知之甚少,因此,在養(yǎng)殖動物體內(nèi)通過miRNA 調(diào)控乳脂代謝,進(jìn)而改善乳品質(zhì)仍存在較大難度。

6 小 結(jié)

綜上分析,miRNA 可參與乳腺組織脂質(zhì)代謝相關(guān)基因和/或轉(zhuǎn)錄因子的轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,進(jìn)而影響乳脂率和乳品質(zhì),相關(guān)研究將為乳脂調(diào)控、生物標(biāo)記物篩選及分子育種開辟新的方法和途徑。然而,目前miRNA 對乳脂代謝調(diào)控的研究還有很多問題值得深入研究:①由于單個(gè)miRNA 可結(jié)合多個(gè)靶基因,而一個(gè)基因又可能被多個(gè)miRNA 靶向調(diào)控,因此在乳脂代謝中miRNA同mRNA 的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)仍然復(fù)雜,尚需探索;②乳脂代謝相關(guān)miRNA 的功能驗(yàn)證多源自細(xì)胞試驗(yàn),如乳腺上皮細(xì)胞。在動物試驗(yàn)及養(yǎng)殖生產(chǎn)中miRNA 的變化規(guī)律及所發(fā)揮的功能是否能夠重現(xiàn),還需要進(jìn)一步驗(yàn)證;③循環(huán)在細(xì)胞外的miRNA 也具有生物調(diào)控活性[71],外源miRNA 對動物乳脂代謝的影響、乳中外泌體內(nèi)miRNA的非營養(yǎng)功能分析及其是否會對初生子代產(chǎn)生影響尚需深入研究。未來,隨著轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)、整合蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)、多組學(xué)聯(lián)合技術(shù)及系統(tǒng)生物學(xué)方法的應(yīng)用普及,以及國內(nèi)外miRNA 數(shù)據(jù)庫資源的不斷豐富和完善,將更有助于探明miRNA 對乳脂代謝方面的調(diào)控機(jī)制,進(jìn)而為調(diào)節(jié)乳脂率及改善乳品質(zhì)提供理論依據(jù)。

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