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超聲影像組學(xué)助力左心室肥厚病因鑒別

2021-06-17 07:56:14余其徽馬雨琴夏良華
自動化儀表 2021年5期
關(guān)鍵詞:區(qū)分心動圖紋理

余其徽,俞 霏,馬雨琴,夏良華,張 波,張 麒

(1.上海先進(jìn)通信與數(shù)據(jù)科學(xué)研究院(上海大學(xué)),上海 200444;2.上海大學(xué)通信與信息工程學(xué)院,上海 200444;3.同濟(jì)大學(xué)附屬東方醫(yī)院超聲科,上海 200120;4.上海市醫(yī)療圖像與醫(yī)學(xué)知識圖譜人工智能重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海 200051)

0 引言

高血壓性心臟病(hypertensive heart disease,HHD)、肥厚型心肌病(hypertrophic cardio myopathy,HCM)、尿毒癥性心肌病(uremic cardiomyopathy,UCM)是左心室肥厚(left ventricular hypertrophy,LVH)的主要病因[1-2]。胸超聲心動圖(transthoracic echocardiography,TTE)可以通過特定的形態(tài)學(xué)特征對部分LVH病因進(jìn)行診斷[3]。但在其他許多具有非特異性特征的病例中,肥厚原因的鑒別仍具有很大的挑戰(zhàn)性[4-5]。因此,臨床亟需一種可廣泛應(yīng)用的新技術(shù),揭示真正的病因,輔助醫(yī)生進(jìn)行臨床決策。

近年來,人工智能在心血管影像分析中的應(yīng)用頗受關(guān)注[6-8]。假設(shè)不同病因?qū)е碌腖VH組織學(xué)改變的差異將導(dǎo)致不同的心肌紋理,計(jì)算機(jī)在捕捉這些細(xì)微影像差異方面通常優(yōu)于人類肉眼觀察。本研究回顧性地分析了HHD、HCM和UCM患者的超聲心動圖像,提取并分析多組心肌紋理特征,以輔助鑒別LVH病因。

1 材料和方法

首先,采集HHD、HCM和UCM患者的超聲心動圖像,并進(jìn)行感興趣區(qū)域(region of interest,ROI)處理。然后,用計(jì)算機(jī)提取ROI的兩類紋理特征,并對這些特征進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。接著,通過閾值法分類,以期發(fā)現(xiàn)臨床上單個分類能力較好的顯著特征。使用支持向量機(jī)(support vector machine,SVM)算法探討所有顯著特征的整體分類能力。

HHD、HCM和UCM患者的超聲心動圖分析流程如圖1所示。

圖1 超聲心動圖分析流程圖

1.1 圖像采集和ROI處理

本文研究的超聲心動圖像來自上海東方醫(yī)院超聲科,共獲得75例左心室肥厚患者的TTE資料。所有病例均行臨床資料仔細(xì)核實(shí),以確定入選和分組。其中,HHD、HCM和UCM患者各25例。所有病例均采用高級彩超診斷儀,包括GE vivid E9、GE vivid7、Phillips IE33、Phillips EPIQ7c。超聲檢查時(shí),按常規(guī)超聲心動圖檢查流程留取各切面圖像,提取心尖四腔心切面進(jìn)行計(jì)算機(jī)分析。左心室肥厚超聲心動圖的病變處理如圖2所示。

圖2 左心室肥厚超聲心動圖的病變處理

為保證分析的準(zhǔn)確性,本文由具有豐富臨床經(jīng)驗(yàn)的超聲醫(yī)生手動勾勒超聲心動圖中的肥厚室間隔ROI輪廓,如圖2(a)所示。接著,通過二值化處理得到超聲心動圖對應(yīng)的掩膜圖像,如圖2(b)所示。其中,掩膜圖像中白色像素點(diǎn)對應(yīng)病變ROI,黑色像素點(diǎn)對應(yīng)背景區(qū)域。

1.2 紋理特征提取

根據(jù)原始超聲心動圖及其對應(yīng)的掩膜圖像,本文提取了ROI的兩類心肌紋理特征,包括一階統(tǒng)計(jì)量特征和和灰度共生矩陣(gray level co-occurrence matrix,GLCM)特征。

一階統(tǒng)計(jì)量特征基于超聲灰度圖提取,包括ROI內(nèi)部像素的均值、中值、標(biāo)準(zhǔn)差(standard deviation,Std)、變異系數(shù)。與一階統(tǒng)計(jì)量特征不同,本研究使用了兩種類型的GLCM特征,即對比度(Contrast)和均一度(Homogeneity)。作為一種常用的紋理分析方法,GLCM不僅關(guān)注像素整體的分布情況,也可以反映具有接近或相同灰度的像素點(diǎn)之間的位置分布特性[9]。求取GLCM特征時(shí),為減少計(jì)算量,將原來的256 個灰度級量化到 8 個灰度級,即得到 8×8 的灰度共生矩陣G(i,j)(i=1,2,...,8;j=1,2,...,8),再歸一化G(i,j)得到概率矩陣p(i,j),進(jìn)而提取紋理特征。同時(shí),本研究設(shè)定矩陣方向?yàn)?0°、45°、90°、135°,最后求取4個方向特征的平均值作為最終的GLCM紋理特征。其中,Contrast值越小,Homogeneity值越大,則ROI病灶局部間的灰度越接近,像素分布越均勻。

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

為評價(jià)紋理特征對左心室肥厚病因的鑒別有效性,本研究對提取的所有特征進(jìn)行了統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。三組間的特征變量采用方差分析。而對于兩組間的特征變量,假設(shè)特征參數(shù)對應(yīng)的數(shù)據(jù)為正態(tài)分布,采用非配對t檢驗(yàn)進(jìn)行分析;否則,采用KW檢驗(yàn)分析。其中,p值小于0.05表示有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

1.4 分類

1.4.1 閾值法分類

對于有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義且能區(qū)分HHD、HCM和UCM三組的特征,在所有數(shù)據(jù)集上,本文以約登指數(shù)(youden index,Yi)最優(yōu)為參考,調(diào)節(jié)確定合適的特征分類閾值,從而計(jì)算此時(shí)所有數(shù)據(jù)集對應(yīng)的分類精度(accuracy,Acc)、靈敏度(sensitivity,Sen)、特異性(specificity,Spc)和曲線下面積(area under the curve,AUC),以期發(fā)現(xiàn)臨床上分類能力較好的顯著特征。

1.4.2 SVM分類

本文運(yùn)用SVM算法,進(jìn)一步探討所有顯著特征的整體分類性能。SVM是一種有監(jiān)督的學(xué)習(xí)算法。該算法通過非線性變換,將輸入的特征空間映射到高維特征空間,然后在高維特征空間尋找到經(jīng)驗(yàn)誤差最小、分類間距最大的最優(yōu)分類超平面[10]。在本研究中,合并HHD、HCM和UCM中的任意兩組之后,使用SVM二分類算法分類,最后再次使用SVM二分類算法區(qū)分被合并的兩組。每次分類時(shí),首先按照6∶4的比例,將數(shù)據(jù)集分成訓(xùn)練集和測試集。然后,在訓(xùn)練集上,使用5次交叉驗(yàn)證尋找特征的最優(yōu)模型,用于測試集的分類。最后,可以獲得了兩次分類過程中測試集對應(yīng)的分類性能,包括Acc、Sen、Spc、Yi和AUC。

2 結(jié)果分析

2.1 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析結(jié)果

入組病例均經(jīng)詳細(xì)臨床資料核實(shí)確定LVH病因,包括HHD、HCM和UCM患者各25例,共75個ROI病灶。對提取的所有心肌紋理特征進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,能顯著區(qū)分HHD、HCM和UCM三組的特征如表1所示。表1中:0表示HHD組,1表示HCM組,2表示UCM組。與此同時(shí),表1給出了對應(yīng)特征的均值和標(biāo)準(zhǔn)差。

表1 顯著區(qū)分HHD、HCM和UCM的紋理特征

從表1中可以看出,當(dāng)區(qū)分HHD、HCM和UCM三組左心室肥厚疾病(0vs1vs2)時(shí),Std、Contrast和Homogeneity有一定的參考作用(p<0.001,Std;p=0.002,Contrast;p=0.004,Homogeneity)。當(dāng)區(qū)分HHD、HCM組和UCM組(0,1vs2)時(shí),Std、Contrast和Homogeneity三個參數(shù)均有顯著差異(p<0.001,Std;p<0.001,Contrast;p=0.048,Homogeneity),UCM組的Std、Contrast值更大,Homogeneity值更小,表明UCM的ROI像素分布最不均勻。同時(shí),相較于HCM組,HHD組表現(xiàn)更不均勻(0vs1),且在Std、Contrast和Homogeneity三個參數(shù)上有顯著差異(p=0.034,Std;p<0.001,Contrast;p<0.001,Homogeneity)。此外,相較于HHD、UCM組,HCM組表現(xiàn)更均勻(0,2vs1),且在Std、Contrast和Homogeneity三個參數(shù)上均有顯著差異(p=0.021,Std;p<0.001,Contrast;p<0.001,Homogeneity)。同時(shí),相較于UCM組,HHD組表現(xiàn)更均勻(0vs2),但僅在Std和Contrast兩個參數(shù)上有顯著差異(p=0.001,Std;p=0.016,Contrast)。

2.2 閾值法分類結(jié)果

利用閾值法分類探討臨床上單個顯著特征的分類能力時(shí),Contrast參數(shù)表現(xiàn)最好。Contrast的閾值法分類結(jié)果如表2所示。

表2 Contrast的閾值法分類結(jié)果

當(dāng)區(qū)分HHD、HCM組與UCM組(0,1vs2)時(shí),AUC為0.769;進(jìn)而區(qū)分HHD和HCM組(0vs1),AUC為0.800。由此表明,Contrast對臨床上HHD、HCM和 UCM的區(qū)分有潛在的重要參考價(jià)值。

2.3 SVM分類結(jié)果

為區(qū)分HHD、HCM和UCM三組病因,本文分別運(yùn)用了兩次SVM分類算法。其中,利用所有特征先區(qū)分HHD、HCM和UCM組(0,1vs2),接著再區(qū)分HHD組和HCM組時(shí)(0vs1),測試集分類性能表現(xiàn)更好。測試集的分類結(jié)果如表3所示。

表3 測試集的分類結(jié)果

分類結(jié)果表明,UCM組和HHD、HCM組更好區(qū)分,測試集Acc、Sen和Spc分別為0.867、0.875和0.833。當(dāng)區(qū)分HHD組和HCM組時(shí),測試集Acc、Sen和Spc分別為0.800、0.857和0.769,Sen和Spc相對不平衡。兩次分類模型的ROC曲線如圖3所示。

圖3 兩次分類模型的ROC曲線

3 結(jié)論

本研究將人工智能影像學(xué)技術(shù)應(yīng)用于75例LVH圖像分析。分析結(jié)果表明,Contrast能顯著區(qū)分HHD、HCM和 UCM(p=0.002),這與心肌病理生理特征密切相關(guān)[11-13]。同時(shí),在SVM模型中區(qū)分HHD、HCM組和 UCM組時(shí),AUC為0.910;區(qū)分HHD組和HCM組時(shí),AUC為0.857。由此表明,醫(yī)生可從心肌紋理分析中獲益以輔助診斷三種LVH病因。本研究也存在一定的局限性:病例數(shù)相對較少,需不斷積累病例為臨床診斷提供更可靠的參數(shù)。后續(xù)可將影像組學(xué)特征應(yīng)用于多模態(tài)超聲研究,以獲取更多新指標(biāo)。

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