劉艷文,劉 黎
(湖南省腦科醫(yī)院藥學(xué)部,湖南 長(zhǎng)沙 410007)
參麥注射液(SMI)由紅參和麥冬2 味中藥材組方,用于治療心力衰竭、肺源性心臟病、冠狀動(dòng)脈粥樣硬化性心臟病、病毒性心肌炎、粒細(xì)胞減少等[1]。紅參主要活性成分有皂苷類、揮發(fā)油類、糖類、氨基酸類等,具有增強(qiáng)免疫力、抗腫瘤、抗氧化、抗衰老、抗疲勞等作用[2]。麥冬主要活性成分有甾體皂苷類、高異黃酮類、多糖類等,具有降血糖、保護(hù)心血管系統(tǒng)、增強(qiáng)免疫力、抗炎、抗腫瘤等作用[3]。參麥注射液的有效成分為人參、麥冬皂苷及微量多糖,能降低巨噬細(xì)胞炎性反應(yīng)遞質(zhì)胺的釋放量,減輕對(duì)機(jī)體的損傷,增強(qiáng)機(jī)體體液免疫及細(xì)胞免疫應(yīng)答功能,提高抗腫瘤能力[4]。細(xì)胞色素 P450(CYP450)具有氧化功能,廣泛參與外源及內(nèi)源物質(zhì)(藥物、致癌物質(zhì)、類固醇等)的代謝。近年來已有大量關(guān)于CYP450 酶與心血管疾病相關(guān)性的報(bào)道,提示花生四烯酸的CYP450環(huán)氧化物酶代謝物環(huán)氧-二十碳三烯酸(EETs)具有心血管保護(hù)作用[5]。某些CYP450 酶的過表達(dá)與腫瘤耐藥相關(guān),可作為抗腫瘤治療策略的代表性新靶點(diǎn),且已有關(guān)于參麥注射液對(duì) CYP450 有影響的報(bào)道[6-8],但尚未明確其具體活性物質(zhì)基礎(chǔ)及作用機(jī)制。本研究中通過網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)研究和分子對(duì)接技術(shù),分析了參麥注射液活性成分對(duì)CYP450 的影響機(jī)制,為后期進(jìn)行生物學(xué)試驗(yàn)提供理論基礎(chǔ)和研究方向?,F(xiàn)報(bào)道如下。
數(shù)據(jù)庫:中藥系統(tǒng)藥理學(xué)數(shù)據(jù)庫(TCMSP,https:/ /tcmspw.com /tcmsp.php);中 藥 綜 合 數(shù) 據(jù) 庫 (TCMID,http:/ /www.megabionet.org /tcmid /);用于評(píng)估小分子的藥代動(dòng)力學(xué)和藥物相似性數(shù)據(jù)庫(SIB,http:/ /www.swissadme.ch /);蛋白結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)庫(PDB,http:/ /www.rcsb.org /);小 分 子 數(shù) 據(jù) 庫 (ZINC,http:/ /zinc.docking.org /)。
運(yùn)用工具:中藥分子機(jī)制的生物信息學(xué)分析工具(BATMAN - TCM, http:/ /bionet.ncpsb.org /batman -tcm /);三維分子結(jié)構(gòu)軟件(PyMol,https:/ /pymol.org /2 /);分子對(duì)接軟件(AutoDock Tools v1.5.6,http:/ /autodock.scripps.edu)。
在 TCMSP 數(shù)據(jù)庫的“Herb name”輸入“紅參”“麥冬”,在 TCMID 數(shù)據(jù)庫的“Herb”輸入“HONG SHEN”“MAI DONG”,分別收集相關(guān)成分;在此基礎(chǔ)上,在BATMAN - TCM 數(shù)據(jù)庫的“Select input type”選“Herb”,輸入“HONG SHEN”“MAI DONG”,收集相關(guān)成分,并用于后續(xù)研究。
1.2 項(xiàng)下得到的紅參和麥冬的化學(xué)成分通過PubMed 數(shù)據(jù)庫下載其規(guī)范化的三維分子結(jié)構(gòu)或Smiles ID,并輸入SIB 數(shù)據(jù)庫,整理化學(xué)成分的藥代動(dòng)力學(xué)參數(shù)。口服生物利用度(OB)是藥物吸收、分布、代謝、排泄(ADME)過程中起重要作用的參數(shù)[9]。在 Swiss ADME中,胃腸道吸收的高低以O(shè)B 來表示,OB 值越高表示藥效分子進(jìn)入體內(nèi)后更易被吸收[10]。CYP450 和P-糖蛋白(P-gp)能在胃腸道中高度表達(dá),且兩者的底物能相互重疊,CYP450 和P-gp 作為界定OB 的參數(shù),進(jìn)一步提高了數(shù)據(jù)的可靠性[4]。
活性成分英文名導(dǎo)入ZINC 數(shù)據(jù)庫或TCMSP 數(shù)據(jù)庫,以mol 格式文件下載其3D 結(jié)構(gòu);在PyMol 軟件中檢查空間結(jié)構(gòu)無誤后,以pdb 格式保存;將結(jié)構(gòu)件載入AutoDock Tools v 1.5.6 程序,添加原子電荷,分配原子類型,所有柔性鍵默認(rèn)為可旋轉(zhuǎn);將其保存為pdbqt 格式,作為對(duì)接配體[11]。
CYP450 通過PDB 數(shù)據(jù)庫下載通過X 晶體衍射法獲取的蛋白結(jié)構(gòu),為了保證對(duì)接精度,選擇晶體解析度小于3? 且自帶小分子配體的蛋白,刪除多余的蛋白鏈和配體,加氫去除水分子,計(jì)算Gasteiger 電荷,保存為pdbqt 文件,作為分子對(duì)接的受體。
1.4 和1.5 項(xiàng)下得到的配體和受體使用 Autodock Tools v 1.5.6 軟件進(jìn)行對(duì)接,取優(yōu)勢(shì)構(gòu)象進(jìn)行分析,并用PyMol 作圖。
參麥注射液中紅參和麥冬的活性成分,通過TCMSP數(shù)據(jù)庫分別得到74 個(gè)和0 個(gè),通過TCMID 數(shù)據(jù)庫分別得到9 個(gè)和57 個(gè),通過BATMAN-TCM 數(shù)據(jù)庫分別得到9 個(gè)和10 個(gè);刪除重復(fù)成分,最終得到155 個(gè)化學(xué)成分(紅參 88 個(gè)、麥冬 67 個(gè))。在 Swiss ADME 中,根據(jù)藥代動(dòng)力學(xué)參數(shù)OB,以胃腸道吸收高和OB≥0.55 為標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行篩選。由于紅參的人參皂苷 Rb1(ginsenoside Rb1)、人 參 皂 苷 Rb2(ginsenoside Rb2)、人 參 皂 苷 Rc(ginsenoside Rc)、人參皂苷 Rh1(ginsenoside Rh1)、人參皂 苷 Rh2(ginsenoside Rh2)、人 參 皂 苷 Rg3(ginsenoside Rg3)等成分雖不符合以上篩選標(biāo)準(zhǔn),但均有增強(qiáng)免疫的功能,且對(duì) CYP450 酶有影響[12],故這 6 個(gè)成分也被列為活性成分。最終,篩選得到41 個(gè)活性成分(紅參27個(gè)、麥冬14 個(gè)),用于后期分子對(duì)接的配體。詳見表1。其中,C1為(3 R,9 R,10 R)-h(huán)eptadec-1-en-4,6-diyne-3,9,10 - triol;C2為(3 S,5 R,6 S,8 R,9 R,10 R,12 R,13 R,14 R,17 S)-17- [(2 S)-2-h(huán)ydroxy-6-methylhept-5-en-2-yl]-4,4,8,10,14-pentamethyl-2,3,5,6,7,9,11,12,13,15,16,17 -dodecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,6,12-triol;C3為(3 R,5 R,8 R,9 R,10 R,12 R,13 R,14 R,17 S)-17- [(2 S)-2-h(huán)ydroxy-6-methylhept-5-en-2-yl]-4,4,8,10,14 - pentamethyl- 2,3,5,6,7,9,11,12,13,15,16,17 - dodecahydro - 1H - cyclopenta[a]phenanthrene-3,12 - diol;C4為(3 S,5 R,8 R,9 R,10 R,12 R,13 R,14 R,17 S)-17 - [(2 S)-2 - hydroxy-6 -methylhept- 5 - en - 2 - yl]-4,4,8,10,14 - pentamethyl- 2,3,5,6,7,9,11,12,13,15,16,17 -dodecahydro-1H -cyclopenta[a]phenanthrene - 3,12 - diol;C5為(3 S,5 R,6 S,8 R,9 R,10 R,12 R,13 R,14 R,17 S)-17 - [(2 R)-2-h(huán)ydroxy-6-methylhept-5-en-2-yl]-4,4,8,10,14 - pentamethyl-2,3,5,6,7,9,11,12,13,15,16,17-dodecahydro-1H -cyclopenta[a]phenanthrene-3,6,12 - triol;DNOP 為鄰苯二甲酸二正辛酯。
表1 經(jīng)ADME 篩選的參麥注射液活性成分Tab.1 Active components of Shenmai Injection screened by ADME
參考參麥注射液對(duì)CYP450 酶影響的相關(guān)文獻(xiàn),共收集 12 個(gè) CYP450,包括 CYP1A2,CYP2C19,CYP2B1,CYP2J3,CYP1A1,CYP1B1,CYP2C11,CYP2E1,CYP4A1,CYP4F1,CYP4F4,CYP4F5,將其中 5 個(gè)具有晶體結(jié)構(gòu)的藥物代謝酶作為受體蛋白。詳見表2。
表2 具有晶體結(jié)構(gòu)CYP450 亞型的受體蛋白Tab.2 CYP450 subtype receptor protein with crystal structure
按能量原則來實(shí)現(xiàn)受體與配體的相互作用,查找最佳結(jié)合模式。針對(duì)網(wǎng)絡(luò)分析得到參麥注射液影響CYP450 的5 個(gè)亞型分別建立對(duì)接模型,選取原配體從活性口袋里分離并進(jìn)行對(duì)接,計(jì)算對(duì)接后的結(jié)合能(Score)值。Score 越低,表示配體與受體結(jié)合的構(gòu)象越穩(wěn)定,發(fā)生相互作用的可能性越大[13]。以 Score≤ - 5.0 kJ/mol 為篩選標(biāo)準(zhǔn),結(jié)果見表3?;钚猿煞种杏?%與CYP2E1 對(duì)接成功,63%與CYP1A1 對(duì)接成功,74%與CYP1B1 對(duì)接成功,77%與CYP2C19 對(duì)接成功,63%與CYP1A2 對(duì)接成功。部分成分與5 個(gè)CYP450 間的對(duì)接模式見圖1。可見,ophiopogonanone D 與 CYP1A2 之間形成了2 個(gè)芳香氫鍵(ASP313 和 ASN257),與 PHF125 形成 π -π鍵;coumaran 與 CYP2E1 的氨基酸殘基PHE478 形成ππ 鍵;ophiopogonone A 與 CYP1B1 的氨基酸殘基 ASP333形成芳香氫鍵,與ASN228 形成氫鍵,與PHE231 形成2個(gè) π -π 鍵,與 PHE134 形成 π -π 鍵;ophiopogonanone F與CYP2C19 的氨基酸殘基GLY296 形成芳香氫鍵,與PHE114 形成 π - π 鍵;DNOP 與 CYP1A1 之間形成 3個(gè)芳香氫鍵(ASP320 和 2 個(gè)PHE123),與 PHE224 形成π-π 鍵。分子對(duì)接結(jié)果顯示,在多種分子間相互作用的協(xié)助下,參麥注射液活性成分均能與CYP450 亞型的氨基酸殘基形成各種作用力而穩(wěn)定結(jié)合,對(duì)CYP2E1,CYP1A1,CYP1B1,CYP2C19,CYP1A2 代謝酶活性有較明確的調(diào)節(jié)潛能??梢?,參麥注射液在理論上為一種多靶點(diǎn)的藥物代謝酶調(diào)節(jié)劑。
圖1 參麥注射液部分成分與5 個(gè)CYP450 間的對(duì)接模式Fig.1 Docking mode among some components of Shenmai Injection and five CYP450
表3 分子對(duì)接結(jié)合能驗(yàn)證結(jié)果(Score≤-5.0 kJ/mol)Tab.3 Results of the binding energy scores of molecular docking(Score≤ -5.0 kJ /mol)
本研究結(jié)果表明,具有較高胃腸道吸收和OB 的成分中,紅參主要包括揮發(fā)油和皂苷類成分,麥冬主要包括甾體皂苷類和高異黃酮類成分。在心血管疾病研究方面,參麥注射液通過改善心功能,抑制心肌纖維化,從而對(duì)急性心肌梗死模型大鼠發(fā)揮心肌保護(hù)作用[14]。紅參提取物可抑制乳酸脫氫酶和丙二醛釋放,提高超氧化物歧化酶活性,以及B 淋巴細(xì)胞瘤2/兔抗人單克隆抗體比值,從而減輕H2O2誘導(dǎo)的氧化應(yīng)激損傷,減少大鼠心肌細(xì)胞凋亡[15],但缺乏紅參具體活性成分在心血管方面的研究。麥冬活性成分對(duì)試驗(yàn)性心肌梗死及腦缺血損傷均有保護(hù)作用[16]。麥冬皂苷D 為麥冬的主要有效成分之一,可通過降低DOX 誘導(dǎo)活性氧累積,緩解內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激,而對(duì)心肌產(chǎn)生保護(hù)作用[17]。在腫瘤研究方面,參麥注射液通過促進(jìn)白細(xì)胞生成,抑制腫瘤生長(zhǎng),調(diào)節(jié)免疫功能,從而達(dá)到增強(qiáng)抗腫瘤的作用[18]。麥冬的有效成分麥冬皂苷B 能抑制人黑色素瘤A375 細(xì)胞增殖,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[19]。此外,麥冬中的標(biāo)志性成分高異黃酮具有良好的抗腫瘤活性,是抗腫瘤的藥效物質(zhì)。紅參提取物通過調(diào)節(jié)lncRNA,從而達(dá)到抑制癌細(xì)胞增殖的作用[20]。
分子對(duì)接結(jié)果表明,與 CYP1A2,CYP2C19,CYP1A1,CYP1B1,CYP2E1 亞型具有較好結(jié)合活性的成分為麥冬的麥冬皂苷類成分。心血管疾病研究方面,麥冬皂苷D 通過誘導(dǎo)CYP2J3,增強(qiáng)內(nèi)質(zhì)網(wǎng)鈣調(diào)蛋白SERCA2a 的活性,升高內(nèi)質(zhì)網(wǎng)鈣離子水平,從而改善大鼠心肌細(xì)胞的心衰表現(xiàn)[21]。CYP2C19 基因分型可用來指導(dǎo)老年患者心腦血管二級(jí)預(yù)防中抗血小板藥物的應(yīng)用,麥冬皂苷D 與CYP2C19 結(jié)合活性最低(Score = - 9.6),提示配體與受體結(jié)合的構(gòu)象越穩(wěn)定,發(fā)生相互作用的可能性就越大。但麥冬皂苷D 是否通過影響CYP2C19 活性而改善心血管疾病,有待進(jìn)一步試驗(yàn)驗(yàn)證。據(jù)報(bào)道,麥冬誘導(dǎo)CYP2E1 和 CYP1A2 活性[22],參麥注射液、紅參注射液、麥冬注射液均上調(diào)了CYP2E1 mRNA 的表達(dá),表明參麥注射液對(duì)CYP2E1 的誘導(dǎo)作用可能由復(fù)方中的紅參和麥冬共同貢獻(xiàn)[7]??梢姡@些中藥可使經(jīng)由這些酶代謝藥物的代謝活性增強(qiáng),消除加快,難以達(dá)到有效的血藥濃度,故應(yīng)注意調(diào)整這些藥物的使用劑量或換用其他藥物。但紅參具體的活性成分作用于CYP450 而影響心血管疾病的研究報(bào)道較少。以上結(jié)果為參麥注射液活性成分通過影響CYP450,從而發(fā)揮心血管保護(hù)作用的預(yù)測(cè)結(jié)果提供了佐證。在腫瘤研究方面,雖然有研究報(bào)道參麥注射液、紅參、麥冬及其活性成分均具有抗腫瘤作用,某些CYP450 酶可作為抗腫瘤治療策略的代表性新靶點(diǎn),但參麥注射液、紅參、麥冬及其活性成分是否影響CYP450 的活性,從而達(dá)到抗腫瘤作用,尚缺少相關(guān)研究。
綜上所述,本研究雖可分析出部分參麥注射液對(duì)CYP450 的影響機(jī)制,但網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)和分子對(duì)接技術(shù)有一定局限性,體內(nèi)外藥理學(xué)、藥效學(xué)和作用靶點(diǎn)均需進(jìn)一步的試驗(yàn)驗(yàn)證。