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立足水稻研究

2021-08-03 10:50
科學(xué)中國人·下旬刊 2021年4期
關(guān)鍵詞:分子實驗室基因

水稻生物學(xué)國家重點實驗室2003年被批準(zhǔn)建設(shè),2006年12月通過建設(shè)驗收。2006年及2016年,它在生命科學(xué)領(lǐng)域國家重點實驗室評估中被評為優(yōu)秀實驗室。實驗室依托單位為中國水稻研究所和浙江大學(xué),以解決我國稻作科技和水稻生產(chǎn)發(fā)展中的關(guān)鍵問題為宗旨,順應(yīng)農(nóng)業(yè)科技發(fā)展大趨勢,瞄準(zhǔn)世界水稻科學(xué)發(fā)展前沿,以水稻資源學(xué)和分子育種研究為重點,開展水稻生物學(xué)研究,為稻作科技發(fā)展提供先進(jìn)的資源平臺、技術(shù)平臺和理論平臺。

方向明確

水稻生物學(xué)國家重點實驗室主要研究方向為水稻功能基因組學(xué)與分子育種基礎(chǔ)研究、水稻種質(zhì)創(chuàng)新與分子育種應(yīng)用研究、水稻病蟲成災(zāi)機(jī)理與控制研究、水稻可持續(xù)生產(chǎn)基礎(chǔ)與應(yīng)用研究。

水稻功能基因組學(xué)與分子育種基礎(chǔ)研究主要開展基因克隆、性狀控制機(jī)理、水稻轉(zhuǎn)基因及其利用、優(yōu)良性狀的分子設(shè)計育種基礎(chǔ)研究。水稻種質(zhì)創(chuàng)新與分子育種應(yīng)用研究主要開展水稻有利基因發(fā)掘與創(chuàng)新、育種新材料創(chuàng)制、新品種選育研究。水稻病蟲成災(zāi)機(jī)理與控制研究主要開展水稻病原菌致病性及變異機(jī)制,水稻抗病蟲的分子調(diào)控,水稻害蟲種群演替、發(fā)生及流行擴(kuò)散機(jī)制等研究,轉(zhuǎn)基因抗病蟲水稻培育及安全性評價。水稻可持續(xù)生產(chǎn)基礎(chǔ)與應(yīng)用研究主要開展水稻抗病蟲草害應(yīng)用、水稻抗逆(旱、寒、鹽堿)應(yīng)用及新技術(shù)應(yīng)用于水稻生產(chǎn)研究。

根據(jù)研究方向,實驗室組建了功能基因組學(xué)研究、超級稻研究、水稻病蟲成災(zāi)機(jī)理與控制研究及水稻可持續(xù)生產(chǎn)基礎(chǔ)與應(yīng)用研究4個研究團(tuán)隊。其中,功能基因組學(xué)研究團(tuán)隊主要從事水稻分子育種基礎(chǔ)研究、功能基因組學(xué)研究、蛋白質(zhì)組研究、代謝組學(xué)研究;超級稻研究團(tuán)隊主要從事超級稻研究、資源發(fā)掘與利用研究、育種材料創(chuàng)制等研究;水稻病蟲成災(zāi)機(jī)理與控制研究團(tuán)隊主要從事水稻病原菌致病性及變異機(jī)制、抗病蟲的分子調(diào)控,水稻害蟲種群演替、發(fā)生及流行擴(kuò)散的機(jī)制,轉(zhuǎn)基因抗病蟲水稻培育及安全性評價等研究;水稻可持續(xù)生產(chǎn)基礎(chǔ)與應(yīng)用研究團(tuán)隊主要從事新型栽培技術(shù)研究、生理生態(tài)研究、轉(zhuǎn)基因安全研究。

不斷進(jìn)取

實驗室在運(yùn)行中形成了多性狀綜合分析重要種質(zhì)、多學(xué)科協(xié)作創(chuàng)造重要材料、多途徑并舉攻克重要難題的特色,取得了許多重要研究成果,先后獲得國家科技進(jìn)步獎一等獎、二等獎、三等獎及國家自然科學(xué)獎一等獎、二等獎、三等獎等獎勵;研究成果分別在Nature、Science、Nature Genetics、PNAS、Plant Cell等雜志發(fā)表。

2019年12月13日,水稻生物學(xué)國家重點實驗室種質(zhì)創(chuàng)新團(tuán)隊在Scientific Reports在線發(fā)表了題為“Using CRISPR-Cas9 to generate semi-dwarf rice lines in elite landraces”的論文,提出了利用基因編輯技術(shù)快速減緩綠色革命帶來的遺傳侵蝕效應(yīng)。

遺傳侵蝕指的是隨著農(nóng)業(yè)工業(yè)化發(fā)展,栽培的農(nóng)作物會失去大量遺傳資源,群體內(nèi)多樣性會大大降低,存在潛在生物或者非生物侵害危機(jī)。綠色革命基因sd1應(yīng)用水稻育種以來,帶有半矮稈基因植株的改良品種在多個生態(tài)區(qū)得到較快推廣,淘汰了當(dāng)?shù)胤N植的農(nóng)家品種,這種單一化的現(xiàn)代品種種植現(xiàn)象在中國尤為突出。研究人員認(rèn)為,利用基因編輯工具,對已經(jīng)保存的大量高稈農(nóng)家品種進(jìn)行半矮稈sd1基因的編輯,可以大量且迅速獲得單一位點破壞但仍保留其他優(yōu)良農(nóng)藝性狀特點的種質(zhì),這比當(dāng)初僅僅依靠自發(fā)等位突變的sd1基因通過雜交、回交獲得改良品系,不僅有效率上的優(yōu)勢,更重要的是可以更大程度上保留地方品種優(yōu)良特性。

該研究中研究人員選擇了亞洲栽培稻aus生態(tài)型代表品種kasalath和越南著名廣譜性抗稻瘟病品種特特普,進(jìn)行sd1靶位點編輯??紤]特特普抽穗晚的特性,研究人員同時還對se5抽穗期基因進(jìn)行編輯,這些編輯使研究人員成功獲得了攜帶有新的不同等位突變sd1變異體和帶有sd1se5雙突變的特特普編輯株系。研究發(fā)現(xiàn),至少兩個帶有新的sd1突變的kasalath株系在同樣栽培條件下表現(xiàn)出比kasalath增產(chǎn)的趨勢;特特普編輯成半矮稈的株系,其廣譜的抗稻瘟病特性不僅沒有減少,反而有一定程度的增加,這為研究人員保護(hù)利用好水稻遺傳資源提供應(yīng)對危機(jī)的準(zhǔn)備。

另外,2019年,國際著名病毒學(xué)雜志Journal of Virology在線發(fā)表了水稻生物學(xué)國家重點實驗室微生物資源與生物農(nóng)藥創(chuàng)新團(tuán)隊完成的研究論文“Identification and Characterization of the Nucleolar Localization Signal of Autographa californica Multiple Nucleopolyhedrovirus LEF5”,該論文揭示了昆蟲桿狀病毒LEF5蛋白的核仁定位信號及其功能。

桿狀病毒(Baculovirus)是一類特異感染節(jié)肢動物的雙鏈環(huán)狀DNA病毒。由于其防效高、對人畜無毒以及對環(huán)境安全等優(yōu)點,桿狀病毒被作為生物殺蟲劑廣泛應(yīng)用于害蟲防治。此外,桿狀病毒也被開發(fā)成為高效的真核表達(dá)載體,應(yīng)用于藥物研發(fā)以及疫苗生產(chǎn)領(lǐng)域。而核仁是許多病毒感染過程中的重要作用靶標(biāo),目前多種病毒編碼的蛋白被證實定位于核仁,并篡奪宿主細(xì)胞的核仁以利于病毒自身的感染與復(fù)制,然而桿狀病毒的感染是否與昆蟲核仁存在關(guān)聯(lián)卻仍未見報道。

研究團(tuán)隊通過轉(zhuǎn)錄組學(xué)分析鑒定了昆蟲細(xì)胞的核干細(xì)胞因子和核仁纖維蛋白,免疫熒光定位和蛋白印跡等分析首次證實昆蟲核仁結(jié)構(gòu)會隨著桿狀病毒的感染而解體,同時病毒的感染導(dǎo)致核仁蛋白重新分布進(jìn)而參與桿狀病毒的復(fù)制擴(kuò)增過程。LEF5蛋白是桿狀病毒的一個晚期蛋白,它在桿狀病毒中高度保守。生物信息學(xué)分析顯示許多病毒的LEF5帶有核仁定位信號,該核仁定位信號的缺失影響桿狀病毒晚期和極晚期基因的表達(dá),最終導(dǎo)致病毒產(chǎn)量以及多角體合成的下降。該研究對桿狀病毒在昆蟲體內(nèi)擴(kuò)散機(jī)制的闡釋提供了重要的理論依據(jù),具有潛在的應(yīng)用價值。

砥礪前行

實驗室積極遵循“開放,流動,聯(lián)合,競爭”的基本方針,與中國科學(xué)院、中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、浙江大學(xué)等科研單位和院校開展了廣泛的合作,共同承擔(dān)科研課題、合作培養(yǎng)研究生,充分實現(xiàn)資源共享。與日本JIRCAS、美國CornellUniversity、Syngenta公司、法國國際農(nóng)藝研究發(fā)展中心,以及聯(lián)合國糧農(nóng)組織,印度、埃及、俄羅斯、菲律賓、意大利、比利時、奧地利等國家和地區(qū)的科研單位和大學(xué)都有合作項目。在未來5年的建設(shè)發(fā)展中,實驗室的努力目標(biāo)是在雜種優(yōu)勢理論及應(yīng)用研究上,進(jìn)入世界前沿;分子設(shè)計育種研究、水稻有害生物致害性機(jī)理研究取得重要進(jìn)展;稻米品質(zhì)機(jī)理、轉(zhuǎn)基因水稻環(huán)境安全性研究國內(nèi)領(lǐng)先;建成我國資源最豐富、數(shù)據(jù)最全、利用效率最高的水稻種質(zhì)庫,成為稻作科技界共享的資源平臺;完善分子生物學(xué)、基因工程、生理生化及環(huán)境生物學(xué)4個公共實驗平臺,面向國內(nèi)外開放,力爭實驗室走向國際前沿。

同時,實驗室還根據(jù)自身的環(huán)境與發(fā)展?fàn)顩r,確立了人才培養(yǎng)與隊伍建設(shè)的方針:培養(yǎng)既了解生命科學(xué)發(fā)展尖端、掌握生命科學(xué)前沿理論與技術(shù),又熟悉水稻科學(xué)與生產(chǎn)實際、能洞察和預(yù)測水稻生產(chǎn)中的重大科學(xué)問題并展開卓有成效的研究的青年學(xué)者,鼓勵奉獻(xiàn)精神,安于農(nóng)業(yè)科研。

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