余緒明,余世榮,石金敏,龔杰,王佳
[十堰市人民醫(yī)院(湖北醫(yī)藥學院附屬人民醫(yī)院)藥學部,十堰 442000]
核受體NR4A1 ( nuclear receptor subfamily 4 group A member 1,也稱為Nur77)是孤兒核NR4A亞家族重要成員之一,可被多種復雜的細胞信號所誘導,作為分子開關在基因的表達調(diào)控中發(fā)揮重要作用,主要參與代謝、免疫調(diào)控、細胞應激、記憶、胰島素敏感性和心臟穩(wěn)態(tài)的調(diào)控等。NR4A1主要在腦組織中表達[1]。NR4A1與炎癥的關系緊密。DIATCHENKO等[2]報道,NR4A1是單核細胞內(nèi)核因子-κB(nuclear factor kappa-B,NF-κB)信號通路中最強的抑制基因之一。LI等[3]研究揭示Nur77是NF-κB介導的炎癥反應中的重要制動因素。Nur77敲除的小鼠對細菌脂多糖易感,且Nur77可通過阻斷p65與其κB元件的結合從而抑制NF-κB的活性,進而抑制促炎細胞因子的產(chǎn)生。研究表明,激活的小膠質(zhì)細胞內(nèi)Toll樣受體4(Toll-like receptor 4,TLR4)信號通路介導了脂多糖抑制Nur77的表達,特殊的TLR4拮抗劑CLI-095可以抑制BV2細胞內(nèi)Nur77的下調(diào)作用[4]。然而,脂多糖誘導的TLR4信號通路中Nur77下調(diào)的具體分子機制仍未闡明。
芳烴受體(aryl hydrocarbon receptor,AhR)屬于螺旋-環(huán)-螺旋/Per-Arnt-Sim同源超家族(basic helix-loop-helix/Per-Arnt-Sim homology superfamily)成員之一,是一種在脊椎動物細胞中廣泛表達的配體依賴性轉錄因子[5]。其激活后,AhR與芳烴受體核轉位蛋白(aryl hydrocarbon receptor nuclear translocator,ARNT)一起進入細胞核參與其靶基因表達的調(diào)控。AhR的生物學功能包括化學和微生物防御,器官發(fā)育,免疫和炎癥的調(diào)節(jié),繁殖和NAD+依賴的能量代謝等[6]。WANG等[7]和ZHOU[8]報道了配體依賴的AhR的激活抑制了腸道炎癥反應。AhR -配體軸在各種類型的炎癥反應[9]和骨穩(wěn)態(tài)[10]中發(fā)揮關鍵作用。目前研究聚焦在尋找人源AhR的靶基因以及與之串聯(lián)的轉錄因子[6]。NR4A1是否是AhR的下游靶基因,二者之間是否存在串聯(lián)以及是否參與了脂多糖誘導的TLR4信號通路中Nur77的下調(diào)過程,筆者尚未檢索到國內(nèi)外相關報道。
本研究對體外神經(jīng)膠質(zhì)瘤細胞系U251細胞給予外源性脂多糖,構建炎癥細胞模型,探究AhR是否參與了脂多糖誘導的TLR4信號通路中Nur77的下調(diào)過程,及其可能的分子機制。
1.1材料 胎牛血清(fetal bovine serum,F(xiàn)BS,杭州四季青生物公司,批號:2104);達爾伯克高糖培養(yǎng)基(Dulbecco's minimum essential medium,DMEM)(Thermofisher公司,美國,批號: 10569044);青鏈霉素溶液(Thermofisher公司,美國,批號: 15140122);opti-MEM培養(yǎng)基(Gibco公司,美國,批號:31985-070);脂質(zhì)體 (Invitrogen公司,美國,批號:11668-027);裂解液(Invitrogen公司,美國,批號:15596018);脂多糖 (Invitrogen公司,美國,批號: 00-4976-93);TLR4抑制劑CLI-095(InvivoGen公司,美國,批號:tlrl-cli95);髓樣分化因子抑制劑ST 2825(Medchem Express,公司,美國,批號:HY-50937);DH5α感受態(tài)(Tianfen公司,批號:CB101);酵母提取物(Invitrogen公司,美國,批號: 18180059);蛋白胨(Invitrogen公司,美國,批號:LP0043B);氨芐西林鈉(Amresco公司,批號:0339);T4DNA連接酶( Invitrogen公司,美國,批號: IVGN2104)、快速限制性內(nèi)切酶XhoI( Thermo Scientific公司,美國,批號:FD0694)和快速限制性內(nèi)切酶HindIII( Thermo Scientific公司,美國,批號:FD0504);空載pDONR223質(zhì)粒(湖南優(yōu)寶生物公司提供),人源AhR(湖南優(yōu)寶生物公司,批號: G119772)和人源ANRT(湖南優(yōu)寶生物公司,批號:G116155)cDNA克隆質(zhì)粒;pGL4.11[luc2P]質(zhì)粒(湖南優(yōu)寶生物公司,批號: VT1728 );DNA 梯度條帶( 碧云天生物公司,批號:D0107);瓊脂糖(Sigma公司,美國,批號:A9539);染料法熒光定量試劑盒(TAKARA,批號:DRR041A);高保真預混液(I-5TM2X High Fidelity Master Mix)(Molecular Cloning Laboratones,批號:I5HM-200);cDNA合成預混液( Biotool公司,美國,批號:B24403);雙熒光素酶分析試劑盒(Promega公司,美國,批號:E1910,Lot.220597);GoldViewⅡ型核酸染色劑(5000×)(Solarbio,批號: G8142 );膠回收試劑盒( BiomiGA,批號:122131-2);AxyPrep質(zhì)粒DNA小劑量試劑盒(AxyGEN,批號: AP-MN-P-4);染色質(zhì)免疫共沉淀試劑盒(Epigentek公司,美國,批號: P-2002-2);ChIP級單克隆小鼠抗人AhR抗體 (RPT9,Invitrogen公司,美國,批號: MA1-513); 人膠質(zhì)瘤細胞系U251細胞和人腎上皮細胞系293T細胞(武漢大學基礎醫(yī)學院樂江教授實驗室)。
1.2方法
1.2.1細胞培養(yǎng) U251和293T細胞置于DMEM(含10% FBS,1% 雙抗)的培養(yǎng)基中,培養(yǎng)條件為37 ℃、5%二氧化碳( CO2)培養(yǎng)箱恒溫培養(yǎng)。6孔板內(nèi)細胞密度約為70%時,將完全培養(yǎng)基棄去,PBS沖洗1或2次,更換無血清培養(yǎng)基根據(jù)具體實驗目的加藥處理,繼續(xù)培養(yǎng)至24 h。
1.2.2TLR4 -MyD88抑制性實驗 采用二甲亞砜(DMSO)分別將CLI-095、ST 2825和脂多糖稀釋成1,20 μmol·L-1和1,0.1 μg·mL-1。U251細胞于6孔板中培養(yǎng),分別給予不同劑量脂多糖(1,0.1 μg ·mL-1)處理24 h。U251細胞給藥分組:對照組(DMSO)、脂多糖組、CLI-095組、CLI-095+脂多糖組、ST 2825組、ST 2825+脂多糖組。其中CLI-095+脂多糖組和ST 2825+脂多糖組中,CLI-095和ST 2825先分別預處理1 h后添加脂多糖(1 μg·mL-1),連續(xù)培養(yǎng)至24 h,每組設3個復孔[11]。
1.2.3實時熒光定量聚合酶鏈反應(quantitative real-time polymerase chain reaction,qRT-PCR)檢測 采用Trizol抽提U251細胞總RNA,Nano drop測定其濃度。加入All-in-one cDNA Synthesis SuperMix按如下條件進行RT-PCR擴增得到cDNA樣本,25 ℃,10 min;42 ℃,30 min;85 ℃,5 min。擴增基因,人源NR4A1上游引物GGCTCGGG-GATACTGGATACA,下游引物CTGGCATGAAGCGT-TGTCC;人源AHR上游CAAATCCTTCCAAGCGGCATA,下游引物CGCTGAGCCTAAGAACTGAAAG;人源ARNT上游CTGCCAACCCCGAAATGACAT,下游引物CGCCGC-TTAATAGCCCTCTG;人源GAPDH上游引物CATCACCATCTTCCAGGAGCGAGA,下游引物TGCAGG-AGGCATTGCTGATGATCT;擴增體系為:樣本cDNA 2 μL,熒光染料混合液(SYBR mix)5 μL,正向引物0.3 μL,反向引物0.3 μL,焦碳酸二乙酯處理的超純水2.4 μL;反應條件為95 ℃ 10 min,95 ℃ 15 s,60 ℃ 1 min,40個循環(huán)。
1.2.4質(zhì)粒構建 ENSEMBL(http://asia.ensembl.org/index.html)網(wǎng)站上尋找人源NR4A1啟動子片段(距離ATG為0~-2000 bp,NR4A1-003 ENST00000545748.5)。根據(jù)生物信息學方法以及網(wǎng)站(http://tfbind.hgc.jp)預測NR4A1啟動子上AhR/ARNT的結合位點。依據(jù)評分,最大分值并包含AhR / ARNT位點的片段序列547 bp(距離ATG為-1606 ~-1590 bp)插入到pGL4.11[luc2P]載體中,構建NR4A1啟動子片段的Luc-報告質(zhì)粒(NR4A1 -pGL4.11[luc2P])。構建的上游引物: CCGCTCGAGTTATGTAACCGGGTGTGCCGG(限制性內(nèi)切酶為XhoI);下游引物:CCCAAGCTTAAAGGCATCC-ACCGAAGAGGG(限制性內(nèi)切酶為HindIII)。
1.2.5瞬時共轉染實驗 U251細胞于6孔板中培養(yǎng),實驗分組:空載組和AhR/ANRT表達組。采用Lipofectamine 2000轉染試劑盒進行操作,轉染體系為質(zhì)粒DNA濃度1 μg : 脂質(zhì)體2000 3 μL,分別用 opti-MEI 250 μL優(yōu)化培養(yǎng)稀釋并配置成混合液,室溫孵育放置10~20 min,加入無血清培養(yǎng)基的6孔板中繼續(xù)培養(yǎng)24 h。
1.2.6雙熒光素酶報告(dual-luciferase reporter)分析實驗 293T細胞培養(yǎng)于6孔板,實驗分為對照組和轉染組。對照組轉染空載pDONR223質(zhì)粒+NR4A1-pGL4.11[luc2P]報告質(zhì)粒,轉染組為AhR -pDONR223表達質(zhì)粒+ARNT-pDONR223表達質(zhì)粒+NR4A1-pGL4.11[luc2P]報告質(zhì)粒。按照Lipofectamine2000轉染試劑盒和雙熒光素酶報告實驗試劑盒說明操作,每組平行設3個復孔,ModulusTM單管型多功能檢測儀測定熒光強度,計算相對熒光強度。
1.2.7染色質(zhì)免疫共沉淀(chromatin immuno-precipitation,ChIP)分析 實驗分組:對照組(DMSO)和脂多糖(1 μg·mL-1)組。按照染色質(zhì)免疫共沉淀試劑盒提供的方法進行操作。調(diào)整每皿U251細胞密度為(2×106) ~( 2×107)個·mL-1,按上述分組分別處理,細胞計數(shù),1%甲醛固定,室溫孵育10 min。加入1.25 mol·L-1甘氨酸1 mL終止交聯(lián)。超聲破碎,將DNA打碎成500~1000 bp的片段。測定染色質(zhì)濃度,將約10%的染色質(zhì)預留作為裂解液處理。10 μg的ChIP級單克隆小鼠抗人AhR抗體和使用正常的小鼠IgG(ChIp試劑盒提供,Epigentek公司,美國)作為陰性對照?;厥彰庖叱恋淼腄NA,使用PCR純化試劑盒純化,使用qRT-PCR擴增裂解液樣本中的DNA以及從沉淀復合物中分離得到的DNA。擴增產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠上分離,使用Auto Chemi成像系統(tǒng)對條帶強度進行定量分析。
2.1脂多糖對NR4A1和AhR表達的影響 U251細胞給予不同濃度脂多糖(1和0.1 μg·mL-1)處理24 h。與對照組比較,脂多糖劑量依賴性下調(diào)NR4A1和AhR的表達,脂多糖1 μg·mL-1組分別下調(diào)56%,32%;脂多糖0.1 μg·mL-1組分別下調(diào)38%,19%,見表1。
表1 脂多糖對U251細胞中NR4A1和AhR表達水平的影響
2.2TLR4-MyD88通路介導脂多糖下調(diào)AhR和NR4A1的表達 U251細胞采用脂多糖(1 μg·mL-1)處理24 h后,qRT-PCR結果顯示,與對照組比較,脂多糖顯著下調(diào)了NR4A1和AhR mRNA水平,分別下降了53.78%(t=13.15,P<0.01 )和42.96%(t=8.062,P<0.01)。TLR4特殊的抑制劑CLI-095(1 μmol·L-1)和MyD88拮抗劑ST 2825(20 μmol·L-1)分別預處理1 h,接著給予脂多糖(1 μg·mL-1)處理至24 h。單用CLI-095組和單用ST 2825組與對照組比較差異無統(tǒng)計學意義,表明二者均不影響NR4A1和AhR mRNA的表達水平。與單用脂多糖組比較,CLI-095+脂多糖組和ST 2825+脂多糖組NR4A1和AhR mRNA水平的下調(diào)作用顯著被逆轉,且CLI-095的逆轉作用更明顯(t=7.467,P<0.01),ST 2825部分逆轉了其表達的下調(diào)(t=5.485,P<0.05)。提示,在U251細胞內(nèi)脂多糖下調(diào)AhR和NR4A1的表達可能通過TLR4 -MyD88通路實現(xiàn),見圖1。
A.對照組;B.脂多糖組;C.CLI-095組;D.CLI-095+脂多糖組;E.ST 2825組;F.ST 2825+脂多糖組。①與對照組比較,P<0.01;②與脂多糖組比較,P<0.01;③與對照組比較,P<0.05。
2.3NR4A1作為AhR的下游靶基因,其表達受到AhR的調(diào)控 U251細胞瞬時轉染人源的AhR / ANRT表達質(zhì)粒。qRT-PCR檢測發(fā)現(xiàn),與對照組比較,轉染組AhR和ARNT表達分別上調(diào)了106.63倍和165.23倍,提示U251細胞成功轉入AhR / ANRT表達質(zhì)粒。qRT-PCR檢測NR4A1的表達,與對照組比較,NR4A1 mRNA水平上調(diào)至2.63倍(t=7.384,P<0.01),提示AHR作為轉錄因子調(diào)控了下游靶基因NR4A1的表達。
2.4AhR結合到NR4A1啟動子區(qū)域,在轉錄水平上調(diào)控其表達 將預測包含AhR/ARNT結合位點的NR4A1啟動子片段(-1606~-1590 bp)構建入pGL4.11[luc2P]質(zhì)粒中,經(jīng)基因測序,成功構建NR4A1啟動子的luc-報告質(zhì)粒。293T細胞內(nèi)瞬時共轉染實驗,與對照組比較,轉染組熒光強度明顯增加,上調(diào)至19.08倍(t=52.42,P<0.01),提示AhR與ARNT形成異源二聚體,并結合到NR4A1啟動子區(qū)域,在轉錄水平上調(diào)控其表達。
2.5脂多糖抑制了AhR蛋白與NR4A1啟動子位點的結合 ChIP分析結果顯示,與對照組比較,脂多糖顯著抑制了AhR蛋白與NR4A1啟動子位點的結合,下調(diào)32.7%(t=5.621,P<0.05),見圖2。
①與對照組比較,P<0.05。
本實驗研究發(fā)現(xiàn)U251細胞內(nèi),脂多糖呈劑量依賴性下調(diào)NR4A1和AhR的表達。TLR4-MyD88信號通路介導了脂多糖抑制AhR和NR4A1的表達;此外,U251細胞高表達AhR和ARNT,同時NR4A1的表達明顯上調(diào),提示NR4A1是AhR的下游靶基因;熒光素酶分析結果提示,AhR和ARNT形成異源二聚體結合在NR4A1啟動子結合位點,在轉錄水平上調(diào)控其表達。ChIP分析結果表明,在U251細胞內(nèi)脂多糖抑制了AhR蛋白與NR4A1啟動子位點的結合。由此推論,脂多糖通過U251細胞內(nèi)的TLR4-MyD88信號通路抑制了AhR的表達,進而在轉錄水平上減少了AhR和ARNT異源二聚體在下游靶基因NR4A1啟動子上的結合,從而抑制其表達。
近年來的諸多研究表明,神經(jīng)炎癥是神經(jīng)退行性疾病發(fā)生的重要機制之一[12-20]。核受體作為神經(jīng)退行性疾病治療潛在的靶標,在過去的十多年里受到了極大的關注。大量的文獻報道了小鼠神經(jīng)退行性疾病模型以及一些臨床試驗證實了核受體在不同神經(jīng)退行性疾病中發(fā)揮重要作用[21]。有關NR4A1與神經(jīng)炎癥以及帕金森病(Parkinson’s disease,PD)之間關系的報道也較多。在正常條件下,腦內(nèi)的NR4A1主要在多巴胺能神經(jīng)元的靶區(qū)內(nèi)表達,如紋狀體的復合區(qū)和前額葉皮質(zhì),然而在成年大鼠腦黑質(zhì)以及腹側被蓋區(qū)域(ventral cover area,VTA)內(nèi)NR4A1則呈現(xiàn)低水平表達[22]。ROTHE等[23]報道了NR4A1作為小膠質(zhì)細胞活化的調(diào)制子,成為自身免疫性中樞神經(jīng)系統(tǒng)炎癥的潛在治療靶標。MONTAROLO等[24]報道,與健康志愿者比較,PD患者外周血內(nèi)整個NR4A亞家族基因(NR4A1、NR4A2和NR4A3)的表達呈現(xiàn)顯著下調(diào)。此外,研究顯示小膠質(zhì)細胞內(nèi)Nur77的活化衰減了促炎介質(zhì)的產(chǎn)生以及保護了多巴胺能神經(jīng)元免受炎癥誘導的細胞損傷。體外脂多糖激活的小膠質(zhì)細胞內(nèi)以及1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氫吡啶(1-methyl-4-phenyl-1,2,3,6-tetrahydropyridine,MPTP)誘導的小鼠PD模型中Nur77的表達下調(diào)[4]。因此,可以大膽假設NR4A1作為炎癥的一個負向調(diào)控子在神經(jīng)炎癥誘導的神經(jīng)退行性疾病(如PD)中發(fā)揮關鍵保護作用,其可能是PD治療新的潛在分子靶標。
本實驗探討了U251細胞內(nèi)脂多糖抑制NR4A1表達的可能的分子機制,為進一步探究NR4A1的生物學功能,闡明其與炎癥的關系,進而為炎癥誘導的神經(jīng)退行性疾病、腫瘤、代謝性疾病等病理過程的逆轉提供參考,同時為尋找針對PD的靶標開發(fā)治療藥物提供實驗依據(jù)。此外,實驗還證實了NR4A1是AhR的下游靶基因,這對于遴選人源AhR的靶基因以及細胞內(nèi)串聯(lián)的轉錄因子至關重要。NR4A1是否像AhR緊密耦聯(lián)的轉錄因子靶基因AHRR(aryl hydrocarbon receptor repressor)和核因子Nrf2(nuclear factor,erythroid 2 like 2,NFE2L2)一樣發(fā)揮AhR依賴的生物學功能[25-28],仍需進一步探討。然而,實驗僅從mRNA水平上進行了考察,缺乏蛋白水平的證據(jù)。課題組將進一步在U251細胞內(nèi)從蛋白水平探究這一論斷,并且在U251細胞內(nèi)敲高NR4A1,以便探究NR4A1的生物學功能,諸如是否抗炎、抗線粒體氧化應激和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應激,以及是否參與脂質(zhì)代謝相關基因表達的調(diào)控等。同時,脂多糖誘導的在體PD模型中通過慢病毒包裝NR4A1質(zhì)粒,使其感染黑質(zhì)-紋狀體區(qū)域,并使NR4A1呈現(xiàn)高水平表達,以探究NR4A1的抗PD作用。