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基于屬性相關(guān)性與特征選擇的K-近鄰缺失值順序填充算法

2021-10-12 14:51:40唐晗
錦繡·下旬刊 2021年11期
關(guān)鍵詞:特征選擇

摘要:由于K-局部近鄰插補算法無法直接計算相關(guān)性,因此在插補時難以進行特征選擇,提出一種基于屬性相關(guān)性的對于多維數(shù)據(jù)缺失按順序并進行特征選擇的填充方法,在解決相關(guān)性計算的問題同時提出了采用相關(guān)性進行填充順序選擇。算法首先提取完整數(shù)據(jù)集或者投影計算距離相關(guān)性,并按照一定的方式按相關(guān)性從大到小進行填充,保證在填充時不會因為特征選擇出現(xiàn)參照數(shù)據(jù)集為空的情況,在填充時選擇大于相關(guān)性臨界點的特征在投影的基礎(chǔ)上進行近鄰填充。實驗分別在不同缺失率下計算該方法與其它算法的均方誤差結(jié)果,結(jié)果表明,該算法在填充效果上明顯優(yōu)于其它算法。

關(guān)鍵詞:距離相關(guān)性;特征選擇;順序插補

引言

數(shù)據(jù)缺失在現(xiàn)實中是一種非常常見的現(xiàn)象,它產(chǎn)生的原因可能是信息難以獲取或者是數(shù)據(jù)傳輸中發(fā)生錯誤產(chǎn)生遺漏。數(shù)據(jù)缺失會導(dǎo)致模型難以建立,使決策分析無法達到好的效果。數(shù)據(jù)挖掘中預(yù)處理占最大比重,而預(yù)處理中最關(guān)鍵的就是對缺失數(shù)據(jù)的處理。

常用的處理方法有加權(quán)法、刪除法和插補法。加權(quán)法通過某些方法把權(quán)數(shù)從缺失單位上轉(zhuǎn)移到非缺失單位上,刪除法則是直接刪除存在缺失單位的樣本,直接得到一個完整的數(shù)據(jù)集。刪除法雖然簡單,但當(dāng)缺失率比較高的時候可能會刪除較多的樣本,產(chǎn)生較多誤差,因此國內(nèi)外學(xué)者更希望采用其他方法來填補不完整數(shù)據(jù),以保證數(shù)據(jù)的質(zhì)量,即插補法,插補法是用一個或者多個估計值來代替缺失值的方法,前后分為單值插補和多重插補,常用的單值插補有均值填充、回歸填充、冷卡填充和熱卡填充等。

K-近鄰填充(K-nearest neighbor imputation, KNNI)是一種比較典型的冷卡填充,它是Olga Troyanskaya提出的基于局部相似性的插補算法,它將完整數(shù)據(jù)集提取出來,缺失值的近鄰樣本將從完整數(shù)據(jù)集中提取,分類值采用眾數(shù)填充,連續(xù)值采用平均數(shù)填充,這種方法的填充效果極大程度上收到了缺失率的影響,當(dāng)缺失率極大時,完整數(shù)據(jù)集的樣本數(shù)量將會非常少,這意味著這種情況下得到的近鄰樣本實際上相似性并不高,這可能導(dǎo)致產(chǎn)生較大的誤差,在這個基礎(chǔ)上,楊日東、李琳等提出了基于局部K近鄰的填充算法,它并不直接提取完整數(shù)據(jù)集,而是在填充缺失值時,將當(dāng)前樣本的完整屬性投影出來,并根據(jù)屬性投影結(jié)果從數(shù)據(jù)集中提取完整數(shù)據(jù)集,這在缺失率較大的情況下極大地改善了K近鄰插補的缺陷,但以上都并未考慮過屬性相關(guān)性以及填充順序?qū)μ畛錅?zhǔn)確率的影響。劉春英提出了一種基于屬性依賴度的順序填充方法,利用填充樹按依賴度從大到小進行填充。謝霖銓、趙楠等和張曉琴、王敏都采用了主成分分析法進行二次插補?,F(xiàn)有的將相關(guān)性應(yīng)用到算法中的方法很多,但對于填充順序進行處理的方法卻相對較少,本文將通過距離相關(guān)性研究填充順序與特征選擇在提升K-近鄰填充準(zhǔn)確率的能力。

1相關(guān)概念與原理

距離相關(guān)性(Distance Correlation)

皮爾遜相關(guān)系數(shù)常被用于度量兩個變量之間的線性相關(guān)程度,兩個變量必須服從正態(tài)分布的假設(shè),對于非線性關(guān)系無法進行測量,即pearson相關(guān)系數(shù)為0時,兩個變量不一定是獨立的,自然界中的變量仍有大部分是非線性關(guān)系,而距離相關(guān)系數(shù)能很好地克服這個缺點,距離相關(guān)系數(shù)為0時,我們可以說這兩個變量一定是獨立的。王黎明、吳香華等對比了皮爾遜相關(guān)系數(shù)、秩相關(guān)系數(shù)、距離相關(guān)性的利弊,最終采用距離相關(guān)系數(shù)來衡量預(yù)報因子和PM2.5之間的相關(guān)性。

研究變量 和 的獨立性,記為 。當(dāng) 時, 和 相互獨立; 越大,代表 和 的相關(guān)性越強。設(shè) 是總體 的隨機樣本, Székely等 (2008) 定義兩隨機變量的 和 的DC樣本估計值為

1.2K-局部投影

傳統(tǒng)K-近鄰填充在缺失率較大的時候可能導(dǎo)致完整數(shù)據(jù)集的樣本數(shù)量過小或者為空,填充時難以找到真正的近鄰,K-局部近鄰插補針對這個缺點做了改進,使能夠參考的完整數(shù)據(jù)集更多。

K-局部近鄰插補中,投影是其中最關(guān)鍵的部分。若樣本 在屬性 上的值是缺失值,對于 在數(shù)據(jù)集T上投影的完整數(shù)據(jù)子集為TC,其中 ,任意 對應(yīng)的TC都是不同的。例如表1來說,如果需要對數(shù)據(jù)aB進行填充,那么缺失屬性集 ,完整數(shù)據(jù)子集 ,近鄰樣本則在TC中取舍。而對于傳統(tǒng)K-近鄰填充,完整數(shù)據(jù)集 。

1.3基于屬性相關(guān)性與特征選擇的K-近鄰缺失值順序填充算法

在K-局部近鄰插補中,插補從樣本中缺失值最多、屬性中缺失最少的數(shù)據(jù)開始,這說明算法的插補順序完全是由數(shù)據(jù)的缺失分布確定的,并且在計算樣本相似度時,也未曾考慮屬性之間的依賴程度,這可能導(dǎo)致相關(guān)性不高的屬性介入相似度計算,使計算出的近鄰是相似度不高的偽近鄰。如果要在該算法基礎(chǔ)上將相關(guān)性計算與它結(jié)合,有缺失值的數(shù)據(jù)集會無法進行相關(guān)性的計算,若在對每個缺失值做相似度計算前計算屬性的相關(guān)性再進行屬性篩選,這將極大地增加算法的運行時間與復(fù)雜度。因此本文將K-近鄰插補和K-局部近鄰插補兩種算法結(jié)合后進行改進,使屬性相關(guān)性能夠同時對填充順序和特征選擇作出干預(yù),同時最小化相關(guān)性計算、順序填充和特征選擇的運算時間代價。

1.3.1 屬性相關(guān)性計算

K-近鄰插補的優(yōu)點在于它直接篩選出沒有缺失值的完整數(shù)據(jù)子集,所有插補計算都在這個完整數(shù)據(jù)子集上進行,因此它十分簡便,計算速度也很快。由于不存在缺失值,距離相關(guān)性也可以在完整數(shù)據(jù)子集上很方便地計算出來。但K-近鄰插補的缺點在于,當(dāng)缺失率較大時,無法找到完整數(shù)據(jù)子集或者子集容量太小無法進行計算,此時將屬性兩兩篩選完整子集進行相關(guān)性計算,最終計算出屬性相關(guān)性矩陣C。

在數(shù)據(jù)集 中,屬性集 的數(shù)量為 , 表示標(biāo)簽列的數(shù)量,樣本數(shù)量為 ,樣本中存在缺失值的屬性集為 ,該數(shù)據(jù)集相關(guān)性矩陣為 。 變量 的距離相關(guān)性, ,因此 為軸對稱矩陣,其中 。當(dāng)缺失率較小、通過刪除法得到的完整數(shù)據(jù)子集 的樣本數(shù)量i'占數(shù)據(jù)集T樣本數(shù)量i的比例≥一個給定的 假設(shè)值時,直接使用完整數(shù)據(jù)子集通過式(1)計算相關(guān)性矩陣 ;當(dāng)缺失率較大,可能導(dǎo)致比率 時,通過對數(shù)據(jù)集 的屬性列 作刪除法,將得到的子集 通過式(1)計算相關(guān)性矩陣 。

1.3.2 特征選擇

在進行插補時,如果采用全部的屬性集做近鄰插補,某些屬性與待填充數(shù)據(jù)的屬性相關(guān)性較小或者是相互獨立的情況下,無論是計算相似度還是近鄰填充都會扭曲近鄰分布,降低插補的準(zhǔn)確率,因此需要根據(jù)相關(guān)性剔除參照屬性中相關(guān)性過低的屬性。參照屬性指的是對于待插補值選出的用于計算近鄰的完整數(shù)據(jù)集的屬性,參照集是該完整數(shù)據(jù)集。對于待插補值 ,首先通過投影得到參照數(shù)據(jù)集D,其中屬性集為 ,設(shè)定相關(guān)性臨界點Cr,當(dāng) 中的屬性在相關(guān)性矩陣 中的屬性 列中的對應(yīng)值小于 時將剔除該屬性列。

當(dāng) 時,算法不做特征處理,相當(dāng)于有排序的K-局部近鄰插補; 時,表示只有強相關(guān)的屬性才能進行近鄰計算,此時將無法進行填補運算。經(jīng)過大量實驗, 的取值在0.6左右表現(xiàn)為最好。

1.3.3 順序選擇

由于本文針對的是屬性中的缺失值插補,而標(biāo)簽中的數(shù)據(jù)是完整的,因此當(dāng)標(biāo)簽列作為參照屬性時,不會減少參照集的樣本數(shù)量,因此當(dāng)按照與標(biāo)簽的相關(guān)性從大到小的順序進行插補能得到較多的參照樣本數(shù)量,在極限情況下與當(dāng)前屬性的相關(guān)性只有標(biāo)簽列達到臨界點要求時,不會出現(xiàn)參照集太小或者為空的情況。

選擇第二個填充列時,選擇 中使值最大的 作為當(dāng)前填充列 ,以此類推,直到填充完畢。

1.3.4 極端情況

當(dāng)數(shù)據(jù)集的缺失率較大時,存在一種情況,即選擇的填充列 與其它屬性列的相關(guān)性并不大,甚至小于 ,該列在特征選擇上會刪除所有的參照集的屬性,導(dǎo)致無法進行插補。對于這種情況,本文作如下設(shè)計:對于當(dāng)前設(shè)定的相關(guān)性臨界點 ,如果在填充時由于 比較高導(dǎo)致參照集為空,那么將 減去一定的值,直到使參照集非空,然后在下一個缺失值填補時返回原設(shè)定的 值。

1.4算法的實現(xiàn)

基于屬性相關(guān)性與特征選擇的K-近鄰缺失值順序填充算法流程如圖1所示。

2實驗結(jié)果及分析

2.1 實驗方法

為了驗證算法在真實情況下的有效性,進行了仿真實驗。從公開數(shù)據(jù)集UCI上提取Breast、Slump、Real Estate、Yacht4個完整數(shù)據(jù)集,隨機在屬性中分別生成5%、10%、15%、20%、25%、30%的缺失值,分別采用本文提出的方法和K-近鄰插補法、K-局部近鄰插補方法在4個數(shù)據(jù)集上進行實驗。

由于數(shù)據(jù)量綱的不同,將所有數(shù)據(jù)集進行歸一化,實驗中采用的是Min-Max標(biāo)準(zhǔn)化(Min-Max Normalization),將原始數(shù)據(jù)通過線性變換轉(zhuǎn)映射到[0,1]之間,公式如下:

從結(jié)果來看,改進后的算法明顯優(yōu)于K-局部近鄰算法,并且具有一定的穩(wěn)定性,并且在大部分的情況下隨著缺失率的增加MSE的增長速率明顯小于LKNN。兩種算法在Yacht上的MSE的差要比其他三個數(shù)據(jù)集上小一些,這是由于不同數(shù)據(jù)集中的屬性與屬性、屬性與標(biāo)簽之間的相關(guān)性都是不同的,可以看出Yacht數(shù)據(jù)集的相關(guān)性比較強,導(dǎo)致即使做了特征選擇,剔除的屬性也沒有其他三個數(shù)據(jù)集多,使算法和K-局部近鄰方法更相當(dāng)一些。

3結(jié)語

為解決特征選擇無法直接在KNN局布近鄰插補法上使用的問題,本文采用K近鄰插補算法中提取完整數(shù)據(jù)集的方法計算距離相關(guān)性,并采用距離相關(guān)性同時對插補順序和特征選擇進行了融合改進,通過觀察仿真實驗結(jié)果,可知基于屬性相關(guān)性與特征選擇的K-近鄰缺失值順序填充算法在填充準(zhǔn)確率上明顯優(yōu)于K-局部近鄰插補算法。

但算法也有不足之處,在屬性值較多的情況下,頻繁進行特征選擇將大量提高算法的時間復(fù)雜度,在未來的研究中將會對這一不足之處進行優(yōu)化。

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作者簡介:唐晗,女,1993年11月,漢,江西省吉安市,工學(xué)學(xué)士,江西應(yīng)用工程職業(yè)學(xué)院,數(shù)據(jù)挖掘。

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