馬 嚴(yán) 姚牧笛 蔣 沁 曹國(guó)凡
circRNA是信使RNA(message RNA,mRNA)反向剪接而成的閉合環(huán)狀非編碼RNA,其異常表達(dá)與多種疾病的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),包括腫瘤、心血管疾病、神經(jīng)退行性疾病等[1]。在非編碼RNA領(lǐng)域,circRNA成為繼miRNA和長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)之后的又一研究熱點(diǎn)。眼部新生血管性疾病主要是指眼部異常血管生成從而導(dǎo)致嚴(yán)重視力障礙的一類疾病,是中老年人不可逆視力喪失的重要原因,其核心過(guò)程是病理性血管新生,涉及血管內(nèi)皮細(xì)胞(endothelial cells, ECs)的選擇性出芽、增殖和周細(xì)胞的募集及管腔重建等。根據(jù)異常新生血管生長(zhǎng)的解剖部位,眼部新生血管可分為角膜新生血管、視網(wǎng)膜新生血管和脈絡(luò)膜新生血管等[2]。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn)circRNA在眼部新生血管性疾病的發(fā)病機(jī)制和調(diào)控中起著重要作用。
1.circRNA的來(lái)源和形成:circRNA是一類在真核細(xì)胞中含量豐富且保守的內(nèi)源性非編碼RNA,由前體RNA(pre-mRNA)經(jīng)反向首尾剪接或者基因重排形成,通過(guò)5′和3′端共價(jià)連接,形成沒(méi)有PolyA尾巴的閉合環(huán)狀RNA,不易被核酸外切酶降解,可在組織或體液中穩(wěn)定存在[3]。早期人們對(duì)circRNA的功能知之甚少,被認(rèn)為是線性RNA的副產(chǎn)品[4]。近年來(lái),隨著基因測(cè)序等相關(guān)技術(shù)的發(fā)展,circRNA的重要生物學(xué)功能逐漸被挖掘。circRNA 的來(lái)源主要有:①來(lái)源于外顯子的circRNA(exon circRNA, ecircRNA);②來(lái)源于外顯子-內(nèi)含子circRNA(exon-intron circRNA, EIciRNA);③來(lái)源于內(nèi)含子的circRNA(circular intronic RNA, ciRNA);④來(lái)源于tRNA的circRNA(tricRNA)[4,5]。
circRNA形成模式主要有:①內(nèi)含子配對(duì)介導(dǎo)的環(huán)化(又叫直接反剪接);②套索機(jī)制驅(qū)動(dòng)的環(huán)化(又叫外顯子跳躍);③套索內(nèi)含子的直接環(huán)化;④RNA結(jié)合蛋白(RNA-binding protein, RBP)驅(qū)動(dòng)的環(huán)化;⑤tRNA剪接過(guò)程環(huán)化[4,5]。目前,真核細(xì)胞中circRNA主要來(lái)自外顯子,外顯子circRNA的形成主要包括兩種機(jī)制:第1種機(jī)制是直接反剪接,由于環(huán)化外顯子兩側(cè)的內(nèi)含子序列互補(bǔ)配對(duì),pre-mRNA下游 5′剪接供體位點(diǎn)直接與上游 3′剪接受體位點(diǎn)接合形成circRNA,從而產(chǎn)生循環(huán)轉(zhuǎn)錄本;第2種機(jī)制是外顯子跳躍,當(dāng)前體mRNA 進(jìn)行經(jīng)典的 GU/AG 剪接時(shí),外顯子跳躍產(chǎn)生一個(gè)包含外顯子和內(nèi)含子的套索中間體,隨后經(jīng)過(guò)反向剪接,套索中的內(nèi)含子被移除,形成ecircRNA[4]。除了上述的形成方式,目前還存在其他circRNA形成機(jī)制:①內(nèi)含子套索驅(qū)動(dòng)環(huán)化:由前體RNA在經(jīng)典套索驅(qū)動(dòng)環(huán)化形成的,內(nèi)含子套索中的 5′剪接位點(diǎn)的重復(fù)7nt GU基因序列和分支位點(diǎn)的豐富11nt C-rich基因序列轉(zhuǎn)錄形成套索內(nèi)含子并共價(jià)連接環(huán)化,形成 ciRNA[6];②RBP驅(qū)動(dòng)的環(huán)化:RBP通過(guò)互補(bǔ)序列與側(cè)翼內(nèi)含子序列相互作用,使兩個(gè)側(cè)翼內(nèi)含子相互靠近,進(jìn)而促進(jìn)環(huán)化,并通過(guò)反向剪接使其頭尾連接,形成 ecirc RNA 或 EIciRNA[4];③tRNA剪接過(guò)程環(huán)化:通過(guò)識(shí)別前tRNA中的凸起-螺旋-凸起基序并切割,從而產(chǎn)生tRNA和tricRNA[5]。
2.circRNA的功能:競(jìng)爭(zhēng)內(nèi)源性RNA(competing endogenous RNA, ceRNA)假說(shuō)[7]:指信使 RNA(mRNA)、lnc RNA、假基因轉(zhuǎn)錄物等含有與miRNA反應(yīng)元件(microRNA response element, MRE)相同的結(jié)合位點(diǎn),可以競(jìng)爭(zhēng)miRNA結(jié)合位點(diǎn),降低miRNA對(duì)靶基因的抑制作用,從而上調(diào)miRNA目標(biāo)基因表達(dá),調(diào)節(jié)細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài),該過(guò)程又叫miRNA的“海綿作用”。目前研究最為透徹的兩個(gè)是CDR1as/CIRS-7和Sry基因。CIRS-7/CDR1as在腦組織中高度表達(dá),含有70多個(gè)選擇性miR-7靶位點(diǎn),并與miR-7結(jié)合,抑制miR-7活性來(lái)增加miR-7靶基因的水平,在斑馬魚(yú)中,miR-7的敲除或CIRS-7/CDR1as的表達(dá)損害了中腦的發(fā)育。睪丸組織中的circRNA性別決定區(qū)域circRNA-Sry,也具有可以與miR-138相互作用的結(jié)合位點(diǎn),參與功能活動(dòng)的調(diào)控[3]。這兩項(xiàng)研究是circRNA的首次功能及機(jī)制研究,使circRNA成為RNA領(lǐng)域的一顆新星。目前,還有很多circRNA被證明具有miRNA分子海綿的作用。
circRNA還可與RBP相互作用,通過(guò)作為競(jìng)爭(zhēng)位點(diǎn)來(lái)阻斷蛋白質(zhì)效應(yīng),在轉(zhuǎn)錄和轉(zhuǎn)錄后水平上控制基因表達(dá)[4]。例如circ-Foxo3主要在細(xì)胞質(zhì)中表達(dá),能夠與衰老相關(guān)蛋白 ID1(inhibitor of DNA binding 1)、轉(zhuǎn)錄因子E2F1和低氧誘導(dǎo)因子1α(hypoxia inducible factor 1 subunit α, HIF-1α)結(jié)合,并抑制蛋白進(jìn)入細(xì)胞核中,阻斷其抗衰老功能,促進(jìn)心肌細(xì)胞衰老。此外,circ-Foxo3還可以通過(guò)結(jié)合細(xì)胞分裂蛋白激酶 2(cell division protein kinase 2, CDK2)和P21蛋白形成circ-Foxo3-p21-CDK2三元復(fù)合物來(lái)抑制細(xì)胞周期進(jìn)程,進(jìn)而結(jié)束細(xì)胞進(jìn)程導(dǎo)致細(xì)胞凋亡[8]。circRNA還具有編碼蛋白質(zhì)和多肽的功能,一種方式是通過(guò)內(nèi)部核糖體進(jìn)入位點(diǎn)IRES(internal ribosome entry sites)序列促進(jìn)起始因子或核糖體與可翻譯circRNA直接結(jié)合,如circZNF609[9]等。此外,circRNA 在缺乏 IRES、polyA和 5′帽結(jié)構(gòu)的條件下,也可以通過(guò)RCA(rolling circle amplification)機(jī)制翻譯蛋白質(zhì)[10]。研究還發(fā)現(xiàn)大量的circRNA 富含m6A甲基化修飾,驅(qū)動(dòng)circRNA從而啟動(dòng)翻譯[11]。
circRNA 存在于體液及血液中,占總RNA的1%,含量相對(duì)豐富。與lncRNA和miRNA比較,circRNA因其特殊環(huán)狀結(jié)構(gòu)具有獨(dú)特的抗RNA酶降解能力,更容易獲得和檢測(cè)。不同類型的細(xì)胞中circRNA差異性表達(dá),因此具有組織特異性[12]。circRNA豐度高,穩(wěn)定性好,特異性高。原則上,可以在人類全血、血漿、唾液和外泌體中檢測(cè)到circRNA,作為特定的生物學(xué)標(biāo)志物。
1.角膜新生血管:主要是由病原體感染或物理、化學(xué)損傷及內(nèi)源性調(diào)節(jié)因子的異常表達(dá)引起,導(dǎo)致角膜緣血管在角膜中異常生長(zhǎng),使角膜失去正常透明度,嚴(yán)重可導(dǎo)致失明[13]。Zhou等[14]對(duì)NaOH堿燒傷誘導(dǎo)的角膜新生血管小鼠模型進(jìn)行circRNA微陣列分析,鑒定出174個(gè)上調(diào)55個(gè)下調(diào)共229個(gè)差異表達(dá)的circRNA,cKifap3和cZNF609的異常表達(dá)與角膜新生血管的發(fā)生、發(fā)展密切相關(guān),其中cKifap3通過(guò)ceRNA機(jī)制作為miR-184的分子海綿,作用于Akt、VEGF通路調(diào)節(jié)角膜新生血管的形成。Wu等[15]進(jìn)一步利用角膜縫線誘導(dǎo)的角膜新生血管大鼠模型闡述cZNF609在角膜新生血管形成中進(jìn)一步的作用和機(jī)制。研究提示,cZNF609作為miR-184海綿隔離miR-184活性,提高下游Akt和VEGF表達(dá)水平,促進(jìn)人角膜上皮角質(zhì)形成細(xì)胞的體外增殖、遷移和成管。干預(yù)cZNF609的表達(dá)可能為角膜新血管性疾病開(kāi)創(chuàng)新的治療理念。
2.糖尿病視網(wǎng)膜病變(diabetic retinopathy, DR):糖尿病嚴(yán)重的微血管并發(fā)癥,是視網(wǎng)膜血管疾病的代表性疾病,位居中老年致盲性眼病第1位。高血糖引起視網(wǎng)膜ECs失衡,血-視網(wǎng)膜屏障功能受損,血管通透性增加,DR可導(dǎo)致微血管功能障礙和神經(jīng)膠質(zhì)變性為表現(xiàn)的神經(jīng)-血管單元病變,晚期可出現(xiàn)新生血管和增殖膜等[2]。目前臨床治療方法主要針對(duì)晚期視力嚴(yán)重受損的患者,需反復(fù)多次注射或手術(shù),組織創(chuàng)傷大[16]。因此,進(jìn)一步尋找相關(guān)診斷標(biāo)志物和治療靶標(biāo)對(duì)眼部新生血管性疾病的早期防治具有重要的戰(zhàn)略性意義。
circHIPK3是由HIPK3基因的2號(hào)外顯子產(chǎn)生,在肺、視網(wǎng)膜、胃腸道、卵巢等不同的組織中均有所表達(dá),參與多種癌癥的發(fā)病機(jī)制[17]。Shan等[18]研究發(fā)現(xiàn),circHIPK3在鏈脲佐菌素誘導(dǎo)的DR小鼠模型和高糖誘導(dǎo)的人視網(wǎng)膜血管內(nèi)皮細(xì)胞(human retinal vascular endothelial cells, HRVECs)中表達(dá)顯著上調(diào)。沉默circHIPK3抑制HRVECs活力、增殖、遷移和成管等能力,減少視網(wǎng)膜無(wú)細(xì)胞毛細(xì)血管、血管滲漏、炎癥和水腫,保護(hù)視網(wǎng)膜功能。circHIPK3作為內(nèi)源性miR-30a-3p分子海綿,通過(guò)ceRNA機(jī)制導(dǎo)致下游VEGF-C、FZD4和WNT2表達(dá)增加,調(diào)控血管內(nèi)皮病變。此外,臨床上對(duì)DR患者的房水標(biāo)本檢測(cè)發(fā)現(xiàn),circHIPK3表達(dá)明顯上調(diào)。上述研究提示,circHIPK3可通過(guò)多種調(diào)控通路調(diào)節(jié)內(nèi)皮細(xì)胞功能,circHIPK3/miR-30a-3p/VEGF-C、FZD4、WNT2軸可能在DR的發(fā)生、發(fā)展中起重要作用,為認(rèn)知DR病因和發(fā)病機(jī)制提供了全新的分子信息,為糖尿病微血管病變研究提供了新的機(jī)制和視角。
Liu等[19]研究發(fā)現(xiàn),在高糖和低氧應(yīng)激下cZNF609表達(dá)顯著上調(diào),敲低cZNF609可以減少視網(wǎng)膜血管丟失和病理性血管新生,熒光素酶報(bào)告基因測(cè)定證實(shí)cZNF609可能與miR615-5p相互作用,cZNF609可能通過(guò)cZNF609/miR615-5p/MEF-2A網(wǎng)絡(luò)調(diào)節(jié)DR血管功能,參與眼部新生血管性疾病的發(fā)生,并可能作為其潛在治療靶標(biāo)。circHIPK3和cZNF609的研究激起了血管領(lǐng)域?qū)Ψ蔷幋aRNA研究的熱情,為非編碼RNA在血管領(lǐng)域的研究做出了重要突破,同時(shí)也促進(jìn)了不同學(xué)科的交叉。Zhang等[20]通過(guò)微陣列分析了DR患者血漿、玻璃體纖維血管中circRNA表達(dá)情況,檢測(cè)出356個(gè)上調(diào)和173個(gè)下調(diào)的circRNA,提示糖尿病微血管病變可能與多個(gè)circRNA的異常表達(dá)相關(guān)。其中,circ-0005015可作為內(nèi)源性miR-519d-3p海綿,抑制miR-519d-3p活性,促進(jìn)MMP-2、STAT3及XIAP蛋白的表達(dá),調(diào)節(jié)ECs功能,促進(jìn)血管生成。Zhu等[21]研究發(fā)現(xiàn)CircDNMT3B通過(guò)調(diào)節(jié)miR-20b-5p, 靶向作用于BAMBI參與調(diào)控內(nèi)皮穩(wěn)定和維持血管動(dòng)態(tài)平衡。CircDNMT3B的高表達(dá)可調(diào)節(jié)ECs功能,減少糖尿病視網(wǎng)膜滲漏和視功能損傷,逆轉(zhuǎn)視網(wǎng)膜電圖a、b波振幅下降。circCOL1A2作為miR-29b海綿,提高VEGF,MMP-2,MMP-9表達(dá)水平,沉默circCOL1A2可能減少血管新生,減少高糖刺激下的視網(wǎng)膜結(jié)構(gòu)和功能損害。以上研究表明,circRNA可通過(guò)多個(gè)致病途徑介導(dǎo)DR中新生血管的發(fā)展,有望成為DR的潛在診斷、預(yù)后生物學(xué)標(biāo)志物及抗新生血管治療靶標(biāo)。
周細(xì)胞是血管成熟和視網(wǎng)膜屏障的重要組成部分,周細(xì)胞丟失是DR的早期病理特征,異常的周細(xì)胞-內(nèi)皮細(xì)胞串?dāng)_可導(dǎo)致視網(wǎng)膜血管滲漏、閉塞和成熟障礙。有研究發(fā)現(xiàn),在臨床標(biāo)本及STZ誘導(dǎo)的DR小鼠視網(wǎng)膜組織中circRNA表達(dá)異常,糖尿病相關(guān)應(yīng)激源刺激可上調(diào)周細(xì)胞中cPWWP2A、cZNF532的表達(dá),而在內(nèi)皮細(xì)胞表達(dá)不受影響。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),cPWWP2A過(guò)表達(dá)使周細(xì)胞覆蓋率增加,周細(xì)胞可通過(guò)旁分泌作用影響HRVECs的增殖、遷移和成管能力,間接調(diào)節(jié)內(nèi)皮細(xì)胞的功能,使視網(wǎng)膜血管滲漏減輕,無(wú)細(xì)胞毛細(xì)血管及微動(dòng)脈瘤減少。研究表明,cPWWP2A通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR-579,調(diào)節(jié)視網(wǎng)膜Ang1、occludin、SIRT1的表達(dá)水平,增強(qiáng)周細(xì)胞的表達(dá)及募集,保護(hù)視網(wǎng)膜。SP1是在糖尿病應(yīng)激條件下激活的一種轉(zhuǎn)錄因子,可與cZNF532的啟動(dòng)子結(jié)合并增強(qiáng)cZNF532的表達(dá)。在周細(xì)胞中cZNF532通過(guò)作為miR-29a-3p分子海綿,靶向提高NG2、LOXL2和CDK2的表達(dá)從而調(diào)節(jié)周細(xì)胞生物學(xué)活性,增強(qiáng)周細(xì)胞活力,增殖和分化并增強(qiáng)周細(xì)胞向內(nèi)皮細(xì)胞募集,減輕糖尿病應(yīng)激條件下的細(xì)胞凋亡。通過(guò)對(duì)cPWWP2A、cZNF532的研究,發(fā)現(xiàn)血管周細(xì)胞病變的表觀調(diào)控新機(jī)制,挖掘了視網(wǎng)膜病變干預(yù)治療的潛在靶標(biāo)。因此,基于周細(xì)胞-內(nèi)皮細(xì)胞串?dāng)_調(diào)控的治療干預(yù)將為預(yù)防和保護(hù)糖尿病視網(wǎng)膜血管損傷提供一種新的方法,周細(xì)胞保護(hù)的DR治療有望成為抗新生血管之外的又一新的治療方向。
3.早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變(retinopathy of prematurity, ROP):一種以視網(wǎng)膜缺氧繼發(fā)新生血管增殖為特點(diǎn)的早產(chǎn)兒眼底疾病[2]。隨著醫(yī)療技術(shù)水平的發(fā)展,早產(chǎn)兒成活率增高,ROP成為兒童失明的重要原因[22]。氧誘導(dǎo)視網(wǎng)膜病變(oxygen-induced retinopathy, OIR)小鼠模型是模擬ROP視網(wǎng)膜血管病變的主要?jiǎng)游锬P?。Zhou等[14]對(duì) OIR視網(wǎng)膜進(jìn)行測(cè)序發(fā)現(xiàn),大量差異表達(dá)的circRNA在血管生成等生物學(xué)過(guò)程中富集。OIR小鼠視網(wǎng)膜中circRNA水平改變與細(xì)胞進(jìn)程、細(xì)胞內(nèi)酶活性、MAPK信號(hào)通路和腎素-管緊張素系統(tǒng)調(diào)節(jié)相關(guān),并可能參與OIR病理性血管新生。此外,Liu等[19]研究發(fā)現(xiàn)在OIR模型中,cZNF609表達(dá)顯著上調(diào),cZNF609可能通過(guò)cZNF609/miR615-5p/MEF-2A軸調(diào)節(jié)宿主基因,參與眼部新生血管性疾病的發(fā)生。敲低cZNF609可以減少視網(wǎng)膜血管丟失和病理性血管新生,作為其潛在治療靶標(biāo)。然而,circRNA對(duì)ROP血管新生過(guò)程及其具體分子機(jī)制仍然缺乏了解,需要加大這方面的研究來(lái)全面驗(yàn)證結(jié)果并闡明其中潛在分子機(jī)制。
4.脈絡(luò)膜新生血管(choroidal neovascularization, CNV):一種累及RPE-脈絡(luò)膜-鞏膜復(fù)合體的常見(jiàn)眼部疾病[2]。年齡相關(guān)性黃斑變性(age-related macular degeneration, AMD)、病理性近視、弱視等是引起CNV的主要原因,常導(dǎo)致視力喪失。Liu等[23]對(duì)CNV小鼠RPE-脈絡(luò)膜-鞏膜復(fù)合體進(jìn)行微陣列分析,發(fā)現(xiàn)大量異常表達(dá)的circRNA,circRNA可能在CNV的發(fā)病機(jī)制中發(fā)揮至關(guān)重要的作用。滲出型AMD的特征是CNV形成。有研究發(fā)現(xiàn),在缺氧應(yīng)激后的ECs及激光誘導(dǎo)的CNV小鼠模型中cZBTB44的表達(dá)明顯上調(diào),cZBTB44作為miR-578分子海綿,抑制miR-578活性,導(dǎo)致VEGFA和VCAM1表達(dá)增加。敲低cZBTB44可降低內(nèi)皮細(xì)胞的活力、增殖、遷移和成管能力,延緩CNV的發(fā)生、發(fā)展。敲低cZBTB44聯(lián)合眼內(nèi)抗VEGF類藥物貝伐珠單抗注射可增加抗VEGF藥物療效,進(jìn)一步抑制CNV的發(fā)展。綜上所述,AMD有可能通過(guò)cZBTB44/miR-578/VEGFA、VCAM1軸調(diào)節(jié)脈絡(luò)膜新生血管,并與貝伐珠單抗具有協(xié)同抗VEGF作用。此外,在滲出性AMD患者的臨床樣品中檢測(cè)到cZBTB44表達(dá)失調(diào),提示cZBTB44可能成為AMD的標(biāo)志物并有助于AMD的臨床診斷。
circRNA 可通過(guò)多種生物學(xué)機(jī)制調(diào)節(jié)基因的表達(dá),參與眼部新生血管性疾病的發(fā)生、發(fā)展。對(duì)circRNA的研究可能豐富對(duì)生物機(jī)體遺傳調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的認(rèn)識(shí),揭示了潛在的疾病發(fā)病機(jī)制,提供更多診療思路、判斷預(yù)后及轉(zhuǎn)歸情況。目前,circRNA的研究主要集中在其生理病理過(guò)程中的表達(dá)變化,大多數(shù)研究?jī)H局限于動(dòng)物模型,且circRNA的功能研究及具體調(diào)控機(jī)制并未完全明了。因此,未來(lái)需要進(jìn)一步研究基于人體標(biāo)本中的circRNA在新生血管性疾病中的詳細(xì)作用機(jī)制,并積極進(jìn)行臨床轉(zhuǎn)化研究。積極進(jìn)行相關(guān)檢測(cè)試劑盒的研制,使circRNA在眼部新生血管性疾病的診療方面發(fā)揮無(wú)限的價(jià)值。此外,靶細(xì)胞的特異性circRNA敲除技術(shù)也存在著廣闊的研究空間。目前,針對(duì)circRNA的研究廣度已經(jīng)鋪開(kāi),而研究深度還遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠,仍需研究者開(kāi)展深入探索。