莫璋紅,梁 俊,謝金蘭,林 麗,李長(zhǎng)寧
(1.廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所/農(nóng)業(yè)農(nóng)村部廣西甘蔗生物技術(shù)與遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/ 廣西甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣西南寧 530007;2.廣西益譜檢測(cè)技術(shù)有限公司,廣西南寧 530007;3.廣西泰格瑞科技有限公司,廣西南寧 530007;4.廣西智標(biāo)云信息科技有限公司,廣西南寧 530009)
白糖作為我國(guó)戰(zhàn)略儲(chǔ)備物資之一,其地位不言而喻。甘蔗是生產(chǎn)白糖的主要原料,因此優(yōu)良甘蔗品種育種具有極其重要意義和價(jià)值。我國(guó)具有極其豐富的野生甘蔗種質(zhì)資源,為雜交育種提供了優(yōu)質(zhì)的親本[1]。然而傳統(tǒng)的甘蔗育種方式幾乎完全依賴于植株的表現(xiàn)型,因此高效優(yōu)質(zhì)的甘蔗生產(chǎn)需要向弱化表現(xiàn)型影響的育種形式發(fā)展,分子標(biāo)記輔助甘蔗遺傳育種的方法成為最優(yōu)選擇。分子標(biāo)記能直接反映出遺傳多樣性,因此其在輔助育種上開始運(yùn)用,這一技術(shù)也逐漸成為國(guó)內(nèi)外甘蔗遺傳育種的研究熱點(diǎn),且在部分發(fā)達(dá)地區(qū)已開始應(yīng)用[2]。
分子標(biāo)記(Molecular Markers)技術(shù)的基礎(chǔ)是個(gè)體間遺傳物質(zhì)內(nèi)核苷酸序列變異,是常用于檢測(cè)生物間差異的遺傳標(biāo)記。相比于形態(tài)學(xué)標(biāo)記、生物化學(xué)標(biāo)記、細(xì)胞學(xué)標(biāo)記等標(biāo)記技術(shù),分子標(biāo)記有較多的優(yōu)勢(shì),例如,大部分分子標(biāo)記為共顯性,選擇隱性性狀對(duì)分子標(biāo)記技術(shù)來說十分便利;基因組變異豐富,分子標(biāo)記的數(shù)量幾乎是無限的;標(biāo)記分析不受生物發(fā)育時(shí)段影響;可揭示變異的DNA 片段;目標(biāo)性狀不受外界環(huán)境等因素影響,可正常表達(dá);檢測(cè)手段簡(jiǎn)單、迅速等[3-6]。得益于以上優(yōu)點(diǎn),DNA 分子標(biāo)記能在各領(lǐng)域受到重點(diǎn)研究和應(yīng)用,如種質(zhì)資源遺傳多樣性分析、目標(biāo)性狀基因的標(biāo)記與定位、抗性育種、作物品種純度鑒定及品質(zhì)鑒定等。
在甘蔗作物生產(chǎn)活動(dòng)中,各種因素影響著甘蔗的品質(zhì)和產(chǎn)量。其中對(duì)甘蔗育種生產(chǎn)影響較大的因素是氣候和病害,如干旱、寒冷等環(huán)境會(huì)影響甘蔗根系的呼吸能力,嚴(yán)重影響其糖類積累過程,進(jìn)而造成嚴(yán)重減產(chǎn)。銹病、黑穗病等是甘蔗常見的病害,蔗田間的病菌量累積至一定程度后會(huì)大規(guī)模爆發(fā),毀壞甘蔗植株,導(dǎo)致大規(guī)模減產(chǎn)。分子標(biāo)記可以很好地應(yīng)對(duì)這些問題,尤其是當(dāng)基因不能很好地表現(xiàn)出其性狀的類型,如甘蔗抗黑穗病性狀不僅受主基因控制,還受其他內(nèi)在因素及外在因素的累加影響。由于雜交育種的前提基礎(chǔ)是種質(zhì)資源的遺傳廣泛性。因此,當(dāng)前甘蔗育種研究的重難點(diǎn)方向?yàn)榉肿訕?biāo)記輔助甘蔗育種研究[7]。
秦茜等人研究發(fā)現(xiàn)光合產(chǎn)物積累和甘蔗抗旱性有關(guān)[8]。廖詩童等采用簡(jiǎn)單重復(fù)序列(Simple Sequence Repeat,SSR)標(biāo)記技術(shù)標(biāo)記和篩選了35 個(gè)不同耐寒蔗種,結(jié)果表明品種間的基因組SSRs(Genomic SSR,gSSR)遺傳相似系數(shù)在0.413 8~0.804 6,平均值為0.625 1;品種間的表達(dá)序列標(biāo)簽(Express Sequence Tag,EST-SSR)遺傳相似系數(shù)在0.514 5~0.797 1,平均值為0.665 1,研究中g(shù)SSR 標(biāo)記的效果明顯優(yōu)于EST-SSR[9]。
端木卜文等用Bru1 和黃銹病抗性位點(diǎn)G1 對(duì)國(guó)內(nèi)164 份甘蔗材料進(jìn)行檢測(cè)分析,結(jié)果14%參試材料中帶有Bru1 抗性標(biāo)記,5.56%的參試材料中帶有G1 位點(diǎn),3.66%參試材料同時(shí)帶有Bru1 和G1 位點(diǎn),結(jié)果表明,國(guó)內(nèi)大多數(shù)甘蔗品種不具有抗褐銹病基因,為后續(xù)甘蔗抗銹病基因資源研究提供了科學(xué)依據(jù)[10]。目前,國(guó)內(nèi)外都在加大培育甘蔗抗病種力度[11]。
2.2.1 種質(zhì)鑒定及篩選
豐富的種質(zhì)資源是育種的前提和基礎(chǔ),開展種質(zhì)資源分子檢測(cè),對(duì)甘蔗資源育種具有重要意義。肖關(guān)麗等為了建立適合甘蔗隨機(jī)擴(kuò)增多態(tài)性DNA(Randomly Amplified Polymorphic DNA,RAPD)分析的聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(Polymerase Chain Reaction,PCR)條件,用甘蔗雜種梁河78/121 及其親本華南56/12 和崖城58/473 材料的DNA,對(duì)115 個(gè)隨機(jī)引物進(jìn)行篩選,找到了可用于鑒定該雜種的引物OPR-17、OPK-17 和OPR-18[12]。
2.2.2 指紋圖譜的構(gòu)建
曾華宗等采用RAPD 技術(shù)對(duì)多組甘蔗種質(zhì)間的親緣關(guān)系、特異標(biāo)記進(jìn)行分析,成功構(gòu)建關(guān)于41 份種質(zhì)的RAPD 指紋圖譜[13]。劉新龍也成功構(gòu)建了甘蔗分子遺傳圖譜,方法是利用36 對(duì)SSR 引物和12 對(duì)擴(kuò)增片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Amplified Fragment Length Polymorphism,AFLP)引物對(duì)甘蔗商業(yè)品種Co419 與野生種割手密Y75/1/2 兩個(gè)群體進(jìn)行PCR 擴(kuò)增和分子遺傳連鎖分析[14]。
2.2.3 遺傳多樣性評(píng)估
AFLP 技術(shù)也能較好地評(píng)估甘蔗遺傳多樣性,李鳴采集了不同地區(qū)的甘蔗種質(zhì),利用AFLP 技術(shù)進(jìn)行鑒定和區(qū)分,并對(duì)各個(gè)種質(zhì)的AFLP 指紋圖譜進(jìn)行遺傳多樣性和聚類分析,結(jié)果表明各種質(zhì)間存在豐富的遺傳多樣性[15]。昝逢剛等采用AFLP 標(biāo)記技術(shù),對(duì)來自中國(guó)、澳大利亞、美國(guó)等6 個(gè)國(guó)家不同地區(qū)的118 份甘蔗種質(zhì)進(jìn)行分析,結(jié)果表明各種間存在豐富的遺傳多樣性[16]。
相比于傳統(tǒng)甘蔗育種,分子標(biāo)記輔助育種具備諸多優(yōu)點(diǎn),在甘蔗抗性研究、遺傳多樣性等方面發(fā)揮較大作用。但其在甘蔗育種的應(yīng)用上仍存在不少問題,甘蔗染色體數(shù)量多是最主要的原因,甘蔗是高度雜合的多倍體,供試材料的選擇十分困難;甘蔗一般為種間雜交,難以建立出能夠世代遺傳優(yōu)質(zhì)基因的分離群體。雖然目前的分子標(biāo)記輔助甘蔗育種研究已在嘗試克服這些問題,例如,嘗試同時(shí)使用幾種不同的標(biāo)記方法;開展甘蔗野生近種的研究,挖掘抗性基因,拓寬甘蔗遺傳基礎(chǔ);結(jié)合多種分子標(biāo)記技術(shù),構(gòu)建致密的遺傳連鎖圖譜等。在此研究基礎(chǔ)上,分子標(biāo)記可以進(jìn)一步應(yīng)用在輔助性狀篩選、多性狀同時(shí)標(biāo)記及篩選,充分發(fā)揮分子標(biāo)記輔助甘蔗育種的作用,提高甘蔗育種效率。