吳華濤,崔玉坤
(1.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院第一附屬醫(yī)院普外科,廣東 汕頭 515041;2.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院廣東省乳腺癌診治研究重點實驗室,廣東 汕頭 515041)
N6-甲基腺苷(N6-methyladenosine,m6A)最早于20世紀(jì)70 年代由Desrosiers 等[1]團隊報道,是真核信使RNA(messenger RNA,mRNA)中最豐富的內(nèi)部修飾方式。近年來,針對m6A修飾的研究越來越廣泛,m6A主要出現(xiàn)在序列RRm6ACH([G/A/U][G>A]m6AC[U>A>C])中,該甲基化修飾過程是可逆性的,包括甲基轉(zhuǎn)移酶、去甲基化酶和甲基化閱讀蛋白等共同參與[2]。越來越多的證據(jù)表明,m6A不僅在正常的生理過程中發(fā)揮重要作用,在多種惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展過程中都占據(jù)重要地位[3]。
目前研究表明m6A修飾過程在乳腺癌發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮著重要的作用,有望成為腫瘤治療的新靶點[4]。其中甲基轉(zhuǎn)移酶樣蛋白3(methyltransferase-like protein 3,METTL3)作為主要的m6A甲基化酶,通過調(diào)控下游分子甲基化水平參與正常生理和多種疾病的病理過程,且多項研究顯示METTL3在人類多種惡性腫瘤中表達失調(diào)且具有致癌/促癌特性[3]。本文將總結(jié)METTL3 在乳腺癌發(fā)生發(fā)展中作用的最新研究進展,探索其對乳腺癌的調(diào)控機制及其作為乳腺癌患者治療靶點的潛能。
研究已經(jīng)證實,m6A對RNA的甲基化修飾是可逆化過程,調(diào)控因子包括甲基轉(zhuǎn)移酶、去甲基化酶和甲基化閱讀蛋白等[5]。結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究表明,甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3 和METTL14 均具有關(guān)鍵的催化結(jié)構(gòu)域,在m6A 修飾過程中,兩者之間形成復(fù)合物,共同行使催化功能,其中METTL3 具有催化活性,而METTL14 主要負(fù)責(zé)底物識別,因此METTL3表達水平及活性對真核生物細(xì)胞內(nèi)m6A修飾水平起到重要的作用。Huang等[6]指出,m6A相關(guān)修飾酶在腫瘤中的表達水平不盡相同,環(huán)境因素和基因位點突變均可導(dǎo)致m6A狀態(tài)的改變,同時m6A修飾還可參與腫瘤靶向治療基因的調(diào)控。因此,METTL3 在惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展中占有重要的地位。
Zhang 等[7]首先在乳腺癌干細(xì)胞(breast cancer stem cell,BSCS)中發(fā)現(xiàn),在缺氧刺激下缺氧誘導(dǎo)因子可促進m6A 去甲基化酶ALKBH5 的表達,進而使多能性因子NANOG 的甲基化水平下調(diào)、表達增加并誘導(dǎo)BSCS 表型,而ALKBH5 表達的下調(diào)可顯著減少BSCS 的數(shù)量,降低乳腺癌發(fā)生的能力,提示m6A甲基化水平對乳腺癌發(fā)生發(fā)展的重要作用,而m6A甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3的表達水平則可直接影響乳腺癌中m6A 的修飾水平。有趣的是,沉默METTL3 表達可抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖能力,并增強其凋亡水平[8]。隨后,F(xiàn)ry 等[9]在永生化的人類乳腺上皮細(xì)胞HMEC 中發(fā)現(xiàn)METTL3 表達及m6A 水平均下調(diào),過表達METTL3可促進該細(xì)胞的增殖和遷移潛能。Wu等[10]利用生存分析及Cox 單因素分析發(fā)現(xiàn)METTL3 表達水平與乳腺癌患者不良預(yù)后密切相關(guān);且另一項研究發(fā)現(xiàn)在乳腺癌組織及細(xì)胞中,METTL3的表達均顯著升高[11]。
然而,一項針對轉(zhuǎn)移率和惡性程度高的三陰性乳腺癌(triple-negative breast cancer, TNBC) 的研究則發(fā)現(xiàn) ,METTL3在TNBC中呈低表達狀態(tài),且與TNBC患者短距離無轉(zhuǎn)移生存率密切相關(guān),敲除METTL3 可通過降低TNBC細(xì)胞中的m6A 水平進而增強細(xì)胞的遷移、侵襲和黏附能力[12]。Fry 等[9]則發(fā)現(xiàn)在永生化和轉(zhuǎn)化的乳腺上皮細(xì)胞中,METTL3的表達及m6A甲基化水平均顯著低于其親本細(xì)胞。
失控性增長是惡性腫瘤重要的生物學(xué)特點之一,乳腺癌也不例外。研究認(rèn)為在脊椎動物細(xì)胞凋亡過程中,線粒體處于凋亡調(diào)控的中心位置,而在線粒體通路中,凋亡信號激活含BH3 結(jié)構(gòu)域的Bcl-2 家族成員,后者發(fā)生寡聚化并插入線粒體膜,引起線粒體膜通透性改變,誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[13]。Wang 等[11]發(fā)現(xiàn)抗凋亡蛋白 Bcl-2 是 METTL3 的下游靶分子。在乳腺癌細(xì)胞和組織中,METTL3 表達水平顯著增高,敲減METTL3 表達可下調(diào)Bcl-2 的m6A 及表達水平,進而促進腫瘤細(xì)胞凋亡,抑制其增殖能力。Cheng等[14]在探索二甲雙胍對乳腺癌的治療作用的研究中,通過轉(zhuǎn)錄組測序發(fā)現(xiàn)p21是METTL3的潛在下游分子,METTL3可以通過依賴m6A的方式抑制p21的表達,從而促進乳腺癌細(xì)胞增殖;而二甲雙胍則以p21為主要靶點,通過抑制METTL3 的表達降低乳腺癌細(xì)胞中m6A 水平,進而上調(diào)p21 表達,抑制乳腺癌細(xì)胞的增殖,提示METTL3 是二甲雙胍治療乳腺癌的潛在靶點。
METTL3 通過m6A 修飾不僅可以調(diào)控下游蛋白表達,還可以通過調(diào)控非編碼RNA的表達水平調(diào)控后者的下游蛋白,進而影響乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程。乙型肝炎X互作蛋白(hepatitis B X-interacting protein,HBXIP)的異常表達是驅(qū)動乳腺癌侵襲性進展的重要因素,Cai 等[8]研究發(fā)現(xiàn)HBXIP 可通過抑制小分子miRNA let-7g 進而上調(diào)METTL3的表達,而上調(diào)的METTL3則可通過上調(diào)HBXIP的m6A修飾水平,進而促進HBXIP的表達,兩者正反饋調(diào)控,最終促進了乳腺癌的增殖并抑制了凋亡的發(fā)生。Rong等[15]發(fā)現(xiàn)長 鏈 非 編 碼 RNA (long non-coding RNA, lncRNA)LINC00958 是METTL3 的下游分子,m6A 甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3 通過促進LINC00958 甲基化水平上調(diào)后者的表達,而LINC00958則在乳腺癌增殖進展過程中扮演促癌基因的作用,其通過吸附作用降低miR-378a-3p的表達,從而上調(diào)其下游基因YY1的mRNA 和蛋白水平,促進乳腺癌的增殖能力。而LINC00675 在METTL3 甲基化的修飾下則增強了其作為內(nèi)源性競爭RNA 的作用,增強了其與miR-513b-5p 的相互作用,進一步抑制了miR-513b-5p 對下游基因的抑制作用,從而抑制了乳腺癌細(xì)胞的增殖能力和侵襲轉(zhuǎn)移能力[16]。
近期,Wan 等[17]研究發(fā)現(xiàn),在乳腺癌細(xì)胞中,PD-L1是METTL3 介導(dǎo)的m6A 修飾的下游靶點,抑制METTL3 表達可顯著下調(diào)m6A修飾水平,降低PD-L1的穩(wěn)定性,進而增強PD-L1介導(dǎo)的T細(xì)胞激活和浸潤,在體增強抗腫瘤免疫,對腫瘤免疫治療提供了新的治療策略和思路。
作為體表腫瘤,乳腺癌患者因癌死亡的主要原因是腫瘤的復(fù)發(fā)和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移,探索乳腺癌復(fù)發(fā)和轉(zhuǎn)移的分子機制,將為延長患者生存期和提高患者生存質(zhì)量提供幫助。Chen 等[18]篩選建立了乳腺癌肺轉(zhuǎn)移細(xì)胞模型,即BCLMF3細(xì)胞,并進一步研究發(fā)現(xiàn)在BCLMF3細(xì)胞中m6A 甲基化水平及METTL3 的表達均顯著升高,而去甲基化酶FTO 明顯下調(diào);METTL3通過甲基化角蛋白7(keratin 7,KRT7)的反義lncRNA KRT7-AS 的A877 位點,促進KRT7-AS/KRT7 mRNA 的穩(wěn)定性及KRT7 的翻譯和表達;體內(nèi)實驗和臨床研究都同樣證實METTL3 及其上調(diào)的KRT7 和KRT7-AS 均在乳腺癌肺轉(zhuǎn)移過程中發(fā)揮重要作用,是治療乳腺癌轉(zhuǎn)移的重要靶點。LncRNA 轉(zhuǎn)移相關(guān)肺腺癌轉(zhuǎn)錄本1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript-1,MALAT1)也是METTL3甲基化的下游分子[19]。METTL3通過上調(diào)MALAT1 的m6A 修飾水平進而增加MALAT1 的表達,而MALAT1則可通過吸附miR-26b進而上調(diào)其下游分子高遷移率基團AT-Hook 蛋白2 (high mobility group at-hook protein 2,HGMA2),從而促進乳腺癌上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT)過程和侵襲轉(zhuǎn)移能力[19]。
另一方面,Li 等[20]則發(fā)現(xiàn)METTL3基因在乳腺癌中高表達環(huán)狀circMETTL3,其作為內(nèi)源性競爭性RNA 拮抗miR-31-5p的作用,進而上調(diào)其下游靶分子周期蛋白依賴性激酶1 促進乳腺癌侵襲轉(zhuǎn)移,而其宿主基因METTL3則可通過m6A 依賴的方式上調(diào)circMETTL3 的表達,促進乳腺癌進展;該研究未發(fā)現(xiàn)circMETTL3 對其宿主基因表達的影響。然而,近期一項針對TNBC 的研究則認(rèn)為circMETTL3 可作為miR-34c-3p 的吸附海綿進而促進其下游分子METTL3的表達,發(fā)揮抑制細(xì)胞增殖、侵襲和腫瘤生長轉(zhuǎn)移的作用[21]。而免疫共沉淀研究發(fā)現(xiàn),METTL3 可與EZH2 的mRNA 結(jié)合,并通過m6A 修飾促進后者的表達,進而通過下調(diào)E-cadherin 的表達促進乳腺癌細(xì)胞的EMT和轉(zhuǎn)移過程,加重乳腺癌的進展[22]。
雌激素受體陽性的Luminal 型乳腺癌患者對含他莫昔芬等藥物的內(nèi)分泌治療敏感,預(yù)后優(yōu)于其他類型的乳腺癌患者。然而,他莫昔芬耐藥的出現(xiàn)嚴(yán)重影響了患者生存期和生存質(zhì)量,Liu等[23]發(fā)現(xiàn)在他莫昔芬耐藥的乳腺癌細(xì)胞株中腺苷酸激酶4(adenylate kinase 4,AK4)和METTL4 表達均顯著上調(diào)。研究表明,在他莫昔芬耐藥的MCF-7乳腺癌細(xì)胞株中AK4的5′非翻譯區(qū)存在多個m6A修飾位點,在METTL3 調(diào)控下,AK4 表達顯著上調(diào)并進一步激活活性氧自由基的產(chǎn)生及p38的磷酸化水平,從而誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞產(chǎn)生對他莫昔芬的抗性。
而METTL3 的高表達同樣可以降低乳腺癌對阿霉素(adriamycin,ADR)的敏感性,研究表明,在ADR耐藥的MCF-7 乳腺癌細(xì)胞中下調(diào)METTL3 表達可降低pri-miR-221-3p 的m6A 甲基化水平,從而抑制后者的成熟,降低miR-221-3p 及多藥耐藥蛋白1 和乳腺癌耐藥蛋白的表達;另一方面,miR-221-3p 可通過與3′非翻譯區(qū)結(jié)合負(fù)向調(diào)控同源結(jié)構(gòu)域相互作用蛋白激酶2 (homeodomaininteracting protein kinase 2,HIPK2),進而誘導(dǎo) ADR 耐藥的MCF-7 乳腺癌細(xì)胞的抗性。METTL3/miR-221-3p/HIPK2信號軸的發(fā)現(xiàn)闡述了乳腺癌化療耐藥的表觀遺傳學(xué)分子機制,并提供了新的治療靶點[24]。而Li 等[25]也發(fā)現(xiàn)MALAT1 作為METTL3 的下游分子同樣參與了乳腺癌對ADR 耐藥的過程,METTL3 甲基化修飾MALAT1 并上調(diào)后者的表達,進而招募轉(zhuǎn)錄因子E2F1 直接結(jié)合于人前梯度蛋白2(anterior gradient 2,AGR2)的啟動子區(qū)域促進AGR2 的表達,誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞對ADR 治療的抵抗。METTL3 同樣參與了同源重組修復(fù)的調(diào)控,抑制METTL3表達可降低同源重組修復(fù)的效率,并通過調(diào)節(jié)EGF/RAD51軸的m6A 修飾水平增加ADR 所誘導(dǎo)的DNA 損傷[26]。上述結(jié)果均提示,METTL3 介導(dǎo)的化療藥物反應(yīng)性改變,是惡性腫瘤治療的重要分子機制。
腫瘤干細(xì)胞理論的提出為重新認(rèn)識腫瘤的起源和本質(zhì)提供了新的方向,也為臨床惡性腫瘤的治療提供了新的視角[27],而對腫瘤干細(xì)胞標(biāo)志物的篩選為該類研究提供了有力的平臺[28]。Xie 等[29]研究表明,METTL3 在乳腺癌組織中高表達,同時與腫瘤大小和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移密切相關(guān),而敲減METTL3 的表達可顯著下調(diào)腫瘤干細(xì)胞標(biāo)志物SOX2、CD133 和CD44 的表達水平,進一步抑制乳腺癌的侵襲轉(zhuǎn)移能力,而RNA 免疫共沉淀實驗證實SOX2 是METTL3 的靶分子,METTL3 可與SOX2 的mRNA 直接結(jié)合并富集SOX2的表達。
NANOG 是維持干細(xì)胞自我更新增殖和亞全能性的關(guān)鍵因子,屬于胚胎干細(xì)胞的轉(zhuǎn)錄因子,可增強腫瘤干細(xì)胞的多能干性,增加了惡性腫瘤的復(fù)發(fā)風(fēng)險[30]。而METTL3作為轉(zhuǎn)錄因子鋅指蛋白217 (zinc finger protein 217,ZNF217)的下游分子可以抑制NANOG的表達,ZNF217通過下調(diào)METTL3 及m6A 水平促進NANOG 的表達,促進乳腺癌細(xì)胞的干性和進展[31]。
近期,He 等[32]利用TCGA 數(shù)據(jù)庫,在775 例乳腺癌患者中分析了24 種與m6A 修飾相關(guān)的重要調(diào)節(jié)因子的表達情況,發(fā)現(xiàn)m6A調(diào)節(jié)因子與乳腺癌惡性程度、預(yù)后及抗腫瘤免疫反應(yīng)等密切相關(guān),提示m6A修飾在乳腺癌發(fā)生發(fā)展過程中起到重要的作用。而不同類型的惡性腫瘤中m6A甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3 的高表達均與患者不良預(yù)后密切相關(guān),是腫瘤進展過程中的重要標(biāo)志物[33]。本文通過對已發(fā)表的關(guān)于甲基轉(zhuǎn)移酶METTL3 在乳腺癌中的作用分析后發(fā)現(xiàn),METTL3主要通過提高乳腺癌細(xì)胞內(nèi)m6A修飾水平調(diào)控下游蛋白或非編碼RNA的表達水平,進而影響乳腺癌的發(fā)生發(fā)展過程。然而,由于表觀遺傳學(xué)中RNA 翻譯的復(fù)雜性,現(xiàn)有的研究結(jié)果對METTL3在乳腺癌進展中的作用仍存在一定的爭議,對METTL3的作用及其調(diào)節(jié)乳腺癌的關(guān)鍵步驟和分子機制仍需進一步研究和闡明。
雖然針對METTL3 作用的研究存在一定矛盾的結(jié)果,但其在乳腺癌中發(fā)揮促癌作用得到一定的認(rèn)可,且以METTL3或m6A修飾為分子診療靶點的研究展現(xiàn)出了相應(yīng)的效果,為患者帶來希望,受到了廣泛的關(guān)注[34]。此外,除了上述已報道的在乳腺癌中的作用機制外,METTL3 也在其他重要的生物過程起到重要的作用,如新陳代謝調(diào)節(jié)、血管生成失調(diào)、免疫逃逸等[35]。因此,深入研究并闡明METTL3及其調(diào)控的m6A修飾對明確乳腺癌發(fā)生發(fā)展的機制,完善相關(guān)分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),探索乳腺癌精準(zhǔn)治療的潛在靶點等均具有重要的意義。同時迫切需要研發(fā)針對METTL3的抑制劑或小分子藥物,將為研究m6A修飾表型與乳腺癌表型間的關(guān)系提供條件,也使其在未來成功地應(yīng)用于乳腺癌患者的治療提供了可能。