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一株楊樹灰霉病原菌的分離及鑒定

2022-02-09 02:14:48馮連榮宋立志趙大根矯麗曼
南方林業(yè)科學(xué) 2022年6期
關(guān)鍵詞:灰霉病楊樹病斑

馮連榮,宋立志,趙大根,矯麗曼

(遼寧省楊樹研究所,遼寧 蓋州 115213)

新林1號楊(PopulusבXinlin 1’)是國有新民市機(jī)械林場培育的楊樹品種,屬于黑楊派與青楊派的雜交種[1],樹干通直,樹冠冠形圓滿,樹枝多而密,雄株,無飛絮,2015年9月通過遼寧省林木良種委員會被審定為楊樹良種,2016年10月取得了林木良種生產(chǎn)經(jīng)營許可證。與意大利214楊(P.×euramericana cv.‘I-214’)、蓋 楊(P.×gaixianensis)、107楊(P.×euramericana cv.‘Neva’)和108楊(P.×euramericana cv.‘Guariento’)相比,其生長優(yōu)勢明顯且抗逆性較強(qiáng)[2],目前在遼寧省內(nèi)沈陽、錦州、葫蘆島等地被大面積推廣,推廣效果良好,是纖維材、膠合板材等原料林重要造林品種,也是重要的防護(hù)林造林品種之一[1]。

新林1號楊1年生扦插盆栽苗在溫室內(nèi)培養(yǎng)過程中,發(fā)現(xiàn)其中1株盆栽苗葉片上出現(xiàn)圓形病斑,為鑒定引起該病斑的病原菌種類,于室內(nèi)進(jìn)行了病原菌菌種分離,并利用rDNA-ITS序列分析進(jìn)行了分子鑒定,為下一步研究該病原菌致病機(jī)理及防治方法等奠定基礎(chǔ)。

1 試驗(yàn)材料與方法

1.1 植物材料

新林1號楊(PopulusבXinlin1’)1年生扦插盆栽苗,置于25℃人工智能溫室內(nèi)培養(yǎng),空氣濕度70%~80%。

1.2 酶和試劑

TaKaRa Ex Taq、DL2000 Marker購自TaKaRa生物工程有限公司、TIANGEN植物快捷型DNA提取系統(tǒng)(非離心柱型)試劑盒購自北京天根生化有限公司;引物ITS1:CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA;ITS4:TC CTCCGCTTATTGATATGC,引物合成于上海生工生物工程有限公司。

1.3 菌種分離

將采集的新林1號楊病葉于超凈工作臺中按下列步驟進(jìn)行菌種分離:無菌水清洗病葉3遍,75%酒精消毒2 min,無菌水漂洗3次,0.1%HgCl消毒2 min,無菌水漂洗3次,剪取病健交界處葉片組織約0.5 cm2接種至PDA固體平板培養(yǎng)基中。每個平板接種2塊,置于25℃生化培養(yǎng)箱中進(jìn)行黑暗培養(yǎng)。待菌落直徑為2 cm左右時,挑取菌落邊緣菌絲進(jìn)行轉(zhuǎn)接、純化,將純化后的菌株命名為XL-1,于4℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.4 致病性測定

根據(jù)柯赫氏法則,采用離體葉片接種,以菌絲塊作為接種材料進(jìn)行致病性測定。4℃冰箱中保存的菌株接種于PDA平板培養(yǎng)基上,25℃培養(yǎng)7 d,用直徑為6 mm的打孔器在菌落邊緣打取菌餅。取健康的新林1號楊中上部葉片,葉柄末端用浸水脫脂棉包裹,葉片表面用75%酒精擦拭消毒后,將菌餅放置在主脈兩側(cè)葉片上,每側(cè)放置一個菌餅,對照處理接種PDA培養(yǎng)基塊,將處理后的葉片放置在直徑為11 cm的培養(yǎng)皿中,培養(yǎng)皿底部鋪2層濾紙,滴1 mL無菌水進(jìn)行保濕,25℃條件下培養(yǎng),觀察葉片發(fā)病情況。葉片發(fā)病后,從發(fā)病部位進(jìn)行再次分離,通過柯赫氏法則以驗(yàn)證分離菌株是否為病原菌。

1.5 病原菌分子生物學(xué)鑒定

4℃冰箱中保存的菌株接種于PDA平板培養(yǎng)基上,25℃培養(yǎng)7 d,無菌刀片刮取平板菌絲,經(jīng)液氮速凍后進(jìn)行研磨,用TIANGEN快捷型植物基因組DNA提取系統(tǒng)(非離心柱型)進(jìn)行DNA提取,具體操作步驟按照說明書進(jìn)行。提取后的DNA用TE Buffer溶解于-20℃保存?zhèn)溆?,并利用DHS NanoPro測定DNA濃度。以DNA為模板進(jìn)行ITS-PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系及應(yīng)程序見馮連榮[3]。反應(yīng)結(jié)束后,擴(kuò)增產(chǎn)物送至TaKaRa(大連)生物工程有限公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果登錄NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)進(jìn)行序列BLAST比對分析。下載相似性序列,用Clustalw進(jìn)行多序列比對,并輔以人工修正,分析時所有參數(shù)均為軟件默認(rèn)值。利用MEGA7.0軟件采用N-J法構(gòu)建進(jìn)化樹,進(jìn)行系統(tǒng)發(fā)育分析,構(gòu)建發(fā)育樹時進(jìn)行自舉檢驗(yàn),重復(fù)抽樣1 000次。

2 結(jié)果與分析

2.1 純種菌絲的獲得

經(jīng)過組織分離及轉(zhuǎn)接,獲得了XL-1純種菌絲,菌落特征見圖1,菌落平展邊緣整齊,菌絲絮狀、灰白色,后期變?yōu)榛液稚?,不產(chǎn)生色素。菌絲生長速度較快,5 d左右可以長滿整個平板。

圖1 XL-1菌落正、反特征Fig.1 Positive and negative characteristics of XL-1 colony

2.2 XL-1致病性測定

致病性測定結(jié)果(圖2)顯示,接種PDA培養(yǎng)基的對照組未產(chǎn)生病斑,接種XL-1菌餅的處理組發(fā)病,隨著接種時間的延長病斑面積逐漸增大:接種后第2天,菌餅邊緣長出菌絲,菌餅覆蓋處葉片組織出現(xiàn)小病斑,病斑直徑約1 cm;第3天病斑面積增大且菌絲透過葉片生長;第5天葉片表面出現(xiàn)大量霉層,第6天霉層布滿整個葉片。對病斑組織再次進(jìn)行病原菌分離獲得相同菌絲,證明新林1號楊葉部病斑由XL-1引起。

圖2 XL-1致病性測定Fig.2 Determination of pathogenicity of XL-1

2.3 XL-1分子生物學(xué)鑒定

提取XL-1菌絲DNA,利用DHS NanoPro測定DNA濃度為68.953 ng·μL-1,A260/A280為1.96。DNA經(jīng)0.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測,條帶單一明亮(圖3A),證明DNA質(zhì)量較好。以DNA為模板,ITS1/ITS4為引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增,結(jié)果獲得大小約為500 bp的目的條帶(圖3B)。PCR產(chǎn)物送至TaKaRa(大連)生物工程有限公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果顯示目的片段

行BLAST序列比對,獲得的相似序列均為Botrytis屬真菌,大多數(shù)為B.cinerea和B.fabae,其中與登陸號為MH212236.1的B.cinerea覆蓋度為100%,相似性為100%。下載排名靠前的B.cinerea和B.fabae序列,利用MEGA7.0構(gòu)建進(jìn)化樹(圖4),XL-1與B.cinerea聚為一支,親緣關(guān)系較近。另外通過GenBnak下載Botrytis屬標(biāo)準(zhǔn)菌株ITS序列,進(jìn)行系統(tǒng)進(jìn)化樹構(gòu)建(圖5),結(jié)果顯示XL-1同樣與B.cinerea聚為一支,故將XL-1鑒定為B.cinerea(灰葡萄孢)?;移咸焰邽榻z孢綱(Hyphomycetes)叢梗孢目(Miniliales)叢梗孢科(Moniliaceae)葡萄孢屬(Botrytis)。

3 結(jié)論與討論

圖3 DNA電泳結(jié)果Fig.3 Results of DNA electrophoresis

圖4 基于ITS序列N-J法構(gòu)建進(jìn)化樹Fig.4 Construction of phylogenetic tree based on ITS gene using N-J method

圖5 基于N-J法構(gòu)建XL-1與標(biāo)準(zhǔn)菌株的系統(tǒng)發(fā)育樹Fig.5 Construction of phylogenetic tree of XL-1 and standard strains based on N-J method

楊樹是遼寧省平原地區(qū)的主要造林樹種,在防護(hù)林和用材林的建設(shè)中均占有重要地位,具有防風(fēng)固沙、水土保持、農(nóng)田防護(hù)、固碳釋氧、凈化空氣等作用,同時還承擔(dān)著產(chǎn)業(yè)建設(shè)的重任,為社會提供大量木材,解決木材短缺、供給不足的問題[1]。在楊樹生長過程中,經(jīng)常會受到各種病原菌的侵染,其中葉部病害較為常見,如楊樹黑斑病[4]、楊葉銹病[5-6]、楊樹葉枯病[7-8]等,目前關(guān)于楊樹灰霉病的研究報道還比較少。楊樹灰霉病主要危害楊樹的莖和葉,在新植楊樹中發(fā)生較重,影響楊樹生長,降低了造林成活率,嚴(yán)重時可以導(dǎo)致楊樹大面積死亡[9-10]。段冰冰研究表明Del/Ros基因在新疆楊(P.alba var.pyramidalis)的株系過表達(dá),可顯著提高新疆楊葉片中的丹寧、花青素、槲皮素、山奈酚以及總酚等黃酮類物質(zhì)的含量,進(jìn)一步提高了其對灰霉病的抗病能力[9]。吉海龍研究了長枝木霉(Trichoderma longibrachiatum)T05對灰霉病菌的抑菌活性,菌落對峙培養(yǎng)結(jié)果顯示T05對灰霉病菌抑菌率達(dá)88.4%,其產(chǎn)生的揮發(fā)性物質(zhì)對灰霉病菌抑菌率達(dá)91.9%[10]。

灰霉菌又稱灰葡萄孢菌,是一種廣寄主性的、能夠引起多種植物幼苗、果實(shí)及儲藏器官的猝倒、落葉、花腐、爛果及爛窖的病源菌[11]。潮濕時病部表層產(chǎn)生大量的灰色霉層(分生孢子梗和分生孢子),稱為灰霉病?;移咸焰弑徽J(rèn)為是新鮮水果蔬菜中最重要的采后病原菌之一,也被認(rèn)為是全球范圍第二重要的植物病原菌[12-13]。它對各種重要經(jīng)濟(jì)作物的災(zāi)難性影響,造成全球每年100億~1000億美元不等的經(jīng)濟(jì)損失[14]。在葡萄(Vitis viniferax×V.labrusca'Shuijing')[15]、番茄(Solanumlyco persicum)[16]、草莓(Fragaria×ananassa)[17]、人參(Panax ginseng)[18]、煙草(Nicotiana tabacum)[19]、藍(lán)莓(Vaccinium spp.)[20]、浙貝母(Fritillaria thunbergii)[21]中均有報道。對于灰霉病菌的鑒定,一般基于形態(tài)特征并結(jié)合分子生物學(xué)鑒定來完成。形態(tài)特征一般從菌落形態(tài)、菌絲體、分生孢子及分生孢子梗等方面進(jìn)行初步鑒定;分子生物技術(shù)鑒定應(yīng)用最為廣泛的是rDNA-ITS序列分析,如應(yīng)用rDNA-ITS序列分析對蝴 蝶 蘭(Phalaenopsis amabilis)[22]、香 蔥(Allium ascalonicum)[23]、煙草[24]、番茄[25]等灰霉病的鑒定。在真核生物基因組的編碼核糖體基因中有5SrDNA、5.8SrDNA、18SrDNA和28SrDNA這樣4種,其中18S、5.8S和28SrDNA基因組成一個轉(zhuǎn)錄單元,其中的間隔區(qū)為內(nèi)轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)(internal transcribed spacer,ITS),包括ITS1及ITS2兩部分[26]。ITS序列通過與GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST檢索比對,序列相似性為95%~99%,可以鑒別為相同屬;序列相似性≥99%,可以鑒別為相同種[27]。隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展,越來越多的基因被應(yīng)用于病原真菌的鑒定,如甘油醛-3-磷酸(Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,gpd)、組蛋白(Histone)、翻譯延伸因子1-α(Elongation factor,EF1-α)、微管蛋白(β-tubulin,BT1和BT2)、幾丁質(zhì)合成酶(chitin synthase,CHS)等[28-29]。

本研究從新林1號楊1年生扦插苗上分離獲得一種引起葉部病害的病原菌XL-1,結(jié)合病原菌菌落形態(tài)特征和rDNA-ITS序列分析對病原菌種屬地位進(jìn)行了鑒定,其中與登陸號為MH212236.1的B.cinerea覆蓋度為100%,相似性為100%,系統(tǒng)發(fā)育分析與B.cinerea聚為一支,雖然未進(jìn)行多基因聯(lián)合分析,從比對結(jié)果和系統(tǒng)發(fā)育分析可以確定分離病原菌為灰葡萄孢(B.cinerea)。該病原菌侵染楊樹葉片后可迅速蔓延,導(dǎo)致整個葉片發(fā)霉腐爛,嚴(yán)重影響楊樹的生長發(fā)育。下一步需要針對該病原菌的生物學(xué)特性、病原菌對不同楊樹品種的致病能力和致病機(jī)理以及防治方法等進(jìn)行深入研究,提出楊樹灰霉病綜合防治方法,以減輕其對楊樹的危害。

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