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三維魚體參數(shù)化建模

2022-02-21 04:37:00胡海濤趙銀君石敏趙國亮朱登明
關(guān)鍵詞:魚體體型剛性

胡海濤,趙銀君,石敏*,趙國亮,朱登明

(1.華北電力大學(xué)控制與計算機工程學(xué)院,北京 102206;2.中國科學(xué)院計算技術(shù)研究所前瞻研究實驗室,北京 100190)

魚類作為水產(chǎn)養(yǎng)殖中最重要的生物物種,對其進行監(jiān)測有助于提高漁業(yè)的精細化管理水平。三維魚體作為重要的量化指標,對預(yù)測魚類生長狀況[1]、估 計 魚 群 密 度[2]、分 析 魚類 種 群 結(jié) 構(gòu)[3]具 有 重 要意義。

近年來,隨著三維重建技術(shù)的發(fā)展,重建范圍不斷擴大,使得水下三維建模成為可能。水下三維建模主要分為主動式重建和被動式重建。主動式重建,通過發(fā)射激光雷達[4]、結(jié)構(gòu)光[5]等重建水底環(huán)境;被動式重建,通過拍攝水底多視角圖像重建水底環(huán)境[6]。但這兩種方法都無法實現(xiàn)對游動魚類的三維重建。在空中雖可利用三維掃描儀[7]、基于雙目視覺的三維重建[8]等方法獲取魚類三維模型,但耗時費力,成本高,得到的三維模型精度不高,且不能快速批量采集,無法對基于三維魚體數(shù)據(jù)驅(qū)動的自動化研究工作提供大量數(shù)據(jù)。

基于真實三維注冊數(shù)據(jù)的三維參數(shù)化建模已應(yīng)用于多個領(lǐng)域,主要有人體參數(shù)化建模[9-12]、基于真實的人體掃描注冊數(shù)據(jù)、統(tǒng)計分析人體體型分布空間、構(gòu)建人體體型參數(shù)化表示模型、通過控制相關(guān)權(quán)參數(shù)生成豐富的三維人體模型等。

目前尚未見三維魚體的參數(shù)化表示模型,為此,本文提出了一種三維魚體參數(shù)化建模方法。主要貢獻有:掃描儀采集真實三維魚體數(shù)據(jù),對其進行網(wǎng)格注冊,構(gòu)建拓撲結(jié)構(gòu)一致的三維魚體數(shù)據(jù)集,在此基礎(chǔ)上,基于主成分分析法研究三維魚體參數(shù)化建模方法,構(gòu)建三維魚體參數(shù)化表示模型,進而快速生成大量三維魚體模型,解決了三維魚體數(shù)據(jù)獲取困難的問題。

1 相關(guān)工作

1.1 三維數(shù)據(jù)注冊

對三維數(shù)據(jù)注冊的研究已有多年,其本質(zhì)是對標準網(wǎng)格模板進行平移、旋轉(zhuǎn)、變形等操作,使得標準模板能表征所掃描的目標模型。其可分為剛性注冊及在此基礎(chǔ)上的非剛性注冊,剛性注冊只是將標準模板進行平移和旋轉(zhuǎn)操作,非剛性注冊還會使模板網(wǎng)格發(fā)生變形。BESL等[13]提出的最近迭代點(iterative closest point,ICP)算法,通過貪心算法迭代求解2個點云模型之間的對應(yīng)點,然后用最小二乘法求解得到兩模型之間的旋轉(zhuǎn)、平移參數(shù),實現(xiàn)2個點 云模型的剛性注 冊。ALLEN等[9]提 出的變形標準模板網(wǎng)格使其逼近真實掃描數(shù)據(jù)的方法,通過構(gòu)建拓撲結(jié)構(gòu)一致的網(wǎng)格數(shù)據(jù)集,實現(xiàn)非剛性注冊。AMBERG等[14]在ALLEN等[9]工作的基礎(chǔ)上提出了非剛性最近迭代點(non-rigid ICP,NRICP)算法,通過迭代尋找最近點實現(xiàn)非剛性注冊,得到了較好的注冊效果。LI等[15]和YAO等[16]提出的非剛性注冊方法均用于解決最小化NRICP中的注冊代價函數(shù),前者通過重加權(quán)提高變換矩陣的稀疏性,降低計算量,后者則用優(yōu)化-最小化(majorization-minimization,MM)算法將每次迭代簡化為L-BFGS的最小二乘問題,2種方法在注冊精度和計算速度上均有所提升。

1.2 參數(shù)化建模

三維魚類參數(shù)化建模方法多種多樣.涂曉媛等[17]最早提出“人工魚”模型,用生物力學(xué)方法建模人工魚的物理和生理結(jié)構(gòu),設(shè)計了“質(zhì)點-彈簧-阻尼”魚體模型,其主要由23個“質(zhì)點”和91個“彈簧-阻尼”單元組成。此外,還有三維仿生機器魚模型[18-20],將魚體作為剛性多級連桿進行建模,但上述方法均不是對真實三維魚體的建模,構(gòu)建的三維魚體模型主要用于水下環(huán)境作業(yè)、軍事偵察、考古等,無法用于對魚體體型的研究。

目前尚未發(fā)現(xiàn)有基于真實魚體掃描數(shù)據(jù)進行參數(shù)化建模的研究工作。但在人體建模領(lǐng)域,基于真實的三維人體注冊數(shù)據(jù)集,ALLEN等[9]采用主成分分析法進行了人體體型參數(shù)化建模,通過調(diào)整身高、體重等參數(shù)生成相應(yīng)的三維人體模型。之后出現(xiàn)了許多用相同方法進行人體體型參數(shù)化建模的工作,如 經(jīng) 典 的 人 體 參 數(shù) 化SCAPE模 型[10]、SMPL模型[11]。SCAPE模型在參數(shù)化人體姿勢的基礎(chǔ)上也對人體體型進行了參數(shù)化,但無法直接通過修改參數(shù)生成相應(yīng)的體型,參數(shù)化控制不直接;德國馬普所的SMPL模型提煉了人體的10個體型參數(shù)和72個姿態(tài)參數(shù),實現(xiàn)了給定參數(shù)即可生成對應(yīng)的人體,但由于對參數(shù)缺乏約束,有時會生成不自然的人體,為此,2020年,馬普所提出了STAR模型[12],在改進上述問題的同時也減少了參數(shù)量,是一個輕量級的人體參數(shù)化表示模型。

本文的三維魚體參數(shù)化方法是受ALLEN等[9]的工作和SMPL模型[11]的啟發(fā),通過控制相關(guān)參數(shù),直接快速生成豐富的三維魚體模型。

2 本文方法

提出了一種基于主成分分析的魚體參數(shù)化建模方法,主要包括魚體掃描數(shù)據(jù)注冊和魚體體型參數(shù)化建模兩部分,如圖1所示。

圖1 三維魚體參數(shù)化建模方法Fig.1 Parametric modeling method of 3D fish body

2.1 魚體標準模板構(gòu)建

掃描儀采集的原始三維魚體數(shù)據(jù),網(wǎng)格頂點數(shù)量龐大,拓撲結(jié)構(gòu)雜亂,無法批量放入計算機進行統(tǒng)計分析和參數(shù)化建模,需對其進行網(wǎng)格拓撲同構(gòu)處理,使網(wǎng)格模型具有相同的頂點數(shù)以及點之間相同的連接結(jié)構(gòu)。通過標準模板變形,令變形后的模板能表征原始掃描數(shù)據(jù),實現(xiàn)對原始掃描數(shù)據(jù)的注冊,得到拓撲結(jié)構(gòu)一致的三維魚體注冊數(shù)據(jù)。

采集魚體多視角圖像,由專業(yè)建模師在三維建模軟件3ds Max中進行三維魚體標準網(wǎng)格模板建模,見圖2。

圖2 三維魚體標準模板構(gòu)建Fig.2 Standard template construction of 3D fish body

上述標準魚體模板定義為S=(H,Ε),其中,H為由m個頂點構(gòu)成的頂點集,Ε為由n條邊構(gòu)成的邊集。

2.2 魚體網(wǎng)格注冊

用標準模板對原始掃描數(shù)據(jù)進行注冊,以原始掃描魚體數(shù)據(jù)為約束變形標準魚體模板,令其逼近原始掃描魚體,使變形后的模板能表征原始掃描數(shù)據(jù)。由于所有原始掃描數(shù)據(jù)的注冊均基于同一標準魚體模板,因此注冊得到的數(shù)據(jù)具有一致的拓撲結(jié)構(gòu)。本文采用剛性注冊和非剛性注冊相結(jié)合的魚體網(wǎng)格注冊方法,用剛性注冊算法為非剛性注冊算法提供初始條件。

2.2.1 剛性注冊

網(wǎng)格注冊時對標準模板和原始掃描數(shù)據(jù)的初始值較敏感,為此設(shè)計了魚體剛性注冊算法,以變換兩者之間的初始位置和大小。以采集的原始三維魚體為坐標原點,因它們處于不同的坐標系,需將掃描數(shù)據(jù)變換到標準模板坐標系下,使掃描數(shù)據(jù)和模板的位置盡量重合;因采集的不同生長周期的魚體體型差異明顯,需縮放標準模板,令每個三維魚體的掃描數(shù)據(jù)均與一個大小相仿的模板模型對應(yīng)。因此,魚體剛性注冊包含坐標變換和縮放變換。

通過坐標變換將掃描模型變換至模板空間下,目標函數(shù)定義為

其中,Told為原始掃描模型,R和t分別為掃描數(shù)據(jù)坐標系和模板坐標系之間的旋轉(zhuǎn)和平移參數(shù),Tnew為變換到模板坐標空間的掃描模型。

縮放變換是將模板模型剛性地縮放至接近掃描模型,目標函數(shù)定義為

其中,Sold為標準模板,s為模板和掃描數(shù)據(jù)之間的縮放矩陣,Snew為縮放后的模板。

在剛性注冊時,先進行一次坐標變換,將掃描數(shù)據(jù)變換至模板坐標系下,再進行縮放變換,將模板縮放至掃描模型大小,縮放變換將導(dǎo)致模板空間位置變動,因此需再進行一次坐標變換,將掃描模型調(diào)整至模板坐標系下。剛性注冊算法步驟如下:

輸入掃描網(wǎng)格Told,標準模板Sold。

輸出坐標變換后的網(wǎng)格Tnew,縮放變換后模板的Snew。

Step1第1次坐標變換。

Step1.1求解Told和Sold2個坐標系之間的R和t。

Step1.2用式(1)將Told變換為T1new。

Step2縮放變換。

Step2.1求解T1new和Sold之間的縮放矩陣s。

Step2.2用式(2)將Sold變換為Snew。

Step3第2次坐標變換。

Step3.1求解T1new和Snew2個坐標系之間的R和t。

Step3.2用式(1)將T1new變換為Tnew。

2.2.2 非剛性注冊

通過魚體剛性注冊,在空間位置和大小上令標準模板和掃描模型近似對齊,但作為柔性物體的魚類,魚體之間存在差異,因此,還需進行魚體非剛性注冊,通過調(diào)整模板使其逼近掃描模型,令調(diào)整后的模板能最大限度地表征掃描魚體模型體型。

用非剛性ICP算法進行魚體模型非剛性注冊,非剛性注冊算法思想如圖3所示,其中,S表示標準模板,S′表示變形后的模板,T表示掃描模型。非剛性ICP算法,即最小化S′和T之間的距離,使S′能夠表征T。

圖3 非剛性ICP算法思想Fig.3 Non-rigid ICP algorithm idea

非剛性ICP算法的目標函數(shù)由數(shù)據(jù)項誤差Ed、平滑項誤差Es和特征點誤差El組成:

其中,X為模板頂點的變換矩陣,α和β分別為Es和El的影響因子。

數(shù)據(jù)項誤差Ed表征變形后的模板魚體模型與掃描魚體三維網(wǎng)格模型之間網(wǎng)格頂點的接近程度,具體表示為

其中,vi表示模板模型上的第i個頂點,Xi表示對第i個頂點進行的變換,ui表示vi在掃描模型上對應(yīng)的第i個頂點,wi表示vi頂點的變換對整體的影響權(quán)重。式(4)第2個等式為數(shù)據(jù)項誤差在所有模型數(shù)據(jù)中的表示。

平滑項誤差Es約束變形過程中相鄰頂點的仿射變換矩陣,令模板平滑形變,具體表示為

其中,ε為模板S中所有邊的集合,G為權(quán)重矩陣,M表征點之間的連接關(guān)系,M的行表示三角形的邊,列數(shù)表示頂點,當?shù)趓條邊連接第i個頂點和第j個頂點(i<j)時,Mri的元素為-1,同時Mrj中的元素為1,其他元素為0,符號?表示求解M和G之間的Kronecker積,下標F表示范數(shù)。

特征點誤差El表征變形后模板與掃描模型上對應(yīng)特征點之間的距離,相當于稀疏的數(shù)據(jù)誤差項,具體表示為

其中,L={(v1,l1),(v2,l2),…,(vi,li)}為特征點。

綜上,目標函數(shù)完整的二次損失函數(shù)可表示為

令該二次損失函數(shù)的導(dǎo)數(shù)為0,直接求解,當X=(ATA)-1ATB時,損失函數(shù)值最小。

由于特征點需要手動標記,而采集的魚體掃描數(shù)據(jù)和模板數(shù)據(jù)頂點數(shù)量又較多,只有標記了大量標記點的數(shù)據(jù)才有較好的注冊效果,但手動標記大量頂點造成的誤差將影響魚體模板模型變形的準確性?;跍蚀_性和配準效率考慮,因在魚體非剛性注冊時沒有使用特征點誤差El,故設(shè)置β=0,則在魚體非剛性注冊中,目標函數(shù)可簡化為

在每輪迭代中,α依次取50,20,2,0.8,0.5,0.35,0.2。

2.3 魚體參數(shù)化建模

參數(shù)化建模又稱變量建模,通過統(tǒng)計分析三維注冊數(shù)據(jù)集,用少量變量表征數(shù)據(jù)集中模型的三維空間分布,由控制變量生成豐富的三維模型。主成分分析(principal component analysis,PCA)作為一種最廣泛使用的數(shù)據(jù)降維算法,其主要思想是將n維特征映射至k維,稱此k維全新的正交特征為主成分。k維主成分保留了原n維數(shù)據(jù)中絕大部分維度特征,實現(xiàn)以少數(shù)維度表示高維空間。本文用PCA法進行魚體三維模型參數(shù)化建模,實現(xiàn)用低維度參數(shù)空間表示高維的三維魚體網(wǎng)格數(shù)據(jù)。

魚體體型空間的PCA參數(shù)化可表示為

其中,SE∈R3N表示三維魚體的平均體型,D∈R3N×k表示由k個主成分分量構(gòu)成的主成分矩陣,S∈R3N表示參數(shù)控制生成的具有N個頂點的三維魚體網(wǎng)格模型,ωs∈Rk表示k個可調(diào)控參數(shù)。

各參數(shù)的具體求解過程如下:

魚體模型的體型均值向量SE∈R3N:

其中,K為三維魚體數(shù)據(jù)集中的魚體網(wǎng)格模型數(shù),Si為第i個魚體的三維網(wǎng)格向量。

對所有魚體數(shù)據(jù)去均值,得到三維魚體體型的變化空間U:

其中,Ui∈R3N為數(shù)據(jù)集中第i個魚體去均值后的向量表示,U∈R3N×K為由數(shù)據(jù)集中所有K個魚體去均值后向量Ui構(gòu)成的高維矩陣。

分解U求解其特征向量,取前k個特征向量作為主成分,此k維主成分能表征U空間的主要特征:

用一組權(quán)參數(shù)ws={w1,w2,…,wk}表示魚體模型S:

通過設(shè)置權(quán)參數(shù)ws可合成新的魚體模型,ws即為參數(shù)化構(gòu)造得到的可控制的權(quán)參數(shù)。

3 實驗與分析

草魚是典型的紡錘魚型,因其體型特征變化明顯,故選擇草魚作為實驗魚。采集草魚的多視角圖像,由專業(yè)建模師給出有粒度劃分的拓撲結(jié)構(gòu)清晰的三維魚體標準模板,該標準模板共有9 846個頂點,19 688個三角面片,如圖4所示。

圖4 標準魚體模板Fig.4 Standard fish template

搭建掃描平臺采集草魚的全包圍數(shù)據(jù),將草魚掛起,固定魚鰭使其呈張開狀態(tài),用手持式激光掃描儀掃描,如圖5所示。共采集11條處于不同生長期的草魚掃描數(shù)據(jù),每個三維魚體掃描數(shù)據(jù)的三角面片數(shù)均超30萬,其中含大量冗余數(shù)據(jù)。為提高注冊效率,用經(jīng)典的網(wǎng)格簡化算法:二次誤差量(quadric error metrics,QEM)[21]法簡化原始掃描數(shù)據(jù),將三維魚體掃描數(shù)據(jù)降采樣至近似標準魚體模板的頂點數(shù)和三角面片數(shù)。

圖5 草魚掃描數(shù)據(jù)采集Fig.5 Grass carp scan data collection

3.1 魚類剛性注冊實驗

對降采樣后的11條草魚的掃描數(shù)據(jù)進行剛性注冊實驗。經(jīng)坐標變換,將草魚的掃描數(shù)據(jù)變換至標準模板坐標空間;對標準模板進行縮放變換,使采集的所有草魚數(shù)據(jù)均對應(yīng)一個大小相近的模板。

圖6給出了4組草魚體剛性注冊的實驗結(jié)果。其中,第1行為剛性注冊前的模板模型(淺色)和掃描模型(深色),分別位于2個坐標空間,且大小差異明顯;第2行和第3行為剛性注冊后的效果,模板和掃描模型已調(diào)整至同一坐標空間,標準模板調(diào)整至近似掃描模型大小。

圖6 剛性注冊實驗結(jié)果Fig.6 Results of rigid registration experiment

3.2 魚類非剛性注冊實驗

基于剛性注冊結(jié)果進行非剛性注冊實驗,計算機配置為Quad-Core Intel Core i5 CPU@2.00 GHz,內(nèi)存為16 GB,操作系統(tǒng)為macOS。圖7給出了4組魚體非剛性注冊的實驗結(jié)果。以上述剛性注冊結(jié)果作為非剛性注冊的輸入,得到的變形模板模型(淺色)高度逼近掃描模型(深色)。

圖7 非剛性注冊實驗結(jié)果Fig.7 Results of non-rigid registration experiment

進一步,對變形模板的變形精度進行定量分析,表1記錄了11條草魚掃描數(shù)據(jù)非剛性注冊后變形模板與掃描數(shù)據(jù)之間的均方根誤差以及注冊所需配準時間,平均均方根誤差為0.691 3 mm,平均配準時間為45.61 s,注冊精度和配準時間均在可接受范圍,定量分析表明,變形后的魚體模板能很好地表征真實掃描魚體體型。

表1 魚體非剛性注冊均方根誤差及配準時間Table 1 Root mean square error of fish body non-rigid registration and registration time

由于標準魚體模板有9 846個頂點、19 688個三角面片,在最終構(gòu)建的三維魚類注冊數(shù)據(jù)庫中,11個魚體模型的頂點數(shù)均為9 846,三角面片數(shù)均為19 688。

3.3 魚體體型參數(shù)化實驗

對上述非剛性注冊構(gòu)建的三維魚體拓撲數(shù)據(jù)集進行了魚體參數(shù)化建模實驗,圖8為生成的三維魚體平均體型。經(jīng)多次實驗發(fā)現(xiàn),當k=4,權(quán)參數(shù)ws={w1,w2,w3,w4}施加在平均魚體體型上時,魚體體型會發(fā)生較大變化,而當k>5時,改變權(quán)參數(shù),魚體體型變化不明顯,故取k=4,即采用4維主成分進行定性與定量分析,平均魚體體型默認的權(quán)參數(shù)為ws={1.000,1.000,1.000,1.000}。

圖8 三維魚體平均體型Fig.8 Three-dimensional mean body shape of fish

圖9給出了魚體定量分析示意,綠線為魚體體長,紅線為體高,藍線為體寬,通過計算體長、體高和體寬,定量分析魚體模型的變化。

圖9 魚體定量分析示意Fig.9 Schematic diagram of quantitative analysis of fish

圖10為改變權(quán)參數(shù)w1時生成的三維魚體模型的側(cè)視圖和俯視圖,第1列為w1=0.851時生成的魚體體型,第2列為w1=1.000時生成的魚體體型,第3列為w1=1.135時生成的魚體體型,可以發(fā)現(xiàn),減小或增大w1,生成的魚體體型較標準魚體體型有所縮小或放大。表2定量分析了權(quán)參數(shù)w1對魚體體長、體高和體寬變化的影響,發(fā)現(xiàn)隨著w1的變化,魚體的體長、體高和體寬均發(fā)生了明顯變化,w1控制魚體體型的整體變化。

表2 權(quán)參數(shù)w1對魚體體型的影響Table 2 The effect of weight parameters w1 on fish body shape

圖10 三維魚體模型隨權(quán)參數(shù)w1的變化Fig.10 The three-dimensional fish model changes with the weight parameter w1

表3定量分析了通過控制w2,w3,w4中的某一參數(shù),魚體體長、體高和體寬發(fā)生的變化。分析發(fā)現(xiàn),隨著其中任一權(quán)參數(shù)的變化,魚體的體長、體高、體寬只在小范圍內(nèi)變動。因此,w2,w3,w4對魚體體型只有微調(diào)作用。

表3 權(quán)參數(shù)w2,w3,w4對魚體體型的影響Table 3 The effect of the weight parameters w2,w3,w4 on fish body shape

基于拓撲結(jié)構(gòu)一致的三維魚體數(shù)據(jù)集構(gòu)建了三維魚體參數(shù)化表示模型,通過改變不同的權(quán)參數(shù)可快速生成不同體型的三維魚體模型。權(quán)參數(shù)ws={w1,w2,w3,w4}中,第一主成分對應(yīng)的權(quán)參數(shù)w1對魚體體型的控制作用明顯,通過調(diào)節(jié)w1,生成不同體型的魚體模型;改變權(quán)參數(shù)w2,w3和w4,魚體體型變化不明顯,此3主成分對魚體模型只起微調(diào)作用,表征的是數(shù)據(jù)集中魚體的個體差異。此外,任一權(quán)參數(shù)ws不能單獨改變魚體某一維度。分析產(chǎn)生上述2種情況的原因,主要在于數(shù)據(jù)集規(guī)模小,注冊數(shù)據(jù)集中僅有11條三維魚體模型,而主成分分析法只有在數(shù)據(jù)集規(guī)模為參數(shù)量的5~10倍甚至更多時才能實現(xiàn)單維度控制以及令三維模型發(fā)生較大變化,因此在數(shù)據(jù)量較少時,只有權(quán)參數(shù)w1在生成魚體三維模型時起決定性作用。

4 結(jié)論

由于水底環(huán)境復(fù)雜,三維魚體模型獲取較困難,本文基于主成分分析法對三維魚體參數(shù)化建模方法進行了研究,構(gòu)建了三維魚體參數(shù)化表示模型,通過改變相應(yīng)的權(quán)參數(shù),可快速、方便地生成豐富的三維魚體模型,從而解決了三維魚體模型獲取困難的問題。得到的三維魚體模型可應(yīng)用于魚體三維模型重建、三維動畫等領(lǐng)域,但仍存在以下不足:

(1)由于魚鰭非常輕薄且透明,導(dǎo)致魚鰭掃描不完整。在魚體階段,因魚鰭注冊效果不佳,出現(xiàn)魚鰭三角面片法向量朝內(nèi)以及三角面片交叉的情況,有待后續(xù)重點研究。

(2)在參數(shù)化建模階段,由于注冊數(shù)據(jù)集規(guī)模較小,無法做到權(quán)參數(shù)單維度控制,造成參數(shù)設(shè)置不直觀,沒有與魚體體型特征的語義相關(guān)聯(lián)。后續(xù)可適當增加三維魚體數(shù)據(jù)的采集量,將擬合的魚體體型語義參數(shù)線性映射至參數(shù)化魚體模型權(quán)參數(shù)空間,實現(xiàn)用具有語義信息的參數(shù),如魚體的體重、體長等生成相應(yīng)大小的三維魚體模型。

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體型特別的勇士
幽默大師(2019年10期)2019-10-17 02:09:12
體型最小的貓,竟然是個恐怖的大胃王
文苑(2019年14期)2019-08-09 02:14:30
剛性兌付的法律治理
金融法苑(2018年2期)2018-12-07 00:59:52
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