生物大分子凝聚態(tài)調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)可塑性
國(guó)外學(xué)者在解析家族性直腸癌基因APC突變體功能易感性時(shí)發(fā)現(xiàn)了APC的重要調(diào)控蛋白EB1。但是,EB1如何招募眾多的APC類蛋白(人類基因組顯示約有1000種含SxIP基序蛋白)與動(dòng)態(tài)變化的β-微管蛋白結(jié)合,一直是細(xì)胞生物學(xué)、生物物理學(xué)與分子病理學(xué)未解答的問(wèn)題。對(duì)相關(guān)問(wèn)題開(kāi)展研究,中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)取得了重要突破。研究成果于北京時(shí)間12月20日發(fā)表在國(guó)際學(xué)術(shù)期刊《自然·細(xì)胞生物學(xué)》(Nature?Cell?Biology)雜志上。
科研團(tuán)隊(duì)在解析細(xì)胞分裂微管動(dòng)力學(xué)機(jī)制時(shí),于2009年發(fā)現(xiàn)與克隆了一個(gè)新穎的EB1結(jié)合蛋白TIP150。TIP150含有典型EB1結(jié)合蛋白基序SxIP,負(fù)責(zé)招募微管解聚酶MCAK,在動(dòng)態(tài)組裝微管的正末端形成催化區(qū)室。在此基礎(chǔ)上,團(tuán)隊(duì)利用活細(xì)胞光敏定位超高分辨顯微成像與熒光蛋白互補(bǔ)策略,發(fā)現(xiàn)了柔性區(qū)域堿性氨基酸在EB1二聚化與調(diào)控微管動(dòng)態(tài)性的功能,揭示了EB1第66位賴氨酸動(dòng)態(tài)巴豆?;揎椗c微管結(jié)合的動(dòng)態(tài)調(diào)控機(jī)制,及其對(duì)細(xì)胞分裂紡錘體定向穩(wěn)定性維系的作用機(jī)制。
研究人員發(fā)現(xiàn)了EB1蛋白在活細(xì)胞動(dòng)態(tài)微管追蹤過(guò)程的液滴表征,利用基因編輯、物理化學(xué)模擬堿性氨基酸的豐度與間隔,并結(jié)合超高分辨成像,揭示了EB1蛋白的相分離特征與凝聚態(tài)物質(zhì)基礎(chǔ),解析了相分離驅(qū)動(dòng)EB1蛋白的微管正端追蹤功能。至此,團(tuán)隊(duì)闡明了EB1蛋白相分離調(diào)控紡錘體微管可塑性的物理化學(xué)機(jī)制,向解析生物大分子凝聚態(tài)調(diào)控細(xì)胞命運(yùn)可塑性理論研究邁出了重要一步。.
全球林棲脊椎動(dòng)物滅絕債務(wù)始于第二次工業(yè)革命
中國(guó)科研人員用歷史證據(jù)表明全球林棲脊椎動(dòng)物的滅絕債務(wù)始于19世紀(jì)中葉,即第二次工業(yè)革命伊始。相關(guān)科研成果于近日發(fā)布于生物學(xué)期刊《通信生物學(xué)》(Communications?Biology)。
據(jù)了解,滅絕債務(wù)是指人類破壞生態(tài)系統(tǒng)和導(dǎo)致生活在生態(tài)系統(tǒng)內(nèi)的物種的滅亡之間存在的幾十年甚至幾個(gè)世紀(jì)的延遲。由于無(wú)法確定物種滅絕債務(wù)的信號(hào)有多強(qiáng),以及這些債務(wù)是何時(shí)開(kāi)始的,所以尚不清楚全球已建立的保護(hù)地是否對(duì)緩解物種滅絕債務(wù)的累積起到積極作用。
為高效開(kāi)展生物多樣性保護(hù)工作,中國(guó)科研人員通過(guò)匯編迄今為止最全面的生物、自然地理和生態(tài)數(shù)據(jù)集,揭示了第二次工業(yè)革命的開(kāi)始是全球林棲脊椎動(dòng)物滅絕債務(wù)已知最早的信號(hào),表明與人類活動(dòng)有關(guān)的生境變化開(kāi)始帶來(lái)延遲的生物多樣性損失。更重要的是,全球保護(hù)地對(duì)林棲脊椎動(dòng)物滅絕債務(wù)積累的緩解作用并不像對(duì)減緩森林覆蓋率那樣立竿見(jiàn)影,而是具有明顯的時(shí)間滯后效應(yīng)。這一現(xiàn)象對(duì)于棲息在泰加林和溫帶針葉林中的脊椎動(dòng)物類群尤為明顯。這表明過(guò)去兩個(gè)世紀(jì)在全球范圍內(nèi)已建保護(hù)地仍需至少幾十年時(shí)間來(lái)有效地減緩生物多樣性喪失。
由于林棲脊椎動(dòng)物豐富度和森林棲息地的非平衡態(tài)仍在繼續(xù)發(fā)生,因此,應(yīng)當(dāng)積極采取預(yù)防措施,在促進(jìn)森林恢復(fù)、保護(hù)區(qū)建設(shè)和生物多樣性保護(hù)策略之間尋找良好的平衡點(diǎn),以減少為全球林棲脊椎動(dòng)物債務(wù)累積所支付的高額代價(jià)。
我國(guó)首艘超深水科考鉆探船實(shí)現(xiàn)主船體貫通
12月18日,由我國(guó)自主設(shè)計(jì)建造的首艘面向深海萬(wàn)米鉆探的超深水科考船——大洋鉆探船,在廣州市南沙區(qū)實(shí)現(xiàn)主船體貫通,即將下水,標(biāo)志著我國(guó)深海探測(cè)領(lǐng)域重大裝備建設(shè)邁出關(guān)鍵一步。
大洋鉆探船是我國(guó)首艘超深水科考鉆探船,隸屬于自然資源部中國(guó)地質(zhì)調(diào)查局,設(shè)計(jì)排水量達(dá)4.2萬(wàn)噸,具備全球海域無(wú)限航區(qū)作業(yè)能力和海域超過(guò)1萬(wàn)米的鉆探能力。
作為支撐海洋強(qiáng)國(guó)建設(shè)的“國(guó)之重器”,大洋鉆探船的設(shè)計(jì)和建造,聚焦解決地球深部重大資源環(huán)境科學(xué)問(wèn)題,具有油氣鉆探和大洋科學(xué)鉆探兩大作業(yè)模式,兼具隔水管和無(wú)隔水管鉆探作業(yè)方式。此外,這個(gè)鉆探船擬配置十大類別先進(jìn)的船載設(shè)備,形成涵蓋海洋研究全領(lǐng)域的九大實(shí)驗(yàn)室,并首次配建國(guó)際一流標(biāo)準(zhǔn)的古地磁和超凈實(shí)驗(yàn)室,總體裝備和綜合作業(yè)能力處于國(guó)際領(lǐng)先水平。
后續(xù),大洋鉆探船將開(kāi)展上建區(qū)域搭載、設(shè)備安裝調(diào)試、碼頭試驗(yàn)等工作,預(yù)計(jì)于2024年全面建成。鉆探船建成后主要承擔(dān)國(guó)家重大科技項(xiàng)目和國(guó)際大科學(xué)計(jì)劃中的大洋科學(xué)鉆探任務(wù)。
決定種子活力的表觀遺傳調(diào)控機(jī)制被揭示
產(chǎn)生高活力的種子在環(huán)境條件合適時(shí)迅速萌發(fā)并發(fā)育產(chǎn)生健壯的幼苗是高等植物繁衍的關(guān)鍵。然而,目前尚不清楚在種子形成時(shí),其萌發(fā)和胚后發(fā)育的能力是如何產(chǎn)生的。近日,中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)在《自然·通信》(Nature?Communications)雜志上發(fā)表研究論文,為進(jìn)一步闡釋種子活力的形成機(jī)制提供了基礎(chǔ)。
通過(guò)對(duì)H3.3完全敲除的擬南芥突變體研究發(fā)現(xiàn),這個(gè)突變體能夠正常產(chǎn)生成熟的種子,且其形態(tài)和種子儲(chǔ)藏蛋白等指標(biāo)均與野生型一致。然而H3.3突變體種子卻無(wú)法正常萌發(fā),抑或是少數(shù)萌發(fā)的種子也在萌發(fā)后立即停止發(fā)育。分析H3.3在種子染色質(zhì)上的分布發(fā)現(xiàn)其在成熟種子中具有特異的基因5'端/啟動(dòng)子區(qū)和基因3'端均富集的分布模式,而在營(yíng)養(yǎng)組織如幼苗中H3.3僅在基因3'端富集。H3.3對(duì)于成熟種子中染色質(zhì)開(kāi)放性的形成至關(guān)重要,其促進(jìn)基因5'端/啟動(dòng)子區(qū)的開(kāi)放,從而使種子在萌發(fā)時(shí)感知環(huán)境及胚后發(fā)育的基因能夠正常表達(dá)。此外,H3.3卻在基因3'端抑制染色質(zhì)的開(kāi)放性和基因上的異常轉(zhuǎn)錄?(cryptic?transcription)。
上述研究揭示了植物通過(guò)組蛋白變體H3.3在種子中的特異裝配,從而“打開(kāi)”染色質(zhì)為其萌發(fā)和胚后發(fā)育做準(zhǔn)備的機(jī)制。因此,在一定程度上H3.3具有類似先鋒因子在細(xì)胞命運(yùn)調(diào)節(jié)中的作用。作為一種替代組蛋白,H3.3在很多植物細(xì)胞的分化時(shí)均發(fā)生明顯富集。因此,H3.3可能是一個(gè)植物細(xì)胞命運(yùn)決定的關(guān)鍵因子,對(duì)其作用機(jī)制的進(jìn)一步解析將有助于植物再生等重大科學(xué)問(wèn)題的探索。
世界鯧屬魚類物種多樣性和地理分布格局被揭示
近日,中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)在世界鯧科、鯧屬魚類分類及地理分布格局研究方面獲得新進(jìn)展,首次揭示世界鯧屬魚類物種多樣性和地理分布格局,相關(guān)成果發(fā)表在《海洋科學(xué)前沿》(Frontiers?in?Marine?Science)上。
鯧屬魚類廣泛分布于印度—西太平洋熱帶和溫帶海域,是世界及中國(guó)重要海洋漁業(yè)資源和經(jīng)濟(jì)魚類。中國(guó)是鯧屬漁業(yè)資源捕撈和利用大國(guó),其年捕撈量和外貿(mào)進(jìn)出口總量分別約占全球總數(shù)的75%和80%。然而,由于鯧屬物種間外部形態(tài)極其相似,物種區(qū)分缺乏重要形態(tài)鑒別特征,個(gè)別物種模式標(biāo)本丟失,導(dǎo)致依據(jù)傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)方法建立的鯧屬物種分類、地理分布及系統(tǒng)演化關(guān)系長(zhǎng)期存在較大爭(zhēng)議。因此,揭示鯧屬物種多樣性組成及地理分布格局形成與演化歷程,對(duì)未來(lái)世界及我國(guó)鯧科鯧屬漁業(yè)資源的合理開(kāi)發(fā)和可持續(xù)利用具有重要研究?jī)r(jià)值。
中國(guó)科研團(tuán)隊(duì)在前期研究基礎(chǔ)上,基于分子系統(tǒng)學(xué)和物種界定方法,整合全球1497條鯧屬線粒體序列,建立全球鯧屬線粒體序列數(shù)據(jù)集,對(duì)印度—西太平洋海域鯧屬物種分類和地理分布進(jìn)行系統(tǒng)分析,首次揭示了世界鯧屬魚類物種多樣性和地理分布格局,厘清世界鯧屬7個(gè)有效物種,即銀鯧、中國(guó)鯧、灰鯧、劉氏鯧、珍鯧、翎鯧和素鯧。研究結(jié)果表明,過(guò)去文獻(xiàn)中報(bào)道的鐮鯧應(yīng)為銀鯧的同物異名。
研究結(jié)果還顯示,鯧屬物種多樣性中心在印度—西太平洋中部,包括巽他陸架及南海周邊海域,除素鯧僅局限分布于印度洋沿海外,其余6種均在這個(gè)區(qū)域交叉分布。分化時(shí)間和生物地理重建結(jié)果表明,鯧屬魚類起源于晚中新世的印度—西太平洋中部,與印太交匯區(qū)生物多樣性中心形成時(shí)間相近,推測(cè)鯧屬起源可能與印太交匯區(qū)生物多樣性中心形成有關(guān)。
(責(zé)編:李莉)