邢婉婷 徐靜軒 齊魯楠
肝癌是全球第六大最常被診斷的癌癥,死亡率位居第四[1]。手術切除是肝癌的主要治療方法,然而術后復發(fā)率依然較高,而高復發(fā)率也是制約肝癌患者預后的主要原因。microRNA(miRNAs/miR)是長度為17~25個核苷酸的高度保守的非編碼小RNA[2]。既往研究顯示,miRNAs異常表達可通過mRNA降解和翻譯抑制參與調(diào)控基因表達、細胞分化、細胞增殖以及惡性腫瘤的侵襲和轉移等[3]。miRNA在肝癌中的作用也引起廣泛關注,miR-145-5p作為miRNA家族中重要的一員,目前也被發(fā)現(xiàn)在多種類型腫瘤中具有抗腫瘤作用,包括肝細胞癌[4-6]。但miR-145-5p在肝癌中確切的作用及其機制仍不明確。賴氨酰氧化酶(lysyl oxidase,LOX)是一種分泌的銅依賴性單胺氧化酶,可對細胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)中可溶性膠原和彈性蛋白交聯(lián)的關鍵酶步驟進行催化[7-8]。近年來越來越多的證據(jù)表明LOX在肝癌發(fā)病機制中起著關鍵作用。在肝癌組織中LOX呈高表達,且LOX過表達能導致上皮細胞-間充質(zhì)轉化(EMT),并與肝癌患者的高早期復發(fā)率和低總生存率相關[9-10]。還有研究報道,在富含腫瘤起始細胞的肝癌中,LOX過表達能通過增加血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)和增強內(nèi)皮細胞的成管能力而部分激活血管生成[11]。因此,推測miR-145-5p可能通過靶向調(diào)控上游靶基因LOX而影響肝癌進展。為此,本研究通過在肝癌細胞系SMMC-7721、SK-Hep1中探討miR-145-5p和LOX在肝癌細胞侵襲和遷移中的作用及其靶向調(diào)控機制,以期為靶向基因治療肝癌提供新思路。
收集2017年9月至2019年9月于廣西醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院肝膽外科手術切除的73例肝癌患者腫瘤組織及其相應配對的鄰近正常組織樣本,所有腫瘤組織標本均經(jīng)病理學證實為肝癌,并將切除的樣本立即置于-80℃冰箱中備用。本研究方案經(jīng)廣西醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院倫理委員會批準,患者均提供書面知情同意書。
人肝癌細胞系SMMC-7721購自上海生命科學院細胞庫,人肝癌細胞系SK-Hep1購自上海中喬新舟生物科技有限公司。miR-145-5p慢病毒載體、LOX過表達質(zhì)粒、LOX慢病毒沉默載體均由吉凱基因科技有限公司(中國上海)提供。重組Anti-LOX抗體購自英國ABCAM公司,Anti-GAPDH抗體購自北京索萊寶科技有限公司。RNA提取試劑盒Total RNA Kit購自美國OMEGA公司;逆轉錄試劑盒、microRNA反轉錄試劑盒、PCR檢測試劑盒、Takara microRNA TB Green mix均購自日本Takara公司;SDS PAGE凝膠配制試劑盒、ECL化學發(fā)光試劑盒購自北京索萊寶科技有限公司;Matrigel膠購自美國BD公司;SYBGreen染料購自德國Roche公司;LipofectamineTM3000轉染試劑購自美國Invitrogen公司;Opti-MEM無血清培養(yǎng)基、胰酶、青霉素雙抗購自上海碧云天生物技術有限公司;胎牛血清(FBS)購自美國Gibco公司。
1.2.1 細胞培養(yǎng) 人肝癌細胞SMMC-7721、SK-Hep1均培養(yǎng)于含10% FBS的完全培養(yǎng)基中,置于37℃、5% CO2飽和濕度條件下培養(yǎng)。待細胞貼壁生長至整個培養(yǎng)瓶底面積的80%~90%時進行傳代。
1.2.2 質(zhì)粒瞬時轉染 取對數(shù)生長期SMMC-7721細胞,以1×106/mL濃度接種于6孔板中。根據(jù)LipofectamineTM3000試劑盒說明書分別轉染LOX過表達質(zhì)粒(pBABE組)以及空白載體(pBABE-NC組),以不做任何處理的細胞作為空白對照組(Control組)。
1.2.3 慢病毒載體轉染 參考吉凱基因的慢病毒使用手冊進行實驗操作。取對數(shù)生長期SK-Hep1細胞,以5×104/mL濃度接種于6孔板中。實驗分組:將LOX沉默慢病毒轉染SK-Hep1細胞,記作sh組;轉染空白載體記作sh-NC組,以不做任何處理的細胞作為空白對照組(Control組)。另外分別將miR-145-5p mimics(mimics組)、mimics control(NC組)轉染SK-Hep1細胞。取對數(shù)生長期細胞SMMC-7721,以1×106/mL濃度接種于6孔板中,分別將miR-145-5p mimics(mimics組)、miR-145-5p inhibitor(inhibitor組)及其相應空白載體轉染至SMMC-7721細胞,同時設相應空白對照組。
1.2.4 共轉染 分別將miR-145-5p mimics(mimics組)、mimics control(NC組)以及LOX過表達質(zhì)粒+miR-145-5p mimics(共轉染組)轉染至SMMC-7721細胞,并按照LipofectamineTM3000試劑盒說明書進行轉染。
1.3.1 miRNA逆轉錄及qRT-PCR檢測 參照說明書操作步驟提取各組組織中的總RNA。按照Takara microRNA反轉錄試劑盒說明書步驟操作合成cDNA,加A尾和RT反應一步完成。按照Takara microRNA TB Green mix說明書進行反應。PCR反應條件:95℃變性10 min,60 ℃退火30 s、72 ℃延伸40 min,共40個循環(huán)。引物序列:miR-145-5p加尾法設計,CAGTTTTCCCAGGAATCCCTAA;U6作為內(nèi)參由Takara microRNA反轉錄試劑盒提供。用2-△△Ct法計算miR-145-5p相對表達量。
1.3.2 LOX逆轉錄及PCR檢測 按照Takara逆轉錄試劑盒說明書操作合成cDNA。熒光定量反應體系20 μL,其中 SYBGreen 10 μL,F(xiàn)orward primer 0.6 μL,Reverse primer 0.6 μL,cDNA 模板 2 μL,無酶水加至 20 μL。PCR反應條件:95℃ 10 min,95℃ 15 s,60℃ 60 s共擴增40個循環(huán)。引物序列:LOX(F)TTCTTACCCAGCCGACCAAGATA,(R)GTGTTGGCATCAAGCAGGTCA;β-Actin(F)CTGGAACGGTGAAGGTGA-CA,(R)CGGCCACATTGTGAACTTTG。用2-△△Ct法計算LOX相對表達量。
取轉染后的各組細胞,加入蛋白裂解液,4℃下以12 000 r/min離心,提取總蛋白,用BCA試劑盒檢測蛋白質(zhì)濃度,用10%SDS-PAGE分離,然后轉移至PVDF膜上。用TBST緩沖液漂洗后,室溫封閉15 min。加入LOX抗體按1∶300稀釋作為一抗,4℃孵育過夜。次日將PVDF膜置于1∶2 500稀釋的GAPDH抗體中,室溫下孵育3 h。然后采用ECL化學發(fā)光試劑盒觀察蛋白條帶。實驗重復3次。
遷移實驗:用純DMEM培養(yǎng)基重懸各組細胞(密度為500/μL)。將100 μL細胞懸液接種至24孔板Transwell小室上室中,下室加入含10%FBS的600 μL完全培養(yǎng)基作為趨化劑。每組細胞重復2個孔,做好標記,密封條包好后在37℃、5% CO2潮濕環(huán)境的細胞培養(yǎng)箱中繼續(xù)培養(yǎng)。16 h后取出,用1 mL甲醇固定30 min,0.5 mL 0.1%結晶紫染色20 min,在倒置顯微鏡下觀察并拍照,計數(shù)5個視野細胞數(shù)。實驗重復3次。侵襲實驗中預先將Matrigel基質(zhì)膠和DMEM培養(yǎng)基按照1∶8比例稀釋并包被Transwell小室上室,待其凝固后,接種細胞懸液。除培養(yǎng)時間調(diào)整為36 h外,其余操作同遷移實驗。
通過生物信息學技術TargetScan(http://www.targetscan.org/vert_72/)對差異表達的miR-145-5p的可能靶基因進行預測,利用Cluster Profiler包對預測的差異表達miR-145-5p靶基因交集進行GO功能注釋和KEGG通路分析。其中GO功能注釋富集分析包括生物過程(biological process,BP)、細胞組分(cellular component,CC)、分子功能(molecular function,MF)三個方面。對miR-145-5p可能的靶基因在以上三方面的富集結果按照從大到小排序,用GraphPad Prism 5.0繪制GO富集分析,R軟件4.0.2繪制KEGG生物通路富集分析結果的氣泡圖,采用Benjamini-Hochberg法矯正P值。
采用SPSS 22.0和GraphPad Prism 8.0對數(shù)據(jù)進行分析。計量資料以均數(shù)±標準差表示,兩組均數(shù)比較采用獨立樣本t檢驗,多組均數(shù)比較采用單因素方差分析,若組間差異有統(tǒng)計學意義,采用Bonferroni檢驗進行多重比較。以雙側P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
qRT-PCR檢測結果顯示,miR-145-5p在癌旁正常組織中的表達高于肝癌組織(4.196±2.288 vs 2.835±1.817,P<0.0001),見圖1A;LOX在肝癌組織中的表達高于癌旁組織(12.17±1.369 vs 11.26±1.556,P<0.001),見圖1B。
圖1 miR-145-5p和LOX在肝癌組織及其癌旁正常組織中的表達Fig.1 Expression of miR-145-5p and LOX in liver cancer tissues and adjacent normal tissues
用Transwell小室實驗分別檢測過表達LOX對SMMC-7721細胞侵襲、遷移能力的影響,及沉默LOX對SK-Hep1細胞侵襲、遷移能力的影響,結果顯示,與Control組和pBABE-NC組比較,pBABE組中SMMC-7721細胞侵襲和遷移個數(shù)增加(P=0.011,P<0.001),見圖2A、C;與Control組和sh-NC組比較,沉默LOX組(sh組)SK-Hep1細胞侵襲和遷移個數(shù)明顯減少(均P<0.001),見圖2B、D。說明敲低LOX能抑制肝癌細胞的侵襲、遷移能力,過表達LOX增強肝癌細胞侵襲、遷移能力。
圖2 過表達和沉默LOX對肝癌細胞遷移和侵襲能力的影響Fig.2 Effects of overexpression and silencing of LOX on migration and invasion of liver cancer cells
Transwell小室實驗檢測結果顯示,與NC組和Control組比較,轉染miR-145-5p mimics的SK-Hep1細胞侵襲和遷移細胞個數(shù)均減少(均P<0.001),見圖3A;與NC和Control組比較,轉染 miR-145-5p inhibitor組的SMMC-7721細胞侵襲和遷移細胞個數(shù)均明顯增加(均P<0.001),見圖3B。說明過表達miR-145-5p抑制了肝癌細胞SK-Hep1的侵襲和遷移能力,沉默miR-145-5p則促進了肝癌細SMMC-7721的侵襲和遷移能力。
圖3 過表達和沉默miR-145-5p對肝癌細胞遷移和侵襲能力的影響Fig.3 Effects of overexpression and silencing of miR-145-5p on migration and invasion of liver cancer cells
TargetScan 7.0數(shù)據(jù)庫分析顯示,LOX基因的3'-UTR區(qū)與miR-145-5p存在結合位點,見圖4A。Western blot檢測結果顯示,與NC組相比,轉染miR-145-5p mimics的SMMC-7721細胞中LOX的表達水平降低(P<0.001),而轉染miR-145-5p inhibitor能明顯升高LOX的蛋白表達水平(P<0.001),見圖4B;與mimics組比較,共轉染組SMMC-7721細胞中LOX蛋白表達水平顯著增加(P<0.001),見圖4C。Transwell小室實驗檢測結果顯示,與mimics組比較,共轉染組中SMMC-7721細胞遷移和侵襲數(shù)目均增加(P<0.001),見圖4D~E。說明miR-145-5p能抑制LOX蛋白表達水平,LOX過表達逆轉了miR-145-5p對SMMC-7721細胞遷移和侵襲的抑制能力。
圖4 LOX過表達可逆轉miR-145-5p對SMMC-7721細胞侵襲和遷移的抑制能力Fig.4 Overexpression of LOX reversed the inhibitory ability of miR-145-5p on migration and invasion of SMMC-7721 cells
用TargetScan獲取miR-145-5p所有靶基因,再用Cluster Profiler包進行GO功能注釋富集分析,分別從生物過程、細胞組分、分子功能三方面進行GO功能注釋富集分析(圖5A)并按照大小排序,結果顯示,miR-145-5p靶基因與小GTP酶結合、Ras GTP酶結合、蛋白絲氨酸/蘇氨酸激酶活性、GTP酶調(diào)節(jié)活性、核苷三磷酸酶調(diào)節(jié)活性、肌動蛋白結合酶激活劑活性、肌動蛋白絲結合、蛋白酪氨酸激酶活性等緊密相關。細胞組分富集分析顯示miR-145-5p的靶基因與細胞前緣、黏著斑、細胞-基底連接、細胞-細胞連接、突觸后特化作用、突觸后密度、不對稱突觸、神經(jīng)元間突觸、谷氨酸能突觸、細胞皮層等有關。生物過程富集分析發(fā)現(xiàn)miR-145-5p靶基因參與GTPase活性調(diào)節(jié)、GTPase活性正性調(diào)節(jié)、細胞連接組件、細胞形態(tài)發(fā)生調(diào)控、軸突生成、胚胎器官發(fā)育、阿米巴型細胞遷移以及細胞-基質(zhì)黏附等過程。
圖5 miR-145-5p靶基因的GO和KEGG富集分析結果Fig.5GO and KEGG enrichment analysis of miR-145-5p target genes
使用Cluster Profiler包對預測的miR-145-5p靶基因集合進行KEGG生物通路富集分析,對miR-145-5p靶基因富集的通路進行排序匯總,其中位于前10的參與信號通路包括MAPK信號通路、癌癥中的蛋白聚糖、(細胞)內(nèi)吞作用、軸突導向、癌癥中的轉錄失調(diào)、黏附連接、Rap1信號通路、耶爾森菌感染、FoxO信號通路、TGF-β信號通路。見圖5B。
腫瘤的發(fā)生發(fā)展是一個復雜的進化過程,受腫瘤前體和抗腫瘤因子共同調(diào)控[12]。既往研究顯示多種miRNAs可以通過調(diào)節(jié)靶基因的表達參與腫瘤的生物學行為,在腫瘤診斷和預后中均具有重要作用[13]。異常表達的miRNA可以作為原癌基因或腫瘤抑制基因影響多種惡性腫瘤的發(fā)展和轉移[14]。多項研究也報道了miR-145-5p在不同癌癥類型中異常表達,并顯示出抗腫瘤作用[15-16]。如在胰腺癌研究中發(fā)現(xiàn)miR-145-5p可通過靶向MUC13抑制細胞侵襲和遷移[17];在口腔鱗狀細胞癌中通過調(diào)控c-Myc和CDK6發(fā)揮抗腫瘤效應[18];在子宮內(nèi)膜癌[19]和黑色素瘤[20]也發(fā)揮了抑制細胞侵襲和遷移作用。在肝癌中,盡管有研究證實miR-145-5p表達下調(diào)[21],但其作用機制尚不清楚。LOX是一種銅依賴性單胺氧化酶,在腫瘤發(fā)生中發(fā)揮關鍵作用,近年來,越來越多的研究表明LOX家族參與了腫瘤細胞增殖、遷移、侵襲和轉移的調(diào)控,且可作為調(diào)節(jié)多種基因的轉錄因子[22]。但是,LOX在肝癌中的研究機制并不全面,為了探索miR-145-5p是否通過調(diào)控LOX而在肝癌中發(fā)揮抗腫瘤作用,本研究首先采用Transwell小室實驗檢測LOX對肝癌細胞侵襲、轉移的影響,結果發(fā)現(xiàn)過表達LOX能增強細胞侵襲和遷移能力,而沉默LOX則抑制肝癌細胞的侵襲和遷移能力;同時還發(fā)現(xiàn)在肝癌細胞中miR-145-5p具有抑制細胞侵襲、遷移能力,并且這種能力可通過上調(diào)LOX表達逆轉。為了進一步驗證兩者的關系,本研究還進行生物信息學分析,結果發(fā)現(xiàn)LOX mRNA的3'-UTR區(qū)與miR-145-5p有結合位點;且Western blot實驗驗證miR-145-5p對肝癌細胞中的LOX表達水平具有一定調(diào)控作用;qRT-PCR檢測結果也顯示大多數(shù)HCC患者癌旁組織中miR-145-5p mRNA的表達水平高于相應癌組織,而LOX則相反,提示miR-145-5p可能為上游調(diào)控LOX的一個關鍵miRNA。此外,本研究還通過生物信息學預測miR-145-5p的靶基因并找出了與miR-145-5p在生物過程、細胞組分、分子功能三個方面的作用。但是,本研究未進行雙熒光免疫實驗驗證LOX是否為miR-145-5p的結合靶點,有待今后進一步驗證。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)miR-145-5p在肝癌組織中低表達,而LOX則高表達,miR-145-5p可能通過負向調(diào)控LOX抑制肝癌細胞侵襲和遷移,因此miR-145-5p的升高或抑制可能是一種潛在的治療策略。本研究初步探索了miR-145-5p通過靶向LOX抑制肝癌惡性生物學行為,研究結果有望為肝癌復發(fā)和轉移的診療提供新思路。