張陽 阮海文 邵文桂 竇德虎 王靜 張雪峰
關鍵詞:質(zhì)譜技術;代謝組學;體外藥物肝毒性;細胞模型
【中圖分類號】 O657.63 【文獻標識碼】 A ? ? ? 【文章編號】2107-2306(2021)02--02
藥物毒性(drug hepatotoxicity,本文簡稱DH)評價在藥物研發(fā)過程中屬于一個關鍵性的環(huán)節(jié),藥物毒性反應中,肝臟為其靶器官,常見于外源性物質(zhì)與相關代謝物中,對肝臟的損傷較大,可至功能障礙與紊亂[1]。從對臨床藥物試驗失敗和撤回警告的原因中分析,得知藥物誘導性肝損傷的危害最大。有關數(shù)據(jù)顯示,受藥物誘導性肝損傷影響,藥物早期研發(fā)便終止的比例約有14%左右[2]。因此,必須重視DH的評價工作,及早發(fā)現(xiàn)具有相關風險的藥物,促進藥物研發(fā)的成功性。
藥物暴露對細胞的功能結構均有著一定影響,甚至還會使得細胞代謝時的內(nèi)源性代謝物失衡,細胞便會響應毒物或其他刺激,加劇毒性反應的發(fā)生。從而可知,直接反應藥物毒性還可選擇細胞代謝表型變化作為評價指標。在代謝組學之下,對生物樣品分子的質(zhì)量進行了有效分析,發(fā)現(xiàn)其質(zhì)量低于1000u時,便可完成毒性損傷情況的反應,對生物標志物和毒性機制的發(fā)現(xiàn)均有推測意義。細胞代謝組學自身的優(yōu)勢極為顯著,價格低廉,且易把控,有著良好的重復性,在DH體外評價中得到了廣泛應用。而質(zhì)譜技術也有獨特優(yōu)勢,經(jīng)1次檢測便可得到代謝物的諸多信息,例如峰強度/面積、精確質(zhì)荷比、特征離子、同位素分布等等[3]。液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)合應用后,還將彰顯出良好的靈敏度、分離度,且其重現(xiàn)性也較為明顯,對代謝組的定量分析極為有著積極作用,數(shù)據(jù)庫還能鑒定相關代謝物,在代謝組學研究中具有顯著的應用價值[4]。質(zhì)譜成像又為新一代的分子影像技術,可在相關的生物樣品中提取諸多的內(nèi)外源代謝物和藥物信息。在質(zhì)譜技術之下,能夠反應藥物刺激后出現(xiàn)的時空改變,在DH研究中具有良好的可行性,應用價值高?,F(xiàn)本文將基于質(zhì)譜技術的代謝組學予以分析,力求為體外DH評價提供相關參考,提升藥物研發(fā)質(zhì)量。
1 DH評價細胞模型
要想做好體外DH的準確評價,必須找到適宜的肝細胞類型,并選擇具有針對性的方法培養(yǎng)?,F(xiàn)將列舉常見的細胞類型,并總結其優(yōu)點與問題。
1.1 DH評價的典型細胞類型
(1)原代肝細胞。該細胞主要來源于肝臟,屬其分離物,其中含有較高的轉(zhuǎn)運體與藥物代謝酶,屬于DH細胞模型與外源性化合物代謝一種“金標準”[5]。同時,在代謝酶的抑制和誘導中也有著一定價值,并且還能實現(xiàn)化合物的篩選。不過,常態(tài)化的二維單層培養(yǎng)模式時間較長,肝細胞特異功能會在時間的延長下不斷降低,功能維持時間僅在24-72小時左右。
(2)干細胞樣細胞。在干細胞培養(yǎng)技術研究的不斷深入下,干細胞衍生肝細胞系逐漸走進臨床,并在肝細胞模型中得到了大面積使用。該細胞能夠?qū)崿F(xiàn)多能干細胞的誘導,并可衍生干細胞,在肝毒性研究中應用較廣。不過,現(xiàn)在臨床還未找到可直接分化為完全成熟肝細胞的干細胞,見其僅具有相應的干細胞特征,進行干細胞的誘導重建期間易發(fā)生分化異質(zhì)性與遺傳改變,和成熟人體肝細胞表型存在一定相似之處,但相似比例較為有限[6]。
(3)永生化肝細胞系。該細胞系的獲取方法主要有兩種,其一為經(jīng)原代肝細胞基因改造而成;其二便是在突變肝腫瘤中分離所得。永生化肝細胞系優(yōu)勢較為顯著,增值能力強,且具有無限性的特點,培養(yǎng)成本也較低?,F(xiàn)階段,臨床在研究肝腫瘤細胞系時常將HepG2與HepaRG兩種細胞作為主要細胞,分析原因,主要在于其細胞的穩(wěn)定性強,同時獲取容易,且具有無限增殖的能力[7]。另外,上述2種細胞皆具有較高的CYP450活性。不過,該細胞也存在一定的不足,由于其基因型較為單一,只可代表單個供體,在特異性人群中的適用性不高,在肝功能標志物表達中則體現(xiàn)為較低水平。
1.2 細胞模型培養(yǎng)方式
相比體內(nèi)的肝組織,二維方式培養(yǎng)的肝細胞無通訊和空間的異質(zhì)性,并且也無細胞外基質(zhì),無法進行肝臟功能與其結構的維持,穩(wěn)定性不足,在藥物毒性測試中的適用性不佳。而三維細胞模型同人體肝組織較為相似,能夠?qū)崿F(xiàn)細胞表型相關性的改善,同時還可將模型生存能力得以延長[8]。經(jīng)培養(yǎng)所得的三維結構,會模擬藥物的滲透過程對DH評價有著積極作用,準確度也較高。
目前,在研究的不斷深入下,也出現(xiàn)了新型的培養(yǎng)方式,如肝芯片、肝細胞球等,對抑制性微環(huán)境中的細胞模型有著積極作用。在過去的研究中,一般會選擇瓊脂糖進行96孔板凝固凹形表面細胞球的培養(yǎng),但當下的3D打印技術發(fā)展較為成熟,瓊脂糖凹形微孔陣列模型的構建將變得更加精準,在3D肝細胞球形模型下,可使細胞表達出成熟的肝細胞標志物,故藥物自身的敏感性將變得更高[9]。器官芯片也屬體外3D細胞模型,在制造微芯片后,能夠構建出微流控細胞模型,可模擬器官和相關組織的生理環(huán)境。在此技術下,各種類型的細胞均能以空間方式一起培養(yǎng),并不斷模擬出機體細胞中的微環(huán)境,價值顯著。
2基于質(zhì)譜技術的細胞代謝組學分析
2.1 液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用技術
(1)制備樣品。相比尿液、血漿等生物樣品的代謝組學研究,細胞樣品的前期處理十分復雜,包括細胞的采集、淬滅、破碎、提取等諸多環(huán)節(jié)[10]。因此,必須找到高效且科學的細胞樣本前期處理對策,確保細胞代謝物的穩(wěn)定和真實,奠定細胞代謝組學研究的基礎。在李麗美等人[11]的研究中,在細胞樣品的前期處理中,加入了LC-MS技術,并進行每一處理環(huán)節(jié)的優(yōu)化和改良,找到了最佳的樣本前期處理辦法,將細胞用PBS清洗2次后,再以零下40度的甲醇(60%)進行細胞代謝淬滅(時間把控在5分鐘內(nèi)),隨后再以甲醇(80%)進行細胞代謝物的提取。另外,該研究中還發(fā)現(xiàn),收集批次與液氮凍存時間的差異,也會影響細胞代謝物,因此,在相關研究開展過程中,盡量選擇同批次且培養(yǎng)條件相同的細胞樣本,以降低誤差。
(2)技術與方法。在代謝組學樣品分析過程中,色譜與質(zhì)譜技術是應用頻率最高的。相比液相色譜,氣相色譜能夠減少基質(zhì)效應,同時還可降低洗脫化合物離子抑制影響,色譜分離的重復性與分辨率也更佳,在低分子質(zhì)量揮發(fā)性化合物中有著顯著價值。而液相色譜技術能夠與極性代謝物相容,同時也被看作代謝組學分離的一種工具。一般情況下,LC-MS可經(jīng)親水作用色譜柱與反向柱進行代謝物的極性分析。如若單一分離技術無法檢測時,可采取兩種分離機制的色譜進行分離,對樣品分析的覆蓋范圍和分辨率均有明顯提升作用。
(3)采集數(shù)據(jù)。在進行數(shù)據(jù)采集過程中,有靶向與非靶向分析兩種方法。非靶向代謝組學可實現(xiàn)樣品代謝物的全面分析,對新型生物標志物有發(fā)現(xiàn)作用,不過處理時的工作量較大,效率不高。而靶向代謝組學則主要涉及已知代謝物組的測試。此外,也有研究提出把向與非靶向結合應用的方法,在非靶向下可分析出代謝物的信息和離子特征,提升數(shù)據(jù)處理的準確性與特異性,確保已知和未知代謝物均能實現(xiàn)檢測,重復性較高,且有著較寬的線性范圍,處理過程也相對簡便。
(4)處理分析。使用代謝組學分析時會有大量數(shù)據(jù)產(chǎn)生,因此,必須做好相應的分析與處理。首先,應過濾噪聲,提取峰,解卷積峰,時間保留對齊等操作,確保原始數(shù)據(jù)能夠轉(zhuǎn)換,使得每一樣本中的離子、強度矩陣、峰面積等均可被檢出。隨后,再進行數(shù)據(jù)的多元處理,結合代謝譜做到樣本聚類。另外,還可使用新型的統(tǒng)計方法與計算方法,將模型進行優(yōu)化,例如,隨機森林、自組織映射,支持向量機等,得到貢獻值較大的差異變量。
2.2 基于質(zhì)譜成像技術體外細胞模型
在質(zhì)譜成像技術中,空間分辨代謝組學能夠?qū)⒋x物進行有效保留,確保異質(zhì)性生物的空間位置信息能夠及時反饋,并擴展至二維或三維層面中,完成生物代謝的研究?,F(xiàn)階段,質(zhì)譜成像技術中的基質(zhì)輔助激光解析電離質(zhì)譜、二次離子質(zhì)譜、解吸電噴霧電離質(zhì)譜等的使用頻率均較高。
基質(zhì)輔助激光解析電離質(zhì)譜的分辨率通常處于50-100μm,最高能夠至微米狀態(tài),對寬質(zhì)量范圍也有著良好的分析性,尤其在體積較小的生物組織樣本質(zhì)譜成像中的優(yōu)勢最為明顯[12]。針對多細胞腫瘤球(1μm直徑)內(nèi)的西妥昔單抗與哌立福新等藥物的代謝、滲透也有表征作用。
二次離子質(zhì)譜可展現(xiàn)出亞微米、納米等級別的空間圖片,分辨率較高,對單細胞、亞細胞質(zhì)譜研究均十分有益。相關研究便對該技術進行了有效分析,發(fā)現(xiàn)其在單細胞和相關代謝物中均具有可視化效果,不過以高能離子束轟擊樣本,便會有諸多的碎片離子產(chǎn)生,因此在使用該技術時,無法進行內(nèi)源性代謝物的有效檢測,同時分子質(zhì)量超過1000u的化合物也不適用,靈敏度不高。
解吸電噴霧電離質(zhì)譜具有敞開式特征,操作十分便捷,在分析樣本的過程中也不會依靠噴涂基質(zhì),即使物質(zhì)的質(zhì)量區(qū)較低,也可獲得良好的檢測結果,可覆蓋較寬范圍內(nèi)的代謝物,且靈敏度高。有研究便進行了該項技術的使用和研究,發(fā)現(xiàn)其可將內(nèi)源性分子空間分布可視化,缺氧微環(huán)境與腫瘤異質(zhì)性區(qū)域均可被表征,可知曉多細胞腫瘤球的中心壞死位與外周增殖范圍[13]。不過,該項技術的空間分辨率不高,僅處于100μm上下,因此在表征體外的3D細胞球時,會出現(xiàn)一定的代謝差異,局限性明顯。
3總結展望
使用人源細胞進行DH評價存在較多的優(yōu)勢之處,有著良好的可控性,且重復性高、時間短,并且還能降低動物成本。肝細胞自身的選擇與培養(yǎng)方式在DH評價中具有顯著的作用價值,在3D細胞培養(yǎng)模型下,對其性能有提升作用,同時還可保證肝臟特異功能,使毒副反應預測的結果更加準確。僅憑單一的細胞模型無法實現(xiàn)體內(nèi)肝細胞狀況的有效分析,因此還需進行細胞毒性評價模型的持續(xù)研究。
基于質(zhì)譜細胞代謝組學技術與許多生物學技術均能實現(xiàn)有效融合,同時還可彌補其中的不足之處,在毒理學機制評價、生物標志物評價中均具有顯著的應用成效?,F(xiàn)階段,分析技術依舊面臨著諸多的機遇和挑戰(zhàn),不足之處也十分明顯。而二維液相色譜分離技術能夠彌補1次分析中的覆蓋度與分辨率,同時還可促進代謝物靈敏度的提升,效率也較高。當質(zhì)譜成像技術出現(xiàn)后,又能實現(xiàn)藥物滲透、代謝等的反映,對細胞代謝組時空改變均有明顯益處,在可視化之下完成藥物、代謝物與細胞代謝的分析,價值顯著,同時也能幫助臨床理解藥物毒性與其機制。
把細胞代謝組學中得出的DH生物標志物用在臨床中,同時進行藥物安全性評價,雖然已經(jīng)取得了一定應用成效,但其實際的安全性與效果也依舊還需持續(xù)研究和證實。若把計算機與代謝組學聯(lián)系起來,并進行相關風險評估,將實現(xiàn)代謝信息的有效發(fā)現(xiàn)與使用,把毒性相關代謝變化與藥物結合后,還可幫助更好的預測DH風險。結合細胞模型與代謝組學后,對臨床DH的預測極為有益,目前已經(jīng)在中藥和化學藥DH中取得了一定成效,基于3D細胞模型,研制出體內(nèi)微環(huán)境的DH系統(tǒng),將促進生物藥物毒理學的發(fā)展,可為其提供新的方向和思路。
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