1958年秋，朱建士剛從北京大學數學力學系畢業(yè)，就被分配到了中國唯一的核武器研制單位——北京第九研究所。當時，朱建士被分在了鄧稼先所在的一室力學組。為打好理論基礎，組員們從研讀厚厚的專業(yè)書籍開始。當時的條件很差，這些書不能人手一冊，于是大家刻蠟紙自己油印，共同學習。1959年6月20日，蘇聯來信，決定暫緩向中國提供原子彈教學模型和相關技術資料。在這一嚴峻的形勢下，我國決定獨立自主研制原子彈，為記住這個屈辱的日子，還把第一顆原子彈的代號取名“596”，將其稱為“爭氣彈”。1960年5月，為得出核反應之前力學過程的數值，朱建士帶領大家三班倒，使用手搖計算機，甚至算盤苦苦運算相關數據。然而，其中一個計算結果跟蘇聯專家曾經說過的數值不一樣——大家驗證了九次，還是與之大相徑庭。朱建士雖然是參加計算的主力，也是每次討論答辯的主角，但屬于“小字輩”，有時不太敢在會上表達意見，只能在下面小聲議論。彭桓武先生注意到后說：“在原子彈問題上，大家是平等的，因為誰也不知道應該怎么做?！弊罱K，實驗小組否定了蘇聯給的數據，結束了長達幾個月的爭論與徘徊，掃清了理論設計的障礙，為“爭氣彈”的圓滿爆破奠定了堅實基礎。