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微生物成因鮞粒研究進(jìn)展

2022-04-02 09:49:00李飛易楚恒李紅王夏李楊凡李怡霖曾偉王曾俊
沉積學(xué)報(bào) 2022年2期
關(guān)鍵詞:藍(lán)細(xì)菌紋層碳酸鹽

李飛,易楚恒,李紅,王夏,李楊凡,李怡霖,曾偉,王曾俊

1.西南石油大學(xué)地球科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,成都 610500 2.西南石油大學(xué)天然氣地質(zhì)四川省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和中石油碳酸鹽巖儲(chǔ)層重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室分室,成都 610500 3.成都理工大學(xué)沉積地質(zhì)研究院,成都 610059

0 引言

鮞粒是一種球形或橢球形包覆顆粒(coated grains),由核心和圍繞核心的一系列光滑、均勻紋層共同構(gòu)成。其中,鮞粒核心常見類型包括化石碎片、球粒和陸源碎屑礦物等,紋層主要為鈣質(zhì)成分(CaCO3),少量為磷質(zhì)、鐵質(zhì)和硅質(zhì)等。鮞粒粒徑一般在0.25~2 mm[1-2]。早期文獻(xiàn)常將直徑大于2 mm的鮞粒稱為豆粒(pisoids),但這種用法遭到Peryt[3]和Richter[2]等人批評(píng)。目前國際沉積學(xué)界常把粒徑大于2 mm的鮞粒稱為巨鮞(giant ooids)[4-5],其形貌和內(nèi)部結(jié)構(gòu)與正常鮞相比并沒有明顯差別[6]。鮞??梢孕纬捎诓煌h(huán)境,從海洋、湖泊到洞穴,甚至熱泉中均有發(fā)現(xiàn)[3,7]。本文主要針對(duì)海洋環(huán)境下碳酸鹽鮞粒展開論述。

目前最古老的鮞粒記錄保存在南非的太古宇(約3 000~2 900 Ma)[8],其出現(xiàn)稍晚于已知最早的生命記錄——疊層石(~3 450 Ma)[9]。此后鮞粒廣泛發(fā)育于碳酸鹽主導(dǎo)的沉積環(huán)境,并在新元古代、寒武紀(jì)、石炭紀(jì)、三疊紀(jì),以及侏羅—白堊紀(jì)之交分別達(dá)到高峰,這與當(dāng)時(shí)表層海水碳酸鈣飽和度顯著增加有關(guān)[10-12]。在現(xiàn)代碳酸鹽沉積環(huán)境下,鮞粒主要形成于溫暖、動(dòng)蕩的淺灘,緯向上主要分布于中—低緯度(大致沿南、北回歸線附近)[7,13-15],例如巴哈馬[16]和加勒比海[17-18]地區(qū)、波斯灣[19]、澳大利亞西海岸(鯊魚灣)[20],南太平洋社會(huì)群島和庫克群島[21]等地。地質(zhì)歷史時(shí)期鮞粒灘的分布與現(xiàn)代類似,但在一些極端氣候環(huán)境下,也可能出現(xiàn)在整個(gè)中、低緯度地區(qū)廣泛發(fā)育的現(xiàn)象(例如早三疊世)[12,22-23]。

鮞粒的凈生長速率并不快。以現(xiàn)代巴哈馬地區(qū)為例,每顆鮞粒每年新增約0.4~18 ng鈣質(zhì)成分,這意味著直徑在0.25~0.5 mm 之間的鮞粒需要幾百到數(shù)千年時(shí)間才能形成[24-25]。其生長遲緩的原因可能與鮞粒之間碰撞、磨蝕造成的質(zhì)量損失有關(guān)[26]。鮞粒內(nèi)部結(jié)構(gòu)上表現(xiàn)為同心狀、放射狀、同心—放射狀、泥晶狀等多種紋層類型,且不同類型既可以單獨(dú)發(fā)育,也可以共生[27-28]。但是,地質(zhì)歷史時(shí)期形成的鮞粒受成巖作用影響并不都能保存下來原始的紋層結(jié)構(gòu)。原生礦物成分的不同是造成鮞粒保存程度存在差異的重要原因之一[27],這主要受控于海水化學(xué)性質(zhì),表現(xiàn)為以文石和高鎂方解石為主(亞穩(wěn)定礦物)和以低鎂方解石為主(穩(wěn)定礦物)的礦物類型的交替變化,這種變化也被稱為“文石?!迸c“方解石?!敝g的轉(zhuǎn)化[27,29]。

雖然人們對(duì)鮞粒在古環(huán)境、古氣候、古海水性質(zhì)、儲(chǔ)層特征等方面的作用和價(jià)值已經(jīng)有了深入認(rèn)識(shí),但在鮞粒成因這個(gè)最基本問題上,長期以來爭議不斷(圖1)[3,7,10,24,26,29-58]。概括來講,鮞粒形成主要有物理作用[35],化學(xué)作用[38]和生物作用[59]三種主要機(jī)制,其中關(guān)于生物作用與化學(xué)作用哪種機(jī)制占主導(dǎo)一直沒有定論。目前被大多數(shù)學(xué)者所接受的“化學(xué)作用主導(dǎo)”的認(rèn)識(shí)正受到越來越多生物化學(xué)證據(jù)的挑戰(zhàn)[47-48,51,60]。需要說明的是,關(guān)于鮞粒“生物成因”的認(rèn)識(shí)并非是近年來才開始出現(xiàn)的,在鮞粒研究的早期階段學(xué)者們就已經(jīng)有了“生物參與形成”的樸素認(rèn)識(shí)。隨著測(cè)試分析技術(shù)的不斷進(jìn)步和對(duì)有機(jī)礦化過程的深入了解[53,61],目前沉積學(xué)界對(duì)于鮞粒“生物和化學(xué)作用共同參與”的認(rèn)識(shí)越來越成熟,大有取代“化學(xué)成因”之勢(shì)(圖1)。雖然國外學(xué)者對(duì)鮞粒成因已經(jīng)進(jìn)行過總結(jié)[1,3,26,38,43,53,62-65],但這些認(rèn)識(shí)主要是基于對(duì)現(xiàn)代鮞粒研究的結(jié)果,對(duì)于地質(zhì)歷史時(shí)期其他類型微生物成因鮞粒闡述有限。國內(nèi)也有學(xué)者對(duì)鮞粒成因進(jìn)行過非常好的總結(jié)[66],但相關(guān)工作開展較早,對(duì)于近十年來鮞粒成因方面的新認(rèn)識(shí)有待梳理。此外,中國有著豐富的鮞粒巖沉積記錄,但對(duì)于這些鮞粒在成因研究領(lǐng)域的價(jià)值還有待深入挖掘。

圖1 鮞粒成因研究主要認(rèn)識(shí)時(shí)間線每個(gè)特定發(fā)現(xiàn)∕觀點(diǎn)的引用包括:虎克顯微鏡研究[30];第一本鮞粒專著[31];生物結(jié)構(gòu)[31];“無機(jī)成因”起源[32-33];第一次鮞粒成因爭議[32-33];第一次海灘調(diào)查[34];“滾雪球”模型[35];藍(lán)細(xì)菌(微藻∕藍(lán)綠藻)[36-37];“化學(xué)成因”模式[38];第一次培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)[39];反硝化細(xì)菌(DB:denitrifying bacteria)參與[40];硫酸鹽還原菌(SRB:sulfate-reducing bacteria)參與[41];有機(jī)質(zhì)參與[42];生物誘導(dǎo)礦化[43];胞外聚合物(EPS:extracellular polymeric substances)貢獻(xiàn)[44];有機(jī)礦化作用[45];超微細(xì)菌[46];無定形碳酸鈣(ACC:amorphous calcium carbonate)[24,47];光合作用微生物主導(dǎo)[48-50];異養(yǎng)微生物群落主導(dǎo)[51];微生物群落綜合參與[52];生物成因ACC與物理化學(xué)因素參與構(gòu)型[53];具體觀點(diǎn)詳見第1節(jié);原圖參考筆者在《沉積之聲》公眾號(hào)文章《碳酸鹽鮞粒工廠》圖4Fig.1 Timeline of principal insights∕views in the study history of the genesis of ooids

基于此,本文從歷史和當(dāng)前視角,回顧了從“藻類參與”到“細(xì)菌參與”,以及現(xiàn)在“有機(jī)礦化過程”在鮞粒微生物成因研究方面的歷程,對(duì)鮞粒形成的地球生物學(xué)過程進(jìn)行了系統(tǒng)闡述,并對(duì)一些可能與有機(jī)礦化過程有關(guān)的鮞粒類型進(jìn)行了探討,這可為進(jìn)一步認(rèn)識(shí)鮞粒形成過程、生物與礦物相互作用機(jī)理,以及其他具有類似成因的碳酸鹽組分研究提供參考。

1 鮞粒成因研究歷史(2000年以前)

最早對(duì)鮞粒進(jìn)行研究的學(xué)者被認(rèn)為是古羅馬博物學(xué)家和哲學(xué)家Pliny the Elder,他在公元77 年的著作Naturalis Historia中首次對(duì)鮞粒進(jìn)行了系統(tǒng)描述,提到鮞粒的形貌與魚卵有相似之處[34]。之后,Agricola 在1546 年對(duì)鮞粒形態(tài)和表面特征進(jìn)行研究后認(rèn)為巖石中的鮞??深惐壬碁┥萧~籽的形成與保存[67]。1665 年,Hooke[30]在顯微鏡下首次觀察到鮞粒的內(nèi)部特征,并描述這種結(jié)構(gòu)類似于雞蛋的同心結(jié)構(gòu)(即,蛋殼、蛋清和蛋黃)。此外,他認(rèn)為這些顆粒是在流體環(huán)境中產(chǎn)生的。Brückmann 在1721 年出版了關(guān)于鮞粒巖的第一本專著[31],進(jìn)一步提出鮞粒是石化的生物結(jié)構(gòu)[34]。然而,Da Costa 在1757 年提出,鮞粒起源于微小顆粒的連續(xù)結(jié)晶,而不是生物化石[32]。1779年,De Saussure[33]也反對(duì)“鮞粒來自石化魚卵”的觀點(diǎn),并進(jìn)一步指出在動(dòng)蕩水體中細(xì)小礦物會(huì)不斷在鮞粒表面聚集,促進(jìn)其生長。這兩種對(duì)立的觀點(diǎn)可能是鮞粒成因研究史上生物作用與非生物作用的首次交鋒。

自19世紀(jì)以來,隨著對(duì)現(xiàn)代海灘鮞粒的研究,有關(guān)其成因的認(rèn)識(shí)得以豐富、完善。De La Beche 在1823—1824 年對(duì)牙買加海灘考察后認(rèn)為,鮞粒的生長主要依靠碳酸鹽過飽和的攪動(dòng)水環(huán)境[68];之后,他提出物理加積和化學(xué)沉淀是形成鮞粒的兩個(gè)重要因素[68]。Dana[69]也持有類似的觀點(diǎn),并進(jìn)一步強(qiáng)調(diào)灰泥的物理加積作用對(duì)鮞粒生長的重要性。1879 年,著名的鮞粒研究學(xué)者Sorby[35]提出鮞粒的生長過程類似于“雪球”的形成,即鮞粒在滾動(dòng)過程中通過在表面黏附大量細(xì)小的顆粒而不斷長大。但是,這種觀點(diǎn)未被學(xué)界廣泛接受,因?yàn)樗鼰o法解釋鮞粒光滑的表面結(jié)構(gòu)(很難被黏附)(圖2a),以及放射狀紋層結(jié)構(gòu)的形成等一系列問題[26,42,70-72]??紤]到鮞粒表面有機(jī)物(生物膜)有捕獲細(xì)小顆粒的能力,一些研究者認(rèn)為物理加積作用也可作為部分鮞粒形成的影響因素[72-74]。

圖2 現(xiàn)代鮞粒和古代石化鮞粒(a)巴哈馬灘鮞粒(Schooner Cays),具有光滑的外部形貌;(b)寒武系第二統(tǒng)鮞粒(河南龍門石窟);(c)下三疊統(tǒng)鮞粒(廣西來賓);其中(b)和(c)均為具有均勻條帶狀紋層結(jié)構(gòu)的巨鮞Fig.2 Modern ooid sands and ancient fossilized ooids

另一方面,鮞粒來源于宏體生物(或其器官、分泌物等)的認(rèn)識(shí)也受到了批評(píng)[1,43]。從19 世紀(jì)末開始,“微藻”在鮞粒形成過程中的價(jià)值受到研究者們的關(guān)注[36,75]。Wethered[36]和Rothpletz[37]在研究大鹽湖鮞粒時(shí),在與酸性溶液反應(yīng)后的殘?jiān)凶R(shí)別出一些藍(lán)綠藻(藍(lán)細(xì)菌)。Wethered 在鏡下觀察發(fā)現(xiàn)這些已經(jīng)鈣化的微生物(如葛萬菌等)通常平行或垂直于鮞粒紋層分布,或保存在鮞粒核心[36,75]?;诖耍茰y(cè)一部分在鮞粒表面生存的藍(lán)細(xì)菌具有黏結(jié)、捕獲周圍灰泥的能力,這對(duì)于鮞粒生長具有建設(shè)性作用;但是其他一些垂直于同心紋層(鉆孔類),或在紋層間絮狀分布的微生物對(duì)鮞粒的形成沒有實(shí)質(zhì)性貢獻(xiàn)(圖3a)。類似的鈣化藍(lán)細(xì)菌在寒武系鮞粒中也非常常見[76-79]。Kalkowsky[59]在德國哈爾茨山地區(qū)(Harz Mountains)下三疊統(tǒng)湖相地層中確認(rèn)了鮞粒內(nèi)部存在富有機(jī)質(zhì)紋層,且常具有腦紋狀(cerebroid)和條帶狀(banded)結(jié)構(gòu),并且這些特征與共生疊層石的紋層結(jié)構(gòu)較為相似(圖3h,i)。其中條帶狀紋層與現(xiàn)代巴哈馬鮞粒的同心狀紋層之間還存在一定差別:條帶狀紋層結(jié)構(gòu)通常由暗色和亮色層交替排列,分別對(duì)應(yīng)有機(jī)質(zhì)富集層和貧乏層(圖3f)[80];而同心狀(切線狀)紋層中各個(gè)紋層細(xì)密且特征相似,不存在間隔變化的特點(diǎn)(圖3a)。需要說明的是,地質(zhì)歷史時(shí)期鮞粒與疊層石或凝塊石的發(fā)育既可以相互獨(dú)立,也可以共存[59,81](圖4)。

圖3 典型的鮞粒鏡下微結(jié)構(gòu)(單偏光,Leica DM750P 顯微鏡)(a)同心狀鮞粒。注意鉆孔微生物在鮞粒紋層內(nèi)局部(左側(cè)箭頭)和層狀(右側(cè)箭頭)富集的特征;(b)具放射狀(RF:radial fabric)紋層鮞粒;(c)內(nèi)部放射狀(RF)和外部同心狀(CF:concentric fabric)結(jié)構(gòu)鮞粒;(d)內(nèi)部同心放射狀和外部腦紋狀(輕微,黃色箭頭標(biāo)記)結(jié)構(gòu)鮞粒;(e)放射狀(RF)和同心狀(CF)結(jié)構(gòu)交替出現(xiàn)的鮞粒;(f)暗色(富有機(jī)質(zhì))和亮色(貧有機(jī)質(zhì))紋層交替發(fā)育的鮞粒;(g)暗色(富有機(jī)質(zhì),箭頭標(biāo)記)和亮色(貧有機(jī)質(zhì),放射—同心狀結(jié)構(gòu))紋層交替的鮞粒;(h)腦紋狀結(jié)構(gòu)鮞粒。注意紋層內(nèi)部含有交替出現(xiàn)的暗色(富有機(jī)質(zhì))和亮色(貧有機(jī)質(zhì))紋層(箭頭);(i)內(nèi)部同心—放射狀和外部暗色和亮色紋層交替結(jié)構(gòu)。注意出現(xiàn)在外部紋層的輕微腦紋狀結(jié)構(gòu)(箭頭)。樣品來源:(a)現(xiàn)代巴哈馬灘;(b~e)現(xiàn)代大鹽湖(美國猶他州);(f)廣西來賓下三疊統(tǒng);(g)塔里木盆地上奧陶統(tǒng);(h~i)德國Harlyberg地區(qū)下三疊統(tǒng)Fig.3 Photomicrographs of diagnostic ooid inner microstructures (plane light, Leica DM750P)

圖4 疊層石與鮞粒發(fā)育關(guān)系(a)現(xiàn)代澳大利亞Hamelin Pool疊層石紋層以及紋層之間鮞粒(箭頭所指位置)分布特征;(b)河南新鄉(xiāng)寒武系苗嶺統(tǒng)鮞粒分布于柱狀疊層石紋層內(nèi)部以及疊層石之間(箭頭所示);(c)湖北利川下三疊統(tǒng)疊層石紋層(SL:stromatolitic laminae)與紋層間鮞粒層(OL:oolitic laminae),引自文獻(xiàn)[81]中圖11,經(jīng)Elsevier授權(quán)使用Fig.4 Relationships between microbialite and ooid deposits in sedimentary successions

20 世紀(jì)初,Linck[38]首次在實(shí)驗(yàn)室合成了類似鮞粒的結(jié)構(gòu)(需要注意的是有部分試劑成分也可由生物產(chǎn)生)。其形成過程可以概括為如下反應(yīng)方程式:

Ca2++ 2HCO-3?CaCO3+ CO2+ H2O

從式中可以看出,鮞粒的生長速率主要取決于水體中Ca2+和HCO-3的反應(yīng)速率,因而鮞粒發(fā)育的化學(xué)條件可以概括為:1)碳酸鹽過飽和的水體環(huán)境,2)充分的成核顆粒,3)動(dòng)蕩的水環(huán)境(利于CO2脫氣和表面沉淀環(huán)境更新),以及4)在適宜生長環(huán)境中的停留時(shí)間[26,82]。雖然之前已經(jīng)有學(xué)者認(rèn)為化學(xué)沉淀過程可能在鮞粒形成中起主導(dǎo)作用,但是Linck的實(shí)驗(yàn)證據(jù)極大地支持了鮞?!盎瘜W(xué)成因”。隨著“化學(xué)成因”模型的不斷完善,很多關(guān)于鮞粒生長機(jī)制方面的疑慮被消除,自20世紀(jì)70年代以來該模型在碳酸鹽沉積和成巖研究領(lǐng)域逐漸被廣泛接受[10,29,83]。

另一方面,隨著化學(xué)成因模式的興起,以藍(lán)細(xì)菌為代表的“微藻”在鮞粒形成過程中的作用不斷受到質(zhì)疑。由于鉆孔活動(dòng)是藍(lán)細(xì)菌的一種常見行為(圖3a),這在當(dāng)時(shí)被研究者認(rèn)為對(duì)鮞粒形成主要起破壞作用[26,42,84-86]。此外,在嚴(yán)格無光或不含藻類的環(huán)境中,類似鮞粒的結(jié)構(gòu)亦可被合成[87]??紤]到這些不利因素,一些研究者開始探索不進(jìn)行光合作用的異養(yǎng)型微生物在促進(jìn)鮞粒紋層形成過程中的可能性[88-89]。需要說明的是,微生物鉆孔行為在固定松散碳酸鹽顆粒和維護(hù)原始紋層結(jié)構(gòu)方面的積極作用在后來得到驗(yàn)證[90]。

Drew[39,91]在培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中引入反硝化細(xì)菌后合成了具有類似鮞粒紋層結(jié)構(gòu)的碳酸鹽結(jié)殼。之后,硫酸鹽還原菌在合成類似結(jié)構(gòu)碳酸鹽沉積物中的作用也得到了證實(shí)[41]。另一方面,一些研究者發(fā)現(xiàn)在培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中添加一些有機(jī)質(zhì)(如腐殖酸和氨基酸等)[42,86-87]也能形成碳酸鈣結(jié)晶。進(jìn)一步的研究確認(rèn)了有機(jī)質(zhì)和細(xì)菌共同參與了碳酸鹽的沉淀過程,即一些細(xì)菌在代謝過程中通過消耗有機(jī)質(zhì),在其周圍形成堿性微環(huán)境誘導(dǎo)碳酸鹽成核[26,89,92-94](詳見2.2.2 節(jié))。Fabricius[43]將這種行為描述為“生物誘導(dǎo)”形成過程,是一種間接的、生物促進(jìn)礦物形成的機(jī)制[95-97],而成核模板(template)主要集中在細(xì)菌的胞外聚合物(Extracellular Polymeric Substances,EPS)上。EPS 主要為高分子聚合物,在生物誘導(dǎo)礦化過程中主要起到絡(luò)合和釋放金屬陽離子,提供有機(jī)質(zhì)來源和成核場所等作用[61]。隨后,Gerdes[44]證實(shí)了鮞粒紋層內(nèi)存在大量由細(xì)菌和EPS 構(gòu)成的微生物席(膜),這為微生物參與鮞粒形成提供了可供觀察的直接證據(jù)[98-100]。而鮞粒外部大量發(fā)育的微生物席狀結(jié)構(gòu)常被作為存在活躍微生物活動(dòng)以及鮞粒處于停滯期的證據(jù)[88](圖5)。

圖5 巨鮞和共存的微生物席狀結(jié)構(gòu)(a)下三疊統(tǒng)結(jié)構(gòu)與形貌保存良好的巨鮞(2~8 mm,如箭頭所示)。鮞粒一般具有明暗相間的紋層結(jié)構(gòu);(b)掃描電鏡照片顯示鮞粒保存環(huán)境存在微生物席狀結(jié)構(gòu)。注意箭頭所示位置保存有大量的EPS,在弱醋酸刻蝕下仍能較好地保存席狀結(jié)構(gòu)(鮞粒則呈現(xiàn)凹陷特征);樣品來自下三疊統(tǒng)羅樓組(貴州羅甸沫陽)Fig.5 Development of giant ooids and associated microbial mats

2 鮞粒成因研究的最新進(jìn)展(2000 年至今)

從2000 年以來,關(guān)于鮞粒成因的研究再次進(jìn)入一個(gè)高潮期,大量新的認(rèn)識(shí)和進(jìn)展可以概括為如下三個(gè)方向。

2.1 生物成因礦物

微生物成因礦物的證實(shí)為微生物參與鮞粒形成過程提供了直接證據(jù)。Folket al.[46,101-102]通過掃描電子顯微鏡在鮞粒紋層中識(shí)別出大量0.03~0.3 μm 的球形或桿狀微粒,他們認(rèn)為這些微粒可能是超微細(xì)菌的礦化結(jié)構(gòu)或者是由細(xì)菌等產(chǎn)生的納米級(jí)碳酸鹽沉淀。實(shí)際上,自20 世紀(jì)70 年代以來,這種微小的顆粒就已經(jīng)被早期鮞粒研究者所關(guān)注(如Purser[19]原文圖14E;Fabricius[43]原文圖11-A2)。但是一些研究人員認(rèn)為這些超微顆粒的大?。ㄉ踔帘纫阎钚〉纳w—支原體還要小)和特征不屬于微生物的范疇[103-104],傾向于認(rèn)為這些微粒是純化學(xué)成因或與微生物誘導(dǎo)礦化有關(guān)。Duguidet al.[24]認(rèn)為這些納米級(jí)顆粒(至少一部分)是碳酸鹽化學(xué)沉淀過程中形成的無定形碳酸鈣(ACC),這些ACC 隨后轉(zhuǎn)化為文石晶體,整個(gè)過程不需要微生物參與(圖6a)。但是,Diazet al.[47]通過交叉極化結(jié)合魔角旋轉(zhuǎn)核磁共振法技術(shù)證實(shí)了鮞粒紋層中存在ACC,且這些ACC主要分布于EPS 上,暗示了其來源很可能是在有機(jī)礦化過程中形成的碳酸鈣結(jié)晶。隨著ACC 的大量聚集,在鮞粒外皮層形成薄層。由于ACC 不穩(wěn)定,其隨后轉(zhuǎn)變?yōu)榫哂蟹€(wěn)定晶形的文石∕方解石礦物,但這個(gè)過程中晶體排列似乎更多地受到鮞粒周圍水化學(xué)∕物理?xiàng)l件影響(例如,海水Mg∕Ca 摩爾比值和水動(dòng)力條件等),進(jìn)而形成精細(xì)紋層結(jié)構(gòu)(圖6b)[47,53,105-107]。

圖6 無定形碳酸鈣(ACC)在鮞粒紋層形成過程中的兩種機(jī)制(化學(xué)模型和有機(jī)礦化模型)(a)鮞粒形成的化學(xué)模型(參照Davieset al.[88]和Duguidet al.[24]的假設(shè));ACC是由海水沉淀產(chǎn)生,在隨后轉(zhuǎn)變?yōu)槲氖樀倪^程中受到水動(dòng)力和水化學(xué)條件的共同影響;(b)生物成因ACC模型(據(jù)Diazet al.[47,53]);注意生物成因ACC的產(chǎn)生可能發(fā)生在動(dòng)蕩的表層海水和∕或淺埋藏(暫時(shí)停滯)環(huán)境中的早期成巖階段。有機(jī)礦化過程中生成的ACC轉(zhuǎn)化為文石針;受水動(dòng)力和水化學(xué)條件的共同影響,鮞粒表層晶體結(jié)構(gòu)發(fā)生重新排列Fig.6 Roles of amorphous calcium carbonates (ACC) in the formation of ooid laminae (Chemical vs. microbial models)

2.2 鮞粒中可能的生物建造者及其代謝途徑

雖然化學(xué)沉淀是形成碳酸鹽沉積物的一個(gè)重要途徑,但是有機(jī)礦化(生物誘導(dǎo)和生物影響礦化)作用在鮞粒形成過程中同樣有可能促進(jìn)碳酸鈣的產(chǎn)生。生物誘導(dǎo)礦化指的是由于生物活動(dòng)和環(huán)境之間相互作用從而產(chǎn)生礦物沉淀的過程[61,108-110],例如藍(lán)細(xì)菌光合作用過程中產(chǎn)生的一些副產(chǎn)物(如OH-)造成微環(huán)境中堿度或飽和度的增加,進(jìn)而誘導(dǎo)碳酸鹽成核。生物影響礦化指的是由于外界環(huán)境條件改變?cè)斐商妓猁}在微生物成因沉淀模板(如EPS表面)上成核,與沉淀模板本身無直接關(guān)聯(lián)的一種被動(dòng)礦化過程[53],例如EPS 降解過程中吸附的鈣離子釋放,造成微環(huán)境碳酸鈣飽和度增加從而在模板上發(fā)生沉淀的過程。目前對(duì)于生物誘導(dǎo)礦化作用機(jī)理研究較為深入。一些微生物類型,如光合作用細(xì)菌(如藍(lán)細(xì)菌、紫硫細(xì)菌和綠硫細(xì)菌等)、硫酸鹽還原菌、硫化物厭氧氧化細(xì)菌和產(chǎn)甲烷菌等,具有生物誘導(dǎo)礦化能力(圖7)。相反,其他能夠降低pH 和堿度的微生物類型(如硫化物有氧氧化細(xì)菌和酵化細(xì)菌等)在代謝活動(dòng)中不利于碳酸鹽成核(甚至造成CaCO3損失)[61,111],本文不再論述。就鮞粒形成潛在的貢獻(xiàn)者而言,主要包括圖7所示類型。

2.2.1 自養(yǎng)細(xì)菌

能在鮞粒形成過程中起到促進(jìn)作用的自養(yǎng)微生物包括化能自養(yǎng)和光能自養(yǎng)細(xì)菌兩種類型。其中化能自養(yǎng)細(xì)菌(如產(chǎn)甲烷菌和硫化物厭氧氧化菌)通常利用H2或還原性硫化物(reduced sulfur compounds)作為電子供體,誘導(dǎo)CaCO3在嚴(yán)格缺氧條件下沉淀[110-111]。研究表明,產(chǎn)甲烷菌和硫化物厭氧氧化菌在各自的代謝過程中每消耗4 mol H2和5∕3 mol HS-便可將1 mol 的Ca2+固定下來形成CaCO3沉淀(圖7)[111]。光合自養(yǎng)微生物(不產(chǎn)氧和產(chǎn)氧細(xì)菌)可將光能轉(zhuǎn)化為化學(xué)能進(jìn)行代謝活動(dòng)(圖7)。其中不產(chǎn)氧光合微生物,如紫硫細(xì)菌,利用HS-(由硫酸鹽還原作用生成)作為電子供體誘導(dǎo)碳酸鹽在氧化還原界面附近成核[109]。其中,紫硫細(xì)菌每消耗1 mol HS-便可產(chǎn)生1 mol CaCO3沉淀[111]。產(chǎn)氧光合作用微生物(藍(lán)細(xì)菌)在光照下利用H2O(電子供體)固定CO2,并在藍(lán)細(xì)菌鞘體(內(nèi)部或表面)[109]和EPS 基質(zhì)[111-113]上產(chǎn)成CaCO3。藍(lán)細(xì)菌在現(xiàn)代湖相鮞粒形成過程中的建造作用是明顯的,這些鮞粒紋層中常見到大量保存完好的、鈣化的絲狀和球狀藍(lán)細(xì)菌,以及在EPS上形成與生物影響礦化有關(guān)的沉淀物[48-50,114]。

圖7 鮞粒微生物礦化過程中可能存在的微生物類型及其相應(yīng)的代謝途徑(引文詳見2.2 節(jié))Fig.7 Types of microbes potentially involved in ooid microbial mineralization and their corresponding metabolic pathways

盡管如此,藍(lán)細(xì)菌作為鮞粒紋層的建造者也存在一些不利因素。首先,藍(lán)細(xì)菌的鈣化必須同時(shí)滿足高鈣離子(Ca2+)濃度(>13 mmol∕L)和低溶解無機(jī)碳濃度兩個(gè)條件[115]。海水中鈣離子濃度的降低會(huì)極大抑制藍(lán)細(xì)菌的鈣化,例如,現(xiàn)代海洋中鈣離子濃度較低(~10 mmol∕L),很難形成鈣化藍(lán)細(xì)菌[115]。其次,藍(lán)細(xì)菌周圍EPS 似乎不是碳酸鹽成核的理想場所,因?yàn)樵谛玛惔x過程中EPS能夠吸收周圍的Ca2+(和其他離子),從而降低微環(huán)境碳酸鹽的飽和度[116]。最后,光合作用產(chǎn)生的CaCO3可能被隨后的有氧呼吸(好氧異養(yǎng)細(xì)菌)耗盡,因而沒有產(chǎn)生CaCO3凈沉淀[61]。這些因素可能限制了藍(lán)細(xì)菌在鮞粒形成中的直接貢獻(xiàn),特別是在現(xiàn)代低鈣離子濃度的海洋環(huán)境中。

與現(xiàn)代海洋不同的是,湖相微生物巖和鮞粒中常可以保存鈣化藍(lán)細(xì)菌[48-50,117-118]。其原因可能與:1)周圍環(huán)境鈣離子濃度(或碳酸鈣飽和度)較高[112,115];2)富鎂硅酸鹽基質(zhì)(鎂來自于被分解的EPS(能絡(luò)合金屬離子);硅來自于溶解的硅藻)在藍(lán)細(xì)菌細(xì)胞∕鞘體表面的包覆機(jī)制,可抵御周圍環(huán)境的溶解作用[48,119-121];以及3)協(xié)同硫酸鹽代謝作用(如不產(chǎn)氧光合作用和硫酸鹽還原作用),創(chuàng)造了局部堿性增強(qiáng)的微環(huán)境[122]。對(duì)于藍(lán)細(xì)菌鈣化的長期控制因素,Riding[112,123-124]認(rèn)為CO2濃縮機(jī)制可能在大部分地質(zhì)時(shí)期中起著重要作用,該機(jī)制的運(yùn)行可以顯著提高CO2吸收率[125],從而誘導(dǎo)鞘層的鈣化和EPS 的生成[125-126](圖8a)。毫無疑問的是,藍(lán)細(xì)菌產(chǎn)生的有機(jī)物和附屬的EPS 是有機(jī)質(zhì)的主要來源之一,可為一些異養(yǎng)微生物(如硫酸鹽還原菌和產(chǎn)甲烷菌;圖7)新陳代謝活動(dòng)提供能量來源[61,111,127]。

圖8 鮞粒表皮內(nèi)微生物礦化的兩種模型(a)CO2濃縮機(jī)制調(diào)節(jié)藍(lán)細(xì)菌主導(dǎo)的礦化作用模型[80]。圖片經(jīng)Elsevier授權(quán)使用和翻譯;(b)異養(yǎng)細(xì)菌主導(dǎo)的有機(jī)礦化模型。自養(yǎng)細(xì)菌與異養(yǎng)細(xì)菌共同參與,其中藍(lán)細(xì)菌和EPS為有機(jī)質(zhì)重要來源之一[125-126];CA:碳酸酐酶;DNB:反硝化細(xì)菌;GSB:綠硫細(xì)菌;MB:產(chǎn)甲烷菌;PSB:紫硫細(xì)菌;RuBisCO:一種固碳酶;SRB:硫酸鹽還原菌。注意可能造成碳酸鈣損失的新陳代謝活動(dòng)(如有氧呼吸、發(fā)酵和硫化物有氧氧化)和效率較低的促進(jìn)碳酸鹽沉淀(如氨化)的新陳代謝活動(dòng)在模型b中沒有顯示;鮞粒內(nèi)部的有機(jī)礦化過程參考[53,60,108,122]Fig.8 Two models of the possible processes of microbial mineralization within ooid cortices

由此可見,藍(lán)細(xì)菌在鮞粒紋層形成中的直接作用仍存在爭議,但藍(lán)細(xì)菌的間接作用,即釋放吸附的鈣離子和提供有機(jī)質(zhì)來源,對(duì)促進(jìn)其他有機(jī)礦化過程起到了重要作用。

2.2.2 異養(yǎng)微生物

異養(yǎng)微生物的一些新陳代謝活動(dòng)同樣能夠促進(jìn)碳酸鹽沉淀[110],主要包括有機(jī)質(zhì)降解過程中的硝酸鹽和硫酸鹽的還原[111,128-130]。與氮、硫循環(huán)有關(guān)的微生物群落被Diazet al.[52,131]認(rèn)為在現(xiàn)代巴哈馬鮞粒形成過程中起到了主要作用。但是反硝化細(xì)菌在微生物誘導(dǎo)碳酸鈣沉淀過程中的作用仍存在爭議:一些研究人員認(rèn)為,反硝化作用過程產(chǎn)生CaCO3的效率較高,每消耗1 mol有機(jī)質(zhì)或0.5 mol乙酸鹽就可以產(chǎn)生1 mol CaCO3[132-133];但是也有些研究者認(rèn)為硝酸鹽的還原過程會(huì)導(dǎo)致CaCO3的溶解[61,111,134],每消耗1mol 有機(jī)質(zhì)將溶解0.2 mol CaCO3。

對(duì)于硫酸鹽還原菌,大量的研究認(rèn)為其在誘導(dǎo)碳酸鹽沉淀過程中起到了關(guān)鍵作用[111,116,135-139],具體功能包括:1)通過新陳代謝活動(dòng)營造堿性微環(huán)境(pH 值增加);2)通過消耗有機(jī)質(zhì)釋放已結(jié)合的鈣離子(主要被EPS 吸附);3)通過消除相關(guān)的動(dòng)力學(xué)障礙(消耗硫酸鹽)促進(jìn)白云石沉淀。該過程每氧化1 mol 有機(jī)碳可以產(chǎn)生0.5~1.5 mol 的CaCO3沉淀(從不完全氧化到完全氧化)[116]。有意思的是,硫酸鹽還原菌并非嚴(yán)格意義上的厭氧微生物,它們也可能出現(xiàn)在有氧環(huán)境中[140-141],且某些有氧環(huán)境下(如咸化強(qiáng)蒸發(fā))的代謝效率與其在厭氧環(huán)境下相當(dāng)[141-144]。此外,鮞粒生物標(biāo)志化合物[51]和基因[52,131]分析也證實(shí)了硫酸鹽還原菌在異養(yǎng)微生物群落中的優(yōu)勢(shì)地位。因而一些研究人員認(rèn)為硫酸鹽還原菌可能在鮞粒紋層有機(jī)礦化過程中發(fā)揮了關(guān)鍵作用(圖8b)[51,145]。

2.3 鮞粒生長的有機(jī)礦化過程

近年來隨著生物標(biāo)志化合物和基因檢測(cè)等技術(shù)的應(yīng)用,目前已經(jīng)證實(shí)鮞粒內(nèi)微生物種群中具有礦化能力的類型與疊層石內(nèi)非常相似[45,47,52,131,145-148],暗示兩者成因可能具有關(guān)聯(lián)。但是目前關(guān)于生物礦化過程如何參與鮞粒形成的認(rèn)識(shí)還處于初級(jí)階段。前人認(rèn)為的微生物參與鮞粒的形成過程主要參考Davieset al.[88]經(jīng)典的兩步生長模型。在這個(gè)模型中,受水動(dòng)力條件和地形影響,鮞粒處于周期性的動(dòng)蕩和停滯狀態(tài)[16,149-150],當(dāng)鮞粒脫離強(qiáng)水動(dòng)力環(huán)境并最終被保存在海底時(shí),微生物活動(dòng)性開始增強(qiáng)(建造或破壞作用)。一些研究者還認(rèn)為微生物的加積過程可以在特定環(huán)境或階段進(jìn)行,例如潮下低能環(huán)境[150]和鮞粒間歇靜止期[114]。在這樣的環(huán)境中微生物群落可以完成誘導(dǎo)礦化、生物膜(席)建造和初始紋層形成[49-50](圖5)。Diazet al.[47]更是認(rèn)為生物誘導(dǎo)產(chǎn)生的碳酸鈣(ACC 形成)可以形成于各個(gè)生長階段,特別是在鮞粒生長活躍期(攪動(dòng)和間歇靜止階段;圖6b)。概括來看,這些觀點(diǎn)沒有脫離傳統(tǒng)的對(duì)于鮞粒發(fā)育條件的認(rèn)識(shí),即強(qiáng)水動(dòng)力和多階段生長過程控制。

另一類觀點(diǎn)不考慮水動(dòng)力條件的影響,轉(zhuǎn)而強(qiáng)調(diào)營養(yǎng)來源和參與鮞粒建造微生物類型的重要性[43-44,151-153]。例如,Brehmet al.[154-155]提出鮞粒是一個(gè)具有某些生態(tài)優(yōu)勢(shì)(例如,利用光照和減少生物捕獲)、以藍(lán)細(xì)菌為主導(dǎo)的球形微生物群落。這些微生物群落首先構(gòu)建出一個(gè)松散的、具紋層的球狀結(jié)構(gòu),鈣質(zhì)紋層則來源于隨后的有機(jī)礦化過程。Batcheloret al.[60]進(jìn)一步推測(cè)鮞粒內(nèi)部微生物群落通過與外界營養(yǎng)交換而不斷發(fā)育。這些認(rèn)識(shí)在解釋具有層狀微生物席的現(xiàn)代湖相鮞粒和古代Kalkowsky型鮞粒(類似疊層石構(gòu)造和富含大量有機(jī)質(zhì))時(shí)似乎更為適合[59-60,156]。但是現(xiàn)代巴哈馬鮞粒中很少有類似的層狀微生物席的存在(圖3a)。

3 如何解決“鮞粒成因”之謎:從Kalkowsky型鮞粒入手

鮞粒通常具有排列良好的文石∕方解石晶體結(jié)構(gòu),且化學(xué)成因機(jī)制可以對(duì)CaCO3的沉淀給出令人滿意的解釋。但是,單一模型并不足以解釋在地質(zhì)歷史時(shí)期廣泛出現(xiàn)的、具有不同內(nèi)部結(jié)構(gòu)和特征鮞粒的成因。正如許多沉積學(xué)家所警告的那樣,完全排除微生物在鮞粒形成過程中的建設(shè)性作用是不可取的[1,7,34,43,48,51-53,80]??紤]到現(xiàn)階段關(guān)于鮞粒成因的認(rèn)識(shí)仍然存在非常大的爭議,研究某些特定類型鮞粒的形成機(jī)制可能為解決其成因之謎提供一個(gè)突破口。而具有條帶狀結(jié)構(gòu)的Kalkowsky 型鮞粒(圖3f,i)則是最有可能存在微生物參與建造的類型。

Kalkowsky 型鮞粒在古代海相和湖相地層中非常常見,包括埃迪卡拉系[157-159]、寒武系[78,160]、奧陶系(圖3g)、志留系[161]、泥盆系[162]、石炭系[163-165]、三疊系[156,166-170]、侏羅系[170-171]和白堊系[172],且粒徑普遍較大(圖2b,c、圖3f、圖5a)。一些現(xiàn)代鮞粒中也具有富含有機(jī)質(zhì)的紋層,如日內(nèi)瓦湖[48,173-174]、大鹽湖[36]和波斯灣[175],其直徑一般小于0.5 mm。奇怪的是,巴哈馬鮞粒中很少出現(xiàn)有機(jī)質(zhì)富集層。Kalkowsky 型鮞粒一般以貧有機(jī)質(zhì)和富有機(jī)質(zhì)紋層的交替出現(xiàn)為特征(圖3f,g),其中貧有機(jī)質(zhì)層主要為同心晶粒狀和同心—放射纖維狀結(jié)構(gòu)(圖3c,f)。貧有機(jī)質(zhì)紋層中晶粒狀結(jié)構(gòu)很可能是以亞穩(wěn)定的文石礦物在成巖過程中發(fā)生溶解—重結(jié)晶改造的結(jié)果(圖3f)[165,176];而保存條件良好的同心—放射纖維狀結(jié)構(gòu)可能與原生礦物為低鎂方解石有關(guān)(圖3g)。此外,腦紋狀鮞粒與紋層狀鮞粒內(nèi)部結(jié)構(gòu)高度相似(圖3h,i),外凸的紋層結(jié)構(gòu)可能反映了微生物群落對(duì)光照和營養(yǎng)的競爭[60]。

Kalkowsky 型鮞粒存在有機(jī)礦化過程參與基于以下證據(jù):1)富含有機(jī)質(zhì)的紋層由大量鈣化的、分層平鋪排列且平行于鮞粒表面的微生物殘余物(如鞘和EPS)和礦化產(chǎn)物構(gòu)成(圖3f),這些殘余物與垂直紋層方向的鉆孔微生物特征明顯不同;2)富含有機(jī)質(zhì)的紋層相互獨(dú)立,且與膠結(jié)良好的紋層交替出現(xiàn)。這種結(jié)構(gòu)不同于鮞粒在低能環(huán)境的泥晶化作用。后者通常會(huì)改變鮞粒最外層(或某一層)甚至全部紋層結(jié)構(gòu)(圖3a),但很難有規(guī)律地間隔改造鮞粒紋層(圖3f)。這是由于鮞粒在生長過程中不太可能頻繁地在生長階段和脫離動(dòng)蕩水體的低能環(huán)境之間轉(zhuǎn)換;3)貧有機(jī)質(zhì)紋層(顏色亮,晶粒粗)和富有機(jī)質(zhì)紋層(顏色暗,晶粒細(xì))的交替特征與層狀疊層石結(jié)構(gòu)高度相似(圖2b,c、圖3f、圖5a)。Burne 和Moore 稱之為“規(guī)則 紋 層 狀 疊 層 石 ”(regularly laminational stromatolite),Riding[177]將這種生物作用與化學(xué)作用共同參與的疊層石類型稱為“混合疊層石”(hybrid stromatolite)。

對(duì)于Kalkowsky 型鮞粒的形成過程,我們?cè)谇叭薣60,122]的基礎(chǔ)上提出了一個(gè)改進(jìn)的模型(圖8b)。在這個(gè)模型中,鮞粒的表面發(fā)育由微生物群落(包括自養(yǎng)和異養(yǎng)微生物)構(gòu)成的松散微生物席。其中最靠近表層的自養(yǎng)微生物群落(如藍(lán)細(xì)菌和綠硫細(xì)菌)在光照條件下通過新陳代謝活動(dòng)不斷產(chǎn)生碳酸鹽沉淀和有機(jī)質(zhì),內(nèi)部的異養(yǎng)微生物(如硫酸鹽還原菌和產(chǎn)甲烷菌)通過消耗有機(jī)質(zhì)誘導(dǎo)碳酸鹽沉淀。在缺乏光照條件下,以異養(yǎng)微生物群落主導(dǎo)的有機(jī)礦化作用將繼續(xù)參與鮞粒紋層建造。在鮞粒不斷生長的過程中,內(nèi)層的光合自養(yǎng)微生物群落由于光照缺失,在鮞粒紋層形成過程中的直接貢獻(xiàn)會(huì)消失,從而完全讓位給異養(yǎng)微生物主導(dǎo)的有機(jī)礦化過程,直到鮞粒表面微生物群落的下一次更新(圖6b、圖8b)。

對(duì)于Kalkowsky 型鮞粒而言,生物過程和化學(xué)過程(即生物化學(xué)過程)是控制富有機(jī)質(zhì)紋層鮞粒生長的重要因素;相對(duì)而言,物理因素的作用是次要的(圖9)。而對(duì)于同心狀和放射狀結(jié)構(gòu)的鮞粒,最新的研究認(rèn)為微生物誘導(dǎo)礦化過程(生物成因ACC 的形成)在鮞粒紋層形成的早期階段非常重要,而從ACC到有序晶體排列的轉(zhuǎn)變可能由物理化學(xué)因素控制(圖6b)。因此,至少在某些類型(或某些階段)鮞粒形成過程中,對(duì)“完全由化學(xué)因素控制鮞粒形成”的傳統(tǒng)觀念需要再慎重考慮(圖9)。

圖9 鮞粒形成過程中的控制因素Fig.9 Diagram illustrating three interacting factorsin the genesis of ooids

4 結(jié)論

(1)從鮞粒成因最新研究認(rèn)識(shí)來看,有機(jī)礦化作用產(chǎn)生的ACC 以及隨后受物理、化學(xué)因素影響從ACC 到有序晶體排列的轉(zhuǎn)變,可能制約著鮞粒的形成過程。

(2)考慮到豐度、礦化作用能力和效率等因素,以光合自養(yǎng)細(xì)菌(藍(lán)細(xì)菌和紫硫細(xì)菌)、硫酸鹽還原菌和產(chǎn)甲烷菌主導(dǎo)的微生物群落可能在鮞粒有機(jī)礦化過程中起到了積極作用。

(3)不同類型鮞粒中微生物參與的程度可能存在較大差異。Kalkowsky 型鮞粒與層狀疊層石結(jié)構(gòu)非常類似,其成因可能具有相似性,但有待深入探索。因此,對(duì)于與微生物成因有關(guān)的鮞粒研究可考慮重點(diǎn)關(guān)注富含有機(jī)質(zhì)紋層的Kalkowsky型鮞粒。

致謝 感謝澳大利亞國立大學(xué)Robert Burne 教授提供的關(guān)于鮞粒成因的早期文獻(xiàn)和現(xiàn)代疊層石樣品,以及昆士蘭大學(xué)圖書館對(duì)一些歐洲早期文獻(xiàn)的影印支持。感謝實(shí)驗(yàn)室已畢業(yè)的蘇成鵬、龔嶠林、曾楷、鄧嘉婷和車正強(qiáng)等同學(xué)在內(nèi)容討論和資料收集整理方面提供的幫助。感謝張?jiān)品甯苯淌谔峁┑膱D3g 樣品,方宇恒博士提供的圖4c 原圖。最后,非常感謝評(píng)審專家提出的寶貴修改意見。

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