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基于肝臟CT 圖像GLTP 特征的肝功能分級方法研究*

2022-06-16 12:46:04郭瑞敏黃煒嘉張正言王澤輝
計算機與數(shù)字工程 2022年5期
關(guān)鍵詞:降維分塊識別率

郭瑞敏 黃煒嘉 張正言 楊 魏 王澤輝

(1.江蘇科技大學(xué)海洋學(xué)院 鎮(zhèn)江 212003)(2.江蘇省人民醫(yī)院介入科 南京 210029)

1 引言

對肝功能進行監(jiān)測是慢性肝病治療中的重要環(huán)節(jié)[1]。Child-Pugh、MELD[2]等評分方法基于血清肌酐、膽紅素、白蛋白等血液學(xué)檢查指標(biāo)及腹水、肝性腦病等臨床主觀指標(biāo),無創(chuàng)易行,在臨床中被廣泛使用,在預(yù)測終末期肝病患者的死亡率以及術(shù)后的生存時間等方面有重要的臨床價值。計算機斷層掃描(Computed Tomography,CT)是臨床中常用的影像學(xué)檢查方法,有研究使用CT灌注成像、多期增強CT 掃描的動脈增強分數(shù)的類灌注技術(shù)、能譜CT碘基圖定量分析等技術(shù)評估肝功能[3~4]。隨著人工智能及大數(shù)據(jù)技術(shù)在醫(yī)療領(lǐng)域的應(yīng)用,影像組學(xué)(Radiomics)被應(yīng)用于肝纖維化、肝硬化程度、肝功能相關(guān)性研究,是病理學(xué)檢查以外良好的潛在替代評估方法[5],基于機器學(xué)習(xí)的醫(yī)學(xué)影像數(shù)據(jù)分析已成為了交叉學(xué)科中的研究熱點[6~7]。

醫(yī)學(xué)圖像的紋理分析為病變組織提供了客觀、定量的描述方法?;叶裙采仃嚕℅rey-Level Co-occurrence Matrix,GLCM)方法由Haralick 等[8]提出,具有原理簡單、辨別能力較強等優(yōu)點。Suganya等[9]將GLCM用于肝臟超聲圖像的紋理特征提取和正常、異常分類。Sergeeva 等[10]將GLCM 和離散小波變換結(jié)合,用于提取肺部CT 圖像的多尺度特征,實現(xiàn)對正常、異常圖像的分類。在基于圖像局部的特征提取方面,局部二值模式(Local Binary Pattern,LBP)[11]及其改進方法已逐步應(yīng)用于醫(yī)學(xué)領(lǐng)域。Chu 等[12~13]使用一種Webber 局部二值模式描述子用于胰腺超聲圖像,對慢性胰腺炎和自身免疫性胰腺炎進行分類。Tan 等[14]提出了局部三值模式(Local Ternary Pattern,LTP),在原始LBP 算子上引入閾值t 對圖像進行三值編碼,有效提高了對光照和噪聲影響的魯棒性,在圖像紋理較為均勻的區(qū)域的辨別能力更強[15]。金鑄浩等[16]提出了自適應(yīng)方向局部三值模式,將圖像全局的灰度特征應(yīng)用到編碼中,對全局特征描述大幅增強,且閾值的自適應(yīng)性增強了該算法的抗噪聲能力。梯度局部三值模 式(Gradient Local Ternary Pattern,GLTP)[17]在LTP 的基礎(chǔ)上,使用Sobel 算子[18]對圖像進行邊緣檢測,然后進行三值特征提取,減少了計算量、提高了特征提取的效率。目前,醫(yī)學(xué)圖像的紋理分析主要被用于正常、異常組織的分類,基于異常肝臟CT圖像,進行肝功能分級的工作還沒有被討論。

本文分析了不同MELD 評分的慢性肝病患者的肝臟CT 圖像,將GLTP 模式引入基于肝臟CT 圖像的肝功能分類中,提取肝臟組織局部紋理特征,采用支持向量機(Support Vector Machine,SVM)[19]訓(xùn)練和分類,建立基于增強CT 門脈期肝臟的肝功能分級模型,揭示了不同肝功能等級肝臟CT 圖像的特征差異,為肝功能分級提供了基于CT 影像的新方法。

2 梯度局部三值模式

LTP 是GLTP 的基礎(chǔ),LTP 編碼通過定義閾值t增加一個編碼模式,對LBP編碼在“0”碼和“1”碼的基礎(chǔ)上增加了“-1”碼,使得LTP描述符對紋理特征的描述更加詳細,且對光照變化和噪聲因素的影響較小,提升了其辨別能力。LTP 的基本方法是:首先設(shè)置3×3像素的區(qū)域,在中心像素點Gc周圍設(shè)定閾值t,定義一個長度為2t的區(qū)間[-t,t],如果各鄰域像素點的灰度值Gi落在Gc-t 和Gc+t 之間,則編碼為0。低于Gc-t或高于Gc+t則分別編碼為“-1”和“+1”,如式(1)和式(2)所示:

其中,Gc是中心像素點的灰度值,Gi是中心像素點鄰域內(nèi)第i個像素點的灰度值。

將編碼中除“1”以外的值改為“0”后所得的編碼定義為上模式(或正模式),如式(3)所示:

其中,SLTP(i)表示中心像素點鄰域中第i個采樣點經(jīng)過量化后的值。

同理,將編碼中除“-1”以外的值改為“0”,并且用“1”替換“-1”后所得的編碼定義為下模式(或負模式),如式(4)所示:

對上述兩種模式中得到的二進制編碼乘以相應(yīng)的權(quán)重后相加,得到中心點正、負模式的十進制LTP 特征值,如圖1 所示。根據(jù)上述特征值計算正負LTP編碼的統(tǒng)計直方圖,并將其級聯(lián)作為最終的特征向量。

圖1 閾值t設(shè)置為10的LTP算子編碼

GLTP[17]使用水平和垂直方向的Sobel 算子與原始圖像I 做卷積,分別得到水平及垂直方向濾波結(jié)果Gx、Gy,如式(5)所示;然后,計算圖像中每個像素的梯度幅度值Gx,y如式(6)所示;最后,對Gx,y使用LTP編碼模式完成GLTP特征的提取。

3 基于GLTP的肝臟CT圖像分類方法

圖2 為本文方法的整體流程圖。首先,對經(jīng)過MELD 分級劃分出的不同肝功能等級的圖像進行預(yù)處理,提取出相同大小,不包含血管和腫瘤的肝臟組織感興趣區(qū)域(ROI);其次,對圖像中每個像素點計算GLTP局部模式;再次,將圖像分成相同大小的子塊,統(tǒng)計編碼后的直方圖,將直方圖級聯(lián),構(gòu)特征向量,對特征向量進行PCA降維[20];最后,使用SVM分類器對特征向量進行訓(xùn)練和識別。

圖2 本文方法的整體流程圖

3.1 MELD評分與圖像預(yù)處理

首先,選取患者術(shù)前最近一次的檢查結(jié)果(包括血膽紅素、凝血酶原時間國際標(biāo)準(zhǔn)化比值(INR)和血肌酐等指標(biāo))計算得分R[21~22],如式(7)所示:

其中,病因項,膽汁性或酒精性為0、其他為1。根據(jù)MELD 評分標(biāo)準(zhǔn)劃分出“低?;颊撸≧<15)”、“中?;颊撸?5 ≤R≤18)”和“高危患者(R>18)”。不同等級肝功能MELD評分的肝臟CT圖像如圖3所示。

圖3 不同等級肝功能MELD評分的肝臟CT圖像

然后,提取肝臟CT 圖像中不包含血管與腫瘤的肝臟組織ROI,大小為38×38 像素,建立樣本數(shù)據(jù)集。

3.2 特征提取與分類

基于GLTP 的肝臟CT 圖像特征提取與分類方法如表1所示,圖4給出了GLTP編碼的過程。

表1 基于GLTP特征的肝臟CT圖像特征提取與分類算法

圖4 GLTP編碼過程

圖5 為不同肝功能等級肝臟CT 圖像的GLTP編碼圖像。分別給出了“低危”、“中危”和“高?!备尾』颊叩脑紙D像、提取出的ROI 區(qū)域、ROI 區(qū)域經(jīng)過Sobel 算子濾波后的圖像以及相應(yīng)的正GLTP模式和負GLTP模式。

圖5 肝臟CT圖像的GLTP編碼圖像

4 實驗設(shè)置及結(jié)果分析

4.1 實驗設(shè)置

本文實驗環(huán)境:Windows 10 操作系統(tǒng),Matlab R2018a 編程環(huán)境。實驗所用的CT 圖像數(shù)據(jù)來自江蘇省人民醫(yī)院,每張圖像包含其對應(yīng)的MELD 評分信息。實驗共使用肝臟CT 圖像240 張,其中,MELD 評分“低?!?20 張、“中?!?0 張、“高?!?0張。為了驗證算法的有效性,本文進行兩組實驗:1)選擇評分為“低?!?、“中?!?、“高危”圖像各60張,共計180 張圖片,進行三類分類;2)將“中?!迸c“高?!眻D像合并成一類,即使用“低?!?20 張,“中高?!?20 張,共計240 張圖片,進行二類分類。實驗采用10 折交叉驗證的方法:將數(shù)據(jù)集隨機劃分成10 組,其中1 組作為測試集,其他的9 組作為訓(xùn)練集,以此輪流實驗10 次計算出每組測試集上的識別率,將其平均后作為最終的識別率。

4.2 不同分塊大小對實驗結(jié)果的影響

為了分析不同分塊大小的編碼圖像直方圖統(tǒng)計對分類結(jié)果的影響,本文對5 種不同分塊大小分別進行了實驗。表2 和表3 分別為將圖像分為3×3、5×5、7×7、9×9和11×11塊,基于線性核、三次多項式核以及RBF 核SVM 進行“低?!薄ⅰ爸形!薄ⅰ案呶!比惙诸惡汀暗臀!?、“中高?!眱深惙诸惖膶嶒灲Y(jié)果。從表2可以看出,將圖像分為3×3塊時,三類分類的識別率最高,在三種核函數(shù)下的識別率分別為60.56%,60.56%,58.89%。隨著圖像分塊數(shù)量的增加,識別率有所下降,說明了將圖像分為較大的子塊,可以獲得有代表性的特征。

表2 不同分塊的GLTP算子三類識別率(單位:%)

從表3可以看出,將圖像分類11×11塊時,兩類分類的識別率最高,三種核函數(shù)下的識別率分別為65.00%,62.92%,55.42%。在圖像分塊數(shù)量較小時,獲得了較高的識別率??傮w來看,“低?!薄ⅰ爸懈呶!眱深惙诸惖淖R別率高于“低?!薄ⅰ爸形!薄ⅰ案呶!比惙诸惖慕Y(jié)果,可能的原因是在MELD 評分中,“低?!被颊邽镽<15,“中?!被颊邽?5 ≤R≤18,“高?!被颊邽镽>18,中高?;颊叩脑u分相對接近,因此,“中?!?、“高?!被颊吒闻K組織紋理具有類似的特征,這些特征與低?;颊叩母闻K紋理特征差異大,更易于分類。

表3 不同分塊的GLTP算子兩類識別率(單位:%)

4.3 不同降維參數(shù)對實驗結(jié)果的影響

為了降低特征維度,本文對提取的特征進行了降維,圖6 為圖像分塊為3×3,基于線性核SVM,三階多項式核和RBF 核(C=100),PCA 降維參數(shù)從0.85 到0.99 時所對應(yīng)的“低危”、“中?!?、“高危”三類分類的識別率。從圖中可以看出,當(dāng)降維參數(shù)為0.91,基于線性核SVM 時,識別率最高,為61.67%。圖7 為圖像分塊為11×11,PCA 降維參數(shù)從0.85 到0.99 時所對應(yīng)的“低危”、“中高危兩類分類的識別率?;诰€性核SVM 時,獲得了最高64.17%的識別率??傮w來看,隨著降維參數(shù)的變化,基于線性核和RBF 核,識別率基本在60%左右波動,進一步地驗證了基于GLTP提取肝臟組織特征的有效性。

圖6 不同降維參數(shù)下“低?!?、“中危”、“高危”三類分類識別率

圖7 不同降維參數(shù)下“低?!薄ⅰ爸懈呶!眱深惙诸愖R別率

4.4 采用不同特征的實驗結(jié)果

表4 為三種不同局部特征對“低?!?、“中?!焙汀案呶!比悎D像的識別率,其中分塊大小為9×9,降維參數(shù)為0.91。從實驗結(jié)果可以看出,本文的方法相較于LBP和LTP模式獲得了更高的識別率,更好地描述了肝臟的局部紋理。

表4 不同方法的三類識別率(單位:%)

5 結(jié)語

本文分析了不同等級肝功能的CT 圖像,提出了一種基于梯度局部三值模式的肝功能分級方法,揭示了MELD 肝功能分級與CT 影像的潛在關(guān)系,對于臨床診斷有一定的輔助和應(yīng)用價值。未來的工作將基于以下兩個方面進一步展開:1)增加實驗數(shù)據(jù)量,建立更為完善的肝臟CT圖像數(shù)據(jù)集;2)進一步研究肝臟CT 圖像的紋理特點,提取出更具辨別力的特征,結(jié)合不同的肝功能評分標(biāo)準(zhǔn),提高利用CT影像進行肝功能分級的準(zhǔn)確性。

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