張 晉 ,周 燦,王青瑤,吳俊敏,申旭東,傅松哲,劉 鷹
(1 大連海洋大學(xué)海洋科技與環(huán)境學(xué)院,遼寧 大連 116023;2 設(shè)施漁業(yè)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,遼寧 大連 116023;3 中國水產(chǎn)科學(xué)研究院營口增殖實(shí)驗(yàn)站,遼寧 營口 115004)
凡納濱對蝦(Penaeusvannamei)已成為全世界養(yǎng)殖產(chǎn)量最高的對蝦種類[1]。目前中國是世界上主要的凡納濱對蝦養(yǎng)殖大國[2]。2019年,全國凡納濱對蝦養(yǎng)殖總產(chǎn)量為181.56萬t,比上年增長3.14%[3]。隨著對蝦集約化養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大,導(dǎo)致養(yǎng)殖水環(huán)境持續(xù)惡化、傳染性疾病大規(guī)模爆發(fā),嚴(yán)重制約對蝦養(yǎng)殖業(yè)發(fā)展[4-5]。相關(guān)研究表明,養(yǎng)殖環(huán)境的細(xì)菌群落組成是影響海洋生物疾病暴發(fā)的重要因素[6-7],弧菌則是水產(chǎn)養(yǎng)殖中細(xì)菌性流行病的主要因素[8-10]。因此在養(yǎng)殖過程中檢測弧菌、水質(zhì)變化起著至關(guān)重要的作用。
多數(shù)養(yǎng)殖企業(yè)通過大量換水更新養(yǎng)殖水質(zhì),從而解決水質(zhì)惡化問題,這種模式也稱為流水式養(yǎng)殖(flow-through system,FTS)。但在養(yǎng)殖過程中換水可能會(huì)引入外來病原,使得對蝦獲得疾病,同時(shí)大量換水會(huì)造成嚴(yán)重水資源浪費(fèi)并且污染周圍養(yǎng)殖水域[11-12]。
近年來,相關(guān)研究表明對蝦循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)(re-circulating aquaculture system,RAS)在養(yǎng)殖生產(chǎn)中具有較強(qiáng)的可行性[13]。目前,對蝦循環(huán)水養(yǎng)殖在水資源消耗、對蝦疾病管控等方面具有優(yōu)勢,受到對蝦養(yǎng)殖業(yè)廣泛關(guān)注[14-16],對養(yǎng)殖水體水質(zhì)具有良好調(diào)節(jié)效果,方便實(shí)施[17-19]。此外,生物濾池作為對蝦循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中養(yǎng)殖廢水凈化處理的核心,具有較好的生物處理效果和較高的硝化效率,為養(yǎng)殖水體水質(zhì)中的營養(yǎng)物轉(zhuǎn)化提供了有效保證[20]。但這兩種系統(tǒng)長期運(yùn)行的穩(wěn)定性和細(xì)菌群落演替規(guī)律異同的報(bào)道較少,這些差異是如何影響對蝦養(yǎng)殖也是未知的。
本研究對相同養(yǎng)殖容量、相同溫度范圍和相同水源運(yùn)行的兩種養(yǎng)殖模式進(jìn)行了比較研究,分別在養(yǎng)殖前期、中期和后期對兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)中水樣進(jìn)行采集,通過分析兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)中的水質(zhì)、弧菌總數(shù)和細(xì)菌總數(shù)變化、水體中細(xì)菌群落變化、可培養(yǎng)菌株情況等數(shù)據(jù),系統(tǒng)性地比較流水式和循環(huán)水兩種對蝦養(yǎng)殖模式的系統(tǒng)穩(wěn)定性及其對細(xì)菌種群演替的影響。
本試驗(yàn)于2020年5月—2020年10月對營口某養(yǎng)殖場中流水式和循環(huán)水對蝦養(yǎng)殖系統(tǒng)中的水樣進(jìn)行采集,養(yǎng)殖周期均為100 d。每套系統(tǒng)由規(guī)格相同的養(yǎng)殖池組成,養(yǎng)殖池規(guī)格均為1.5 m×1.5 m×1.5 m,水深1.0 m,水體2.25 m3。采用氣泵曝氣充氧。其中循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)還配備了生物濾器(0.45 m×0.3 m×0.7 m)用于水質(zhì)處理。生物濾器內(nèi)填充生物填料,生物濾器內(nèi)生物膜處于成熟狀態(tài)。循環(huán)水養(yǎng)殖池采用2 000 L/h循環(huán)泵,24 h運(yùn)行。
流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)(FTS)和循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)(RAS)每日換水率分別為20%和0.5%,養(yǎng)殖水體水溫(T)24~27 ℃,溶氧7~8 mg/L,pH 7.8~8.5。對蝦養(yǎng)殖前平均體長77 ±7.37 mm,平均體質(zhì)量2.8 ±0.91 g。每個(gè)養(yǎng)殖池放蝦苗100尾,放養(yǎng)密度為0.124 kg/m3。養(yǎng)殖期間,每天投喂3次,投喂時(shí)間分別為7∶00、12∶00、19∶00。投喂飼料選自唐山禾豐科技有限公司,日投喂量為蝦體生物量的5%,通過觀察養(yǎng)殖桶內(nèi)殘余飼料及糞便量多少,適當(dāng)調(diào)節(jié)飼料投喂量。
試驗(yàn)分為2組,一組為高鹽度組(A組),使用海水和自來水配制,鹽度為8。另一組為低鹽度組(B組),直接使用地下井水作為水源,鹽度為4。每組包含4個(gè)養(yǎng)殖池,流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)和循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)各使用2個(gè)養(yǎng)殖池(圖1)。
圖1 流水式養(yǎng)殖模式(FTS)和循環(huán)水養(yǎng)殖模式(RAS)養(yǎng)殖池示意圖
在養(yǎng)殖第1天,第50天,第100天(分別對應(yīng)養(yǎng)殖前期,中期和后期)對養(yǎng)殖系統(tǒng)水樣進(jìn)行采集測序,每14 d采集一次水樣,檢測弧菌總數(shù)和細(xì)菌總數(shù),同時(shí)每25 d采集一次水樣,檢測水質(zhì)參數(shù)。
分別從同一養(yǎng)殖系統(tǒng)2個(gè)養(yǎng)殖池內(nèi)水深0.75 m處取0.5 L水樣混勻,檢測水質(zhì)氨氮、亞硝酸鹽氮和COD指標(biāo),測定方法參照海洋監(jiān)測規(guī)范GB17378.7—2007[21]。其中,采用次溴酸鹽氧化法測定氨氮數(shù)值,采用萘乙二胺分光光度法測定亞硝酸鹽氮,采用堿性高錳酸鉀法測定COD數(shù)值[21]。
取養(yǎng)殖水體25 mL加入225 mL生理鹽水中混勻,隨后采用10倍系列梯度稀釋液分別涂布于TCBS瓊脂培養(yǎng)基和2216E瓊脂培養(yǎng)基平板內(nèi),每個(gè)稀釋梯度設(shè)置3個(gè)平行,37℃培養(yǎng)24 h后進(jìn)行細(xì)菌總數(shù)和弧菌總數(shù)計(jì)數(shù)[22]。
使用直徑為47 mm,孔徑0.22 μm的濾膜對水體進(jìn)行過濾。用剪刀將整張過濾膜盡量剪碎,置于2 mL離心管中。
采用Water DNA Isolation Kit試劑盒(FOREGEN)提取的養(yǎng)殖水體總基因組DNA,委托諾禾致源有限公司進(jìn)行16S rDNA V4區(qū)高通量測序。基于 Illumina HiSeq 測序平臺(tái),以雙末端測序(Paired-End)進(jìn)行小片段文庫的構(gòu)建,構(gòu)建后對文庫進(jìn)行測序,每個(gè)樣品重復(fù)兩次。在對原始測序序列進(jìn)行過濾、雙端拼接后得到優(yōu)化序列。利用軟件QIIME(version 1.8.0)[23]中的UCLUST將優(yōu)化序列進(jìn)行聚類,進(jìn)而進(jìn)行操作分類單元(Operational Taxonomic Unit,OTU)的劃分,并根據(jù)OTU的序列組成獲得養(yǎng)殖水體樣本中細(xì)菌的物種分類。在OTU結(jié)果的基礎(chǔ)上對樣品進(jìn)行分類學(xué)分析,獲得養(yǎng)殖水體細(xì)菌的群落結(jié)構(gòu)圖。Alpha多樣性分析研究97%以上相似度水平下的Ace、Chao1及Shannon指數(shù),對養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落多樣性進(jìn)行分析。同時(shí)運(yùn)用主坐標(biāo)分析(PCoA,Principal Co-ordinates Analysis)對養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落的差異性進(jìn)行分析。
數(shù)據(jù)均利用Excel 2010和SPSS19軟件進(jìn)行處理和統(tǒng)計(jì)分析。
采用2216E 海水培養(yǎng)基分別對循環(huán)水和流水式養(yǎng)殖池水體進(jìn)行細(xì)菌分離與鑒定,在養(yǎng)殖第14、28、42、56、70、84、100天進(jìn)行取樣分離。隨后利用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒(Qiagen)提取基因組DNA。采用16S rRNA 引物27F(5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′)對其進(jìn)行PCR擴(kuò)增[24]。PCR反應(yīng)體系為:DNA模板2.5 μL;上下游引物F/R各0.5 μL;2×Taq PCR Super Mix12.5 μL;ddH2O 9 μL。PCR產(chǎn)物送至北京華大基因科技有限公司,完成測序。
養(yǎng)殖后期,F(xiàn)TS中高鹽組和低鹽組的對蝦平均體質(zhì)量從2.8 ±0.91 g分別增加至10.9 ±4.08 g和8.6 ±3.22 g,平均體長從77.6 ±7.37 mm增加至117.4 ±13.99 mm和106.9 ±14.11 mm。
RAS中高鹽組和低鹽組的對蝦平均體質(zhì)量從2.8 ±0.91 g分別增加至10.5 ±1.73 g和11.1±4.67 g,平均體長從77.6 ±7.37 mm分別增加至116.8 ±4.78 mm和119.3 ±15.35 mm。結(jié)果顯示,F(xiàn)TS和RAS中的對蝦體質(zhì)量無顯著性差異(P>0.05)(圖2)。
圖2 對蝦養(yǎng)殖期間平均體質(zhì)量(A)和平均體長(B)變化
2.2.1 養(yǎng)殖水體中COD質(zhì)量濃度變化
RAS和FTS養(yǎng)殖池水體中COD質(zhì)量濃度變化如圖3A所示,高鹽組和低鹽組中FTS水體中COD質(zhì)量濃度均高于RAS水體。高鹽組RAS水體中COD質(zhì)量濃度在養(yǎng)殖第25天時(shí)略顯升高,但后期COD質(zhì)量濃度變化基本趨于穩(wěn)定,變化范圍為2.32~4.00 mg/L。高鹽度FTS水體中COD質(zhì)量濃度變化范圍為2.56~8.98 mg/L,隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加,F(xiàn)TS水體中COD質(zhì)量濃度逐漸增加,且均高于RAS水體質(zhì)量濃度,養(yǎng)殖后期質(zhì)量濃度差異顯著。
同樣低鹽組RAS水體中COD質(zhì)量濃度在養(yǎng)殖前期小幅度增加,養(yǎng)殖中后期COD質(zhì)量濃度基本穩(wěn)定,變化范圍為2.59~4.50 mg/L。低鹽組FTS水體中的COD質(zhì)量濃度變化與高鹽組變化趨勢基本相同,呈大幅度增加趨勢,且明顯高于RAS水體中COD質(zhì)量濃度,變化范圍為2.86~9.62 mg/L,同樣養(yǎng)殖后期濃度差異顯著。
2.2.2 養(yǎng)殖水體中氨氮質(zhì)量濃度變化
RAS和FTS養(yǎng)殖池水體中氨氮質(zhì)量濃度變化如圖3B所示,高鹽組和低鹽組中FTS水體中氨氮質(zhì)量濃度均高于RAS水體。高鹽組RAS水體的氨氮質(zhì)量濃度變化范圍為0.020~0.093 mg/L,其氨氮質(zhì)量濃度在養(yǎng)殖前期略顯升高,但在養(yǎng)殖中后期氨氮質(zhì)量濃度基本趨于穩(wěn)定。FTS水體的氨氮質(zhì)量濃度變化范圍為0.020~0.268 mg/L,隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加,F(xiàn)TS水體中氨氮質(zhì)量濃度顯著增加,且均高于RAS水體中氨氮質(zhì)量濃度,養(yǎng)殖后期質(zhì)量濃度差異顯著。
低鹽組RAS水體中氨氮質(zhì)量濃度在養(yǎng)殖前期小幅度增加,養(yǎng)殖中后期氨氮質(zhì)量濃度基本穩(wěn)定,變化范圍為0.003~0.102 mg/L。低鹽組FTS水體中氨氮質(zhì)量濃度呈大幅度增加趨勢,且明顯高于RAS水體中氨氮質(zhì)量濃度,變化范圍為0.025~0.305 mg/L,同樣養(yǎng)殖后期質(zhì)量濃度差異顯著。
2.2.3 養(yǎng)殖水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度變化
RAS和FTS養(yǎng)殖池水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度變化如圖3C所示,高鹽組和低鹽組中FTS水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度均高于RAS水體。高鹽組RAS水體的亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度變化范圍為0.001 2~0.012 5 mg/L,其亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度在養(yǎng)殖前期略顯升高,但在養(yǎng)殖第25天后亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度基本趨于穩(wěn)定。FTS水體的亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度變化范圍為0.001 6~0.053 6 mg/L,隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加,F(xiàn)TS水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度顯著增加,且均高于RAS水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度,養(yǎng)殖后期質(zhì)量濃度差異較大。
圖3 循環(huán)水和流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)養(yǎng)殖水體中COD(A)、氨氮(B)和亞硝酸鹽氮(C)變化
低鹽組RAS水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度在養(yǎng)殖前期小幅度增加,養(yǎng)殖中后期亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度略微升高,變化范圍為0.000 1~0.015 0 mg/L。低鹽組FTS水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度呈大幅度增加趨勢,且明顯高于RAS水體中亞硝酸鹽氮質(zhì)量濃度,變化范圍為0.000 7~0.078 0 mg/L,同樣養(yǎng)殖后期質(zhì)量濃度差異較大。
圖4A顯示,隨著時(shí)間增加,兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)水體中弧菌總數(shù)在初始時(shí)明顯較低,隨后持續(xù)增加。FTS和RAS水體中弧菌總數(shù)變化差異顯著(P<0.05)。FTS水體中弧菌總數(shù)明顯高于RAS,同時(shí)FTS水體中弧菌增長速率高于RAS。
RAS內(nèi)弧菌總數(shù)在0~28 d內(nèi)保持平穩(wěn),28 d后呈增長趨勢,變化范圍為1.13×102~1.01×103CFU/mL;FTS內(nèi)弧菌總數(shù)隨時(shí)間增加在0~70 d呈明顯上升趨勢,弧菌總數(shù)最高達(dá)到4.73×103CFU/mL,隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加,F(xiàn)TS內(nèi)弧菌總數(shù)增長速率高于RAS,且弧菌總數(shù)明顯高于RAS,在養(yǎng)殖中后期差異明顯,在養(yǎng)殖第70天,兩種養(yǎng)殖模式弧菌總數(shù)最大相差4.08×103CFU/mL。
圖4B顯示,隨著時(shí)間增加,兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)下細(xì)菌總數(shù)在初始時(shí)明顯較低,隨后持續(xù)增加。FTA和RAS水體中細(xì)菌總數(shù)變化差異顯著(P<0.05)。FTS水體中細(xì)菌總數(shù)明顯高于RAS,同時(shí)FTS水體中細(xì)菌增長速率RAS。
圖4 高鹽組(A)和低鹽組(B)養(yǎng)殖水體中弧菌總數(shù)、細(xì)菌總數(shù)變化
RAS在0~28 d細(xì)菌總數(shù)變化趨于平穩(wěn),28d以后細(xì)菌總數(shù)明顯增加,最高達(dá)到3.04×104CFU/mL。RAS水體中內(nèi)細(xì)菌總數(shù)變化較小,范圍在4.34×102~3.82×103CFU/mL之間。隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加,F(xiàn)TS水體中細(xì)菌總數(shù)增長速率高于RAS,且細(xì)菌總數(shù)明顯高于RAS系統(tǒng),在養(yǎng)殖第70天,細(xì)菌總數(shù)最大相差2.92×104CFU/mL。
對養(yǎng)殖水體各采樣點(diǎn)提取的水體DNA,選擇16S rDNA V4區(qū)域進(jìn)行擴(kuò)增子測序,高鹽度和低鹽度2套流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)分別標(biāo)記為FTS-A和FTS-B,3個(gè)采樣時(shí)間對應(yīng)的水體分別標(biāo)記為FTSA1、FTSA50和FTSA100;高鹽度和低鹽度2套循環(huán)水養(yǎng)殖池分別標(biāo)記為RAS-A和RAS-B,3個(gè)采樣時(shí)間的水體分別標(biāo)記為RASA1、RASA50和RASA100。樣品的覆蓋率(Good’s coverage)指數(shù)均超過99.9%(表1),說明本試驗(yàn)測序深度足夠大,足以覆蓋樣品的大多數(shù)微生物,測序的數(shù)據(jù)量合理[25]。
表1 樣品的細(xì)菌群落多樣性
圖5A結(jié)果顯示,高鹽組流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)(FTSA)水體中主要分布變形菌綱(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)和Campilobacteroa。FTSA水體中變形菌綱所占比例隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加不斷升高,水體中Campilobacteroa所占比例隨著養(yǎng)殖時(shí)間的推移逐漸減少;高鹽組循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)(RASA)水體中變形菌綱所占比例在第50天時(shí)略有減少,但在第100天時(shí)顯著增加。兩池相比較而言,養(yǎng)殖池FTSA水體中變形菌綱所占總細(xì)菌量的比例高于池RASA,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)的變形菌綱(Proteobacteria)種群演替速度慢于流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)。
圖5B屬水平結(jié)果顯示,在高鹽組養(yǎng)殖池FTSA養(yǎng)殖水體中,弧菌屬(Vibrio)為主要優(yōu)勢菌。RASA養(yǎng)殖水體中黃桿菌屬(Flavobacterium)和紅細(xì)菌科(Rhodobacteraceae)為優(yōu)勢菌。養(yǎng)殖池FTSA和養(yǎng)殖池RASA養(yǎng)殖水體中細(xì)菌組成結(jié)構(gòu)存在一定差異,在所采集的養(yǎng)殖水體中,養(yǎng)殖池FTSA水體中弧菌屬所占細(xì)菌總數(shù)比例隨時(shí)間的推移迅速升高,早期所占細(xì)菌總比例3.3%,養(yǎng)殖后期所占比例高達(dá)85.3%。池RASA養(yǎng)殖水體中弧菌屬比例較少。兩池相比較而言,養(yǎng)殖池FTSA水體中弧菌屬所占細(xì)菌總量比例均顯著高于養(yǎng)殖池RASA。
注:高鹽組流水式和循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)門(Phylum)水平(圖A)和屬水平(圖B)水體細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成
圖6A結(jié)果顯示低鹽組流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)(FTSB)水體中主要分布著變形菌綱(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)兩大類細(xì)菌。養(yǎng)殖池FTSB養(yǎng)殖水體中變形菌綱所占比例隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加不斷減少,水體中Epsilobacteraeota所占比例隨著養(yǎng)殖時(shí)間的推移逐漸增加;而低鹽組循環(huán)水養(yǎng)殖池(RASB)水體中變形菌綱所占比例在第50天時(shí)升高,在第100天時(shí)有所降低,但高于第1天所占比例,同樣養(yǎng)殖水體中Epsilobacteraeota在第100天時(shí)顯著增加。經(jīng)兩組養(yǎng)殖系統(tǒng)結(jié)果分析,兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)養(yǎng)殖水體中變形菌綱(Proteobacteria)為水體優(yōu)勢細(xì)菌。
圖6B同樣可以看出,在屬水平,低鹽組養(yǎng)殖池FTSB養(yǎng)殖水體中弧菌屬(Vibrio)為優(yōu)勢菌,而循環(huán)水養(yǎng)殖池RASB水體優(yōu)勢菌為紅細(xì)菌科(Rhodobacteraceae)、交替單胞菌屬(Alteromonas)和弧菌屬。
注:低鹽組流水式和循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)門(Phylum)水平(圖A)和屬水平(圖B)水體細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成
兩池養(yǎng)殖水體細(xì)菌組成結(jié)構(gòu)差異與組一基本相同,養(yǎng)殖池FTSB養(yǎng)殖水體中弧菌屬所占細(xì)菌總數(shù)比例隨時(shí)間的推移迅速升高。養(yǎng)殖池RASB養(yǎng)殖水體中弧菌屬所占比例在試驗(yàn)第1天和第50天時(shí)均比較小,在第100天時(shí)迅速升高。兩池相比較而言,養(yǎng)殖池FTSB水體中弧菌屬所占細(xì)菌總量比例均顯著高于養(yǎng)殖池RASB。兩組試驗(yàn)數(shù)據(jù)結(jié)果基本相同,兩池養(yǎng)殖水體中弧菌占細(xì)菌總數(shù)量的比例均隨養(yǎng)殖時(shí)間的增加而升高,但養(yǎng)殖池FTSB水體中弧菌數(shù)量和增長速度均高于養(yǎng)殖池RASB。
對養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落的Alpha多樣性(Alpha diversity)進(jìn)行分析,反映養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落物種豐度及多樣性。
結(jié)果顯示:試驗(yàn)第1天,RAS與FTS水體中細(xì)菌種群Chao1指數(shù)、ACE指數(shù)和Shannon指數(shù)均基本相同,表明試驗(yàn)起始養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落豐富及多樣性基本相同。試驗(yàn)第50天,高鹽組與低鹽組FTS水體細(xì)菌種群Chao1指數(shù)和ACE指數(shù)均高于對應(yīng)的RAS,表明在養(yǎng)殖中期,F(xiàn)TS水體中細(xì)菌群落豐富度與多樣性高于RAS。高鹽組在養(yǎng)殖第100天時(shí),RAS水體中ACE指數(shù)和Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)均有所升高,低鹽組則少量降低;FTS水體中ACE指數(shù)和Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)與第1天數(shù)值基本無顯著變化;RAS水體中細(xì)菌群落的多樣性高于FTS,其中對于RAS,Chao1指數(shù)的均值是1 136.189 3,而對于FTS是1 050.823 9。
隨后,為了進(jìn)一步解析兩種養(yǎng)殖模式水體細(xì)菌群落的差異性,對循環(huán)水養(yǎng)殖池和流水式養(yǎng)殖池養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落的測序結(jié)果進(jìn)行主坐標(biāo)分析(PCoA,Principal Co-ordinates Analysis)。
圖7A中PC1和PC2解釋了高鹽組養(yǎng)殖水體中細(xì)菌群落 54.47%和 23.92%的信息,兩主成分之和為78.39%,可以較好地代表樣品中的細(xì)菌群落信息。分析結(jié)果顯示:養(yǎng)殖期間3次采樣FTS與RAS距離均較遠(yuǎn),即表明FTS和RAS水體的細(xì)菌群落組成均存在較大差異。
圖7B中PC1和PC2解釋了低鹽組養(yǎng)殖水體中細(xì)菌群落 66.03%和 26.45%的信息,兩主成分之和大于90%,也較好地代表樣品中的細(xì)菌群落信息。分析結(jié)果顯示:在試驗(yàn)第1天與試驗(yàn)第50天,兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)距離較近,但在試驗(yàn)第100天時(shí)兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)距離較遠(yuǎn),表明在養(yǎng)殖前期兩種養(yǎng)殖水體的物種組成結(jié)構(gòu)越相似,細(xì)菌群落組成差異較小,但隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加,養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落組成產(chǎn)生較大差異。
圖7 高鹽組(圖A)和低鹽組(圖B)養(yǎng)殖水體細(xì)菌群落主坐標(biāo)分析(PCoA)
綜上結(jié)果表明:隨著養(yǎng)殖時(shí)間的增加,F(xiàn)TS與RAS內(nèi)的細(xì)菌群落差異逐漸產(chǎn)生明顯較大差異,細(xì)菌組成結(jié)構(gòu)逐漸不同。
對高鹽組和低鹽組FTS養(yǎng)殖水體中可培養(yǎng)細(xì)菌進(jìn)行培養(yǎng),共分離59株菌株,由圖8A可知可培養(yǎng)細(xì)菌中弧菌(Vibrio)所占比例達(dá)到61%,為可培養(yǎng)細(xì)菌的優(yōu)勢類群,芽孢桿菌(Bacillus)所占比例為12%,其次為不動(dòng)桿菌(Acinetobacter)、發(fā)光細(xì)菌(Photobacterium)、假單胞菌(Pseudomonas)、腸桿菌(Enterobacter)、希瓦菌屬(Shewanella),所占比例分別為7%、5%、3%、3%和3%。
對高鹽組和低鹽組RAS養(yǎng)殖水體中可培養(yǎng)細(xì)菌進(jìn)行培養(yǎng),共分離出34株菌株,由圖8B可知可培養(yǎng)細(xì)菌中腸桿菌(Enterobacter)所占比為18%,氣單胞菌(Aeromonas)、Klebsiella、弧菌(Vibrio)、海洋桿菌(Marinobacterium)所占比例均為9%。兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)中共培養(yǎng)可培養(yǎng)菌株93株,其中弧菌屬(Vibrio)為主要可培養(yǎng)菌株,所占比例為所有可培養(yǎng)菌株的41.9%,其次為腸桿菌(Enterobacter)和芽孢桿菌(Bacillus),占比均為8.6%。
圖8 流水式養(yǎng)殖水體(圖A)和循環(huán)水養(yǎng)殖水體(圖B)可培養(yǎng)細(xì)菌餅狀圖
本研究通過對循環(huán)水對蝦養(yǎng)殖系統(tǒng)和流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)全過程中水質(zhì)、弧菌總數(shù)和微生物種群結(jié)構(gòu)進(jìn)行了系統(tǒng)性分析。對蝦生長情況方面,F(xiàn)TS和RAS中的對蝦體質(zhì)量無顯著性差異(P>0.05),這與張龍等[13]結(jié)果一致。水質(zhì)方面,初始時(shí)FTS和RAS水體中氨氮、亞硝酸鹽氮和COD質(zhì)量濃度較低,隨著養(yǎng)殖時(shí)間增加,三者質(zhì)量濃度逐漸升高,養(yǎng)殖后期FTS水體中氨氮、亞硝酸鹽氮和COD質(zhì)量濃度明顯高于RAS,與索建杰等[1]、RAT等[26]結(jié)果一致?;【倲?shù)和細(xì)菌總數(shù)方面,兩種養(yǎng)殖模式下弧菌總數(shù)和細(xì)菌在初始時(shí)明顯較低,隨后弧菌和細(xì)菌總數(shù)持續(xù)增加。FTS下水體中弧菌總數(shù)和細(xì)菌總數(shù)明顯高于RAS,同時(shí)FTS水體中弧菌和細(xì)菌總數(shù)增長速率高于RAS。
門水平分析顯示變形菌綱(Proteobacteria)和擬桿菌門(Bacteroidetes)為水體優(yōu)勢細(xì)菌。屬水平主要為弧菌屬(Vibrio)、紅細(xì)菌科(Rhodobacteraceae)、交替單胞菌屬(Alteromonas)等。最后本研究對兩種系統(tǒng)的可培養(yǎng)菌株進(jìn)行了比較,在兩種養(yǎng)殖系統(tǒng)中得到可培養(yǎng)菌株93株,其中FTS水體中弧菌屬(Vibrio)為主要可培養(yǎng)菌株,所占比例為61%。而循環(huán)水系統(tǒng)腸桿菌(Enterobacter)所占比例為18%,為主要可培養(yǎng)菌株,通過可培養(yǎng)菌株可以看出FTS養(yǎng)殖水體中提高致病性的弧菌明顯高于RAS,從而降低系統(tǒng)穩(wěn)定性。結(jié)果顯示在FST和RAS兩種對蝦養(yǎng)殖模式中,在水體細(xì)菌群落種群結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性方面,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)優(yōu)于流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)。
Heyse等[27]初步研究了不同操作對凡納濱對蝦幼蝦階段微生物種群結(jié)構(gòu)的影響。通過對干飼料、輪蟲、藻類加入水體前后及換水前后微生物種群動(dòng)態(tài)變化進(jìn)行18 d監(jiān)測,結(jié)果顯示藻類和輪蟲為系統(tǒng)提供了新的細(xì)菌種群,其中有很大一部分有潛在病原菌,對病害發(fā)展進(jìn)程影響最大,而水體交換前后,微生物種群動(dòng)態(tài)變化并不顯著,并被認(rèn)為不是引入病害的主要原因[27]。本研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),在飼料等條件一致的情況下,F(xiàn)TS中的細(xì)菌群落穩(wěn)定性相比RAS較差,說明換水會(huì)對養(yǎng)殖系統(tǒng)水體細(xì)菌群落穩(wěn)定性造成一定的影響,這與Heyse等[27]結(jié)果不同,可能是本試驗(yàn)與其相比進(jìn)行了100 d的長期觀測,增加養(yǎng)殖周期從而觀察出對試驗(yàn)的影響。
本結(jié)果表明,隨著時(shí)間的推移,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中的微生物種群比流水式養(yǎng)殖下的微生物種群更穩(wěn)定,這與Vadstein等[28]提出的假設(shè)一致。最近的一項(xiàng)研究通過變性梯度凝膠電泳(PCR/DGGE)分析了16S rDNA基因序列,以比較一個(gè)流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)和一個(gè)循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)養(yǎng)殖水體和大西洋鱈魚幼蟲的細(xì)菌群落組成[29]?;贐ray-Curtis相似性的排序表明,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)樣本之間沒有明顯的分離;然而,在流水式養(yǎng)殖樣品中微生物群落組成發(fā)現(xiàn)了明顯的分離。此外,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中的Bray-Curtis相似性為75%,而流水式養(yǎng)殖中為20%~25%,這表明循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中的細(xì)菌群落更加穩(wěn)定。所有這些觀察結(jié)果都支持關(guān)于穩(wěn)定水質(zhì)參數(shù)將對微生物群落演替特征產(chǎn)生重要影響的微生物管理假說。
此外,本研究通過擴(kuò)增子測序還發(fā)現(xiàn),與傳統(tǒng)換水養(yǎng)殖模式相比,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)在一個(gè)對蝦養(yǎng)殖周期內(nèi)對弧菌的控制效果更好。這與之前的研究相符。例如楊勝遠(yuǎn)等[30]采用TCBS瓊脂平板菌落計(jì)數(shù)法對凡納濱對蝦循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)水體中弧菌的消長進(jìn)行了監(jiān)測。結(jié)果表明,與傳統(tǒng)換水養(yǎng)殖模式相比,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)對非O1群霍亂弧菌,溶藻弧菌和普通變形桿菌控制效果更好。在整個(gè)養(yǎng)殖過程中,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)弧菌和普通變形桿菌的數(shù)量均低于對蝦發(fā)病的閾值(104CFU/mL)[30-31]。這也很好地說明了循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中可以更好地減少病害的發(fā)生,以提高養(yǎng)殖效率及產(chǎn)量。
循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)中水質(zhì)參數(shù)在運(yùn)行過程中更加穩(wěn)定,循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)較流水式養(yǎng)殖系統(tǒng)相比能夠更好地維持水體中的細(xì)菌群落,突出了循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)在維持細(xì)菌群落穩(wěn)定性方面的優(yōu)勢,表明其可以通過提供良好的養(yǎng)殖環(huán)境,從而減少對蝦病害的發(fā)生,提高養(yǎng)殖效率及產(chǎn)量。
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