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2019年昆明市輸入性登革熱病例流行病學(xué)和病原學(xué)特征分析

2022-09-20 03:30:18王雪菲田榮陳志輝楊明東郭曉芳
關(guān)鍵詞:登革熱病伊蚊登革熱

王雪菲,田榮,陳志輝,楊明東,郭曉芳

1.云南省寄生蟲(chóng)病防治所,云南省蟲(chóng)媒傳染病防控重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,云南 普洱 665000;2.昆明市疾病預(yù)防控制中心

登革熱(dengue fever, DF)是由登革病毒(den‐gue virus, DENV)感染引起的蚊媒傳染病,傳播媒介主要為白紋伊蚊和埃及伊蚊[1]。登革病毒隸屬黃病毒科黃病毒屬,分為DENV-1、DENV-2、DENV-3和DENV-4四種血清型[2],其中,DENV-1分為5個(gè)基因型(Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型、Ⅳ型和Ⅴ型)[3],DENV-2則分為6 個(gè)基因型(Asian/American、Asian Ⅰ、Asian Ⅱ、Cosmopolitan、American 和 Sylvatic)[4]。登革熱廣泛流行于全球熱帶和亞熱帶國(guó)家或地區(qū),目前已有美洲、東地中海、西太平洋、歐洲、非洲和東南亞的100多個(gè)國(guó)家和地區(qū)報(bào)告了登革熱的流行[5],亞洲國(guó)家的疾病負(fù)擔(dān)占全球的70%[6],我國(guó)廣東、云南、福建、浙江等多省均有流行[1]。

云南省緊鄰老撾、緬甸和越南等登革熱廣泛流行的東南亞國(guó)家,是我國(guó)主要的登革熱流行地區(qū)之一,十余年來(lái),均有輸入性和(或)本地病例的報(bào)道[7-9]。昆明市作為云南省省會(huì)和我國(guó)溝通東南亞地區(qū)的主要交通樞紐之一,輸入性登革熱病例的報(bào)道也呈逐年上升趨勢(shì)[8,10-11],但有關(guān)血清型或基因型的研究較少,僅2013—2015年對(duì)昆明市輸入性登革熱病例開(kāi)展了E 基因序列分析,且分析的樣本量較少[12-13]。本研究分析了2019年昆明市輸入性登革熱病例的流行病學(xué)特征,同時(shí)對(duì)部分病例進(jìn)行了病毒血清型和基因型測(cè)定,并對(duì)所得序列進(jìn)行進(jìn)化分析,為昆明市輸入性登革熱的防控提供流行病學(xué)和病原學(xué)依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 資料來(lái)源 按照《全國(guó)登革熱監(jiān)測(cè)方案》對(duì)2019 年昆明市輸入性登革熱病例(包括實(shí)驗(yàn)室診斷病例和臨床診斷病例)開(kāi)展個(gè)案調(diào)查,病例的診斷依據(jù)為《登革熱診斷》(WS 216—2018)[14]。病例個(gè)案調(diào)查以問(wèn)卷調(diào)查的形式開(kāi)展,問(wèn)卷變量包括病例姓名、性別、年齡、職業(yè)、登革熱疫區(qū)旅居史等。

1.2 病毒血清分型 采集2019年1—6月昆明市部分輸入性登革熱病例血清樣本,采用美國(guó)公司生產(chǎn)的Cortez NS1 抗原檢測(cè)試劑作為病例臨床診斷試劑,NS1 抗原陽(yáng)性血清樣本采集后置于-20 ℃冰箱保存,隨后冷鏈運(yùn)輸至實(shí)驗(yàn)室,-80 ℃保存待檢。采用天隆科技(西安)有限公司生產(chǎn)的半自動(dòng)核酸提取儀和病毒DNA/RNA 提取試劑盒(磁珠法)提取病毒RNA,獲得的RNA 立即用于后續(xù)試驗(yàn),剩余RNA-80 ℃保存。分型引物和探針參考《登革熱診斷》(WS 216—2018)[14]設(shè)計(jì)合成。采用實(shí)時(shí)熒光RT-PCR對(duì)待測(cè)樣本進(jìn)行血清型測(cè)定。

1.3 E 基因測(cè)定及進(jìn)化分析 采用天根反轉(zhuǎn)錄試劑盒將提取的RNA 逆轉(zhuǎn)錄合成得到病毒第一鏈cDNA。參考有關(guān)文獻(xiàn)[7]設(shè)計(jì)合成DENV-1 和DENV-2 E 基因擴(kuò)增引物,以上述步驟合成的cDNA為模板進(jìn)行E 基因序列擴(kuò)增,PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行1.5%瓊脂糖凝膠電泳,陽(yáng)性擴(kuò)增產(chǎn)物送測(cè)序公司進(jìn)行雙向測(cè)序以獲得相應(yīng)E基因序列。測(cè)序結(jié)果使用DNAStar 軟件下的SeqMan 模塊進(jìn)行序列拼接,所得序列在NCBI網(wǎng)站的Blast進(jìn)行比對(duì)并選取相似性最高的序列。進(jìn)化分析所用的參考序列均下載自NCBI 數(shù)據(jù)庫(kù),包括比對(duì)后選取的相似序列、云南省近年流行株、柬埔寨近年流行株、泰國(guó)近年流行株和各基因型代表序列。采用ClustalW 軟件進(jìn)行多序列比對(duì),Mega 軟件構(gòu)建Neighbor-Joining 進(jìn)化樹(shù),進(jìn)化樹(shù)構(gòu)建采用Kirmura2-parameter 模型,bootstrap設(shè)置為1 000。

1.4 統(tǒng)計(jì)分析 采用Excel 2019 建立數(shù)據(jù)庫(kù),并進(jìn)行描述性分析。

2 結(jié) 果

2.1 總體情況 2019 年昆明市共報(bào)告輸入性登革熱病例400 例。其中,實(shí)驗(yàn)室診斷病例55 例,占13.75%;臨床診斷病例345例,占86.25%。

2.2 流行病學(xué)特征

2.2.1 來(lái)源地分布 境外輸入297 例(占74.25%),以東南亞國(guó)家為主,柬埔寨(187例)、緬甸(38例)和老撾(28 例)為主要來(lái)源國(guó);境內(nèi)輸入99 例(占24.75%),以云南省西雙版納(93例)輸入為主;未知來(lái)源地4例(占1.00%)。見(jiàn)表1。

表1 2019年昆明市輸入性登革熱病例來(lái)源地分布

2.2.2 時(shí)間分布 2019 年昆明市全年均有輸入性登革熱病例報(bào)告,5—10 月為輸入性病例報(bào)告高峰,其中10月病例數(shù)最多,占20.75%(83/400)。見(jiàn)圖1。

2.2.3 人群分布 400例輸入性登革熱病例中男性267 例,女性 133 例,男女性別比為 2.01∶1。各年齡組均有報(bào)告病例,年齡最小6 月,最大83 歲,其中,20~29 年齡組報(bào)告病例數(shù)最多,共135 例(占33.75%)。職業(yè)以家務(wù)及待業(yè)人員、商業(yè)服務(wù)人員、干部職員、農(nóng)民和工人為主,分別為78 例(占19.50%)、56例(占14.00%)、52例(占13.00%)、46例(占11.50%)和43例(占10.75%)。見(jiàn)表2。

表2 2019年昆明市輸入性登革熱病例人群分布

2.3 DENV 血清分型 共采集DENV NS1 抗原陽(yáng)性輸入性病例血清60 例,輸入地分別為柬埔寨(49例,占81.67%)、老撾(1 例,占1.67%)、緬甸(3 例,占5.00%)、越南(3例,占1.67%)、泰國(guó)(1例,占1.67%)和非洲國(guó)家(3例,占5.00%)。DENV 核酸檢測(cè)陽(yáng)性34 例,其中輸入來(lái)源為柬埔寨的32 例(28 例為DENV-1 型,4 例為 DENV-2 型),越南 1 例(DENV-2型),泰國(guó)1例(DENV-1型)。

2.4 DENV 基因分型和 E 基因進(jìn)化分析 34 例DENV 核酸檢測(cè)陽(yáng)性樣本擴(kuò)增得到6 條DENV-1 E基因序列(5 條源自柬埔寨,1 條源自泰國(guó))和2 條DENV-2 E基因序列(均源自柬埔寨)。

6 條DENV-1 E 基因序列核苷酸相似性為96.63%~100.00%,與選取參考序列的進(jìn)化分析結(jié)果顯示,6株DENV-1均屬于基因Ⅰ型,分別位于3個(gè)不同的進(jìn)化分支(Lineage 1、Lineage 2 和Lineage 3)。各序列分別有與其在遺傳上高度相似的毒株,Lin‐eage 1 分支中KM67 和KM71 E 基因序列分別和2019年廣東柬埔寨輸入株(MN921287、MN921259)同源性最高,核苷酸相似性分別為100.00%和99.93%,而KM68 E 基因序列則和2019 年老撾流行株(MW228042)同源性最高,核苷酸相似性為100.00%;Lineage 2 分支中,KM36 和 KM37 E 基因序列和2019 年南昌株(MN894235)同源性最高,核苷酸相似性為100.00%;Lineage 3分支中,泰國(guó)輸入性病例的病毒KM7 E 基因序列與2019 年上海株(MT856309)和2018 年泰國(guó)流行株(MN955621)同源性最高,核苷酸相似性分別為99.87%和99.66%。見(jiàn)圖2。

2 條DENV-2 E 基因序列核苷酸相似性為99.73%,與參考序列的進(jìn)化分析結(jié)果顯示,2條序列均屬AsianⅠ基因型,KM28 和KM61 E 基因序列分別與2019 年廣東柬埔寨輸入株(MN923115、MN915188)同源性最高,核苷酸同源性均為99.93%。見(jiàn)圖3。

3 討 論

通過(guò)對(duì)2019 年昆明市輸入性登革熱病例的流行病學(xué)特征分析發(fā)現(xiàn),該地登革熱病例以境外輸入為主,占總病例數(shù)的74.25%,主要輸入來(lái)源為柬埔寨、緬甸和老撾等登革熱疫情高發(fā)的東南亞國(guó)家。其中,柬埔寨是2019年昆明市輸入性病例的主要來(lái)源國(guó),占總輸入性病例數(shù)的46.75%,這可能與2019年柬埔寨登革熱疫情嚴(yán)重,報(bào)告病例數(shù)大幅超過(guò)去年同期[15],且昆明與柬埔寨間的人員往來(lái)日益頻繁等因素有關(guān)。輸入性登革熱病例全年均有報(bào)道,報(bào)告高峰為5—10 月,要早于云南省登革熱高發(fā)季節(jié)(8—11月)[16],這可能與柬埔寨等東南亞國(guó)家登革熱流行季節(jié)在5—10 月有關(guān)[17-19]。輸入性病例男性多于女性,職業(yè)以家務(wù)及待業(yè)人員、商業(yè)服務(wù)人員、干部職員、農(nóng)民和工人為主,提示該類人群為昆明市登革熱防控的重點(diǎn)人群。

本研究共檢測(cè)出2 個(gè)血清型和2 種基因型,2 種基因型均屬東南亞地區(qū)流行的優(yōu)勢(shì)基因型[20-22],系統(tǒng)進(jìn)化分析也發(fā)現(xiàn)本研究序列和東南亞流行株、我國(guó)東南亞輸入株高度同源。由于周邊國(guó)家登革熱廣泛流行,我國(guó)廣東、云南、福建、浙江等地也多次報(bào)告了來(lái)自東南亞國(guó)家的輸入性病例,且部分省份暴發(fā)了由輸入性病例引起的本土聚集性疫情[23-27]。昆明市是連接我國(guó)與東南亞國(guó)家的重要門(mén)戶,便利的交通為東南亞國(guó)家登革熱病例的輸入提供了渠道。2019 年昆明市未發(fā)生由輸入性病例引起的本地散發(fā)、暴發(fā),且無(wú)本地登革熱病例報(bào)告,這主要?dú)w因于該地對(duì)輸入性病例的早發(fā)現(xiàn)、早診斷和早隔離。登革熱傳播媒介白紋伊蚊在云南省廣泛分布[28],昆明市也有監(jiān)測(cè)到伊蚊的相關(guān)報(bào)道[29-30],雖然昆明市伊蚊密度較低且暫未發(fā)現(xiàn)優(yōu)勢(shì)蚊種埃及伊蚊[31],但仍存在由輸入性病例引起本地登革熱暴發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)。

研究結(jié)果提示,對(duì)境內(nèi)外輸入性病例的監(jiān)測(cè)依然是昆明市登革熱防控工作的重點(diǎn),應(yīng)密切關(guān)注東南亞地區(qū)登革熱流行形勢(shì),提前做好昆明市登革熱防控工作部署。同時(shí),需加強(qiáng)對(duì)疫情高發(fā)國(guó)家往來(lái)重點(diǎn)人群的監(jiān)測(cè),提高輸入性病例的發(fā)現(xiàn)和報(bào)告能力,及時(shí)處置輸入性疫情,防止由輸入性病例引起的本地登革熱疫情暴發(fā)。

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