武岳,張夢迪,李君,王冬雪,白圖雅,呂曉麗,胡玉霞,高峰,周樹宏,李京慧,范興業(yè),常福厚,王光*(.內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)附屬醫(yī)院,呼和浩特 0000;.內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)藥學(xué)院,呼和浩特 000;3.內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)新藥安全評價研究中心,呼和浩特 000;4.內(nèi)蒙古自治區(qū)新藥篩選工程研究中心,呼和浩特 000;5.內(nèi)蒙古醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,呼和浩特 000;6.上海中醫(yī)藥大學(xué)交叉科學(xué)研究院,上海 00)
肝癌是世界上常見的惡性腫瘤之一,我國肝癌的發(fā)病率和病死率均居世界首位[1]。肝癌的發(fā)生也和其他腫瘤一樣是環(huán)境因素和遺傳因素共同作用的結(jié)果,已有研究表明腫瘤相關(guān)基因啟動子異常甲基化可以作為腫瘤發(fā)生的敏感生物標(biāo)志物[2-3]。
DNA 甲基化為DNA 化學(xué)修飾的一種形式,能夠在不改變DNA 序列的前提下,改變遺傳表現(xiàn)。脆性組氨酸三聯(lián)體(fragile histidinetriad,F(xiàn)HIT)基因是一個抑癌基因[4]。T-鈣黏蛋白(T-cadherin/H-cadherin,CDH13)是非典型的鈣黏素家族中的一員[5]。研究表明FHIT、CDH13可能成為惡性腫瘤風(fēng)險評估和監(jiān)測預(yù)后的新的分子生物學(xué)標(biāo)志物[6]。此外,本課題組前期研究發(fā)現(xiàn)FHIT、CDH13基因甲基化在肝癌患者中高表達(dá),提示FHIT、CDH13基因甲基化可能與肝癌的發(fā)生發(fā)展關(guān)系密切[7]。
苯并芘[benzo(a)pyrene,BaP]是一種常見的環(huán)境污染物。在流行病學(xué)研究中,環(huán)境中高水平的BaP 暴露會增加肝細(xì)胞癌(human hepatocellular carcinoma,HCC)的風(fēng)險,表明BaP 可能是誘發(fā)HCC 的原因之一[8]。但是關(guān)于BaP 作用于HepG2細(xì)胞對FHIT、CDH13基因啟動子區(qū)甲基化的影響尚未見報道。本研究選取DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑5-氮雜-2'-脫氧胞苷(5-Aza-2'-deoxycytidine,5-Aza-CdR)作為陽性對照,通過MSP 法檢測BaP 對FHIT、CDH13基因甲基化的情況,同時采用RT-qPCR 和Western blot 法檢測BaP 對FHIT、CDH13、DNMT1、Sp1 mRNA 和蛋白表達(dá)的影響并對其機(jī)制進(jìn)行初步探討,為肝癌分子標(biāo)記物的篩選及致癌機(jī)制的探討提供參考。
BaP(美國Sigma 公司),DMEM 高糖培養(yǎng)基、胎牛血清(美國Gibco 公司),DNA 提取酚試劑(中國Solarbio 公司),5-Aza-CdR(中國上海源葉公司),EZ DNA Methylation-Gold 試劑盒(中國南京博爾迪生物有限公司),甲基化特異性PCR 試劑盒(中國天根生化科技有限公司),F(xiàn)HIT、CDH13、DNMT1、Sp1 和β-actin 兔單克隆抗體(英國Abcam 公司),RevertTra Ace qPCR RT kit、SYBR Green Realtime PCR Master Mix試劑盒(日本TOYOBO 公司)。人肝癌細(xì)胞株HepG2(北京協(xié)和基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)研究所)。
人肝癌HepG2 細(xì)胞培養(yǎng)于含10%胎牛血清的DMEM 培養(yǎng)基中,置于含5% CO2的37℃培養(yǎng)箱中常規(guī)培養(yǎng),倒置顯微鏡觀察細(xì)胞生長情況,當(dāng)細(xì)胞達(dá)到80%~90%融合時,胰蛋白酶消化制成細(xì)胞懸液后以適當(dāng)?shù)拿芏冉臃N于細(xì)胞培養(yǎng)6 孔板中并搖勻。選取DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑5-Aza-CdR 作為陽性對照組,實驗分為對照組、陽性對照組及不同濃度BaP(0.1、1、10 μmol·L-1)組。分別用0.1、1、10 μmol·L-1BaP,5-Aza-CdR 處理細(xì)胞24 h,對照組不加任何藥物處理。然后收集細(xì)胞進(jìn)行下一步的檢測實驗。
采用酚氯仿法提取DNA,根據(jù)DNA Methylation-Gold 試劑盒說明書對DNA 進(jìn)行甲基化修飾,并進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增引物見表1,PCR 條件如下:變性(95 ℃,5 min),退火(94℃ 20 s、64℃ 30 s、72 ℃ 20 s,35 個循環(huán)),延伸(72 ℃10 min)。PCR 產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠中電泳分析,應(yīng)用UVP 凝膠成像系統(tǒng)觀察電泳結(jié)果。
表1 MSP 中FHIT、CDH13 基因的引物序列、產(chǎn)物片段大小及退火溫度Tab 1 Primer sequences of FHIT and CDH13 genes in MSP,product fragment size and annealing temperature
將細(xì)胞按“2.1”項下方法處理后,收集細(xì)胞,按RNA 提取試劑盒提取細(xì)胞總RNA,使用Nanodrop2000 測定RNA 純度及濃度,根據(jù)反轉(zhuǎn)錄試劑盒說明書合成cDNA。引物序列見表2,使用RT-qPCR 法進(jìn)行擴(kuò)增,反應(yīng)程序如下:95℃2 min,90℃ 20 s,55 ℃ 30 s,68 ℃ 50 s(40 個循環(huán)),采用2-△△CT法計算檢測基因mRNA 的相對表達(dá)量,實驗重復(fù)3 次。
表2 FHIT、CDH13、DNMT1 及Sp1 基因的引物序列Tab 2 Primer sequence of FHIT,CDH13,DNMT1,and Sp1 gene
將細(xì)胞處理24 h 后,蛋白裂解液裂解細(xì)胞提取各組細(xì)胞總蛋白,BCA 法測定蛋白質(zhì)濃度,定量后進(jìn)行 SDS-PAGE 垂直電泳,濕法PVDF 轉(zhuǎn)膜,封閉液封閉20 min,在4℃下一抗(1∶5000)孵育過夜,TBST 清洗3 次,二抗避光孵育1 h,紅外熒光掃描成像系統(tǒng)檢測,掃描后應(yīng)用Image J軟件進(jìn)行分析。
采用SPSS 22.0 對數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析,計量資料組間差異采用單因素方差分析法進(jìn)行檢驗,數(shù)據(jù)采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)來表示,并采用Graphpad Prism 統(tǒng)計分析軟件作圖,P<0.05 表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
FHIT基因擴(kuò)增對接基因中原始序列的位置為:195—283(來自GenBank 序列號U76263),甲基化島5 個[9]。CDH13擴(kuò)增對接基因中原始序列的位置為-265—-247,甲基化島6 個[10]。采用MSP 法檢測不同濃度的BaP(0、0.1、1、10 μmol·L-1)處理24 h 后的HepG2 細(xì)胞,結(jié)果顯示陽性對照組(5-Aza-CdR 組)中CDH13、FHIT基因呈現(xiàn)非甲基化狀態(tài),隨著BaP 濃度增加,F(xiàn)HIT、CDH13基因甲基化條帶(M 條帶)亮度逐漸增強(qiáng),而非甲基化條帶(U 條帶)亮度逐漸減弱,且均呈劑量依賴性,高劑量組呈現(xiàn)完全甲基化狀態(tài)(見圖1)。表明BaP可促進(jìn)FHIT、CDH13基因啟動子區(qū)域的甲基化。
圖1 FHIT 基因(A)和CDH13 基因(B)MSP 電泳圖Fig 1 MSP electropherogram of FHIT genes (A) and CDH13 genes (B)
將對照組中FHIT、CDH13、DNMT1、Sp1mRNA 表達(dá)量設(shè)置為1,與對照組比較(見圖2),陽性對照組FHIT、CDH13、DNMT1、Sp1mRNA及BaP 1 μmol·L-1和10 μmol·L-1組中FHIT、CDH13、DNMT1、Sp1的表達(dá)差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05,P<0.001)。結(jié)果表明BaP 中、高劑量組可以顯著下調(diào)FHIT、CDH13mRNA 表達(dá)量,而上調(diào)DNMT1、Sp1mRNA 表達(dá)量。
圖2 不同濃度BaP 處理后FHIT、CDH13、DNMT1 及Sp1 基因mRNA 表達(dá)的情況(n =3)Fig 2 mRNA expression of FHIT,CDH13,DNMT1 and Sp1 at different concentrations of BaP(n =3)
與對照組相比,BaP 0.1 μmol·L-1蛋白表達(dá)雖降低,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),陽性對照組表達(dá)顯著升高(P<0.05)。BaP 1 μmol·L-1和10 μmol·L-1組較對照組FHIT、CDH13 蛋白表達(dá)顯著減低,而DNMT1、Sp1 蛋白表達(dá)顯著增加(見圖3)(P<0.05)與RT-qPCR 結(jié)果一致。表明BaP 可能通過增加DNMT1、Sp1 蛋白表達(dá)而抑制FHIT、CDH13 蛋白表達(dá)。
圖3 不同濃度BaP 處理后FHIT、CDH13、DNMT1 及Sp1 基因蛋白表達(dá)的情況(n =3)Fig 3 Protein expression of FHIT,CDH13,DNMT1 and Sp1 at different concentrations of BaP(n =3)
DNA 甲基化是重要的表觀遺傳修飾方式之一,參與調(diào)節(jié)胚胎發(fā)育、轉(zhuǎn)錄、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)、X染色體失活、基因組印記和染色體穩(wěn)定等多項生命活動[11]。近年來國內(nèi)外學(xué)者對FHIT、CDH13基因甲基化與肝癌的關(guān)系進(jìn)行了大量的研究,研究表明FHIT、CDH13基因甲基化與惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[12]。此前,Tuoya 等[7]的實驗也證實了FHIT、CDH13基因在肝癌患者中呈現(xiàn)高甲基化狀態(tài)。BaP 是國際公認(rèn)的環(huán)境污染物,被列為Ⅰ類致癌物,已有研究報道BaP 可以促進(jìn)肝癌的發(fā)生和進(jìn)展[13],但其具體機(jī)制尚未清晰。Jiang 等[14]研究發(fā)現(xiàn),BaP 誘導(dǎo)的DNA 甲基化改變可能會導(dǎo)致與空氣污染相關(guān)肺癌中異常的DNA 甲基化,這些DNA 甲基化改變可能影響肺癌的發(fā)生和進(jìn)展。本實驗以DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑5-Aza-CdR 為陽性對照組,通過采用甲基化特異性PCR 法檢測不同濃度BaP 作用于HepG2細(xì)胞后FHIT、CDH13基因的甲基化情況,結(jié)果表明BaP 可增強(qiáng)FHIT、CDH13基因甲基化水平,且具有濃度依賴性,本實驗結(jié)果佐證了之前的研究內(nèi)容也彌補(bǔ)了的BaP 對HepG2 細(xì)胞內(nèi)的FHIT、CDH13甲基化水平的研究空白。
DNA 甲基化和去甲基化可通過DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶(DNMT)進(jìn)行調(diào)控,兩個 DNMT 家族 DNMT3和 DNMT1 分別負(fù)責(zé)甲基化的建立和維持[15]。Robert 等[16-17]研究發(fā)現(xiàn)DNMT1 和DNMT3b 協(xié)同作用抑制腫瘤的CpG 島高甲基化。DNMT1 負(fù)責(zé)將己經(jīng)發(fā)生變化的基因DNA 甲基化信息傳遞于子代細(xì)胞,使得異常DNA 甲基化模式繼續(xù)發(fā)生和延續(xù)[18]。Leu 等[19]在卵巢癌的研究中,沉默DNMT1后3 個無活性TWIST、RASSF1A和HIN-1基因發(fā)生部分去甲基化,并恢復(fù)了基因的表達(dá)。本實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn)隨著BaP 濃度的升高,DNMT1 的蛋白及mRNA 表達(dá)逐漸增加,高劑量組BaP 對DNMT1蛋白及mRNA 表達(dá)增加最為明顯,但抑癌基因FHIT、CDH13無論是蛋白表達(dá)還是mRNA 表達(dá)都逐漸減少,表明BaP 可能通過顯著增加甲基化轉(zhuǎn)移酶DNMT1 的活性使FHIT、CDH13表達(dá)減少,從而發(fā)揮促甲基化的作用。
DNMT1 活性的改變與其表達(dá)水平和功能性激活有關(guān),其表達(dá)水平主要受核轉(zhuǎn)錄因子Sp1的調(diào)控。Song 等[20]研究發(fā)現(xiàn)DNA 甲基轉(zhuǎn)移酶DNMT1 與Sp1 結(jié)合并引起一些Sp1靶基因的抑制,同時Sp1 還可以通過與DNMT1 相互作用而促進(jìn)特定位點的甲基化[21]。為了進(jìn)一步探究BaP 抑制DNMT1 表達(dá)的機(jī)制,采用RT-qPCR、Western blot 法對其進(jìn)行驗證,結(jié)果表明BaP 暴露后,細(xì)胞中Sp1mRNA 與蛋白表達(dá)均顯著增高。有研究指出對DNMT1 的表達(dá)抑制機(jī)制可能是通過抑制Sp1 的活性而實現(xiàn)的[22]。由于Sp1 在DNMT1 上有結(jié)合位點,所以BaP 可能通過上調(diào)Sp1 蛋白與mRNA 的表達(dá)發(fā)揮促進(jìn)作用,可能最終會導(dǎo)致DNMT1 的活性增強(qiáng),從而促進(jìn)FHIT、CDH13基因甲基化作用。
綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)BaP 可能會通過增強(qiáng)Sp1 促進(jìn)DNMT1 活性,調(diào)控FHIT、CDH13基因甲基化表達(dá),影響FHIT、CDH13基因的表達(dá)水平,從而發(fā)揮促甲基化作用。但BaP 如何調(diào)控Sp1和DNMT1 及其下游信號通路有待進(jìn)一步研究。