采用免疫檢查點阻斷的癌癥治療(ICB),通常會誘發(fā)免疫相關的不良事件(irAEs)。研究人員假設在腫瘤和正常細胞中共表達的蛋白可能是irAEs中的抗原靶點,并在此描述了用于鑒定它們的DITAS(腫瘤相關自身抗原的發(fā)現(xiàn))?;趩螛颖净蚣患治?,DITAS計算了肺腫瘤和健康肺組織之間的轉(zhuǎn)錄相似性。
本研究鑒定了10個在肺腫瘤中高度表達的肺組織特異性基因。將計算分析與功能性T細胞分析和抗原特異性T細胞的單細胞RNA測序相結(jié)合,以驗證肺腫瘤自身抗原。在接受ICB治療的非小細胞肺癌(NSCLC)患者中,napsin A是一種自身抗原,可引發(fā)強烈的CD8+T細胞應答,與無應答者相比,ICB應答者攜帶這些CD8+T細胞的頻率更高。源于napsin A的人白細胞抗原(HLA)I類配體存在于人肺腫瘤和非腫瘤肺組織中,napsin A四聚體證實了非小細胞肺癌患者血液和腫瘤中存在napsin A特異性CD8+T細胞。Napsin A特異性T細胞克隆型在肺腫瘤和ICB誘導的炎癥性肺損傷中富集,并且可以離體殺死永生化的與HLA匹配的NSCLC細胞。單細胞RNA測序顯示這些T細胞克隆型表達促炎細胞因子和細胞毒性標志物。
因此,DITAS成功鑒定了自身抗原,包括napsin A,它們可能在NSCLC中介導有效的抗腫瘤T細胞反應,并可能同時支持肺irAEs。