蘇文悅 李 鑫 褚雄燕 包 才 何旻霞 黃澤軍 國艷梅 王孝宣 杜永臣 劉 磊李君明*
(1中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所,蔬菜生物育種全國重點實驗室,北京 100081;2新疆康美瑞農(nóng)業(yè)發(fā)展有限公司,新疆昌吉 831502)
我國鹽漬土總面積占可利用土地的4.88%,6.62%的耕地出現(xiàn)鹽漬化問題(楊勁松,2008)。土壤鹽堿化和次生鹽堿化限制作物生長,降低土地利用率,已成為我國農(nóng)業(yè)發(fā)展的重要障礙。同時,淡水資源的逐年減少,也迫使作物耐鹽堿遺傳改良愈加重要(陳皓煒 等,2021;劉東讓 等,2021)。
植物耐鹽能力具有階段特異性,即不同發(fā)育階段的耐鹽性無顯著關(guān)聯(lián)(Foolad &Chen,1999),植物芽期和苗期對鹽脅迫更為敏感(代明龍 等,2015)。目前絕大多數(shù)耐鹽堿研究集中在植物苗期或成株期,如已在擬南芥、水稻、番茄等模式植物中定位到許多調(diào)控植株苗期響應(yīng)鹽脅迫和調(diào)控植株耐鹽性的轉(zhuǎn)錄因子(Lu et al.,2011;Neily et al.,2011;Xie et al.,2011;Yang et al.,2019;Wang et al.,2020)。研究還發(fā)現(xiàn),相同的基因參與了番茄種子在低溫、鹽脅迫、干旱脅迫下萌發(fā)率的加性效應(yīng),在脅迫條件下選擇發(fā)芽率高的材料能夠更顯著地提高非脅迫條件下的發(fā)芽率(Foolad et al.,2003a),因此芽期耐鹽性研究不僅具有實際應(yīng)用價值,而且能為深入揭示作物的耐鹽機制提供必要的科學(xué)依據(jù)。
大多數(shù)栽培種番茄在生長發(fā)育階段對鹽脅迫具有中等耐性(Foolad,2004),而野生種則表現(xiàn)更好的耐鹽性,是番茄作物耐鹽遺傳改良的寶貴資源(Jones,1986)。在鹽、低溫等非生物脅迫條件下,番茄野生資源種子快速萌發(fā)的能力主要由多基因控制,表現(xiàn)為加性遺傳效應(yīng)(Foolad &Jones,1991),目前已在潘那利番茄(Solanum pennellii)LA0716、醋栗番茄(S.pimpinellifolium)LA0722等野生資源中定位了耐鹽QTL(Foolad et al.,1998;Foolad et al.,2007),但相關(guān)研究僅集中在有限的遺傳資源,對野生資源的廣泛挖掘十分有限。
野生醋栗番茄資源廣泛分布于南美不同區(qū)域,具有豐富的遺傳多樣性,表現(xiàn)較好的耐鹽能力,與栽培種可以直接雜交轉(zhuǎn)育。中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所番茄遺傳育種課題組收集了來自全球的600 余份野生醋栗番茄遺傳資源,對每份資源進行了多代嚴格自交純化,并基于全基因組數(shù)據(jù)信息,分析了該遺傳群體,構(gòu)建了41 份醋栗番茄核心種質(zhì)。通過對其芽期耐鹽性進行評價,以期深入了解醋栗番茄資源耐鹽的遺傳多樣性,為番茄耐鹽遺傳改良提供信息。
試驗于2020 年9 月至2021 年1 月在中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蔬菜花卉研究所組培室中進行。試驗材料包括41 份野生醋栗番茄核心種質(zhì),分別來自美國番茄遺傳資源中心(TGRC)、亞洲蔬菜研究中心(AVRDC)和荷蘭遺傳資源中心(NL CGN)(表1)。對照為栽培種番茄Moneymaker(核心種質(zhì)編號MM)和M82,來自TGRC。
表1 41 份醋栗番茄核心種質(zhì)信息
1.2.1 種子滅菌 參照Foolad 等(2003b)的滅菌方法,用0.5% NaClO 溶液浸泡種子,表面滅菌10 min 后,用無菌水沖洗3 次,去除種子表面殘留的NaClO,之后用無菌濾紙擦拭滅菌后的種子,吸干種子表面水分,以上全部操作在超凈工作臺進行。
1.2.2 種子催芽 采用紙床發(fā)芽法(劉冰 等,2010),在直徑90 mm 塑料培養(yǎng)皿中墊入兩張無菌濾紙制備雙層濾紙培養(yǎng)基,每個鹽處理加入5 mL 150 mmol·L-1NaCl 溶液;每個非鹽脅迫處理加入5 mL 無菌水。種子用10%商業(yè)漂白劑溶液表面消毒10 min,然后用無菌蒸餾水沖洗。每份材料取50 粒種子放置于雙層濾紙培養(yǎng)皿中,每個培養(yǎng)皿為1 個重復(fù),每處理共設(shè)3 次重復(fù)。將培養(yǎng)皿放置于(25 ± 1)℃恒溫黑暗條件下對種子進行催芽,催芽周期為14 d(葉鑫 等,2021)。
以胚芽萌發(fā)長度達到種子長度1/2 為發(fā)芽標準(范翠枝 等,2021),每隔12 h 記錄種子發(fā)芽粒數(shù),連續(xù)觀測14 d,統(tǒng)計相對發(fā)芽率??紤]到參試種子中存在無活力種子,以非鹽脅迫下種子發(fā)芽粒數(shù)作為參試種子數(shù),計算不同種質(zhì)的相對發(fā)芽率。以番茄栽培種Moneymaker、M82 為對照,分析醋栗番茄各種質(zhì)間相對發(fā)芽率、耐鹽性的差異。
1.2.3 進化樹分析 課題組前期已對41 份醋栗番茄核心種質(zhì)進行了全基因組重測序(由貝瑞和康生物技術(shù)有限公司于2019 年完成),平均測序深度為10 ×。2 份栽培種番茄重測序數(shù)據(jù)為已發(fā)表的公共數(shù)據(jù)(Zhu et al.,2018)。挑選均勻分布于全基因組上的10 000 個高質(zhì)量SNPs 進行聚類分析,構(gòu)建進化樹。
利用Microsoft Excel 2016 軟件整理試驗數(shù)據(jù),利用SAS 9.4 軟件對相對發(fā)芽率進行方差分析;利用FastTree 軟件構(gòu)建進化樹,并用iTOL 軟件對進化樹進行美化。
2.1.1 醋栗番茄核心種質(zhì)發(fā)芽結(jié)果 在無菌水非鹽脅迫條件下,栽培番茄(Moneymaker、M82)和醋栗番茄野生種質(zhì)普遍于24~48 h 內(nèi)開始萌發(fā),132 h 內(nèi)基本完全萌發(fā)(圖1)。而在150 mmol ·L-1NaCl 脅迫條件下,栽培番茄Moneymaker 和M82 分別于192 h 和132 h 開始萌發(fā);醋栗番茄在48~132 h 內(nèi)開始萌發(fā),一直到300 h 仍有種子萌發(fā)(圖2)。由此可以明顯看出,在鹽脅迫下栽培番茄和醋栗番茄的萌發(fā)均明顯推遲,萌發(fā)整齊度明顯下降,且栽培番茄Moneymaker 的萌發(fā)速度明顯較醋栗番茄更慢。N5、N7、N23、N27、N31、N34、N35、N38、N39、N41 等10 份材料在鹽脅迫下5 d 內(nèi)種子發(fā)芽粒數(shù)較多,且萌發(fā)整齊度高。其中N27、N34、N35、N38、N39 等5 份種質(zhì)在第5 天的相對發(fā)芽率達到45%以上,特別是N35、N39 種質(zhì)在150 mmol·L-1NaCl 鹽脅迫下仍能在60 h 內(nèi)開始萌發(fā),并分別于228 h 和108 h 相對發(fā)芽率達到97%,萌發(fā)時間明顯早于其他材料,具有優(yōu)異的芽期耐鹽性狀。
圖1 非鹽脅迫條件下醋栗番茄核心種質(zhì)發(fā)芽情況
圖2 鹽脅迫條件下醋栗番茄核心種質(zhì)發(fā)芽情況
2.1.2 醋栗番茄核心種質(zhì)相對發(fā)芽率及芽期耐鹽性鑒定結(jié)果 對兩個栽培種Moneymaker、M82 和41份野生醋栗番茄核心種質(zhì)進行芽期耐鹽性比較,發(fā)現(xiàn)Moneymaker 和M82 在150 mmol·L-1NaCl 脅迫下的相對發(fā)芽率分別為28.67%和38.67%,無顯著差異(表2)。以栽培種Moneymaker 和M82 作為判斷醋栗番茄耐鹽性的標準,對41 份醋栗番茄核心種質(zhì)芽期耐鹽性進行評價:耐鹽(T),相對發(fā)芽率顯著高于兩個栽培種番茄;中等耐鹽(M),相對發(fā)芽率和栽培種Moneymaker 或M82 無顯著差異;鹽敏感(S),相對發(fā)芽率顯著低于兩個栽培種番茄。
表2 醋栗番茄核心種質(zhì)相對發(fā)芽率及芽期耐鹽性鑒定結(jié)果
由表2 可知,在150 mmol·L-1NaCl 脅迫下,醋栗番茄N10、N12、N13、N21、N25、N30、N36、N37 與栽培種番茄Moneymaker 或M82 的相對發(fā)芽率不存在顯著差異,為中等耐鹽種質(zhì);N5、N7、N15、N23、N26、N27、N31、N32、N34、N35、N38、N39、N41 等13 份醋栗番茄的相對發(fā)芽率顯著高于Moneymaker 和M82,耐鹽性相對較強,為耐鹽種質(zhì);N1、N2、N3、N4、N6、N8、N9、N11、N14、N16、N17、N18、N19、N20、N22、N24、N28、N29、N33、N40 等20 份醋栗番茄的相對發(fā)芽率顯著低于Moneymaker 和M82,耐鹽性相對較弱,為鹽敏感種質(zhì)。并且,在耐鹽種質(zhì)中,N23、N27、N34、N35、N38、N39、N41 等7份醋栗番茄材料第14 天的相對發(fā)芽率大于85%,符合GB 16715.3—2010 規(guī)定的番茄種子質(zhì)量最低要求。其中,N27、N34、N35、N38、N39、N41 等6 份材料相對發(fā)芽率顯著高于其他參試材料,在150 mmol·L-1NaCl 脅迫第14 天時,相對發(fā)芽率高達95%以上。
由圖3 可知,43 份參試材料可分為3 個大類,第一大類(紅色)共14 份材料,均為醋栗番茄,其中4 份(N15、N26、N34、N35)為耐鹽材料,4 份(N16、N18、N19、N20)為鹽敏感材料;第二大類(綠色)共7 份材料,均為醋栗番茄,其中1 份(N7)為耐鹽材料,4 份(N14、N17、N22、N24)為鹽敏感材料;第三大類(藍色)共22 份材料,包括醋栗番茄和栽培番茄,其中8 份(N5、N23、N27、N31、N32、N38、N39、N41)為耐鹽材料,11 份(N1、N2、N3、N4、N6、N9、N11、N28、N29、N33、N40)為鹽敏感材料。
圖3 醋栗番茄核心種質(zhì)進化樹分析結(jié)果
在鹽脅迫下,雖然醋栗番茄種子的開始萌發(fā)時間和相對發(fā)芽率等發(fā)芽指標均較非鹽脅迫環(huán)境表現(xiàn)出明顯的下降趨勢,但部分野生醋栗番茄材料仍明顯優(yōu)于栽培種。通過篩選發(fā)現(xiàn)有6 份材料(N27、N34、N35、N38、N39、N41)耐鹽性較好,平均開始萌發(fā)時間為76 h,較栽培種(162 h)提前了86 h;相對發(fā)芽率可達95%以上,平均相對發(fā)芽率(96.89%)較栽培種(33.67%)提高了63.22 百分點。同時還發(fā)現(xiàn)不同醋栗番茄種質(zhì)的耐鹽性也存在較大差異,遺傳多樣性豐富,20 份材料表現(xiàn)芽期鹽敏感,萌發(fā)開始時間與栽培種相近,相對發(fā)芽率低于10%,較栽培種平均降低了32.34 百分點,其中14 份材料在鹽脅迫下不萌發(fā)。通過利用重測序數(shù)據(jù)進化樹分析,將41 份野生醋栗番茄資源分為三大類,結(jié)果與Rao 等(2012)的研究一致,而耐鹽材料卻分布在不同類群,推測耐鹽性狀受有限的數(shù)量性狀位點控制,而且這些位點可能也不相同。另外,本研究還發(fā)現(xiàn)N41 和N11 種質(zhì)遺傳距離極小,基因組極其相似,但分別表現(xiàn)出明顯的耐鹽和鹽敏感,有利于借助基因組數(shù)據(jù)進行耐鹽基因的挖掘。
雖然目前番茄均已采用育苗移栽,其芽期受到鹽脅迫的概率大大降低,但在淡水資源日益缺乏的現(xiàn)狀下,篩選芽期耐鹽遺傳種質(zhì),為將來較好地利用海水資源提供了良好的技術(shù)支撐。Foolad 等(2003a)發(fā)現(xiàn),在逆境下選擇發(fā)芽率高的材料可以顯著提高其在正常栽培條件下的發(fā)芽率,芽期耐鹽遺傳種質(zhì)無疑會為提高番茄商品種的發(fā)芽率和出苗整齊度奠定一定的遺傳基礎(chǔ);另外,目前對于作物耐鹽性的階段性機制尚不明確,芽期耐鹽資源也為深入了解作物耐鹽調(diào)控機制提供了必要的材料。