潘根 秦裕輝 張水寒
摘??要:多糖是玉竹的質(zhì)量標(biāo)志物,在免疫調(diào)節(jié)、抗腫瘤等方面具有顯著的藥理作用。作為多糖合成的關(guān)鍵酶之一,蔗糖合成酶(sucrose?synthase,?SUS)一直是揭示植物多糖合成的重要研究?jī)?nèi)容?;谵D(zhuǎn)錄組序列信息,本研究利用生物信息學(xué)手段對(duì)玉竹SUS基因家族及其成員進(jìn)行鑒定,并利用熒光定量PCR(qPCR)對(duì)其成員表達(dá)模式進(jìn)行分析。結(jié)果表明:玉竹轉(zhuǎn)錄組共獲得8個(gè)具有ORF序列的PoSUS基因家族成員,其編碼蛋白質(zhì)含有111~310個(gè)氨基酸,分子量為12.81~35.43?kDa,其理論等電點(diǎn)為5.83~9.18。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明,8個(gè)PoSUS基因家族成員可分為3個(gè)亞家族,其中第Ⅲ亞家族基因成員數(shù)目最多。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)顯示大多數(shù)PoSUS蛋白定位在葉綠體?;虮磉_(dá)模式分析表明,PoSUS1和PoSUS6基因在多糖積累的根莖組織中表達(dá)量最高,且高多糖種質(zhì)HN1中PoSUS1和PoSUS2表達(dá)量顯著高于低多糖種質(zhì)AH2。此外,本研究還從種質(zhì)HN1和AH2克隆得到PoSUS1基因CDS序列,其編碼蛋白在2份種質(zhì)間存在3處氨基酸差異,且這些差異位于PoSUS1蔗糖合成酶結(jié)構(gòu)域。本研究結(jié)果為深入研究玉竹SUS基因功能奠定基礎(chǔ),也為玉竹藥用品質(zhì)形成分子機(jī)制研究提供理論依據(jù)。
關(guān)鍵詞:玉竹;SUS基因家族;表達(dá)分析;PoSUS1中圖分類號(hào):S567.239??????文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A
Identification?and?Expression?Profiling?of?the?Sucrosesynthase?(SUS)?Gene?Family?and?Cloning?of?PoSUS1?in?Polygonatum?odoratum
PAN?Gen1,2,3,?QIN?Yuhui1,2*,?ZHANG?Shuihan1*
1.?Institute?of?Chinese?Materia?Medica,?Hunan?Academy?of?Chinese?Medicine,?Changsha,?Hunan?410013,?China;?2.?Colleges?of?Chinese?Medicine,?Hunan?University?of?Chinese?Medicine,?Changsha,?Hunan?410208,?China;?3.?Institute?of?Bast?Fiber?Crops,?Chinese?Academy?of?Agricultural?Sciences,?Changsha,?Hunan?410205,?China
Abstract:?Polysaccharide?is?a?quality?marker?of?Polygonatum?odoratum,?which?has?significant?pharmacological?effects?in?immune?regulation?and?anti-tumor.?As?one?of?the?key?enzymes?in?polysaccharide?synthesis,?sucrosesynthase?(SUS)?has?always?been?an?important?research?field?to?reveal?the?synthesis?of?plant?polysaccharides.?Based?on?transcriptom?data?of?Polygonatum?odoratum,?the?SUS?gene?family?members?were?identified?by?bioinformatics,?and?their?expression?profiling?were?analyzed?using?qPCR.?The?results?showed?that?eight?PoSUS?gene?were?identified,?their?protein?ranged?from?111?to?310?amino?acid?residues?(aa)?in?length,?and?relative?molecular?weight?varied?from?12.81?kDa?to?35.43?kDa,?isoelectric?point?(pI)?in?the?range?of?5.83?to?9.18;?phylogenetic?analysis?indicated?that?eight?PoSUS?genes?were?divided?into?3?subfamily,?and?the?subfamily?Ⅲ?included?the?largest?PoSUS?genes?family?member;?subcellural?localization?analysis?showed?that?most?of?PoSUS?proteins?were?located?in?chloroplast.?Additionally,?expression?patterns?analysis?revealed?that?PoSUS1?and?PoSUS6?genes?were?preferably?expressed?in?rhizome,?and?the?transcript?levels?of?PoSUS1?and?PoSUS2?were?higher?in?high-polysaccharide?cultivar?HN1?than?those?in?a?low-polysaccharide?cultivar?AH2.?In?addition,?the?CDS?of?PoSUS1?gene?were?cloned?from?HN1?and?AH2,?there?are?three?amino?acid?difference?between?HN1?and?AH2,?which?located?in?sucrose?synthase?domain.?Our?findings?can?laid?a?basis?for?the?further?study?of?functional?analysis?of?SUS?genes,?and?provided?a?theoretical?basis?for?analyzing?molecular?mechanism?of?the?formation?mechanism?of?medicinal?quality?of?Polygonatum?odoratum.
Keywords:?Polygonatum?odoratum;?SUS?gene?family;?expression?analysis;?PoSUS1
DOI:?10.3969/j.issn.1000-2561.2023.12.012
玉竹[Polygonatum?odoratum?(Mill.)?Druce]為百合科(Liliaceae)黃精屬(Polygonatum)植物,為我國(guó)常見中藥材之一,廣泛分布我國(guó)陜西、甘肅、青海、臺(tái)灣、河南、湖北、湖南、廣東等地。作為傳統(tǒng)中藥材,玉竹具有降血糖、免疫調(diào)節(jié)、抗腫瘤、抗氧化、抗疲勞、延緩皮膚衰老等藥理作用[1-2]。玉竹多糖被認(rèn)為是玉竹的主要活性成分,含量較高,也是發(fā)揮藥理作用的有效成分之一,同時(shí)也是衡量玉竹品質(zhì)主要標(biāo)準(zhǔn)[3-4]。鑒于玉竹多糖的重要性,其越來越受到研究者的廣泛關(guān)注。
多糖在植物體內(nèi)生物合成路徑主要包括3個(gè)步驟:第1步為蔗糖經(jīng)過一系列轉(zhuǎn)化生成尿苷二磷酸葡萄糖(uridine?diphosphate?glucose,?UDP-Glc)、鳥苷二磷酸甘露糖(guanosine?diphosphate?mannose,?GDP-Man)和鳥苷二磷酸巖藻糖(guanosine?diphosphate?fucose,?GDP-Fuc);第2步為UDP-葡萄糖轉(zhuǎn)化為其他NDP單糖;最后一步通過不同的糖基轉(zhuǎn)移酶(glycosyl?transferases,?GTs)將NDP單糖從糖核苷酸供體結(jié)合到生長(zhǎng)中的多糖聚合物中,隨后多糖聚合物從合成部位輸出,形成多糖[5-7]。UDP-Glc是多糖合成途徑中重要前體物質(zhì),在整個(gè)合成過程中起著至關(guān)重要的作用[8]。
蔗糖合成酶(sucrose?synthase,?SUS)是植物多糖合成中的關(guān)鍵酶之一,它包含蔗糖合成酶結(jié)構(gòu)域和糖基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域,它主要的功能是催化蔗糖裂解為果糖和UDP-Glc及腺苷二磷酸葡萄糖[9]。目前在甘草、鐵皮石斛、百合、枸杞等8種藥用植物中有蔗糖合成酶基因的相關(guān)研究報(bào)道[10-18]。利用基因組序列信息,在鐵皮石斛鑒定出4個(gè)DcSuSy基因家族成員,同時(shí)對(duì)這些基因在不同組織及冷脅迫下的表達(dá)模式進(jìn)行了分析[18];GuSUS1和GuSUS2是從甘草中克隆的2個(gè)蔗糖合成酶基因,在甘草不同生育期其基因表達(dá)量存在差異,同時(shí)證實(shí)2個(gè)基因編碼的酶對(duì)蔗糖具有裂解催化作用[10]。玉竹多糖作為玉竹發(fā)揮藥理作用的主要成分之一,其合成途徑中關(guān)鍵酶基因PoSUS還未見相關(guān)研究報(bào)道。由于玉竹基因組測(cè)序未完成,本研究基于玉竹轉(zhuǎn)錄組序列信息,通過生物信息學(xué)方法對(duì)PoSUS基因家族成員進(jìn)行鑒定,同時(shí)對(duì)其組織表達(dá)模式及不同多糖種質(zhì)間表達(dá)量進(jìn)行分析,進(jìn)一步克隆出PoSUS1的CDS序列,并分析了該基因在不同種質(zhì)間氨基酸序列差異。研究結(jié)果為PoSUS家族基因的生物學(xué)功能研究奠定基礎(chǔ),同時(shí)為玉竹藥用品質(zhì)質(zhì)量形成機(jī)制研究提供理論依據(jù)。
1.1??材料
供試材料為玉竹種質(zhì)豬屎尾、HN1、AH2,種植于中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院麻類研究所望城實(shí)驗(yàn)基地。于玉竹膨大期分別選取豬屎尾玉竹的根莖、莖、葉組織及HN1、AH2玉竹的根莖,立即放入液氮中,用于RNA提取。
1.2??方法
1.2.1??PoSUS基因家族的鑒定??轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來于NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sra/?term=?SRP 187533),其轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)來自成熟的根莖、葉片及莖組織[7]。利用關(guān)鍵詞“sucrose?synthase”對(duì)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中的unigene進(jìn)行搜索,對(duì)所有相關(guān)序列進(jìn)行重復(fù)序列剔除,利用Pfam(http://pfam.xfam.org/)在線軟件對(duì)剩余序列的保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行鑒定,去除不含蔗糖合成酶和糖基轉(zhuǎn)移酶結(jié)構(gòu)域的序列。進(jìn)一步采用BioXM?2.7軟件對(duì)剩余序列進(jìn)行ORF預(yù)測(cè)。
1.2.2??PoSUS蛋白基本理化性質(zhì)分析??利用ExPasy在線軟件(https://web.expasy.org/protpa ram/)對(duì)PoSUS蛋白序列的分子量、等電點(diǎn)等基本理化性質(zhì)進(jìn)行預(yù)測(cè);運(yùn)用Plant-mPLoc(http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/plant-multi/)在線軟件預(yù)測(cè)PoSUS蛋白的亞細(xì)胞定位。
1.2.3??PoSUS系統(tǒng)進(jìn)化樹分析??分別從NCBI中下載擬南芥和水稻SUS基因蛋白序列,通過MEGA?7.0軟件中MUSCLE程序?qū)Π裰瘛⑺炯皵M南芥SUS基因氨基酸進(jìn)行多重序列比對(duì)。采用Neighbor-Joining法構(gòu)建進(jìn)化樹,設(shè)定Bootstrap值為1000次重復(fù)。
1.2.4??PoSUS基因組織特異性表達(dá)分析及表達(dá)模式熱圖繪制??參考PoSUS轉(zhuǎn)錄組序列信息,利用Primer?5軟件設(shè)計(jì)熒光定量引物(表1),引物序列委托湖南擎科生物科技有限公司合成。RNA提取參照EASYspinPlus多糖多酚提取試劑盒(北京艾德萊生物科技有限公司)。使用1.0%瓊脂糖凝膠電泳和NanoDrop?2000超微量分光光度計(jì)進(jìn)行RNA質(zhì)量和濃度檢測(cè)。利用Evo?M-MLV?RT
Premix?for?qPCR?Kit試劑盒(湖南艾科瑞生物工程有限公司),將玉竹種質(zhì)豬屎尾的根莖、莖、葉及種質(zhì)HN1、AH2根莖的RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。采用SYBR??Green?Premix?Pro?Taq?HS?qPCR試劑盒(湖南艾科瑞生物工程有限公司)進(jìn)行熒光定量PCR,反應(yīng)程序?yàn)椋?5?℃?30?s,95?℃?5?s,60?℃?30?s,40個(gè)循環(huán)。基因相對(duì)表達(dá)量計(jì)算方法為2?ΔΔCT。利用網(wǎng)上已公布的玉竹根、根莖和莖的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)[7],使用TBtools軟件繪制PoSUS1~?PoSUS8基因表達(dá)模式熱圖。
1.2.5??PoSUS1基因的克隆??參考玉竹轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中PoSUS1相關(guān)序列信息,利用Primer?5.0軟件進(jìn)行基因克隆引物設(shè)計(jì)(表1)。以玉竹種質(zhì)HN1和AH2的根莖cDNA為模板,用Apex?HFHSDNA?Polymerase?FS?Master?Mix(dyeplus)試劑盒(湖南艾科瑞生物工程有限公司)進(jìn)行基因克隆,擴(kuò)增程序?yàn)椋?4?℃?30?s,94?℃?15?s,55?℃?5?s,72?℃?15?s,30個(gè)循環(huán),72?℃?2?min。PCR產(chǎn)物進(jìn)行1.0%瓊脂糖凝膠電泳,使用Fast?Pure?Gel?DNA?Extraction?Mini?Kit試劑盒進(jìn)行目的條帶回收(南京諾唯贊生物科技股份有限公司)。將回收的目的條帶連接到pEASY-Blunt載體(北京全式金生物技術(shù)有限公司),轉(zhuǎn)化至Trans1-T1感受態(tài)細(xì)胞,涂布于含卡那抗生素的LB培養(yǎng)基上進(jìn)行陽性單菌落篩選,提取質(zhì)粒送至湖南擎科生物有限公司進(jìn)行測(cè)序。
1.2.6??玉竹多糖含量測(cè)定??采用苯酚-硫酸法(《中華人民共和國(guó)藥典》,2020版)對(duì)不同種質(zhì)玉竹根莖多糖含量進(jìn)行檢測(cè)。首先對(duì)各組織樣品進(jìn)行冷凍干燥,待干燥完全用打粉機(jī)將各組織樣品打粉保存。分別取干燥的組織樣品1?g與100?mL蒸餾水進(jìn)行混合,加熱回流1?h,并用脫脂棉過濾,重復(fù)提取2次,合并濾液,加熱濃縮,轉(zhuǎn)移至100?mL容量瓶中加水至刻度,精密量取2?mL,加入10?mL的95%乙醇,攪拌離心獲得沉淀,將沉淀物加水溶解,置于50?mL容量瓶中并稀釋至刻度。精密量取2?mL加入1?mL?4%苯酚混合均勻,迅速加入7?mL硫酸,搖勻,放入40?℃水浴鍋中保溫30?min,隨后放入冰水浴5?min取出。用紫外分光光度計(jì)(JASCO?company,?Japan)在490?nm處測(cè)定樣品的吸光度,重復(fù)上述實(shí)驗(yàn)3次,取平均值作為最終結(jié)果。
2.1??玉竹PoSUS基因家族成員的鑒定
首先利用關(guān)鍵詞“sucrose?synthase”對(duì)玉竹
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫進(jìn)行搜素,然后通過NCBI?CDD數(shù)據(jù)庫對(duì)保守結(jié)構(gòu)域進(jìn)行預(yù)測(cè),最終篩選出8條PoSUS蛋白序列,基因命名為PoSUS1~PoSUS8。這些基因CDS序列全長(zhǎng)大小范圍為336~933?bp,所編碼的氨基酸數(shù)介于111~310?aa之間;預(yù)測(cè)的理論分子量大小范圍在12.81~35.43?kDa之間。等電點(diǎn)大小范圍在5.83~9.18之間,其中大多數(shù)PoSUS蛋白的等電點(diǎn)小于7,顯酸性。亞細(xì)胞定位預(yù)測(cè)表明,PoSUS1定位在細(xì)胞核中,PoSUS2、PoSUS4、PoSUS6和PoSUS7定位在葉綠體中,PoSUS3在細(xì)胞核和胞質(zhì)中均有定位信號(hào),PoSUS8在葉綠體、胞質(zhì)、線粒體、細(xì)胞核及過氧化體中均有定位信號(hào)(表2)。
2.2??PoSUS蛋白進(jìn)化樹分析
為了解PoSUS基因家族成員的進(jìn)化關(guān)系,本研究構(gòu)建了包含單子葉模式植物水稻7個(gè)SUS家族成員和雙子葉模式植物擬南芥6個(gè)家族成員在內(nèi)的系統(tǒng)進(jìn)化樹。結(jié)果表明,玉竹8個(gè)PoSUS分為3個(gè)亞家族,其中第Ⅰ和Ⅱ亞家族各包含1個(gè)成員,第Ⅲ亞家族包含6個(gè)PoSUS家族成員。同時(shí)也發(fā)現(xiàn),第Ⅲ亞家族成員呈現(xiàn)明顯的單子葉植物(水稻和玉竹)和雙子葉植物(擬南芥)聚類現(xiàn)象,6個(gè)玉竹PoSUS蛋白與水稻OsSUS蛋白親緣關(guān)系較近,為同一亞群,而擬南芥中AtSUS1與AtSUS4為一亞群(圖1)。
2.3??PoSUS組織特異性表達(dá)分析
為了研究PoSUS基因的組織表達(dá)特性,本研究分析了PoSUS基因在玉竹膨大期根莖、莖、葉等不同組織表達(dá)模式。如圖2所示,PoSUS基因家族成員在不同組織中表達(dá)模式不同,PoSUS1和PoSUS6在根莖組織中表達(dá)量較高,PoSUS4和PoSUS5在葉中表達(dá)量最高,PoSUS7在莖中表達(dá)量最高,PoSUS2、PoSUS3、PoSUS8在根莖和莖中的表達(dá)量高于葉。利用已公布的玉竹不同組織(根莖、根、葉)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息[7],繪制PoSUS1~?PoSUS8基因表達(dá)量熱圖。如圖3所示,PoSUS1和PoSUS6在根莖組織中表達(dá)量最高,PoSUS2、PoSUS4和PoSUS7在莖中表達(dá)量最高,PoSUS5在葉中表達(dá)量最高。
2.4??不同種質(zhì)間PoSUS表達(dá)模式分析
為了研究PoSUS基因在玉竹多糖合成中的作用,選取不同多糖含量種質(zhì)進(jìn)行PoSUS基因表達(dá)量分析。玉竹種質(zhì)HN1多糖含量約為7.8%,顯著高于種質(zhì)AH2(圖4A)。玉竹8個(gè)PoSUS基因在2份種質(zhì)間表達(dá)量存在差異,其中PoSUS1和PoSUS2在種質(zhì)HN1中的表達(dá)量顯著高于種質(zhì)AH2,而PoSUS4、PoSUS5、PoSUS6、PoSUS8在種質(zhì)HN1中的表達(dá)量低于種質(zhì)AH2,PoSUS3和PoSUS7基因表達(dá)量在2份種質(zhì)中差異不顯著(圖4B)。
2.5??PoSUS1基因的克隆及氨基酸序列分析
通過設(shè)計(jì)引物,分別從玉竹種質(zhì)HN1和AH2中將PoSUS1基因擴(kuò)增出來。PoSUS1在2份種質(zhì)中CDS全長(zhǎng)均為684?bp,其序列長(zhǎng)度與轉(zhuǎn)錄組測(cè)序所獲得PoSUS1序列長(zhǎng)度一致(圖5A)。測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),PoSUS1氨基酸序列在2份種質(zhì)中存在3處氨基酸差異,分別為第21位、第185位、第199位。在第21位氨基酸,種質(zhì)HN1為組氨酸,AH2為精氨酸;在第185位氨基酸,HN1為組氨酸,AH2為亮氨酸;在第199位氨基酸,HN1為蘇氨酸,AH2為異亮氨酸,且3處氨基酸均位于蔗糖合成酶結(jié)構(gòu)域(圖5B)。
多糖是眾多中藥材如玉竹、黃精、枸杞、黨參等重要質(zhì)量標(biāo)志物,發(fā)掘和研究多糖合成關(guān)鍵酶基因可為多種中藥材品質(zhì)形成機(jī)理的闡述奠定基礎(chǔ)[8]。蔗糖合成酶基因SUS是植物體內(nèi)參與蔗糖代謝的關(guān)鍵酶之一,在調(diào)控多糖合成中起到關(guān)鍵作用[19]。本研究基于轉(zhuǎn)錄組序列信息,通過ORF全長(zhǎng)預(yù)測(cè),保守結(jié)構(gòu)域的鑒定,在玉竹中首次確定了8個(gè)PoSUS基因。相比較于水稻、擬南芥、柑橘、石榴基因組分別編碼7、6、6、5個(gè)SUS基因[20-23],玉竹中鑒定出數(shù)目較多的SUS基因,但其數(shù)目少于棉花、蘋果、楊樹等植物[24-26]。隨著玉竹基因組測(cè)序的完成,將來可能會(huì)有更多的玉竹PoSUS基因家族成員被發(fā)現(xiàn),對(duì)本研究所鑒定的PoSUS基因進(jìn)行有效補(bǔ)充。
系統(tǒng)進(jìn)化樹分析可預(yù)測(cè)基因起源及與其他成員之間的親緣關(guān)系。前人大量研究表明,SUS基因家族成員分可為3個(gè)亞家族,類似結(jié)果在石榴、蘋果等物種中也有相關(guān)研究報(bào)道[23,?25]。本研究也表明,玉竹PoSUS基因家族成員可分為3個(gè)亞家族,且其成員主要屬于亞家族Ⅲ,在亞家族Ⅰ與亞家族Ⅱ中僅包含1個(gè)成員。同時(shí)也發(fā)現(xiàn),在亞家族Ⅲ中,基因出現(xiàn)明顯單子葉植物和雙子葉植物分類現(xiàn)象。玉竹和水稻同為單子葉植物,玉竹6個(gè)SUS成員與水稻3個(gè)SUS成員較好聚為同一亞群,而擬南芥AtSUS1、AtSUS4被聚類為另一亞群。上述研究結(jié)果在其他植物SUS基因家族中也有相關(guān)報(bào)道[24,?27-28]。
根莖為玉竹碳同化物主要存儲(chǔ)的庫組織,其玉竹多糖含量顯著高于莖、葉等組織[4,?7]。前人在不同植物中研究表明,SUS基因主要在植物庫組織特異性表達(dá)。玉米ZmSUS3主要在籽粒中表達(dá),且隨著籽粒成熟,其表達(dá)量逐漸升高[28];石榴PgSUS1、PgSUS3、PgSUS4基因在果皮發(fā)育中顯著上調(diào)表達(dá)[23];木薯MeSUS2、MeSUS4、MeSUS6在其根中特異性高表達(dá)[29]。本研究也發(fā)現(xiàn)PoSUS1、PoSUS3、PoSUS6、PoSUS8在根莖中表達(dá)量較高,其中PoSUS1和PoSUS6在根莖組織中表達(dá)量最高,此結(jié)論與前人研究結(jié)果類似[7]。此外,PoSUS1和PoSUS2在高多糖種質(zhì)HN1中表達(dá)量顯著高于低多糖種質(zhì)AH2。進(jìn)一步對(duì)PoSUS1基因
進(jìn)行測(cè)序發(fā)現(xiàn),高多糖種質(zhì)HN1和低多糖種質(zhì)AH2存在氨基酸差異,且均位于PoSUS1蔗糖合成酶結(jié)構(gòu)域。同時(shí),水稻OsSUS3為玉竹PoSUS1的同源基因,親緣關(guān)系較近,過表達(dá)OsSUS3后能促進(jìn)水稻籽粒中淀粉的積累[30]。綜合基因表達(dá)量、蛋白氨基酸序列差異及其他物種中同源基因功能研究,推測(cè)PoSUS1很可能為多糖合成的關(guān)鍵候選基因。在今后的研究中,本課題組將利用轉(zhuǎn)基因技術(shù)對(duì)該基因在玉竹多糖生物合成中的生物學(xué)功能進(jìn)行進(jìn)一步驗(yàn)證。
本研究從玉竹轉(zhuǎn)錄組中鑒定出8個(gè)PoSUS基因家族成員,其編碼的氨基酸具有不同的理化性質(zhì)。與擬南芥、水稻SUS蛋白構(gòu)建了系統(tǒng)進(jìn)化樹,8個(gè)PoSUS蛋白被分為3個(gè)亞家族,且亞家族Ⅲ中包含6個(gè)PoSUS成員。PoSUS1基因不僅在玉竹碳同化積累庫組織根莖中表達(dá)量最高,同時(shí)其在高多糖種質(zhì)的表達(dá)量顯著高于低多糖種質(zhì),且其編碼的蔗糖合成酶結(jié)構(gòu)域在不同多糖含量種質(zhì)中存在氨基酸差異。因此,PoSUS1基因很可能在玉竹多糖生物合成中發(fā)揮作用。雖然該基因的生物學(xué)功能還需進(jìn)一步驗(yàn)證,但本研究可為PoSUS候選基因功能深入研究奠定基礎(chǔ),為玉竹藥用品質(zhì)形成分子機(jī)制研究提供理論依據(jù)。
參考文獻(xiàn)
[1]?ZHAO?P,?ZHAO?C?C,?LI?X,?GAO?Z?Q,?HUANG?L?Q,?XIAO?P?G,?GAO?W?Y.?The?genus?Polygonatum:?a?review?of?ethn opharmacology,?phytochemistry?and?pharmacology[J].?Journal?of?Ethnopharmacology,?2017,?214:?274-291.
[2]?ZHANG?R?Z,?GAO?X,?BAI?H,?NING?K.?Traditional?Chinese?medicine?and?gut?microbiome:?their?respective?and?concert?effects?on?healthcare[J].?Frontiers?in?Pharmacology,?2020,?214(11):?538.
[3]?JIANG?Q?G,?LYU?Y?X,?DAI?W?D,?MIAO?X?Y,?ZHONG?D?W.?Extraction?and?bioactivity?of?polygonatum?polysacchar ides[J].?International?Journal?of?Biological?Macromolecules,?2013,?54(3):?131-135.
[4]?孟慶龍,?崔文玉,?劉雅婧,?金莎,潘景芝.?玉竹的化學(xué)成分及藥理作用研究進(jìn)展[J].?上海中醫(yī)藥雜志,?2020,?54(9):?93-98.MENG?Q?L,?CUI?W?Y,?LIU?Y?J,?JIN?S,?PAN?J?Z.?Advances?in?studies?on?chemical?constituents?and?pharmacological?eff e cts?of?Polygonatum?odoratum[J].?Shanghai?Journal?of?Traditional?Chinese?Medicine,?2020,?54(9):?93-98.?(in?Chinese)
[5]?WANG?S?Q,?WANG?B,?HUA?W?P,?NIU?J?F,?DANG?K?K,?QIANG?Y,?WANG?Z?Z.?De?novo?assembly?and?analysis?of?Polygonatum?sibiricum?transcriptome?and?identification?of?genes?involved?in?polysaccharide?biosynthesis[J].?Internat i onal?Journal?of?Molecular?Science,?2017,?18(9):?1950.
[6]?NIU?J?F,?ZHAO?G?M,?MI?Z?Y,?CHEN?L?J,?LIU?S,?WANG?S?Q,?WANG?D?H,?WANG?Z?Z.?De?novo?sequencing?of?Bletilla?striata?(Orchidaceae)?transcriptome?and?identification?of?genes?involved?in?polysaccharide?biosynthesis[J].?Genetics?and?Molecular?Biology,?2020,?43(3):?e20190417.
[7]?ZHANG?S?X,?SHI?Y?Y,?HUANG?L?Q,?WANG?C?K,?ZHAO?D?R,?MA?K?L,?WU?J?W,?PENG?D?Y.?Comparative?trans c r i p tomic?analysis?of?rhizomes,?stems,?and?leaves?of?Polyg o n atum?odoratum?(Mill.)?Druce?reveals?candidate?genes?associated?with?polysaccharide?synthesis[J].?Gene,?2020,?744:?144626.
[8]?李曉崗,?張雪,?俞捷,?王希付,?代紅洋,?陳嘉偉,?許均博,?曹冠華,?賀森.?藥用植物質(zhì)量標(biāo)志物多糖生物合成通路及關(guān)鍵酶研究進(jìn)展[J].?中草藥,?2021,?52(15):?4752-4762.LI?X?G,?ZHANG?X,?YU?J,?WANG?X?F,?DAI?H?Y,?CHEN?J?W,?XU?J?B,?CAO?G?H,?HE?S.?Research?progress?on?biosynthesis?pathway?of?quality?marker?polysaccharide?and?involved?key?enzymes?for?medicinal?plants[J].?Chinese?Traditional?and?Herbal?Drugs,?2021,?52(15):?4752-4762.?(in?Chinese)
[9]?XU?X?Y,?YANG?Y?H,?LIU?C?X,?SUN?Y?M,?ZHANG?T,?HOU?M?L,?HUANG?S?Z,?YUAN?H?Y.?The?evolutionary?history?of?the?sucrose?synthase?gene?family?in?higher?plants[J].?BMC?Plant?Biology,?2019,?19(1):?566-579.
[10]?ZHANG?L,?GAO?Y?N,?LIU?X?F,?GUO?F,?MA?C?X,?LIANG?J?H,?FENG?X?D,?LI?C.?Mining?of?sucrose?synthases?from?Glycyrrhiza?uralensis?and?their?application?in?the?construct i on?of?an?efficient?UDP-recycling?system[J].?Journal?of?Agric ultural?and?Food?Chemistry,?2019,?67(42):?11694-11702.
[11]?張園,?劉正杰,?徐紹忠,?趙明富,?林春,?文國(guó)松.?鐵皮石斛蔗糖合成酶基因序列特征與表達(dá)模式分析[J].?分子植物育種,?2018,?16(20):?6631-6638.ZHANG?Y,?LIU?Z?J,?XU?S?Z,?ZHAO?M?F,?LIN?C,?WEN?G?S.?Analysis?of?the?sequence?characteristics?and?expression?patt ern?of?sucrose?synthase?gene?in?Dendrobium?officinale[J].?Molecular?Plant?Breeding,?2018,?16(20):?6631-6638.?(in?Chinese)
[12]?聞奮亮,?隆小華,?岳楊,?何騰飛,高秀美,周兆勝.?菊芋蔗糖代謝相關(guān)產(chǎn)物與關(guān)鍵酶基因?qū)Ω邷氐捻憫?yīng)[J].?生態(tài)學(xué)雜志,?2020,?39(1):?82-92.WEN?F?L,?LONG?X?H,?YUE?Y,?HE?T?F,?GAO?X?M,?ZHOU?Z?S.?Responses?of?related?products?and?key?enzyme?genes?in?sucrose?metabolic?pathway?to?high?temperature?in?Jerusalem?artichoke[J].?Chinese?Journal?of?Ecology,?2020,?39(1):?82-92.?(in?Chinese)
[13]?李麗娜.?虎眼萬年青中蔗糖合酶基因的克隆、表達(dá)及功能鑒定[D].?北京:?北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院,?2016.LI?L?N.?cDNA?cloning,?expression?and?functional?identificat ion?of?sucrose?synthase?from?Ornithogalum?caudatum[D].?Beijing:?Peking?Union?Medical?College,?2016.?(in?Chinese)
[14]?程金云.?蘭州百合蔗糖代謝關(guān)鍵酶基因的克隆及原核表達(dá)[D].?沈陽:?沈陽農(nóng)業(yè)大學(xué),?2017.CHEN?J?Y.?Gene?cloning?and?prokaryotic?expression?of?key?enzymes?of?sucrose?metabolism?in?Lilium?davidii?var.?unic olor[D].?Shenyang:?Shenyang?Agricultural?University,?2017.?(in?Chinese)
[15]?BALK?P?A,?DE?BOER?A?D.?Rapid?stalk?elongation?in?tulip?(Tulipa?gesneriana?L.?cv.?apeldoorn)?and?the?combined?act i on?of?cold-induced?invertase?and?the?water-channel?protein?gamma?TIP[J].?Planta,?1999,?209(3):?346-354.
[16]?HOHNJEC?N,?BECKER?J?D,?PUHLER?A,?PERLICK?A?M,?KUSTER?H.?Genomic?organization?and?expression?propert i es?of?the?MtSucS1?gene,?which?encodes?a?nodule-enhanced?s ucrose?synthase?in?the?model?legume?Medicago?truncatula[J].?Molecular?and?General?Genetics,?1999,?261(3):?514-522.
[17]?王麗娟,?石晶,?王彥才.?枸杞蔗糖合成酶基因cDNA分離及表達(dá)分析[J].?北方園藝,?2013(21):?105-109.WANG?L?J,?SHI?J,?WANG?Y?C.?Isolation?and?expression?analysis?of?sucrose?synthase?gene?cDNA?from?Lycium?barb a rum?L.[J].?Northern?Horticulture,?2013(21):?105-109.?(in?Chinese)
[18]?劉博婷,?吳洋,?劉宇,?理雅,?唐演兒,?陳堰珊,?于白音,?劉羽佳.?鐵皮石斛蔗糖合成酶基因家族鑒定及表達(dá)分析[J/OL].?分子植物育種:?1-14?[2023-11-14].?http://kns.cnki.?net/kcms/detail/46.1068.S.20220305.1801.015.html.LIU?B?T,?WU?Y,?LIU?Y,?LI?Y,?TANG?Y?E,?CHEN?Y?S,?YU?B?Y,?LIU?Y?J.?Identification?and?expression?analysis?of?suc r ose?synthase?family?in?Dendrobium?catenatum?Lindl.?[J/OL].?Molecular?Plant?Breeding:?1-14?[2023-11-14].?http://?kns.cnki.net/kcms/detail/46.1068.S.20220305.1801.015.html.?(in?Chinese)
[19]?STEIN?O,?GRANOT?D.?An?overview?of?sucrose?synthases?in?plants[J].?Frontier?in?Plant?Science,?2019,?8(10):?95.
[20]?LIU?Z?M,?JIANG?S,?JIANG?L?L,?LI?W?J,?TANG?Y?Q,?HE?W,?WANG?M?L,?XING?J?J,?CUI?Y?C,?LIN?Q?L,?YU?F,?WANG?L.?Transcription?factor?OsSGL?is?a?regulator?of?starch?synt h e s is?and?grain?quality?in?rice[J].?Journal?of?Experimental?Bota ny,?2022,?73(11):?3417-3430.
[21]?BAUD?S,?VAULTIER?M?N,?ROCHAT?C.?Structure?and?expression?profile?of?the?sucrose?synthase?multigene?family?in?Arabidopsis[J].?Journal?of?Experimental?Botany,?2004,?55(396):?397-409.
[22]?ISLAM?M?Z,?HU?X?M,?JIN?L?F,?LIU?Y?Z,?PENG?S?A.?Gen o me-wide?identification?and?expression?profile?analysis?of?citrus?sucrose?synthase?genes:?investigation?of?possible?roles?in?the?regulation?of?sugar?accumulation[J].?PLoS?One,?2014,?9(11):?e113623.
[23]?LIU?L,?ZHENG?J.?Identification?and?expression?analysis?of?the?sucrose?synthase?gene?family?in?pomegranate?(Punica?granatum?L.)[J].?Peer?J,?2022,?10(10):?e12814.
[24]?CHEN?A?Q,?HE?S?E,?LI?F?F,?LI?Z,?DING?M?Q,?LIU?Q?P,?RONG?J?K.?Analyses?of?the?sucrose?synthase?gene?family?in?cotton:?structure,?phylogeny?and?expression?patterns[J].?BMC?Plant?Biology,?2012,?12:?85-92.
[25]?TONG?X?L,?WANG?Z?Y,?MA?B?Q,?ZHANG?C?X,?ZHU?L?C,?MA?F?W,?LI?M?J.?Structure?and?expression?analysis?of?the?sucrose?synthase?gene?family?in?apple[J].?Journal?of?Integrative?Agriculture,?2018,?17(4):?847-856.
[26]?AN?X?M,?CHEN?Z,?WANG?J?C,?YE?M?X,?JI?L?X,?WANG?J,?LIAO?W?H,?MA?H?D.?Identification?and?characterization?of?the?Populus?sucrose?synthase?gene?family[J].?Gene,?2014,?539(1):?58-67.
[27]?Koramutla?M?K,?RAM?C,?BHATT?D,?ANNAMALAI?M,?BHATTACHARYA?R.?Genome-wide?identification?and?expression?analysis?of?sucrose?synthase?genes?in?allotetraplo id?Brassica?juncea[J].?Gene,?2019,?707:?126-135.
[28]?Carlson?S?J,?Chourey?P?S,?Helentjaris?T,?DATTA?R.?Gene?expression?studies?on?developing?kernels?of?maize?sucrose?synthase?(SuSy)?mutants?show?evidence?for?a?third?SuSy?gene[J].?Plant?Molecular?Biology,?2002,?49(1):?15-29.
[29]?Huang?T,?Luo?X,?Fan?Z,?Yang?Y,?Wan?W.?Geno me-?wide?identification?and?analysis?of?the?sucrose?synthase?gene?family?in?cassava?(Manihot?esculenta?Crantz)[J].?Gene,?2021,?769:?145191-145202.
[30]?FAN?C,?WANG?G,?WANG?Y,?ZHANG?R,?WANG?Y?T,?FENG?S?Q,?LUO?K?M,?PENG?L?C.?Sucrose?synthase?enhances?hull?size?and?grain?weight?by?regulating?cell?division?and?starch?accumulation?in?transgenic?rice[J].?International?Journal?of?Molecular?Science,?2019,?20(20):?4971-4988.