鄭秋玲,劉軍鵬,鄭媛媛,王建萍,盧建聲,肖慧琳,劉萬好,唐美玲,陳景輝,徐維華,孫行杰
(1. 山東省煙臺市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院,山東煙臺 265500;2. 煙臺水禾土生物科技有限公司,山東煙臺 264003;3. 龍口市農(nóng)業(yè)技術(shù)推廣中心,山東龍口 265701;4. 山東省釀酒葡萄與葡萄酒技術(shù)創(chuàng)新中心,山東煙臺 264000)
葡萄具有見效快、收益高等特點,種植面積呈增長態(tài)勢,已經(jīng)成為很多地方農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的支柱產(chǎn)業(yè),在鄉(xiāng)村振興和精準扶貧中發(fā)揮著重要作用[1-3]。葡萄為喜肥果樹,且在不同生育期對氮、磷、鉀、鈣、鎂等礦質(zhì)元素的需求規(guī)律不同[4-5],傳統(tǒng)的重施氮磷鉀肥而忽視鈣鎂肥的方式不僅導(dǎo)致樹體生長失衡、果實品質(zhì)下降,也會造成肥料利用率下降和生產(chǎn)成本增加[6]。液體肥通過水肥一體化技術(shù)施用具有肥效高、容易吸收、養(yǎng)分均勻、配方可調(diào)、施用方便等優(yōu)點,可以實現(xiàn)精確供給[7-8]。目前,關(guān)于液體肥在葡萄上的應(yīng)用效果主要集中在提高產(chǎn)量、改善品質(zhì)方面。于會麗等[9]試驗證明海藻水溶肥配施可提高葡萄產(chǎn)量、增加果實香氣;王振龍[10]認為,適當(dāng)補充腐殖酸、氨基酸以及有益功能菌可以提高葡萄的花色苷及多酚含量;呂中偉等[11]證實不同類型液體肥可增加‘陽光玫瑰’葡萄可溶性固形物及Vc含量,同時可提高‘紅地球’葡萄產(chǎn)量,改善果實品質(zhì)[12],而針對液體肥影響葡萄土壤根際微生物的研究較少。
土壤根際微生物在植物生長發(fā)育過程中發(fā)揮了重要作用,其種類受土壤類型、植物種類、種植模式等因素影響[13-14]。目前葡萄園土壤微生物的研究多集中在水分管理[15-17]、產(chǎn)區(qū)[18-19]及土壤管理方式[20-21]等農(nóng)藝措施對微生物多樣性的影響。本研究以‘夏黑’葡萄為試材,采用Illumina PE250平臺對其進行16S細菌rRNA和ITS真菌高通量測序分析,探討施用液體肥后葡萄根際土壤微生物多樣性和群落結(jié)構(gòu)變化情況,闡明不同液體肥對葡萄根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)間的影響,為液體肥的推廣和應(yīng)用提供參考依據(jù)。
試驗在山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院蓬萊試驗基地進行。園區(qū)土壤pH值6.51,有機質(zhì)含量1.45%,堿解氮(AN)41.2 mg·kg-1,速效磷(AP)34.5 mg·kg-1,速效鉀(AK)132.5 mg·kg-1。試材為5年生‘夏黑’葡萄,株行距為3 m×4 m,龍干棚架,水平葉幕?;ü芾恚夯ㄇ耙恢鼙A羲爰?~7 cm,盛花期采用25 mg·L-1GA3+2 mg·L-1CPPU噴果穗,花后2周采用25 mg·L-1GA3進行膨大處理。
液體肥來自煙臺水禾土科技有限公司,主要成分為:枯草芽孢桿菌(有效活菌數(shù)≥5億 cfu·mL-1)、殼寡糖(氨基酸≥100 g·L-1,Zn+B≥20 g·L-1,殼寡糖5%)、魚蛋白(氨基酸≥100 g·L-1,N+P2O5+K2O≥150 g·L-1,有機質(zhì)≥300 g·L-1)、植物免疫蛋白(0.1%超敏蛋白,氨基酸≥100 g·L-1,Zn+B≥20 g·L-1)、海藻寡糖(腐殖酸≥6%,N+P2O5+K2O≥26%,有機鉀≥18%,海藻寡糖≥5%)。
試驗處理:液體肥復(fù)合處理(T)采用煙臺水禾土科技有限公司的系列產(chǎn)品,對照(CK)為常規(guī)土壤施肥,處理方案見表1。每個處理3個小區(qū),每小區(qū)10株,共計30株,小區(qū)隨機分布。施肥方式為:常規(guī)施肥采用溝施,距樹干30 cm處開溝(深、寬均為20 cm溝),固體肥料撒施入溝內(nèi),覆土后澆透水;液體肥采用溝施與葉面噴施相結(jié)合的方式進行,液體肥料稀釋100倍后澆入溝內(nèi),覆土后澆水。
表1 不同處理施肥時期、方法及用量Table 1 Fertilization period, method and amount of different treatments
取樣方法:葡萄采收期用不銹鋼取土器配合橡膠錘采集樹干與施肥溝間的土壤,采集深度為0~30 cm,每個處理采集3個混合土樣,每個樣本由15個采樣點的土壤混合而成,1個混合土樣1000 g,混合均勻后土壤樣品分為兩組,一組液氮速凍,置于﹣80 ℃冰箱保存,送樣進行土壤微生物測定;另一組自然風(fēng)干過篩后測定相關(guān)理化指標。
1.3.1 土壤理化指標
土壤有機質(zhì)采用重鉻酸鉀容量法-稀釋熱法測定;pH用1∶1水土比,pH計測定;堿解氮采用堿解擴散法;有效磷采用NaHCO3浸提,硫酸鉬銻抗比色法;土壤速效鉀:醋酸銨浸提,火焰光度法測定;交換性鈣鎂采用1 mol·L-1NH4OAc溶液浸提,原子吸收分光光度計測定。
1.3.2 微生物群落分析
用E.Z.N.A.?Soil DNA Kit(Omega Bio-tek, Norcross,GA,US)試劑盒提取土壤總DNA,利用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測抽提的基因組DNA。土壤細菌擴增引物為341F(5'-CCTAYGGGRBGCASCAG-3')和806R(5'-GGACTACNNGGGTATCTAAT-3'),土壤真菌擴增引物為ITS1F(5'-CTTGGTCATTTAGAGGAAGTAA-3')和ITS2R(5'-GCTGCGTTCTTCATCGATGC-3')。反應(yīng)條件:95 ℃預(yù)變性5 min,95 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,共25個循環(huán),最后于72 ℃延伸5 min。擴增產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測,用AxyPrepDNA凝膠回收試劑盒(AXYGEN公司)切膠回收,回收的產(chǎn)物由上海凌恩生物科技有限公司基于Illumina PE250平臺高通量測序。測序得到的PE reads根據(jù)overlap關(guān)系進行拼接,用Usearch軟件和gold數(shù)據(jù)庫,采用denovo和reference結(jié)合的方式去除嵌合體,區(qū)分樣本后進行分類單元(Operational Taxonomic Units,OTU)聚類分析和物種分類學(xué)分析,采用RDP classifier貝葉斯算法對97%相似水平的OTU代表序列進行分類學(xué)分析(置信度閾值為0.7),比對數(shù)據(jù)庫為Silva(細菌)和Unite(真菌),統(tǒng)計各樣本的群落組成。
不同指數(shù)的計算方法如下:
Chao:是用chao1算法估計樣本中所含OTU數(shù)目的指數(shù),chao1在生態(tài)學(xué)中常用來估計物種總數(shù),由Chao(1984)最早提出。本次分析使用計算公式如下:
其中,Schao1為估計的OTU數(shù);Sobs為實際觀測到的OTU數(shù);n1為只含一條序列的OTU數(shù)目;n2為只含兩條序列的OTU數(shù)目。
Simpson:用來估算樣本中微生物多樣性指數(shù)之一,由Edward Hugh Simpson (1949) 提出,在生態(tài)學(xué)中常用來定量描述一個區(qū)域的生物多樣性。Simpson指數(shù)值越大,說明群落多樣性越低。
其中,Sobs為實際觀測到的OTU數(shù);ni為第i個OTU所含的序列數(shù);N為所有的序列數(shù)。
Shannon:用來估算樣本中微生物多樣性指數(shù)之一。它與Simpson多樣性指數(shù)常用于反映α多樣性指數(shù)。Shannon值越大,說明群落多樣性越高。
其中,Sobs為實際觀測到的OTU數(shù);ni為第i個OTU所含的序列數(shù);N為所有的序列數(shù)。
Coverage:是指各樣本文庫的覆蓋率,其數(shù)值越高,則樣本中序列被測出的概率越高,而沒有被測出的概率越低。該指數(shù)反映本次測序結(jié)果是否代表了樣本中微生物的真實情況。
其中,ni為第i個OTU所含的序列數(shù);N為所有的序列數(shù)。
數(shù)據(jù)統(tǒng)計用Excel 2010,顯著性分析用SPSS 19.0。
由表2可知,與對照相比,液體肥處理顯著提高了土壤有機質(zhì)、堿解氮、有效磷、速效鉀及交換性鈣含量,分別增加了19.62%、39.64%、12.10%、19.49%、33.97%;pH值、交換性鎂與對照相比沒有顯著性差異。
表2 施肥處理對土壤理化指標的影響Table 2 Effect of the fertilization treatment to physical and chemical properties of tested soil samples
2.2.1 施肥處理對根際土壤細菌多樣性的影響
由表3可知,液體肥處理與常規(guī)施肥葡萄植株根際土壤細菌的Coverage指數(shù)均在98%以上,表明測序結(jié)果可代表樣本中細菌的真實狀況。液體肥處理的葡萄根際土壤的OTU數(shù)、Chao指數(shù)、Simpson指數(shù)顯著高于對照,Shannon指數(shù)無顯著性差異。
表3 不同處理土壤中細菌α多樣性指數(shù)統(tǒng)計Table 3 Alpha diversity index statistics of bacteria in the rhizosphere soil of different treatments
2.2.2 施肥對根際土壤細菌門分類水平的影響
本研究中檢測到的根際土壤細菌OTU歸類到36門97綱230目359科700屬,表4為不同處理‘夏黑’根際土壤中細菌在門分類學(xué)水平上的主要物種分布種類及豐度。施用液體肥與常規(guī)肥的葡萄根際土壤中,占比大于1%的優(yōu)勢菌門分別為10個和11個。共有的超過10%的優(yōu)勢菌門有4個:變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacteriota)、酸桿菌門(Acidobacteriota)、綠彎菌門(Chloroflexi);低于介于1%~10%的優(yōu)勢菌門為:擬桿菌門(Bacteroidota)、芽單胞菌門(Gemmatimonadota)、疣微菌門(Verrucomicrobiota)、粘球菌門(Myxococcota)、Atescibacteria、硝化螺旋菌門(Nitrospirota)。
表4 根際土壤細菌門分類水平組成與豐度Table 4 Relative abundance of bacteria phylum in rhizosphere soil%
與常規(guī)施肥相比較,液體肥處理的變形菌門、放線菌門、綠彎菌門、擬桿菌門、芽單胞菌門、Atescibacteria豐度增加9.53、0.87、0.12、1.99、0.61、1.12個百分點;酸桿菌門、疣微菌門、粘球菌門、硝化螺旋菌門、Methylomirabilota豐度降低10.90、0.83、0.68、0.11、1.26個百分點。
2.2.3 根際土壤細菌屬分類水平
本研究測定的葡萄根際土壤微生物中,相對豐度大于1%的優(yōu)勢細菌屬共有15個,其中液體肥處理的1%優(yōu)勢細菌屬有14個,常規(guī)施肥處理的有13個(表5),液體肥處理的葡萄根際土壤中富集羅思河小桿菌屬(Rhodanobacter)、鏈霉菌屬(Streptomyces)優(yōu)勢細菌屬,常規(guī)施肥處理富集了酸性細菌屬(Acidobacteriales)特有優(yōu)勢細菌屬。
表5 根際土壤細菌屬分類水平組成與豐度Table 5 Relative abundance of bacteria genus in rhizosphere soil %
液體肥復(fù)合處理相對豐度前4位的分別為RB41、芽單胞菌屬、鞘氨醇單胞菌屬、Gaiellales;常規(guī)對照的相對豐度前4位的屬為:酸桿菌屬、RB41、Gaiellales、芽單胞菌屬。
與常規(guī)施肥相比,液體肥復(fù)合處理的葡萄根際土壤中鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、芽單胞菌屬(Gemmatimonas)、RB41、Candidatus Udaeobacter、黃色桿菌科及兩個優(yōu)勢菌屬相對豐度分別增加了2.28、0.22、0.46、0.21、0.51、0.11、0.10個百分點;酸桿菌屬、Gaiellales、Roseiflexaceae_uncultured、Vicinamibacteraceae_norank、慢生根瘤菌屬優(yōu)勢菌屬相對豐度分別下降了2.36、1.27、0.12、2.05、0.21個百分點。
2.3.1 根際土壤真菌多樣性
由表6看出,不同處理的葡萄根際土壤的Coverage指數(shù)均在99%以上,說明測試結(jié)果代表樣本中真菌的真實情況。施肥處理的OTU數(shù)、Chao指數(shù)、Simpson指 數(shù)顯著高于對照;Shannon指數(shù)顯著低于對照。
表6 不同處理中土壤中真菌α多樣性指數(shù)統(tǒng)計Table 6 Index statistics for alpha diversity of fungi in the rhizosphere soil of different treatments
2.3.2 根際土壤真菌菌門分類水平
不同處理‘夏黑’根際土壤真菌OTU歸類到7門25綱145目145科277屬,液體肥復(fù)合處理和常規(guī)施肥的葡萄根際土壤中,相對豐度大于1%的優(yōu)勢真菌門有3個(表7),分別為:子囊菌門(Ascomycota)、毛霉菌門(Mucoromycota)、擔(dān)子菌門(Asidiomycota);其中液體肥復(fù)合處理根際土壤中三者的相對豐度分別為78.70%、11.37%和4.21%,常規(guī)施肥處理葡萄植株根際土壤中三者的相對豐度分別為62.04%、14.66%、16.68%??梢钥闯?,采用液體肥料復(fù)合施用使葡萄根際土壤真菌優(yōu)勢菌門占比發(fā)生變化,子囊菌門占比增加,毛霉菌門和擔(dān)子菌門占比減少。
表7 根際土壤真菌門分類水平組成與豐度Table 7 Relative abundance of fungi phylum in rhizosphere soil%
2.3.3 根際土壤真菌屬分類水平
液體肥復(fù)合處理和常規(guī)施肥的葡萄根際土壤中,相對豐度大于1%的優(yōu)勢真菌屬分別為15個和13個(表8),不同處理富集的優(yōu)勢菌屬不同,液體肥處理的葡萄根際土壤富集了頭束霉屬、Fusicolla、枝孢屬、瓶毛殼屬、Podospora、Dendrostilbella特有的優(yōu)勢真菌屬;常規(guī)施肥處理根際土壤富集了毛霉菌屬、Phoma、小不整球殼屬、柄孢殼屬特有優(yōu)勢菌屬。
表8 根際土壤真菌屬分類水平組成與豐度Table 8 Relative abundance of fungi genus in rhizosphere soil%
兩處理共有的優(yōu)勢菌屬有9個,分別為毛葡孢屬(Botryotrichum)、鐮刀菌屬(Fusarium)、被孢霉屬(Mortierella)、腐質(zhì)霉屬(Humicola)、短柄菌屬(Solicoccozyma)、Gibellulopsis、毛殼菌屬(Chaetomium)、盤菌屬(Tricharina)、Tausonia。與常規(guī)施肥相比,水溶肥復(fù)合處理的葡萄根際土壤中毛葡孢屬、鐮刀菌屬、短柄菌屬、Gibellulopsis、盤菌屬的相對豐度分別增加9.08、2.70、1.49、1.24、0.61個百分點,被孢霉屬、腐質(zhì)霉屬、毛殼菌屬、Tausonia的相對豐度分別降低3.29、8.05、0.38、3.21個百分點。
通過對液體肥處理和常規(guī)施肥處理的葡萄根際土壤樣品細菌和真菌群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)的RDA冗余分析,可直觀看出土壤有機質(zhì)、pH、速效磷、速效鉀及交換性鈣鎂等指標對土壤微生物細菌(圖1左)和真菌(圖1右)影響作用一致,細菌中變形菌門、放線菌門、擬桿菌門、芽單胞菌門與有機質(zhì)、pH、速效磷、速效鉀及交換性鈣鎂等指標正相關(guān);真菌門水平的子囊菌門與有機質(zhì)、pH值、速效磷、速效鉀及交換性鈣鎂等指標正相關(guān)。
圖1 細菌(左)和真菌(右)門水平群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)間的冗余分析Figure 1 Redundancy analysis of bacterial (Left) and fungal (Right) community structure and soil
土壤中的微生物是提高土壤生態(tài)功能的重要群體,在有機質(zhì)周轉(zhuǎn)、物質(zhì)循環(huán)等活動中起著舉足輕重的作用[23]。前人研究表明,不同施肥處理對土壤細菌和真菌的群落結(jié)構(gòu)和生物多樣性產(chǎn)生一定影響。本研究中發(fā)現(xiàn)施用液體肥可顯著提高土壤部分礦質(zhì)元素及有機質(zhì)含量,這是因為液體肥中含有的氨基酸態(tài)氮、腐殖酸和有機酸等成分,通過螯合作用和酸溶解作用促使土壤中固化的氮素、磷素和鉀素轉(zhuǎn)化為更易吸收的礦化態(tài)[22-24],因此提高了土壤中氮、磷、鉀的有效性。施用液體肥處理的葡萄根際土壤的細菌和真菌的OTU數(shù)、Chao指數(shù)、Simpson指數(shù)、Shannon指數(shù)高于常規(guī)施肥處理,這可能是由于施入液體肥,為微生物提供了可直接利用的營養(yǎng)物質(zhì),增加了微生物的數(shù)量及多樣性[25],這與桑文等[26]在番茄中的研究結(jié)果一致。
本研究表明,施用液體肥對土壤微生物結(jié)構(gòu)及活性影響較大,尤其是對細菌影響較大。施用液體肥處理的變形菌門、放線菌門、綠彎菌門、擬桿菌門、芽單胞菌門的豐度高于常規(guī)施肥處理,這些菌門有助于根系吸收更多的鉀、磷和其他微量營養(yǎng)元素[27]。本研究中通過門水平群落結(jié)構(gòu)與土壤理化指標間的冗余分析也得出變形菌門、放線菌門、擬桿菌門與土壤礦質(zhì)元素指標之間存在正相關(guān),說明兩者之間可能存在互相促進的關(guān)系。施用液體肥處理提高了根際土壤中子囊菌門的豐度,降低了毛霉菌門和擔(dān)子菌門豐度。研究表明,子囊菌門是土壤有機質(zhì)和纖維素的主要分解者[28],施入液體有機肥后,刺激了子囊菌門的生長,更有利于葡萄吸收土壤營養(yǎng)。Lauber等[29]研究發(fā)現(xiàn),擔(dān)子菌門的相對豐度與土壤中C/N和有效磷含量成反比,本研究中施用液體肥提高了土壤有機質(zhì)、有效磷等礦質(zhì)元素含量,冗余分析表明毛霉菌門和擔(dān)子菌門豐度與土壤理化指標呈負相關(guān),可能是土壤中擔(dān)子菌門豐度降低的原因。
與常規(guī)肥相比,液體肥處理顯著提高了細菌和真菌的多樣性和豐度;細菌門水平上變形菌門、放線菌門、綠彎菌門等相對豐度增加,屬水平上鞘氨醇單胞菌屬、芽單胞菌屬、RB41等優(yōu)勢菌屬相對豐度增加;真菌門水平上葡萄根際土壤中優(yōu)勢菌群子囊菌門豐度增加,毛霉菌門、擔(dān)子菌門豐度有所下降,屬水平上毛葡孢屬、鐮刀菌屬、短柄菌屬等的相對豐度增加。土壤有機質(zhì)、pH、速效磷、速效鉀及交換性鈣鎂等指標與微生物群落結(jié)構(gòu)存在相關(guān)性。