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艱難擬梭菌的分子流行病學(xué)及耐藥特征

2023-05-15 07:38:05權(quán)敏呂曉菊王曉輝
關(guān)鍵詞:克林西沙萬(wàn)古霉素

權(quán)敏 呂曉菊 王曉輝

四川大學(xué)華西醫(yī)院感染性疾病中心,成都 610041

艱難擬梭菌(Clostridioides difficile, Cd),曾稱(chēng)艱難梭菌或難辨梭菌,是一種可形成芽孢、產(chǎn)生毒素的嚴(yán)格厭氧革蘭陽(yáng)性桿菌,能引起醫(yī)院獲得性感染。 Cd 感染(Clostridioides difficileinfection, CDI)可表現(xiàn)為發(fā)熱、腹痛、腹瀉,嚴(yán)重者可致偽膜性腸炎、中毒性巨結(jié)腸甚至膿毒性休克。 CDI 通常發(fā)生在使用抗菌藥物后, 腸道微生態(tài)遭破壞喪失對(duì)Cd 的定植抗性, 引起抗菌藥物相關(guān)性腹瀉(antibioticassociated diarrhea, AAD)。 25%~33%的AAD 和90%的偽膜性腸炎與CDI 相關(guān)[1],因Cd 的產(chǎn)芽孢特性,治療后平均17.0%可出現(xiàn)CDI 復(fù)發(fā)[2]。 此外,Cd也可致社區(qū)獲得性感染(community-associated CDI,CA-CDI)。 近年來(lái),CA-CDI 發(fā)生率增加[3],且患者通常沒(méi)有抗菌藥物暴露史、近期住院史和并發(fā)癥等危險(xiǎn)因素,有研究指出其可能源于醫(yī)院[4]。

一、CDI 流行現(xiàn)狀

盡管CDI 防控能力不斷進(jìn)展,但其仍是危害全球公共衛(wèi)生安全的因素之一,極大增加社會(huì)經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)。 據(jù)報(bào)道,美國(guó)每年因CDI 增加7.96 億美元經(jīng)費(fèi)開(kāi)支,歐洲增加300 億歐元,主要源于住院天數(shù)延長(zhǎng)[5]。 美國(guó)2017 年CDI 患者數(shù)為223 900 例,死亡12 800 例[6]。 歐洲的醫(yī)療保健相關(guān)胃腸道疾病最常見(jiàn)為CDI(約48%),每年新發(fā)約152 905 例,死亡8 382 例[5]。一項(xiàng)評(píng)估CDI 負(fù)擔(dān)的系統(tǒng)性回顧研究指出,美國(guó)醫(yī)院獲得性CDI(healthcare-associated,HACDI)和CA-CDI 發(fā)生率分別為每天8.00/萬(wàn)和2.00/萬(wàn);在歐洲,波蘭的HA-CDI 和CA-CDI 發(fā)病率最高,分別為6.18/萬(wàn)和1.4/萬(wàn)[2]。中國(guó)重慶地區(qū)HA-CDI 的發(fā)生率為1.8/萬(wàn)[7], 浙江寧波地區(qū)CDI 中僅2.3%為CA-CDI[8]。 中國(guó)香港2015—2019 年數(shù)據(jù)顯示HA-CDI 為91.9%,6.0%為CA-CDI[9]。 總體上,中國(guó)大陸HA-CDI 與CA-CDI 的系統(tǒng)調(diào)查數(shù)據(jù)相對(duì)較少,需各醫(yī)療機(jī)構(gòu)引起重視。

二、Cd 菌株分子流行病學(xué)特征

目前常用的Cd 分型方法包括脈沖場(chǎng)凝膠電泳(Pulse field gel electrophoresis,PFGE)、 毛細(xì)血管或常規(guī)PCR 核糖體分型(PCR-ribotyping,PCR RT)、多位點(diǎn)可變數(shù)目串聯(lián)重復(fù)序列分析 (Multiple locus variable-number tandem repeat analysis, MLVA)和多位點(diǎn)序列分型(Multilocous sequence typing,MLST)。

自2000 年以來(lái), 因?qū)t霉素和莫西沙星耐藥的高毒力菌株RT027 在北美和歐洲暴發(fā)流行,CDI病例大幅增加,臨床表現(xiàn)更嚴(yán)重,病死率、復(fù)發(fā)率和結(jié)腸切除率更高[5]。 美國(guó)CDC 于2012—2017 年共分離出593 株Cd 菌株, 其中以RT027 (23.1%)、RT016(16.9%)和RT002(13.3%)型別最常見(jiàn)[10]。 為期5 年的歐洲Cd 流行縱向監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)顯示,以RT027(11.4%)、RT001(9.1%)和RT078(8.0%)菌株最常見(jiàn)[11]。 波蘭數(shù)據(jù)顯示,2021 年CDI 發(fā)生率是2020 年的2 倍(26.4/10 萬(wàn)vs55.1/10 萬(wàn)),在13 家醫(yī)院中共分離出215 株Cd 菌株, 其中RT027 型別占77.2%[12]。

此外,其他分型Cd 菌株也在世界各地流行。 墨西哥2014—2018 年主要流行ST1/RT027 (71.4%)型別[13], 澳大利亞在2015—2018 年主要流行RT014/020(30.1%)、RT002(10.4%)和RT056(5.7%)型別[14]。伊朗Cd 菌株中以ST54(57.9%)與ST2(31.6%)型別常見(jiàn)[15]。 韓國(guó)2018 年分離的413 株Cd 菌株中,以RT018(21.8%)與RT014/020(15.5%)型別多見(jiàn)[16]。泰國(guó)2017—2018 年分離的321 株Cd 菌株中以RT017(18%)與RT014(12%)型別常見(jiàn)[17]。中國(guó)主要流行的菌株包括ST3、ST37(RT017)和ST54 型別[18],不同地區(qū)流行菌株有所差異。 寧波6 個(gè)月分離出177 株產(chǎn)毒Cd 菌株, 主要為ST3 (26.2%)、ST54 (16.9%)和ST2(10.0%)型別[8],而武漢地區(qū)以ST54(35.6%)型別最多[19]。 重慶醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院在2014 年6月至2016 年3 月分離出的55 株Cd 菌株中,以ST2/RT449(14.5%)、ST39/RT085(12.7%)和ST37/RT017(9.0%)型別為主[7]。 2021 年中南大學(xué)湘雅醫(yī)院共分離出184 株Cd 菌株,以ST3 最常見(jiàn),≥50%為多重耐藥菌[20]。北京友誼醫(yī)院2023 年公布的數(shù)據(jù)顯示,在2020 年9 月至2022 年6 月分離的243 株產(chǎn)毒Cd 菌株中,最常見(jiàn)的是ST81(20.58%)、ST42(14.40%)和ST2(12.76%)型別[21],這與中國(guó)其他地區(qū)流行菌株情況不太相同。相較于歐美,中國(guó)關(guān)于Cd菌株的流行情況報(bào)道少,有待推進(jìn)CDI 的監(jiān)測(cè)管理。

三、Cd 耐藥情況

Cd 是2019 年美國(guó)CDC 公布的五大抗菌藥物耐藥菌緊急威脅之一[22],共可通過(guò)獲得可移動(dòng)基因元件、抗菌藥物結(jié)合靶點(diǎn)的改變以及代謝變化或形成生物膜等產(chǎn)生耐藥。一項(xiàng)納入1992—2019 年111項(xiàng)Cd 抗菌藥物耐藥的系統(tǒng)回顧和薈萃分析研究結(jié)果顯示,Cd 菌株對(duì)環(huán)丙沙星的耐藥率為77.3%,利福平為42.3%,頭孢曲松為37.1%,莫西沙星為34.1%,克林霉素為34.0%,萬(wàn)古霉素為3.7%,甲硝唑?yàn)?.2%[23]。

不同地區(qū)分離的Cd 菌株對(duì)抗菌藥物耐藥差異大。 在美洲地區(qū),美國(guó)2 家醫(yī)院的Cd 數(shù)據(jù)顯示,對(duì)萬(wàn)古霉素耐藥率為33.6%, 對(duì)甲硝唑?yàn)?9.4%[24];墨西哥7 家醫(yī)院分離的Cd 菌株中,對(duì)莫西沙星、克林霉素和利福平的耐藥率分別為90.4%、88.8%和85.7%[13]。 歐洲Cd 流行縱向監(jiān)測(cè)顯示, 僅分離出1株Cd 菌株(RT344)對(duì)非達(dá)霉素耐藥,甲硝唑耐藥率為0.2%,萬(wàn)古霉素為0.03%,莫西沙星為40.1%,克林霉素為51.3%[11]。 德國(guó)國(guó)家參考中心2014—2019年分離出的1 535 株Cd 菌株, 對(duì)萬(wàn)古霉素均敏感,對(duì)甲硝唑、莫西沙星、克拉霉素和利福平的耐藥率分別為2.7%、57.1%、53.2%和19.2%, 幾乎所有的RT027 對(duì)莫西沙星和克拉霉素耐藥, 對(duì)甲硝唑耐藥率最高 (5.9%)[25]。 以色列一項(xiàng)研究發(fā)現(xiàn)123 株Cd菌株中53.6%可產(chǎn)生生物膜, 其中對(duì)甲硝唑和萬(wàn)古霉素敏感性下降株產(chǎn)膜增加[26]。 在非洲地區(qū),肯尼亞一項(xiàng)關(guān)于臨床分離的71 株Cd 抗菌藥物敏感性檢測(cè)顯示,多重耐藥(MDR)率為85.9%[27]。 在亞洲地區(qū), 伊朗在2010 年7 月至2016 年9 月分離的46株Cd 菌株,對(duì)萬(wàn)古霉素均敏感,對(duì)甲硝唑耐藥率為67.4%、莫西沙星為78.3%、替加環(huán)素為82.6%,MDR占67.3%[28]。 有學(xué)者對(duì)來(lái)自日本、韓國(guó)和中國(guó)的140株Cd 菌株進(jìn)行敏感性檢測(cè), 發(fā)現(xiàn)RT017 型菌株對(duì)克林霉素100%耐藥、莫西沙星為91.3%,MDR 菌株主要源于中國(guó)和韓國(guó)[29]。澳大利亞10 個(gè)微生物實(shí)驗(yàn)室測(cè)定2015—2018 年1 091 株Cd 菌株顯示, 所有菌株對(duì)甲硝唑、非達(dá)霉素、利福昔明和阿莫西林/克拉維酸鉀敏感,對(duì)克林霉素耐藥率最高為85.2%[14]。

在我國(guó), 有學(xué)者檢測(cè)武漢地區(qū)2016 年6 月至2017 年9 月73 株產(chǎn)毒Cd 菌株,發(fā)現(xiàn)對(duì)環(huán)丙沙星的耐藥率為71.2%, 紅霉素為61.6%,MDR 占53.4%,對(duì)甲硝唑和萬(wàn)古霉素敏感[19]。 重慶地區(qū)的55 株Cd菌株對(duì)紅霉素和克林霉素耐藥率為87.3%和61.8%,MDR 占14.5%,對(duì)甲硝唑和萬(wàn)古霉素均敏感[7]。寧波地區(qū)177 株Cd 菌株對(duì)克林霉素耐藥率最高為83.8%,MDR 占45.4%,對(duì)甲硝唑和萬(wàn)古霉素敏感[8]。北京一家醫(yī)院2023 年發(fā)表的數(shù)據(jù)顯示,181 株主流Cd 菌株對(duì)甲硝唑、 萬(wàn)古霉素和美羅培南均敏感,對(duì)環(huán)丙沙星耐藥率最高為96.69%, 對(duì)克林霉素為92.27%,莫西沙星為40.33%,利福昔明為2.76%,僅有1 株ST1 對(duì)非達(dá)霉素耐藥[21]。 成都某醫(yī)院2015—2017 年分離的73 株Cd 菌株中有79.5%耐克林霉素,對(duì)甲硝唑、萬(wàn)古霉素、非達(dá)霉素和硝唑尼特均敏感[30]。 總體而言,中國(guó)分離的Cd 菌株通常對(duì)甲硝唑和萬(wàn)古霉素敏感,而對(duì)克林霉素和喹諾酮類(lèi)(環(huán)丙沙星、莫西沙星)耐藥率高[31]。

2021 年全球Cd 數(shù)據(jù)顯示, 對(duì)利福昔明敏感性降低或耐藥發(fā)生率為99.5%, 對(duì)莫西沙星耐藥率為37.9%,對(duì)萬(wàn)古霉素為32.8%,對(duì)甲硝唑?yàn)?4.5%,不容忽視[32]。 迄今對(duì)非達(dá)霉素耐藥少見(jiàn),除美國(guó)外,全球其他地區(qū)萬(wàn)古霉素耐藥率較低。 因此,非達(dá)霉素和萬(wàn)古霉素仍為治療CDI 的一線藥物,但其耐藥率的上升趨勢(shì)值得重視。

四、Cd 耐藥株分子流行病學(xué)特征

Cd 菌株的MDR 菌株常見(jiàn), 不同地區(qū)MDR 分子流行情況不同。 2011—2017 年美國(guó)26 家醫(yī)院分離的940 株Cd 菌株中,對(duì)莫西沙星、利福平、克林霉素和萬(wàn)古霉素耐藥的菌株主要為RT027 型別,在2015—2017 年有12.2%的RT027 同時(shí)對(duì)克林霉素、莫西沙星、利福平、四環(huán)素耐藥[33]。歐洲Cd 流行病學(xué)監(jiān)測(cè)結(jié)果顯示,RT027 對(duì)甲硝唑、利福平、莫西沙星和美羅培南表現(xiàn)出持續(xù)的耐藥性或敏感性下降[11]。德國(guó)分離的RT027 菌株對(duì)克拉霉素、莫西沙星和利福平耐藥率高,分離的RT017 和RT078 對(duì)克拉霉素具有高耐藥率(>50%)[34]。 2010—2017 年中國(guó)16 家醫(yī)院發(fā)現(xiàn)的319 株Cd 菌株, 對(duì)克林霉素和紅霉素耐藥的主要型別為ST3, 其次是ST35、ST54 和ST37;對(duì)左氧氟沙星和莫西沙星耐藥的主要型別為ST37、ST35 和ST3;ST37/RT017 為對(duì)四環(huán)素、 氯霉素、美羅培南和利福平耐藥率低的主要型別[35]。 總體而言,歐美分離的Cd 耐藥菌株主要為RT027 型別,而中國(guó)分離的ST3、ST35、ST37 和ST54 型別與高比例抗菌藥物耐藥相關(guān)。

五、CDI 防控策略

抗菌藥物的使用是CDI 發(fā)生的選擇壓力風(fēng)險(xiǎn)因素,尤其是喹諾酮類(lèi)藥物、頭孢菌素類(lèi)藥物、克林霉素[36],并易誘導(dǎo)Cd 菌株MDR 的發(fā)生。 不斷變化的Cd 耐藥性可在不同類(lèi)別細(xì)菌及不同Cd 菌株間傳播,致CDI 暴發(fā)流行,抗菌藥物管理與醫(yī)院感染防控是克服Cd 耐藥、預(yù)防CDI 的關(guān)鍵。 抗菌藥物管理包括選擇合適的抗菌藥物治療CDI 和非CDI。 醫(yī)院感染防控需全院、全社會(huì)協(xié)調(diào)合作,重在反復(fù)培訓(xùn)、宣教與踐行[37]。 2022 年美國(guó)醫(yī)療保健流行病學(xué)學(xué)會(huì)/傳染病學(xué)會(huì)/感染控制和流行病學(xué)專(zhuān)業(yè)人員協(xié)會(huì)實(shí)踐[38]建議對(duì)明確CDI 患者采取接觸隔離(首選單間隔離, 延長(zhǎng)無(wú)癥狀患者接觸隔離時(shí)間直至出院), 同時(shí)使用推薦的稀釋的次氯酸鈉等芽孢殺滅劑,清潔消毒CDI 患者用過(guò)的設(shè)備或周?chē)h(huán)境。 不推薦對(duì)無(wú)腹瀉患者常規(guī)檢測(cè)Cd。 患者-患者間傳播主要經(jīng)醫(yī)務(wù)人員被Cd 芽孢污染的手發(fā)生, 相關(guān)人員應(yīng)做好手衛(wèi)生,醫(yī)院感染管理部門(mén)需對(duì)各個(gè)流程進(jìn)行監(jiān)督,并建立CDI 監(jiān)測(cè)與報(bào)告分析系統(tǒng)。 《中國(guó)艱難梭菌醫(yī)院感染預(yù)防與控制指南》建議包括基于醫(yī)院層面優(yōu)化抗菌藥物的合理使用、對(duì)醫(yī)務(wù)工作者和患者及其家屬進(jìn)行防控CDI 的培訓(xùn)教育, 開(kāi)展CDI 流行監(jiān)測(cè)和目標(biāo)人群檢測(cè), 做好接觸隔離和個(gè)人防護(hù)等[39]。

六、結(jié)語(yǔ)

目前CDI 形勢(shì)依然嚴(yán)峻,治療的一線藥物萬(wàn)古霉素與非達(dá)霉素耐藥率低,但喹諾酮類(lèi)和克林霉素耐藥率普遍較高,MDR 菌株也多見(jiàn),可能加速Cd 的選擇進(jìn)化,導(dǎo)致全球CDI 的傳播、暴發(fā)與流行。 迄今中國(guó)CDI 監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)有限, 需進(jìn)一步完善監(jiān)測(cè)系統(tǒng),了解HA-CDI 和CA-CDI 情況,重視CDI 預(yù)防,減少Cd 耐藥傳播。

利益沖突所有作者均聲明不存在利益沖突

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