郝紅燕,?;弁?,呂山花,樊穎倫,李海云
(聊城大學(xué)農(nóng)學(xué)院,山東 聊城 252059)
植物在生長發(fā)育過程中經(jīng)常遭遇干旱、高鹽、高溫、低溫、營養(yǎng)缺乏等非生物脅迫以及病害、蟲害、雜草等生物脅迫[1],造成作物根系活力降低、細(xì)胞膜透性增加、葉綠素含量下降、光合作用變?nèi)?、抗氧化酶活性下降等,使得作物生長受到抑制,最終導(dǎo)致產(chǎn)量和品質(zhì)下降[2?4]。為應(yīng)對這些逆境脅迫,植物在分子、細(xì)胞、生理和生化水平上進(jìn)化出了不同的調(diào)節(jié)機(jī)制,其中利用轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控逆境相關(guān)基因的表達(dá),從而抵御脅迫傷害是一種最重要的防御機(jī)制[5?6]。研究者已在植物中發(fā)現(xiàn)64 種轉(zhuǎn)錄因子[7],其中,很多轉(zhuǎn)錄因子家族參與植物逆境脅迫響應(yīng),調(diào)控植物的抗逆性,例如:MYB(v?myb avian myeloblastosis viral oncogene homolog)[8]、bZIP(Basic leucine zippers)[9]、bHLH(Basic helix?loop?helix protein)[10]、NAC(No apical meristem,ATAF1/2 and cup?shaped cotyledon)[11]、WRKY[12]等。其中,bZIP 轉(zhuǎn)錄因子是高等植物中數(shù)量龐大,并且十分保守的基因家族之一。在不同植物中,bZIP 轉(zhuǎn)錄因子成員數(shù)量有所差異,其中,擬南芥(Arabidopsis thaliana)中發(fā)現(xiàn)了78 個成員[13],在玉米(Zea maysL.)[14]、小麥(Triticum aestivumL.)[15]、大豆(Glycine maxL.)[16]、陸地棉(Gossypium hirsutumL.)[17]中分別發(fā)現(xiàn)了125、187、160、151 個成員。研究發(fā)現(xiàn),bZIP 轉(zhuǎn)錄因子參與多種生物學(xué)過程,如調(diào)控植物生長發(fā)育,包括種子的萌發(fā)[18],植物根、莖等各個器官的生長和發(fā)育[19?22],植物衰老[21?22],光信號傳導(dǎo)[23];參與植物對生物[24?26]和非生物脅迫[27?28]的響應(yīng)等。超表達(dá)[29?30]或者沉默其表達(dá)[31]可以提高植物對非生物和生物脅迫的抗性。對bZIP轉(zhuǎn)錄因子的結(jié)構(gòu)、分類及其提高植物對非生物脅迫(干旱、高溫、低溫、高鹽、營養(yǎng)缺乏等)和生物脅迫抗性等方面的最新研究進(jìn)展進(jìn)行了較全面地綜述,以期為bZIP轉(zhuǎn)錄因子的應(yīng)用及植物抗逆遺傳改良提供參考。
bZIP 轉(zhuǎn)錄因子的保守結(jié)構(gòu)域由60~80 個氨基酸殘基組成,包含堿性氨基酸區(qū)和亮氨酸拉鏈區(qū),這2 個區(qū)域在結(jié)構(gòu)和功能上是不同的[32]。堿性氨基酸區(qū)域的序列高度保守,由大約16個氨基酸殘基組成,基序不變,為N-X7-R/K-X9,負(fù)責(zé)識別啟動子上的特定序列并與之結(jié)合[33]。亮氨酸拉鏈區(qū)域是由1個或多個含有7 個氨基酸殘基的重復(fù)區(qū)組成,其中,每個重復(fù)區(qū)的第7位是亮氨酸,其余的氨基酸包括異亮氨酸、蛋氨酸、纈氨酸、甲硫氨酸等,該區(qū)域可介導(dǎo)bZIP蛋白的同源或異源二聚體的形成,具有轉(zhuǎn)錄激活或抑制功能[5,34]。
JAKOBY 等[9]根據(jù)bZIP 堿性氨基酸區(qū)的序列相似性,將擬南芥75 個bZIP 基因分為10 個亞家族(A—I 和S)[9]。DR?GE-LASER 等[13]在此基礎(chǔ)上添加了bZIP76—bZIP79,并排除了1 個假基因(bZIP73),根據(jù)bZIP 和其他保守序列的相似性進(jìn)行分組,增加了3 個亞家族,即M、K 和J。后來,參照擬南芥bZIP 基因家族的分類標(biāo)準(zhǔn),將大豆的160 個bZIP基因分為12個亞家族(A—K 和S)[16],陸地棉的151 個bZIP 基因分為12 個亞家族(A—I、K、N 和S)[17],甘薯(Ipomoea batatasL.)的87 個bZIP 基因分為12 個亞家族(A—K 和S)[35],高粱(Sorghum bicolorL.)的92 個bZIP 基因分為10 個亞家族(A—I 和S)[36],核桃(Juglans regiaL.)的88 個bZIP 基因分為13 個亞家族(A—K、M 和S)[37],油菜(Brassica napusL.)的247 個bZIP 基因分為10 個亞家族(A—I 和S)[38],馬鈴薯(Solanum tuberosumL.)的56 個bZIP 基因分為10 個亞家族(A—J)[39],番茄(Solanum lycopersicumL.)的76 個bZIP 基因分成16 個亞家族(A—O 和S)[40],楊樹(Populus trichocarpaL.)的86 個bZIP基因分為12個亞家族(A—J、M和S)[41]等。
植物在生長發(fā)育過程中會遇到各種非生物脅迫,包括干旱、高鹽、高溫、低溫、營養(yǎng)缺失等,這些不利的環(huán)境條件會嚴(yán)重影響植物的生長發(fā)育。在長期進(jìn)化過程中,植物形成了一套響應(yīng)和防御逆境脅迫的機(jī)制。研究發(fā)現(xiàn),超表達(dá)[26,42?43]或者沉默[44?45]bZIP 基因可以提高植物對上述非生物脅迫的抗性。
干旱脅迫是降低作物產(chǎn)量的主要因素之一。過表達(dá)葡萄(Vitis labruscaL.)VlbZIP36基因使擬南芥在種子萌發(fā)、幼苗和成熟階段表現(xiàn)出脫水耐受性,這主要是因為超表達(dá)VlbZIP36基因減少了擬南芥植株的細(xì)胞死亡量,降低了電解質(zhì)滲漏率,提高了抗氧化酶活性和調(diào)控了脫落酸(Abscisic acid,ABA)相關(guān)基因的表達(dá)量,說明VlbZIP36 通過提高植株抗氧化能力和調(diào)控ABA 相關(guān)基因的表達(dá)量來增強(qiáng)擬南芥的抗旱性[46]。干旱脅迫下,過表達(dá)OsbZIP42基因使水稻(Oryza sativaL.)中對ABA 敏感的LEA3(Late embryogenesis abundant group 3)和Rab16(Ras?like in rat brain 16)基因表達(dá)量提高,進(jìn)而增強(qiáng)了水稻對干旱脅迫的耐受性[47]。與野生型相比,過表達(dá)小麥TabZIP174基因使擬南芥植株在干旱脅迫下的失水率降低,葉片脯氨酸、可溶性糖和葉綠素含量升高,且干旱脅迫響應(yīng)基因的表達(dá)量提高[48]。在干旱脅迫下,沉默SlbZIP1基因?qū)е路阎仓曛蠥BA 生物合成和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)基因的表達(dá)量降低,表明SlbZIP1正調(diào)控植物的抗旱性[49]。過表達(dá)CsbZIP50基因使黃瓜(Cucumis sativusL.)植株耐旱性增強(qiáng),主要表現(xiàn)在抗氧化酶活性升高,活性氧(Reactive oxygen species,ROS)和 丙 二 醛(Malondialdehyde,MDA)含量下降,對外源ABA 的敏感性增強(qiáng),應(yīng)激相關(guān)基因的表達(dá)量提高,說明CsbZIP50 通過提高植株抗氧化能力和調(diào)控ABA 相關(guān)基因的表達(dá)量來增強(qiáng)黃瓜對干旱脅迫的耐受性[50]。蘋果(Malus domestica)C/S1 bZIP 網(wǎng)絡(luò)(包括MdbZIP2、MdbZIP39 和MdbZIP80)直接抑制了MdIPT5b(Isopentenyl transferase 5b)基因的表達(dá),進(jìn)而使轉(zhuǎn)基因蘋果愈傷組織和番茄幼苗的耐旱性提高[51]。上述研究結(jié)果不僅表明bZIP 轉(zhuǎn)錄因子在植物抗旱響應(yīng)過程中具有重要作用,也為通過基因工程技術(shù)利用bZIP 轉(zhuǎn)錄因子提高作物的抗旱能力提供了參考。
土壤高鹽脅迫被認(rèn)為是一種主要的環(huán)境脅迫,其限制植物生長,降低作物產(chǎn)量[52?53]。因此,提高植物的耐鹽性迫在眉睫。過表達(dá)藍(lán)莓(Vacciniumspp.)VabZIP12基因提高了擬南芥植株中抗氧化酶活性和氧化應(yīng)激相關(guān)基因的表達(dá)量,進(jìn)而提高了擬南芥植株的耐鹽性[54]。過表達(dá)大豆GmbZIP2基因擬南芥植株在鹽脅迫下的存活率顯著高于野生型,轉(zhuǎn)基因擬南芥葉片的MDA含量和相對電導(dǎo)率降低,進(jìn)而增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因植株的耐鹽性[55]。在鹽脅迫下,過表達(dá)辣椒(Capsicum annuumL.)CabZIP25基因使擬南芥發(fā)芽率、鮮質(zhì)量、葉綠素含量和根長均高于野生型,沉默CabZIP25基因使辣椒在鹽脅迫下葉綠素含量低于野生型,可知CabZIP25 正調(diào)控植物的耐鹽性[56]。過表達(dá)甘薯IbbZIP1基因提高了鹽脅迫下擬南芥植株中ABA、脯氨酸合成和ROS 清除系統(tǒng)相關(guān)基因的表達(dá)量,進(jìn)而提高了擬南芥植株的耐鹽性[57]。在鹽脅迫下,過表達(dá)苦蕎(Fagopyrum tataricumL.)FtbZIP5基因提高了擬南芥植株中ABA 響應(yīng)基因(RD29A、RD29B、RAB18、RD26、RD20和COR15)的表達(dá)水平,進(jìn)而提高了擬南芥植株的耐鹽性[58]。過表達(dá)TabZIP15基因使小麥植株在300 mmol/L NaCl處理20 d 后萎蔫程度明顯低于野生型;通過雙分子熒光互補(bǔ)試驗發(fā)現(xiàn),TabZIP15與烯醇化酶TaENO-b相互作用,參與糖酵解和糖異生途徑的調(diào)控,從而提高小麥的耐鹽性[59]。同樣,過表達(dá)馬鈴薯StbZIP65基因使擬南芥的耐鹽性也有所提高[60]。
高溫抑制作物的生長,并在世界范圍內(nèi)造成巨大的產(chǎn)量損失。過表達(dá)小麥TabZIP60s基因提高了擬南芥植株中內(nèi)質(zhì)網(wǎng)應(yīng)激相關(guān)基因的表達(dá)量,進(jìn)而提高了植株的耐熱性[61]。同樣地,過表達(dá)bZIP60基因也使玉米[62]和番茄[63]的耐熱性提高。過表達(dá)小麥TabZIP28基因提高高溫脅迫下擬南芥植株的成活率和種子發(fā)芽率,提高了擬南芥的耐熱性[64]。小麥中bZIP 成員TaOBF1-5B(Ocs?element binding factor 1?5B)與細(xì)胞核中的TaHSP90(Heat shock protein 90)以及核仁和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中的TaSTI(Stress?induced protein)相互作用,提高了應(yīng)激反應(yīng)基因的表達(dá)量,從而提高了植物的耐熱性[65]。
低溫脅迫會破壞細(xì)胞膜,增加體內(nèi)ROS 含量,從而影響植物的生長和生理狀態(tài)。過表達(dá)小麥TaABI5(TabZIP96)基因提高了擬南芥中冷響應(yīng)基因的表達(dá)量,進(jìn)而提高了擬南芥的抗凍性[66]。小麥TabZIP6 通過與CBFs(C?repeat binding factors)的啟動子結(jié)合,降低下游COR(Cold?regulated)基因的表達(dá),增強(qiáng)對低溫的敏感性,是冷脅迫反應(yīng)的負(fù)調(diào)控因子[67]。玉米ZmbZIP68 也是冷脅迫反應(yīng)的負(fù)調(diào)控因子,bZIP68 與MPK8(Mitogen?activated protein kinase 8)相互作用,不僅提高了bZIP68 蛋白在4 ℃下的穩(wěn)定性,而且提高其與DREB1(Dehydration?responsive element?binding protein 1)基因啟動子的結(jié)合能力,抑制了冷誘導(dǎo)的DREB1基因的表達(dá)[68]。在低溫條件下,過表達(dá)茶樹(Camellia sinensisL.)CsbZIP18基因減弱了擬南芥植株對ABA 的敏感性,提高了相對電解質(zhì)滲漏率,降低光系統(tǒng)Ⅱ的最大量子效率(Fv/Fm),抑制與ABA 穩(wěn)態(tài)、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)和非生物脅迫相關(guān)基因RD22(Responsive to dehydration protein 22)、RD26(Responsive to dehydration protein 26)和RAB18(Ras?like in rat brain 18)的表達(dá)量,說明CsbZIP18 是依賴于ABA 途徑的耐冷性負(fù)調(diào)控因子[69]。在蘋果中,MdHY5(Elongated hypocotyl 5)通過與MdCBF1啟動子的G-Box 序列結(jié)合,正向調(diào)控MdCBF1的轉(zhuǎn)錄;同時,MdHY5 還調(diào)控CBF 冷調(diào)控基因的表達(dá)量,推斷MdHY5 通過依賴CBF 和不依賴CBF 途徑正向調(diào)節(jié)植物耐冷性[70]。在菊花[Dendranthema gradifolium(Ramat)Kitam] 中 ,DgbZIP3 與DgbZIP2 相互作用,調(diào)控DgPOD(Peroxidase)的表達(dá),提高抗氧化酶活性,調(diào)節(jié)ROS平衡,從而提高菊花對低溫脅迫的耐受性[71]。
植物在生長發(fā)育過程中需要各種營養(yǎng)元素,包括大量元素和微量元素。已報道的與營養(yǎng)元素脅迫相關(guān)的bZIP 轉(zhuǎn)錄因子較少,主要集中于磷(Phosphorus,P)、氮(Nitrogen,N)、鐵(Ferrum,F(xiàn)e)和鋅(Zinc,Zn)方面。研究發(fā)現(xiàn),bZIP44基因參與植物缺鐵脅迫應(yīng)答,可直接調(diào)節(jié)NAS2(Nicotianamine synthase 2)和MYB10基因的表達(dá)量,進(jìn)而提高植物在缺鐵脅迫下的耐受能力[72]。在缺鐵條件下,過表達(dá)bZIP44基因使擬南芥植株葉片葉綠素含量顯著高于野生型,可見bZIP44正調(diào)控植物對缺鐵的耐受性[72]。在缺鋅條件下,過表達(dá)AtbZIP19提高了擬南芥植株中參與根系吸收鋅的ZIP9等基因的表達(dá)量,AtbZIP19缺失突變體對鋅脅迫的敏感性明顯高于野生型,表明AtbZIP19 正向調(diào)控植物對缺鋅的耐受性[73]。同樣在擬南芥中,AtbZIP19 的同源蛋白AtbZIP23 也正向調(diào)控植物對缺鋅的耐受性[74]。與AtbZIP19 和AtbZIP23 相似度最高的水稻OsbZIP48也是缺鋅響應(yīng)的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子[75]。超表達(dá)擬南芥AtTGA4基因提高了小麥低磷脅迫條件下莖稈磷含量、莖葉籽??偭缀浚f明超表達(dá)AtTGA4基因可以改善轉(zhuǎn)基因小麥對磷的吸收和運(yùn)輸,增強(qiáng)轉(zhuǎn)基因小麥對低磷脅迫的耐受性,提高低磷脅迫條件下的小麥產(chǎn)量[76]。
bZIP 轉(zhuǎn)錄因子不僅在植物響應(yīng)非生物脅迫中發(fā)揮重要作用,還參與調(diào)控植物的生物脅迫。過表達(dá)葡萄VvbZIP60基因提高了擬南芥植株中水楊酸(Salicylic acid,SA)的積累量,上調(diào)SA 信號通路中病程相關(guān)基因PR1(Pathogenesis related 1)的表達(dá)量,增強(qiáng)了對白粉病的抗性[77]。通過對盾殼霉(Coniothyrium minitans)中的bZIP 基因家族進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)CmbZIP基因在非生物脅迫反應(yīng)、分生孢子形成和應(yīng)對真菌寄生中起重要作用,進(jìn)而增強(qiáng)對病原菌的抗性[78]。小麥TabZIP1通過乙烯/茉莉酸甲酯依賴性信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑增強(qiáng)對條銹病病原體(Puccinia striiformisf.sp.tritici)感染的應(yīng)激耐受性和防御反應(yīng)[79]。大豆GmbZIP15 通過調(diào)節(jié)抗氧化防御系統(tǒng)和植物激素信號傳導(dǎo)增加了對核盤菌(Sclerotinia sclerotiorum)和疫霉菌(Phytophthora sojae)的抗性[80]。過表達(dá)西洋參(Panax quinquefoliusL.)PqbZIP1基因提高了番茄和本氏煙草中茉莉酸(Jasmonic acid,JA)、水楊酸和脫落酸含量,進(jìn)而抑制了丁香假單胞菌(Pseudomonas syringae)和鐮刀菌(Fusariumspp.)的生長,在接種鐮刀菌后,PqbZIP1基因的表達(dá)量持續(xù)增加,表明PqbZIP1 可能介導(dǎo)多種激素信號通路來調(diào)節(jié)西洋參對根腐病的抗性[81]。過表達(dá)辣椒CabZIP1基因增強(qiáng)了擬南芥對丁香假單胞菌的抗性[82]。灰翅夜蛾(Spodoptera littoralis)和草地貪夜蛾(Spodoptera frugiperda)的幼蟲侵害擬南芥和玉米,導(dǎo)致植株受傷害,過表達(dá)向日葵(Helianthus annuus)HD-Zip 轉(zhuǎn)錄因子基因HAHB4(Homeobox 4)使擬南芥和玉米植株上的幼蟲數(shù)量減少,且幼蟲的體質(zhì)量也有所降低,表明過表達(dá)HAHB4基因增強(qiáng)了轉(zhuǎn)基因擬南芥和玉米的抗蟲能力[83]。過表達(dá)擬南芥ATHB13基因使擬南芥植株對病原菌如白粉菌(Oidium neolycopersici)、霜霉菌(Hyaloperonospora arabidopsidis)和昆蟲如桃蚜(Myzus persicae)的抗性增強(qiáng),但其保留了對丁香假單胞菌的易感性,說明ATHB13基因在植物響應(yīng)生物脅迫應(yīng)答中可能具有雙重作用[84]。
bZIP 轉(zhuǎn)錄因子是植物中最大的轉(zhuǎn)錄因子家族之一,在植物抵御干旱、高鹽、低溫、高溫等非生物脅迫以及病蟲害等生物脅迫中具有十分重要的調(diào)控作用。目前,已成功利用基因工程技術(shù)在多種植物中通過過表達(dá)bZIP基因提高了植物抗性,為植物抗逆性改良奠定了堅實的基礎(chǔ)。但是,該領(lǐng)域仍存在一些亟待解決的問題。首先,許多學(xué)者通過生物信息學(xué)手段對多種植物bZIP 家族進(jìn)行系統(tǒng)分析并對其家族成員中基因結(jié)構(gòu)域、順式作用元件、染色體分布等進(jìn)行分析,預(yù)測每個成員的生物學(xué)功能,但具體功能驗證較少。因此,之后可以加強(qiáng)對bZIP基因的功能驗證,以便找到提高植物抗逆性的優(yōu)良基因。其次,目前對bZIP轉(zhuǎn)錄因子結(jié)構(gòu)和功能的研究已經(jīng)取得了一些進(jìn)展,但具體調(diào)控網(wǎng)絡(luò)不是十分明確,內(nèi)在聯(lián)系也需要進(jìn)一步深入探索,特別是在與其他轉(zhuǎn)錄因子(bHLH、WRKY、NAC 和MYB 等)相互作用以共同響應(yīng)植物脅迫時,是一個轉(zhuǎn)錄因子起主要作用還是幾個轉(zhuǎn)錄因子協(xié)同工作。此外,目前對部分bZIP基因功能研究較明確,但對于信號通路之間的調(diào)控機(jī)制并不十分清楚,例如上游調(diào)控信號是什么,如何調(diào)控下游基因的表達(dá),互作蛋白如何形成調(diào)控網(wǎng)絡(luò)等問題均有待解決。因此,可以通過基因組學(xué)和轉(zhuǎn)錄組學(xué)手段對其進(jìn)行深入研究,以期對bZIP 的逆境調(diào)控機(jī)制進(jìn)行更細(xì)致全面地闡釋。除此之外,對bZIP轉(zhuǎn)錄因子的研究主要集中在模式植物上,對其他植物的研究較少,特別是瀕危植物。因此,需要對bZIP轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)和內(nèi)在機(jī)制進(jìn)行深入研究,利用基因工程技術(shù)增強(qiáng)植物抗逆能力,培育更多抗性新品種,并將其應(yīng)用于瀕危植物中,以應(yīng)對當(dāng)前復(fù)雜多變的環(huán)境。綜上所述,研究bZIP轉(zhuǎn)錄因子具有重要的理論和現(xiàn)實意義。