于 雪 王超萍 任艷華 王 博 付廣青 房經(jīng)貴,*
(1南京農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院,江蘇 南京 210095; 2山東省葡萄研究院,山東 濟南 250199;3江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院,江蘇 南京 210014)
葡萄是產(chǎn)業(yè)鏈最長、全球最重要的果樹之一。由于葡萄果實品質(zhì)是葡萄酒的主要影響因素,葡萄酒的感官屬性與其地理來源相關(guān)。雖然葡萄的環(huán)境適應(yīng)性較強,但生長條件的差異會對釀酒葡萄的果實性狀產(chǎn)生重大影響[1]。
紅葡萄酒葡萄(Vitis viniferaL.)品種美樂是早熟品種,能夠適應(yīng)不同的氣候條件[2],是世界上栽培最多的葡萄品種之一。全球美樂葡萄園面積約為260 000 hm2,在意大利,約有25 000 hm2土地專門用于種植美樂[3]。在我國,山東省是美樂葡萄主栽地區(qū),集中分布于膠東半島,在魯中、魯北等地區(qū)有零星分布[4]。美樂葡萄酒作為市場上最受歡迎的紅酒品種之一,既可用于制作單一品種葡萄酒,也可用于制作混合葡萄酒。
前人研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)色期到成熟期是葡萄漿果變化最大以及內(nèi)在品質(zhì)形成的關(guān)鍵時期[5]。此階段與果實成熟過程有關(guān),包括顏色、風(fēng)味和香氣的變化等[6-9]。進入轉(zhuǎn)色期之后葡萄樹體的生理代謝增強,其中與品質(zhì)形成相關(guān)的K+的日積累速率增加2~4 倍,韌皮部流動水分的速度增加了10倍[5]。
為了探究美樂葡萄在山東的品質(zhì)表現(xiàn),本研究對膠東半島乳山種植的美樂的糖、酸、花青素和酚類等品質(zhì)性狀及其在果實轉(zhuǎn)色期的變化特點進行分析,并與德州地區(qū)種植的美樂品質(zhì)性狀等進行比較分析。進一步利用RNA-seq 分析從分子水平上解析兩地美樂葡萄果實品質(zhì)異同的機理,旨在對膠東半島美樂葡萄的品質(zhì)特征及其與德州美樂葡萄的品質(zhì)差異進行分析,為在膠東半島進一步發(fā)展美樂葡萄以及美樂葡萄的引種推廣提供一定的理論指導(dǎo)。
以山東德州奧德曼酒莊(DZ)與乳山臺依湖酒莊(RS)的美樂葡萄果實為試驗材料。葡萄采用籬架樹形,樹齡為5~10年。德州酒莊美樂產(chǎn)量為9 t·hm-2,乳山產(chǎn)量為3.6 t·hm-2。葡萄園均采用常規(guī)管理措施。乳山臺依湖酒莊(36.89°N,121.52°E),地處山東半島東南端、膠東低山丘陵區(qū),暖溫帶東亞季風(fēng)型大陸性氣候,年平均日照時數(shù)2 095.5 h,年平均氣溫12.4 ℃,年降水量428.3~458.8 mm;德州奧德曼酒莊(37.45°N,116.29°E),地處山東西北部、黃河下游沖積平原,溫帶季風(fēng)氣候,年平均日照時數(shù)2 592 h,年平均氣溫12.9 ℃,平均無霜期長達208 d,年平均降水量為547.5 mm。
樣品分別在轉(zhuǎn)色階段(50%的漿果開始變色,M)和成熟期(T)收集。樣品收集后立即在液氮中單獨冷凍。將所有樣品儲存在-80 °C條件下,以備后續(xù)分析。
采用游標(biāo)卡尺測定果實縱向直徑和橫向直徑,采用電子天平測定粒重;總可溶性固形物(total soluble solid)由PAL-1 手持測糖儀(Atago,日本)測定;總花色苷的測定參照糾松濤[10]的方法,采用pH 值示差法;參照Guan 等[11]的方法,使用液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(liquid chromatograph mass spectrometer,LC-MS)測定花色苷成分??偡拥臏y定采用高效液相色譜(high performance liquid chromatography,HPLC)法[12];使用氫氧化鈉溶液滴定法測定可滴定酸含量[13];可溶性糖含量的測定參考文獻[14]。
1.2.1 果實糖組分和有機酸組分的提取與測定 糖酸的測定采用高效液相色譜法,參照先前報道的方法并加以改良[15-16]。取0.2 g 果肉粉末于2 mL 離心管中,加入1.5 mL 超純水;80 ℃加熱30 min;加熱后12 000 r·min-1條件下離心10 min,吸取上清液到干燥的容器中(10 mL 管);重復(fù)上述步驟2 次。合并2 次的上清液,吸取上清液過濾到進樣瓶,待測。
糖組分的測定色譜條件:采用HPLC-MLSD 色譜儀(安捷倫,上海),Prevail Carbohydrate ES 5μ柱(100 mm×4.6 mm,5 μm);流動相:V(乙腈)∶V(水)=80∶20;柱溫:50 ℃;流速:1.0 mL·min-1;進樣量:20 μL。有機酸組分的測定色譜條件:色譜柱為Discovery C18 柱(25 cm×4.6 mm,5 m);流動相為50 mmol·L-1的K2HPO4溶液,用磷酸調(diào)節(jié)pH 值至2.4;柱溫30 ℃;流速0.5 mL·min-1;進樣量2 μL;檢測波長為210 nm。
1.2.2 果實香氣含量的分析 葡萄果實香氣的提取采用頂空固相微萃?。╤eadspace solid phase microextraction,HS-SPME)技術(shù)。提取方法參照文獻[17]并進行了改良:稱取3 g 研碎的葡萄果實裝到20 mL 的頂空瓶中,向其中加入3 mL 飽和NaCl 溶液,再加入2 μL 色譜級3-辛醇(使用乙醇梯度稀釋至萬分之一濃度)作為內(nèi)標(biāo),加蓋并與柱面混合器混合10 min,插入50/30 μm PDMS/DVB/CAR SPME 萃取頭(Supelco,美國)。
氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用(gas chromatograohy-mass spectrometry,GC-MS)測定:使用J&W 122-4732 DB-17ms(30 m×0.25 mm×0.25 μm)色譜柱在GC-MS/MS Quantum TSQ 9000/TRACE 1310(Thermo Fisher Scientific,美國)上進行分析。MS條件:質(zhì)譜儀采用EI模式,電壓為70 eV;離子源溫度為230 ℃;掃描速率為2.88 scan·s-1;質(zhì)譜檢測范圍為29~540 m/z,載氣為氦氣,流速為1.0 mL·min-1。
使用十六烷基三甲基溴化銨(hexadecyl trimethyl ammonium bromide,CTAB)方法提取總RNA。文庫制備和轉(zhuǎn)錄組測序由北京新近紀(jì)科技股份有限公司完成。使用DESeq2 進行差異表達基因(differential gene expression)分析。采用clusterProfile(4.2.1)軟件對GO富集和KEGG通路進行分析。
采用Microsoft Excel 2019 軟件處理數(shù)據(jù),使用TBtools v1、Prism 8.0.2 制圖,并使用SPSS 17.0 和Blast2GO分析軟件進行數(shù)據(jù)分析。
分析表明,兩個地區(qū)美樂葡萄成熟期果實特征相似(圖1)。乳山臺依湖酒莊(以下稱乳山)與德州奧德曼酒莊(以下稱德州)收集的葡萄果實的粒重、橫徑、縱徑、TSS、可溶性糖以及總有機酸分別相差0.41 g、0.247 mm、0.98 mm、2.1 個百分點、0.505 個百分點、0.188 個百分點。花色苷、酚含量差異較大,乳山葡萄含量分別為0.385、8.553 mg·g-1,德州為3.576、12.278 mg·g-1,相差3.196、3.735 mg·g-1。乳山葡萄果實中可溶性糖和總有機酸含量高于德州,總花色苷、總酚、粒重、橫徑、縱徑以及TSS含量低于德州。
圖1 美樂葡萄在乳山和德州的轉(zhuǎn)色期和成熟期生理指標(biāo)的測定Fig.1 Determination of physiological indicators of Véraison stage and maturity stage of Merlot berries in Rushan and Dezhou
葡萄果實中酸成分主要包括檸檬酸、蘋果酸、酒石酸,糖成分主要包括葡萄糖和果糖。本研究結(jié)果如圖1 所示,乳山和德州葡萄果實主要酸成分都為酒石酸且差異極顯著,分別為3.271、2.666 mg·g-1。乳山果實中蘋果酸和檸檬酸含量與酒石酸分別相差1.925、3.15 mg·g-1,德州分別相差0.883、2.34 mg·g-1。乳山葡萄果實中的葡萄糖和果糖含量都高于德州,分別相差5.288、1.111 mg·g-1。
進一步分析兩地差異較大的花色苷、酚的種類及主要成分含量發(fā)現(xiàn)(圖2),雖然乳山葡萄果實花色苷種類為25 種,德州為14 種,但德州花色苷主要成分含量高于乳山。德州葡萄果實中總酚含量是乳山的1.4倍。兩種果實的主要多酚成分含量差異顯著或極顯著。表沒食子兒茶素為乳山漿果中檢測到的主要多酚成分,是表兒茶素沒食子酸酯含量的60 倍。表兒茶素沒食子酸酯為德州漿果中檢測到的主要多酚成分,是原花青素B1含量的76倍。
圖2 美樂葡萄在乳山和德州成熟期花色苷及多酚分析Fig.2 Analysis of anthocyanins and polyphenols in the ripening stages of Merlot grapes in Rushan and Dezhou
在轉(zhuǎn)色時期,美樂葡萄在兩個酒莊的品質(zhì)性狀存在一定差異(圖1)。乳山葡萄果實中總有機酸含量、橫徑、縱徑、粒重高于德州,可溶性糖、TSS、總花色苷、總酚含量低于德州。可溶性糖、總酚、花色苷、TSS 含量在不同的環(huán)境條件下差異極顯著??扇苄蕴恰⒖偡右约癟SS相差3.797個百分點、3.133 mg·g-1、2.133個百分點。德州葡萄果實中總花色苷含量是乳山的9倍。
從轉(zhuǎn)色期到成熟階段,美樂的品質(zhì)在各方面均發(fā)生變化(圖1)。葡萄果實有機酸含量降低,可溶性糖、TSS、總花色苷、總酚、橫徑、縱徑、粒重均升高。其中,兩個地區(qū)總有機酸、TSS、總酚、粒重變化量相近,乳山果實變化量分別為0.579個百分點、2.033個百分點、4.17 mg·g-1、0.367 g,德州分別為0.562 個百分點、2.133 個百分點、4.776 mg·g-1、0.82 g。乳山果實中可溶性糖含量在轉(zhuǎn)色到成熟階段變化較大,為6.709 個百分點,德州為2.41 個百分點。德州葡萄果實中總花色苷含量變化較大,為3 mg·g-1,乳山變化量為0.321 mg·g-1。
為了了解美樂葡萄在不同產(chǎn)區(qū)基因的表達情況,對德州奧德曼和乳山臺依湖酒莊的美樂葡萄的轉(zhuǎn)色和成熟階段進行轉(zhuǎn)錄組分析,并將獲得原始數(shù)據(jù)進行整理。測序質(zhì)量良好,測序數(shù)據(jù)可用于進一步分析。
分析結(jié)果表明,兩地均是轉(zhuǎn)色期的基因數(shù)量多于成熟期(表1)。轉(zhuǎn)色期到成熟期,乳山和德州基因數(shù)量分別減少295、37 個。兩個時期數(shù)量相近,乳山的基因數(shù)量較多,分別為22 157、21 862 個。進一步以Padj≤0.05 和|log2FoldChange|≥1 作為篩選差異表達基因(DEGs)的閾值,發(fā)現(xiàn)乳山的DEGs 表達數(shù)量較多,為5 695,約占所有表達基因的26%;德州的表達基因數(shù)量為4 488個,占所有表達基因的22%。
表1 不同地區(qū)不同時期表達基因數(shù)和DEG數(shù)Table 1 The number of expressed genes and the number of DEGs in each winery in different periods
進一步總結(jié)分析DEGs的上調(diào)和下調(diào)基因,發(fā)現(xiàn)兩個地區(qū)的上調(diào)基因數(shù)量均少于下調(diào)基因數(shù)量。乳山的上下調(diào)基因數(shù)量分別為2 340、3 355 個,德州的分別為2 092個、2 396個(圖3-B)。比較兩個酒莊美樂葡萄的DEGs,發(fā)現(xiàn)有1 610個相同的基因(圖3-A)。根據(jù)Padj≤0.05 和|log 2(FoldChange) |≥1 的閾值篩選出DEGs(圖3-C),分析轉(zhuǎn)色時期與成熟時期兩個地區(qū)不同染色體上的差異基因表達水平。結(jié)果表明,同一產(chǎn)區(qū)高表達基因在轉(zhuǎn)色期和成熟期的變化趨勢相似。
圖3 兩個地區(qū)美樂葡萄的 DEG 分析Fig.3 DEG analysis of Merlot grapes in two regions
使用Blast2GO中的GOseq方法進行分析,認(rèn)為Padj≤0.05的GO條目明顯更豐富。富集到836組生物功能,包括生物過程431組、細(xì)胞組分113組和分子功能292組。其中,碳水化合物分解代謝過程、羧酸生物合成過程、丙酮酸代謝過程、糖酵解過程、有機酸代謝過程,磷酸核糖生物合成過程,谷氨酰胺家族氨基酸代謝過程顯著富集,表明這些代謝途徑的基因可能是導(dǎo)致果實品質(zhì)形成差異的主要因素(表2)。
表2 兩個地區(qū)的差異表達基因GO功能分析Table 2 Analysis of GO function of differentially expressed genes in two regions
將每個產(chǎn)區(qū)的DEG 映射到KEGG 數(shù)據(jù)庫,乳山和德州均注釋了114條KEGG途徑。為了進一步總結(jié)與漿果品質(zhì)形成相關(guān)的生物學(xué)途徑,本研究選擇了10 個重要途徑進行分析(表3)。轉(zhuǎn)錄組結(jié)果發(fā)現(xiàn),乳山在檸檬酸循環(huán)、乙醛酸和二羧酸代謝途徑中富集的DEGs數(shù)量分別為32、36個,德州的數(shù)量分別為18、24個。兩個地區(qū)主要酸成分都為酒石酸,其中乳山的酸成分含量高于德州。酒石酸的生物合成始于L-抗壞血酸。兩個地區(qū)在抗壞血酸和醛糖代謝途徑中富集的DEGs 數(shù)量均為22個,但德州的下調(diào)數(shù)量較多,為16個。對于糖成分含量,乳山在果糖和甘露糖代謝、淀粉和蔗糖代謝途徑中富集的DEGs數(shù)量分別為34、60個,德州為22、44個。
表3 轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中與性狀相關(guān)的代謝途徑及DEG 數(shù)Table 3 Trait-related metabolic pathways and number of DEGs in transcriptome data
葡萄是世界上種植較為廣泛的多年生水果作物之一。葡萄在不同環(huán)境中生長的果實品質(zhì)存在差異。同時這種變異性也使現(xiàn)有品種適應(yīng)特定的種植區(qū)域,并產(chǎn)生不同風(fēng)格的葡萄酒。
葡萄果實的花色苷含量和組成受溫度、光照和濕度等環(huán)境因素的影響[18]。研究發(fā)現(xiàn),在適度的光照條件下,大多數(shù)葡萄品種的花色苷含量會隨著光照強度的增加而增加[19-20],適宜的溫度也可以促進花青素的合成[21-23]。本研究中,德州美樂葡萄的總花色苷含量高于乳山(圖1),可能由于德州有更適宜美樂栽培的溫度、光照和濕度。Qin 等[24]研究表明,烏魯木齊的光照強度、溫度和濕度較低,更有利于酚類物質(zhì)的積累。本研究中,德州葡萄果實的多酚含量高于乳山,可能與德州較低的光照強度、溫度和濕度相關(guān)。此外,在主要檢測出的6 種多酚組分中,由于生態(tài)環(huán)境的差異,成分含量產(chǎn)生了較大差異。其中,乳山葡萄果實中檢測到的主要多酚成分為表沒食子兒茶素,德州的主要多酚成分為表兒茶素沒食子酸酯。糖和酸的含量也受葡萄自身以及外界生長環(huán)境的影響。前人研究發(fā)現(xiàn),對糖分積累影響較大的氣象因子有日平均氣溫、日照時數(shù)、最高氣溫、降水量等,其中降水量的增加不但會降低葡萄園的光照,阻礙光合作用,影響果實成熟,而且葡萄成熟期過多的降水還會導(dǎo)致葡萄果實中風(fēng)味物質(zhì)濃度降低[25-27]。另外,毛如志等[28]研究發(fā)現(xiàn),高海拔產(chǎn)區(qū)的美樂葡萄比低海拔產(chǎn)區(qū)果實積累更多的有機酸和糖類等物質(zhì)。本試驗中,乳山葡萄果實的可溶性糖、總有機酸含量均高于德州,推測與其低降水量和較高海拔有關(guān)。
葡萄中的主要花色苷包括矢車菊素-3-O-葡萄糖苷(cyanidin-3-O-glucoside)、牽?;ㄋ?3-O-葡萄糖苷(petunidin-3-O-glucoside)、飛燕草素-3-O-葡萄糖苷(dephinidin-3-O-glucoside)、錦葵素-3-O-葡萄糖苷(peonidin-3-O-glucoside)和牡丹素-3-O-葡萄糖苷(malvidin-3-O-glucoside)[29]。這些單體花色苷進一步經(jīng)歷?;蚓酆?,形成花色苷衍生物[30]。本研究中,山東兩個地區(qū)美樂葡萄中花色苷的主要成分為錦葵素-3-O-葡萄糖苷及其?;苌铮▓D2),與前人研究結(jié)果一致[29,31]。德州美樂葡萄中花色苷含量高于乳山,與德州花色苷主要成分的含量較高相關(guān)。
為了進一步總結(jié)與葡萄果實品質(zhì)形成相關(guān)的機制,對差異表達基因進行了GO功能分析和KEGG代謝通路分析。分析發(fā)現(xiàn),上調(diào)或下調(diào)基因的數(shù)量可能與果實表現(xiàn)出的農(nóng)藝性狀有關(guān)。葡萄果實中的可滴定酸含量較低,但可滴定酸對果實品質(zhì)有重要影響。兩個地區(qū)葡萄果實的主要酸成分都為酒石酸。酒石酸由L-抗壞血酸合成。在壞血酸和醛糖代謝途徑中,乳山上調(diào)基因較多,可能導(dǎo)致其較高的酸含量。另外,乳山在檸檬酸循環(huán)、乙醛酸和二羧酸代謝途徑中富集的DEGs 數(shù)量以及上調(diào)基因數(shù)量均高于德州。葡萄屬于己糖積累型果樹,成熟果實中可溶性糖主要為葡萄糖和果糖[32-33]。糖分來源于光合產(chǎn)物的運輸與積累,蔗糖是主要的光合產(chǎn)物,在果實中經(jīng)轉(zhuǎn)化酶分解為葡萄糖和果糖。本研究中乳山淀粉和蔗糖代謝途徑差異基因以及上調(diào)基因均多于德州,可能導(dǎo)致乳山較高的糖含量[34]。另外,果實中糖含量取決于糖代謝關(guān)鍵酶的活性與含量[35]。乳山轉(zhuǎn)錄組中,與果糖-葡萄糖生物合成和代謝相關(guān)的α-淀粉酶、蔗糖合酶和己糖激酶的上調(diào)基因數(shù)量均多于德州。
本研究通過比較分析乳山和德州兩地美樂葡萄果實的生理指標(biāo)粒重、橫徑、縱徑和TSS、可溶性糖、總有機酸、酚、花色苷含量,發(fā)現(xiàn)兩地區(qū)美樂葡萄品質(zhì)各具區(qū)域特色,其中德州地區(qū)葡萄果實中花色苷、酚類含量較高,乳山地區(qū)的可溶性糖和總有機酸含量較高。此外,基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)構(gòu)建的兩地區(qū)美樂葡萄在轉(zhuǎn)色期和成熟期的差異表達,進一步解釋了兩地葡萄果實中糖酸含量差異的原因。