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豬圓環(huán)病毒2 型感染樹突狀細胞外泌體中差異miRNA 分析

2023-09-09 04:39:44上官琳暉丁文文劉佳宇范闊海尹偉孫娜孫盼盼李宏全
關鍵詞:外泌體測序調(diào)控

上官琳暉,丁文文,劉佳宇,范闊海,尹偉,孫娜,孫盼盼,李宏全*

(1.山西農(nóng)業(yè)大學 動物醫(yī)學學院/中獸醫(yī)藥現(xiàn)代化山西省重點實驗室,山西 晉中 030801;2.山西農(nóng)業(yè)大學 實驗動物管理中心,山西 晉中 030801)

豬圓環(huán)病毒2 型(Porcine circovirus type 2,PCV2)是豬圓環(huán)病毒相關疾?。≒orcine circovirus type 2 associated disease,PCVAD)主要病原體[1]。PCV2 感染后主要侵害機體免疫系統(tǒng),表現(xiàn)為感染豬外周血和免疫器官中淋巴細胞大量凋亡,致使感染豬出現(xiàn)免疫抑制并繼發(fā)感染豬繁殖與呼吸綜合征病毒(Porcine reproductive and respiratory syndromevirus,PRRSV)、豬細小病毒和豬流行性腹瀉病毒等多種病原體[2-3]。在PCV2 感染豬體內(nèi),其抗原主要存在于樹突狀細胞(Dendritic cell,DC)中[4]。體外實驗表明,PCV2 在體外感染樹突狀細胞后,會抑制DC 成熟增強DC 內(nèi)吞作用,減弱DC對T 淋巴細胞的刺激作用[5]。因此,探討PCV2 與樹突狀細胞相互作用的機制是有必要的。

DC 作為功能最強的抗原呈遞細胞(Antigenpresenting cell,APC),在免疫反應中起捕獲外來抗原的作用[6]。但是病毒也可以通過干擾DC 功能來逃避機體的抗病毒免疫反應并導致持續(xù)感染[7],或者利用DC 攝取抗原后向淋巴結遷移的特性以DC 為媒介在體內(nèi)傳播[8-9]。研究表明,PCV2感染機體后,以巨噬細胞或樹突狀細胞為靶細胞,單核細胞來源的樹突狀細胞(Mononuclear-derived dendritic cells,MoDC)中持續(xù)存在并保持感染性;這種現(xiàn)象表明DC 可能是PCV2 在體內(nèi)傳播的媒介[10-11]。

外泌體(Exosome,Exo)是一種由細胞釋放的細胞外囊泡(Extracellular vesicles,EVs),直徑為30~150 nm,呈橢圓或圓形盤狀[12-14]。外泌體可通過傳遞其所攜帶的內(nèi)容物(蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、mRNA、miRNA、tRNA 等)參與細胞間的分子傳遞來調(diào)節(jié)受體細胞的生理狀態(tài)[15]。在病毒感染中,外泌體可以通過內(nèi)容物變化,對機體的抗病毒作用產(chǎn)生影響[16]。MicroRNA(miRNA)是一類內(nèi)源性非編碼小RNA,大小為19~25 nt,在細胞凋亡、免疫功能和腫瘤發(fā)生等過程中發(fā)揮調(diào)節(jié)作用,通常會導致靶基因轉(zhuǎn)錄后沉默[17-18]。研究表明,病毒感染會引起宿主細胞中miRNA 表達量的變化,差異miRNA 又可以通過靶向宿主或病毒的基因轉(zhuǎn)錄,來調(diào)節(jié)病毒感染過程和宿主的免疫反應[19],如PRRSV可以通過上調(diào)感染細胞中miR-382-5p 和miR-30c表達,抑制Ⅰ型IFN 產(chǎn)生,促進PRRSV 的感染和復制[20-21]。病毒與miRNA 這種相互作用可以被外泌體介導。PCV2 感染PK-15 細胞后,PK-15 外泌體可以通過上調(diào)miR-125a-5p 來抑制靶基因Bcl-2 表達,從而激活線粒體凋亡通路,抑制脾淋巴細胞增殖[22-23]。

課題組前期研究發(fā)現(xiàn),PCV2 感染MoDC 后,在MoDC 來源外泌體中檢測到病毒成分,但PCV2感染后是否可以引起MoDC 來源外泌體中miRNAs 變化,以調(diào)節(jié)機體免疫反應目前尚不清楚。因此,本研究通過建立PCV2 感染豬MoDC 模型,對正常MoDC 來源外泌體(DEX)與病毒感染的MoDC 來源外泌體(VDEX)中miRNA 進行高通量測序,旨在探明PCV2 影響下VDEX 中差異表達miRNAs 及其靶基因的變化規(guī)律,為明確PCV2 感染的分子機制提供思路。

1 材料和方法

1.1 試驗材料和細胞制備

PCV2-SH 毒株由南京農(nóng)業(yè)大學姜平教授提供,經(jīng)PK-15 增殖后測定病毒TCID50 為10-5.38。選取1 月齡臨床健康且PCV2 陰性長白豬,購自太谷縣冠農(nóng)農(nóng)牧科技有限公司,采集前腔靜脈血20 mL,使用豬外周血單個核細胞(Peripheral blood mononuclear cell,PBMC)分離液試劑盒(天津灝洋)提取PBMC。將PBMC 在MoDC 誘導培養(yǎng)基中培養(yǎng)6 d,每隔天更換半量培養(yǎng)基,即可得到MoDC。

1.2 試驗方法

1.2.1 建立MoDC 感染PCV2 模型

將所得MoDC 接種到96 孔板中,每孔5×104個細胞,37 ℃孵育12 h。棄去原培養(yǎng)基,加入2%1640 培養(yǎng)基和感染復數(shù)為1 MOI 的PCV2 病毒液,同時設置空白細胞對照組,每組3 個重復孔,病毒作用于細胞2 h 后棄去病毒液,加入2% 1640 培養(yǎng)基,培養(yǎng)至48 h。使用PCV2 間接免疫熒光檢測試劑盒(中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所)檢測MoDC 是否感染PCV2。

1.2.2 外泌體制備及鑒定

超高速離心法提取DEX 與VDEX。將細胞培養(yǎng)液轉(zhuǎn)移到10 mL EP 管中,1500 r·min-1,離心10 min,去除細胞沉淀;6000 r·min-1,4 ℃,離心10 min,去除死細胞;15 000 r·min-1,4 ℃,離心30 min,去除細胞碎片;31 200 r·min-1,4℃,離心90 min,棄去液體,1 mL 預冷PBS 完全溶解沉淀后,補滿PBS;31 200 r·min-1,4℃,離心90 min,棄去液體,100 μL 預冷PBS 重懸沉淀,經(jīng)0.22 μm 濾器過濾后分裝,-80 ℃保存。

納米顆粒追蹤技術(NTA)檢測:使用超純水清洗Zeta View PMX 110 樣本池,聚苯乙烯微球(110 nm)校準機器,PBS 溶液再次清洗樣本池,將DEX 與VDEX 樣品使用PBS 溶液稀釋后上機檢測。

Western blot 檢測:分別取100 μL 溶于PBS 的DEX 與VDEX 提取總蛋白,二喹啉甲酸(Bicinchoninic acid,BCA)法測蛋白濃度,Western blot 鑒定外泌體表面標志物CD63 和TSG101,一抗Anti-CD63 antibody(Abcam)和TSG101 Polyclonal Antibody(三鷹生物)以5% BSA 封閉液按1:1000 稀釋,二抗Goat Anti-Rabbit IgG(H+L)-HRP(全式金)以TBST 按1∶40 000 稀釋。

1.2.3 Small RNA 測序

TRIzol 法分別提取DEX 與VDEX 組總RNA,用于Small RNA 文庫制備。使用TruSeq Small RNA Sample Prep Kits 試劑盒制備Small RNA 測序文庫,由聯(lián)川生物技術公司完成測序。

1.2.4 測序結果分析

使用ACGT101-miRNA 軟件對miRNA 測序結果進行分析。原始數(shù)據(jù)經(jīng)過質(zhì)控處理后得到clean reads,留堿基長度在18~26 nt 序列,再將其與各種RNA 數(shù)據(jù)庫(mRNA 數(shù)據(jù)庫、RFam 數(shù)據(jù)庫和Repbase 數(shù)據(jù)庫)序列比對與過濾,最后獲得有效數(shù)據(jù),對有效數(shù)據(jù)進行進一步鑒定和預測分析。

1.2.5 miRNA 表達和差異分析

將DEX 組和VDEX 組miRNA 表達量歸一化到同一數(shù)量級,每組樣品拷貝數(shù)=原始拷貝數(shù)×算法校正因數(shù);當miRNA 表達量>1000 為高表達,表達量在10~999 之間為中表達,表達量在0~9 之間為低表達。miRNA 差異倍數(shù)(Fold change,F(xiàn)C)=VDEX 組均值/DEX 組均值,采用獨立樣本T 檢驗分析兩組樣品間miRNA 差異顯著性,當|Log2(FC)|>1 時,如P<0.01 則miRNA 表達差異極顯著;0.010.05 時miRNA 差異表達不顯著。選擇差異最顯著40 個miRNA(校正P值FDR 最小的3.14e-08~9.70e-04)利用百邁克云平臺熱圖繪制軟件繪制了聚類熱圖。

1.2.6 miRNA 靶基因預測和富集性分析

使用TargetScan(v5.0)和miRanda(v3.3a)對差異顯著(P<0.05)的miRNA 進行靶基因預測。在TargetScan算法中保留閾值為TargetScan score≥50,miRanda Energy<-10,兩款軟件篩選結果取交集即為miRNA 靶基因。對靶基因進行GO 功能和KEGG通路富集分析。

1.2.7 目標miRNA 的qPCR 驗證

根據(jù)測序所得miRNA 序列采用加尾法在DNAMAN 9 軟件中設計miRNA 上游引物(表1),引物序列由西安擎科生物科技有限公司合成,下游通用引物由M5 miRNA qPCR Assay Kit 提供。使用Easy Pure? miRNA Kit 試劑盒(全式金)提取并純化DEX 與VDEX 中miRNA,根據(jù)M5 miRNA cDNA Synthesis Kit(聚合美)說明書進行操作,qPCR 反應體系20 μL:2×M5 miRNA qPCR Mixture 10 μL,上、下游引物各0.4 μL,cDNA 2 μL,ddH2O 7.2 μL。PCR 反應條件:95 ℃預變性10 min;95 ℃變性15 s,60 ℃退火/延伸1 min,共40個循環(huán);熔解曲線15 s。目的基因表達量用2-ΔΔCt法計算。

表1 qRT-PCR 引物序列Table 1 qRT-PCR primer sequence

1.3 數(shù)據(jù)分析

miRNA 測序結果用獨立樣本t檢驗和超幾何檢驗進行分析。qRT-PCR 結果t-test 檢驗顯著性;P<0.05 表示差異顯著,P<0.01 差異極顯著。用GraphPad Prism 5.0 軟件作圖。

2 結果與分析

2.1 感染PCV2 MoDC 模型的鑒定

PCV2 Cap 蛋白是由ORF2 所編碼的病毒衣殼蛋白,是PCV2 目前唯一已知的結構蛋白,具有良好的免疫原性,常用來作為PCV2 的檢測[22]。感染PCV2 的MoDC 培養(yǎng)48 h 后,]間接免疫熒光(IFA)檢測PCV2 Cap 蛋白,用熒光倒置顯微鏡觀察。未感染病毒的MoDC 正常細胞對照組(圖1A,圖1C)中未觀察到特異性綠色熒光;MoDC 在感染PCV2 48 h 后,熒光顯微鏡下可觀察到特異性的綠色熒光為Cap 蛋白(圖1D,圖1F),并且可以觀察到Cap 蛋白在MoDC 內(nèi)表達(圖4F)。結果表明,MoDC 可以被PCV2 感染,PCV2 體外感染MoDC 模型建立成功,達到后續(xù)提取外泌體的細胞要求。

圖1 PCV2 感染MoDC 48 h 后PCV2 Cap 蛋白分布Fig.1 Cap protein distribution of PCV2 after PCV2 infection with MoDC in 48 h

2.2 外泌體鑒定

DEX 與VDEX 鑒定結果如圖2 所示。粒徑檢測顆粒分析技術結果見圖2A,2 組外泌體直徑集中在120 nm 左右。從兩組MoDC 培養(yǎng)基上清中經(jīng)超速離心所得的沉淀物,免疫印跡檢測結果見圖2B,沉淀物均表達外泌體標志性蛋白質(zhì)CD63 和TSG101。NTA 和WB 結果表明,超高速離心所得沉淀物為外泌體。

圖2 外泌體鑒定Fig.2 Identification of exosomes

2.3 DEX 和VDEX 差異表達miRNAs 比較分析

DEX 和VDEX 的miRNAs 表達量差異表達miRNAs 有908 個。表2 給出差異極顯著前10 個miRNA。差異表達miRNAs 火山圖(圖3)顯示,與DEX 組相比,VDEX 組差異表達顯著有504 個miRNAs(P<0.05),VDEX 組特異性高表達新miRNA 有3 個,分別是:miPC-3p-11758_454、miPC-3p-7555_705 和miPC-5p-3971_1298;特異性中度表達有61 個。DEX 組特異性高表達有3個,分別是:ssc-miR-4332_L-1R-1、ssc-miR-142-3p 和ssc-miR-150;特異性中表達有156 個,特異性低表達87 個。即PCV2 侵入樹突細胞外泌體以后激活了64 種miRNA 表達,遏止了246 個miRNA 表達。

圖3 差異表達miRNA 火山圖Fig.3 Volcano plot of differentially expressed miRNA

表2 PCV2 感染外泌體中差異極顯著miRNA(前10)Table.2 Highly differentiated miRNAs in PCV2-infected exosomes (Top 10)

2.4 miRNAs 聚類熱圖

圖4是用miRNA 差異極顯著前40 個miRNA聚類分析,特異性僅在DEX 中表達miRNA 有11個,僅在VDEX 組表達8 個;共表達miRNA 有21個:其中19 個miRNA 在VDEX 中顯著降低,僅有2 個上調(diào)。

圖4 差異表達miRNA 聚類熱圖Fig.4 Complex heatmap of differentially expressed miRNA

2.5 靶基因GO 富集分析

GO 富集分析氣泡圖顯示(圖5),差異miRNA的靶基因富集在細胞核中的數(shù)量最多,其次是蛋白結合功能;富集程度最高的是激酶活性、其次是氧化還原酶活性;靶基因富集數(shù)量多同時富集程度高是在細胞質(zhì)。結果表明差異miRNA 的靶基因可能廣泛參與調(diào)控細胞功能和生物學過程。

圖5 差異表達miRNA 靶基因GO 富集分析Fig.5 GO enrichment analysis of differentially expressed genes in miRNA

2.6 靶基因KEGG 分析

KEGG 通路分析氣泡圖(圖6)顯示,差異miRNA 的靶基因富集在癌癥通路的數(shù)量最多,其次是單純皰疹病毒1 感染通路;富集程度最高的通路是T 細胞受體(TCR)信號通路,其次Th17 細胞分化通路、再者是B 細胞受體信號通路和FCγR-介導吞噬作用;靶基因富集數(shù)量多同時富集程度高的是內(nèi)吞作用通路。TNF 信號通路、人白細胞病毒1 感染(HTLV-1)、人類免疫缺陷病毒1 型感染(HIV-1)、類風濕關節(jié)炎通路、流體剪切力與動脈粥樣硬化、趨化因子信號通路等均與免疫相關。

圖6 差異表達miRNA 靶基因KEGG 富集分析Fig.6 KEGG enrichment analysis of differentially expressed miRNA target genes

2.7 構建miRNA 靶基因的網(wǎng)絡圖

選擇VDEX 組特異性高表達的3 個miRNAs,極顯著上調(diào)ssc-miR-10b 和PC-3p-29629_167 ,極顯著下調(diào)ssc-miR-140-3p_L-1、ssc-miR-532-5p、 ssc-miR-425-5p、 ssc-miR-210、 ssc-miR-144_R+1 和ssc-miR-34c 的靶基因及其富集KEGG 通路(表3)。把12 個miRNAs 預測靶基因作為研究對象,以紅色四邊形節(jié)點為miRNA,紫色圓形節(jié)點為對應的靶基因,箭頭代表靶向關系,構建miRNA-Target 的調(diào)控網(wǎng)絡圖(圖7),其中VDEX 組特異性高表達miPC-3p-7555_705 處于中間位置,與ssc-miR-10b 共同調(diào)控TNF 表達,與特異性高表達miPC-5p-3971_1298 共同調(diào)控TRIM52 和SMAD3,與ssc-miR-140-3p_L-1 共同調(diào)控IL2 和PPP3CA,還有ssc-miR-532-5p 調(diào)控IL2,與ssc-miR-34c 共同調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子FOSL1。另外,IL-2 及受體家族IL2RG、IL2RA、IL2RB,原癌基因AKT 家族等、轉(zhuǎn)錄因子、NFKBIA、NFKBIE、NFATC1 家族均是與免疫調(diào)控密切相關的基因。

圖7 12 個miRNA-靶基因網(wǎng)絡圖Fig.7 Network diagram of 12 miRNA-target genes

2.8 miRNA 測序結果驗證

在表達差異顯著miRNA 中進一步篩選,保留P<0.001 和| Log2(FC)|≥2.0 的豬源已知miRNA,再參照KEGG 結果篩選可能參與病毒感染和免疫相關的目標miRNA。最后選出10 個目標miRNA:ssc-miR-199a-3p-R-1、ssc-miR-532-5p、ssc-miR-425-5p、ssc-miR-210、ssc-miR-144-R+1、ssc-let-7c、ssc-miR-107-R-2、ssc-miR-22-5p-R-1、ssc-miR-296-3p-R+1 和ssc-miR-10b。對篩選出10 個目標miRNA 進行qPCR 驗證,結果表明,與DEX 相比,ssc-miR-532-5p、ssc-miR-425-5p、ssc-miR-210、ssc-miR-144-R+1、ssc-let-7c、ssc-miR-107-R-2、ssc-miR-22-5p-R-1 和 sscmiR-296-3p-R+1 在VDEX 中表達量均顯著降低(P<0.05;圖8),與測序結果一致;ssc-miR-199a-3p-R-1 和ssc-miR-10b 在VDEX 中表達量顯著降低(P<0.05),與測序結果不一致,這可能由于我們未使用測序樣本進行驗證,并且這2 組基因表達量偏低,從而導致結果上下調(diào)不一致。

圖8 目標miRNA qPCR 驗證Fig.8 qPCR verification of target miRNA

3 討論

DC 是目前所知抗原遞呈功能最強大的抗原遞呈細胞,能有效激活初始T 細胞,參與機體的免疫調(diào)節(jié)。Vincent 等[24]研究發(fā)現(xiàn),感染了PCV2 的DC 與T 細胞共培養(yǎng)一段時間后,雖然觀察到T 細胞與DC 產(chǎn)生了細胞接觸,但未觀察到病毒轉(zhuǎn)移。這表明,在PCV2 感染中,感染了PCV2 的DC 可能不通過細胞接觸的方式調(diào)節(jié)機體的抗PCV2 感染。DC 分泌的外泌體具有調(diào)節(jié)多種免疫細胞細胞活動的功能。Tkach 等[25]通過將DC 分泌的各類外泌體分別添加進CD4+T 細胞培養(yǎng)體系中與T 細胞共孵育。結果發(fā)現(xiàn),DC 分泌的外泌體均可以激活CD4+T 細胞,促進CD4+T 細胞增殖及分化。另外,在腫瘤研究中,發(fā)現(xiàn)外泌體還可以通過向受體細胞傳遞MHC Ⅰ、補體活化相關物質(zhì)以及抗原成分,促進T 細胞和B 細胞的活化,增強抗腫瘤免疫反應[26-28]。為了探究感染了PCV2 的DC 是否可以通過VDEX 途徑進行免疫調(diào)節(jié),本研究通過高通量測序技術獲得了DEX 與VDEX 中miRNA 差異表達譜,與DEX 相比,VDEX 中表達差異顯著的miRNA 有504 個(P<0.05),其中上調(diào)的有161個,下調(diào)的有343 個。對差異顯著的miRNA 進行靶基因預測、GO 富集分析和KEGG 富集分析,差異顯著miRNA 共預測到13 204 個靶基因(P<0.05),GO 富集分析得到具有顯著性的GO 條目1752 條(P<0.05),KEGG 富集分析得到具有顯著性的通路203 條(P<0.05)。

GO 富集分析結果顯示,差異miRNA 的靶基因主要參與的生物學功能有轉(zhuǎn)錄調(diào)控(DNA 模板)、RNA 聚合酶Ⅱ?qū)D(zhuǎn)錄的正/負調(diào)控、信號轉(zhuǎn)導和氧化還原等過程,KEGG 通路富集顯示,差異miRNA 靶基因在TNF 信號通路、Th17 細胞分化通路、T 細胞受體信號通路、癌癥通路、B 細胞受體信號通路、自噬通路和AMPK 信號通路等信號通路顯著富集。因此,DEX 與VDEX 的差異主要集中在轉(zhuǎn)錄調(diào)控、信號轉(zhuǎn)導、細胞核、T 細胞受體信號通路等方面。這些差異表明,VDEX 可能通過參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控和T 細胞受體信號通路介導免疫過程。

其中ssc-miR-122 通過與PK-15 細胞中的3’UTR 結合,下調(diào)活化T 細胞5 核因子(NFAT5)和嘌呤霉素敏感氨基肽酶的表達,抑制PCV2 的蛋白質(zhì)表達和病毒DNA 復制[29]。miR-30a-5p 靶向自噬調(diào)節(jié)因子14-3-3 基因,并在調(diào)節(jié)細胞周期中發(fā)揮作用。miR-30a-5p 的過表達可以通過增強自噬來觸發(fā)PCV2 復制,而miR-30a-5p 的阻斷顯著降低了PCV2 的復制[30]。miR-15a 的上調(diào)通過介導細胞周期蛋白D1 和E 的降解促進了PCV2 誘導的G0/G1 細胞周期阻滯,有助于病毒的有效復制[31]。在本研究中,ssc-miR-122 的上調(diào)以及miR-30a-5p 的下調(diào)可能解釋PCV2 在DC 細胞中沒有檢測到明顯的病毒復制。PCV2 通過上調(diào)miR-23a 和miR-29b,激活PI3K/Akt1 和p38 MAPK 信號,抑制IL-12p40 的表達。同時,抑制ssc-miR-23a 和ssc-miR-29b 可以減輕PCV2 對IL-12p40 的抑制作用,導致IL-12p40 表達和Th1 細胞群增加[32]。IL-12p40 是IL-12 的p40 亞基,其可以誘導Th1 的促炎功能,從而將先天免疫反應和適應性免疫反應聯(lián)系起來[33]。提示ssc-miR-23a 和ssc-miR-29b可能與T 細胞極化和宿主免疫反應有關。在PCV2 亞臨床感染豬中miRNA 126-3p,miRNA 126-5p,let-7d-3p,mir-129a 和mir-let-7b-3p 上調(diào),而mir-193a-5p,mir-574-5p 和mir-34a 下調(diào),推測這些miRNA 可以參與與免疫系統(tǒng)相關的途徑[34]。

本研究通過結合差異miRNA 顯著性P 值,F(xiàn)old-change 以及KEGG 分析結果,選出可能參與VDEX 介導免疫反應的10 個目標miRNA。在這10 個miRNA 的預測靶點中,存在調(diào)控T 細胞增殖分化的靶點。ssc-miR-10b 靶向IL2RA 基因,IL2RA 可以通過激活調(diào)節(jié)性T 細胞(Treg)來抑制效應T 細胞的活化和增殖[35,36]。ssc-miR-532-5p、ssc-miR-107-R-2 和ssc-miR-296-3p-R+1 靶向TAF1 基因,TAF1 是CD4+CD25+FoxP3+Treg 細胞主要轉(zhuǎn)錄子FoxP3 的啟動子,有促進Treg 分化增殖的作用[37]。ssc-miR-107-R-2 靶向STAT3,STAT5 基因,研究發(fā)現(xiàn)STAT3 和STAT5 可作用于Treg 的分化過程,未成熟樹突狀細胞外泌體中miR-683 可以通過調(diào)節(jié)STAT3,STAT5 的表達促進Treg 分化[38]。

隨后,我們對目標miRNA 進行qPCR 驗證,檢測miRNA 在正常組和病毒組中的相對表達量,結果發(fā)現(xiàn)qPCR 結果與測序結果基本一致。由此可知,VDEX 可能是通過調(diào)控T 細胞的增殖分化來調(diào)節(jié)免疫反應。雖然本研究獲得了感染PCV2 的MoDC 外泌體中差異表達miRNA 的一些信息,但仍然存在一些不足,本研究僅限于基因水平,缺乏在動物模型中的驗證,我們將在后期試驗中進一步驗證本次發(fā)現(xiàn)。

4 結論

本研究通過比較DEX 和VDEX 中差異表達miRNA 來進行生物信息學預測分析,結果發(fā)現(xiàn)差異miRNA 靶基因主要參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控,并且多集中于T 細胞受體信號通路。由此我們推測PCV2 感染后表達量變化最大的13 種miRNA 可能是VDEX 調(diào)節(jié)免疫反應的效應物質(zhì)之一。本試驗為深入研究PCV2 與DC 感染的相互作用以及對PCV2 的防治提供了新思路。

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