周曉敏，滕 飛，張 藝

（西南交通大學(xué) 計(jì)算機(jī)與人工智能學(xué)院，成都 611756）

0 引言

國(guó)際疾病分類（International Classification of Diseases，ICD）是依據(jù)疾病的某些特征，按規(guī)則將疾病分門(mén)別類并用編碼的方法表示的系統(tǒng)。ICD 編碼分配是為患者的診斷和治療數(shù)據(jù)分配編碼的過(guò)程，已經(jīng)廣泛地用于臨床研究、醫(yī)療保健、醫(yī)療付費(fèi)、診斷信息的檢索等問(wèn)題。然而，手工編碼是勞動(dòng)密集型任務(wù)并且容易出錯(cuò)［1］。因此，為了提高ICD 編碼分配的準(zhǔn)確性和效率，進(jìn)行自動(dòng)ICD 編碼研究十分有必要。

自動(dòng)ICD 編碼分配被視為一種多標(biāo)簽文本分類問(wèn)題，目的是從電子病歷文本數(shù)據(jù)中提取信息并進(jìn)行編碼分配。然而，ICD 編碼的分布呈現(xiàn)出長(zhǎng)尾分布的問(wèn)題，給研究帶來(lái)了巨大挑戰(zhàn)。具體來(lái)說(shuō)，在臨床中頻繁出現(xiàn)的編碼（本文稱為頻繁編碼——many-shot）只占據(jù)總編碼數(shù)的很少一部分，而臨床中很少出現(xiàn)的編碼（本文稱為少樣本編碼——few-shot）卻占據(jù)了總編碼數(shù)的大部分。根據(jù)Teng 等［2］的統(tǒng)計(jì)，在醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)集MIMIC-Ⅲ中共有18 000 多種ICD-9 編碼，按照出現(xiàn)頻率排序的前50 種編碼占總數(shù)據(jù)的93.17%。少樣本編碼的訓(xùn)練樣本是少樣本編碼自動(dòng)分配研究的瓶頸所在。

少樣本編碼對(duì)于臨床具有相當(dāng)?shù)闹匾?，主要體現(xiàn)在罕見(jiàn)病、醫(yī)學(xué)研究以及醫(yī)療開(kāi)銷這幾個(gè)方面。一方面，在臨床中存在較多罕見(jiàn)疾病，如兒童早衰癥、Cockayne 綜合征等［3］，這些疾病發(fā)病幾率非常低，因此不容易觀察到相應(yīng)編碼。罕見(jiàn)疾病的出現(xiàn)事關(guān)每一個(gè)患者的健康，正確為該記錄分配正確的編碼對(duì)于臨床治療至關(guān)重要。另一方面，隨著醫(yī)療水平的發(fā)展，可能會(huì)引入一些新的編碼，在這種情況下臨床觀察到的樣本少，少樣本編碼的預(yù)測(cè)性能可能不會(huì)對(duì)ICD 編碼的總體準(zhǔn)確性產(chǎn)生重大影響，但是對(duì)于醫(yī)學(xué)研究的發(fā)展可以起到積極的作用。另外，編碼員在給電子病歷分配編碼時(shí)，可能更容易給電子病歷分配常遇到的編碼，而忽略或混淆少樣本編碼。例如，如果編碼員在為電子病歷分配編碼時(shí)容易選擇經(jīng)常遇到的編碼“Acute myocardial infarction，of other anterior wall，initial episode of care”（410.11：many-shot code），而不是正確的少樣本編碼“Acute myocardial infarction，of anterolateral wall，subsequent episode of care”（410.02：fewshot code）。編碼員對(duì)少樣本編碼的錯(cuò)誤分配會(huì)給患者造成不公平的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)，也加大了醫(yī)療機(jī)構(gòu)的醫(yī)療投資。綜上所述，本文認(rèn)為對(duì)少樣本編碼的正確預(yù)測(cè)進(jìn)行研究十分重要。

為了提高ICD 編碼的準(zhǔn)確性和效率，學(xué)者們對(duì)自動(dòng)ICD編碼進(jìn)行了大量研究，包括傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)和深度學(xué)習(xí)模型。然而，在保持已有學(xué)習(xí)性能的同時(shí)，對(duì)訓(xùn)練數(shù)據(jù)較少的樣本進(jìn)行快速泛化仍然是神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型面臨的一個(gè)重大挑戰(zhàn)?，F(xiàn)有研究較少關(guān)注少樣本編碼，這些模型在少樣本編碼上的表現(xiàn)仍然不令人滿意。由于ICD 編碼數(shù)據(jù)的長(zhǎng)尾分布，使得對(duì)少樣本編碼進(jìn)行準(zhǔn)確的多標(biāo)簽文本分類極具挑戰(zhàn)性。

本文針對(duì)數(shù)據(jù)呈現(xiàn)出的長(zhǎng)尾分布問(wèn)題，提出一種元網(wǎng)絡(luò)模型，在不犧牲整體編碼性能的情況下能提高少樣本編碼的分類準(zhǔn)確性。本文的主要工作如下：

1）提出一種基于元網(wǎng)絡(luò)的ICD 編碼模型（Meta Networkbased ICD Coding model，MNIC）。將頻繁編碼的特征表示映射到分類器權(quán)重上，以學(xué)習(xí)到元知識(shí)；同時(shí)，將元知識(shí)從數(shù)據(jù)豐富的頻繁編碼轉(zhuǎn)移到數(shù)據(jù)貧乏的少樣本編碼，顯著提高了少樣本編碼的性能，實(shí)現(xiàn)多標(biāo)簽文本分類的少樣本學(xué)習(xí)。

2）對(duì)元知識(shí)的可轉(zhuǎn)移性和通用性提供解釋，證明了少樣本編碼和頻繁編碼存在通用的元知識(shí)。

3）在MIMIC-Ⅲ數(shù)據(jù)集上進(jìn)行對(duì)比，驗(yàn)證了元網(wǎng)絡(luò)模型有助于提高少樣本編碼的性能。

1 相關(guān)工作

在醫(yī)療保健領(lǐng)域，有關(guān)自動(dòng)ICD 編碼的研究已有約20 年的歷史［4］。傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)模型以及深度學(xué)習(xí)模型被應(yīng)用于臨床文本的自動(dòng)ICD 編碼。Medori 等［5］使用具有不同屬性集的樸素貝葉斯（Naive Bayes）優(yōu)化了自動(dòng)編碼技術(shù)；Huang等［6］使用K 近鄰（K-Nearest Neighbor，KNN）算法利用ICD 編碼相關(guān)性構(gòu)建了臨床決策框架，改進(jìn)了多標(biāo)簽分類算法；Koopman 等［7］使用支持向量機(jī)（Support Vector Machine，SVM）對(duì)死亡證書(shū)中癌癥相關(guān)編碼進(jìn)行自動(dòng)分類。除此之外，Perotte 等［8］嘗試了平面分類器以及基于SVM 的層次分類器，證實(shí)了基于層次的分類器具有更良好的性能；Karimi 等［9］使用了SVM 和邏輯回歸分類器（logistic regression classifiers）對(duì)放射學(xué)報(bào)告進(jìn)行了自動(dòng)ICD 編碼。傳統(tǒng)的機(jī)器學(xué)習(xí)為自動(dòng)ICD 編碼提供了解決思路，但需要手動(dòng)選擇特征。

隨著深度學(xué)習(xí)的發(fā)展，許多研究者開(kāi)始將卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（Convolutional Neural Network，CNN）［10］、循環(huán)神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（Recurrent Neural Network，RNN）［11］、圖卷積網(wǎng)絡(luò)（Graph Convolutional Network，GCN）［12］、生成對(duì)抗網(wǎng)絡(luò)（Generative Adversarial Network，GAN）［13］等應(yīng)用于自動(dòng)ICD 編碼。Mullenbach 等［14］使用CNN 聚合文檔信息，并使用注意力機(jī)制為編碼分配提供可解釋性；Chen 等［15］使用醫(yī)學(xué)主題挖掘模型提取病歷中最相關(guān)的片段，并提出一種多通道卷積注意力網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)ICD 編碼的自動(dòng)預(yù)測(cè)；Ji 等［16］提出一種門(mén)控卷積神經(jīng)架構(gòu)，能夠成功捕獲臨床文本中豐富的語(yǔ)義信息；Catling等［17］使用RNN 改善了醫(yī)學(xué)文本的表示，并利用分層結(jié)構(gòu)的醫(yī)學(xué)知識(shí)提升了自動(dòng)編碼的性能；Yu 等［18］提出一種多層注意力雙向遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)模型，并證實(shí)了多層注意力機(jī)制的有效性；Cao 等［19］利用GCN 實(shí)現(xiàn)了編碼共現(xiàn)，并借助編碼的層次結(jié)構(gòu)提升了模型表現(xiàn)；Xie 等［20］使用GCN 捕獲編碼間的層級(jí)關(guān)系及編碼語(yǔ)義；Teng 等［21］使用GAN 生成對(duì)抗性樣本以調(diào)和醫(yī)生的寫(xiě)作風(fēng)格，并引入知識(shí)圖譜提高編碼預(yù)測(cè)精度。

對(duì)于醫(yī)療編碼的研究，醫(yī)療實(shí)體識(shí)別模型也是一大熱點(diǎn)，這些研究主要關(guān)注從電子病歷中識(shí)別不同類別醫(yī)療語(yǔ)義的短語(yǔ)。侯旭東等［22］針對(duì)深度學(xué)習(xí)技術(shù)在醫(yī)療實(shí)體識(shí)別問(wèn)題中隨著網(wǎng)絡(luò)加深識(shí)別模型出現(xiàn)的識(shí)別精度與算力要求不平衡問(wèn)題，提出一種基于深度自編碼的醫(yī)療實(shí)體識(shí)別模型CasSAttMNER（Cascade Self Attention Medical Named Entity Recognition）。CasSAttMNER 模型與本文MNIC 的研究對(duì)象均為醫(yī)療文本，兩者都采用自然語(yǔ)言處理提高醫(yī)療編碼和分類的效率。不同的是，CasSAttMNER 模型進(jìn)行的是實(shí)體識(shí)別研究，將醫(yī)療文本依據(jù)語(yǔ)義大致分為了6 種類別，而本文需要對(duì)醫(yī)療文本分配所有匹配的編碼，編碼的個(gè)數(shù)決定了N分類的精度要求。根據(jù)數(shù)據(jù)規(guī)模，本文使用了1 533 個(gè)編碼，相當(dāng)于需要分為1 533 個(gè)類別，與前者的6 個(gè)類別相比，任務(wù)難度不在一個(gè)數(shù)量級(jí)，因此兩種模型的總體F1 分?jǐn)?shù)也有顯著差異；同時(shí)兩個(gè)模型一個(gè)利用的是中文數(shù)據(jù)集，另一個(gè)是用的英文數(shù)據(jù)集，前者數(shù)據(jù)集文本總數(shù)為1 000 條，后者則為50 000 多條，在數(shù)據(jù)規(guī)模上的差異顯著。

以上工作專注于提升常見(jiàn)編碼的性能表現(xiàn)，忽略了少樣本編碼。Rios 等［23］最先關(guān)注到了ICD 編碼的少樣本及零樣本學(xué)習(xí)，將出院摘要與利用具有圖卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)（Graph CNN，GCNN）的結(jié)構(gòu)化標(biāo)簽空間得到的每個(gè)編碼的特征向量進(jìn)行匹配，學(xué)會(huì)了預(yù)測(cè)少樣本和零樣本編碼；Song 等［24］在他的模型基礎(chǔ)上將GCNN 修改為GRNN（Graph Recurrent Neural Network），并使用GAN 為零樣本編碼生成偽特征，在保證可見(jiàn)編碼性能的前提下提升了零樣本編碼的預(yù)測(cè)能力。然而這些模型在預(yù)測(cè)時(shí)幾乎不會(huì)為臨床文本分配少樣本ICD 編碼，目前最優(yōu)模型少樣本編碼的F1 分?jǐn)?shù)為19.17%。

以上研究為自動(dòng)ICD 編碼提供了重要的理論支撐，本文重點(diǎn)討論了數(shù)據(jù)的長(zhǎng)尾分布以及預(yù)測(cè)多標(biāo)簽的可解釋性問(wèn)題，提出了MNIC，捕獲通用元知識(shí)以實(shí)現(xiàn)少樣本學(xué)習(xí)；此外，本文使用T-SNE（T-distributed Stochastic Neighbor Embedding）圖為元知識(shí)的通用性提供了有意義的解釋。

2 模型構(gòu)建

ICD 編碼任務(wù)是一個(gè)多標(biāo)簽文本分類問(wèn)題，設(shè)L={l1，l2，…，ls}是所有的ICD 編碼的集合，其中，s為ICD 編碼的數(shù)量。本文的目標(biāo)是訓(xùn)練s個(gè)二元分類器。對(duì)于輸入文本，每個(gè)分類器預(yù)測(cè)結(jié)果為，其中∈{0，1}是L 中的第i個(gè)編碼的預(yù)測(cè)結(jié)果。每個(gè)ICD-9 編碼l都有一個(gè)簡(jiǎn)短的編碼描述。例如，466.1 的編碼描述為：“急性細(xì)支氣管炎”；466.11的編碼描述為：“呼吸道合胞病毒（Respiratory Syncytial Virus，RSV）引起的急性細(xì)支氣管炎”。

由于大部分ICD 編碼并不常出現(xiàn)在臨床文本數(shù)據(jù)中，使得ICD 編碼頻率的分布往往呈現(xiàn)出長(zhǎng)尾分布。針對(duì)這個(gè)問(wèn)題，本文主要關(guān)注少樣本編碼問(wèn)題：在不犧牲頻繁編碼性能的情況下，準(zhǔn)確預(yù)測(cè)少樣本編碼。

本文提出了一個(gè)用于自動(dòng)ICD 編碼的模型MNIC，整體框架如圖1 所示。MNIC 主要由四個(gè)模塊組成：第一個(gè)模塊是數(shù)據(jù)輸入；第二個(gè)模塊是特征提取器，它從臨床文檔和ICD 編碼描述中為每個(gè)編碼提取最相關(guān)的語(yǔ)義信息，并且還訓(xùn)練了一個(gè)基礎(chǔ)分類器獲得了每個(gè)編碼的初始權(quán)重，該基礎(chǔ)分類器對(duì)于頻繁編碼表現(xiàn)良好，但對(duì)于少樣本編碼則不能令人滿意；第三個(gè)模塊是元網(wǎng)絡(luò)，它從頻繁編碼的特征表示和分類器權(quán)重的映射中學(xué)習(xí)元知識(shí)，然后將元知識(shí)轉(zhuǎn)移到少樣本編碼，并更新少樣本編碼的分類器權(quán)重；第四個(gè)模塊是模型輸出，它結(jié)合了頻繁編碼的原始分類器權(quán)重和少樣本編碼更新后的分類器權(quán)重，得到每個(gè)編碼的二元分類器，輸出最終的分類結(jié)果。

圖1 MNIC的框架Fig.1 Framework of MNIC

2.1 輸入層

給定一個(gè)包含n個(gè)單詞的臨床文本矩陣X=[x1，x2，…，xi，…，xn]，對(duì)于每個(gè)單詞xi，使用預(yù)訓(xùn)練的詞嵌入方法得到每個(gè)單詞的詞嵌入向量ci（具有相同的維度de），得到輸入文本的詞嵌入向量表示D=(c1，c2，…，ci，…，cn)。

2.2 特征提取

給定輸入矩陣D，特征提取模塊旨在從每個(gè)輸入中提取每個(gè)編碼最相關(guān)的表示。具體來(lái)說(shuō)，本文首先使用卷積層學(xué)習(xí)單詞表示，并且為了更好地提取語(yǔ)義信息，使用編碼描述使編碼在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域具有說(shuō)服力和可解釋性；然后，使用標(biāo)簽注意力機(jī)制來(lái)學(xué)習(xí)每個(gè)編碼最相關(guān)的特征向量。

2.2.1 卷積層

給定輸入數(shù)據(jù)D，卷積層的目標(biāo)是從數(shù)據(jù)密集且信息豐富的詞嵌入中學(xué)習(xí)文本語(yǔ)義信息。在CNN 中沒(méi)有使用池化層，而是通過(guò)標(biāo)簽注意力機(jī)制在文檔中找到每個(gè)編碼最相關(guān)的特征。使用卷積濾波器組合相鄰詞嵌入，k為濾波器寬度；de為輸入的詞嵌入維度；dc是濾波器輸出大小。計(jì)算公式為：

2.2.2 編碼向量

每個(gè)ICD 編碼l都有一個(gè)編碼描述，為了表示l，本文對(duì)每個(gè)編碼描述進(jìn)行預(yù)處理。首先將編碼描述中的所有單詞小寫(xiě)并刪除停止詞，然后通過(guò)平均剩余單詞的詞嵌入向量來(lái)形成編碼向量

其中，N是編碼描述中剩余的單詞數(shù)。

2.2.3 注意力機(jī)制

由于臨床文本很長(zhǎng)，并且每個(gè)文檔有多個(gè)編碼，每個(gè)編碼的相關(guān)信息可能分散在整個(gè)文檔中。針對(duì)這個(gè)問(wèn)題，本文采用標(biāo)簽注意力機(jī)制，使模型可以關(guān)注文本的不同部分。標(biāo)簽注意力機(jī)制的計(jì)算公式為：

2.2.4 基礎(chǔ)分類器

本文將每個(gè)編碼的特征al作為輸入傳遞給全連接神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)，然后使用Sigmoid 激活函數(shù)生成第i個(gè)編碼的概率為所有編碼構(gòu)建一個(gè)基本分類器，得到每個(gè)代碼l的分類結(jié)果如下：

其中：yi∈{0，1}是第i個(gè)編碼的基本事實(shí)是第i個(gè)編碼的預(yù)測(cè)結(jié)果；lm是頻繁編碼的個(gè)數(shù)。

2.3 元網(wǎng)絡(luò)

通過(guò)特征提取模塊，在每個(gè)樣本中可以獲得所有編碼的特征向量，對(duì)d個(gè)包含r編碼的樣本進(jìn)行采樣，通過(guò)訓(xùn)練好的

特征提取器，獲得特征表示{ar1，ar2，…，ard}。然后通過(guò)取這些向量的平均值，獲得頻繁編碼r和少樣本編碼z的特征表示分別為Mmany聯(lián)系起來(lái)。將每個(gè)頻繁編碼的特征pr映射到相應(yīng)的頻

元網(wǎng)絡(luò)將頻繁編碼特征pmany和頻繁編碼分類器參數(shù)繁編碼的分類器參數(shù)mr，通過(guò)多任務(wù)學(xué)習(xí)得到一個(gè)少樣本編碼模型參數(shù)到頻繁編碼模型參數(shù)的映射關(guān)系，這種映射關(guān)系為少樣本編碼提供了元知識(shí)Wknowledge。對(duì)于每個(gè)頻繁編碼，本文取樣U次（U通常取30 或40），以獲得不同的頻繁編碼的特征表示，這樣可以訓(xùn)練一個(gè)可推廣的遷移元網(wǎng)絡(luò)學(xué)習(xí)器，提高模型的泛化性。

通過(guò)最小化損失Lt進(jìn)行學(xué)習(xí)：

本文可以利用元知識(shí)將少樣本編碼特征表示Pfew（fewshot）映射到它的分類器參數(shù)Mmany（many-shot），從而將元知識(shí)從頻繁編碼遷移到少樣本編碼，提高少樣本編碼的分類性能。由式（8）能得到少樣本編碼z的編碼特征表示

2.4 輸出層

在輸出層將頻繁編碼的分類器權(quán)重Mmany和更新后的少樣本編碼的分類器參數(shù)進(jìn)行連接，得到用于預(yù)測(cè)的整個(gè)分類器權(quán)重M。

給定一個(gè)測(cè)試文檔，首先通過(guò)特征提取器得到它的特征向量g，然后通過(guò)Sigmoid 激活函數(shù)，產(chǎn)生給定文檔的預(yù)測(cè)結(jié)果。

3 實(shí)驗(yàn)設(shè)置

3.1 環(huán)境配置

本文的實(shí)驗(yàn)環(huán)境為Windows10 操作系統(tǒng)，CPU 為Intel Core i7-10700，GPU 為Nvidia GeForce RTX3060 12 GB，CUDA11.1。

3.2 數(shù)據(jù)介紹

MIMIC-Ⅲ［25］是由麻省理工學(xué)院開(kāi)發(fā)的公開(kāi)可用數(shù)據(jù)集，包含了2001—2012 年間在貝斯以色列女執(zhí)事醫(yī)療中心重癥監(jiān)護(hù)病房的4 萬(wàn)多名患者約58×103相關(guān)數(shù)據(jù)。每份病歷的出院小結(jié)中包含主訴、既往病史、診斷結(jié)果等?；颊呙看稳朐憾紩?huì)生成1 組ICD-9 編碼，具有準(zhǔn)確性與權(quán)威性。MIMIC-Ⅲ數(shù)據(jù)集經(jīng)常被用于驗(yàn)證模型的有效性。

本文參考了文獻(xiàn)［14］中的數(shù)據(jù)預(yù)處理方法。對(duì)文本進(jìn)行分詞，將所有標(biāo)記轉(zhuǎn)換為小寫(xiě)，使用“”標(biāo)記替換不包含字母字符的標(biāo)記。本文使用患者編號(hào)（subject_id）和病案號(hào)（hadm_id）進(jìn)行數(shù)據(jù)集的劃分，最終得到46 067 份出院小結(jié)用于訓(xùn)練，3 270 份用于驗(yàn)證，3 280 份用于測(cè)試。

3.3 數(shù)據(jù)劃分

本文采用了Rios 等［23］提出的數(shù)據(jù)劃分方式。少樣本編碼與頻繁編碼劃分的前提是這些編碼存在于驗(yàn)證集或測(cè)試集中。以驗(yàn)證集為例，在驗(yàn)證集中具有<5 個(gè)數(shù)據(jù)示例的ICD 編碼不參與評(píng)估。若某ICD 編碼同時(shí)出現(xiàn)在驗(yàn)證集及訓(xùn)練集中并且在訓(xùn)練集中的數(shù)據(jù)示例≤5，那么將它定義為少樣本編碼；否則將它定義為頻繁編碼。測(cè)試集中的編碼劃分標(biāo)準(zhǔn)與驗(yàn)證集相同。最終的少樣本編碼由驗(yàn)證集與測(cè)試集中少樣本編碼求并集得到。頻繁編碼由驗(yàn)證集與測(cè)試集中的頻繁編碼求交集得到。表1 中展示了編碼劃分后的結(jié)果。

表1 ICD編碼劃分結(jié)果Tab.1 ICD code division result

3.4 基線模型

CNN［26］：使用一維卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行句子分類。

雙向門(mén)控循環(huán)單元（Bidirectional Gate Recurrent Unit，BiGRU）［14］：執(zhí)行ICD 編碼。

CAML（Convolutional Attention for Multi-Label classification）［14］：用于多標(biāo)簽分類的卷積注意力網(wǎng)絡(luò)，包含一個(gè)單層CNN 和一個(gè)注意力層，為每個(gè)ICD 編碼生成與標(biāo)簽相關(guān)的表示。

ZAGCNN（Zero-shot Attentive Graph Convolutional Neural Network）［23］：利用結(jié)構(gòu)化標(biāo)簽空間和GCNN 來(lái)預(yù)測(cè)多標(biāo)簽集合中的少樣本和零樣本標(biāo)簽。

AGM-HT（Adversarial Generative Model conditioned on code descriptions with Hierarchical Tree structure）［24］：利用ICD編碼層次結(jié)構(gòu)和新穎的隱特征生成框架來(lái)實(shí)現(xiàn)多標(biāo)簽文本分類的廣義零樣本學(xué)習(xí)。

3.5 評(píng)價(jià)指標(biāo)

使用精度（precision）、召回率（recall）、F1 分?jǐn)?shù)、曲線下面積（Area Under Curve，AUC）來(lái)評(píng)價(jià)各模型表現(xiàn)。在Micro 上分別用RMicro-pre、RMicro-rec與RMicro-F1表示：

其中：n為ICD 編碼總數(shù)；TP指預(yù)測(cè)為正例，實(shí)際也為正例的個(gè)數(shù)；FP指預(yù)測(cè)為正例，實(shí)際為負(fù)例的個(gè)數(shù)；FN指預(yù)測(cè)為負(fù)例，實(shí)際為正例的個(gè)數(shù)。

在Macro 上用RMacro-pre、RMacro-rec與RMacro-F1表示：

3.6 超參數(shù)設(shè)置

實(shí)驗(yàn)中的參數(shù)為：詞嵌入維度de=200；語(yǔ)義提取器中CNN 的卷積核大小為10；出院小結(jié)文本的最大長(zhǎng)度為2 000；dropout 率為0.5；生成特征表示時(shí)各類別編碼采樣的文本數(shù)為5，對(duì)于文本實(shí)例不足5 份的少樣本編碼，則根據(jù)它在訓(xùn)練集中對(duì)應(yīng)的文本實(shí)例數(shù)確定該值；學(xué)習(xí)率為0.001；batch_size 為8。

4 實(shí)驗(yàn)與結(jié)果分析

4.1 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

表2 展示了MNIC 與基線模型在所有編碼上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果?？梢钥闯觯琈NIC 在大部分指標(biāo)上都有一定提高，說(shuō)明模型在提升少樣本編碼性能的同時(shí)未損害頻繁編碼的性能。表3 展示了MNIC 與基線模型在少樣本編碼上的結(jié)果對(duì)比?？梢钥闯觯c較先進(jìn)的AGM-HT 相比，MNIC 將Micro-AUC 和Micro-F1 提高了3.82 和3.77 個(gè)百分點(diǎn)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果驗(yàn)證了元網(wǎng)絡(luò)策略的有效性，它將學(xué)到的知識(shí)從數(shù)據(jù)豐富的頻繁編碼轉(zhuǎn)移到數(shù)據(jù)貧乏的少樣本編碼。

表2 各模型在所有編碼上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果 單位：%Tab.2 Experimental results of each model on all codes unit：%

表3 各模型在少樣本編碼上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果 單位：%Tab.3 Experimental results of each model on few-shot codes unit：%

盡管MNIC 的Micro 指標(biāo)表現(xiàn)出色，但Macro 指標(biāo)與AGM-HT 差距不大，這是因?yàn)樯贅颖揪幋a的數(shù)據(jù)量相對(duì)較小，樣本間的差異和不確定性較大，這可能導(dǎo)致模型在計(jì)算Macro 指標(biāo)時(shí)無(wú)法完全捕捉到每個(gè)類別的平衡性和整體性能；其次，MNIC 的架構(gòu)和訓(xùn)練策略可能在一些類別上產(chǎn)生了不均衡的學(xué)習(xí)效果，導(dǎo)致Macro 指標(biāo)沒(méi)有顯著提升。在實(shí)際情況中，對(duì)于大多數(shù)應(yīng)用場(chǎng)景，Micro 指標(biāo)更重要，因?yàn)樗鼈兛紤]了所有類別的綜合性能。因此，雖然MNIC 在Macro 分?jǐn)?shù)上略低于AGM-HT，但它仍然是一種有效的模型，能夠在少樣本編碼任務(wù)中取得顯著改進(jìn)。

4.2 消融實(shí)驗(yàn)

消融實(shí)驗(yàn)用于驗(yàn)證元網(wǎng)絡(luò)模塊的有效性。本文將去除元網(wǎng)絡(luò)模塊的模型稱為MNIC-MN（Meta Network-based ICD Coding model -Meta Network）。在少樣本編碼上的消融實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表4 所示?？梢钥闯?，MNIC 在所有的評(píng)估指標(biāo)中獲得了最好的結(jié)果，在沒(méi)有元網(wǎng)絡(luò)模塊時(shí)，與完整的MNIC 相比少樣本編碼的Micro-F1 和Micro-AUC 下降了19.28、7.96個(gè)百分點(diǎn)。以上結(jié)果表明，元網(wǎng)絡(luò)學(xué)到的元知識(shí)能夠提高少樣本編碼的性能表現(xiàn)。

表4 消融實(shí)驗(yàn)結(jié)果 單位：%Tab.4 Ablation experimental results unit：%

4.3 模型可解釋性

在手動(dòng)編碼臨床記錄時(shí)，編碼人員通常需要尋找相關(guān)疾病描述等證據(jù)來(lái)佐證自己的判斷。自動(dòng)ICD 編碼模型同樣也需要分配編碼的證據(jù)，即可解釋性。自動(dòng)ICD 編碼的可解釋性有助于提高編碼員頻繁編碼的編碼效率，同時(shí)也為編碼員提供了少樣本編碼的選擇，避免忽略罕見(jiàn)病的編碼，從而獲得專業(yè)編碼員的支持和信任。

圖2 為一些頻繁編碼樣本和少樣本編碼樣本的特征和特征表示（特征的平均值）繪制的T-SNE 圖。較淺的色點(diǎn)是頻繁編碼和少樣本編碼特征降維的結(jié)果；較深的點(diǎn)是頻繁編碼和少樣本編碼的特征表示降維的結(jié)果。

圖2 T-SNE圖Fig.2 T-SNE plots

圖2（a）為使用部分頻繁編碼及少樣本編碼特征繪制的T-SNE 圖，414.01、530.19 為頻繁編碼，414.19、530.13 為少樣本編碼；圖2（b）為頻繁編碼原型及少樣本編碼原型繪制的T-SNE 圖，410.11、532.40 為頻繁編碼，410.02、532.30 為少樣本編碼。圖2（b）的編碼特征表示2D 降維結(jié)果呈現(xiàn)出聚集性，表明它們具有相似的由少樣本編碼到頻繁編碼的映射轉(zhuǎn)換方式。可以發(fā)現(xiàn)特征表示使降維結(jié)果更加集中，這是特征表示模塊提高少樣本編碼性能的前提。此外，從圖2 可以看出，頻繁編碼和少樣本編碼的特征表示的2D 降維結(jié)果呈現(xiàn)出一定程度的聚類，這說(shuō)明相似的頻繁編碼和少樣本編碼具有相似的映射方式，因此可以通過(guò)從頻繁編碼學(xué)習(xí)元知識(shí)轉(zhuǎn)移到少樣本編碼，從而提高小樣本的編碼性能。頻繁編碼和少樣本編碼可以實(shí)現(xiàn)聚類，是由于ICD 編碼存在層次結(jié)構(gòu)，相近的兄弟或者父子編碼有相似的編碼描述，這為元知識(shí)學(xué)習(xí)和轉(zhuǎn)移提供了基礎(chǔ)。

5 結(jié)語(yǔ)

本文提出了一種基于特征表示的元網(wǎng)絡(luò)模型MNIC 用于ICD 編碼的少樣本學(xué)習(xí)。通過(guò)元網(wǎng)絡(luò)將元知識(shí)從數(shù)據(jù)豐富的頻繁編碼轉(zhuǎn)移到數(shù)據(jù)貧乏的少樣本編碼，在不影響頻繁編碼性能的情況下對(duì)少樣本編碼的性能進(jìn)行了改進(jìn)。在MIMIC-Ⅲ數(shù)據(jù)集上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，與目前最先進(jìn)的模型相比，MNIC 的表現(xiàn)具有優(yōu)越性。使用MNIC 能夠改善大規(guī)模多標(biāo)簽數(shù)據(jù)中長(zhǎng)尾問(wèn)題所帶來(lái)的影響。盡管本文的實(shí)驗(yàn)結(jié)果相較于同類研究性能大有提升，但是由于本文數(shù)據(jù)規(guī)模較大，訓(xùn)練模型的計(jì)算消耗也較大，文獻(xiàn)［22］中的模型減少了編碼深度以及對(duì)訓(xùn)練和應(yīng)用上的算力要求，未來(lái)對(duì)于小樣本分類的研究也可以考慮借鑒該思路，從減少算力要求并且不損失性能的角度入手繼續(xù)優(yōu)化模型。