關(guān)鍵詞:茶園土壤;有機(jī)肥配施化肥;細(xì)菌多樣性;細(xì)菌群落結(jié)構(gòu);細(xì)菌功能類群
中圖分類號:S154.3;S571.1 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:1672-2043(2024)12-2959-15 doi:10.11654/jaes.2023-1067
茶樹是典型葉用經(jīng)濟(jì)作物,一年中新梢的多輪次采摘會帶走大量養(yǎng)分,因而比其他農(nóng)作物對養(yǎng)分的需求量更大。茶農(nóng)為了提高茶葉產(chǎn)量,大量化肥被施入茶園土壤,為茶樹生長補(bǔ)充大量速效養(yǎng)分,迅速提升茶葉產(chǎn)量[1-2]。據(jù)國家茶產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系調(diào)查數(shù)據(jù)顯示[3],全國茶園化肥養(yǎng)分平均用量為678 kg·hm-2(高施肥茶園化肥用量可達(dá)1 041 kg·hm-2),提供茶樹全年90%的氮、78%的磷和75%的鉀,茶園化肥過量施用比例超過30%,且施肥主要以復(fù)合肥、尿素等速效化肥為主。長期過量施用化肥導(dǎo)致茶園土壤出現(xiàn)酸化程度加劇、板結(jié)和透氣性差、養(yǎng)分不均衡退化、微生物多樣性及功能下降等一系列問題[4-5],過量化肥還會以淋洗、地表徑流、氨揮發(fā)及N2O排放等形式進(jìn)入環(huán)境[6-7],造成肥料浪費(fèi)和環(huán)境污染。有機(jī)肥配施化肥是茶園化肥減施的重要途徑,可有效緩解茶園單施化肥引起的土壤質(zhì)量下降問題[8],且能夠明顯提高茶葉品質(zhì)。有研究表明,有機(jī)肥替代部分化肥可顯著提高茶園土壤有機(jī)質(zhì)和養(yǎng)分含量,提高土壤酶活性,降低養(yǎng)分徑流損失,改善土壤結(jié)構(gòu),提高茶葉產(chǎn)量和品質(zhì),同時降低茶園土壤溫室氣體排放量[9-11]。但連續(xù)施用有機(jī)肥對土壤微生物群落的影響仍有待明確。
土壤微生物是生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,幾乎參與了所有生態(tài)系統(tǒng)中土壤、碳、氮、磷、硫、鐵等養(yǎng)分的生物地球化學(xué)循環(huán)過程[12],是表征生態(tài)系統(tǒng)健康和恢復(fù)水平的敏感性指標(biāo)[13]。有研究表明,在地球的各個生物群落中,土壤微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性與一系列的生態(tài)系統(tǒng)功能,如營養(yǎng)循環(huán)、分解和植物生產(chǎn)力有正相關(guān)[14],且能夠迅速響應(yīng)土壤環(huán)境的變化。施肥作為一項(xiàng)重要的農(nóng)業(yè)措施,會加速土壤退化進(jìn)程,對土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和功能組成產(chǎn)生影響。近年來的研究表明,長期單施化肥會引起土壤酸化,導(dǎo)致微生物多樣性降低[15-16],與單施化肥相比,合理配施有機(jī)肥可以提高土壤微生物多樣性和多功能性[17-18],從而減少集約施肥的負(fù)面效應(yīng)。然而一些研究者發(fā)現(xiàn)施用有機(jī)肥后土壤微生物多樣性并未發(fā)生明顯改變,甚至?xí)档屯寥牢⑸锶郝涞亩鄻有?,這些不一致的結(jié)果可能是由有機(jī)肥類型和施肥持續(xù)年限不同造成的[19-21],且土壤類型和土地利用方式也可能影響有機(jī)肥對土壤微生物多樣性和群落組成的影響[22]。在茶園生態(tài)系統(tǒng)中,茶園施肥管理措施通過改變土壤理化性質(zhì)直接影響土壤微生物數(shù)量和群落,或影響茶樹根系分泌物(分泌物種類和數(shù)量)間接對土壤微生物數(shù)量和群落產(chǎn)生影響[23]。田間試驗(yàn)結(jié)果表明,長期施用氮肥改變了茶園土壤細(xì)菌群落特征,群落多樣性和穩(wěn)定性下降導(dǎo)致有益菌群減少[24-25]。相反,茶園施用有機(jī)肥能提高土壤細(xì)菌的多樣性,還能有效調(diào)節(jié)茶園土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),改善潛在的生態(tài)系統(tǒng)功能[26-27],但是過高的有機(jī)肥替代比例會降低茶葉產(chǎn)量[28]。相比而言,微生物各物種間的網(wǎng)絡(luò)互作關(guān)系及功能多樣性對于預(yù)測土壤生態(tài)功能更有意義,但有關(guān)施肥對茶園土壤細(xì)菌網(wǎng)絡(luò)及功能影響的研究尚少見報道。因此,本研究基于6 a 的茶園長期定位試驗(yàn),采用IlluminaMiSeq高通量測序技術(shù)和共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)分析,探討不同施肥措施下茶園土壤細(xì)菌群落多樣性、群落組成和共線性網(wǎng)絡(luò)的變化趨勢,并利用FAPROTAX方法對土壤細(xì)菌生態(tài)功能進(jìn)行預(yù)測,以期為茶園合理施肥提供科學(xué)依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 研究區(qū)概況
研究區(qū)位于福建省壽寧縣南陽鎮(zhèn)龜嶺村的茶園長期定位試驗(yàn)基地(27°43′N,119°40′E),該區(qū)域處于亞熱帶季風(fēng)氣候區(qū),海拔高度657 m,全年平均氣溫為15.1 ℃,低溫出現(xiàn)在1月,平均為3.7 ℃,高溫出現(xiàn)在7月,平均為22.6 ℃,年平均降雨量為1831mm。試驗(yàn)地土壤的成土母質(zhì)為火山巖,土壤類型為紅壤。試驗(yàn)地植茶前土壤(0~20 cm)基礎(chǔ)理化性質(zhì)如下:pH5.57,有機(jī)質(zhì)4.49 g·kg-1,全氮0.20 g·kg-1,堿解氮25.1mg·kg-1,全磷0.11 g·kg-1,有效磷0.80 mg·kg-1,全鉀7.65 g·kg-1,速效鉀31.9 mg·kg-1。
1.2 試驗(yàn)設(shè)計
長期定位試驗(yàn)設(shè)計如下:2016 年選擇未種植過茶樹的自然土壤布置長期定位試驗(yàn),用單片磚水泥全粉刷的方式進(jìn)行小區(qū)的分割,分割處深入地下30 cm,并涂防水材料處理,地面上高出20 cm。采用隨機(jī)區(qū)組方法進(jìn)行排列,每個區(qū)組之間距離30 cm,中間有水泥排水溝,每個小區(qū)留有統(tǒng)一方向的出水口通向排水溝(圖1)。2016年冬季將試驗(yàn)小區(qū)進(jìn)行土地平整,于2016年11月24日種植1年生扦插苗,茶樹品種為金牡丹(C. sinensis cv. jinmudan)。具體施肥處理如下:①對照(CK),植茶不施肥;②單施化肥(CF),施用量以純氮計算,第1年為75 kg·hm-2,第2年為150 kg·hm-2,第3年為300 kg·hm-2,第4年為450 kg·hm-2,此后每年均為600 kg·hm-2;③單施化肥+清園處理(CFC),茶園管理以清耕除草為主,茶樹修剪時移除修剪枝條;④有機(jī)肥配施化肥(OF),第1年和第2年有機(jī)肥的施用量為化肥等氮量的50%,第3年起有機(jī)肥的施用量改為化肥等氮量的25%;⑤有機(jī)肥配施化肥+種植綠肥(OFM),日常種植綠肥,綠肥品種為白三葉。每個處理設(shè)4個重復(fù),小區(qū)面積為30 m2。尿素(含氮量46%)、過磷酸鈣(含磷量12%)和硫酸鉀(含鉀量52%)作為化肥養(yǎng)分來源,肥料養(yǎng)分配比N∶P2O5∶K2O=1∶0.33∶0.48,施肥方式為撒施。氮肥和鉀肥分批次施用,冬季基肥40%(11月下旬)、春季催芽肥30%(3中下旬—4月上旬),秋茶追肥30%(8月中下旬),有機(jī)肥和磷肥作為基肥一次性施入。有機(jī)肥來源為商品有機(jī)肥(N 4.3%、P2O5 1.1%、K2O 3.2%),茶行中間開15~20cm 的施肥溝,溝施覆土。采摘按照制作大宗紅茶標(biāo)準(zhǔn)(一芽二葉或一芽三葉)進(jìn)行,春茶和秋茶各采摘一次。修剪按照傳統(tǒng)方式進(jìn)行,各處理保持一致。
1.3 土壤樣品采集與處理
各試驗(yàn)小區(qū)土壤樣品采集于2022 年6 月,去除地表的凋落物后,按照隨機(jī)多點(diǎn)混合取樣,采集耕層0~30 cm土壤樣品,采集5點(diǎn)子樣點(diǎn)混合成1個樣品,共獲得20份樣品,樣品用冰盒運(yùn)輸帶回實(shí)驗(yàn)室。剔除植物殘體、石塊等雜物,樣品分成兩份:一份保存于-80 ℃冰箱用于土壤微生物測定;另一份置于室內(nèi)通風(fēng)場地晾干,用木棍碾碎分別過10、20 目和100 目的標(biāo)準(zhǔn)篩后裝袋,標(biāo)記好用于土壤理化性質(zhì)測定。
1.5 土壤微生物DNA提取與高通量測序
采用FastDNA? Spin Kit for Soil 試劑盒(MP Bio?medicals,美國)提取土壤微生物DNA,提取過程參照說明書進(jìn)行。提取的DNA用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測樣品質(zhì)量,用NanoDrop2000 超微量分光光度計檢驗(yàn)DNA 的濃度和純度,稀釋合格后的樣品保存于-80 ℃冰箱用于PCR擴(kuò)增。細(xì)菌選用16S通用引物338F(5′-ACTCCTACGGGAGGCAGCAG-3′)和806R(5′ -GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3′)進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增條件:95 ℃ 3 min;95 ℃ 30 s,55 ℃ 30 s,72 ℃ 45s,27個循環(huán);72 ℃延伸10 min直至反應(yīng)完成。擴(kuò)增體系為20 μL 反應(yīng)體系,其中包括4 μL 的5×FastPfuBuffer緩沖液、2 μL 的2.5 mmol·L-1 dNTPs、0.8 μL 的正反引物(5 μmol·L-1)、0.4 μL的5×FastPfu DNA聚合酶、0.2 μL 的BSA 和10 ng 的模板DNA,補(bǔ)dd H2O 至20 μL。擴(kuò)增產(chǎn)物委托上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司完成測序工作,測序平臺為Illumina MiSeq(PE300,San Diego,CA,美國)。
1.6 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計分析
測序獲得的原始序列經(jīng)過Qiime 平臺篩選和序列優(yōu)化后,依據(jù)97%的相似度聚類成操作分類單元,采用RDP classifier 貝葉斯算法對97% 相似水平的OTU代表序列進(jìn)行分類學(xué)信息注釋。細(xì)菌16S rRNA比對數(shù)據(jù)庫為Silva(Release138 http://www.arb-silva.de),默認(rèn)置信度閾值為0.7。20 個土壤樣品獲得1 756 713條高質(zhì)量的序列,平均長度為414.14 bp,可劃分為40個門,134個綱,327個目,515個科,991個屬,2144 個種。采用Mothur(1.30.2)計算樣品的Alpha多樣性指數(shù)來反映微生物群落的豐富度(Sobs、Chao1、Ace)和多樣性(Shannon、Simpson)。采用Qiime(2020.2.0)計算beta 多樣性Bray-Curtis 距離矩陣。R語言(version 3.3.1)vegan軟件包進(jìn)行非度量多維尺度分析(NMDS分析)和制圖,可視化呈現(xiàn)不同環(huán)境樣本中群落組成的相似或差異程度。土壤細(xì)菌功能預(yù)測采用FAPROTAX 軟件[30],具體分析步驟基于美吉在線云平臺(https://cloud.majorbio.com/)。基于樣本OTU 之間的Spearman 系數(shù)進(jìn)行共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)分析,保留穩(wěn)健相關(guān)(相關(guān)系數(shù)絕對值gt;0.7,Plt;0.05)的OTU進(jìn)行構(gòu)建,將單施化肥(CF、CFC)和有機(jī)肥配施化肥(OF、OFM)的處理進(jìn)行合并,從而提高網(wǎng)絡(luò)的穩(wěn)健性和可信度。利用Networkx復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)分析工具包(Python語言),通過計算網(wǎng)絡(luò)的節(jié)點(diǎn)度分布、網(wǎng)絡(luò)的直徑、網(wǎng)絡(luò)的平均最短路徑,以及節(jié)點(diǎn)聯(lián)通性、緊密系數(shù)、介數(shù)中心性等屬性,來獲得物種和樣本的組內(nèi)或組間的相關(guān)信息,更加全面高效地挖掘出復(fù)雜數(shù)據(jù)中包含的信息。利用Cytoscape 3.8.2 軟件對微生物網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行可視化處理,為方便構(gòu)圖挑選豐度前50位的物種進(jìn)行展示。土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)之間的相關(guān)性采用冗余分析(RDA 分析),采用R語言vegan 包進(jìn)行分析和制圖。RDA 分析前對環(huán)境因子進(jìn)行篩選,采用方差膨脹因子分析保留多重共線性較小的環(huán)境因子(VIFlt;10)進(jìn)行后續(xù)研究。采用Spearman相關(guān)系數(shù)進(jìn)行環(huán)境因子與物種之間的相關(guān)性熱圖分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 不同施肥措施對茶園土壤理化性質(zhì)的影響
不同施肥處理下,茶園土壤理化性質(zhì)產(chǎn)生了明顯的變化(表1)。由于持續(xù)的養(yǎng)分投入,相比CK處理,各施肥處理的土壤養(yǎng)分含量均有所增加(土壤全鉀除外)。統(tǒng)計分析表明,與CK處理相比,CF處理使土壤堿解氮和全磷含量(Plt;0.05)分別顯著增加了27.47%和32.70%,其他指標(biāo)差異不顯著(Pgt;0.05);與CK處理相比,OF 和OFM 處理土壤pH 分別顯著增加0.85 個和0.32個單位(Plt;0.05),土壤全氮、堿解氮、全磷及速效磷含量顯著增加(Plt;0.05);與CF 處理相比,OF 處理顯著增加了土壤pH、全磷、速效磷和速效鉀(Plt;0.05),OFM處理顯著增加了土壤pH(Plt;0.05);CF和CFC 處理之間土壤理化性質(zhì)差異不顯著(Pgt;0.05)。由此可見,連續(xù)6a配施有機(jī)肥提高了茶園土壤有機(jī)質(zhì)、全氮、速效養(yǎng)分含量和pH,改善了茶園土壤肥力水平。
2.2 不同施肥措施對土壤細(xì)菌群落Alpha多樣性的影響
不同施肥處理茶園土壤樣品中一共分析出26 973個OTUs數(shù)目,其中各施肥處理土壤共有OTUs數(shù)為2733個,占OTUs總數(shù)的10.13%(圖2)。CK、CF、CFC、OF 和OFM 土壤細(xì)菌OTUs 總數(shù)分別為5 282、4935、5068、5 611個和6077個,單施化肥處理OTUs數(shù)目低于CK,而有機(jī)肥配施處理OTUs數(shù)目明顯高于單施化肥處理。
通過分析土壤樣品,計算得到各樣品土壤細(xì)菌Alpha多樣性指數(shù)(表2)。由表2可知,覆蓋度指數(shù)值在所有的處理中均大于97.7%,表明在該測序深度下,大多數(shù)的細(xì)菌群落已經(jīng)被覆蓋。不同施肥處理下Sobs指數(shù)為2 897.81~3 602.81、Ace指數(shù)為3 882.40~4 676.10,Chao1指數(shù)為3 890.30~4 653.30,Shannon指數(shù)為6.37~6.73,Simpson 指數(shù)為0.003 6~0.005 5。與CK處理相比,CF和CFC處理降低土壤細(xì)菌群落Alpha多樣性指數(shù),但差異不顯著(Pgt;0.05),OFM處理顯著增加了土壤細(xì)菌Sobs、Ace、Chao1和Shannon指數(shù)(Plt;0.05),顯著降低了Simpson 指數(shù)(Plt;0.05);OFM 處理的Sobs、Ace、Chao1 和Shannon 指數(shù)顯著高于CF 和CFC處理(Plt;0.05),OF和OFM處理之間各指數(shù)差異不顯著(Pgt;0.05)。整體上,單施化肥處理一定程度降低土壤細(xì)菌群落的多樣性指數(shù),而配施有機(jī)肥則提高土壤細(xì)菌群落的多樣性。
2.3 不同施肥措施對土壤細(xì)菌群落特征和Beta多樣性的影響
各處理土壤細(xì)菌門水平相對豐度如圖3a所示,豐度相對較高(gt;1%)的有變形菌門(Proteobacteria)、放線菌門(Actinobacterita)、酸桿菌門(Acidobacteria)綠彎菌門(Chloroflexi)、厚壁菌門(Firmicutes)、黏球菌門(Myxococcota)、芽單胞菌門(Gemmatimonadetes)、擬桿菌門(Bacteroidota)、浮霉菌門(Planctomycetota)和WPS-2候選分支,其中綠彎菌門、放線菌門、變形菌門和酸桿菌門是絕對優(yōu)勢菌門,約占到所有細(xì)菌總數(shù)的72.67%~77.31%。與CK處理相比,OF處理顯著增加了厚壁菌門和擬桿菌門的相對豐度(Plt;0.05);與CF和CFC處理相比,OF處理顯著增加了黏球菌門的相對豐度(Plt;0.05),但也顯著降低了浮霉菌門的相對豐度(Plt;0.05)。
在屬分類水平上(圖3b),相對豐度大于1%的屬共有26 個,其中norank_f__norank_o__norank_c__AD3、norank_f__Xanthobacteraceae、norank_f__norank_o__Subgroup_2、norank_f__norank_o__Acidobacteriales 和norank_f__norank_o__Vicinamibacterales 的相對豐度大于5%。與CK處理相比,OF和OFM處理顯著降低了norank_f__norank_o__norank_c__AD3 和熱酸菌屬(Acidothermus)的相對豐度(Plt;0.05),OF處理顯著增加了芽孢桿菌屬(Bacillus)的相對豐度(Plt;0.05);與CF 處理相比,OFM 處理顯著增加了norank_f__norank_o__Vicinamibacterales 的相對豐度,OF 和OFM處理顯著降低了熱酸菌屬、羅河桿菌屬(Rhodano?bacter)和Burkholderia - Caballeronia-Paraburkholderia的相對豐度(Plt;0.05),OF處理顯著增加了芽孢桿菌屬的相對豐度(Plt;0.05)。
對不同施肥措施的茶園土壤細(xì)菌群落進(jìn)行NMDS分析,結(jié)果見圖4。從圖4可以看出,單施化肥的CF和CFC兩個處理的土壤樣品較為緊密地聚集在一起,CK和CFC處理之間也有一定程度的重合,而施用有機(jī)肥(OF和OFM)處理土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與施用化肥(CF和CFC)均有明顯差異。進(jìn)一步通過ANOSIM分析表明,不同施肥措施顯著改變茶園土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)(R2=0.442 1,P=0.001)。OF 與CK、CF 和CFC 處理之間的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)存在顯著差異(Plt;0.05),OFM 與CFC 處理之間的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)存在顯著差異(Plt;0.05),其他處理之間差異不顯著(Pgt;0.05)。
2.4 不同施肥措施對茶園土壤細(xì)菌功能菌群的影響
采用FAPROTAX工具對土壤細(xì)菌群落功能注釋后共獲得45種功能分組,相對豐度較高的功能類群如圖5 所示。各處理中化能異養(yǎng)(chemoheterotro?phy)、有氧化能異養(yǎng)(aerobic chemoheterotrophy)、固氮作用(nitrogen fixation)、纖維素分解(cellulolysis)、硝酸鹽還原作用(nitrate reduction)、發(fā)酵作用(fer?mentation)、鐵呼吸(iron respiration)、尿素水解(ureol?ysis)和光養(yǎng)作用(phototrophy)的相對豐度在1% 以上,其中化能異養(yǎng)、有氧化能異養(yǎng)、固氮作用、纖維素分解和硝酸鹽還原作用功能類群占總豐度的65.63%~76.28%。方差分析結(jié)果表明,與CK 處理相比,CF處理中捕食性或外寄生作用(predatory or exo?parasitic)功能種群的相對豐度顯著降低(Plt;0.05),而錳氧化作用(manganese oxidation)功能種群的相對豐度顯著增加(Plt;0.05),OF和OFM處理中固氮作用和纖維素分解功能種群的相對豐度顯著降低(Plt;0.05),芳香族化合物降解(aromatic compound degradation)功能種群的相對豐度顯著增加(Plt;0.05)。與CF處理相比,OF處理中纖維素分解和錳氧化作用功能種群的相對豐度顯著降低(Plt;0.05),捕食性或外寄生作用、光異養(yǎng)作用(photoheterotrophy)、光養(yǎng)作用(pho?totrophy)、氮呼吸(nitrogen respiration)、硝酸鹽呼吸(nitrate respiration)、亞硝酸鹽呼吸(nitrite respira?tion)、硝酸鹽反硝化(nitrate denitrification)、亞硝酸反硝化(nitrite denitrification)、一氧化二氮反硝化(nitrous-oxide-denitrification)、反硝化作用(denitrifi?cation)、光合自養(yǎng)硫氧化(anoxygenic photoautotrophy Soxidizing)和光能自養(yǎng)(anoxygenic photoautotrophy)功能種群的相對豐度顯著增加(Plt;0.05)。
2.5 不同施肥措施對茶園土壤細(xì)菌共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)特征的影響
基于CK、單施化肥(CF、CFC)、有機(jī)肥配施化肥(OF、OFM)測序結(jié)果構(gòu)建細(xì)菌共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)(圖6、表3)。如圖6和表3所示,3個處理的共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)具有明顯的不同,CK處理網(wǎng)絡(luò)由48個節(jié)點(diǎn)和234條邊組成,菌群主要分布在變形菌門、綠彎菌門、放線菌門、厚壁菌門、酸桿菌門和GLA15;單施化肥網(wǎng)絡(luò)有48個節(jié)點(diǎn)和292條邊組成,菌群主要分布在變形菌門、綠彎菌門、放線菌門、厚壁菌門和酸桿菌門;有機(jī)肥配施網(wǎng)絡(luò)由48個節(jié)點(diǎn)和258條邊組成,菌群主要分布在藍(lán)藻門(Cyanobacteria)、芽單胞菌門、變形菌門、綠彎菌門、放線菌門、厚壁菌門和酸桿菌門。與CK 處理相比,單施化肥土壤細(xì)菌分子網(wǎng)絡(luò)平均連通度明顯增加,表明施肥后其網(wǎng)絡(luò)規(guī)模、復(fù)雜性均得到了提升,其中單施化肥處理的邊數(shù)、連通度大于有機(jī)肥配施處理。各處理細(xì)菌作用均以正相關(guān)為主(正相關(guān)比例為58.03%~77.78%),說明各處理細(xì)菌均以合作關(guān)系為主,其中正相關(guān)比例排序?yàn)镃Kgt;單施化肥gt;有機(jī)肥配施,施肥加劇了茶園土壤細(xì)菌間的競爭程度。相比CK處理,單施化肥和有機(jī)肥配施處理下的網(wǎng)絡(luò)平均聚類系數(shù)較低,而網(wǎng)絡(luò)平均路徑長度距離較長。
2.6 土壤細(xì)菌多樣性及群落結(jié)構(gòu)與土壤理化性質(zhì)的相關(guān)性
土壤理化性質(zhì)和土壤細(xì)菌多樣性的相關(guān)性分析見圖7,土壤pH、全磷和速效磷與土壤細(xì)菌Sobs、Shannon、Ace和Chao1指數(shù)呈顯著或極顯著正相關(guān),與Simpson指數(shù)呈顯著或極顯著負(fù)相關(guān);其余指標(biāo)與土壤細(xì)菌多樣性指數(shù)之間的相關(guān)性均未達(dá)到顯著水平??傮w而言,土壤pH、全磷和速效磷對土壤細(xì)菌群落多樣性影響較為顯著。
土壤理化性質(zhì)與相對豐度最高的12個門和50個屬的Spearman相關(guān)性分析結(jié)果見圖8。門水平上(圖8a),土壤pH與放線菌門、厚壁菌門、黏球菌門和芽單胞菌門的相對豐度之間呈顯著或極顯著正相關(guān),與浮霉菌門的相對豐度呈極顯著負(fù)相關(guān);土壤全磷和速效磷與放線菌門、厚壁菌門、黏球菌門、芽單胞菌門和擬桿菌門的相對豐度呈顯著或極顯著正相關(guān),與綠彎菌門、浮霉菌門和WPS-2的相對豐度呈顯著或極顯著負(fù)相關(guān);土壤速效鉀與擬桿菌門的相對豐度呈顯著正相關(guān)。在屬水平上(圖8b),土壤有機(jī)質(zhì)、全氮、速效鉀和CEC與大多數(shù)土壤細(xì)菌屬的相對豐度相關(guān)性不顯著,土壤pH、全磷和速效磷與大多數(shù)細(xì)菌屬的相對豐度存在顯著或極顯著相關(guān)性。
進(jìn)一步通過RDA分析來解析土壤理化性質(zhì)對細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響。結(jié)果(圖9a)顯示,門水平上土壤理化性質(zhì)解釋了細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化的58.47%,其中第一排序軸解釋量為46.88%,第二排序軸解釋量為11.59%,其中速效磷(R2=0.841 9,P=0.001)和pH(R2=0.6309,P=0.001)對土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的影響顯著。在屬水平上(圖9b),前兩個排序軸分別解釋了細(xì)菌群落變化的46.91% 和11.21%,兩者共解釋58.12%,速效磷(R2=0.676 7,P=0.001)和pH(R2=0.4938,P=0.004)對土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)有顯著影響。由Mantel test(表4)分析可知,有效磷和pH對土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)(門水平)具有最顯著的影響(R=0.4346,P=0.002 和R=0.3087,P=0.003),有效磷對土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)(屬水平)具有最顯著的影響(R=0.2339,P=0.026)。因此,土壤有效磷和土壤pH可能是影響施肥后茶園土壤細(xì)菌群落變化的重要環(huán)境因素。
3 討論
3.1 不同施肥措施對茶園土壤細(xì)菌多樣性和群落組成的影響
適宜的有機(jī)肥替代比例不僅提高茶葉產(chǎn)量[31],增加茶葉水浸出物、氨基酸和香氣成分物質(zhì)的含量,還可以改善茶園土壤理化性狀,并引起土壤微生物群落結(jié)構(gòu)及多樣性的差異[32-33]。土壤細(xì)菌Alpha多樣性指數(shù)是表征土壤細(xì)菌功能和生態(tài)系統(tǒng)穩(wěn)定的重要指標(biāo),一般而言長期施用化肥導(dǎo)致土壤酸化和養(yǎng)分不均衡,降低土壤細(xì)菌多樣性[15],而施用有機(jī)肥則會刺激土壤細(xì)菌生長并提高土壤細(xì)菌多樣性[17-18]。Feng等[34]分析了我國10個20 a田間施肥(有機(jī)肥和無機(jī)肥)試驗(yàn)結(jié)果,發(fā)現(xiàn)在高降水和高土壤肥力地區(qū)的酸性土壤中,施用化肥可導(dǎo)致土壤進(jìn)一步酸化,進(jìn)而對土壤細(xì)菌多樣性產(chǎn)生負(fù)面影響,而有機(jī)肥能提高大多數(shù)酸性土壤細(xì)菌豐富度。本研究中,與CK處理相比,6 a CF處理降低茶園土壤細(xì)菌群落的多樣性指數(shù),而OF處理和OFM處理均提高了細(xì)菌Alpha多樣性指數(shù),其中OFM處理細(xì)菌Alpha多樣性指數(shù)顯著增加(表2)。Ma等[24]對龍井茶園研究的結(jié)果也與本研究一致。這可能是由于有機(jī)肥配施化肥提高土壤結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性、土壤養(yǎng)分含量以及生物活性,整體形成有利于細(xì)菌生長繁殖的良好環(huán)境[35]。本研究中,土壤pH、全磷和速效磷是影響土壤細(xì)菌多樣性的重要土壤因子,這與已有的研究結(jié)果基本一致[26-28]。RDA 分析結(jié)果也表明,全磷、速效磷和pH對土壤中的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)有顯著影響,這說明不同的施肥措施會通過改變土壤養(yǎng)分和pH來影響茶園土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。有研究表明[36],土壤pH已經(jīng)被認(rèn)為是影響全球土壤細(xì)菌群落變化的關(guān)鍵因子。本研究中,與CF處理相比,OF和OFM處理土壤pH分別顯著提高了0.85個和0.32個單位,因而部分與pH呈顯著正相關(guān)的放線菌門、厚壁菌門、黏球菌門和芽單胞菌門的相對豐度明顯增加(圖8),從而導(dǎo)致了土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的變化。Wu等[37]的研究認(rèn)為,隨著全球氮輸入的增加,磷對土壤微生物生長過程的限制可能更大,適宜的土壤有效磷含量對土壤微生物在全球尺度具有積極影響,而土壤中大量的有效磷可能導(dǎo)致植物有益微生物的消耗,同時增加致病微生物豐度并影響植物健康[38-39]。本課題組前期研究結(jié)果顯示速效磷含量過高的茶園土壤致病菌含量顯著增加,而土壤有益菌含量顯著降低[40]。本試驗(yàn)地茶園土壤有效磷含量較低(7.57 mg·kg-1),施肥后土壤有效磷含量明顯增加,其中OF處理有效磷含量達(dá)到了優(yōu)質(zhì)高產(chǎn)茶園標(biāo)準(zhǔn)(gt;25 mg·kg-1),適宜的土壤有效磷含量會改變生物群落結(jié)構(gòu)和組成并會促進(jìn)某些特定微生物的生長[41]。
不同施肥處理所引起的土壤環(huán)境變化會顯著影響微生物群落的組成[42]。本研究結(jié)果表明,不同施肥處理中細(xì)菌優(yōu)勢菌群相似,但不同處理門和屬水平上的優(yōu)勢類群的相對豐度差異顯著(圖3)。與CK處理相比,OF處理中厚壁菌門和擬桿菌門的相對豐度顯著增加了65.55% 和176.12%(Plt;0.05);與CF 和CFC處理相比,OF處理黏球菌門的相對豐度顯著增加86.60% 和72.60%(Plt;0.05),但浮霉菌門的相對豐度也顯著降低了73.59%和63.58%(Plt;0.05)。盡管不同施肥處理土壤細(xì)菌優(yōu)勢菌群基本相似,但是各施肥處理中土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的整體組成存在顯著差異(R2=0.442 1,P=0.001)。NMDS分析表明(圖4),CK 和CFC處理樣品存在明顯重疊區(qū)域,而OF和OFM處理土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)與CF和CFC處理均有明顯差異,這表明連續(xù)6a 施肥已顯著改變茶園土壤細(xì)菌群落組成,其中OF處理影響更為顯著。OF處理土壤富集了更多的細(xì)菌分類群(33個進(jìn)化枝,2個門,8個綱,8個目,8個科和7個屬),而這類菌群能夠起到溶解病原菌、防治植物土傳病害和分泌抗菌抑制劑等多種作用[43-45]。另外,變形菌門中的生絲微菌科(Hyphomi?crobiaceae)同樣在OF 處理中廣泛富集,這類富營養(yǎng)型細(xì)菌均具有較強(qiáng)的固氮功能,OF處理中黏球菌門中的多囊菌綱和多囊菌目相對豐度顯著增加,這說明有機(jī)肥配施化肥可能有利于驅(qū)動土壤中作物有益微生物群落結(jié)構(gòu)穩(wěn)定,從而降低土傳病害發(fā)生,緩解長期植茶帶來的連作障礙。
3.2 不同施肥措施對茶園土壤細(xì)菌功能類群和共現(xiàn)性網(wǎng)絡(luò)的影響
茶園土壤細(xì)菌生態(tài)功能類群以化能異養(yǎng)、有氧化能異養(yǎng)、固氮作用、纖維素分解和硝酸鹽還原作用功能類群為主(圖5),比例為65.63%~76.28%。與CF處理相比,OF處理中纖維素分解和錳氧化作用功能種群的相對豐度顯著降低(Plt;0.05),而捕食性或外寄生作用、光異養(yǎng)作用、光養(yǎng)作用、光合自養(yǎng)硫氧化和光能自養(yǎng)功能種群的相對豐度顯著增加(Plt;0.05),表明OF處理中有更高比例的細(xì)菌參與土壤碳氮循環(huán),這與Gu等[26]的研究結(jié)果一致。同時OF處理中參與氮循環(huán)功能細(xì)菌種群豐度的提高,意味著降低氮肥施入量有利于土壤有機(jī)氮被微生物礦化[46],從而釋放出更多無機(jī)氮供作物吸收利用,這可能也是適宜有機(jī)肥替代比例條件下茶葉提質(zhì)增產(chǎn)的原因之一。
土壤微生物網(wǎng)絡(luò)分析為探索土壤微生物群落之間復(fù)雜的相互關(guān)系提供了新的途徑,可以識別影響土壤微生物群落結(jié)構(gòu)和潛在功能最大的關(guān)鍵物種[47],網(wǎng)絡(luò)節(jié)點(diǎn)數(shù)和邊數(shù)可以表示分子生態(tài)網(wǎng)絡(luò)的規(guī)模和復(fù)雜性[48]。本研究中,施肥后茶園土壤細(xì)菌分子網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)鋵W(xué)特征如連接數(shù)、平均連通度、度中心性及緊密中心性明顯提高,表明施肥增強(qiáng)了對環(huán)境擾動的抵抗性[49],且中短期內(nèi)(6a)茶園細(xì)菌網(wǎng)絡(luò)規(guī)模的擴(kuò)大更加依賴于單施化肥。CF處理顯著增加了土壤堿解氮和全磷含量,有機(jī)肥配施化肥處理則通過增加土壤有機(jī)質(zhì)、全氮和速效養(yǎng)分的含量顯著改善土壤肥力水平,土壤養(yǎng)分的提升能夠?yàn)榧?xì)菌群落提供更多的資源生態(tài)位,從而能夠塑造和形成更加復(fù)雜的互作關(guān)系和共存網(wǎng)絡(luò)。由微生物菌群之間正負(fù)相關(guān)比例可見(表3),茶園土壤細(xì)菌菌群之間以正相關(guān)為主(正相關(guān)比例為58.03%~77.78%),表明在本研究的茶園土壤中細(xì)菌群落之間有更為緊密的協(xié)作關(guān)系;CK處理的細(xì)菌菌群正相關(guān)比例最高,有機(jī)肥配施化肥處理的正相關(guān)比例較低,表明施肥(尤其是有機(jī)肥配施化肥)加劇了茶園土壤細(xì)菌間競爭程度,這可能與有機(jī)肥中富含更易被細(xì)菌群落分解利用的半纖維素和蛋白質(zhì)等簡單有機(jī)物有關(guān)[50]。此外,有機(jī)肥配施化肥處理的共現(xiàn)細(xì)菌類群多于CK和單施化肥處理(圖6),新增關(guān)鍵類群藍(lán)藻門和芽單胞菌門則與土壤養(yǎng)分循環(huán)和病原菌防控有關(guān)[51],這在一定程度上說明有機(jī)肥配施化肥處理有利于促進(jìn)土壤細(xì)菌群落生態(tài)位競爭。另外,微生物網(wǎng)絡(luò)平均路徑長度代表物種間傳遞物質(zhì)、能量及信息的效率[52],平均聚類系數(shù)表明微生物對外界環(huán)境因子擾動的敏感程度。相比于CK處理,各施肥處理的土壤微生物網(wǎng)絡(luò)平均路徑距離增加,平均聚類系數(shù)均有所下降,且有機(jī)肥配施化肥的變化程度要高于單施化肥,這意味有機(jī)肥配施化肥后土壤細(xì)菌響應(yīng)速度變慢,外界環(huán)境變化不會在較短時間內(nèi)影響整個細(xì)菌生態(tài)網(wǎng)絡(luò),有利于提高細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性[53]。
4 結(jié)論
(1)6a田間試驗(yàn)結(jié)果表明,施肥明顯提高了茶園土壤速效養(yǎng)分含量,與單施化肥相比,有機(jī)肥配施化肥顯著增加了土壤全磷、速效磷和速效鉀含量,提高土壤pH有效緩解了土壤酸化。
(2)施肥改變茶園土壤細(xì)菌多樣性,與不施肥處理相比,單施化肥降低了土壤細(xì)菌群落的Alpha多樣性,有機(jī)肥配施化肥則提高了土壤細(xì)菌的Alpha多樣性,而這主要與施肥后速效磷和pH的變化有關(guān)。
(3)茶園土壤細(xì)菌生態(tài)功能類群以化能異養(yǎng)、有氧化能異養(yǎng)、固氮作用、纖維素分解和硝酸鹽還原作用功能類群為主,有機(jī)肥配施化肥處理提高了細(xì)菌參與碳氮循環(huán)功能種群的相對豐度。
(4)施肥有助于茶園土壤細(xì)菌群落形成復(fù)雜的共生網(wǎng)絡(luò),有機(jī)肥配施化肥可改變茶園土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),促進(jìn)土壤細(xì)菌碳氮循環(huán)功能,提高細(xì)菌網(wǎng)絡(luò)規(guī)模和群落互作。