荀寶茹 秦洪濤 馬 蕊 郭楠楓 劉運(yùn)平 吳 瑩 藍(lán)興國
(東北鹽堿植被恢復(fù)與重建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,東北林業(yè)大學(xué),哈爾濱 150040)
在開花植物中,柱頭能特異地識別本物種的花粉而拒絕其他遠(yuǎn)源花粉和真菌孢子等的萌發(fā),這一過程極為復(fù)雜,花粉和柱頭的精準(zhǔn)識別決定授粉事件的成功完成[1-2]。柱頭作為雌蕊授粉的受感面,當(dāng)花粉落到柱頭后,會迅速啟動一條基本反應(yīng)途徑,花粉經(jīng)過黏附、水合、萌發(fā)最終生長出花粉管,穿過花柱,進(jìn)入子房,一直到達(dá)胚珠并完成受精,此過程受到多種關(guān)鍵分子調(diào)控[3-5]。自然界中,許多開花植物進(jìn)化出一種自交不親和性遺傳機(jī)制,排斥自身花粉,接受異花花粉,以避免近親繁殖,促進(jìn)雜種優(yōu)勢[6-8]。在十字花科(Brassicaceae)中,自交不親和性(SI)遺傳機(jī)制受S位點(diǎn)控制[9],雄性S位點(diǎn)決定因子為SP11/SCR,雌性S位點(diǎn) 決 定因子為SRK[10]。SP11/SCR 和SRK 之間相互作用能夠誘導(dǎo)SRK 自磷酸化,觸發(fā)下游信號級聯(lián)反應(yīng),導(dǎo)致自身花粉被排斥[11]。M-位點(diǎn)蛋白激酶MLPK 和具有E3泛素連接酶活性的臂重復(fù)蛋白ARC1 已 被 鑒 定 為SRK 直 接 下 游 效 應(yīng) 因 子[12-14]。SRK 磷酸化后激活下游效應(yīng)因子ARC1,使其泛素化 進(jìn) 而 降 解 親 和 因 子Exo70A1[15]、GLO1[16]和PLD1[17],導(dǎo)致SI反應(yīng)。
一些類受體激酶RLKs 在雌雄相互作用中已被鑒定,具有感知信號分子的功能[18-19]。FERONIA(FER)屬于類受體激酶CrRLKL1家族,在植物生長、發(fā)育、激素信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、生物和非生物脅迫等多種生物過程發(fā)揮著重要調(diào)控作用[20-25]。FER 的功能缺失會導(dǎo)致雄性不育、根毛、下胚軸、葉片、種皮等細(xì)胞伸長、根系發(fā)育及對病原菌應(yīng)答等缺陷[26-31]。FER-Rac/Rop 信號能夠調(diào)控NADPH 氧化酶產(chǎn)生活性氧(ROS),導(dǎo)致結(jié)球白菜(Brassica rapa)SI 反應(yīng)[6]。類受體激酶CrRLKL1 家族另一個(gè)成員ANJEA(ANJ),也在柱頭中高度表達(dá)[28,32]。在擬南芥(Arabidopsis thaliana)中,花粉外被蛋白(PCP-B)和快速堿化因子(RALF23/33)競爭性與ANJ-FER 復(fù)合物結(jié)合,導(dǎo)致柱頭中ROS下降,促進(jìn)花粉水合、萌發(fā)[33]。自交不親和花粉或種間花粉與柱頭SRK 結(jié)合,能夠招募FER,激活SI 柱頭中FER 介導(dǎo)的ROS 產(chǎn)生信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑,以排斥不親和花粉[6,26,34-36],SRK 和FER 整合了種內(nèi)和種間生殖屏障的潛在機(jī)制,可為十字花科作物遠(yuǎn)緣育種提供可行性途徑[37]。
目前FER 在羽衣甘藍(lán)(Brassica oleraceavar.acephala)授粉早期事件及其潛在靶向效應(yīng)因子等方面研究非常少。本研究從羽衣甘藍(lán)柱頭中成功克隆得到BoFER基因,對其氨基酸序列、組織特異性和授粉后不同時(shí)間的表達(dá)模式進(jìn)行分析,并鑒定其與已報(bào)道的SI 因子互作關(guān)系,以期進(jìn)一步了解BoFER 可能發(fā)揮的功能,為深入解析BoFER 在生殖發(fā)育過程中的作用奠定基礎(chǔ)。
羽衣甘藍(lán)自交不親和系(S13-bS13-b)與親和系(S45S45)種植于東北林業(yè)大學(xué)花卉生物工程研究所(45°72′53″N,126°62′92″E)。分別用來自S45S45株系和自身(S13-bS13-b)的花粉對去雄后的S13-bS13-b株系成熟柱頭進(jìn)行親和及不親和授粉,收集親和及不親和授粉后0、30、60 min的雌蕊,同時(shí)采集S13-bS13-b株系萼片、花瓣、柱頭、花柱及子房等樣本,隨后用液氮立即冷凍樣本,于冰箱中-80 ℃存儲。
根據(jù)NCBI 數(shù)據(jù)庫提供的甘藍(lán)基因組序列,設(shè)計(jì)BoFER基因的CDS 序列特異性引物BoFERCDS-F 和BoFER-CDS-R,用于BoFER基因CDS 區(qū)的克隆。在BoFER 激酶結(jié)構(gòu)域(KD)序列兩端設(shè)計(jì)特異性引物BoFER-KD-F 和BoFER-KD-R,用于BoFER 激酶域的克隆,引物均由華大基因合成(見表1)。通過E.Z.N.A.? Plant RNA Kit(OMEGA)試劑盒提取S13-bS13-b柱頭總RNA,利用TranScript One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis Super-Mix(TransGen)試劑盒獲得柱頭cDNA。參考李陽等[38]的方法進(jìn)行載體構(gòu)建,利用LATaqDNA 聚合酶(TaKaRa)克隆基因,使用E.Z.N.A.?Gel Extraction Kit(OMEGA)試劑盒回收PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物,并將回收產(chǎn)物連接到pMD19-T 載體連接,熱激法轉(zhuǎn)化到大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α中,涂于相應(yīng)抗性平板上,挑取單克隆,進(jìn)行菌液PCR,符合目的片段大小的菌液送至華大基因進(jìn)行測序,利用TIANprep Mini Plasmid Kit(TIANGEN)試劑盒提取測序結(jié)果正確的菌液質(zhì)粒。
表1 引物信息Table 1 Primer sequences information
參照栗赫銘等[39]提供的生物信息學(xué)方法,通過ProtParam(https://web.expasy.org/protparam/)預(yù)測蛋白分子量及理論等電點(diǎn)等。使用SMART(http://smart.embl-heidelberg.de/)進(jìn) 行 結(jié) 構(gòu) 域 分析。通過NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)進(jìn)行氨基酸序列分析。
利用E.Z.N.A.? Plant RNA Kit(OMEGA)試劑盒提取親和及不親和授粉后不同時(shí)間雌蕊,以及S13-bS13-b株系雄蕊、花萼、花瓣、柱頭、花柱及子房總RNA,使用TranScript One-Step gDNA Removal and cDNA Synthesis SuperMix(TransGen)合成cDNA。參照李晗等[40]的方法進(jìn)行qRT-PCR,使用Trans-Start?Top Green qPCR SuperMix(TRANS)試劑盒配制20 μL 反應(yīng)體系如下:TransStart Top Green qPCR SuperMix(2X) 10 μL,cDNA 1 μL,BoFER基因上游特異性引物0.4 μL,下游特異性引物0.4 μL(引物序列見表1),ddH2O 8.2 μL,通過LightCyker480Ⅱ(Roche)儀器進(jìn)行目的基因qRT-PCR 分析,程序設(shè)置:94 ℃預(yù)變性 30 s,94 ℃變性5 s,58 ℃退火30 s,40 個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)結(jié)束后采集熒光信號,所有循環(huán)結(jié)束后繪制熔解曲線。每個(gè)樣品進(jìn)行3 次技術(shù)重復(fù)。BoACTIN基因作為內(nèi)參基因[41],通過比值分析方法計(jì)算目的基因相對表達(dá)量。
將BoFER-KD 的序列構(gòu)建到pGADT7(激活域,AD)表達(dá)載體上(見表1)。將BoSRK13-b-KD、Bo-MLPK 及Bo-ARC1 的ORF 序 列 構(gòu) 建 到pGBKT7(DNA 結(jié)合域,BD)表達(dá)載體上,根據(jù)酵母轉(zhuǎn)化手冊將重組的AD 和BD 質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化到酵母菌株Y2HGold 中,共轉(zhuǎn)化質(zhì)粒組合(見表2)。將酵母轉(zhuǎn)化子涂布到SD/-Leu-Trp 缺陷型平板上進(jìn)行培養(yǎng)2~3 d。挑取單個(gè)酵母菌落加入到含5 mL SD/-Leu-Trp 缺陷型液體培養(yǎng)基中,220 r·min-1培養(yǎng)1 d 后,取5 μL 培養(yǎng)液滴加在SD/-Leu-Trp 和SD/-Leu-Trp-His+x-α-gal 缺陷型平板上進(jìn)行培養(yǎng)。利用含有3-氨基-1,2,4-三唑(3-AT)的SD/-Leu-Trp-His缺陷型平板對自激活試驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證。
表2 BoFER酵母共轉(zhuǎn)化質(zhì)粒組合Table 2 Combination of BoFER yeast co-transformation plasmids
以羽衣甘藍(lán)S13-bS13-b株系柱頭cDNA 為模板,通過RT-PCR 克隆得到BoFER(見圖1),通過測序結(jié)果發(fā)現(xiàn)BoFER大小為2 682 bp,編碼893 個(gè)氨基酸(見圖2)。BoFER蛋白分子質(zhì)量大小為97.25 kDa,等電點(diǎn)為5.89。通過SMART 數(shù)據(jù)庫分析,BoFER蛋白結(jié)構(gòu)域主要由信號肽區(qū)域、Malectin-like 區(qū)域、跨膜螺旋區(qū)域、Ser/Thr激酶結(jié)構(gòu)域及低成分復(fù)雜區(qū)組成(見圖3)。從NCBI數(shù)據(jù)庫中檢索出油菜(Brassica napus)、白菜(B.rapa)、擬南芥的FER 氨基酸序列,與BoFER 進(jìn)行序列相似度分析發(fā)現(xiàn),與油菜BnFER 序列相似度達(dá)98.5%,與白菜BrFER序列相似度達(dá)96.5%,與擬南芥AtFER序列相似度達(dá)81.3%,且BoFER 激酶結(jié)構(gòu)域及Ser/Thr 激酶結(jié)合位點(diǎn)高度保守(見圖4)。
圖1 羽衣甘藍(lán)BoFER的RT-PCR擴(kuò)增結(jié)果Fig.1 Results of RT-PCR amplification product of BoFER
圖2 BoFER核苷酸及氨基酸序列Fig.2 The nucleotide and amino acid sequences of BoFER
對羽衣甘藍(lán)S13-bS13-b株系的萼片、花瓣、花藥、柱頭、花柱及子房中的BoFER的表達(dá)量進(jìn)行qRTPCR 分析。結(jié)果表明,BoFER在被測組織中均有表達(dá),在柱頭中表達(dá)水平最高,顯著高于在其他被測組織中的表達(dá)水平,在花藥中表達(dá)水平最低(見圖5)。
圖5 BoFER在花器官中表達(dá)分析***.P<0.001.Fig.5 BoFER expression analysis in floral organ
對S13-bS13-b株系進(jìn)行親和及不親和授粉,選取親和及不親和授粉后0、30、60 min 的雌蕊,對BoFER的表達(dá)量進(jìn)行qRT-PCR 分析。結(jié)果表明,BoFER在親和及不親和授粉后的各檢測時(shí)間點(diǎn)均有表達(dá),在不親和授粉后表達(dá)水平逐漸升高,在不親和授粉后60 min 表達(dá)水平達(dá)到最高(見圖6A),BoFER在親和授粉后表達(dá)水平逐漸下降,在親和授粉后60 min表達(dá)水平達(dá)到最低(見圖6B)。
利用酵母雙雜交分析FER 激酶結(jié)構(gòu)域(BoFER-KD)與十字花科植物中自交不親和相關(guān)因子的相互作用,構(gòu)建酵母表達(dá)載體pGADT7-BoFER-KD 與pGBKT7-SRK13-b-KD、pGBKT7-MLPK及pGBKT7-ARC1。將被檢測質(zhì)粒組合pGADT7-BoFER-KD 與pGBKT7-SRK13-b-KD、pGBKT7-MLPK及pGBKT7-ARC1 分別共轉(zhuǎn)化至Y2HGold 酵母感受態(tài)細(xì)胞中,通過SD/-Trp-Leu 和SD/-Trp-Leu-His+x-α-gal+3mM 3-AT 缺陷型培養(yǎng)基平板中菌落生長狀態(tài),鑒定目的蛋白間相互作用情況。結(jié)果發(fā)現(xiàn)在SD/-Trp-Leu二缺平板上,陽性對照、陰性對照以及共轉(zhuǎn)化酵母生長良好,在SD/-Trp-Leu-His+x-αgal+3mM 3-AT 缺陷型培養(yǎng)基平板中,陽性對照生長且變藍(lán),陰性對照沒有生長,pGADT7-BoFERKD 與pGBKT7-SRK13-b-KD 的組合生長且變藍(lán),pGADT7-BoFER-KD 與pGBKT7-MLPK 和pGBKT7-ARC1 的組合沒有生長(見圖7)。這些結(jié)果表明,BoFER-KD 與BoSRK13-b-KD 存在相互作用,BoFERKD與BoMLPK、BoARC1不存在相互作用。
圖7 BoFER與BoSRK相互作用分析Fig.7 Protein interaction analysis between BoFER and BoSRK
本研究從羽衣甘藍(lán)自交不親和系(S13-bS13-b)中分離出BoFER基因。其開放閱讀框大小為2 682 bp,編碼含有893 個(gè)氨基酸殘基的蛋白質(zhì)。BoFER 蛋白由信號肽結(jié)構(gòu)域、Malectin-like 結(jié)構(gòu)域、跨膜螺旋結(jié)構(gòu)域、Ser/Thr 激酶結(jié)構(gòu)域及低成分復(fù)雜區(qū)組成。對BoFER 氨基酸序列進(jìn)行比對分析發(fā)現(xiàn),與油菜BnFER 序列相似度達(dá)98.5%,與白菜BrFER序列相似度達(dá)96.5%,與擬南芥AtFER序列相似度81.3%,這表明BoFER序列高度保守。
分析羽衣甘藍(lán)BoFER的組織表達(dá)特性發(fā)現(xiàn)其在萼片、花瓣、花藥、柱頭、花柱及子房組織中均有表達(dá),且在柱頭中的表達(dá)量要顯著高于在其他花器官中的表達(dá)量,這個(gè)結(jié)果表明BoFER可能在柱頭中發(fā)揮著重要作用。Duan等[34]發(fā)現(xiàn)擬南芥FER是花粉管穿透柱頭乳突細(xì)胞,最終進(jìn)入配子體完成生殖過程的重要調(diào)控因子。本研究進(jìn)一步對羽衣甘藍(lán)BoFER在授粉過程中的表達(dá)模式進(jìn)行研究,結(jié)果顯示BoFER在親和及不親和授粉后的各時(shí)間點(diǎn)均有表達(dá),在不親和授粉后表達(dá)水平逐漸升高,而在親和授粉后其表達(dá)水平逐漸下降,表明BoFER可能在羽衣甘藍(lán)親和授粉及不親和授粉中發(fā)揮作用。Zhang 等[6]研究發(fā)現(xiàn),在白菜中,對BrFER的研究也有類似的表達(dá)特性,BrFER的表達(dá)水平下降,能夠打破自交不親和反應(yīng),促進(jìn)親和授粉花粉管的生長。說明BoFER可能在授粉中發(fā)揮重要作用。
為了進(jìn)一步研究BoFER 在自交不親和中的作用,通過酵母雙雜交技術(shù)研究了BoFER-KD 與已知自交不親和相關(guān)因子的相互作用關(guān)系,發(fā)現(xiàn)BoFER-KD 與BoMLPK、BoARC1 不存在相互作用,與BoSRK13-b-KD 存在相互作用,表明BoFER 可能通過與BoSRK13-b的相互作用來參與自交不親和反應(yīng)。在白菜中也發(fā)現(xiàn)了BrFER1-KD與BrSRK46-KD的相互作用關(guān)系,BrSRK 通過招募BrFER,增加柱頭中ROS 含量,排斥自身花粉,也排斥種間花粉[37]。
本研究中對羽衣甘藍(lán)BoFER基因進(jìn)行克隆,序列分析及蛋白結(jié)構(gòu)分析,同時(shí)分析了該基因的組織表達(dá)特異性和在授粉過程中的表達(dá)模式,并通過酵母雙雜交鑒定BoFER 與其他自交不親和相關(guān)因子的相互作用。不僅豐富了對蕓薹屬植物BoFER 的認(rèn)識,而且為進(jìn)一步探討B(tài)oFER 與BoSRK13-b間的相互作用以及BoFER 的生物學(xué)功能奠定了基礎(chǔ)。這將為更好地開發(fā)植物授粉過程所依賴的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑提供線索,為未來作物育種提供重要的分子育種策略。