摘要:為明確寧夏小麥品種(系)對小麥條銹病和赤霉病的抗病水平,采用與已知抗病基因緊密連鎖的特異性標(biāo)記法對48份小麥材料進行分子標(biāo)記檢測,并對供試小麥品種(系)進行系譜分析。通過對抗條銹病和抗赤霉病典型代表基因Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26、Yr30和Fhb1進行檢測,并對其在寧夏小麥中的分布頻率進行分析。結(jié)果表明,在48份參試品種(系)中,分別含有Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26、Yr30抗性基因的小麥材料有41、15、5、16、20、45、26份,占供試材料的85%、31%、1%、33%、41%、93%、54%;在所測的小麥品系中有42份供試材料攜帶Fhb1基因,占供試材料的87%。本研究,通過選用中國寧夏48份典型小麥品種(系)進行抗條銹病和赤霉病的分子標(biāo)記檢測,為作物育種和遺傳研究提供有效遺傳信息。
關(guān)鍵詞:小麥;條銹??;分子標(biāo)記;基因檢測;種質(zhì)資源;抗性評價
中圖分類號:S435.121.4+2 文獻標(biāo)志碼:A
文章編號:1002-1302(2024)18-0154-06
收稿日期:2023-10-31
基金項目:華北作物改良與調(diào)控國家重點實驗室、河北農(nóng)業(yè)大學(xué)引進人才項目(編號:NCCIR2021RC-6)。
作者簡介:刁文達(1999—),男,河北邢臺人,碩士研究生,從事玉米、小麥抗病性研究。E-mail:d16632233175@163.com。
通信作者:亢 玲,從事小麥抗病性研究,E-mail:kangling1005@163.com;閆曉翠,講師,主要從事玉米、小麥抗病遺傳育種,E-mail:yxc1234jy@163.com。
小麥(Triticum aestivum L.)是我國重要的糧食作物,對我國糧食的供給作出了重大貢獻[1]。而小麥條銹病是世界上影響范圍zsx+9fWw+SUeXo6v7PRE8RA8MXn+BRvdZJ3QSgZwCrI=較大的小麥病害之一,也是寧夏小麥產(chǎn)區(qū)主要病害之一,每年都會對寧夏小麥的產(chǎn)量造成嚴(yán)重損失,因此對寧夏小麥產(chǎn)區(qū)的遺傳多樣性進行分析,并為小麥抗病育種提供一些參考價值。小麥條銹病是一種由小麥條銹菌(Puccinia striiformis f. sp. tririci)引起的氣傳性真菌類病害,它的變異類型較多,分布范圍較廣,可降低感病品種的籽粒數(shù)量和品質(zhì),進而使產(chǎn)量減少40%[2-4]。小麥條銹病病原體可在種植季節(jié)的大部分生長階段都感染小麥植株,主要是降低小麥的光合效率,進而導(dǎo)致植物有機物的合成減少。此外,赤霉病隨氣候的變化也對小麥的產(chǎn)量造成了嚴(yán)重影響。至目前為止,小麥赤霉病常發(fā)區(qū)已擴展到我國黃淮海南部麥區(qū),且西北麥區(qū)也已日益加重,該病害已成為我國小麥產(chǎn)區(qū)常發(fā)性的重大小麥病害。已有研究人員發(fā)現(xiàn),來源于望水白的Fhb1是目前抗性最高且應(yīng)用廣泛的抗赤霉病基因。利用已知分子標(biāo)記對抗赤霉病基因Fhb1進行快速檢測,從而篩選出獲得小麥抗赤霉病的種質(zhì)資源,為小麥抗赤霉病育種選擇提供依據(jù),但當(dāng)前抗病資源匱乏、抗性遺傳基礎(chǔ)狹窄是我國小麥在抗病育種中面臨的主要問題[5-6]。要解決以上問題,必須發(fā)掘新的抗病種質(zhì),挖掘新的抗病基因,才能豐富其遺傳多樣性[7]。然而,噴施農(nóng)藥對小麥條銹病和赤霉病進行防治,盡管能夠達到一定的控制效果,但它的成本昂貴,而且還會對生態(tài)環(huán)境造成影響,而使用抗銹品種是減少各種作物病害損害的最經(jīng)濟和有效的方法[8-9]。
自20世紀(jì)50年代條銹病廣泛流行以來,我國對該病的流行和管理進行了廣泛的研究。小麥的病害防治對于小麥的產(chǎn)量來說至關(guān)重要,迄今,在國際上以Yr系統(tǒng)正式命名的主效抗條銹病基因共有84個位點,即Yr1~Yr84[10-11];其中大多數(shù)在小麥的所有生長階段對葉銹病都有效,在苗期很容易被識別,這被稱為全生育期抗性(all stage resistance,簡稱ASR),這種類型的抗性通常由1個在幼苗期開始表達的單一基因控制(幼苗抗性)。然而,一些Lr基因通常在成株期階段表達,這種類型的抗性被稱為成株植物抗性(adult plant resistance,簡稱APR),進一步分為小種?;禺愋院头切》N?;禺愋?種類型[12-13]。由于小麥的抗病基因?qū)ζ贩N小種的?;院軓?,在生產(chǎn)上使用的抗病基因很容易隨著毒力的頻繁變化而失去抗性[14-16]。由于小麥可以在不同的地理和氣候條件下種植,銹病病原體在不同的環(huán)境條件下也展現(xiàn)了增強的適應(yīng)能力。如果氣候條件適合銹病,并在大面積內(nèi)種植單一抗性小麥品種,這些品種便可以產(chǎn)生抗性。
本研究利用分子標(biāo)記檢測和系譜分析方法對48份供試材料進行抗病基因篩選,其目的是通過分子標(biāo)記診斷和家系分析來鑒定小麥品種(系)和改良種質(zhì)的抗性。了解這些小麥品種(系)的抗性,挖掘新的抗性種質(zhì)資源,對我國小麥抗銹性育種的篩選具有重要價值。
1 試驗材料與方法
1.1 試驗材料
48份供試寧夏小麥材料(表1)(感條銹病的對照品種Avocet S、感赤霉病對照品種Tatara以及含有已知抗赤霉病基因的品種Yr27),由寧夏農(nóng)林科學(xué)院農(nóng)作物研究所提供。已知條銹病抗性基因陽性對照材料包括Yr5(T.spelta Album)、Avocet S*6/Yr9、Avocet S*6/Yr10/6、Avocet S*6/Yr15/6、Avocet S*6/Yr18、Avocet S*6/Yr26、Yr30(Opata85)、Avocet S;鄭州5389作為陰性對照材料;赤霉病以Tatara品種為陽性對照、鄭州5389為陰性對照。條銹病和赤霉病分子標(biāo)記檢測于2022—2023年間在河北農(nóng)業(yè)大學(xué)華北作物種質(zhì)資源研究與利用省部共建教育部重點實驗室完成。
1.2 小麥基因組DNA的提取與分子檢測
將供試小麥材料種植于育苗盤內(nèi),以營養(yǎng)土和蛭石3∶1的比例進行種植,播種20~25粒/盆飽滿的種子,覆土,在底部澆水,使其吸收并直至土壤濕潤移出,放到22~25 ℃室內(nèi)培養(yǎng)6~8 d,待用。待幼苗長到3葉期時用CTAB法提取基因組DNA[17],然后進行Yr基因檢測,用于檢測分子標(biāo)記引物,該引物由北京擎科生物科技股份有限公司合成(表2)。
1.3 PCR擴增
選取國際上主效抗條銹病基因Yr5[18]、Yr9[19]、Yr10[20]、Yr15[21]、Yr18[22]、Yr26[23]、Yr30[24]以及抗赤霉病基因Fhb1[25]共8個緊密連鎖分子標(biāo)記,對所供試的48份小麥材料進行鑒定。PCR擴增反應(yīng)體系:2×Taq Master Mix 10 μL;10 μmol/L上游特異引物 0.5 μL,終濃度為0.1~0.3 μmol/L;10 μmol/L下游特異引物0.5 μL,終濃度為0.1~0.3 μmol/L;模板DNA 2 μL;補水至20 μL。PCR擴增反應(yīng)程序:預(yù)變性95 ℃ 3 min;變性95 ℃ 15 s,退火55~62 ℃ 15 s,延伸 72 ℃ 15 s,35次循環(huán);延伸72 ℃ 5 min。
2 結(jié)果與分析
2.1 已知抗條銹病基因分子標(biāo)記檢測結(jié)果
48份供試材料是來自于寧夏小麥主產(chǎn)區(qū),所有供試材料可能攜帶的基因均列在表3。以感病材料Acocet S為陽性對照,對其供試材料的抗條銹病基因Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26、Yr30已知標(biāo)記檢測。結(jié)果(表3)顯示:以Avocet S為陽性對照,在寧春32號、寧春33號和寧春35號等41份材料中,均可以擴增出100 bp的目的條帶,表明這些材料中可能含有Yr5這個基因;Avocet S*6/Yr9為陽性對照,發(fā)現(xiàn)在15份小麥材料可以擴增出1 500 bp的抗條銹病基因Yr9目的條帶(圖1),說明這些供試材料中均攜帶有Yr9;寧春33號、34號、35號、36號和寧春39號5份材料中鑒定出含有Yr10,且目的條帶為543 bp的條帶;以Avocet S*6/Yr15為陽性對照,在寧春32號、隴春7號和春山4號等16份供試材料中,可以擴增出與Yr15緊密連鎖的目的條帶190 bp,表明在這些材料中均攜帶有Yr15抗病基因;用Avocet S*6/Yr18為陽性對照,在寧春32號、33號和寧春44號等20份小麥材料中,均可以擴增出150 bp的Yr18目的條帶(圖2),這表明這21份供試小麥材料中含有Yr18抗病基因;同理,以AvocetS*6/Yr26為陽性對照,在春山1號、索諾拉64和隴春7號等45份材料,均攜帶有抗條銹病基因Yr26(圖3);索諾拉64、隴春7號和寧春44號等26份材料,均含有抗條銹病基因Yr30(圖4)。此外,分別對這8個已知廣譜抗條銹病基因在所有供試小麥材料中進行占比分析,結(jié)果表明:其攜帶有抗條銹病基因Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26、Yr30,分別占供試材料的85%、31%、1%、33%、41%、93%、54%。
2.2 抗赤霉病基因Fhb1的分子標(biāo)記檢測結(jié)果
對48份供試小麥品種(系)進一步利用抗赤霉病基因Fhb1的特異功能連鎖SSR標(biāo)記Xbarc147進行檢測,且以Tatara(攜帶Fhb1)為陽性對照;結(jié)果表明(圖5),48份供試小麥材料中可成功擴增出與Fhb1目的條帶(122 bp)相一致的材料有42份(如寧春34號、35號和寧春44號等),且占比達到87%。這表明在寧夏小麥材料中普遍攜帶有抗赤霉病基因,且對赤霉病有一定的抗性,為抗赤霉病遺傳育種的研究提供良好的供試材料。
3 討論
分子標(biāo)記為基因檢測提供了一種更有效和更經(jīng)濟的方法[26]。本研究使用已知抗病基因緊密連鎖標(biāo)記來檢測8個已知抗病基因在48份寧夏小麥種質(zhì)資源上的分布情況。結(jié)果顯示,在同一供試材料中可能均攜帶有2個以上抗病基因存在,其寧春38號中攜帶有抗條銹病基因Yr5和Yr15,該品種由永T2945與永1265(Veer后代)雜交,經(jīng)寧夏永寧縣
小麥育繁所育成,其具有良好的抗條銹病。至今,在國內(nèi)外Yr5和Yr15仍然是少有的幾乎對所有條銹病菌表現(xiàn)出廣譜抗性[27-28],且普遍應(yīng)用于西北(四川)和西南(寧夏)麥區(qū)的小麥育種中。Bastian材料中攜帶有抗葉銹病基因Lr26和抗赤霉病基因Fhb1,表明Bastian對葉銹病和赤霉病具有良好的抗性。寧春40號品種同時攜帶Yr5、Yr15、Yr26、Fhb1,該品種是寧夏大學(xué)以中寧58912和永1712進行雜交,采用雜交系譜法選育優(yōu)良單株,系統(tǒng)選育而成,高抗銹病。
目前我國在小麥21條染色體上已經(jīng)定位超過250個抗性位點[29-30],其中Fhb1是世界上公認的主效基因,這個基因已經(jīng)被克隆,這為利用該基因進行分子標(biāo)記輔助選擇提供了便利。本研究通過對48個供試小麥材料的遺傳分析,結(jié)果表明,這些標(biāo)記物穩(wěn)定,可用于基因檢測。在所有攜帶有抗條銹病基因分Yr5、Yr9、Yr10、Yr15、Yr18、Yr26和Yr30中,Yr26占比最大,說明Yr26作為抗銹病源仍廣泛用于生產(chǎn)品種中。但我們應(yīng)合理利用不同類型的抗性基因,發(fā)掘優(yōu)良抗源,為小麥抗病育種及病害精準(zhǔn)防控提供參考。
參考文獻:
[1]郭天財. 試論中國的小麥生產(chǎn)與國家糧食安全[C]//農(nóng)業(yè)科技創(chuàng)新與生產(chǎn)現(xiàn)代化學(xué)術(shù)研討會論文集.蘇州,2001:118-123.
[2]李振岐,商鴻生. 小麥銹病及其防治[M].上海:上海科學(xué)技術(shù)出版社,1989.
[3]黃 亮,劉太國,肖星芷,等. 中國79個小麥品種(系)抗條銹病評價及基因分子檢測[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2017,50(16):3122-3134.
[4]Wellings C R. Global status of stripe rust:a review of historical and current threats[J]. Euphytica,2011,179(1):129-141.
[5]GilliganC A. Sustainable agriculture and plant diseases:an epidemiological perspective[J]. Philosophical Transactions of the Royal Society of London(Series B:Biological Sciences),2008,363(1492):741-759.
[6]Thrall P H,Laine,A L,Ravensdale,M,et al. Rapid genetic change underpins antagonistic coevolution in a natural host-pathogen metapopulation[J]. Ecology Letters,2012,15(5):425-435.
[7]周 軍,李魁印,張 立,等. 242份小麥品種(系)成株期抗條銹病鑒定及分子標(biāo)記檢測[J]. 河南農(nóng)業(yè)科學(xué),2020,49(6):84-97.
[8]楊文香,劉大群. 小麥抗葉銹基因的定位及分子標(biāo)記研究進展[J]. 中國農(nóng)業(yè)科學(xué),2004,37(1):65-71.
[9]閆紅飛,楊文香,陳云芳,等. 偃麥草屬E染色體組特異SCAR標(biāo)記對Lr19的特異性和穩(wěn)定性研究[J]. 植物病理學(xué)報,2009,39(1):76-81.
[10]McIntosh R A,Hart G E,Gale M D. Catalogue of gene symbols for wheat:2021 supplement[J]. Annual Wheat Newsletter,2021,67:104-113.
[11]KlymiukV,Chawla H S,Wiebe K,et al. Discovery of stripe rust resistance with incomplete dominance in wild emmer wheat using bulked segregant analysis sequencing[J]. Communications Biology,2022,5(1):826.
[12]Wan A M,Chen X M,He Z H. Wheat stripe rust in China[J]. Australian Journal of Agricultural Research,2007,58(6):605.
[13]張海泉. 小麥抗白粉病分子育種研究進展[J]. 中國生態(tài)農(nóng)業(yè)學(xué)報,2008,16(4):1060-1066.
[14]詹海仙,暢志堅,楊足君,等. 小麥抗白粉病基因來源及抗性評價的研究進展[J]. 中國農(nóng)學(xué)通報,2010,26(10):42-46.
[15]李 欣,暢志堅,詹海仙,等. 小麥抗條銹病基因來源及染色體定位的研究進展[J]. 中國農(nóng)學(xué)通報,2015,31(5):92-95.
[16]曾慶東,沈川,袁鳳平,等. 小麥抗條銹病已知基因?qū)χ袊?dāng)前流行小種的有效性分析[J]. 植物病理學(xué)報,2015,45(6):641-650.
[17]徐如宏,任明見,思彬彬,等. 貴農(nóng)001中抗白粉病基因的RAPD標(biāo)記研究[J]. 山地農(nóng)業(yè)生物學(xué)報,2005,24(4):283-286.
[18]Smith P H,Hadfield J,Hart N J,et al. STS markers for the wheat yellow rust resistance gene Yr5 suggest a NBS-LRR-type resistance gene cluster[J]. Genome,2007,50(3):259-265.
[19]Francis H A,Leitch A R,Koebner R M D. Conversion of a RAPD-generated PCR product,containing a novel dispersed repetitive element,into a fast and robust assay for the presence of rye chromatin in wheat[J]. Theoretical and Applied Genetics,1995,90(5):636-642.
[20]Singh R,Datta D,Priyamvada,et al. A diagnostic PCR based assay for stripe rust resistance gene Yr10 in wheat[J]. Acta Phytopathologica et Entomologica Hungarica,2009,44(1):11-18.
[21]Peng J H,F(xiàn)ahima T,R?der M S,et al. Microsatellite high-density mapping of the stripe rust resistance gene YrH52 region on chromosome 1B and evaluation of its marker-assisted selection in the F2 generation in wild emmer wheat[J]. New Phytologist,2000,146(1):141-154.
[22]Lagudah E S,McFadden H,Singh R P,et al. Molecular genetic characterization of the Lr34/Yr18 slow rusting resistance gene region in wheat[J]. Theoretical and Applied Genetics,2006,114(1):21-30.
[23]Zeng Q D,Han D J,Wang Q L,et al. Stripe rust resistance and genes in Chinese wheat cultivars and breeding lines[J]. Euphytica,2014,196(2):271-284.
a19b963c2fc3320006079bd13a4fff77de650e56c509cf0b9908ae82664d12c3[24]張 悅. 中國小麥主產(chǎn)區(qū)305份品種抗條銹病評價及抗病基因分析[D]. 楊凌:西北農(nóng)林科技大學(xué),2022.
[25]Liu S X,Pumphrey M O,Gill B S,et al. Toward positional cloning of Fhb1,a major QTL for Fusarium head blight resistance in wheat[J]. Cereal Research Communications,2008,36(6):195-201.
[26]郭 瑞,姚維成,陳 琛,等. 鎮(zhèn)麥品種相關(guān)品質(zhì)性狀基因的分子標(biāo)記檢測分析[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)學(xué)報,2023,39(1):1-14.
[27]BuerstmayrH,Lemmens M,Hartl L,et al. Molecular mapping of QTLs for Fusarium head blight resistance in spring wheat. Ⅰ. Resistance to fungal spread (Type Ⅱ resistance)[J]. Theoretical and Applied Genetics,2002,104(1):84-91.
[28]Jia H Y,Zhou J Y,Xue S L,et al. A journey to understand wheat Fusarium head blight resistance in the Chinese wheat landrace Wangshuibai[J]. The Crop Journal,2018,6(1):48-59.
[29]Marchal C,Zhang J P,Zhang P,et al. BED-domain-containing immune receptors confer diverse resistance spectra to yellow rust[J]. Nature Plants,2018,4(9):662-668.
[30]Klymiuk V,Yaniv E,Huang L,et al. Cloning of the wheat Yr15 resistance gene sheds light on the plant tandem kinase-pseudokinase family[J]. Nature Communications,2018,9(1):3735.