摘""要:木薯花葉病毒病(cassava"mosaic"disease,"CMD)對我國和世界木薯生產(chǎn)造成嚴(yán)重威脅和危害,目前尚無有效防治方法且缺乏抗性材料,造成嚴(yán)重經(jīng)濟(jì)損失,被認(rèn)為是最有威脅性的病毒病之一,斯里蘭卡木薯花葉病毒(Sri"Lankan"cassava"mosaic"virus,"SLCMV)是引起木薯花葉病的主要病原之一。RNA沉默是植物和動物先天性的一種抗病毒免疫反應(yīng)機(jī)制,寄主轉(zhuǎn)錄后基因沉默(post"transcriptional"gene"silencing,"PTGS)是真核生物中一種保守的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制,也是重要的抗病毒免疫機(jī)制之一。寄主基因沉默抑制子(suppressor"of"gene"silencing"3,"SGS3)是PTGS通路的關(guān)鍵蛋白,在寄主抵御病毒侵染中發(fā)揮著關(guān)鍵作用。為抵御宿主這種免疫反應(yīng),病毒通常編碼病毒沉默抑制子(viral"suppressors"of"RNA"silencing,"VSRs)來抵御寄主PTGS的病毒防御機(jī)制,與寄主蛋白互作是沉默抑制子發(fā)揮作用的主要作用機(jī)制之一。為探究SLCMV"AC2是否通過與AtSGS3互作而抑制寄主PTGS的免疫功能,本研究采用酵母雙雜交技術(shù)(yeast"two"hybrid"system,"Y2H)和雙分子熒光互補(bǔ)技術(shù)(bimolecular"fluorescence"complementation,"BiFC)分析SLCMV"AC2與AtSGS3之間的相互作用。結(jié)果表明:SLCMV"AC2與AtSGS3蛋白在酵母細(xì)胞和植物體內(nèi)均存在相互作用的關(guān)系。亞細(xì)胞共定位研究進(jìn)一步證明SLCMV"AC2在與AtSGS3互作后,可與AtSGS3形成siRNA-body的RDR6發(fā)生共定位。這些結(jié)果表明SLCMV"AC2可能通過與siRNA-body互作而影響寄主自身免疫機(jī)制,提高病毒致病性,SLCMV"AC2與AtSGS3的互作可能是SLCMV侵染木薯導(dǎo)致花葉癥狀發(fā)生的分子基礎(chǔ)。該研究結(jié)果為后續(xù)深入解析SLCMV致病機(jī)理提供新的理論依據(jù)。
關(guān)鍵詞:斯里蘭卡木薯花葉病毒;SLCMV"AC2;AtSGS3;蛋白互作中圖分類號:Q71""""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
Interactions"Between"Sri"Lankan"cassava"mosaic"virus"AC2"and"AtSGS3"Proteins
LIU"Xueting1,2,"XIE"Qiuxian1,2,"LIU"Linyu1,2,"FU"Yan1,2,"ZHANG"Xiuchun2*,"REN"Yanli1*
1."School"of"Biological"and"Geographical"Sciences,"Yili"Normal"University,"Yining,"Xinjiang"835000,"China;"2."Institute"of"Tropical"Bioscience"and"Biotechnology,"Chinese"Academy"of"Tropical"Agricultural"Sciences,"Haikou,"Hainan"571101,"China
Abstract:"Cassava"mosaic"disease"(CMD)"poses"a"serious"threat"and"danger"to"cassava"production"in"China"and"the"world,"and"there"is"no"effective"control"method"andnbsp;lack"of"resistant"materials,"causing"serious"economic"losses,"and"is"considered"one"of"the"most"threatening"viral"diseases."Sri"Lankan"cassava"mosaic"virus"(SLCMV)"is"one"of"the"major"pathogens"causing"cassava"mosaic"disease."RNA"silencing"is"an"innate"antiviral"immune"response"mechanism"in"plants"and"animals,"and"post"transcriptional"gene"silencing"(PTGS)"is"a"conserved"gene"expression"regulatory"mechanism"in"eukaryotes,"and"is"one"of"the"important"antiviral"immune"mechanisms."Suppressor"of"gene"silencing"3"(SGS3)"is"a"key"protein"of"the"PTGS"pathway"and"plays"a"critical"role"in"host"defense"against"viral"invasion."To"counteract"this"host"immune"response,"viruses"usually"encode"viral"suppressors"of"RNA"silencing"(VSRs)"to"counteract"the"viral"defense"mechanism"of"host"PTGS,"and"interaction"with"host"proteins"is"one"of"the"main"mechanisms"of"action"for"the"silencing"suppressors"to"function."In"order"to"investigate"whether"SLCMV"AC2"inhibits"the"immune"function"of"host"PTGS"by"interacting"with"AtSGS3,"we"analyzed"the"immune"function"of"host"PTGS"by"using"yeast"two-hybrid"(Y2H)"system"and"bimolecular"fluorescence"complementation"(BiFC)"experiments,"to"analyze"the"interaction"between"AtSGS3"and"SLCMV"AC2."The"results"showed"that"SLCMV"AC2"interacted"with"AtSGS3"protein"in"both"yeast"cells"and"plants."In"subcellular"co-localization"experimental"studies,"we"further"demonstrated"that"SLCMV"AC2"could"co-localize"with"AtRDR6,"a"close"partner"of"AtSGS3,"after"interacting"with"AtSGS3."The"data"suggest"that"SLCMV"AC2"may"affect"the"host"autoimmune"mechanism"and"enhance"viral"pathogenicity"by"interacting"with"siRNA-body,"and"that"the"interaction"between"SLCMV"AC2"and"AtSGS3"may"be"the"molecular"basis"for"the"development"of"foliar"symptoms"in"SLCMV-infected"cassava,"and"the"results"of"this"study"would"provide"a"new"theoretical"basis"for"the"subsequent"in-depth"analysis"of"the"pathogenicity"mechanism"of"SLCMV.
Keywords:"Sri"Lankan"cassava"mosaic"virus"(SLCMV);"SLCMV"AC2;"AtSGS3;"protein"interaction
DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2024.07.003
RNA沉默,又被稱為RNA干擾(RNA"interfe re nce,"RNAi)是生物進(jìn)化過程中由雙鏈RNA誘發(fā)的、高度保守的、同源mRNA高效特異性降解的現(xiàn)象。寄主轉(zhuǎn)錄后基因沉默(post"transcriptional"gene"silencing,"PTGS)是真核生物中一種保守的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制,在很多生物學(xué)過程中發(fā)揮重要作用。植物通過PTGS增強(qiáng)寄主的防衛(wèi)反應(yīng),減少病毒的積累,從而減緩病毒的系統(tǒng)侵染,因此PTGS也是重要的抗病毒免疫機(jī)制之一[1-4]。在植物體內(nèi),PTGS包括起始階段、效應(yīng)階段和擴(kuò)增階段[5]。PTGS的起始階段是來源不同的雙鏈RNA(double-stranded"RNAs,"dsRNA)或者內(nèi)部折疊形成的局部dsRNA經(jīng)核酸酶RNase-Ⅲ家族的Dicer-like(簡稱DCL)切割產(chǎn)生19~25"nucleotide(nt)長的雙鏈小RNA(siRNA)。效應(yīng)階段則是產(chǎn)生的初級sRNA被Argonaute(AGO)蛋白結(jié)合形成RNA誘導(dǎo)沉默復(fù)合體(RNA-ind uced"silencing"complex,"RISC),并指導(dǎo)AGO蛋白專一地識別與其互補(bǔ)的RNA或DNA序列進(jìn)行切割或修飾。在效應(yīng)階段由AGOs切割產(chǎn)生的單鏈RNA會在植物體內(nèi)依賴RNA的RNA聚合酶(RNA"dependent"RNA"polymerases,"RDRs)的作用下轉(zhuǎn)變?yōu)閐sRNA,由DCL切割成雙鏈siRNAs,將沉默信號進(jìn)行放大則稱為擴(kuò)增階段。
研究表明,依賴RNA的RNA聚合酶6(RNA"dependent"RNA"polymerase"6,"RDR6)是合成dsRNA的關(guān)鍵酶,對多種病毒具有抗性。RDR6的沉默會導(dǎo)致中國小麥花葉病毒(Chinese"wheat"mosaic"virus,"CWMV)等多種病毒RNA的積累[6-9],因此在抗病毒沉默途徑中起著重要作用?;虺聊种谱?(suppressor"of"gene"silencing"3,"SGS3)在PTGS中的功能大多都與RDR6一同被鑒定出來,作為RDR6的輔助因子SGS3本身無法合成dsRNA,但當(dāng)與RDR6在細(xì)胞質(zhì)中形成小的、較為分散的焦點(diǎn)狀,被稱為siRNA-body的顆粒,可將植物體內(nèi)的單鏈小RNA(single"stranded"small"RNA,"ssRNA)招募到RDR6上,使其進(jìn)行dsRNA的合成。因此在植物的抗病毒沉默途徑中同樣起著重要作用,然而二者之間的動態(tài)平衡往往是由植物病毒或其他植物組分所操控的。例如,甘薯褪綠矮化病毒(Sweet"potato"chlorotic"stunt"virus,"SPCSV)所編碼的RNase3能夠與siRNA-body產(chǎn)生共定位,抑制RNAi及削弱植物的抗病毒防御[10],萵苣壞死黃色病毒(Lettuce"necrotic"yellows"virus,"LNYV)所編碼的P蛋白可通過在細(xì)胞質(zhì)中與siRNA-body發(fā)生相互作用從而抑制RNAi擴(kuò)增[11],車前草花葉病毒(Plantago"asiatica"mosaic"virus,"PlAMV)則通過編碼的TGBp1蛋白與siRNA-body發(fā)生互作從而抑制dsRNA和ta-siRNA的合成[12]。
斯里蘭卡木薯花葉病毒(Sri"Lankan"cassava"mosaic"virus,"SLCMV)是雙生病毒科(Geminiv iri dae)菜豆金黃花葉病毒屬(Begomovirus)木薯雙生病毒(Cassava"mosaic"virus,"CMV)的一個株系,是引發(fā)木薯花葉?。╟assava"mosaic"disease,"CMD)的主要病原物之一[13]。SLCMV基因組由DNA-A[包含6個基因:AV1(CP)、AV2、AC1、AC2、AC3、AC4]和DNA-B(包含2個基因:BV1、BC1)2個環(huán)狀單鏈DNA組分組成,是一個典型的雙組分單鏈DNA病毒,SLCMV編碼的AC2蛋白則是由DNA-A組分反義鏈編碼的轉(zhuǎn)錄激活因子[13-14]。病毒是專性寄生生物,擁有極小的基因組,因此編碼的蛋白大多數(shù)是多功能蛋白,研究表明東非木薯花葉喀麥隆病毒(East"African"cassava"mosaic"Cameroon"virus,"EACMCV)編碼的AC2蛋白不僅對基因的轉(zhuǎn)錄激活有著高度保守的作用,而且還是沉默抑制子,在病毒侵染過程中發(fā)揮著重要作用[15]。然而,SLCMV"AC2是否通過與寄主PTGS沉默抑制通路的關(guān)鍵蛋白SGS3互作進(jìn)而抵御寄主的自身免疫功能還未見相關(guān)報道。為研究SLCMV是否可能通過AC2蛋白與寄主因子SGS3和RDR6相互作用,而抑制寄主RNA沉默功能導(dǎo)致病毒致病性增強(qiáng),本研究利用酵母雙雜交(yeast"two-hybrid,"Y2H)、雙分子熒光互補(bǔ)(bimolecular"fluorescence"complementation,"BiFC)和亞細(xì)胞共定位實(shí)驗(yàn),對SLCMV"AC2蛋白與擬南芥SGS3(AtSGS3)之間的相互作用進(jìn)行研究,研究結(jié)果將為闡明木薯花葉病毒是如何調(diào)控RNA沉默的抗病毒防御功能的分子機(jī)理奠定基礎(chǔ)。
1.1""材料
本氏煙草(Nicotiana"benthamiana)種子、酵母表達(dá)載體pGADT7、pGBKT7、AD-T、BD-53、AD-PARN[16]、BD-SGS3[17]、植物表達(dá)載體pG1300-YN1、YC-SGS3、pZP-P19[17]和RDR6-RFP均為本實(shí)驗(yàn)室保存。
限制性內(nèi)切酶BamHⅠ、EcoRⅠ等工具酶購于寶日生物技術(shù)(北京)有限公司(TaKaRa);高效無縫克隆試劑盒購于莫納生物科技有限公司;瓊脂糖凝膠DNA試劑盒、瓊脂糖凝膠回收試劑盒購于上海易匯生物科技有限公司(OMEGA);大腸桿菌DH5α、酵母感受態(tài)AH109和農(nóng)桿菌感受態(tài)GV3101均購于上海唯地生物技術(shù)有限公司;質(zhì)粒小提中量試劑盒和DNA"Marker購于天根生化科技(北京)有限公司;LB培養(yǎng)基購于生工生物工程(上海)股份有限公司;SD/-Trp/-Leu、SD/-Trp/-Leu/-His/-Ade培養(yǎng)基均購于北京泛基諾科技有限公司;3-氨基-1,2,4-三唑(3-AT)購于北京啟研生物科技有限公司;卡那霉素(kana my cin)、利福平(rifampicin)購于北京索寶來科技有限公司。
1.2""方法
1.2.1""酵母表達(dá)載體BD-AC2的構(gòu)建""為構(gòu)建SLCMV"AC2蛋白含結(jié)合域的酵母表達(dá)載體BD-AC2,參考已報道的SLACMV序列(GenBank:"KT861468.1),人工合成兩端分別添加酵母獵物載體pGBKT7限制性核酸內(nèi)切酶EcoRⅠ和BamHⅠ位點(diǎn)兩側(cè)序列的目的片段Y2H-AC2。參照無縫克隆試劑盒說明書,將人工合成片段Y2H-AC2與經(jīng)限制性核酸內(nèi)切酶EcoRⅠ和BamHⅠ雙酶切后的pGBKT7載體連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,并涂布到含有50"ng/L卡那霉素的LB培養(yǎng)基中,將平板倒置于37"℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12"h。挑取3~5個單菌落,使用通用引物pGBKT7-F和pGBKT7-R(表1)進(jìn)行菌落PCR鑒定。PCR反應(yīng)體系:引物(10"μmol/L)各1"μL,2×Magic"Green"Taq"SuperMix10"μL,用ddH2O補(bǔ)充到20"μL。PCR反應(yīng)條件為:94"℃預(yù)變性5"min,94"℃變性30"s,56"℃退火30"s,72"℃延伸1"min,循環(huán)35次;最后72"℃徹底延伸10"min。挑取2個經(jīng)菌落PCR鑒定的陽性克隆,委托華大基因科技有限公司進(jìn)行測序鑒定。
1.2.2""熒光雙分子互補(bǔ)表達(dá)載體YN-AC2的構(gòu)建""為構(gòu)建SLCMV"AC2蛋白含綠色熒光蛋白N端序列的的BiFC載體YN-AC2,參考已報道的SLACMV序列(GenBank:"KT861468.1),人工合成兩端分別添加表達(dá)載體pG1300-YN1[17]限制性核酸內(nèi)切酶MluⅠ和KpnⅠ位點(diǎn)兩側(cè)序列的目的片段BiFC-AC2。參照無縫克隆試劑盒說明書將目的片段BiFC-AC2與經(jīng)限制性核酸內(nèi)切酶Mlu"I和Kpn"I進(jìn)行雙酶切后的pG1300-YN1進(jìn)行連接反應(yīng),連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞中,并涂布到含有50"ng/L卡那霉素的LB培養(yǎng)基中,將平板倒置于37"℃恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12"h。挑取3~5個單菌落進(jìn)行PCR檢測,使用AC2特異引物AC2-1F和AC2-390R(表1)進(jìn)行擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系與反應(yīng)條件與1.2.1中一致,挑取經(jīng)PCR鑒定為陽性的克隆委托深圳華大基因科技有限公司完成測序鑒定。
1.2.3""酵母自激活性鑒定""參照產(chǎn)品說明書將構(gòu)建成功的AC2酵母誘餌載體與酵母激活域表達(dá)載體pGADT7共同轉(zhuǎn)化AH109酵母感受態(tài)細(xì)胞,涂布于SD/-Leu/-Trp(SD-LW)培養(yǎng)基上,28"℃恒溫培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)48~96"h,挑取經(jīng)PCR鑒定陽性的單克隆菌落于25nbsp;μL無菌水中,重懸制成懸浮菌液,使用無菌水梯度稀釋成10倍、100倍、1000倍,各吸取2"μL接種于SD-LW培養(yǎng)基和SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade(SD-LWHA)缺陷培養(yǎng)基中,分別以AD-T與BD-Lam和AD-T與BD-53共轉(zhuǎn)化的酵母為陰性對照和陽性對照。共轉(zhuǎn)化成功的酵母單菌落進(jìn)行梯度稀釋后接種于固體培養(yǎng)基中,28"℃恒溫培養(yǎng)箱倒置培養(yǎng)3"d觀察并記錄生長情況。若酵母菌落僅在SD-LW培養(yǎng)基中能正常生長,而在SD-LWHA培養(yǎng)基中無法生長,則說明質(zhì)粒無自激活活性;若酵母菌落在SD-LW培養(yǎng)基和SD-LWHA培養(yǎng)基中均能正常生長,說明該酵母誘餌表達(dá)載體具有自激活活性。若有自激活活性,則采取在SD-LWHA缺陷型培養(yǎng)基中添加3-AT的方法進(jìn)行抑制,逐步增加3-AT的濃度,直至其在添加了該濃度3-AT的SD-LWHA培養(yǎng)基中菌落無法正常生長,則說明在該濃度的3-AT條件下BD-AC2自激活活性基本抑制,可作于后續(xù)點(diǎn)板3-AT添加的濃度。
1.2.4""酵母雙雜交研究SLCMV"AC2與AtSGS3蛋白互作""參照AH109"Chemically"Competent"Cell"產(chǎn)品說明書將SLCMV"AC2的誘餌質(zhì)粒和AtSGS3的激活域載體AD-SGS3共轉(zhuǎn)化到感受態(tài)酵母細(xì)胞中,重懸后的細(xì)胞懸液均勻涂布到SD-LW培養(yǎng)基中,倒置于28"℃恒溫培養(yǎng)箱培養(yǎng)48~96"h,待菌落長出后,挑取單克隆菌落分別使用誘餌載體和激活域載體的通用引物pGBKT7-F/"pGBKT7-R和pGADT7-F/pGADT7-R進(jìn)行PCR鑒定。鑒定正確的菌落梯度稀釋后各取2"μL不同濃度稀釋的菌液分別接種于SD-LW培養(yǎng)基和SD-LWHA培養(yǎng)基,置于28"℃恒溫培養(yǎng)箱,倒置培養(yǎng)3~5"d,觀察并記錄SLCMV"AC2與AtSGS3是否互作。
1.2.5""熒光雙分子互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證SLCMV"AC2與AtSGS3蛋白互作""參照GV3101"Chemically"Competent"Cell產(chǎn)品說明書將植物表達(dá)載體YN-AC2、YN-SGS3和pG1300-YN1轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞,轉(zhuǎn)化后的農(nóng)桿菌均勻涂布到含有相應(yīng)抗性的LB固體培養(yǎng)基上,28"℃倒置培養(yǎng)72~"90"h。使用槍頭挑取經(jīng)菌落PCR鑒定為陽性的單菌落到5"mL含有相應(yīng)抗生素的LB液體培養(yǎng)基中,置于28"℃"200"r/min恒溫?fù)u床震蕩培養(yǎng)過夜。菌液7000"r/min離心15"min后棄上清,并使用5"mL注射緩沖液重懸沉淀,充分旋渦震蕩均勻后將菌液濃度均稀釋至OD600為0.5。注射緩沖液配置:分別取2"mL"1"mol/L的MgCl2,2"mL"1"mol/L的2-嗎啉乙磺酸(MES)和200"μL"100"mg/ml的乙酰丁香酮(AS),最后用超純水定容到200"mL。稀釋后的菌液在室溫放置2~3"h后,等體積混勻用于注射生長旺盛的5~7葉期本生煙葉片。每個組合3個重復(fù),注射后的本生煙避光處理過夜,然后在正常條件下培養(yǎng)。2~3"d后,每個樣品取約1~2"cm2使用激光共聚焦顯微鏡(Olympus"FV3000)進(jìn)行觀察煙草細(xì)胞熒光情況并拍照,GFP激發(fā)光為488"nm。
1.2.6""SLCMV"AC2與AtSGS3形成的復(fù)合物和AtRDR6的亞細(xì)胞共定位""參照1.2.5中的實(shí)驗(yàn)方法將重組質(zhì)粒YN-AC2、YC-SGS3、RDR6-RFP與pZP-P19分別轉(zhuǎn)化農(nóng)桿菌感受態(tài),挑取經(jīng)PCR鑒定為陽性的單克隆菌落到含有相應(yīng)抗生素的培養(yǎng)基中培養(yǎng)。參照1.2.5中的配方配置注射緩沖液,使用注射緩沖液將菌液重懸并將OD600的值均一到0.5,將菌液OD600均為0.5的YN-AC2、YC-SGS3、RDR6-RFP與pZP-P19四種農(nóng)桿菌菌液以1∶1∶1∶1的比例混勻,室溫靜置2~3"h后注射本生煙,至少注射3片煙草葉片,避光條件下處理24"h,然后在正常條件下處理2~3"d。使用熒光共聚焦顯微鏡對煙草細(xì)胞熒光表達(dá)情況進(jìn)行觀察并拍照記錄,GFP激發(fā)光為488"nm,RFP激發(fā)光為546"nm。
2.1""酵母表達(dá)載體BD-AC2的構(gòu)建
使用pGBKT7載體通用引物對選取的4個大腸桿菌單克隆菌落進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測結(jié)果如圖1所示。不同BD-AC2單克隆菌落PCR產(chǎn)物的片段大小均在500~750"bp之間,與預(yù)期目的基因片段大小一致,4個菌落均為陽性克隆,其中2個陽性克隆的測序序列比對正確,表明酵母誘餌表達(dá)載體BD-AC2構(gòu)建成功。
2.2""熒光雙分子表達(dá)載體YN-AC2的構(gòu)建
使用SLCMV"AC2特異引物對選取的4個大腸桿菌單克隆菌落進(jìn)行擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物電泳結(jié)果如圖2所示。不同YN-AC2單克隆菌落PCR產(chǎn)物片段大小均約為250~500"bp,與預(yù)期目的基因片段大小一致,4個菌落均為陽性克隆,其中2個陽性克隆的測序序列比對正確,表明熒光雙分子表達(dá)載體YN-AC2構(gòu)建成功。
2.3""酵母自激活鑒定
酵母自激活驗(yàn)證結(jié)果如圖3所示,可以觀察到陽性對照在SD-LW二缺培養(yǎng)基和SD-LWHA四缺培養(yǎng)基中均能正常生長形成菌落,而陰性對照僅在SD-LW培養(yǎng)基中正常生長,表明該酵母雙雜交系統(tǒng)能有效檢驗(yàn)蛋白之間的互作。BD-AC2與pGADT7共轉(zhuǎn)化的菌株在SD-LW和SD-LWHA缺陷型培養(yǎng)基中均能正常生長,但在添加4"mmol/L"3-AT的SD-LWHA缺陷型培養(yǎng)基不能正常生長。
該結(jié)果表明BD-AC2質(zhì)粒具有自激活活性,即不與其他蛋白相互作用的條件下可激活下游基因的轉(zhuǎn)錄表達(dá),但4"mmol/L"3-AT可有效抑制BD-AC2的自激活活性。AD-SGS3與BD共轉(zhuǎn)化的酵母菌株僅在SD-LW二缺培養(yǎng)基中正常生長,在SD-LWHA四缺培養(yǎng)基中則無法正常生長,表明AD-SGS3質(zhì)粒不存在自激活活性,可直接用于后續(xù)酵母雙雜交實(shí)驗(yàn)。
2.4""SLCMV"AC2與AtSGS3互作的酵母雙雜交驗(yàn)證
SLCMV"AC2與AtSGS3互作的酵母雙雜交驗(yàn)證結(jié)果如圖4所示,所有共轉(zhuǎn)化的酵母在SD-LW缺陷型培養(yǎng)基中均能正常生長,但在添加4"mmol/L"3-AT的SD-LWHA缺陷型培養(yǎng)基中僅陽性對照及共轉(zhuǎn)化BD-AC2與AD-SGS3的酵母可正常生長,陰性對照及共轉(zhuǎn)化BD-AC2與AD-PARN的酵母無法正常生長。結(jié)果表明BD-AC2與AD-SGS3之間存在相互作用。
2.5""BiFC驗(yàn)證SLCMV"AC2與AtSGS3相互作用
剪取不同處理的本生煙葉片在激發(fā)光為488"nm條件下的激光共聚焦顯微鏡下觀察,觀察結(jié)果表明:YN-AC2與YC-SGS3共注射本生煙葉片可在激發(fā)光488"nm下恢復(fù)綠色熒光,而空載pG1300-YN1與YC-SGS3共同注射未見熒光恢復(fù)(圖5),進(jìn)一步驗(yàn)證了斯里蘭卡木薯花葉病毒AC2與AtSGS3之間的相互作用。
2.6""SLCMV"AC2與AtSGS3形成的復(fù)合物和RDR6的亞細(xì)胞共定位
為研究SLCMV"AC2與AtSGS3形成的復(fù)合物是否與AtRDR6在細(xì)胞內(nèi)共定位,將YN-AC2、YC-SGS3與攜帶RFP標(biāo)簽的重組質(zhì)粒RDR6-RFP和pZP-P19共注射本生煙。結(jié)果如圖6所示,與BiFC結(jié)果相同,SLCMV"AC2與AtSGS3在激發(fā)光488"nm下恢復(fù)綠色熒光,并且與激發(fā)光546"nm條件下RDR6-RFP表達(dá)的紅色熒光發(fā)生重合。該研究結(jié)果表明SLCMV"AC2與AtSGS3形成的復(fù)合物和AtRDR6在本生煙表皮細(xì)胞中共定位。
重組是許多病毒進(jìn)化的關(guān)鍵過程,尤其是對于基因組高度壓縮的雙生病毒,這導(dǎo)致病毒快速變異[18],木薯花葉病是一種高度復(fù)雜的疾病,這與木薯花葉病毒是典型的雙組分雙生病毒息息相關(guān)。PTGS是植物抗病毒防御天然機(jī)制,為了成功建立感染,在復(fù)制和基因表達(dá)過程中利用RNA的病毒必須克服宿主抗病毒沉默反應(yīng)。
病毒編碼的蛋白大多數(shù)是多功能蛋白,研究表明雙生病毒編碼的AC2蛋白不僅對基因的轉(zhuǎn)錄激活有著高度保守的作用,并且可能在病毒侵染過程中發(fā)揮著重要作用。SUNTER等[19]研究表明,雙生病毒編碼的AC2蛋白是反式激活晚期病毒基因AV1和BV1的病毒轉(zhuǎn)錄激活因子,近期也有研究表明ACMV的AC2反式激活幾個植物基因[20-21]。VANITHARANI等[15]研究表明印度木薯花葉病毒(Indian"cassava"mosaic"virus)編碼的AC2蛋白是病毒沉默抑制子,能抑制寄主
圖6""亞細(xì)胞共定位實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證SLCMV"AC2和SGS3與RDR6在煙草細(xì)胞核中的共定位
Fig."6""Subcellular"co-localization"experiment"to"verify"the"co-localization"of"SLCMV"AC2"and"SGS3"with"RDR6"in"tobacco"nucleus
PTGS對病毒的降解,提高病毒復(fù)制量和致病性;研究還發(fā)現(xiàn)EACMCV編碼的AC2與協(xié)同基因非洲木薯花葉病毒喀麥隆株(African"cassava"mosaic"virus,ACMV-[CM])編碼的AC4共同作用能夠抑制GFP誘導(dǎo)的PTGS,并消除與PTGS相關(guān)的siRNA,同時增加GFP"mRNA積累。SGS3不僅調(diào)控植物生長發(fā)育,還參與次級siRNA的產(chǎn)生并放大PTGS的沉默效應(yīng),在抗病毒過程中發(fā)揮重要作用,是寄主PTGS通路的關(guān)鍵蛋白。在抗病毒防御中SGS3的作用因病毒而異,如寄主SGS3被沉默或敲除后,馬鈴薯A病毒(Potato"virus"A,"PVA)、油菜花葉病毒(Oilseed"rape"mosaic"virus,"ORMV),蕪菁花葉病毒(Turnip"mosaic"virus,"TuMV)等的病毒積累量也隨之降低;而黃瓜花葉病毒(Cucumber"mosaic"virus,"CMV)則在SGS3被敲除后積累量大幅提高;蕪菁清脈病毒(Turnip"vein"clearing"virus,"TVCV)則基本不受SGS3表達(dá)量的影響[22]。研究報道,多種病毒的VSR已經(jīng)進(jìn)化出不同的機(jī)制來抑制SGS3的功能[23],如番茄黃葉卷曲病毒(Tomato"yellow"leaf"curl"virus,"TYLCV)編碼的V2蛋白通過直接競爭SGS3底物來抑制SGS3的RNA結(jié)合活性[24],車前草花葉病毒(Plantago"asiatica"mosaic"virus,"PlAMV)TGBp1蛋白直接通過與SGS3/RDR6相互作用并共同聚集來干擾dsRNA的合成[12]。然而長期以來的研究表明,與SGS3互作或促進(jìn)SGS3降解而抑制寄主PTGS的抗病毒免疫功能很可能是一種普遍存在的植物病毒侵染機(jī)制[23,"25-26],如NbCaM可與NbSGS3相互作用并通過自噬介導(dǎo)NbSGS3蛋白水平降解,從而起到RNA沉默抑制因子的作用并增強(qiáng)病毒感染[27];水稻條紋花葉病毒(Rice"stripe"mosaic"virus,"RSMV)編碼的P4可以與水稻內(nèi)源基因沉默抑制因子3(OsSGS3)相互作用,并通過泛素化和自噬通路促進(jìn)OsSGS3的降解[28]。然而SLCMV"AC2是否通過與寄主PTGS沉默抑制通路的關(guān)鍵蛋白SGS3互作進(jìn)而抵御寄主的自身免疫功能尚無相關(guān)報道,為探討SLCMV的植物病毒侵染機(jī)制,首先構(gòu)建BD-AC2酵母表達(dá)載體,與AD-SGS3共轉(zhuǎn)化酵母感受態(tài),酵母雙子雜交技術(shù)發(fā)現(xiàn)SLCMV"AC2蛋白能與SGS3發(fā)生蛋白的相互作用;然后本研究構(gòu)建YN-AC2熒光雙分子表達(dá)載體,與YC-SGS3表達(dá)載體的農(nóng)桿菌共注射并在煙草葉片中瞬時表達(dá),熒光雙分子實(shí)驗(yàn)中也驗(yàn)證了二者之間的互作。作為RDR6的輔助因子,SGS3在PTGS中的所有功能幾乎都是與RDR6一起被鑒定出來的,如rdr6或sgs3突變體對CMV的侵染超級敏感性并且能夠抑制GUS轉(zhuǎn)基因誘導(dǎo)的s-PTGS、rdr6或sgs3突變體能夠抑制雙生病毒誘導(dǎo)的基因沉默等;rdr6或sgs3突變體表現(xiàn)的發(fā)育畸形是由于抑制了TAS3的合成等。已有研究表明SGS3/RDR6介導(dǎo)的病毒siRNA擴(kuò)增在幾種病毒中發(fā)揮重要的抗病毒作用,如蕪菁皺縮病毒(Turnip"crinkle"virus,"TCV)[17],馬鈴薯A病毒(Potato"virus"A,"PVA)[25]、番茄帶狀斑點(diǎn)病毒(Tomato"zonate"spot"virus,"TZSV)[29]等。本研究結(jié)果表明SLCMV"AC2不僅與AtSGS3互作,并且形成的復(fù)合物與AtSGS3形成siRNA-body的RDR6發(fā)生共定位,因此推測AC2蛋白可能通過與AtSGS3互作影響siRNA-body的形成從而抑制寄主PTGS功能導(dǎo)致病毒致病性增強(qiáng)。
迄今,已從幾乎所有的真核生物病毒屬中鑒定出至少一種VSRs,通過干擾PTGS的各個步驟劫持或抑制抗病毒PTGS。已有研究表明SLCMV"AC4是病毒基因沉默的強(qiáng)抑制子,可通過抑制寄主RNA沉默誘導(dǎo)的PTGS通路提高致病性[15],在本研究中發(fā)現(xiàn)SLCMV"AC2可與AtSGS3存在相互作用,然而SLCMV"AC2是否發(fā)揮沉默抑制子的功能?SLCMV"AC2是否通過與寄主SGS3互作來對寄主行使PTGS病毒調(diào)控機(jī)制起負(fù)調(diào)控作用?以及具體相互作用機(jī)理尚不明確,這些問題還有待進(jìn)一步研究。
參考文獻(xiàn)
[1]"MUHAMMAD"T,"ZHANG"F,"ZHANG"Y,"LIANG"Y."RNA"interference:"a"natural"immune"system"of"plants"to"counteract"biotic"stressors[J]."Cells,"2019,"8(1):"38.
[2]"GUO"Z"X,"LI"Y,"DING"S"W."Small"RNA-based"antimicrobial"immunity[J]."Nature"Reviews"Immunology,"2019,"19(1):"31-44.
[3]"YANG"Z"R,"LI"Y."Dissection"of"RNAi-based"antiviral"immunity"in"plants[J]."Current"Opinion"in"Virology,"2018,"32:"88-99.
[4]"JIN"Y,"ZHAO"J"H,"GUO"H"S."Recent"advances"in"understanding"plant"antiviral"RNAi"and"viral"suppressors"of"RNAi[J]."Current"Opinion"in"Virology,"2021,"46:"65-72.
[5]"ROSA"C,"KUO"Y"W,"WURIYANGHAN"H,"FALK"B"W."RNA"interference"mechanisms"and"applications"in"plant"pathology[J]."Annual"Review"of"Phytopathology,"2018,"56(1):"581-610.
[6]"WANG"M,"LI"S"W,"YANG"H"F,"GAO"Z,"WU"C"G,"GUO"X"Q."Characterization"and"functional"analysis"of"GhRDR6,"a"novel"RDR6"gene"from"cotton"(Gossypium"hirsutum"L.)[J]."Bioscience"Reports,"2012,"32(2):"139-151.
[7]"ANDIKA"I"B,"SUN"L"Y,"XIANG"R,"LI"J"M,"CHEN"J"P."Root-specific"role"for"Nicotiana"benthamiana"RDR6"in"the"inhibition"of"Chinese"wheat"mosaic"virus"accumulation"at"higher"temperatures[J]."Molecular"Plant-Microbe"Interactions?,"2013,"26(10):"1165-1175.
[8]"HONG"W,"QIAN"D,"SUN"R"H,"JIANG"L,"WANG"Y,"WEI"C"H,"ZHANG"Z"K,"LI"Y."OsRDR6"plays"role"in"host"defense"against"double-stranded"RNA"virus,"Rice"dwarf"phytoreovirus[J]."Scientific"Reports,"2015,"5(1):"11324.
[9]"QU"F,"YE"X"H,"HOU"G"C,"SATO"S,"CLEMENTE"T"E,"MORRIS"T"J."RDR6"Has"a"broad-spectrum"but"temperature-dependent"antiviral"defense"role"in"Nicotiana"benthamiana[J]."Journal"of"Virology,"2005,"79(24):"15209-15217.
[10]"WEINHEIMER"I,"HAIKONEN"T,"ALA-POIKELA"M,"MOSER"M,"STRENG"J,"RAJAM?KI"M"L,"VALKONEN"J"P"T,"RUI"L."Viral"RNase3"co-localizesnbsp;and"interacts"with"the"antiviral"defense"protein"SGS3"in"plant"cells[J]."PLoS"One,"2016,"11(7):"e0159080.
[11]"MANN"K"S,"JOHNSON"K"N,"CARROLL"B"J,"DIETZGEN"R"G."Cytorhabdovirus"P"protein"suppresses"RISC-mediated"cleavage"and"RNA"silencing"amplification"in"planta[J]."Virology,"2016,"490:"27-40.
[12]"OKANO"Y,"SENSHU"H,"HASHIMOTO"M,"NERIYA"Y,"NETSU"O,nbsp;MINATO"N,"YOSHIDA"T,"MAEJIMA"K,"OSHIMA"K,"KOMATSU"K,"YAMAJI"Y,"NAMBA"S."In"planta"recognition"of"a"double-stranded"RNA"synthesis"protein"complex"by"a"potexviral"RNA"silencing"suppressor[J]."The"Plant"Cell,"2014,"26(5):"2168-2183.
[13]"PATIL"B"L,"FAUQUET"C"M."Cassava"mosaic"geminiviruses:"actual"knowledge"and"perspectives[J]."Molecular"Plant"Pathology,"2009,"10(5):"685-701.
[14]"REY"C,"VANDERSCHUREN"H."Cassava"mosaic"and"brown"streak"diseases:"current"perspectives"and"beyond[J]."Annual"Review"of"Virology,"2017,"4(1):"429-452.
[15]"VANITHARANI"R,"CHELLAPPAN"P,"PITA"J"S,"FAUQUET"C"M."Differential"roles"of"AC2"and"AC4"of"cassava"geminiviruses"in"mediating"synergism"and"suppression"of"posttranscriptional"gene"silencing[J]."Journal"of"Virology,"2004,"78(17):"9487-9498.
[16]"劉琳玉,"趙平娟,"符艷,"劉志盺,"任艷利,"張秀春."木薯花葉病毒AC4蛋白與AtPARN互作研究[J]."熱帶作物學(xué)報,""2024,""45(1):"197-204.LIU"L"Y,"ZHAO"P"J,"FU"Y,"LIU"Z"X,"REN"Y"L,"ZHANG"X"C."The"interaction"between"cassava"mosaic"virus"AC4"protein"and"AtPARN[J]."Chinese"Journal"of"Tropical"Crops,""2024,"45(1):"197-204."(in"Chinese)
[17]"LIU"L"Y,"WANG"H"Y,"FU"Y,"TANG"W,"ZHAO"P"J,"REN"Y"L,"LIU"Z"X,"WU"K"X,"ZHANG"X"C."Turnip"crinkle"virus-encoded"suppressor"of"RNA"silencing"interacts"with"Arabidopsis"SGS3"to"enhance"virus"infection[J]."Molecular"Plant"Pathology,"2023,"24(2):"154-166.
[18]"周雪平,"崔曉峰,"陶小榮."雙生病毒——一類值得重視的植物病毒[J]."植物病理學(xué)報,"2003(6):"487-492.ZHOU"X"P,"CUI"X"F,"TAO"X"R."Geminiviruses——an"emerging"threat"for"crop"production[J]."Acta"Phytopathologica"Sinica,"2003(6):"487-492."(in"Chinese)
[19]"SUNTER"G,"BISARO"D"M."Transactivation"of"geminivirus"AR1"and"BRI"gene"expression"by"the"viral"AL2"gene"product"occurs"at"the"leve1"of"transcription[J]."The"Plant"Cell,"1992,"4:"1321-1331.
[20]"TRINKS"D,"RAJESWARAN"R,"SHIVAPRASAD"P"V,"AKBERGENOV"R,"OAKELEY"E"J,"VELUTHAMBI"K,"HOHN"T,"POOGGIN"M"M."Suppression"of"RNA"silencing"by"a"geminivirus"nuclear"protein,"AC2,"correlates"with"transactivation"of"host"genes[J]."Journal"of"Virology,"2005,"79(4):"2517.
[21]"LACATUS"G,"SUNTER"G."Functional"analysis"of"bipartite"begomovirus"coat"protein"promoter"sequences[J]."Virology,"2008,"376(1):"79-89
[22]"CHEN"Q,"WANG"J,"HOU"M"S,"LIU"S"Y,"HUANG"J"Y,"CAI"L."BnSGS3"has"differential"effects"on"the"accumulation"of"CMV,"ORMV"and"TuMV"in"oilseed"rape[J]."Viruses,"2015,"7(8):"4169-4185.
[23]"CHENG"X"F,"WANG"A"M."The"potyvirus"silencing"suppressor"protein"VPg"mediates"degradation"of"SGS3"via"ubiquitination"and"autophagy"pathways[J]."Journal"of"Virology,"2017,"91(1):"e01478-16.
[24]"FUKUNAGA"R,"DOUDNA"J"A."dsRNA"with"5′"overhangs"contributes"to"endogenous"and"antiviral"RNA"silencing"pathways"in"plants[J]."The"EMBO"Journal,"2009,"28(5):"545-555.
[25]"RAJAM?KI"M"L,"STRENG"J,"VALKONEN"J"P"T."Silencing"suppressor"protein"VPg"of"a"potyvirus"interacts"with"the"plant"silencing-related"protein"SGS3[J]."Molecular"Plant-Mi crobe"Interactions?,"2014,"27(11):"1199-1210.
[26]"DU"Z"G,"XIAO"D"L,"WU"J"G,"JIA"D"S,"YUAN"Z"J,"LIU"Y,"HU"L"Y,"HAN"Z,"WEI"T"Y,"LIN"Q"Y,"WU"Z"J,"XIE"L"H."p2"of"Rice"stripe"virus"(RSV)"interacts"with"OsSGS3"and"is"a"silencing"suppressor:"p2"of"rice"stripe"virus"is"a"silencing"suppressor"interacting"with"OsSGS3[J]."Molecular"Plant"Pathology,"2011,"12(8):"808-814.
[27]"LI"F"F,"ZHAO"N,"LI"Z"H,"XU"X"B,"WANG"Y"Q,"YANG"X"L,"LIU"S"S,"WANG"A"M,"ZHOU"X"P."A"calmodulin-like"protein"suppresses"RNA"silencing"and"promotes"geminivirus"infection"by"degrading"SGS3"via"the"autophagy"pathway"in"Nicotiana"benthamiana[J]."PLoS"Pathogens,"2017,"13(2):"e1006213.
[28]"ZHANG"C,"CHEN"D,"YANG"G"Y,"YU"X"Y,"WU"J"G."Rice"stripe"mosaic"virus–encoded"P4"Is"a"weak"suppressor"of"viral"RNA"silencing"and"is"required"for"disease"symptom"development[J]."Molecular"Plant-Microbe"Interactions?,"2020,"33(3):"412-422.
[29]"CHEN"J"B,"ZHENG"L"M,"SHI"X"B,"ZHANG"S"B,"TAN"X"Q,"ZHAO"X"Y,"LU"B"X,"YE"Q,"MIAO"S"Y,"LIU"Y,"ZHANG"D"Y."The"nonstructural"protein"NSs"encoded"by"Tomato"zonate"spot"virus"suppresses"RNA"silencing"by"interacting"with"NbSGS3[J]."Molecular"Plant"Pathology,"2022,"23(5):"707-719.