国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

鉆喙蘭屬種質(zhì)資源鑒評與分子身份證構(gòu)建

2024-12-31 00:00:00肖文芳李佐陳和明呂復(fù)兵
熱帶作物學(xué)報(bào) 2024年7期

摘""要:鉆喙蘭屬為蘭科的一類附生型蘭花,具有較高的觀賞價(jià)值和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。本研究基于前期收集的鉆喙蘭屬3個(gè)常見種的10份不同種質(zhì)資源,采用熒光標(biāo)記毛細(xì)管電泳進(jìn)行等位變異檢測,篩選出21對SSR多態(tài)性引物,其中13對引物位點(diǎn)呈高多態(tài)性,共擴(kuò)增出47個(gè)等位基因,平均觀測等位基因數(shù)(Na)為2.238,平均有效等位基因數(shù)(Ne)為1.860。21個(gè)位點(diǎn)的觀測雜合度(Ho)為0~0.778,均值為0.421,期望雜合度(He)為0.148~0.574,均值僅0.340,Shannon指數(shù)(I)為0.096~0.987,均值為0.567。10份種質(zhì)的聚類結(jié)果和PCoA分析與傳統(tǒng)植物學(xué)分類一致,可將10份種質(zhì)按種劃分成3個(gè)類群。在此基礎(chǔ)上篩選出4對核心引物構(gòu)建每份種質(zhì)的分子身份證。本研究為后續(xù)鉆喙蘭屬種質(zhì)資源的收集保存、鑒評和開發(fā)利用奠定基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞:鉆喙蘭屬;SSR;分子身份證

中圖分類號:S682.31""""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A

Identification"of"Germplasm"Resources"and"Construction"of"Molecular"Identity"Card"for"Rhynchostylis

XIAO"Wenfang,"LI"Zuo,"CHEN"Heming,"LYU"Fubing*

Environmental"Horticulture"Research"Institute,"Guangdong"Academy"of"Agricultural"Sciences"/"Guangdong"Key"Lab"of"Ornamental"Plant"Germplasm"Innovation"and"Utilization,"Guangzhou,"Guangdong"510640,"China

Abstract:"Rhynchostylis"is"an"epiphytic"orchid"belonging"to"the"Orchidaceae"family."It"possesses"high"ornamental"and"economic"value."In"this"study,"based"on"the"collection"of"10"different"germplasm"resources"from"three"common"species"of"Rhynchostylis,"21"pairs"of"SSR"polymorphic"primers"were"selected"using"fluorescent-labeled"capillary"electrophoresis"for"allele"variation"detection."Among"them,"13"primer"pairs"exhibited"high"polymorphism,"resulting"in"a"total"of"47"amplified"alleles."The"average"number"of"observed"alleles"(Na)"was"2.238,"and"the"average"number"of"effective"alleles"(Ne)"was"1.860."The"observed"heterozygosity"(Ho)"of"the"21"loci"ranged"from"0"to"0.778,"with"a"mean"of"0.421,"while"the"expected"heterozygosity"(He)"ranged"from"0.148"to"0.574,"with"a"mean"of"only"0.340."The"Shannon"index"(I)"ranged"from"0.096"to"0.987,"with"a"mean"of"0.567."The"clustering"results"and"PCoA"analyses"of"the"10"germplasm"were"consistent"with"the"traditional"botanical"classification,"and"all"the"germplasm"could"be"classified"into"three"taxa"by"species."On"this"basis,"four"pairs"of"core"primers"were"selected"to"construct"a"molecular"ID"for"each"germplasm."This"study"lays"a"foundation"for"the"collection,"conservation,"identification,"development"and"utilization"of"the"germplasm"resources"of"Rhynchostylis.

Keywords:"Rhynchostylis;"SSR;"molecular"ID

DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2024.07.007

鉆喙蘭屬(Rhynchostylis"Blume)為蘭科、樹蘭亞科、萬代蘭族、指甲蘭亞族的一類單軸生長型附生蘭花,具花多且密的總狀花序,因此又得名狐貍尾蘭。該屬目前僅發(fā)現(xiàn)和鑒定5個(gè)原生種,包括鉆喙蘭(R."retusa)、海南鉆喙蘭(R."gigantea)、立梗狐尾蘭(R."coelestis)、R."rieferi和R."cymifera,主要分布于我國的云南省、貴州省、海南島,以及印度、斯里蘭卡和東南亞各國[1]。該屬植物株型緊湊、花繁色艷且絕大多數(shù)具濃烈芳香,栽培管理簡單,耐熱性強(qiáng),易雜交,具有較高的觀賞價(jià)值和開發(fā)應(yīng)用前景。從19世紀(jì)中葉開始,陸續(xù)有鉆喙蘭屬的種間雜交種、與近緣蘭科植物之間的屬間雜交種在英國皇家園藝學(xué)會(Royal"Horticultural"Society)登錄,截至2023年6月,登錄的鉆喙蘭屬原生種F1代雜交組合已達(dá)402個(gè)。泰國作為野生鉆喙蘭屬植物分布的中心地區(qū)之一,是最早開展鉆喙蘭屬植物育種、繁殖及栽培研究的國家之一,培育的品種在世界各地十分暢銷。我國最早于19世紀(jì)末20世紀(jì)初由臺灣企業(yè)從泰國引種栽培鉆喙蘭屬植物,并進(jìn)行育種和栽培的相關(guān)研究,目前已培育出四倍體海南鉆喙蘭等極具特色的新品種,成為國內(nèi)外各大蘭展的獲獎熱門品種[2]。但我國大陸地區(qū)的市場尚未打開,鉆喙蘭屬植物鮮為消費(fèi)者所知。

除傳統(tǒng)雜交育種工作外,鉆喙蘭屬植物的相關(guān)研究主要集中在組培快繁、栽培管理和野生資源分布及鑒定等方面[3-7],分子生物學(xué)方面僅有極少量利用不同分子標(biāo)記或簡化基因組測序針對單獨(dú)的種進(jìn)行遺傳多樣性等方面的分析。針對海南鉆喙蘭,目前僅利用SRAP標(biāo)記技術(shù)分析來自海南島22個(gè)居群地的144份野生資源的遺傳多樣性[8],發(fā)現(xiàn)海南鉆喙蘭的核型公式為2n=2x=36m+"2sm[9],并利用RT-PCR結(jié)合RACE技術(shù)從海南鉆喙蘭中分離得到2個(gè)僅在生殖器官中表達(dá)的B類MADS-box基因RgAP3和RgPI[10];針對鉆喙蘭,目前僅利用2個(gè)RAPD引物對包括鉆喙蘭在內(nèi)的9個(gè)不同的蘭科原生種進(jìn)行了遺傳相似性分析[11],利用13條RAPD引物和7條ISSR引物對采自印度7個(gè)不同地區(qū)的鉆喙蘭進(jìn)行遺傳多樣性分析[12],并利用ddRAD技術(shù)對包括鉆喙蘭在內(nèi)的4個(gè)蘭花原生種進(jìn)行簡化基因組測序和遺傳多樣性分析[13];針對立梗狐尾蘭構(gòu)建了包含10"600個(gè)BAC克隆的人工細(xì)菌染色體[14]以供后續(xù)進(jìn)行基因組結(jié)構(gòu)分析。

基于鉆喙蘭屬植物本身的優(yōu)良特性,及其與蝴蝶蘭(Phalaenopsis"Blume)、萬代蘭(Vanda)、指甲蘭(Aerides"falcata"Lindl.)等能夠進(jìn)行遠(yuǎn)緣雜交創(chuàng)制跨屬雜交新種質(zhì)的優(yōu)勢,近年來受到越來越多育種工作者的關(guān)注,急需系統(tǒng)性開展鉆喙蘭屬種質(zhì)資源的開發(fā)、保護(hù)、保存與鑒評工作。TP-M13-SSR(simple"sequence"repeat"with"tailed"primer"M13)技術(shù)結(jié)合了SSR分子標(biāo)記技術(shù)和熒光測序技術(shù),具有重復(fù)性高、結(jié)果準(zhǔn)確等優(yōu)點(diǎn),在較大程度上解決了傳統(tǒng)凝膠電泳分析通量較低、擴(kuò)增產(chǎn)物檢測流程繁瑣、數(shù)據(jù)記錄工作量大等一系列問題[15]。目前TP-M13-SSR已在茶花[16]、百合[17]、桂花[18]、荷花[19]等各類觀賞花卉的種質(zhì)資源鑒定和指紋圖譜構(gòu)建方面得到應(yīng)用,在蘭科植物中已成功應(yīng)用于蝴蝶蘭的突變體鑒定[20]、建蘭(Cymbidium"ensifolium)的核心種質(zhì)構(gòu)建[21]、石斛蘭(Dendrobium"Sw.)原生種的鑒評[22]等方面。

為充分保護(hù)和利用鉆喙蘭屬資源的多樣性,本研究利用自主開發(fā)的鉆喙蘭屬基因組SSR引物和蘭科通用SSR引物,對鉆喙蘭屬常見3個(gè)種的10份種質(zhì)資源進(jìn)行分析鑒評,從DNA水平揭示鉆喙蘭屬種質(zhì)資源的親緣關(guān)系,分析其遺傳多樣性并建立種質(zhì)資源的分子身份證,為鉆喙蘭屬種質(zhì)資源的保護(hù)及開發(fā)利用提供理論依據(jù)。

1""材料與方法

1.1""材料

供試品種為廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境園藝研究所收集保存的10份鉆喙蘭屬原生種資源,具體性狀信息見表1,均種植于廣東省農(nóng)業(yè)現(xiàn)代化科技示范區(qū)廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院環(huán)境園藝研究所溫室大棚內(nèi),于2020年5月采集根尖,于液氮中速凍15"min后放入超低溫冰箱,備用。

1.2""方法

根據(jù)簡化基因組信息開發(fā)篩選出12對鉆喙蘭屬內(nèi)和12對鉆喙蘭屬與蝴蝶蘭屬通用引物(待發(fā)表),在不同樣品中進(jìn)行單重PCR擴(kuò)增,反應(yīng)體系總體積為10"μL,其中含50"ng/μL"DNA模板1.2"μL,10×Buffer"Ⅰ緩沖液1.0"μL,5"U/μL的TaKaRa"HS"Taq酶0.1"μL,5"μmol/L的上下游引物各0.3"μL,2.5"mmol/L的dNTP"0.8"μL,5"μmol/L的TP-M13"0.5"μL,去離子水5.8"μL。反應(yīng)程序?yàn)椋?5"℃預(yù)變性5"min;95"℃變性30"s,60"℃退火30"s,72"℃延伸30"s,30個(gè)循環(huán);95"℃變性30"s,53"℃退火30"s,72"℃延伸30"s,10個(gè)循環(huán);60"℃,30"min。

在96孔板中,每孔加入篩選引物的擴(kuò)增產(chǎn)物1.0"μL,ROX-500分子量內(nèi)標(biāo)和甲酰胺混合液(0.5∶8.5)9"μL,95"℃變性3"min后,利用ABI"3730XL檢測儀進(jìn)行檢測,1"kV電壓進(jìn)樣10"s,電泳15"kV,30"min。將Data"Collection軟件收集的原始數(shù)據(jù)文件導(dǎo)入到GeneMapper"3.2軟件中進(jìn)行分析,將各峰值的位置與其泳道中的分子量內(nèi)標(biāo)予以比較,計(jì)算目標(biāo)DNA片段的準(zhǔn)確大小。各熒光標(biāo)記座位上獨(dú)立進(jìn)行3次重復(fù)的毛細(xì)管電泳檢測,取3次重復(fù)的平均值并四舍五入取整,作為試驗(yàn)材料在該座位上的數(shù)據(jù)。

1.3""數(shù)據(jù)處理

根據(jù)擴(kuò)增數(shù)據(jù)對10份鉆喙蘭屬種質(zhì)進(jìn)行遺傳多樣性分析。運(yùn)用GenAlEx"6.503軟件計(jì)算引物的等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Shannon指數(shù)(I)、觀測雜合度(Ho)和期望雜合度(He),并繪制PCoA圖,利用PowerMarker"V3.25軟件計(jì)算引物的多態(tài)性信息含量(PIC),利用NTSYS"2.10軟件進(jìn)行聚類作圖。并根據(jù)引物的PIC及其在鉆喙蘭屬內(nèi)不同種間的通用性篩選核心引物,構(gòu)建每份種質(zhì)的分子身份證。

2""結(jié)果與分析

2.1""鉆喙蘭屬種質(zhì)資源概述

鉆喙蘭屬目前已發(fā)現(xiàn)和鑒定的原生種共5個(gè),其中3個(gè)發(fā)現(xiàn)較早、分布廣泛、雜交利用率較高,3個(gè)種均已有雜交后代登錄,另2個(gè)原生種分布范圍狹窄、發(fā)現(xiàn)較晚,尚無育種利用和針對性研究。

2.1.1""海南鉆喙蘭(R."gigantea)""廣泛分布于中國海南島和中國黃海附近島嶼,緬甸仰光和東高附近以及北部的其他地方,泰國東部地區(qū)、西南地區(qū)的北碧府,新加坡及附近島嶼,老撾的萬象平原和波羅芬高地,柬埔寨的Camchay山,越南胡志明市和廣治省附近,婆羅洲,印度尼西亞的阿南巴斯島。該種的主要特點(diǎn):花序下垂;花較大,花朵平均直徑為3.4"cm;唇瓣片前部明顯3裂;距狹圓錐形,底端銳尖;蕊柱足不明顯;芳香;花期冬季到春季[23]。山采株的花色主要為白底紅點(diǎn)、白底紅粗斑及純白色變種。目前不同品系間已雜交選育出純紅色變形,且臺灣地區(qū)利用粗斑帶橙色的突變個(gè)體已選育出橙色海南鉆喙蘭,并利用橙色個(gè)體與白色變種進(jìn)行雜交選育偏綠色的海南鉆喙蘭。截至2023年6月,該種在英國皇家園藝學(xué)會登錄的雜交F1代有186個(gè),其中海南鉆喙蘭作為父本的有156個(gè),作為母本的有30個(gè),可見其作為父本的雜交育性顯著高于作為母本的雜交育性。

2.1.2""立梗狐尾蘭(R."coelestis)"nbsp;廣泛分布于泰國北部、東北部、西部、西南部的山區(qū)和巴蜀省的低海拔地區(qū),柬埔寨南部,越南大叻附近的山區(qū),老撾。該種的主要特點(diǎn):花序挺立斜生;花較小,花朵平均直徑為2.3"cm;唇瓣片前部明顯3裂;距狹圓錐形,底端銳尖下彎;蕊柱足明顯;芳香;花期春季到夏季[23]。山采株的花色為白底帶藍(lán)紫色暈、藍(lán)紫色唇瓣,也有白底帶紫紅色暈的變形和純白色的變形。目前中國臺灣地區(qū)利用多倍體育種技術(shù)已選育出四倍體的立梗藍(lán)狐尾。截至2023年4月,該種已在英國皇家園藝學(xué)會登錄的雜交F1代有174個(gè),其中立梗狐尾蘭作為母本的有137個(gè),作為父本的有37個(gè),其作為父本的雜交育性顯著高于作為母本的雜交育性。

2.1.3""鉆喙蘭(R."retusa)""廣泛分布于中國云南省西南部和貴州省,斯里蘭卡,印度北部和南部,泰國,馬來西亞,爪哇島,菲律賓呂宋島的巴丹省、布拉干省、甲米地和黎剎省。該種的主要特點(diǎn):花序下垂;花較小,花朵平均直徑為2.2"cm;唇瓣片不明顯3裂;距囊狀,兩側(cè)壓扁,底端鈍圓;蕊柱足明顯;無香或淡香;花期冬季到春季[23]。山采株的花色為白底紫紅點(diǎn),已選育出純白色變形。截至2023年4月,該種已在英國皇家園藝學(xué)會登錄的雜交F1代有46個(gè),其中鉆喙蘭作為母本的僅有2個(gè),作為父本的有44個(gè),其作為父本的雜交育性同樣顯著高于作為母本的雜交育性。

2.1.4""R."rieferi""僅分布于菲律賓。2009年發(fā)現(xiàn)并鑒定為鉆喙蘭屬新種,尚無育種利用等針對性的相關(guān)研究。該種的主要特點(diǎn):花序下垂;花較小;唇瓣狹窄且小,急劇上翹;距較短;芳香[24]。

2.1.5""R."cymifera""僅分布于印度西南部Nilambur的常綠森林中。2018年發(fā)現(xiàn)并鑒定為鉆喙蘭屬新種,尚無育種利用等針對性的相關(guān)研究。該種的主要特點(diǎn):花序下垂;花較小;斜菱形花瓣;方形漸變成倒卵形的唇瓣,先端微凹;長且尖的距;球形花粉塊;無香;花期春季到夏季[25]。

本研究共采用6個(gè)不同的海南鉆喙蘭原生種、3個(gè)不同的立梗狐尾蘭原生種和1個(gè)山采株色鉆喙蘭原生種,涵蓋鉆喙蘭屬常見3個(gè)種中目前發(fā)現(xiàn)和鑒定的所有變種和變型,具體性狀見表1。除花色外,海南鉆喙蘭與鉆喙蘭、立梗狐尾蘭最主要的性狀區(qū)別在于花梗的下垂與直立,而鉆喙蘭區(qū)別于海南鉆喙蘭和立梗狐尾蘭的性狀主要在于花香及花朵數(shù),鉆喙蘭基本無香但花朵數(shù)可多達(dá)百朵,海南鉆喙蘭和立梗狐尾蘭均具濃香但花朵數(shù)較少。

2.2""遺傳多樣性及聚類分析

采用自主開發(fā)的12對鉆喙蘭屬特異引物和12對鉆喙蘭屬與蝴蝶蘭屬通用引物,對來自3個(gè)種的10份鉆喙蘭屬種質(zhì)進(jìn)行檢測,其中3對引物擴(kuò)增后不具多態(tài)性,其余21對引物共擴(kuò)增出47個(gè)等位基因(表2),每對引物擴(kuò)增出1~3個(gè)等位基因,Na均值為2.238,Ne均值為1.860。24個(gè)位點(diǎn)的Ho為0~0.778,均值為0.421,He為0.148~"0.574,均值僅0.340,I介于0.096~0.987之間,均值為0.567,表明供試種質(zhì)的雜合程度極低,遺傳多樣性不高,這與供試種質(zhì)均為原生種或其變型和變種有關(guān)。21對引物中有13對引物位點(diǎn)呈高多態(tài)性(PICgt;0.5)[26],證明本研究所篩選出的多數(shù)引物適用于鉆喙蘭屬種質(zhì)鑒評。

根據(jù)Nei’s遺傳距離,對10份鉆喙蘭屬種質(zhì)資源構(gòu)建UPGMA遺傳關(guān)系聚類圖(圖1),如圖1所示,10份鉆喙蘭屬種質(zhì)被分為三大類,同一個(gè)種的種質(zhì)聚為一類,10份鉆喙蘭屬種質(zhì)的PCoA分析結(jié)果顯示,PCoA1和PCoA2分別占所有鉆喙蘭屬種質(zhì)總遺傳變異的32.63%和15.30%;PCoA分析同樣將10份種質(zhì)分為三大類,同一個(gè)種的種質(zhì)聚為一類(圖2)。聚類結(jié)果和PCoA分析結(jié)果與鉆喙蘭屬種質(zhì)植物學(xué)分類結(jié)果一致。

2.3""核心引物篩選及分子身份證構(gòu)建

根據(jù)引物多態(tài)性信息含量(PIC)及其在鉆喙蘭屬內(nèi)不同種間的通用性,從1對引物開始逐步增加引物數(shù)量篩選出可將供試種質(zhì)全部區(qū)分的引物組合,最終確定引物組合28-N1001301+2-"N10002234+43-N5725511能夠?qū)⑺袠悠穮^(qū)分開,但這3個(gè)引物的通用性均未達(dá)到100%,考慮到后續(xù)樣品的適用性,增加通用性100%的88-N1001036引物(PIC僅次于前3個(gè)引物)作為核心引物,最終確定28-N1001301+2-N10002234+"43-N5725511+8-N1001036作為今后鉆喙蘭屬種質(zhì)資源鑒定的核心引物組合,其他引物作為備選。

通過數(shù)據(jù)化編碼構(gòu)建鉆喙蘭屬種質(zhì)的分子身份證,其構(gòu)成包括2個(gè)部分。第1部分為前2位字母,表示物種信息,鉆喙蘭屬目前共5個(gè)種,包括海南鉆喙蘭(RG)、立梗狐尾蘭(RC)、鉆喙蘭(RR)、R."rieferi(RI)、R."cymifera(RC)。第2部分為后續(xù)的數(shù)字,代表4對核心引物擴(kuò)增結(jié)果,2-N10002234、28-N1001301、43-N5725511、88-N10010364的擴(kuò)增片段按分子量大小排列,從小到大以阿拉伯?dāng)?shù)字1~9標(biāo)注,若該位點(diǎn)在某個(gè)種質(zhì)中無擴(kuò)增則記為0,每個(gè)引物占2位。如R01海南鉆喙蘭(R."gigantea"‘Shen’s"Suns’)的分子身份證為RG00334411,RG代表其為海南鉆喙蘭這個(gè)種的種質(zhì)資源,00334411為其通過核心引物擴(kuò)增轉(zhuǎn)換而來的專屬編碼。最終構(gòu)建的10份鉆喙蘭屬種質(zhì)分子身份證代碼均不相同,能夠?qū)⑺蟹N質(zhì)區(qū)分開,并利用每個(gè)種質(zhì)資源的分子身份證編號,分別制作種質(zhì)特異的條形碼(圖1)。

3""討論

鉆喙蘭屬種質(zhì)資源雖不豐富,但作為蝴蝶蘭屬近緣物種,具有易雜交的特性,可與蝴蝶蘭進(jìn)行跨屬遠(yuǎn)緣雜交創(chuàng)制新種質(zhì)。因鉆喙蘭屬大多數(shù)種質(zhì)具濃香,可作為蝴蝶蘭新品種的香味性狀親本來源,目前鉆喙蘭屬常見3個(gè)種與蝴蝶蘭屬不同種質(zhì)均已有雜交新品種育成。且鉆喙蘭屬種質(zhì)具有蝴蝶蘭不具備的許多優(yōu)點(diǎn),如栽培管理簡單粗放、抗性強(qiáng),海南鉆喙蘭在廣東地區(qū)不用低溫催花可應(yīng)春節(jié)開花,因此鉆喙蘭屬種質(zhì)極具開發(fā)應(yīng)用潛力。雖然鉆喙蘭屬的育種工作起步較早,1825年已在野外發(fā)現(xiàn)鉆喙蘭這個(gè)原生種并命名,1935年在英國皇家園藝學(xué)會上登錄了第1個(gè)鉆喙蘭與鳳蝶蘭的跨屬雜交種Rhynchanthe"Bernardii,1970年在英國皇家園藝學(xué)會上登錄了第1個(gè)海南鉆喙蘭與鉆喙蘭間的種間雜交種R."Chorchalood,但與蝴蝶蘭屬、石斛屬、萬代蘭屬等其他大屬相比,其進(jìn)展緩慢,目前國內(nèi)外僅個(gè)別蘭場栽培了少量單株作為稀有資源進(jìn)行銷售,資源鑒評等相關(guān)研究相對十分匱乏,嚴(yán)重制約了鉆喙蘭屬種質(zhì)的保護(hù)和開發(fā)利用。

我國作為鉆喙蘭屬野生資源分布區(qū),海南島分布大量海南鉆喙蘭,而云南和貴州則分布有鉆喙蘭野生資源,但目前針對相關(guān)資源僅進(jìn)行了少量的分布調(diào)查[2,"7]、組培快繁和栽培管理[5-6,"27]等方面的簡單研究,資源鑒評方面僅利用SRAP標(biāo)記技術(shù)分析了來自海南島22個(gè)居群地144份野生資源的遺傳多樣性[7]。SSR分子標(biāo)記是國際植物新品種保護(hù)聯(lián)盟指定的構(gòu)建植物DNA指紋圖譜的首選方法[28],可檢測DNA序列的差異,穩(wěn)定性強(qiáng)、可重復(fù)性好,已廣泛應(yīng)用于蘭科植物的種質(zhì)鑒評[20-22,"29]。分子身份證是將目標(biāo)種質(zhì)的分子指紋圖譜進(jìn)行編碼,形成種質(zhì)對應(yīng)的特異編號儲存其身份信息,對于數(shù)字化管理種質(zhì)和鑒別具有重要作用,已在石斛蘭[22]、石蒜屬[30]等花卉中成功應(yīng)用。本研究基于自有資源圃收集保存的鉆喙蘭屬3個(gè)常見種的10份不同種質(zhì)資源,利用自主開發(fā)的SSR引物,對其進(jìn)行遺傳多樣性分析、親緣關(guān)系分析和分子身份證構(gòu)建。根據(jù)SSR分子標(biāo)記分析的遺傳距離系數(shù),利用UPGMA方法和PCoA分析可以將供試的10份鉆喙蘭屬種質(zhì)按照種劃分為3個(gè)類群,與傳統(tǒng)植物分類結(jié)果一致。根據(jù)引物多態(tài)性信息含量及其在鉆喙蘭屬內(nèi)不同種間的通用性篩選出的4對核心引物能夠?qū)?0份鉆喙蘭屬種質(zhì)完全區(qū)分開,為每份種質(zhì)建立了獨(dú)有的分子身份證。這充分說明本研究開發(fā)篩選的引物適用于鉆喙蘭屬種質(zhì)的鑒評,可用于野生資源的遺傳多樣性分析、品種資源的分類鑒定、資源圃的分類管理等,為今后鉆喙蘭屬種質(zhì)的收集保存和鑒定提供理論基礎(chǔ)。

參考文獻(xiàn)

[1]"OrchidWiz."OrchidWiz"Encyclopedia"7[Z]."OrchidWiz,"LLC."2020.

[2]"謝佩吾,"許傳輝."鉆喙蘭屬的原生種及主要栽培品種[J]."花木盆景(花卉園藝),"2017(10):"30-33.XIE"P"W,"XU"C"H."Species"and"main"cultivated"varieties"of"Rhynchostylis[J]."Flower"Plant"amp;"Penjing,"2017(10):"30-33."(in"Chinese)

[3]"KURNIASARI"D,"ASTUTI,"YULIANTI"E,"SUYITNO,"SUGIYARTO"L,"MERCURIANI"I"S."Increasing"Rhynchostylis"retusa’s"callus"formation"by"immersing"explant"in"ascorbic"acid"and"planting"on"activated"charcoal"contained"medium[J]."Journal"of"Physics"Conference"Series,"2019,"1241(1):"012060.

  • SAIKIA"P,"TALUKDAR"M"C,"DAS"P."Response"of"Rhynchostylis"retusa"L."to"mineral"nutrients"in"different"growing"supports[J]."Research"on"Crops,"2016,"17(3):"595-598.
  • 諶振,"黃明忠,"許敏,"黃素榮,"廖易,"楊光穗."不同類型栽培基質(zhì)對海南鉆喙蘭生長發(fā)育的影響[J]."中國農(nóng)學(xué)通報(bào),"2019,"35(22):"71-76.SHEN"Z,"HUANG"M"Z,"XU"M,"HUANG"S"R,"LIAO"Y,"YANG"G"S."Effects"of"different"matrixes"on"the"growth"and"development"ofnbsp;Rhynchostylis"gigantean[J]."Chinese"Agricultural"Science"Bulletin,"2019,"35(22):"71-76."(in"Chinese)

[6]"何虹穌,"楊福孫,"王存,"陳金花."菌磷互作對海南鉆喙蘭幼苗生長的影響[J]."云南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)),"2017,"32"("6):"1085-1091.HE"H"S,"YANG"F"S,"WANG"C,"CHEN"J"H."The"interaction"of"endophytic"fungi"and"different"phosphorus"levels"on"growth"of"Rhynchostylis"gigantea"seedlings[J]."Journal"of"Yunnan"Agricultural"University"(Natural"Science),"2017,"32(6):"1085-1091."(in"Chinese)

[7]"顏平,"黃明忠,"楊光穗,"唐燕瓊,"尹俊梅."海南鉆喙蘭種質(zhì)資源現(xiàn)狀調(diào)查[J]."廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),"2015,"42(5):"24-30.YAN"P,"HUANG"M"Z,"YANG"G"S,"TANG"Y"Q,"YIN"J"M."Investigation"of"Rhynchostylis"gigantea"(Lindley)"Ridlry"germplasm"resources"status[J]."Guangdong"Agricultural"Sciences,"2015,"42(5):"24-30."(in"Chinese)

[8]"顏平,"黃明忠,"陸順教,"楊光穗,"唐燕瓊,"尹俊梅."基于SRAP標(biāo)記的海南鉆喙蘭種質(zhì)資源遺傳多樣性分析[J]."熱帶作物學(xué)報(bào),"2014,"35(9):"1677-1682.YAN"P,"HUANG"M"Z,"LU"S"J,"YANG"G"S,"TANG"Y"Q,"YIN"J"M."Genetic"diversity"analysis"of"Rhynchostylis"gigantea"(Lindl.)"Ridl.’s"germplasm"resources"based"on"SRAP"markers[J]."Chinese"Journal"of"Tropical"Crops,"2014,"35(9):"1677-1682."(in"Chinese)

[9]"莫饒,"冷青云,"黃明忠,"彭彬,"唐燕瓊,"羅遠(yuǎn)華,"鄧小果."蘭科11屬14種植物核型分析[J]."云南植物研究,2009,"31(6):"504-508.MO"R,"LENG"Q"Y,"HUANG"M"Z,"PENG"B,"TANG"Y"Q,"LUO"Y"H,"DENG"X"G."A"karyological"study"of"fourteen"species"in"eleven"genera"of"the"Orchidaceae[J]."Acta"Botanica"Yunnanica,"2009,"31(6):"504-508."(in"Chinese)

[10]"張俊芳,"李志英,"徐立."海南鉆喙蘭B類MADS-box基因的克隆與表達(dá)分析[J]."分子植物育種,"2013,"11(4):"570-574.ZHANG"J"F,"LI"Z"Y,"XU"L."Cloning"and"expression"analysis"of"B"type"MADS-box"genes"involving"in"floral"development"from"Rhynchostylis"gigantea[J]."Molecular"Plant"Breeding,"2013,"11(4):"570-574."(in"Chinese)

[11]"JUNITA"K,"LILI"S,"EVY"Y,"HERU"N,"IXORA"S"M."Molecular"identification"of"several"orchid"species"based"on"OPA10"and"OPA18"RAPD"marker[J]."Journal"of"Physics"Conference"Series,"2019,"1397(1):"012042.

  • PARAB"G"V,"KRISHNAN"S."Assessment"of"genetic"variation"among"populations"of"Rhynchostylis"retusa,"an"epiphytic"orchid"from"Goa,"India"using"ISSR"and"RAPD"markers[J]."Indian"Journal"of"Biotechnology,"2009,"7(3):"313-319.
  • SUBHAS"C"R,"KAUSHIK"M,"DILIP"D"S."Assessment"of"genetic"diversity"among"four"orchids"based"on"ddRAD"sequencing"data"for"conservation"purposes[J]."Physiology"and"Molecular"Biology"of"Plants,"2017,"23(1):"169-183.
  • ATSUSHI"M,"MIKI"F,"SHAN"S"L,"GO"S,"MAKI"Y,"YASUHIKO"M."Molecular"cytogenetic"use"of"BAC"clones"in"Neofinetia"falcate"and"Rhynchostylis"coelestis[J]."Nucleus,"2015,"58(3):"207-210.
  • 李會勇,"王天宇,"黎裕,"石云素,"宋艷春,"陸平."TP-M13自動熒光檢測法在高粱SSR基因型鑒定中的應(yīng)用[J]."植物遺傳資源學(xué)報(bào),"2005,"6(1):"68-70.LI"H"Y,"WANG"T"Y,"LI"Y,"SHI"Y"S,"SONG"Y"C,"LU"P."Application"of"the"TP-M13"automated"fluorescent-lablled"system"of"SSR"genotyping"in"sorghum[J]."Journal"of"Plant"Genetic"Resources,"2005,"6(1):"68-70."(in"Chinese)
  • 陶乃奇,"張斌,"劉信凱,"周和達(dá),"鐘乃盛,"嚴(yán)丹峰,"張敏,"高繼銀,"張文駒."利用熒光標(biāo)記SSR鑒別21個(gè)茶花新品種[J]."植物學(xué)報(bào),"2019,"54(1):"37-45.TAO"N"Q,"ZHANG"B,"LIU"X"K,"ZHOU"H"D,"ZHONG"N"S,"YAN"D"F,"ZHANG"M,"GAO"J"Y,"ZHANG"W"J."Identification"of"21"new"Camellia"hybrid"varieties"by"fluorescence-labelled"simple"sequence"repeat"markers[J]."Chinese"Bulletin"of"Botany,"2019,"54(1):"37-45."(in"Chinese)
  • 周俐宏,"石慧,"王志剛,"蔡忠杰."百合熒光SSR標(biāo)記體系構(gòu)建及引物篩選[J]."遼寧農(nóng)業(yè)科學(xué),"2019(5):"1-6.ZHOU"L"H,"SHI"H,"WANG"Z"G,"CAI"Z"J."Optimization"and"primers"screening"of"fluorescent"labeled"SSR-PCR"reaction"system"for"Lily[J]."Liaoning"Agricultural"Sciences,"2019(5):"1-6."(in"Chinese)
  • 段一凡,"王賢榮,"梁麗麗,"李雪霞,"向其柏."桂花品種SSR熒光指紋圖譜的構(gòu)建[J]."南京林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版),"2014,"38(增刊1):"1-6.DUAN"Y"F,"WANG"X"R,"LIANG"L"L,"LI"X"X,"XIANG"Q"B."Fingerprinting"and"identification"of"Osmanthus"fragrans"cultivars"using"fluorescence-labeled"SSR"markers[J]."Journal"of"Nanjing"Forestry"University"(Natural"Sciences"Edition),"2014,"38(Suppl."1):"1-6."(in"Chinese)

[19]"李青竹,"許俊旭,"王楨,"吉琴,"顧云,"楊柳燕."利用SSR熒光標(biāo)記構(gòu)建七十二個(gè)蓮屬荷花品種指紋圖譜[J]."北方園藝,"2020(4):"65-73.LI"Q"Z,"XU"J"X,"WANG"Z","JI"Q,"GU"Y,"YANG"L"Y."Establishment"of"seventy-two"lotus"(Nelumbo"spp.)"cultivars"fingerprints"using"SSR"fluorescent"markers[J]."Northern"Horticulture,"2020(4):"65-73."(in"Chinese)

[20]"肖文芳,"李佐,"陳和明,"呂復(fù)兵."利用SSR熒光標(biāo)記毛細(xì)管電泳法檢測蝴蝶蘭組培突變體[J]."熱帶作物學(xué)報(bào),"2016,"37(10):"1938-1944.XIAO"W"F,"LI"Z,"CHEN"H"M,"LYU"F"B."Detection"of"Phalaenopsis"in"somaclonal"variation"using"fluorescent"labeled"SSR"markers[J]."Chinese"Journal"of"Tropical"Crops,"2016,"37(10):"1938-1944."(in"Chinese)

[21]"艾葉,"陳璐,nbsp;謝泰祥,"陳娟,"蘭思仁,"彭東輝."基于SSR熒光標(biāo)記構(gòu)建建蘭品種核心種質(zhì)[J]."園藝學(xué)報(bào),"2019,"46(10):"1999-2008.AI"Y,"CHEN"L,"XIE"T"X,"CHEN"J,"LAN"S"R,"PENG"D"H."Construction"of"core"collection"of"Cymbidium"ensifolium"cultivars"based"on"SSR"fluorescent"markers[J]."Acta"Horticulturae"Sinica,"2019,"46(10):"1999-2008."(in"Chinese)

[22]"肖文芳,"李佐,"陳和明,"呂復(fù)兵."基于TP-M13-SSR標(biāo)記的石斛蘭種質(zhì)分子身份證構(gòu)建[J]."熱帶作物學(xué)報(bào),"2021,"42(10):"2751-2757.XIAO"W"F,"LI"Z,"CHEN"H"M,"LYU"F"B."Molecular"identity"card"establishment"of"Dendrobium"germplasms"by"TP-M13-"SSR[J]."Chinese"Journal"of"Tropical"Crops,"2021,"42(10):"2751-2757."(in"Chinese)

[23]"中國科學(xué)院《中國植物志》編輯委員會."中國植物志[M]."北京:"科學(xué)出版社,"1993.

Editorial"Committee"of"Flora"of"China,"Chinese"Academy"of"Sciences."Flora"of"China[M]."Beijing:"Science"Press,"1993."(in"Chinese)

[24]"PEGGY"A,"WESLEY"H."Rhynchostylis[J]."Orchids,"2015,"84(2):"86.

[25]"REGY"Y,"JOSE"M,"DARIUSZ"L"S."Rhynchostylis"cymifera"(Orchidaceae),"a"new"species"from"south"western"Ghats,"India[J]."Jordan"Journal"of"Biological"Sciences,"2018,"11(3):"257-259.

[26]"BOTSTEIN"D"R,"WHITE"R"L,"SKOLNICK"M"H,"DAVIS"R"W."Construction"of"a"genetic"linkage"map"in"man"using"restriction"fragment"length"polymorphisms[J]."American"Society"of"Human"Genetics,"1980,"32(3):"314-331.

[27]"陳金花,"王存,"黃素榮,"楊光穗."3株菌根真菌對海南鉆喙蘭幼苗生長的影響[J]."廣東農(nóng)業(yè)科學(xué),"2017,"44(4):"46-52.CHEN"J"H,"WANG"C,"HUANG"S"R,"YANG"G"S."Effects"of"three"kinds"of"mycorrhizal"fungi"on"growth"of"Rhynchostylis"gigantea"seedling[J]."Guangdong"Agricultural"Sciences,"2017,"44(4):"46-52."(in"Chinese)

[28]"International"Union"for"the"Protection"of"New"Varieties"of"Plants."Guidelines"for"DNA-profiling:"molecular"marker"selection"and"database"construction//BMT"Guidelines[C]."Geneva:"UPOV,"2007.

[29]"陳明堃,"陳璐,"孫維紅,"馬山虎,"蘭思仁,"彭東輝,"劉仲健,"艾葉."建蘭種質(zhì)資源遺傳多樣性分析及核心種質(zhì)構(gòu)建[J]."園藝學(xué)報(bào),"2022,"49(1):"175-186.CHEN"M"K,"CHEN"L,"SUN"W"H,"MA"S"H,"LAN"S"R,"PENG"D"H,"LIU"Z"J,"AI"Y."Genetic"diversity"analysis"and"core"collection"of"Cymbidium"ensifolium"germplasm"resources[J]."Acta"Horticulturae"Sinica,"2022,"49(1):"175-186."(in"Chinese)

[30]"王黎,"周琪,"高燕會."石蒜屬種間雜交種的鑒定和分子身份證構(gòu)建[J]."浙江農(nóng)林大學(xué)學(xué)報(bào),"2022,"39(3):"562-570."WANG"L,"ZHOU"Q,"GAO"Y"H."Construction"of"molecular"identification"card"of"Lycoris"interspecific"hybrids[J]."Journal"of"Zhejiang"A"amp;"F"University,"2022,"39(3):"562-570."(in"Chinese)

广灵县| 兴山县| 济宁市| 始兴县| 金川县| 临澧县| 沂水县| 确山县| 三原县| 建德市| 新郑市| 西昌市| 陇川县| 沙雅县| 长寿区| 五常市| 安阳市| 郑州市| 全南县| 长岛县| 郧西县| 西林县| 贵阳市| 陆良县| 常德市| 龙江县| 元朗区| 白水县| 昭平县| 开鲁县| 内江市| 嫩江县| 涞水县| 东乡县| 巴楚县| 巩义市| 南投县| 宁波市| 望奎县| 石景山区| 通江县|