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變異

  • 基于矩陣的并發(fā)關系挖掘算法在新冠病毒變異分析中的應用
    引 言新冠病毒變異株中最受關注的是Delta、Omicron、Alpha、Gamma、Beta、Lambda、Mu 變異株。以上變異株或是增加了毒性,或是增強了傳播性,某些變異株還會降低疫苗效用,對公共衛(wèi)生構成重大威脅[1]。因此,對于新冠病毒突變的研究至關重要。考慮到DNA 序列的特殊性,已經(jīng)有許多專門針對DNA序列挖掘的算法,如ToMMSA、ATRHunter 等[2]。機器學習也被應用到DNA 序列挖掘[3]。至今已經(jīng)有許多研究人員在針對SARS-

    物聯(lián)網(wǎng)技術 2023年9期2023-09-21

  • 群體基因組結(jié)構變異檢測工作流
    01)基因組結(jié)構變異(Structural Variation,SV)是基因組上大尺度的核苷酸序列重排性變化,它包括長度大于50 bp的插入(INS)、缺失(DEL)、倒位(INV)、重復(DUP)、易位(BND)[1]。相關研究表明,平均每個人類個體上存在大約兩萬個結(jié)構變異[2],結(jié)構變異盡管相較于單核苷酸變異(SNV)、短插入缺失變異(INDEL)數(shù)量較少,但因其變異長度較大,因此對基因組上核苷酸序列的影響是最廣泛的[3]。結(jié)構變異會改變基因序列信息,

    生物信息學 2021年4期2021-12-31

  • 世衛(wèi)改用希臘字母命名變異新冠病毒
    臘字母對新冠病毒變異株進行命名。目前,有4種變異新冠病毒被WHO列為“須關切變異株”,另外6種變異新冠病毒則被列為“待觀察變異株”,這些變異病毒都會采用新命名法。據(jù)路透社1日報道,按照WHO新的命名規(guī)則,最早在英國發(fā)現(xiàn)的學名為B.1.1.7變異病毒,將被稱為“阿爾法”(Alpha);最早在南非發(fā)現(xiàn)的B.1.351變異病毒,將被稱為“貝塔”(Beta);最早在巴西發(fā)現(xiàn)的P.1變異病毒,將被稱為“伽馬”(Gamma);以上三種均被列為“須關切變異株”。最早在印

    環(huán)球時報 2021-06-022021-06-02

  • 四季海棠無性系變異離體篩選與變異頻率控制
    質(zhì)逐漸降低、株型變異、葉色變化,抗性變差。四季海棠無性系建立是進行種苗快速繁殖的有效方法之一[5],而四季海棠品種無性系建立過程中,也會有一定變異性狀的出現(xiàn)。無性系變異的發(fā)生,嚴重影響了應用組培技術進行快繁的產(chǎn)業(yè)化生產(chǎn)效益[2]。變異苗觀賞性及再生能力差,采用無性提純的方法剔除變異植株,篩選優(yōu)質(zhì)種苗。目前,對四季海棠組培苗變異的研究空白,但變異在建立無性系過程中日益突出的不利影響逐漸顯現(xiàn),組培變異的篩選和控制顯得愈加重要。1 材料與方法1.1 材料以四季海

    農(nóng)業(yè)科學研究 2021年1期2021-05-12

  • Randoop 和Evosuite 生成測試用例的變異檢測能力分析
    的一種常用方法是變異測試。變異測試將人工缺陷(變異體)種植到被測代碼中,并評估測試用例是否找到它們。當一個測試用例檢測到一個變異體時,說明該變異體被殺死[1],否則變異體仍然存活。本文選擇Randoop 和Evosuite 這兩個積極維護的自動化生成單元測試的工具,muJava 變異工具,以數(shù)據(jù)結(jié)構教材中的基本數(shù)據(jù)結(jié)構項目作為被測項目進行變異測試,通過比較Evosuite、Randoop 生成的測試用例的變異檢測能力,以回答下面2 個研究問題:問題1:兩個

    現(xiàn)代計算機 2020年9期2020-04-25

  • 北洛河流域分期徑流變異診斷及成因分析
    注變化環(huán)境對水文變異的影響[1]。聯(lián)合國政府間氣候變化專門委員會(IPCC)在1990年就提出了氣候變化問題,2014年發(fā)布的報告[2]則明確指出,全球性的水循環(huán)系統(tǒng)、冰雪消融情況、海平面變化以及極端天氣出現(xiàn)的頻率、程度都發(fā)生了顯著變化,與之關系緊密的氣候變化和人類活動引發(fā)了水文系列變異問題。國內(nèi)外的相關研究表明,美國多條河流的水文系列在20世紀后期發(fā)生了明顯變異[3],我國的海河、黃河、渭河等流域的徑流系列均發(fā)生了顯著變異[4-7]。在實際生產(chǎn)應用中,水

    水資源保護 2019年6期2019-12-03

  • 基于SOM神經(jīng)網(wǎng)絡的二階變異體約簡方法?
    010021)變異測試[1]是一種通過向源程序中人工注入缺陷來模擬軟件中實際缺陷的技術,被注入缺陷的程序稱為變異體.傳統(tǒng)的變異測試是指一階變異測試,即通過向源程序中人工注入一個缺陷來模擬軟件中的一個缺陷[2].但程序中的實際缺陷往往是由兩個或者更多個缺陷一起造成的[3,4],所以高階變異測試被提出來用以解決程序中復雜缺陷的問題,在模擬程序的復雜缺陷方面有著重要意義[5].由一階變異體組合形成的高階變異體數(shù)量會大量增加,大大增加了執(zhí)行開銷[6,7].因此,

    軟件學報 2019年5期2019-06-11

  • JQuery變異算子的冗余檢測
    m[3]提出一種變異測試的方法,并廣泛應用在各個語言的軟件上.雖然變異測試已經(jīng)被證明了在提高測試用例的質(zhì)量上是有效的,但是測試成本也隨之增加,這取決于生成的變異體的數(shù)量和產(chǎn)生等價變異體的百分比.為了降低變異測試的成本,國際上許多學者提出了幾種可行的方法.A.J.Offutt和R.H.Untch[4]把這些方法分為了三類,即減少變異、更好的算法以及更快生成和運行.將這三類辦法應用在變異測試分析中,可以大幅降低變異測試的成本,剔除測試過程中的不必要的開銷.A.

    小型微型計算機系統(tǒng) 2019年4期2019-05-05

  • 面向WS-BPEL程序的變異測試優(yōu)化技術
    戰(zhàn)性問題[3].變異測試是一種基于故障的軟件測試技術[4],具有較強的故障檢測能力,廣泛用于評估測試用例集的完備性和測試技術的有效性[5].然而,由于變異測試產(chǎn)生的變異體數(shù)量龐大、等價變異體識別困難、缺乏相應自動化支持工具等原因,變異測試難以在實際中廣泛應用.在WS-BPEL變異測試方面,人們提出面向WS-BPEL程序的變異算子[6],為WS-BPEL程序的變異測試提供基礎[7].在課題組前期研究工作中[8-10],我們提出了一種面向WS-BPEL程序的變

    計算機研究與發(fā)展 2019年4期2019-04-18

  • 一種針對Java程序的充分變異算子集
    621010)變異測試[1](Mutation Testing)是一種基于缺陷的軟件測試方法,基本原理是使用變異算子(Mutants Operator)對被測程序做微小的合乎語法的變動,改變過后得到的程序被稱為變異體(Mutants)。在產(chǎn)生變異體后,分別在原程序和變異體上運行測試用例,如果二者的結(jié)果相同,則表示該變異體是存活的(Alive),如果二者的結(jié)果不同,則表示該變異體是被殺死的(Killed)。如果一個變異體在語義上和原程序保持一致,那么它將無

    西南科技大學學報 2018年3期2018-09-27

  • 基于變異點的選擇性變異測試
    業(yè)界的高度重視。變異測試是一種基于錯誤的軟件測試方法,自20世紀70年代產(chǎn)生以來,經(jīng)過近50年的發(fā)展,變異測試技術日趨成熟,大量實證研究表明[1-4],相對于路徑分析、數(shù)據(jù)流分析和域分析等測試方法,變異測試能夠更為有效地檢測軟件故障。變異測試通過向待測程序注入微小的語法錯誤,得到大量被稱為變異體的錯誤程序,從原程序生成變異體的轉(zhuǎn)換規(guī)則被稱為變異算子,變異算子主要通過替換、刪除和插入三種方式更改程序中的變量或表達式,從而生成變異體,而變異發(fā)生的位置被稱為變異

    現(xiàn)代計算機 2018年7期2018-04-24

  • 實時熒光定量PCR法檢測乙型肝炎病毒YMDD變異的臨床意義
    肝炎病毒YMDD變異的臨床意義陳繼梅1,胡婭嫻1,戴陽2目的:探討拉米夫定治療慢性乙型肝炎期間發(fā)生乙型肝炎病毒HBV YMDD變異情況及其與病毒載量、肝功能的關系。方法:對慢乙肝患者分別檢測血清HBV YMDD變異、HBV DNA 載量及肝功能,并對檢驗結(jié)果進行分析。結(jié)果:3年間共發(fā)生HBV YMDD變異共59例,其中HBV YIDD變異29例(49.15%),HBV YVDD變異41(69.49%)例,2者共同變異11(18.64%)例,YIDD與YVD

    淮海醫(yī)藥 2017年4期2017-07-31

  • 乙型肝炎病毒前C/基本核心啟動子區(qū)變異的生物學意義
    基本核心啟動子區(qū)變異的生物學意義向 瑤 綜述,楊朝國△審校 (成都中醫(yī)藥大學醫(yī)學技術學院,成都 610075)乙型肝炎病毒; 前C區(qū)基因; 基本核心啟動子; 突變乙型肝炎病毒(HBV)基因組變異率約為其他DNA病毒的104倍,主要原因:(1)HBV復制是以mRNA為模板反轉(zhuǎn)錄合成子代病毒DNA,該過程中缺乏校對酶的作用,容易發(fā)生堿基錯配;(2)在內(nèi)源性(宿主免疫清除)和外源性(疫苗接種、乙型肝炎免疫球蛋白注射、抗病毒藥物治療和診斷試劑檢測)選擇性壓力下,H

    檢驗醫(yī)學與臨床 2015年21期2015-04-16

  • 血壓變異對接受降壓治療的急性顱內(nèi)出血預后的影響
    可能存在每日血壓變異,迄今關于每日血壓變異與接受降壓治療的急性ICH 近期不良預后間關系尚不清楚,現(xiàn)就此進行分析。受試對象為205例急性ICH 患者,平均年齡65歲。均于急性ICH 超急期(發(fā)?。? h 內(nèi))接受降壓治療,且初始收縮壓(SBP)均>180 mm Hg(1 mm Hg=0.133 3 kPa),降壓靶標均為使SBP 降至120~160 mm Hg,降壓藥均為靜注尼卡地平。并于降壓頭2 h 內(nèi)每15 min 監(jiān)測1 次SBP,以后每小時監(jiān)測其S

    心血管病學進展 2015年2期2015-02-21

  • 語言變異的種類探析
    寧大學文學院語言變異的種類探析杜啟朕遼寧大學文學院語言變異是言語交際活動中一種正常的語言現(xiàn)象,是語言中新質(zhì)要素不斷出現(xiàn)、舊質(zhì)要素不斷消亡的結(jié)果。根據(jù)不同的標準,語言變異可以分為不同的種類。研究語言變異的種類,具有重要的價值和意義。語言變異;種類;模因;價值一、語言變異界說語言是社會發(fā)展的產(chǎn)物,在社會發(fā)展的過程中不斷產(chǎn)生語言變異。美國著名社會語言學家威廉·拉波夫是語言變異理論的創(chuàng)始人,他認為語言是一個有序的異質(zhì)體,是對同一事物存在的不同說法。祝畹瑾指出:“語

    科學中國人 2015年17期2015-01-28

  • 遺傳算法中的變異算子的述評
    。在遺傳算法中,變異算子通過模擬生物遺傳和進化過程中的變異環(huán)節(jié)對個體進行變異,雖然發(fā)生變異的可能性比較的小,但也是產(chǎn)生新物種的一個不可忽視的原因[1]。通過變異不斷在交叉算子產(chǎn)生的新個體的基礎上進行微調(diào)、增加種群的多樣性、使遺傳算法在交叉算子決定的全局搜索能力的基礎上還具有一定的局部搜索能力。變異算子被認為是必不可少的產(chǎn)生新個體的輔助方法,文獻[2]認為變異算子能夠成為一個重要的遺傳算子,特別體現(xiàn)在維持種群的多樣性問題上。正是變異算子在遺傳算法中的不可或缺

    科技視界 2012年23期2012-08-15

  • HBV逆轉(zhuǎn)錄酶區(qū)181位點變異研究進展
    長,HBV易產(chǎn)生變異耐藥,造成抗病毒治療的失敗。隨著核苷(酸)類藥物種類的增加,可通過聯(lián)合或替代的方法挽救變異耐藥,但是位于逆轉(zhuǎn)錄酶(reverse transcriptase,RT)區(qū)B亞區(qū)第181位氨基酸的變異給抗病毒治療提出了一個新的“挑戰(zhàn)”,因為其變異后不僅僅對阿德福韋產(chǎn)生耐藥,而且對拉米夫定、恩替卡韋、替比夫定、替諾福韋的藥物敏感性均呈現(xiàn)下降,是一個交叉核苷和核苷酸兩類藥物的耐藥位點[3]。一、rt181變異的概念野生型HBV rt181位氨基酸

    實用肝臟病雜志 2012年5期2012-04-12

  • 消化內(nèi)科6種疾病臨床路徑變異原因分析及措施
    例出現(xiàn)不同程度的變異,現(xiàn)分析如下。1 病例概況1.1 病例選擇收集2010年3月~2011年1月符合衛(wèi)生部頒布臨床路徑標準病例119例。其中,男性55例,女性64例;年齡25~83歲,平均年齡53.2歲;其中腸息肉 51例,急性胰腺炎29例,肝硬化腹水11例,膽總管結(jié)石取石(ERCP)27例,十二指腸潰瘍1例。共完成路徑例數(shù)/變異終止例數(shù)(102/17)例。其中腸息肉(47/4)例,急性胰腺炎(23/6)例,肝硬化腹水(7/4)例,膽總管結(jié)石(ERCP)取

    中國衛(wèi)生質(zhì)量管理 2012年5期2012-01-31

  • 踝關節(jié)MR斷層解剖、解剖變異和病理——第二部分:解剖變異和病理(續(xù))
    殷玉明Continued from last issue Bone and cartilage disorders:Clinically, acute ankle pain caused by ankle fracture and dislocation can be adequately evaluated with routine ankle radiographs. Some subtle fractures can be diff i cult t

    磁共振成像 2010年6期2010-06-02